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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022146 | Chr10 | 3972338 | 3989333 | - | Lysine-specific demethylase 5A |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022146.m1 | 31 | 64 | PF02375.20 | JmjN | Family | 57.3 | 1.00E-15 |
LITCHI022146.m1 | 109 | 187 | PF01388.24 | ARID | Domain | 40.4 | 4.00E-10 |
LITCHI022146.m1 | 248 | 295 | PF00628.32 | PHD | Domain | 35.5 | 7.20E-09 |
LITCHI022146.m1 | 419 | 535 | PF02373.25 | JmjC | Domain | 146.4 | 4.60E-43 |
LITCHI022146.m1 | 628 | 680 | PF02928.19 | zf-C5HC2 | Domain | 51.5 | 1.00E-13 |
LITCHI022146.m1 | 745 | 1035 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 54.2 | 1.30E-14 |
LITCHI022146.m1 | 902 | 1194 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 79.4 | 2.90E-22 |
LITCHI022146.m1 | 1215 | 1406 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 46.9 | 2.20E-12 |
LITCHI022146.m1 | 1708 | 1751 | PF00628.32 | PHD | Domain | 32.7 | 5.50E-08 |
LITCHI022146.m2 | 31 | 64 | PF02375.20 | JmjN | Family | 57.4 | 9.90E-16 |
LITCHI022146.m2 | 109 | 187 | PF01388.24 | ARID | Domain | 40.5 | 3.80E-10 |
LITCHI022146.m2 | 248 | 295 | PF00628.32 | PHD | Domain | 35.6 | 6.80E-09 |
LITCHI022146.m2 | 419 | 535 | PF02373.25 | JmjC | Domain | 146.5 | 4.40E-43 |
LITCHI022146.m2 | 628 | 680 | PF02928.19 | zf-C5HC2 | Domain | 51.6 | 9.80E-14 |
LITCHI022146.m2 | 745 | 1035 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 54.4 | 1.20E-14 |
LITCHI022146.m2 | 902 | 1193 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 79.5 | 2.70E-22 |
LITCHI022146.m2 | 1151 | 1406 | PF08429.14 | PLU-1 | Family | 55.6 | 5.00E-15 |
LITCHI022146.m2 | 1708 | 1751 | PF00628.32 | PHD | Domain | 32.8 | 5.20E-08 |
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