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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022379 | Chr10 | 5471028 | 5473014 | + | Transcription factor WER |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022379.m1 | 9 | 56 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 53.2 | 2.80E-14 |
LITCHI022379.m1 | 12 | 71 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 56.9 | 1.90E-15 |
LITCHI022379.m1 | 62 | 107 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 63.1 | 2.20E-17 |
LITCHI022379.m1 | 65 | 111 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 34.5 | 2.00E-08 |
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>LITCHI022379.m1 ATGGAAGGGACGAGTGAATATAAAAAGGGGTTGTGGACGGTGGAGGAAGACAAGATTCTA ACAGATTACATAAGAGTACATGGCAAAGGGAAATGGAATCGCGTCGCCAAAGTTACAGGC CTTAAGAGGTGTGGCAAAAGTTGCAGATTAAGATGGATAAATTATCTAAGTCCTAATGTG AATCGCGGCAATTTCACTCAGGAAGAAGACGACCTCATCATACGCCTCCATAATCTCCTA GGCAACAGGTGGTCCCTAATTGCCGGACGGGTTCCTGGAAGAACAGACAATCAAGTGAAA AATCATTGGAACACTCATTTGAGCAAAAAATTTGGGATCAGAAAGAAGGGAAAGGGTAAA GCTGGTGATTCAACACAAACATTGTCTAAATCATTGGAGGAAAATTTGAATACCCTTACA AAATCAGATTCTACTATCCGACCCTATTGTAATGAAGAAGCTCAAGATCCGAAGGTTAAT GAAAATGGATTTGAATATCTAACGCCTACACTTGATCTAAGTGACTCACAAGAGTTGATC ATGAGGAGTGATGGTTATGAGAACTGTTTTTGGTTTTCTAATGATGAGCTAGATTTGTGG CCTCCTAGCTTAATGGAATTCTTAGATAAGTCCTTTGATTTTGCTTGGCATGGCTTGTAA
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>LITCHI022379.m1 CACAAATAGTTTTCTGACCCTAGGCACCCTACCATCTTCACTCTGTTTTTATAATATTGT TAAATTTATTTATTTATTTTTGTTGAAAAACCAAGTGCAAACCTCAGCATTGCTGATGCC ATTAGATAGTCTTTCAAAACCTAACTCACACCATTGACAACCATATAAACAAACCAAATG ATGTATTCTTTTCCATAAATATTCAAGCTCACTTAGTGCTTTAAACTTTATCACTGTTCT CTCTCTCTCTCTCTCACAGAGTCTCTCTTTGATCTCTCTTTCTGTGAAAAGGGTCTCTTG CAGCTGCCGTATACTTTACTGCAACAATGGAAGGGACGAGTGAATATAAAAAGGGGTTGT GGACGGTGGAGGAAGACAAGATTCTAACAGATTACATAAGAGTACATGGCAAAGGGAAAT GGAATCGCGTCGCCAAAGTTACAGGCCTTAAGAGGTGTGGCAAAAGTTGCAGATTAAGAT GGATAAATTATCTAAGTCCTAATGTGAATCGCGGCAATTTCACTCAGGAAGAAGACGACC TCATCATACGCCTCCATAATCTCCTAGGCAACAGGTGGTCCCTAATTGCCGGACGGGTTC CTGGAAGAACAGACAATCAAGTGAAAAATCATTGGAACACTCATTTGAGCAAAAAATTTG GGATCAGAAAGAAGGGAAAGGGTAAAGCTGGTGATTCAACACAAACATTGTCTAAATCAT TGGAGGAAAATTTGAATACCCTTACAAAATCAGATTCTACTATCCGACCCTATTGTAATG AAGAAGCTCAAGATCCGAAGGTTAATGAAAATGGATTTGAATATCTAACGCCTACACTTG ATCTAAGTGACTCACAAGAGTTGATCATGAGGAGTGATGGTTATGAGAACTGTTTTTGGT