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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021970Chr1025549242557835-High mobility group B protein 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021970.m1182247PF09011.13HMG_box_2Domain39.95.30E-10
LITCHI021970.m1184248PF00505.22HMG_boxDomain62.53.90E-17
LITCHI021970.m1298365PF09011.13HMG_box_2Domain52.65.60E-14
LITCHI021970.m1300366PF00505.22HMG_boxDomain64.69.10E-18
LITCHI021970.m1422492PF09011.13HMG_box_2Domain38.41.50E-09
LITCHI021970.m1425493PF00505.22HMG_boxDomain57.51.40E-15
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>LITCHI021970.m1
ATGGCTGGTGCTGCTGTTGTTGCCTCGACCCCCTCCAACGCCGACCCTGCTCCAACAAAG
AAGCCAAGAAACAACAGGAAAGCCTTGAAACAAAAGAACCCATCAACAAATGCAGCCAAT
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PL.
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>LITCHI020771.m1
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AAAAATCTTTTGATTGCTGTTTATCATCACGTTATCTCTGTACGATTATTCACCCACTAT
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TCTTTTCTGTGTGTGGAACC
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TTTTACACTTCAAAACAAATTTTGAAAAACTTGACATTGACCTCCCTTGGACTTAACTTA
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GCCTTCGTTTGAGGTCATTACCTCCTTGTGAGGAGGTAGCAAGCCTCCCTTCTTGTAAGG
AGGTCTCTTGCGATTGCCTCCTCGTTGGAGGAGGCTATGGCGGTGACCTCCTTTTTCTTT
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TTTGAATATTTATATTAAGAATATTTTAATAATTTTTGTTGTATAAAGAGTAATATGGAT
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TCTTTTCTGTGTGTGGAACC
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GACGCACTTGCATTTCGTATCAGATCATGTGCAAGTTTTTATTGCTGTTGTGTGTTTCAG
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CTTTGTGTTTTGTGTTGTTGCGTTCCAAAAACGGCAAATGGACATACCCTGTGGTTAAAA
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>LITCHI010080.m2 GenomeSequence + 
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ATTTCCACCCACATGTTGGTGGTCTTGGTTCTTGCTCTTTTGGATCCTCTCAGAGCTCCC
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TGCAGTACTTGGCAGCATCTGAAAAGCTTCCAAAAAAGAACTCTCTCTATAGAACCTCAA
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ATAATGAATCATGATAAATGCTGAGGAGAGGAAGCATTTGTTGTTGTGTCTGTTTGGCTG
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>LITCHI010080.m1 GenomeSequence + 
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CAAATGCCATTAGACGACAAAAGCGGTTCATACCATATTTTATATTTTATATTTTTAAAT
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CTGCTGCTGCTTCTGCTGCTCTCTCCAATAATGAACCATCCTCTCCACTTGGAGACATCA
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CTGGGTGTGACTTCCAATTCCTCGAAAACAGTGGACCTACTAGGCCTAACCAAACCCAAC
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GAGAATGTTTAGTAAGTGTGTCTATGTGGGCATTTTATGGATTCCAATTAGATTGATGTT
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