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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI022146Chr1039723383989333-Lysine-specific demethylase 5A

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI022146.m13164PF02375.20JmjNFamily57.31.00E-15
LITCHI022146.m1109187PF01388.24ARIDDomain40.44.00E-10
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LITCHI022146.m1419535PF02373.25JmjCDomain146.44.60E-43
LITCHI022146.m1628680PF02928.19zf-C5HC2Domain51.51.00E-13
LITCHI022146.m17451035PF08429.14PLU-1Family54.21.30E-14
LITCHI022146.m19021194PF08429.14PLU-1Family79.42.90E-22
LITCHI022146.m112151406PF08429.14PLU-1Family46.92.20E-12
LITCHI022146.m117081751PF00628.32PHDDomain32.75.50E-08
LITCHI022146.m23164PF02375.20JmjNFamily57.49.90E-16
LITCHI022146.m2109187PF01388.24ARIDDomain40.53.80E-10
LITCHI022146.m2248295PF00628.32PHDDomain35.66.80E-09
LITCHI022146.m2419535PF02373.25JmjCDomain146.54.40E-43
LITCHI022146.m2628680PF02928.19zf-C5HC2Domain51.69.80E-14
LITCHI022146.m27451035PF08429.14PLU-1Family54.41.20E-14
LITCHI022146.m29021193PF08429.14PLU-1Family79.52.70E-22
LITCHI022146.m211511406PF08429.14PLU-1Family55.65.00E-15
LITCHI022146.m217081751PF00628.32PHDDomain32.85.20E-08
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TATAATGTAATTGATGAATTAGATTGCATTTTGAAAGATGGAACATCACTGAGAATTCGA
GTTGATGAGTTGCCTGTGGTTGAGGTTGAATTGAAAAAGGCTCATTGCAGAGCGAAGGCT
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GTCATACTACAGATTGATAAGGAAAAATTGTTTCTTGATATGTCTGAGGTGGTTGATACT
GCTATGCATTGGGAAGAAAGAGCAAGACATACCCTAGCTTGCAAGGCTCAGATGTCTGAA
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GTCCAAGATGCAGTATCAGCGGCTAAATCCTGGTTAAAGGATTCTAAACCATTTTTAGCT
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TCTTTCTGCTCTTTTGCTCCTTCATTTCAGGATGTGAAGAGCTTGATGGAGGTGGCAGAA
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GTGGGTGAACTAACTACTGCTGTTCAGGAACATAAGCGGTGGCAAGAACAAGTGTTCCAG
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CCAGCAGTTGATACAAATCACCCAGAATTGTATGAATGCCATTATTGCCAACTTTTGAAG
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TTGAGAAAGTTGATTGAGCTTCTATCAGGTTCTGAAAATTTCTGTGTAGGGATTGAAGAA
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ATAGTAAAGGTTGCTCTTTCTTATATGGATAAGGATCTCAGTGTCATCTCTAGTAAACTA
ACTACTGCTTTGAAGGCAATAGAGGTGGCAGGAGTTTATGATCATCAAAGTAATAGGGCA
CTTGACCTGGCATTGGCAAGAAATTCATGGAGACTCAAAGTTGATAAATTATTAGAGGGT
TCAACAAAACCCTCTATTCGACAGATACAACATCGCTTGACAGAGGGACTGGCTATGAAC
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TCTCCGTTTATTCATAGGCAATAG