TTTCTAATGATGAGCTAGATTTGTGGCCTCCTAGCTTAATGGAATTCTTAGATAAGTCCT TTGATTTTGCTTGGCATGGCTTGTAAAATTATTTTCTTTATGAATCTGTAAAAGTACTCT ATATAAAATGACATATATGTTTCTCACTTCTATTGTACTTACACCTGCAACTTTTTTTAA AATAATAATAAAATAATTTTAGGTGCAAGATGAGAATGGCATGTGTTATGAGTCTTATGA CCCTTATACTTACATGAATGAGTTTATGGATTCGAATCATACTCCCTCCTTCAATTAAAT TATAATAAAGTATAAAGAAATAAAAGAAGCTTGGGCCACTAAAATTTCTTTCTAACTCGA AACTTTTTGCCGG
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>LITCHI022379.m1 + Up_Stream_Len 2000 GTGTCCACCACCACATTCTAATATCAATGTCCACAAGAGGAGTGACACGCACGTGTGTAA CGTACTGATAAATATTCTTCTCTATCTTTTGGTTTTCAGAAAATTTGATCAATCATACAT CAACCATTATTTCCCCATTAAACGACATGGTTCCTTACTTTCTTTTTGTTTGACAATTCA AGTAAATCTTTCGTAGTATTTCAACCTCATCAATCATTTCGAAATTAGCATCTCTCATTT TCAACTAATAAATGTGTTATGTACCCTATGATAATATCACCAACCTTAATGAGAATAAAA TTTGGCTTTAGCGTCTTTTACGCCATGATAAGTAATACTCATACCTTTGACGGTTTAGTA ATATTTATATAACAAACCTAAATTAATATGAACAAAACGTATATGTGGCTAATACATTAT TGAAGTAAATCTAGTATCGTATATGTCGTTTGTCACAGGCAGCTAATCAATTGCATAACT CATTTAACATTTGAGCACGAGCTGTCATATGAAATTGCTGTTGACTAAAACCAAAATAAT CCATTGTCATATAGATGATATTCTTCAGGTCATAGCATTAGATTTTAATCGAATTTTGAG GCTTAGAATTATCTCGAGGAGAGAGAATGGGAAGGCCTGACAATGGCAGGGCCCGAAGCT TATTGGCACGTAAGTGTTAAGAGTAACAAATAACACATCCCATCTTCTGTTTCTCTGTCA TGTTTCAACAAAAATATTAAGTTCATGTTTCATGTTTTTTTGAATTCAATTATATCATGT TTTCATTATACCTGTATCCATGTTTCAATGATTTAATTAGTCATGGTTCTCTGTTTTTTC TTCACGCTCAATATTGTTGATTTCAAAATAGAGAAATATTAATTTACTGATTCAATAATA TATTTAAATCAATATTCAATTCAAAACTAAAATTTGAATTAGATTGTTGAAAAATAAAGT CGTGAACTAACCGATAAATTGAAAATTTATTTATTATTATTATTTTTGATTAAAGGGGTA TTATAATCTTTTTACCTTGTAAAACTCAATTTAATTATTTGATATTGGTCAAGTAAGTTT TGAGTTGTAGGAGCTATTAGACCCTCTCCAAATACACCAAAATGGTGTATACCATTTTGG TGCATTTTCACATTCCAACATGTACATCAATTTTATATTCCCACAATAATTTTTTGATGT TAATGAACAATGCAACACCAAATTTGGTGCTGTACTGTTGATAACATCAAATTTAGCATT GATTTAAAAATTAAATTAATTTAAAATATATATTAAATTATTACGAAAAATATATCATTT AAAATGTTTTGTTGAGATCTTTAAAATAAATATGATATTTAATATATTTTAAAATTTTTA ATAGATATTGATTAAATAATTATATAAAGAATATTTTCTGATTTATATCAATTTGGTGTA TAATATATTGGAGTATAAAAAAATTTGGTATAAGAAAATTTGAAATAAATATTAAAATGA TATGAAATTTGGTGTTCACAGAGATGATTTTAGGTATGATTTTTCAAATTTTGATGCTTA GAATCATCTCACGGGGAGAGAATGGGGGGGCCCGATGTTAATGACACGTAAGCAACAGAG TAACAAATAACACATCCCATCGACTTGCAGCTGATCCCTCTAACCCAACCTTATCACAAA TAGTTTTCTGACCCTAGGCACCCTACCATCTTCACTCTGTTTTTATAATATTGTTAAATT TATTTATTTATTTTTGTTGAAAAACCAAGTGCAAACCTCAGCATTGCTGATGCCATTAGA TAGTCTTTCAAAACCTAACTCACACCATTGACAACCATATAAACAAACCAAATGATGTAT TCTTTTCCATAAATATTCAAGCTCACTTAGTGCTTTAAACTTTATCACTGTTCTCTCTCT CTCTCTCTCACAGAGTCTCTCTTTGATCTCTCTTTCTGTGAAAAGGGTCTCTTGCAGCTG CCGTATACTTTACTGCAACA
