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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022422 | Chr10 | 5985417 | 5993769 | + | Homeobox protein knotted-1-like 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022422.m1 | 103 | 145 | PF03790.16 | KNOX1 | Family | 77.7 | 4.20E-22 |
LITCHI022422.m1 | 157 | 203 | PF03791.16 | KNOX2 | Family | 86.8 | 5.40E-25 |
LITCHI022422.m1 | 242 | 263 | PF03789.16 | ELK | Family | 35 | 1.10E-08 |
LITCHI022422.m1 | 282 | 321 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 61.7 | 5.00E-17 |
LITCHI022422.m1 | 288 | 322 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 27.8 | 1.80E-06 |
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>LITCHI022422.m1 ATGGACGAACTCTATGGCCTCAACTCAACGCTTGATTATTCAATGCAAGAGACCGCGGCT GAGAATATCATGGTTGGTACTACTACCACTACTACTACTTGGACCAACTACCACCAACAT ATTTCATCATCATCATCACCAGTCGTGACTACTTTTAATCATGGTGGTGGTGGTGGGGAT CATCCTGTGTATGGATCCGAACAGTTTGGGTCAGGTTCATCTGGGATATCTGATGCCGCT TCAATGGTGGCTGAGCTTCAAAGAAATAACAGTAACATTACTACTTCCGAGGAAGAGGTT TCAAGTGCAATTAGAGCCAAAATTGCTTCTCATCCTCTTTACCCTAAACTGCTTGAAGCC TATGTTGATTGCCAGAAGGTGGGTGCGCCACCGGAGATGGCTGATGTGTTGGACGAAATC AGGAGAGAAAGTGATGTTAGTAAGCGAACCGCCGTCTCTTCAGGTTGCTTCGGCGCCGAT CCCGAGCTGGACGAGTTTATGGAAACTTATTGCGATATATTGGTCAAGTACAAGTCAGAT CTCTCAAAGCCTTTCGATGAAGCGACAACGTTTTTGAATAGTATGGAAACACAGTTGAGC AATCTCTGCAATGGTGTTTCCAGAAGCTATATTGGTTCAGATGAAGGTGGTGGATCATCT GAAGAAGAATTGAGTGGTGGTGAGACAGATGTTCAGGAGATTTCTAGGGCACTCGTGGAC CGAGAGCTCAAGGACAAACTCATACGTAAATATGGTGGTTATATTAGCTCCTTAAAGCTT GAATTTTCTAAAAAGAAGAAAAAGGGGAAGCTCCCCATAGAAGCCCGACAAGCCTTGTTC GATTGGTGGAATATACATTACAAATGGCCCTATCCCACGGAAGCCGACAAGGTTGCACTG GCTGAATCAACCGGTCTGGACCAGAAGCAGATAAACAACTGGTTTATAAATCAAAGGAAA CGACACTGGAAACCATCTGAGAATATGCAACTTAGTGTTATGGAAAGTTTATATGGACCG TATTCATGA
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>LITCHI022422.m1 + Up_Stream_Len 2000 AACAAGAAAATGAGAAATTATACTTGTTACTGCCCTAATCGGGCTGGGTTCCCGTAAGTT CTCTCTATATTACATGAATTATGTTGCCAATCGTACTAATAATCTTAACATATTTGTTGA CCATCCACAACACTACAATCTTGGTGTACATGTTAAAATTTGTGAAAACTGATCGTAAAT ATAATATTTATTATATTAAATAATCTACAGACCTATTAAAATAATAATTTATAATAAATT TTATTTTATTTTAAAAAACAAGATTTAATTAAGATGATGGTATGTATGTTTGCTCTCTCA AGACTACGCTGCTCGTAGTATGCAATCCACAACTACAAACAAGATTTACATAAATATCAC TGAAAAATTTTACAATATATGAATATAAAGTTTTAAACAAAGACTTAGGTTTTAATAAAT GCATAATTATATTACTGTTAAATATGTTTTGATGATAGATAACATTTATTCATATTTAAA TTATTTAAATTTGAATTATCTTTGTCACACGTGGTGTTTATATATACATATATAAAATGA TGCGCAAAATATGAAAGTTTATGAATGATCTTTTCATAAAAATGTTTTTTATAGGGACCC ATATTTGTTATTGAATAGGCTTGTGATTCAATAATTTTGATTAAGTTCATGTAAAATTAG ATCACATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTATTATATATAGTATAACAATTCGAATTTA AAATATTATTATATTAAATGAATGATGTTTTTCCTTTTTAAATATCACATGTAGTATTGG AATTTAAAAGATTGCTAGATAGATTGAATATTGAGATAGCGATGCCGATAAATAATCAAA TTCATGATAAAATAATTTGCTCCAAAGGAATTGTTTTTATTAATAATAAAAAATTGACAA TTAGAATTCGGATGTGTGTTTAATTGACAAAAATAAACCCATTTCCATTAAGAATAGGAC AAATAAAATAATTTAAATAAAAATTTTTCAAATTTATCTAAACCACAAATTTGGGTAATC AATTGAATGTAATTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAGCAAACTCAACAAAATGGCATTGAAA ATGAAATTTTCTGTTAAAAATTATTCAGAGGTCAGAATTACCAAAACTGGAAAGGAAAAT TTCAAGTGCAAAAATAAAGTCGAAAGGATTGAATTTGAGCTTATTTTATGGTTTATCATG TAGGGCTGTGGGCCTGCCCATATTAATTTCATCGAGACTTTCAAAACCATATTTATGGAT CTAAATTCGACATCCTTTGCTCCAATCATTATTTCTAGTAGTATCCAAAACCAGATGTTT TCACCACTAAAGTATACTATAGCGTGGTGAATTAAGCGGTCTTGAATAACATGGTAAATA TCTTTTTATATTTACCATTGCATTCCACACATAATATCTCGCATACTTGTTTTAAATTTA TATACAAAAATTTCGTTTTTTTTATAGACAATTTTTTTTGTTACTACTACCACTAAAAAC GATAGACATATTAAAGGGCTGTCACCATAATATCCCGAAGGGGATGTAGTGAAAATGTTG GATGATCTGGGTTCAGTTTGATTGAAAACAACTGTGCGAAAGGCATAGATGAAATGACAT AATAAGGACCATTGACATGATGCATCACAGCATTTTGTATTTTCATGAATTGGAGCATTG TGGAACAGCAAGTGCTGCTGACGCGCTCAACTGCAACGTGGACGCAGCAGCAGCCCCTCT CCTTCCTCGCCTCTCCTCAAAAGAGCGAAAAGAAGCAACTTTCAGTGGGCCACACTGTGT CGTGCTTCTTCTTGCTCGTATGCTAAATATCACATGACACACGCCCTCCTCCTTGCAACT CCATTCACTTCCATGTCTAGATAACATCTTTCTTGTTCTTCTCTTAACTTCTCCTAGCCT GTATAATCTGCTGTTATAGCTGTTGCATATGTTTATATATTAGCTATCTGATCTTTTTCT ATATTAAAATTAATCAACCT
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>LITCHI009842.m1 GenomeSequence + ATGCATGCCATGAAAATACTGAATGCATCGACTATGCACATGGCAATGGATATCATTGTG GGTGCAGTCCAGGTTACCGAGGCAATCCTTATCTTCTCAATGGCTGTAAAGCTAGTTTTT GATTCTACTGGTAACACATTATGTAGTGTTACTGTTACATTGCCAAAGGCCTTTTTTGTT TTGTTGTTGTTGTTGTTTTGTTTTTTCTTCCCCTTGGTGTGATCTAATCGTGACTAGCTA TAATTCTTCAGATATCGGTAAGTGCAAAATTGGAACAGCAAAATGTGCACAGCAAGCAAA AAGCAAGAACACTGAAGCAGCATATCATTGCAGTTGCCCTAAAGGCTACCACGGCGATGG TATTCCAGAAAATGGTTGCATCCCTGATAAACGACACCTTCCACTGCCTCTAATTTTCTC TTTAGGTGTTGTTATCTTATCCCTTGGCTTCAATGGTAATCTAAGAAATTGAATGGTTGG TAATGCTTTCACATGTGTAGAGGAAAACATTGTGTAATAGTCAAGTTGCTATCTTATATG TTAACCATCCATTTTATGACTTGCAGGAATGGCAGTTGGCTTGAGTTTAGCAGTCATTGC AATATCAGGAATCTTGTTTATATGGAGGCTCGGGAGGCAATGACAATTGAAAGTTTGAAA CAGAGGCAAATGTTCTTTAGACGAAATGGTGGCTTGTTATTGCAACAACAGATTGCTTCA CGGAAAGGAGCAGTTGGGACAGCCAAAATATTTGGTATTGAAGAGTTAGAAAGAGCAACA GACAACCTCAATGCAAGTCGAATTTGTGGAACTAGGGACTACAGTTCACTTTACAAAGGC ATGCTATCTGATGGCAAGATAGTAGCCCTCAAGGAGGCTCGAATTACGGATGAAAGTCAA 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