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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI022104 | Chr10 | 3688664 | 3693646 | - | Transcription factor GLABRA 3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI022104.m1 | 16 | 200 | PF14215.9 | bHLH-MYC_N | Family | 187.8 | 2.20E-55 |
| LITCHI022104.m1 | 446 | 491 | PF00010.29 | HLH | Domain | 38.5 | 9.10E-10 |
| LITCHI022104.m2 | 16 | 200 | PF14215.9 | bHLH-MYC_N | Family | 187.9 | 2.00E-55 |
| LITCHI022104.m2 | 446 | 491 | PF00010.29 | HLH | Domain | 38.6 | 8.70E-10 |
| LITCHI022104.m3 | 267 | 312 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.1 | 6.00E-10 |
| LITCHI022104.m4 | 267 | 312 | PF00010.29 | HLH | Domain | 39.2 | 5.60E-10 |
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>LITCHI022104.m1 ATGGCTACTACTGGGGTTCAAAGCCACGAGAGGGTGCCAGAGAACTTGAAGAAACAGCTT GCTCTTGCTGTGAGAAGCATCCAATGGAGCTATGCTATATTCTGGTCCATTTCAGCTGGA CAACCTGGGGTGTTAGAGTGGGGTGATGGTTACTACAATGGAGATATCAAGACAAGGAAG ACAATTCAAGCAGTAGAACTCAATTCTGACCAGTTGGGTTTGCAAAGGAGTGAGCAACTA AGAGAACTATATGAGTCCCTTTCGGCTGGTGAGAGCAATCCACAATCCAGCAGAAGACCA TCAGCTGCATTGTCCCCTGAAGATCTCACTGATACTGAGTGGTATTATCTGGTTTGCATG TCATTTGTATTCAACATTGGTGAAGGATTGCCAGGAAGAGCATTGGCAAATGGTCAACCT ATCTGGGTATGCAATGCTCATTATGCTGATAGCAAAGTGTTCAGTCGTTCTCTGCTGGCT AAGAGTGCTTCTATTCAGACAGTACTATGCTTCCCATTTTTGCAAGGTGTAGTTGAACTG GGAACAACTGACCTGGTCTTGGAGGACCCCAGTTTCATTCAGCAGGTTAAGAGTTCATTC TTAGAGATTCCATATCCCGTAATTTCCGAAAAATTCAGTAGTGGTGCTGGAAAAATGAGA AATGACAATGATATTGCTCGTGCTTCTCTTGATCCGAAGATTCTTGACACCACAATGTTA CCAGTTATAGGATGTGAAGTCTTAGAAATGGCTTCTCCAAATGACAGTTCAAATGGCATA GAGCCTAATCAACCAGCAGAAGATTCATTTATGGTTGAAGGCATAAATGGGGTGGCTTCT CAAGTACAAAGCTGGCAATTTATAGAGGATGAGCTCAGTAACTGTATCCATCACTCCATG AATTCTAGTGACTGTATATCTCAAACTTTTGTCGATCCTGGAAAAGTTGTTTCTGCTGCT 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>LITCHI022104.m2 ATGGCTACTACTGGGGTTCAAAGCCACGAGAGGGTGCCAGAGAACTTGAAGAAACAGCTT GCTCTTGCTGTGAGAAGCATCCAATGGAGCTATGCTATATTCTGGTCCATTTCAGCTGGA CAACCTGGGGTGTTAGAGTGGGGTGATGGTTACTACAATGGAGATATCAAGACAAGGAAG ACAATTCAAGCAGTAGAACTCAATTCTGACCAGTTGGGTTTGCAAAGGAGTGAGCAACTA