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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021855Chr1015647681575807+Probable RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021855.m11215PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain120.11.00E-34
LITCHI021855.m13219PF00069.28PkinaseDomain166.48.50E-49
LITCHI021855.m17071055PF01137.24RTCDomain153.45.40E-45
LITCHI021855.m18741002PF05189.16RTC_insertDomain87.96.00E-25
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>LITCHI021855.m1
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AACCTTTGGGTGGTCATGCCATTCATGGCAGAGGGCTCATGTTTACATCTTATGAAGATA
GCATACCAAGACGGATTTGAAGAGGCTGCGATTGGTTCTATTTTGAAAGAAACTCTTAAG
GCTCTAGATTATCTTCATCGACAAGGACATATTCATCGGGATGTTAAGGCTGGAAATATA
CTACTTGACAGTAATGGTGTTGTAAAGCTTGCTGATTTTGGTGTTTCAGCTTGCATGTTT
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ACAGGAATTGTTATATGTCTATGTATGGGATGCGGCTGTAAGAACCTATCCGGAAAAGTT
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>LITCHI021855.m1
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AATGTTGTAGGGGAGGATTTAGGGAAGCCGATGACATTCGACGGGAGGCTCAGACTATGA
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ACCAAGACGGATTTGAAGAGGCTGCGATTGGTTCTATTTTGAAAGAAACTCTTAAGGCTC
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CAGAACAAGAAGCTATATCACAGAGTGAGTATCAAAGAGGAGTTAGTGCTTGGAACTTTG
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TTGATTCGCTAGAATCTGGAATCCAAGAAAAAGTTGTTCTGAAGAAAAGTGGATCAAGCA
CTGAGGCAATGGCTTCAACTTCGGAGAAGGACTTGATGCCAGCCAAGGTTAAAACAGTGA
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CAGAAAGGGGGCGTAGCTCAGACAGGTTTGAGAATGATAATCAACCAATTGACAAAGCTA
AAAGTGACGTTCGAAGAGCACCAAGCTTTAGTGGTCCTTTGATGCTTCCGAATCGAGCTT
CAGCAAACAGTTTATCAGCTCCCATAAAATCTTCAGGAGGTTACAGAGATTCTATGGATG
ACAAGTCGAAGGCTAATCTTGTGCAAATTAAAGGGCGTTTCTCAGTAACGTCAGAAAATT
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TGAGGAAATCTGCAAGCGTTGGTGATTGGATATTTGAATCCAAACCATCGCCACCTAATC
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GCCCAGAGAACAATGGAAGTATTCTCTGCCTCTCATGGTTAAGTAGTACAAGTAACTTCC
TCCTCTCTGATCTGCACATTTGGCAGGTTGAAACTGTGGCCTCTGAGAGAGAACGTTCAC
TGCTTCTCAAGATTTCTGAGCTACAATCTAGGATGATCAATTTGAATGATGAACTGACTG
CTGAAAAGTCAAAATACATACAACTTATAGATGCTGCACAACTAGCTCTTCTGAAAAAGG
CCTTCAGCAAGCTATATCAAGTCTCTCTCAAAAATGGAGAAGACAACGTAAAAGAAGCTA
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TTCGCGCCGATGACACGTGGCCTGGTCTCCGCCTCCACGAGGTCTCACTCCTCCGCCTCA
TCGAGAGAGTCTCCGATGACCGCCTCATCGAAATCAACGAAACCGGGACAAAATTGAAAT
ACAAGCCAGGGACAGTGATTGGAGGGAAAAATCTAGTCCACGACTGCGGTGTTAGTCGGT
CCATTGGCTATTTCTTGGAGCCATTGATTCTGCTGTCATTGTTCGCTAAGAAACCTCTTT
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GAGGAGTTACCTTCTCCTCAAGAGTGTCTGCTCAGTTTGAAAATGCTATGATCTGTGCCG
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GGCCTCAAGCTGGAAAGCACAGTTCATCTAATAAAGAAAAGCTATTTCATGGGAGGTCTC
CTGGTTATGGGATATCACTGGTTGCAGAAACTACTTCTGGTTGCTACATTTCTGCTGATA
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TCAGAAGCATAAGAGACTTTCTGGGTGGAAGATTTGACATTAAAGAGGATCCATCGACAG
