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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021970Chr1025549242557835-High mobility group B protein 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021970.m1182247PF09011.13HMG_box_2Domain39.95.30E-10
LITCHI021970.m1184248PF00505.22HMG_boxDomain62.53.90E-17
LITCHI021970.m1298365PF09011.13HMG_box_2Domain52.65.60E-14
LITCHI021970.m1300366PF00505.22HMG_boxDomain64.69.10E-18
LITCHI021970.m1422492PF09011.13HMG_box_2Domain38.41.50E-09
LITCHI021970.m1425493PF00505.22HMG_boxDomain57.51.40E-15
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>LITCHI021970.m1
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AAGCCAAGAAACAACAGGAAAGCCTTGAAACAAAAGAACCCATCAACAAATGCAGCCAAT
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>LITCHI021970.m1
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GCGAAGCCATGAAGCTCTTAGAGGAAGATCAGAAACAAAAGACAGCTATGGAGCTGCTTG
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GAAGGGCAGCTCTTGTAGCAAAGAACAAGAATGTTTTGGAGATAGCAAAGATCACTGGTG
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TGCTCAAGAAAAAAGAAAAGACTGACAACATAATCAAGAAAAACAAGGAGAAACGTCAGA
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TTTTCAGCAAAGAGACAAGGAAGGCTTTGTTGGAGGAGAGGCCAGGCACCAACAATTCTA
CCATCAATGCCCTGATTTCTGTGAAGTGGAAGGAATTGAGTGAGGAAGAGAAGCAAGCGT
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CCATTGCAGGAGCCATGAATGACAAACCAAAGAAGAAGTCTAATCGTGTGAAGGACTGTT
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AATGAAATTCTATTTACAATTCAAATTATCAACTCATAGGCTATGACACAGAACATAAAC
GGCACGCTAATTTGTCACTGTTAACGTTTTGATGATTTGATGTGACCATGTTTCCAATAT
CTTACATTAGTGTATGGCTATTAAGTTTTGATAGGATGTTGATGGATTTGGCTTATTATT
AATGTCTATTTA
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>LITCHI021970.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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AGCCCCCTGTCAGTTTCAGTTTGTCCGGTTACATGGTTAAATAAAGAGTACATTAAGTGG
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GTAGTTTAGTTGACTTCATATAACAAAGTTAACACTCAAAACTCATAAAAATATTTCTTC
TTATTATATTTCTAATCTGTTTTTGATCATCTTCAGGTAGAACAAGCTGTTGAAGTTTAC
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GTTATTTGGTCCCCTTTCCTTGCAAAAGCTGCAACCTTTGAAGATAACAATGGTGTTTCA
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TTTGATTTTGCATACAGTAAAACCCTCAGTTCTGTTCTGAACTTCATAGCCACATCCAAA
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GTTCAAAAAGATTGTTTGCATTGGTGCCTACCTGGCCCCATAGATGCCTGGAATGATGTG
ATAATGGAGATGATTGTTGACAGTTGAAAAGAATTTGGCTCTAATTCATACCACTTTAAA