AGAGAACTATATGAGTCCCTTTCGGCTGGTGAGAGCAATCCACAATCCAGCAGAAGACCA TCAGCTGCATTGTCCCCTGAAGATCTCACTGATACTGAGTGGTATTATCTGGTTTGCATG TCATTTGTATTCAACATTGGTGAAGGATTGCCAGGAAGAGCATTGGCAAATGGTCAACCT ATCTGGGTATGCAATGCTCATTATGCTGATAGCAAAGTGTTCAGTCGTTCTCTGCTGGCT AAGAGTGCTTCTATTCAGACAGTACTATGCTTCCCATTTTTGCAAGGTGTAGTTGAACTG GGAACAACTGACCTGGTCTTGGAGGACCCCAGTTTCATTCAGCAGGTTAAGAGTTCATTC TTAGAGATTCCATATCCCGTAATTTCCGAAAAATTCAGTAGTGGTGCTGGAAAAATGAGA AATGACAATGATATTGCTCGTGCTTCTCTTGATCCGAAGATTCTTGACACCACAATGTTA CCAGTTATAGGATGTGAAGTCTTAGAAATGGCTTCTCCAAATGACAGTTCAAATGGCATA GAGCCTAATCAACCAGCAGAAGATTCATTTATGGTTGAAGGCATAAATGGGGTGGCTTCT CAAGTACAAAGCTGGCAATTTATAGAGGATGAGCTCAGTAACTGTATCCATCACTCCATG AATTCTAGTGACTGTATATCTCAAACTTTTGTCGATCCTGGAAAAGTTGTTTCTGCTGCT 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>LITCHI022104.m1 MATTGVQSHERVPENLKKQLALAVRSIQWSYAIFWSISAGQPGVLEWGDGYYNGDIKTRK TIQAVELNSDQLGLQRSEQLRELYESLSAGESNPQSSRRPSAALSPEDLTDTEWYYLVCM SFVFNIGEGLPGRALANGQPIWVCNAHYADSKVFSRSLLAKSASIQTVLCFPFLQGVVEL GTTDLVLEDPSFIQQVKSSFLEIPYPVISEKFSSGAGKMRNDNDIARASLDPKILDTTML PVIGCEVLEMASPNDSSNGIEPNQPAEDSFMVEGINGVASQVQSWQFIEDELSNCIHHSM NSSDCISQTFVDPGKVVSAAKDDKATDNGLQEVQEFNDTKLTSSDLRGNDLHYRSVLSAL LKTSHQLVWGPHFQNCNQESSFISWKKGWLRNCRKQRDGTPQKLLKKILFEVPLMNNNKL LESSEDNDFKDNVCRPEADEIATNLHVLSERNRREKLNERFVTLKSLVPSISKFDKVSIL DDTILYLKELERKVEELETRLELPELEGRTKRKSKDTAERISDNYGNNKISNGKKLLNKR KACDIVEMEPEIDYVVLKDGSTDDITISVNDKHVLIEIRCPWREGILLEIMDAVSNLHLD SHSVQSSTTEGILTVTIKSKYKGLNIASAGMIRQSLDRVIWKC. >LITCHI022104.m2 MATTGVQSHERVPENLKKQLALAVRSIQWSYAIFWSISAGQPGVLEWGDGYYNGDIKTRK TIQAVELNSDQLGLQRSEQLRELYESLSAGESNPQSSRRPSAALSPEDLTDTEWYYLVCM SFVFNIGEGLPGRALANGQPIWVCNAHYADSKVFSRSLLAKSASIQTVLCFPFLQGVVEL GTTDLVLEDPSFIQQVKSSFLEIPYPVISEKFSSGAGKMRNDNDIARASLDPKILDTTML PVIGCEVLEMASPNDSSNGIEPNQPAEDSFMVEGINGVASQVQSWQFIEDELSNCIHHSM NSSDCISQTFVDPGKVVSAAKDDKATDNGLQEVQEFNDTKLTSSDLRGNDLHYRSVLSAL LKTSHQLVWGPHFQNCNQESSFISWKKGWLRNCRKQRDGTPQKLLKKILFEVPLMNNNKL LESSEDNDFKDNVCRPEADEIATNLHVLSERNRREKLNERFVTLKSLVPSISKFDKVSIL DDTILYLKELERKVEELETRLELPELEGRTKRKSKDTAERISDNYGNNKISNGKKLLNKR KACDIVEMEPEIDYVVLKDGSTDDITISVNDKHVLIEIRCPWREGILLEIMDAVSNLHLD