GAATTGTTATATGTCTATGTATGGGATGCGGCTGTAAGAACCTATCCGGAAAAGTTTCAT
GA
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>LITCHI020909.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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AAAAAAACTCTGATCTCTGCTTGCATCTCCTCCAAACCTAGTAAAAAGTTTAATTTTAAA
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CTCTCCTCCTCCGCATTCTCACAACCAAACGACATTTCCTAGGGTTAGGGTTTTGATAAT
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>LITCHI020909.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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TCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTCAAAATAATTTTTTCAAGATAAGTAGATGGA
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AACACATTACTCAACATGTCATACTTCTCCAGAGCTTCTTCAAAACCCTCATTATTGTTC
CTCTCCTCCTCCGCATTCTCACAACCAAACGACATTTCCTAGGGTTAGGGTTTTGATAAT
CAAATTCCAAAGCTTAGAAA
>LITCHI020909.m6 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI020909.m5 -  Up_Stream_Len 2000
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>LITCHI020909.m4 -  Up_Stream_Len 2000
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CAAATTCCAAAGCTTAGAAA
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CAAATTCCAAAGCTTAGAAA
>LITCHI020909.m7 -  Up_Stream_Len 2000
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CAAATTCCAAAGCTTAGAAA
>LITCHI020909.m10 -  Up_Stream_Len 2000
AATACAGTCATTATCCAGAGCTTTAGATCAGTACAACAAGGCACACATTGCTTGATTGTT
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CAAATTCCAAAGCTTAGAAA
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>LITCHI020909.m2 GenomeSequence - 
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CTCTTCTAAGTTTGAGAGAGTTGCTAGAAACAGATTAAGATTTGTTGGGTTATTGAATTT
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CCTTACCAGAAAAAGGCTGATAAGTGATTACATTGTGTTAGACGGTTGCCTTGCGGTTGA
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GTTTCAACTCGAGTGTTGGGCACCCAGGGATATGTTGCCCCGGAGTATGAAACAACAAAA
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TGTATTAAAATCCATTTAAATATAACTCAATTTATGAATGGCTGTGTTTAATGTATAGGT
ATGCATTAACTGGGCATCTCACGACAAAATCAGATGTGTACAGTTATGGGGTTGTACTTC
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TTGTATCTTGGGTAAGTTTCTTTTCTTTTTTCTTCAGTAAACTTGAGTGCAATCGAATGA
TTAGTTCATAGTGTCATGAGAACCGATCTCATTCTATTTAAACCAAGTTAATATGATCAG
TTATCCTAACTTTGTCTCTCATATTTGTTTAGGCACAACATTTGAAAATGCTATTTAATG
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CTAAACTATTTGTCATATCCTTTTCATCCTCCAATTCCTTTCTATGGCTGCAAAAGGCAT
TGCCTCGGTTGACAGATAGAGAGAAGCTTATAGAGATTATGGATCCAGCATTGGAGGGTC
AATATTTGATGAAGGAGGTTATTCAGGTGGCGGCTATTGCTGCAATGTGCGTACAACCTG
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ATAACAGGTCAACTCCAAAAATGGGCAGCTCCCCAAGCTTCCATGCCACCCCTAACTCCT
CAGCGTCACATGATCCCAGTAGAGCTAGTGGGTGAAATTTTATATGACGCAAGTCTTATT
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TCTATGATCTTTATTTATCTTTCTGAGAAGTAACAGTTAGTACTGTAATTTATGCTCTCT
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TTGTGTCTTTAGTAATTAGGTGACATCTACAGATTCAAAGGAATTTGTTTTCTGATCACG