>LITCHI022146.m2
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AAGATTGTTCCGCCGAAGAGTTGGAGACCCCCGTTTGCGTTGGACTTAGATGCCTTTGAG
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GTGAGGTCAAACAGGAAGATTTCGGAGTGTGCTAAGCATGTTTTGTGTCAGTTGTATCGG
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AAGAGGAGGCGGAGGAGTAATAGTGATTGGGGGAGAGTTCAGGTTTGTGATAATGTTGTT
AAGGAGGAGGAGCTTGATCAGATATGTGAGCAATGCCGAAGTGGGTTGCATGGAGAAGTC
ATGCTTTTGTGTGACAGGTGTAACAAAGGGTGGCACATCTATTGCTTGTCACCACCATTG
AAGCAGGTTCCTATTGGAAATTGGTATTGTTTAGATTGCTTGAATTCTGATAAGGATTGT
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GCCAAAAAGAGGTGGTTTGGGTCAGGATCAGCTTCGCGTGTTCATTTGGAAAAGAAGTTT
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TTACTCTTTCAGCTTGTTACCATGTTGAATCCTTCAGTCTTGCAGGAGAATGGTGTTCCA
GTCTACAGCGTACTGCAGGAGCCTGGAAATTTTGTTATCACATTCCCCAGATCTTACCAT
GCAGGATTTAATTTTGGTTTGAATTGTGCTGAGGCTGTCAACTTCGCTCCTGCTGATTGG
CTACCTCACGGTGGTTTTGGCGCAGAATTGTATCAGCTATATCGCAAACCTGCTGTTTTA
TCTCATGAGGAGCTCCTTTGTGTGGTAGCCAAGGGTGATTGTGATAGCAGAGCATCACCT
TATCTGAAGAAAGAATTGCTTAGAATATCTACTAAAGAAAGAATGTGGCGAGAGCGGCTC
TGGAAAAAAGGCATCATTAGATCAAGACCCATGTGCCCTCGGAAATGTCCAGAGTATGTG
GGTACTAAAGAGGATCCAACGTGTATCATATGCCAGCAGTATCTGTACCTTAGTGCTGTT
ATTTGCCGGTGTAGGCCATCTGCTTTTGTATGCTTGGAGCACTGGGAACACCTTTGTGAA
TGCAAATCTAGAAAACTTTGTCTTCTTTACCGTCATACTCTGGCAGAATTGCATGCGATG
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GAAGGCATAAGAAATTGCCTTTCTAAAGTAGAGAACTGGTCAAATCATCATGGTTGTGAT
GTTGAGAAAGCGCGGTTGGGATATCTTACGGAGTTACTGGGTTTTGATCCTGTGCCCTGC
AGTGAACCTGGGCATCTTAAGTTGAAGAAGTATGCAGAAGAGGCTAGCTTGTTGCATCAG
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AGAGCTTGTAGCTTACCGATCTATGTTGAAGAAAGTGACAAGTTATCACAAAGAATTTCT
TCTGCAAAGGTCTGGATAGAGAGTGTGAGGAAATGCATCGCAGGTAAATGTCCTGCAGGA
AATGAGATTGAAATACTCTACAAGTTAAAGTCCGAGATATTGGATCTCCAAGTACAACTT
CCAGAAACAGAAATTCTTTTGAGTCTTATTAGGCAAGCGGAATCTTGTCGTGCTAAGTGT
AGTCAAATGTTGAATGGTTCTATAAATCTTAAGGACATTGAGGCACTGCTTCAAGAATTG
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GGGAAGGCTGCTGCTTTTCAGTGCTCAGAGCTAGAGAGGGTTGTATCTGAAGTTGGTAAG
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CCATTGCTTGGTGCTCTGCAGAAGCTTAAACAATCTCTGGACAGATCTTTGAACATATAT
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GCGAAAATCTTCATCTGTGCTGCATGTAAACCTGAAGCAGAGGAATTGTTGTCTACTTCT
ACAGTGATGGATGATGGGAGGTAA
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>LITCHI023088.m1
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IAGLWCTHPDRSFKPSIKLAILVLNFETAVPNLPTKMPLSVNHVPLPSISSSEPFMTNST
LEIGR.