SHSVQSSTTEGILTVTIKSKV. >LITCHI022104.m3 MIRFFKVLEDPSFIQQVKSSFLEIPYPVISEKFSSGAGKMRNDNDIARASLDPKILDTTM LPVIGCEVLEMASPNDSSNGIEPNQPAEDSFMVEGINGVASQVQSWQFIEDELSNCIHHS MNSSDCISQTFVDPGKVVSAAKDDKATDNGLQEVQEFNDTKLTSSDLRGNDLHYRSVLSA LLKTSHQLVWGPHFQNCNQESSFISWKKGWLRNCRKQRDGTPQKLLKKILFEVPLMNNNK LLESSEDNDFKDNVCRPEADEIATNLHVLSERNRREKLNERFVTLKSLVPSISKFDKVSI LDDTILYLKELERKVEELETRLELPELEGRTKRKSKDTAERISDNYGNNKISNGKKLLNK RKACDIVEMEPEIDYVVLKDGSTDDITISVNDKHVLIEIRCPWREGILLEIMDAVSNLHL DSHSVQSSTTEGILTVTIKSKYKGLNIASAGMIRQSLDRVIWKC. >LITCHI022104.m4 MIRFFKVLEDPSFIQQVKSSFLEIPYPVISEKFSSGAGKMRNDNDIARASLDPKILDTTM LPVIGCEVLEMASPNDSSNGIEPNQPAEDSFMVEGINGVASQVQSWQFIEDELSNCIHHS MNSSDCISQTFVDPGKVVSAAKDDKATDNGLQEVQEFNDTKLTSSDLRGNDLHYRSVLSA LLKTSHQLVWGPHFQNCNQESSFISWKKGWLRNCRKQRDGTPQKLLKKILFEVPLMNNNK LLESSEDNDFKDNVCRPEADEIATNLHVLSERNRREKLNERFVTLKSLVPSISKFDKVSI LDDTILYLKELERKVEELETRLELPELEGRTKRKSKDTAERISDNYGNNKISNGKKLLNK RKACDIVEMEPEIDYVVLKDGSTDDITISVNDKHVLIEIRCPWREGILLEIMDAVSNLHL DSHSVQSSTTEGILTVTIKSKV.
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>LITCHI022104.m4 ACCATCGACCGACCACACATTAACAGGGTTACCTTCTCACTTGTTTAGATGTTCATGTGA CCCACTGATTTTGTACTGCGTCTCTCTCTCTCTCTATCTCCATATTACTTTGCTGTTTTG TATTGTAGACCGTTGGATCCAATCAACCACCCCAAACAACAGAATCTTAATACATGACAA TCTCATAATATGTGTGTGGATTTTTGATTTTTTAATATATATGTTGTTAAAGCTGAAAAA TTGATGAAGAAATGAAGCAAAAGACTTGCTGACAGAAATGAATGTTATTCTTTACTATTT TTTCTAACTCATTCGCTTGAAAGCAACTTTACTGTTTCCATCTGTTTGCCACTAAGTCCT CTCTATGGCCTTCGTTTGTTTGAGCTGGTTACTAATGGTCTTTGTGGTTTCTGATTGTAG GACCAAATGTTTGTGTTCCTCTTGGTCAGGTCTTTATTAGCTTCTTCATTTGTGTTTTCT GTGTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTTGCCCCCTCACAAAACCAAACAACTAGTAATATTAT ATAAGTATTAACACCTTTGTCTTTGTGTTTTGTTTTGGTTCACTTAAATAAGCTTCTTCT AGTGACAAAATTAGTGCTCATTTCATTTTTCTTGGGATTGAAAGTTGAAACTAAGATACT ATATTTCTATAGTTTTTCTTCAAGGTTATCTGGTTTTCGTACACAAACGGAAAAATTAAT TGCTATTAGTCCTCTCCATTCCCAGTGATGGACATTAGTGTATAAAAATTTCAGGTTCTG TGCCTTTATATTTAGTGTTTTATCAGATTCTCTTCATTTTTCAAGCGCCACAGCTACCCA AAAACCAACCCCATCTTGGTGAAACTCAAAGTCAAAGTTGTAGTCTTTTTCTTTCTTTTT TGCGTAAGAGAAGAGACCATGTTGGTTCTATGGTCTGGTCTGTCTCTGGTTTTGGAAGCA 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