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TGTTTTGACTTCAATGCACCGTTTCAGTTCCA
>LITCHI020909.m1 GenomeSequence - 
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GGATCAATTTAGTATAGGATCTATCCATATTCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTC
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>LITCHI020909.m6 GenomeSequence - 
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TGTTTTGACTTCAATGCACCGTTTCAGTTCCA
>LITCHI020909.m5 GenomeSequence - 
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GGATCAATTTAGTATAGGATCTATCCATATTCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTC
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>LITCHI020909.m4 GenomeSequence - 
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GACTTGGGGATTGCCGGAAGGTGCATGGTGATTAGTTGGTATTGTTTTAATCGCAGGTGG
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CAGCAGAACTGGAGTCAGAGTTAGCTATGCAGCTTTTGTTTTATTTCTTTGTAGTCTTGC
TCTTTTTGCTCATATGGGGGTTCTTTTTGTCTGTTCGTATCAATTGTATATTTTGATAGG
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CTCTTCTAAGTTTGAGAGAGTTGCTAGAAACAGATTAAGATTTGTTGGGTTATTGAATTT
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CCTTACCAGAAAAAGGCTGATAAGTGATTACATTGTGTTAGACGGTTGCCTTGCGGTTGA
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CATGCCAAAGTTTCTGATTTTGGACTGGCGAAGCTGGGATCTGAAAAGGCCGGTGGGCAT
GTTTCAACTCGAGTGTTGGGCACCCAGGGATATGTTGCCCCGGAGTATGAAACAACAAAA
CCTTAGCTCCAATCTTATTGAATCTACCTAGTGTTATTCTGAAGATGGTCCACTATTATT
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ATGCATTAACTGGGCATCTCACGACAAAATCAGATGTGTACAGTTATGGGGTTGTACTTC
TGGAGTTGCTTACAGGCAGAGTTCCTGTTGATTCTAAGAGACCACCTGGAGAAGGAGTTC
TTGTATCTTGGGTAAGTTTCTTTTCTTTTTTCTTCAGTAAACTTGAGTGCAATCGAATGA
TTAGTTCATAGTGTCATGAGAACCGATCTCATTCTATTTAAACCAAGTTAATATGATCAG
TTATCCTAACTTTGTCTCTCATATTTGTTTAGGCACAACATTTGAAAATGCTATTTAATG
ATTGAGCCTCCACCCAATGCTAATTTACTTTCAGGATGGATATCTTAATATTATCTAGTC
TGAATGATCTTTCACCTCCATTTAAAGTACCAACAACAATAAAAGTTTAATTACCATGCA
AGATATGCATAGTTAATAATCAACAAAACAAATTACATAAAAATCTGGTGTACAATACAC
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CTAAACTATTTGTCATATCCTTTTCATCCTCCAATTCCTTTCTATGGCTGCAAAAGGCAT
TGCCTCGGTTGACAGATAGAGAGAAGCTTATAGAGATTATGGATCCAGCATTGGAGGGTC
AATATTTGATGAAGGAGGTTATTCAGGTGGCGGCTATTGCTGCAATGTGCGTACAACCTG
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CAGCGTCACATGATCCCAGTAGAGCTAGTGGGTGAAATTTTATATGACGCAAGTCTTATT
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TCTATGATCTTTATTTATCTTTCTGAGAAGTAACAGTTAGTACTGTAATTTATGCTCTCT
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ATATAAATTATTTGTTAAATGGCTGGCTGTCTAAAGATATGTTAAATGCTTAACCAAATT
TGTTTTGACTTCAATGCACCGTTTCAGTTCCA
>LITCHI020909.m3 GenomeSequence - 
ATTTATTATGTATAATATTATAATTGATACATATTAGGTTTTAATATGAATTTTTTTTTG
GGATCAATTTAGTATAGGATCTATCCATATTCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTC
AAAATAATTTTTTCAAGATAAGTAGATGGATTAAAAAAAAAAGAATTCTCAAAAAAATTC
AAACAAATAGAAGAAAAACATAATGCCAAGAAAATTAGAAAAAGAGATGCAAGACAGCAA
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AGAGCTTCTTCAAAACCCTCATTATTGTTCCTCTCCTCCTCCGCATTCTCACAACCAAAC