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>LITCHI022379.m1 GenomeSequence + CACAAATAGTTTTCTGACCCTAGGCACCCTACCATCTTCACTCTGTTTTTATAATATTGT TAAATTTATTTATTTATTTTTGTTGAAAAACCAAGTGCAAACCTCAGCATTGCTGATGCC ATTAGATAGTCTTTCAAAACCTAACTCACACCATTGACAACCATATAAACAAACCAAATG ATGTATTCTTTTCCATAAATATTCAAGCTCACTTAGTGCTTTAAACTTTATCACTGTTCT CTCTCTCTCTCTCTCACAGAGTCTCTCTTTGATCTCTCTTTCTGTGAAAAGGGTCTCTTG CAGCTGCCGTATACTTTACTGCAACAATGGAAGGGACGAGTGAATATAAAAAGGGGTTGT GGACGGTGGAGGAAGACAAGATTCTAACAGATTACATAAGAGTACATGGCAAAGGGAAAT GGAATCGCGTCGCCAAAGTTACAGGTCAGTTTCATTGTTATATGTCTGTTTGAAGCAACT TGTTATTTTTATTTTTTGTAGTGATCTTTACTATCAGTTAATATAGAAAACTTTTCAATT GAATAATCTTTGTCATTCTTGTGTAAAACAGGCCTTAAGAGGTGTGGCAAAAGTTGCAGA TTAAGATGGATAAATTATCTAAGTCCTAATGTGAATCGCGGCAATTTCACTCAGGAAGAA GACGACCTCATCATACGCCTCCATAATCTCCTAGGCAACAGGTTTGTCAATGCTCAAAAA TATTTACCACATTACAGGTTTGATTAAGATCATTCATGGTTAGAAGTAAAAGTTTATTAA ATGAGTAAAATAATTGAATATAAATATATTATATTTTGTAAGGCGGACACAGCACTATCA TGATGATTCATGATGAGTTGTAATCATGATGGTTATTCTTCTTGAATTATTGTAGCTATT CTTTTACCTGTGTCTGTACGTCAATCATGTTGAGTTACATATTCCATTTTCGTTAGTAGT TAAATTCATTTTATATAGCCATATACATGATAGCATCAATGCATCGTTACTAGCAGTAGT ATAATGTAAACTGTACTGATAGAACCAGCTTTCCTAGCAGCAATATGTAGCACTACTCAC CCTCCGCGCGCCCACCACCCCACCCACCCACCCCACACACCCCGAACCCCACCCCCCAAA GACCAACCCCGCTTTTTTTTTTTTTACACTACTTTTTTACTAGTTTTTTTTTTTTTTTTT AAAGAATCTTTTTTACTAGAGCTTGACACACAACATTGTTGATTTGTTGTCAAAAGTTCT AAATTAAATTAATTTGATCTTACTAAAGGTGGTCCCTAATTGCCGGACGGGTTCCTGGAA GAACAGACAATCAAGTGAAAAATCATTGGAACACTCATTTGAGCAAAAAATTTGGGATCA GAAAGAAGGGAAAGGGTAAAGCTGGTGATTCAACACAAACATTGTCTAAATCATTGGAGG AAAATTTGAATACCCTTACAAAATCAGATTCTACTATCCGACCCTATTGTAATGAAGAAG CTCAAGATCCGAAGGTTAATGAAAATGGATTTGAATATCTAACGCCTACACTTGATCTAA GTGACTCACAAGAGTTGATCATGAGGAGTGATGGTTATGAGAACTGTTTTTGGTTTTCTA ATGATGAGCTAGATTTGTGGCCTCCTAGCTTAATGGAATTCTTAGATAAGTCCTTTGATT TTGCTTGGCATGGCTTGTAAAATTATTTTCTTTATGAATCTGTAAAAGTACTCTATATAA AATGACATATATGTTTCTCACTTCTATTGTACTTACACCTGCAACTTTTTTTAAAATAAT AATAAAATAATTTTAGGTGCAAGATGAGAATGGCATGTGTTATGAGTCTTATGACCCTTA TACTTACATGAATGAGTTTATGGATTCGAATCATACTCCCTCCTTCAATTAAATTATAAT AAAGTATAAAGAAATAAAAGAAGCTTGGGCCACTAAAATTTCTTTCTAACTCGAAACTTT TTGCCGG