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TTAATTTGTAACCCATGTTGTTGTTATTATAGACTTATTATTCAAAATGCTAGTTGTTAG
CAGTGATTGATTGTATTGTATATTCTGGTACTGGGGAAGCTTGATAGTGTTAAAAGCTAC
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ATGTTTGACCAAGCATTTAAACTCCAATTGGTAACTATTTAAAACGCCAAAAAAGTATAA
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TTTGATCCTTTTATGGGAAGTTGATGCCAAATTACTAGCATAGAAGGAGCCTCACTCCAA
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AAAATCCGACCGTTGCAGTTCTTCTATATAAAGCCCCTCCTCTGTCTATCAACGTTACTA
GAACTTTTCATTTGTTTAGTTTCTCTGTTTTTTTCTCTCCTTCTCTCTCTCTTTTTCTCT
CTATATCTGTGTCTGGAGCC
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>LITCHI015371.m1 GenomeSequence - 
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GAAACTTGCTCAATACGATAATGGAAAAAAAAAAAGAAATAAAAAACAGGAAGCAGGTGG
GATGCGAGGAGGTAAAAGATTTAATTGAATCGAACCGAAGCAATAAAAACAAAGAAAACA
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CCACCCTTCCCTTTCATTTCACCTTCCTACAAAAACAACGGCGCGAGCGAGCGACCGCAT
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ATTTCTCTATATATCCATTCTCATTCCTTCTTCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTT
TTTTTAATTTTTAATTTTCCAGCTCACGCGTCTGTTCTCTTGAAGATTTGCAAGAGGGAA
AAAAATAATATAATAACGAAAAATTAATAAAAAACCTCAAAAGCAGATTTTTTTTTTTCT
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AAGCGGCGCGGTTTGGCCGGGTTTTCTTCGGTGGTTTCTGCTTTTATATGTTGTTAGATA
TCTCTCATTTTGTCCTGGGATTTGTGGGTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTTTATAACCT
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TTTGAGTGATTGAGCTGGGTTGTGTAAAATGAAGGAGAGGGAGGCACTGAATATGTAAAT
ACATGAGACTGCATGTTAATGGAAATATAAGATCTGACTGTTGGTGCGATTAGAAATCTC
GGTTCTTGGTCCCAGTGGGGATGTGGGTTTTCAGGTATGTGTTTTTTTATTTATAAATTT
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TTTCTTGGTTCGTCCAAGTGAATATGTTTTACTATTTTTAGCGGAAATCTTTGGCGTGGG
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CTATTTGGAAATTAATGAATGATGGGGATGTGTGAGAAATCTAAGAAATTGAGAAGGAAA
AGCGAATTGGAAATTTATTGCTGTTTGGAATTGGTTGTGTTAGATCTTAATTTAATGGTG
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TGTTTATTTGTTTGCATACAGGACATGAGAATTGAAGATTTGGGTTGTTAATATGGTTCT
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AGAATGGATTGAAGAAGCTGGCAGTCCAGTTTTGGATGCAATGTTAAAGACATTAGCTCC
TGGGCTGTTGGTTTGTGCAGTTCTAGTATCTGTTTCGGTGGCTGATAATGGGTTTCCAAG
ATGTAATTGTGATGATGAGGGTAGCTTGTTGACAGTTGAAAGCATCCTAGAAATCCAGAA
AGTGAGTGATTTCTTGATAGCTGTGGCCTATTTTTCGATTCCAATTGAGCTGCTTTACTT
TGTTAGCTGCTCGAATGTACCGTTCAAATGGGTCCTCTCTCAGTTCATTGCCTTCATTGT
TTTGTGTGGGATGACTCATTTTTTCAATGGCTTCAGCTACAGCCCTCACTCGTTTCAGCT
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TCAGGTGATACTGCATATGGTTGGGAACCTGTTGAATTACAACAAGAGAGGAGGGACTAT
