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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021855 | Chr10 | 1564768 | 1575807 | + | Probable RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021855.m1 | 1 | 215 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 120.1 | 1.00E-34 |
LITCHI021855.m1 | 3 | 219 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.4 | 8.50E-49 |
LITCHI021855.m1 | 707 | 1055 | PF01137.24 | RTC | Domain | 153.4 | 5.40E-45 |
LITCHI021855.m1 | 874 | 1002 | PF05189.16 | RTC_insert | Domain | 87.9 | 6.00E-25 |
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>LITCHI021855.m1 ATGAGTTTGATTGATCATCCAAATGTCATAAGGGCATATTGTTCGTTTGTCGTTGATAGT AACCTTTGGGTGGTCATGCCATTCATGGCAGAGGGCTCATGTTTACATCTTATGAAGATA GCATACCAAGACGGATTTGAAGAGGCTGCGATTGGTTCTATTTTGAAAGAAACTCTTAAG GCTCTAGATTATCTTCATCGACAAGGACATATTCATCGGGATGTTAAGGCTGGAAATATA CTACTTGACAGTAATGGTGTTGTAAAGCTTGCTGATTTTGGTGTTTCAGCTTGCATGTTT GATACAGGTGATAGACAACGTGCAAGAAATACTTTTGTGGGGACTCCATGCTGGATGGCT CCTGAGGTGTTGCAGCCAGGAAGTGGATATAATTCCAAGGCTGATATTTGGTCATTTGGC ATAACAGCACTGGAGTTGGCTCATGGCCATGCACCTTTTTCCAAATACCCACCAATGAAG GTTCTTCTGATGACCATACAAAATGCTCCTCCTGGACTTGATTATGATCGTGATAAAAAG TTCTCTAAGAGGATTTCCAGTTGTGATCAGTCCTTTAAAGAAATGGTTGCTATGTGCTTG GTGAAAGATCAAACCAAGAGGCCGACTGCTGAGAAGTTACTAAAACACTCATTTTTCAAG CACGCAAAACCTCCAGAACTTTCTGTGAAGAAATTGTTTGATGACTTGCCACCACTTTGG AGTCGTGTGAAACAACTTCAGCTTAAAGATGCTGCACAACTAGCTCTTAAAAAAATGCCT TCAGCAGAACAAGAAGCTATATCACAGAGTGAGTATCAAAGAGGAGTTAGTGCTTGGAAC TTTGATATTGAGGATTTGAAAGCTCAAGCCTCACTCGTGCGAGATGATGATGATATGCCA GAGACCAGGGAAGACGATGATAGCACAAAAGAATTTGTTGCTGATAAGGTCGCTGCAGCA GATTCTAAATTGACTTTTGGGAAATCAAATGCTAATGTAGAGTTATATCGGTTTGAATGT AAAGGAAAAAGTGATCAACCACAGCAATCTGAGTGCTTGAACAGAGAGGGGAAGATTCTG GAAGTTGATTCGCTAGAATCTGGAATCCAAGAAAAAGTTGTTCTGAAGAAAAGTGGATCA AGCACTGAGGCAATGGCTTCAACTTCGGAGAAGGACTTGATGCCAGCCAAGGTTAAAACA GTGAAAACTCGTCAAACTCAGAGTGGGCCTCTCATGCCTGGTGTTGTACTTAGTCATTCA GCATCAGAAAGGGGGCGTAGCTCAGACAGGTTTGAGAATGATAATCAACCAATTGACAAA GCTAAAAGTGACGTTCGAAGAGCACCAAGCTTTAGTGGTCCTTTGATGCTTCCGAATCGA GCTTCAGCAAACAGTTTATCAGCTCCCATAAAATCTTCAGGAGGTTACAGAGATTCTATG GATGACAAGTCGAAGGCTAATCTTGTGCAAATTAAAGGGCGTTTCTCAGTAACGTCAGAA