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GCTGTTGGAGGTGGCAAAAGTCCGTTGGATGATCCTAATAACTTCTCTTGTTTAAGTACA
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AATTCACATCCAATGCTGGAAACCCACTTGTTGCAAATAGAGACACATGCATCAGAAGTT
TATACTCGAAACATATTCCTAAAAGTAAGGGATGAAATCAACTCAGAAGCAACGCTAAGC
ATCATAAATTGTGCCACTGATATGACGCAAAAGACATTTACATTTAAAAAGTTTGCGTGC
GGTGAGACAACTTGGGATGTGGTATACAACCCAGCTGAAAATAACTTCCTATGCTCATGC
AAATTGTTTCAAACACTTGGTATCCCTTGTTGCCATATATTCAGTGTAATGAAAGCTATG
AACATTGACTGTTTACCAGAGTCATTGATACTGCGTCGGTGGACAAAGAACGCAAAGGCC
GACGACGACGTTCATAACGTGGTGCACGAATGTGAAGCAAATGTTGTTCATATGGCACGG
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CGGCGGGTGCACCATGATGTGAGGCCGGTCACCACCACATGA
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TTTTCTCTTCAAACAGATATTTTACTCATTTTTAAAATGAATATCACATATATTTATATA
ATTTTCTGTTTTTGAAATTAAATTTTGAAAAATCCTATCAAATATATTGCATTTTTAAAG
TATATTTTTCATTTTTAAAAATATTATTTTAAAAACGATTTCAAACATGTTTTTATATTC
ATAATGATTTAACTTGTTAGATTTATATATATTCGATTATTATTTTATAGATTGGATAAG
ATTATTTATTAATAATAATTTTTAAATTAATTATAAAAATAATTATTAAAGAATATTTAA
AATTTAAATTAATAAAATCGGTGTATTCGTACAAATATAATATACGTGGCGAAGTTAAAA
ACGACAAAGCGGTGGATCTTTGGCAGCCATCCATCCCCAAATTTGACGGGGCAAAAGGAA
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AAGGTTACTTTAGTAATTGACAGGGACCCAATTTTTGACCCCATCCAATCAGAGCTCGGC
AGCGCTTGGATTTCACCCAATCAAAGAGCGAGTAGAGAGAGTTCTAGAATCGCCCGCGAC
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TGAAGCCTCCCCTGATAGGAATCCACGTGGCGAAATCCTGTCCATGAGATTAAAAGTATC
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TCCTGCCCACCCACAAAAATATCACAAAAAATTTGGTTGACTCTTTTGATAATGGAGAAT
TACCGAATAAGTGCCCTGTATTTTAAATAATTTTGTACCATTTCTACTTTTAACTGAATT
AATCCCTATATTTTTCATAATAACCAAATTAGCACCTTCAATTGTACATGTTACCCACTC
TTAATTCTTATTAGGGTGCGAAGTTATACATCTTGTTGGTTGTAAGAAATTAGGAACAAT
TTTTTTATTTTTATAAATATTTTATTTTGATAATTATTAAATAAATATAATTAATTTACG
TATAAATCTTAAAAGTTTACAGAATGAGATTGCATTTTATAATTACTTATAAAATTATGA
TAAAGTAAATCATATTCCTTTACAAATTTGTATGGTGATAGAAGTAGTTATTGTCATCGT
ATTACAATTTAAAGATTCATGAAATTAAAGGTTTGAAATTTAAAAAATTTGAAATCTAAA
AAAATCATTTATAACATAATGTTTTACTAATTATATAGATATTTTATAATAGTTAAACTT
ATTAAAGGTTTAACTTTTCAAGGTTTCTGCTGAAGTCTAAATAAATAATATAATAATTAT
GAAGAAAACTAATTTGATCATTTTGAAAAAATTAAAGCAATTTGATGATTATTAAAAAAA
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CAAATAAAAATAAAATTTTTATTCTCTCCATACATAAGAGTCTATATAATACTCCAATAA
CATATTAATACTTTTTAAAATTATATAGAGATTGGTCAATGTTATGTATTATGGCAGATA
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GAGAGAGCCTCCCAATGAGACTTTGCCTTTTGATCTGTCAGAAAATCTGCTGACTTGGCA
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TTTTCAAAACTCTTCTCTCTCACATTACATTTCAGATATTTTTGCTTATATGTATTGGTT
TCTAGATATTACTAGGTGAT
>LITCHI012124.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI012124.m2 GenomeSequence + 
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>LITCHI012124.m1 GenomeSequence + 
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