Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021833Chr1013494291352217-Transcription factor MYC4

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021833.m126223PF14215.9bHLH-MYC_NFamily154.82.90E-45
LITCHI021833.m1323368PF00010.29HLHDomain43.91.90E-11
Download   Copy
>LITCHI021833.m1
ATGGACGAGATTATGTCTACATCTTCTTTTTCTCTATTTCCCGTGCCTTTTTCACAAGAT
CAAACCTCTGCAACTCTTCAACAACGCCTCCAAGTCATCCTTCAAAGCCGGCCAGACTGG
TGGGTCTACACGATTTTCTGGCAGCCTTCGAAGGATGTCAATGGCCGGCTTGTATTGTCA
TGGGGTGACGGCCTTTTCCGCGGCAACAAGGATTCTGCGAGAGGACCACCAGCCAACAGC
AACAAGCAAGGTGGTCATCATCATCATCAACAACGACAACAACCACCCAAATTCGGGTTC
GATTTGGAGAGTAAGAAGGTGGCCACCAGAGGTTTCCAAGCTCATTTCAACGATGACATG
GAGTTGGAGCATATGGTGAACGGTGGCAGCGACGTCACCGACTGTGGATGGTACTATACA
TTGTCCGTAACTCGATCTTTTGGAATTGAAGCCGGTGTTCTTGGGAGGACTTTTAGCTCC
GGAGATTTTGTTTGGCTTAGTGGTGATAGTGAGCTCCAATTTTACGCGTGTGAGAGAGTC
AAAGAAGCCCGTACGTATGGGATCCAAACGTTGGTCTGCATTTCAACTTCAAGTGGGGTT
GTGGAATTGGGGTCTTGTGACGTGATCAAACAAGACTGGAGCACAGTCGAATTAGCCAAA
TCCCTTTTCGGGCCAGACATTGCCGGTAGTCTGCTTCTGAAACAGCAACCAAATCGTGAT
CAGGTCCAAGTTCAAATCCCACCTCGGAACAATAGTGTTCATCTACTTGACATGGTGTTT
TCACTTGAAGAGAAGCAACAACATGACACTGAAGTAATCAAGAAGGAGCTAACCGGATTA
GGACGGTCGTCTTCTGACTCCGGTCCATCTGATTCGGATGGGAACTTTGCATCTGCTTTT
ACTGATAACTGTAGGTCAAGGAAGAGAGGAAGAAAGCCTGCTGCTAGCGGAAAAGAATCA
CCTTTAAACCATGTTGAAGCTGAGAGGCAGCGACGTGAGAGGCTTAATCACAGATTCTAT
GCACTTAGGTCTGTTGTCCCAAACGTGTCCAAAATGGATAAGGCCTCTCTATTGGCTGAT
GCGGTTACCTACATCAAGGAACTCAAGGGCAAGATCGATGAATTAGAGAGCAAATTAGTC
CATGAACAGCCAAGAAGACAAAAGGCTGCGTCTGTGTTAGCTGCTAGGAATATCTACGAC
AACAACCAAAGCAATTGCTCAATAAACGAGCACACGAGGCCCGTTTCAAGTCATCATTCT
GTGAAAGCGATGGATGTGGATGTGAAGATTGTGGGATCAGAAGCCATGATACGCGTTCAA
TGTCCGGACACGAACTACCCAGCTGCAAAGTTGATGGACGCTCTTAGAAACCTTGAGTTT
CATGTTCATCATGCTAGTGTGTCAAGCGTCAAAGAGCTAATGCTTCAAGATGTTGTGGTC
AAAGTTCCCGAGGGAATGATCTCCGAGGATGTCATGAGAGCAGCTATTTATCAAATGATG
CAAAACTAG
Download   Copy
>LITCHI021833.m1
MDEIMSTSSFSLFPVPFSQDQTSATLQQRLQVILQSRPDWWVYTIFWQPSKDVNGRLVLS
WGDGLFRGNKDSARGPPANSNKQGGHHHHQQRQQPPKFGFDLESKKVATRGFQAHFNDDM
ELEHMVNGGSDVTDCGWYYTLSVTRSFGIEAGVLGRTFSSGDFVWLSGDSELQFYACERV
KEARTYGIQTLVCISTSSGVVELGSCDVIKQDWSTVELAKSLFGPDIAGSLLLKQQPNRD
QVQVQIPPRNNSVHLLDMVFSLEEKQQHDTEVIKKELTGLGRSSSDSGPSDSDGNFASAF
TDNCRSRKRGRKPAASGKESPLNHVEAERQRRERLNHRFYALRSVVPNVSKMDKASLLAD
AVTYIKELKGKIDELESKLVHEQPRRQKAASVLAARNIYDNNQSNCSINEHTRPVSSHHS
VKAMDVDVKIVGSEAMIRVQCPDTNYPAAKLMDALRNLEFHVHHASVSSVKELMLQDVVV
KVPEGMISEDVMRAAIYQMMQN.