AATTTAGATCTTGCAAAGGATATTCCATTAAGTTCCGTTCCCCGTCGATCACAGGGGTCA CCTCTGAGGAAATCTGCAAGCGTTGGTGATTGGATATTTGAATCCAAACCATCGCCACCT AATCAACCCCCTACAGAAATGAGCAACGGTAATATGCCCCCATCACTCCTTATGCCTCAT CTTCAGAGTCTTCTTCAACAGACATCACTCCAACAGGATCTTATTCAGAGTTTATTGAAT AGCTTGCAACCGGCTGAGGCTGTAGATGCTTCTCAAAACGGAAAGTTGCCCCCACTGCCT CGTTGCCCAGAGAACAATGGAAGTATTCTCTGCCTCTCATGGTTAAGTAGTACAAGTAAC TTCCTCCTCTCTGATCTGCACATTTGGCAGGTTGAAACTGTGGCCTCTGAGAGAGAACGT TCACTGCTTCTCAAGATTTCTGAGCTACAATCTAGGATGATCAATTTGAATGATGAACTG ACTGCTGAAAAGTCAAAATACATACAACTTATAGATGCTGCACAACTAGCTCTTCTGAAA AAGGCCTTCAGCAAGCTATATCAAGTCTCTCTCAAAAATGGAGAAGACAACGTAAAAGAA GCTAAAGGGAAGCCAGAACTGGTACTGTCTGCGCTCACTTCCACTCCTATTCTCTTGGAG GACATTCGCGCCGATGACACGTGGCCTGGTCTCCGCCTCCACGAGGTCTCACTCCTCCGC CTCATCGAGAGAGTCTCCGATGACCGCCTCATCGAAATCAACGAAACCGGGACAAAATTG AAATACAAGCCAGGGACAGTGATTGGAGGGAAAAATCTAGTCCACGACTGCGGTGTTAGT CGGTCCATTGGCTATTTCTTGGAGCCATTGATTCTGCTGTCATTGTTCGCTAAGAAACCT CTTTCGATCAGGCTTAAAGGAATTACAAATGATTTTAAGGACCCATGTGTCAACACTTTC CGTTCTACTACTTTCCCCATGTTGAAGCGTTTTGGGGTGCTGTCTGAAGGACTGGAGTTG AAGATAGAGAGCCGTGGAGCTCCACCTCTTGGTGGTGGAGAAGTTATTTTGACAGTTCCC ACTGTTGAAAATTGTGCTCTACAGGCAGTGACCTGGCTCAGTGAAGGGATGGTTAAAAGG ATTAGAGGAGTTACCTTCTCCTCAAGAGTGTCTGCTCAGTTTGAAAATGCTATGATCTGT GCCGTTTGTGGAATCTTCAATTGCTTGCTTCCAGATGTTCACATCTTCACTGATCATAAA TCTGGGCCTCAAGCTGGAAAGCACAGTTCATCTAATAAAGAAAAGCTATTTCATGGGAGG TCTCCTGGTTATGGGATATCACTGGTTGCAGAAACTACTTCTGGTTGCTACATTTCTGCT GATACTGCGGTTTCTTATGCACTAGGAGAAGTTTGTGAAATTGAAGATGAGGAGAAGAAA GAGCTAACTCCACCATCAGAAGATGTTGGCAAGCGAATTGCGTCATTTCTTCTAGAACAG ATTGAGCTAGGTGGTGTCGTGGATTTGACACGCCAGGGTCTGCTGTTTCTACTCTGTGCC TTAAGTGAACTGGATGTTTCTAAGGTTCTTCTTGGGAAGTTGTTGCCGTATGCTATTGAA ACACTCAGAAGCATAAGAGACTTTCTGGGTGGAAGATTTGACATTAAAGAGGATCCATCG ACAGGAATTGTTATATGTCTATGTATGGGATGCGGCTGTAAGAACCTATCCGGAAAAGTT TCATGA
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>LITCHI021855.m1 TGGCCATTGGTTAGTATGTTTCTGGTTGAAAAGCAGGTGAGAATTCAGTATCACTTTTCA GGGATAAAGCACAAGAATAACATTTTTAAGTTCAACAGCCTTATTCTGCTCAGTGTAATT TTATTATAGCTGTTGGAAGTTTGTTCGGAGATTTGGGTGATATGAAAGTTGATTGCTTTG TTTTAATGGTGGATCTTCTTGATCGTTTCCTGGCCTGCGTAGAGAAAAGAACAAGAACAG GGTGCAATGCTCAAGAGGGGACCGTGAACAAAATCTTCAAGTTATACATCCTTCTGGTTT AATGTTGTAGGGGAGGATTTAGGGAAGCCGATGACATTCGACGGGAGGCTCAGACTATGA