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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021970 | Chr10 | 2554924 | 2557835 | - | High mobility group B protein 6 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021970.m1 | 182 | 247 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 39.9 | 5.30E-10 |
LITCHI021970.m1 | 184 | 248 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 62.5 | 3.90E-17 |
LITCHI021970.m1 | 298 | 365 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 52.6 | 5.60E-14 |
LITCHI021970.m1 | 300 | 366 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 64.6 | 9.10E-18 |
LITCHI021970.m1 | 422 | 492 | PF09011.13 | HMG_box_2 | Domain | 38.4 | 1.50E-09 |
LITCHI021970.m1 | 425 | 493 | PF00505.22 | HMG_box | Domain | 57.5 | 1.40E-15 |
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>LITCHI021970.m1 ATGGCTGGTGCTGCTGTTGTTGCCTCGACCCCCTCCAACGCCGACCCTGCTCCAACAAAG AAGCCAAGAAACAACAGGAAAGCCTTGAAACAAAAGAACCCATCAACAAATGCAGCCAAT ATCTTGGCTCAGGCCCTCTCTGCTCAGCCATCACAGTCTCCGATTTCGAACCCGCCTGAC ACTGATTCTTCCAAGGAGAACCATGATAGTCTCTCTCAGACCAAGAAGGCTGCAGCGAAG GGGAAATCGAAGCAGACAACCAAAAAGCAGGACTCTGTTGAGAAGGACTTGCAAGATTTG CAAGAAATGTTTGAGAAGATGAAGATAGAGAAGGAGAAGACGGAGGAGATGTTGAAGGAG AGAGATGAGATGTTGAAGATGAAGGAGGAGGAGCTTGATGTGAAGGGCAAAGAGAAAGAG AAGCTTCAGATGGAGTTGAAGAAGTTGCAGAAAATGAAGGAGTTCAAGCCTAACATGAGT TTCCCATTTGTTCAATCTTTGATGAACAACAAGGAGCAGGAGAAGAAGAAGAAGGGCTGT CCTGAGAAGAAAAGGCCATGTCCACCTTACATTTTGTGGTTTAAAGATCAATGGAATGAG GTCAAGAAGGAGAACCCGGAAGCGGAATTCAAGGAGATCTCAAACATTTTGGGTGCAAAA TGGAAGACCGTTAGTGCAGAAGAGAAGAAGCCTTATGAGGAGAAGTATCAGGCTGAGAAG GAAGCCTATTTGCAAGTAATGGCTAAGGAGAAGCGCGAAAGCGAAGCCATGAAGCTCTTA GAGGAAGATCAGAAACAAAAGACAGCTATGGAGCTGCTTGACCAATATCTCCAGTTCATG CAGGAAACAGAGAAAGATAACAAGAAGACCAAAAGGAAAGAGAAGGATCCATTGAAGCCA AAGCAACCCATGTCAGCATATTTCCTTTTCTCAAATGAGAGAAGGGCAGCTCTTGTAGCA AAGAACAAGAATGTTTTGGAGATAGCAAAGATCACTGGTGAAGAATGGAAGAATATGACT GAAAAACAAAGAGCCCCTTTTGAAGAGATGGCAAAGAAGAACAAGGAGAAATATAACCAA GAAATGGAGGCTTACAAGCAGATGAAGGAAGAAGAAGCTATGAATCACAAGATGGAAGAG GAGGAGCTAATGAAACTTCAAAAACAAGAAGCCTTGCAATTGCTCAAGAAAAAAGAAAAG ACTGACAACATAATCAAGAAAAACAAGGAGAAACGTCAGAAGAAGAAGCAGCAGAATGTT GATCCTAACAAGCCTAAGAAGCCTGCAGGATCATACCTTCTTTTCAGCAAAGAGACAAGG AAGGCTTTGTTGGAGGAGAGGCCAGGCACCAACAATTCTACCATCAATGCCCTGATTTCT GTGAAGTGGAAGGAATTGAGTGAGGAAGAGAAGCAAGCGTGGAATTCAAAGGCAGCCGAA GCAATGGAAGCATACAAGAAGGAATTGGAAGCATACAACAAGTCCATTGCAGGAGCCGCA TGTGACAAACAACAAACAGAAGAGAATAACAACAAAAACTCCATTGCAGGAGCCATGAAT GACAAACCAAAGAAGAAGTCTAATCGTGTGAAGGACTGTTAA
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>LITCHI010080.m3 GenomeSequence + CAAACACATCTTCTTTTTCTCTCTCAGTTGGAGAGGTCAGAACAGAAGTGCCTCAACTCT CAAATGCCATTAGACGACAAAAGCGGTTCATACCATATTTTATATTTTATATTTTTAAAT TATATTTTAAGACAAAAAAGGATAAAACTACATGGTACATTTATATGCATAGAATAGGCC ACAAGAATTAGACATTTGGACAATCTCTTTCCATCTCTCTGTTTTTATTTTATTTCTTGC TCTGCTTCTTTTCTGTGTGTGGAACCATGTGGTCATCTTCAGGTAGAAACAACGACAACA ACAACAATGGTAATGATAACAACAACAATAGAGTGTCTCTATCTCCTTCAAAATCCTCCT CTACCTGCTCTTCTCCATCGCCTTTCTCTCCATCTTCTCCAAACACAAACACATCAACCA GGAAGTCCATGGAAGAGGTCTGGAAAGACATCAACTTGGCTTCACTACATGACCATTCTG ATAATACTACCACGAACACCGCCACTAACCGCACCAGCTTTCCTGGATTGATATTCCAGG ACTTTTTCTCTAGACCTTCACCACATCCAACAACAACAACTACTAAACAGTCAAAAGCTG CTGCTGCTGCTTCTGCTGCTCTCTCCAATAATGAACCATCCTCTCCACTTGGAGACATCA CTGCCTCGTTTGGCTCCCTGGTGCCACCCAAAGCCACCATGTTGAGCTTGAATTCTTCTT CTGGGTGTGACTTCCAATTCCTCGAAAACAGTGGACCTACTAGGCCTAACCAAACCCAAC ATTTCCACCCACATGTTGGTGGTCTTGGTTCTTGCTCTTTTGGATCCTCTCAGAGCTCCC CATTTGATGCTCTTGGTTCTCCAACACCTTTCCACTCCTTTGGCAAGAAAAGGCCTCAAG 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