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GAAAGCTTTGTTCTAAGTTTATATATTAAAGCTAAAAAGGGAATTGATATTTTATTTTTG
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TTGGTTTCAAAACCTCCAACCCAACCCTGGCTTTTGGTTTGTAGGATTATTTTAATGGGA
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TTGTCTATCCGTCGCTTTTTGTTCTATCAATTTCTTCCAAGAGCAATTTCTTGGAAAGTG
GTAGAATTGGTGGGGTGCCTCTGTTTTAATATCATTATTAGCTACAACAATGCTTGGTTT
AACACTTGTCTGAGTGTCAACGTTGGTTGATTATCATCATCTTAGGCATTTTATTGTCCT
TTGGTCCCACCATCTATTTTCCCTTTAAATTCTTCTTCTTTTTTAACTGTCATTTAAAGT
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>LITCHI015371.m6 GenomeSequence - 
AGAAAACTATGAATTTCAACCCAAAATTGTAATTATCTGTACATGTAGATGCTATTTCAT
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AAAAACAAAGAAAACAAAATACAAGAAAAATCAAATTCAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAGA
AAGAAAGAAAGAAACGTCTTTGTGTTGTTTGAGAGGGAGAGAGAAAATAAAACAAATCTT
TTTGGGTCTGACGAGGACGTTTTGGTTCAAAAGAGCGTCCAAGTTCTCTTCATGTAACAA
AGTGGGCCCCACCTCCCCACCCTTCCCTTTCATTTCACCTTCCTACAAAAACAACGGCGC
GAGCGAGCGACCGCATTACTCATACAACTATTTTCTCTCTCTAAAAAATCTAAATATTTT
CTCTCTCTCTCTCTCAATTTCTCTATATATCCATTCTCATTCCTTCTTCCTTCTTTTTTT
TTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTTAATTTTCCAGCTCACGCGTCTGTTCTCTTGAA
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AGATTTTTTTTTTTCTTGCTGGTACCTATAAAAGGCAGGTGGAGAAGTCTTGAGGAAAGT
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TCTGTCTCAGCGCTTTAAGCGGCGCGGTTTGGCCGGGTTTTCTTCGGTGGTTTCTGCTTT
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CGAAATGGAGTGCTGCTTTGAGTGATTGAGCTGGGTTGTGTAAAATGAAGGAGAGGGAGG
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TGCGATTAGAAATCTCGGTTCTTGGTCCCAGTGGGGATGTGGGTTTTCAGGTATGTGTTT
TTTTATTTATAAATTTATGTTATTTTTATTGTGCATTTTTGGTTATGTTTTCGTGGGTTT
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GAAATTGAGAAGGAAAAGCGAATTGGAAATTTATTGCTGTTTGGAATTGGTTGTGTTAGA
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GAAAAGATTGTGTAAAAGAATGGATTGAAGAAGCTGGCAGTCCAGTTTTGGATGCAATGT
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CTCACTCGTTTCAGCTAATGTTGACCCTCACTGTGTTCAAGATCCTCACTGCTTTAGTCT
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AACAGAAAGAGACTGGAGTGCATGTTCGAATGCTTACGCAAGAAATTCGCAAGTCACTTG
ATAGGCATACAATCTTGTACACAACTTTGGTTGAGTTATCCAAGACTTTGAATTTGCAGA
ATTGTGCGGTTTGGATGCCTAATGAGATTAAAACGGAGATGCATTTGACTCATGAGTTGG
ATGGGAGGAATTATTCGAATTTATATAATCGTCCCATACCAATTACTGATCCAGATGTTG
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CAAGTAGTGGGGAGTCTGGTGAGCCAGGTCCTGTAGCTGCAATCAGGATGCCGATGCTTG
