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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI022117 | Chr10 | 3813629 | 3814155 | - | Nuclear transcription factor Y subunit C-3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI022117.m1 | 22 | 87 | PF00125.27 | Histone | Domain | 53.7 | 2.50E-14 |
LITCHI022117.m1 | 23 | 87 | PF00808.26 | CBFD_NFYB_HMF | Domain | 72.3 | 3.20E-20 |
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>LITCHI022117.m1 ATGAGGCAACCGGGGACGTATTCGGGAATACTTTCTGCGAGTATGGCAGGACGAATCGGG CCACATTCATTGCCCTTGGCAAGGATAAAGAAGATCATGAAAAAATCTGGTGATGATGTT AAGATGATATCCGGGGAGGCCCCGATCGTGTTTTCCAAGGCTTGTGAGCTGTTCATTGAA GAGATAACGAAAAGGTCGTGGATGGTGACCGTGCAAGGCAAGAGGAGGACACTGCACAAG GAAGATGTTGCATCTGCTGTTGTGGCAACCGATATATTTGATTTTCTTGTCAACTTGGTT TCTGACTCCACCACCACAAATGAGGCCGAAAACCCTGAAGAAAATGATAAATTATAG
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>LITCHI022117.m1 ATAGAACCCATTAACACAATAACCCTAGCTAGAACTCAAATTTTGGAACCATGAGGCAAC CGGGGACGTATTCGGGAATACTTTCTGCGAGTATGGCAGGACGAATCGGGCCACATTCAT TGCCCTTGGCAAGGATAAAGAAGATCATGAAAAAATCTGGTGATGATGTTAAGATGATAT CCGGGGAGGCCCCGATCGTGTTTTCCAAGGCTTGTGAGCTGTTCATTGAAGAGATAACGA AAAGGTCGTGGATGGTGACCGTGCAAGGCAAGAGGAGGACACTGCACAAGGAAGATGTTG CATCTGCTGTTGTGGCAACCGATATATTTGATTTTCTTGTCAACTTGGTTTCTGACTCCA CCACCACAAATGAGGCCGAAAACCCTGAAGAAAATGATAAATTATAGAGTCGTCCAACGT GATAATGAGGAGCATATATAGACTTTGTAAGCGCAAGCTATAACTACCAAATTAAGCTTT AATTTTCCTTGTTTTATCGATTAAAATGATGAAATTAATCAATATCT
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>LITCHI022117.m1 - Up_Stream_Len 2000 AGTCCCTGAAGTATTTAAAATTACAATTTTTTTCTAAAAGTATAAAAAGTTTTCGTATAC ACCCCTACATGATTTAAAAACTTTTCATTTATACCCTTAACAGTACTTCTTCCTAACAAA ATATGATTAAATTAATGCATTTTAATTATTTATTTTTAGTTCTAATAATTTGTAATATTA ATTTACAATTTTAAAAAAATCATTATTTTAAAATAATTTATAATAAAGTCATCATTTGTT TTTAAATGATTTAATAAATAACCAAAAAAATAGAAATTGAAATCGATTTATTTTTAAAGC AATGTGTTAAGATTTCTAGTTACTTAAAAAATCTGTTTTGAGAAAAAGTTATGTGTTAAA TTAAATACATATTAACTAATGTATTCATAATTTCTTAATTTTTAAGACATTGTATTTTAA ATAATGGATTTTTAATTTATTTTTAAATCGGTTTTAAAAAATAAATATGTCACTAGTGAT ATCTTTGTACATTTTTGTAGTAGTGATGATAATCACTATATTTTATTTTGGATCAAATAT