GTTTGATTGATCATCCAAATGTCATAAGGGCATATTGTTCGTTTGTCGTTGATAGTAACC TTTGGGTGGTCATGCCATTCATGGCAGAGGGCTCATGTTTACATCTTATGAAGATAGCAT ACCAAGACGGATTTGAAGAGGCTGCGATTGGTTCTATTTTGAAAGAAACTCTTAAGGCTC TAGATTATCTTCATCGACAAGGACATATTCATCGGGATGTTAAGGCTGGAAATATACTAC TTGACAGTAATGGTGTTGTAAAGCTTGCTGATTTTGGTGTTTCAGCTTGCATGTTTGATA CAGGTGATAGACAACGTGCAAGAAATACTTTTGTGGGGACTCCATGCTGGATGGCTCCTG AGGTGTTGCAGCCAGGAAGTGGATATAATTCCAAGGCTGATATTTGGTCATTTGGCATAA CAGCACTGGAGTTGGCTCATGGCCATGCACCTTTTTCCAAATACCCACCAATGAAGGTTC TTCTGATGACCATACAAAATGCTCCTCCTGGACTTGATTATGATCGTGATAAAAAGTTCT CTAAGAGGATTTCCAGTTGTGATCAGTCCTTTAAAGAAATGGTTGCTATGTGCTTGGTGA AAGATCAAACCAAGAGGCCGACTGCTGAGAAGTTACTAAAACACTCATTTTTCAAGCACG CAAAACCTCCAGAACTTTCTGTGAAGAAATTGTTTGATGACTTGCCACCACTTTGGAGTC GTGTGAAACAACTTCAGCTTAAAGATGCTGCACAACTAGCTCTTAAAAAAATGCCTTCAG CAGAACAAGAAGCTATATCACAGAGTGAGTATCAAAGAGGAGTTAGTGCTTGGAACTTTG ATATTGAGGATTTGAAAGCTCAAGCCTCACTCGTGCGAGATGATGATGATATGCCAGAGA CCAGGGAAGACGATGATAGCACAAAAGAATTTGTTGCTGATAAGGTCGCTGCAGCAGATT CTAAATTGACTTTTGGGAAATCAAATGCTAATGTAGAGTTATATCGGTTTGAATGTAAAG GAAAAAGTGATCAACCACAGCAATCTGAGTGCTTGAACAGAGAGGGGAAGATTCTGGAAG TTGATTCGCTAGAATCTGGAATCCAAGAAAAAGTTGTTCTGAAGAAAAGTGGATCAAGCA CTGAGGCAATGGCTTCAACTTCGGAGAAGGACTTGATGCCAGCCAAGGTTAAAACAGTGA AAACTCGTCAAACTCAGAGTGGGCCTCTCATGCCTGGTGTTGTACTTAGTCATTCAGCAT CAGAAAGGGGGCGTAGCTCAGACAGGTTTGAGAATGATAATCAACCAATTGACAAAGCTA AAAGTGACGTTCGAAGAGCACCAAGCTTTAGTGGTCCTTTGATGCTTCCGAATCGAGCTT CAGCAAACAGTTTATCAGCTCCCATAAAATCTTCAGGAGGTTACAGAGATTCTATGGATG ACAAGTCGAAGGCTAATCTTGTGCAAATTAAAGGGCGTTTCTCAGTAACGTCAGAAAATT TAGATCTTGCAAAGGATATTCCATTAAGTTCCGTTCCCCGTCGATCACAGGGGTCACCTC TGAGGAAATCTGCAAGCGTTGGTGATTGGATATTTGAATCCAAACCATCGCCACCTAATC AACCCCCTACAGAAATGAGCAACGGTAATATGCCCCCATCACTCCTTATGCCTCATCTTC AGAGTCTTCTTCAACAGACATCACTCCAACAGGATCTTATTCAGAGTTTATTGAATAGCT TGCAACCGGCTGAGGCTGTAGATGCTTCTCAAAACGGAAAGTTGCCCCCACTGCCTCGTT GCCCAGAGAACAATGGAAGTATTCTCTGCCTCTCATGGTTAAGTAGTACAAGTAACTTCC TCCTCTCTGATCTGCACATTTGGCAGGTTGAAACTGTGGCCTCTGAGAGAGAACGTTCAC TGCTTCTCAAGATTTCTGAGCTACAATCTAGGATGATCAATTTGAATGATGAACTGACTG CTGAAAAGTCAAAATACATACAACTTATAGATGCTGCACAACTAGCTCTTCTGAAAAAGG CCTTCAGCAAGCTATATCAAGTCTCTCTCAAAAATGGAGAAGACAACGTAAAAGAAGCTA