GAGCTTCAAATTTTAAAGGCGGAACTCCTCCAGAGCTTGTCCCGACTTGTTATGCAATAT
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ACGCCATCATGGCAAGCCAGGCAAGAAATGCCTTTCAGAAGGTAATGAGCGATGGAATGA
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GTGACCAACAAATGATTGTTGATACAATGATGAAAACCAGCAATGTACTGTCGACTTTGA
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CTTTCAGCTTACATGCTTTGATAAGAGAAGCTGCATGCCTAGCAAGGTGCTTGTGCATTT
ACGAGGGCTTTGGGTTTTCAATTGAGGTTGAGCGGTCCTTGCCTGATCATGTTATGGGTG
ATGAAAGGAGGGTTTTTCAGGTGATACTGCATATGGTTGGGAACCTGTTGAATTACAACA
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AAGCTATTCTCTACTTGAATCATGTCATGTCATGATAGGTTAAAACTTTTTGCTCTTTTT
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ACTTAAGCCTTTTTTTGTCTAATTTGATTAGTGATATATGTTGTTCAGTGATTTATGCTG
TGTGCTCTTTGTGAGTATATGTTGGAACCCATTTTTATCTAATGGTGGCTGTGCTGCCTA
GTTCCAGCTTCCAATGAGCTGTGTTTTACTATTATGGTCTTTTAAATGCAAATGTTTAAT
AGGTTTTTATTTGCACATAGGGAAAGTGGTCATTTATAACTGGTGTAGTCTCTGTTTTTT
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>LITCHI015371.m5 GenomeSequence - 
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>LITCHI015371.m4 GenomeSequence - 
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TCAGGTGATACTGCATATGGTTGGGAACCTGTTGAATTACAACAAGAGAGGAGGGACTAT
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TTTGAT
>LITCHI015371.m3 GenomeSequence - 
AAAAGCACGCGCCTGTTGGCACGGAGCTCGAAAGAAAATCCACAAGTTGCCACGTGGAAT
GAAACTTGCTCAATACGATAATGGAAAAAAAAAAAGAAATAAAAAACAGGAAGCAGGTGG
GATGCGAGGAGGTAAAAGATTTAATTGAATCGAACCGAAGCAATAAAAACAAAGAAAACA
AAATACAAGAAAAATCAAATTCAGGAAAAAAAAAAAAAAGCAGAAAGAAAGAAAGAAACG
TCTTTGTGTTGTTTGAGAGGGAGAGAGAAAATAAAACAAATCTTTTTGGGTCTGACGAGG
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CCACCCTTCCCTTTCATTTCACCTTCCTACAAAAACAACGGCGCGAGCGAGCGACCGCAT
TACTCATACAACTATTTTCTCTCTCTAAAAAATCTAAATATTTTCTCTCTCTCTCTCTCA
ATTTCTCTATATATCCATTCTCATTCCTTCTTCCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTT
TTTTTAATTTTTAATTTTCCAGCTCACGCGTCTGTTCTCTTGAAGATTTGCAAGAGGGAA
AAAAATAATATAATAACGAAAAATTAATAAAAAACCTCAAAAGCAGATTTTTTTTTTTCT
TGCTGGTACCTATAAAAGGCAGGTGGAGAAGTCTTGAGGAAAGTCGAAGCATAAAGAAAA
AGCCAAGGTTTTGGTTTGTTACATCATCACCGTCTGCTCTTATATCTGTCTCAGCGCTTT
AAGCGGCGCGGTTTGGCCGGGTTTTCTTCGGTGGTTTCTGCTTTTATATGTTGTTAGATA
TCTCTCATTTTGTCCTGGGATTTGTGGGTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTTTATAACCT
GAACTGGGGGGTGCCAGTTACCTAACTGGTATATAAAAAAGCAACGAAATGGAGTGCTGC
TTTGAGTGATTGAGCTGGGTTGTGTAAAATGAAGGAGAGGGAGGCACTGAATATGTAAAT
ACATGAGACTGCATGTTAATGGAAATATAAGATCTGACTGTTGGTGCGATTAGAAATCTC
GGTTCTTGGTCCCAGTGGGGATGTGGGTTTTCAGGTATGTGTTTTTTTATTTATAAATTT