TTTATAGAATTTATGAGCATTTTTTAACATAAACAAATTCTTTCTTTTTCATTTATGTAA TCATAAACAATTTTGTTTTTAATTATTTTTAAAGTTGGGGTTTCTCACAGCCTGACAAAA TCAATATTCAATAATTTATAAATATGTCATAATGTAATTTCACTAAACTAGACAATTCAA CCATTTCCTTTATATTCGATCATTATTACTGTAACAATATGGTTTTAAATGTAAGTAAAT TGAAAAGCTAGCTCTGTTTGTTTTAAATAAAGCATACCTTAGATAGATAATTTGTACTTA AGTCAAATAATAATTATTTTTTTATGTTTGAAGTGGTATGTAATTAGTCATTATGATGTT AAATAAAATAAATTTCAAAATTAAATTTATTTATATCAATTTAAAATATCGGGTTTTAGC AACGTGCAGTCATGCACGTTGCTAAAAGATGGGTTTTTAGCAACGTGAAGCCATGCACGT TGCTAAATGATGGGTTTTTAGCAACGTGCAGCAATGCACATTGCTAAAGGACCATTCTTT AGCAACGTGCAGCCTTAACGTTACTAAAAGTTGCCAAAAGGTGGGCTTTTGGCAACGTGC AGAGCTGCACGTTGCCAAAAGATGAGGTTTTGGCAACTTGCATCCATGCACGTTGCCAAA AGAGGGGTTTTTAGCAACGTGCATGGTCTTGCACGTTGCCATATGTCCTTTATTTTCAGC AACATGCGTTTGCACGTTGCCGTAGATCTCTTTCGCAACGTGTAGTCTTTGCACGTTGCT GTAGATGACCTATGGCAACGTGAACCTGATGCACGTTGCCTTTTGAACGTTGCTATAGCC TAAATTTCTTGTAGTGCTGATATTAAAACAGCTGAAATGATTAATAAATTTAAGATCAGA CCAATCAAATTGGTTTAAAAGTCTTTATGTGTTTGTTAATCAACTATTTGAATACGCCAC TAGCCAGTAATAAGCAATTTGTCTTCGGATATAAATTTCACATCTGCAGATGAAGTTGTG ACAATGAAATTTCCGCTAAAAATATATATCTTGATTAACAATCATAAAATCTCTCATATT TTAATAATGTACTGATTTATTTCATTTAATTATCTTCATGTGAGAAGTCCTTTATCATAT TTTAGTAGTCCAAATCAGGCATACGTGTTTGAAATTGAGGGCATGAATCAATTTGTAGAG AGTAGAGTGCATGCATTTGAATTCAACAATCGCATTTAATTGGATTTTAGCCGGCCAAAG CAGGCAAATTGGCCGGCCACCACTTATTATTTTACACTCACTTTTTCTCATTTATTTCTT CAATATCTTCCTCTTCTCACTCGTGATTCACCTATATATATCTCTACTTCTTCCTCTTGT CAATTTCAATATTTCTTCACACATATAGAAATAGAACCCATTAACACAATAACCCTAGCT AGAACTCAAATTTTGGAACC
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>LITCHI023438.m1 GenomeSequence + ATGATGAAGAAGAGACAAGTGGTAGTTAAAAGAGATGCATCCGGCAAAAGTTCAAGTACT TCCTCCTCAATGATTAGATGCGTTCGATATGGGGAGTGCCAAAAGAATCATGCGGCCAAT ATCGGAGGATATGCTGTGGATGGTTGCAGAGAATTCATGGCAAGTGGCGAGGAAGGGACC AGCGCGCTTACATGCGCTGCTTGTGGCTGTCACAGGAACTTCCATAGAAGGGAAGTGGAA ACTGAGGTAGTTTGTGAGTATTCTCCACCTAATTCTAATTGAAAAAAACTTATATAACTA GAGAAAAAGAAAAGGGGAGGCCGTCTTATATATGAATTAACTGATTGCTGTTATTTGTTC TAGATTGCTGTTTTGATCTTTTGTCATCATCAACAGATACACTATTTGTATCAAAAGGAA AACAAAATTGAACTTCAACCACCGTGTGCTTGA