AAGGGAAGCCAGAACTGGTACTGTCTGCGCTCACTTCCACTCCTATTCTCTTGGAGGACA TTCGCGCCGATGACACGTGGCCTGGTCTCCGCCTCCACGAGGTCTCACTCCTCCGCCTCA TCGAGAGAGTCTCCGATGACCGCCTCATCGAAATCAACGAAACCGGGACAAAATTGAAAT ACAAGCCAGGGACAGTGATTGGAGGGAAAAATCTAGTCCACGACTGCGGTGTTAGTCGGT CCATTGGCTATTTCTTGGAGCCATTGATTCTGCTGTCATTGTTCGCTAAGAAACCTCTTT CGATCAGGCTTAAAGGAATTACAAATGATTTTAAGGACCCATGTGTCAACACTTTCCGTT CTACTACTTTCCCCATGTTGAAGCGTTTTGGGGTGCTGTCTGAAGGACTGGAGTTGAAGA TAGAGAGCCGTGGAGCTCCACCTCTTGGTGGTGGAGAAGTTATTTTGACAGTTCCCACTG TTGAAAATTGTGCTCTACAGGCAGTGACCTGGCTCAGTGAAGGGATGGTTAAAAGGATTA GAGGAGTTACCTTCTCCTCAAGAGTGTCTGCTCAGTTTGAAAATGCTATGATCTGTGCCG TTTGTGGAATCTTCAATTGCTTGCTTCCAGATGTTCACATCTTCACTGATCATAAATCTG GGCCTCAAGCTGGAAAGCACAGTTCATCTAATAAAGAAAAGCTATTTCATGGGAGGTCTC CTGGTTATGGGATATCACTGGTTGCAGAAACTACTTCTGGTTGCTACATTTCTGCTGATA CTGCGGTTTCTTATGCACTAGGAGAAGTTTGTGAAATTGAAGATGAGGAGAAGAAAGAGC TAACTCCACCATCAGAAGATGTTGGCAAGCGAATTGCGTCATTTCTTCTAGAACAGATTG AGCTAGGTGGTGTCGTGGATTTGACACGCCAGGGTCTGCTGTTTCTACTCTGTGCCTTAA GTGAACTGGATGTTTCTAAGGTTCTTCTTGGGAAGTTGTTGCCGTATGCTATTGAAACAC TCAGAAGCATAAGAGACTTTCTGGGTGGAAGATTTGACATTAAAGAGGATCCATCGACAG GAATTGTTATATGTCTATGTATGGGATGCGGCTGTAAGAACCTATCCGGAAAAGTTTCAT GA
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>LITCHI021855.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTCATGATATTTGAGTTTATATATATTTACGGATATATATATATATGAAGGATTTTTTTA CAGAAATTTCGAATAATATATATAACAACCTCTTTAACATTACTTTCAAATCAATTTATA ATTATTTAAAAATAACGATACTATTTGATCTTAATATAATACAATCTCTTTTTATGGACT TGCAGCATGTAAACTAAAATTTAGACAGAAAATTTCTATGGCTTCAGAAAATAAAAAGAC AGAAAATTAATATATTTATTATAAATTTGTGGATTTGACTTATCAATCATCTCAATTTTA AAATCAATATTCACATTATTTAATTACAATATTCATGAATAATTTTAATTTATTTTCCCG CAGGAACGTGATAGATGGGGCCAATTACCCCGTGATGATGATGCTTGACTCCACGTGTAA CGATCCCAATCACCTAAAACCATCGCGCCACGTCAGCTTTTCACCTCGTCTCGTCTTCGC TCCCCGTTCAATCCCCCAAAAGCACCACAAAAAAGGGGAAAAAAAAAAAATCAAAAATCA AAACGCAGTCGCATTCTCTCTCTCGCTCTCTCTATCTCAGTCCATCTGTCTCTATACGTA ACTCTCTCGCTCTATCTCTCGATGCCGGTCAACGGATCGAAACTCTATATTTGAAATCGA CGAACTGCTTGTCTGTTCTTGTTTGCTGCGGCGGCTCCGGTGGTGGTGTTCTAGTAAAAT CGCGTTTGTTCTCTTTGTTAGCGATTGCCATGGGAAGGATGGGAGGCAGCAGTCACGGTC GGAATCCTCGGCCGTACTCGGCGAATCACAGTGACTACAAGCTTCTAGAGGAGGTCGGTT ACGGTGCCAGCGCAACGGTCTATCGAGCGATCTATTTGCCTTTGAACGAAGTTGTTGCTG