ATGTTATTTTTATTGTGCATTTTTGGTTATGTTTTCGTGGGTTTGCCGTTTCTGTTTTGA
TTTCTTGGTTCGTCCAAGTGAATATGTTTTACTATTTTTAGCGGAAATCTTTGGCGTGGG
ATTTTTTTTTTCCTTTTTTTGTTTGTTTGTTTATTTATTTATTATTGTTATTGGTTAGTA
TATGTTACATGTCCTTTCGGGTGAGGAAAAGGTGTTGTGTTGTTGTTCATCATTACTGTG
CTATTTGGAAATTAATGAATGATGGGGATGTGTGAGAAATCTAAGAAATTGAGAAGGAAA
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ATATGGATATTTTTGTGCCCAAAGTTTAATGGTGTTTTCAATTTTTGTTGAACTGGTTGT
TGTTTATTTGTTTGCATACAGGACATGAGAATTGAAGATTTGGGTTGTTAATATGGTTCT
AGTTGAAGGAAGATTTGGTTCTTAGTCCGCGAAATTTGGTTGTTGAAAAGATTGTGTAAA
AGAATGGATTGAAGAAGCTGGCAGTCCAGTTTTGGATGCAATGTTAAAGACATTAGCTCC
TGGGCTGTTGGTTTGTGCAGTTCTAGTATCTGTTTCGGTGGCTGATAATGGGTTTCCAAG
ATGTAATTGTGATGATGAGGGTAGCTTGTTGACAGTTGAAAGCATCCTAGAAATCCAGAA
AGTGAGTGATTTCTTGATAGCTGTGGCCTATTTTTCGATTCCAATTGAGCTGCTTTACTT
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TTTGTGTGGGATGACTCATTTTTTCAATGGCTTCAGCTACAGCCCTCACTCGTTTCAGCT
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AACTCTGATTACTCTCATCCCTTTGCTTCTCAAAGTGAAGGTGAGAGAATTCATGTTGAA
GAAAAAGGCTTGGGATCTTGGGCGGGAAGTTGGGATTATAATGAAACAGAAAGAGACTGG
AGTGCATGTTCGAATGCTTACGCAAGAAATTCGCAAGTCACTTGATAGGCATACAATCTT
GTACACAACTTTGGTTGAGTTATCCAAGACTTTGAATTTGCAGAATTGTGCGGTTTGGAT
GCCTAATGAGATTAAAACGGAGATGCATTTGACTCATGAGTTGGATGGGAGGAATTATTC
GAATTTATATAATCGTCCCATACCAATTACTGATCCAGATGTTGTTATGATCGAGAGGAG
TGATGGGGTGAATATCCTGGGGCCTAACTCCCTGCTTGCTATGGCAAGTAGTGGGGAGTC
TGGTGAGCCAGGTCCTGTAGCTGCAATCAGGATGCCGATGCTTGGAGCTTCAAATTTTAA
AGGCGGAACTCCTCCAGAGCTTGTCCCGACTTGTTATGCAATATTAGTTTGTGTTCTTCC
TAGTGGACAGTCTAGAACTTGGAACAATCAGGAAATAGAGATAGTTAAGGTGGTTGCTGA
TCAGGTGGCTGTGGCACTCTCTCATGCTGCAATTCTTGAAGATTCTCAGCACATGAGGGA
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AATTTTGGGCTTGCTTTCAATTATGCAGGATGGGAATTGGAATGGTGACCAACAAATGAT
TGTTGATACAATGATGAAAACCAGCAATGTACTGTCGACTTTGATAAACGACGTAATGGA
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TTCAATTGAGGTTGAGCGGTCCTTGCCTGATCATGTTATGGGTGATGAAAGGAGGGTTTT
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AATGTTTCGAGTTGTCTCAGATAGTGGAAGTCAGGAGAGGAATGATCAAAGATGGGCGAC
TTGGAGGCAAGGCTCCAATGATGGGGATGTATATATAAGATTCGAAATTGGGATCCACAA
TAGTGGTTCGCAAGCAGAGTGCTCAACTTCATTGGTGCAGGTTGGTAGTAGGAGGTTTGC
CAGTGATGGAATTGAAGATCGTCTGAGCTTCAGCATTTGCAAAAAGCTAGTGCAGGTGAG
AATGGTAAATATAAGTGCATTTGCATGTTTATGGGTGATTGGATGCAAAGTAAATTTTAG
TTTTCATTTTGGATGTTAGAAACTACAAAACAGATTTAACTGTTAAGCTATTCTCTACTT
GAATCATGTCATGTCATGATAGGTTAAAACTTTTTGCTCTTTTTAAATGATTCTCTTCGT
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TATTTTAAGGTCCAAGACTATAGACTTTTTATGTAGGATAGGATACTTAAGCCTTTTTTT
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