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>LITCHI020909.m9 GenomeSequence - 
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>LITCHI020909.m8 GenomeSequence - 
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GGATCAATTTAGTATAGGATCTATCCATATTCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTC
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TGTTTTGACTTCAATGCACCGTTTCAGTTCCA
>LITCHI020909.m7 GenomeSequence - 
ATTTATTATGTATAATATTATAATTGATACATATTAGGTTTTAATATGAATTTTTTTTTG
GGATCAATTTAGTATAGGATCTATCCATATTCACATGTTTAATAATTATAAAAAAATCTC
AAAATAATTTTTTCAAGATAAGTAGATGGATTAAAAAAAAAAGAATTCTCAAAAAAATTC
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ATTATAATGCTGTTTAATTTGAAAGATTAAATATATAATTACTTGTGTTCTTGTTCCGTG
GTGTGGAGATGAGTCCTATATTGTTTAATGTGGTTGTGGTTGTCTGCATTTGAAGGAGTT
GATCGTGAGGACAAAGGTGACTCCGGAAATTTGCAAGTTAGTACTGATAAAGGACTTCAG
GTGTTCACTTTCAAGCAGCTGCATTCGGCAACTGGTGGTTTCAGCCAGTCGAATGTGGTT
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TCTCAATTTTGCGTCTTTTTGTAATTGAATGTAGCACTATGTGTGATGTGCTGGCGTTTT
GACTTGGGGATTGCCGGAAGGTGCATGGTGATTAGTTGGTATTGTTTTAATCGCAGGTGG
AATTGCTTAGTCGGCTGAGATCACCATATTTGCTGGCTTTGCTTGGATATTGTTCTGATA
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CAAAATTAATTGTTAAGTTGTGTTATCAAATCTTAGCATTTATACCCAAACAAACTTAAT
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CAGCAGAACTGGAGTCAGAGTTAGCTATGCAGCTTTTGTTTTATTTCTTTGTAGTCTTGC
TCTTTTTGCTCATATGGGGGTTCTTTTTGTCTGTTCGTATCAATTGTATATTTTGATAGG
TCGACTTTGTTGATTGGCCATGTTAGTGGACAGTTTGTTGACTCTTTTTGGTTTATGGAG
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AAATAACAAATGAGAACAAATTGTTAAGGAAATAATAGTTTTTCCAACAAAGGTAGTCTG
CCTGAAGTTAGGCCAGGTTTAGAAGGTTAGAGAAATTTGCTTACTTTTTCAATACACCTA
GCAGAGTTATCAGTTAGGTATAGAGCTCAAGGTGAGTACTAGAGCATCATATAGATGAAT
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CTGGATATTTGTGTTATAATGGGATTGGAGTTTTCAATCTTGAGCCAATTCAAGTTTATT
TTGCATTATTCTGTTTTCTGTTCCTAACTCCTTTATTCTAGACTTTTTAAGAGGCAGCTT
CTCTTCTAAGTTTGAGAGAGTTGCTAGAAACAGATTAAGATTTGTTGGGTTATTGAATTT
TTTATTTGGGAACACATCATCATTTTAGAATCATCTTGTTGTATGACTCTGTGTAACAGT
CCTTACCAGAAAAAGGCTGATAAGTGATTACATTGTGTTAGACGGTTGCCTTGCGGTTGA
AATTTACTGGAGCTAAAACATGCAGGTGCTAACTCGGTTGCCCTAAAATTGGACTGGGAA
AGCCGTCTTAAAATAGCTCTTGAAGCTGCTAAGGGTTTGGAATATCTCCATGAACATGTT
AGTCCACCAGTCATTCACAGAGATTTTAAGAGCAGCAACATTCTCTTGGACAAAAATTTC
CATGCCAAAGTTTCTGATTTTGGACTGGCGAAGCTGGGATCTGAAAAGGCCGGTGGGCAT
GTTTCAACTCGAGTGTTGGGCACCCAGGGATATGTTGCCCCGGAGTATGAAACAACAAAA
CCTTAGCTCCAATCTTATTGAATCTACCTAGTGTTATTCTGAAGATGGTCCACTATTATT
TGTATTAAAATCCATTTAAATATAACTCAATTTATGAATGGCTGTGTTTAATGTATAGGT
ATGCATTAACTGGGCATCTCACGACAAAATCAGATGTGTACAGTTATGGGGTTGTACTTC
TGGAGTTGCTTACAGGCAGAGTTCCTGTTGATTCTAAGAGACCACCTGGAGAAGGAGTTC
TTGTATCTTGGGTAAGTTTCTTTTCTTTTTTCTTCAGTAAACTTGAGTGCAATCGAATGA
TTAGTTCATAGTGTCATGAGAACCGATCTCATTCTATTTAAACCAAGTTAATATGATCAG
TTATCCTAACTTTGTCTCTCATATTTGTTTAGGCACAACATTTGAAAATGCTATTTAATG
ATTGAGCCTCCACCCAATGCTAATTTACTTTCAGGATGGATATCTTAATATTATCTAGTC
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