TCAAGTGCTTGGATCTCGATCGCTGTAATAGTAATCTGGTCAGTGCTGCTCTCTTGTTTC GAACTTCTCGTTGTTTTTGAAATCTAGTATGTAGTTTCATGGATTCGTGTTTGATTGATT TTTTTTTACTTGCTTGCCATAAGTGAATTGTTTGGAGCTAAATTAAATTTGATTGATTGA CTTTAAGTGGAATAGTTTGAGACTGGAGCTTGCTTGTTGTTACCGTTATGGAGGTTTTCT ATATGCTGGAATTGTTTGGATGAAAATTGTTTTGTTTTTGTTTTCCCTTTCTCCTTTTTT TTTTTGTTATTTTTGGTGGATTTTTAAGTTTGTTAACTTGTTTCGGTGGATTTTGAGTAT GGTTGTTACTTGTTTTATTTATTTATTTTTTAAATTTTTTTTGAAGTGTGTAGGTATGTT ATGGGTTGTTTGGGTGCCATGTTTTAAGTTGTTTTCTTGCTAATTGAAAGTAGAGACTGA AGTGTTTATGAGCTTGTTGTGTTAAGAGATGGGTGTGGATTGTTGCAAAGTTTGTTAAAG CTGTACAAGGAAATTCAGTGGATCTTTAGTTAGGGAACGTGACCAGTTTTAACTAAAAGC AAGTAGGAATTGGCCATTGGTTAGTATGTTTCTGGTTGAAAAGCAGGTGAGAATTCAGTA TCACTTTTCAGGGATAAAGCACAAGAATAACATTTTTAAGTTCAACAGCCTTATTCTGCT CAGTGTAATTTTATTATAGCTGTTGGAAGTTTGTTCGGAGATTTGGGTGATATGAAAGTT GATTGCTTTGTTTTAATGGTGGATCTTCTTGATCGTTTCCTGGCCTGCGTAGAGAAAAGA ACAAGAACAGGGTGCAATGCTCAAGAGGGGACCGTGAACAAAATCTTCAAGTTATACATC CTTCTGGTTTAATGTTGTAGGGGAGGATTTAGGGAAGCCGTGAGTGGAGAGTTCATCAGT TTTATCTATAAGTTTAATGCAGGATGTTTTCTATTTTTCTTGTTTTAGAGTATTAACAAA CTCCTTCGTTTTCCTCTTAACTTGTATGTTTAATGAATTGTGTTCTTTTGCAGGATGACA TTCGACGGGAGGCTCAGACT
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>LITCHI021855.m1 GenomeSequence + TGGCCATTGGTTAGTATGTTTCTGGTTGAAAAGCAGGTGAGAATTCAGTATCACTTTTCA GGGATAAAGCACAAGAATAACATTTTTAAGTTCAACAGCCTTATTCTGCTCAGTGTAATT TTATTATAGCTGTTGGAAGTTTGTTCGGAGATTTGGGTGATATGAAAGTTGATTGCTTTG TTTTAATGGTGGATCTTCTTGATCGTTTCCTGGCCTGCGTAGAGAAAAGAACAAGAACAG GGTGCAATGCTCAAGAGGGGACCGTGAACAAAATCTTCAAGTTATACATCCTTCTGGTTT AATGTTGTAGGGGAGGATTTAGGGAAGCCGTGAGTGGAGAGTTCATCAGTTTTATCTATA AGTTTAATGCAGGATGTTTTCTATTTTTCTTGTTTTAGAGTATTAACAAACTCCTTCGTT TTCCTCTTAACTTGTATGTTTAATGAATTGTGTTCTTTTGCAGGATGACATTCGACGGGA GGCTCAGACTATGAGTTTGATTGATCATCCAAATGTCATAAGGGCATATTGTTCGTTTGT CGTTGATAGTAACCTTTGGGTGGTCATGCCATTCATGGCAGAGGGCTCATGTTTACATCT TATGAAGATAGCATACCAAGACGGATTTGAAGAGGCTGCGATTGGTTCTATTTTGAAAGA AACTCTTAAGGCTCTAGATTATCTTCATCGACAAGGACATATTCATCGGGATGTTAAGGT CTGCTAGGCATGGAAGTTTGGCATTATGTTTTTGGATGGCCTGTGAACACCTTTTCATTG AATTACTTTTGCCATGCTCTTAAGCTCCTTTTGTTTTAATTGTTTTACAGGCTGGAAATA TACTACTTGACAGTAATGGTGTTGTAAAGCTTGCTGATTTTGGTGTTTCAGCTTGCATGT 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