Download   Copy
>LITCHI021833.m1
AACAATTCACATACCCGTTTGGGTTCATGATTGTACAATAACTTGGACACGTTTATAATG
GTTTTTGATAGTGAAACATAAGACAGTAACCAGGAAGCAGTTCTACGTTTTGTGTCACTT
TTATATGACCTCGACGTTGCTTAGTTTCCAAACCCCTACAATCACTCCTTCCTTCTCTTT
TTCTAATTTTTTTCTCTCTTGATTGATCACTACTCTTTCAAAGACACAAAGAGCATAAAA
AGAAAACACACACACACACACACACACAAAGAGAGACGGAGTAACATGGACGAGATTATG
TCTACATCTTCTTTTTCTCTATTTCCCGTGCCTTTTTCACAAGATCAAACCTCTGCAACT
CTTCAACAACGCCTCCAAGTCATCCTTCAAAGCCGGCCAGACTGGTGGGTCTACACGATT
TTCTGGCAGCCTTCGAAGGATGTCAATGGCCGGCTTGTATTGTCATGGGGTGACGGCCTT
TTCCGCGGCAACAAGGATTCTGCGAGAGGACCACCAGCCAACAGCAACAAGCAAGGTGGT
CATCATCATCATCAACAACGACAACAACCACCCAAATTCGGGTTCGATTTGGAGAGTAAG
AAGGTGGCCACCAGAGGTTTCCAAGCTCATTTCAACGATGACATGGAGTTGGAGCATATG
GTGAACGGTGGCAGCGACGTCACCGACTGTGGATGGTACTATACATTGTCCGTAACTCGA
TCTTTTGGAATTGAAGCCGGTGTTCTTGGGAGGACTTTTAGCTCCGGAGATTTTGTTTGG
CTTAGTGGTGATAGTGAGCTCCAATTTTACGCGTGTGAGAGAGTCAAAGAAGCCCGTACG
TATGGGATCCAAACGTTGGTCTGCATTTCAACTTCAAGTGGGGTTGTGGAATTGGGGTCT
TGTGACGTGATCAAACAAGACTGGAGCACAGTCGAATTAGCCAAATCCCTTTTCGGGCCA
GACATTGCCGGTAGTCTGCTTCTGAAACAGCAACCAAATCGTGATCAGGTCCAAGTTCAA
ATCCCACCTCGGAACAATAGTGTTCATCTACTTGACATGGTGTTTTCACTTGAAGAGAAG
CAACAACATGACACTGAAGTAATCAAGAAGGAGCTAACCGGATTAGGACGGTCGTCTTCT
GACTCCGGTCCATCTGATTCGGATGGGAACTTTGCATCTGCTTTTACTGATAACTGTAGG
TCAAGGAAGAGAGGAAGAAAGCCTGCTGCTAGCGGAAAAGAATCACCTTTAAACCATGTT
GAAGCTGAGAGGCAGCGACGTGAGAGGCTTAATCACAGATTCTATGCACTTAGGTCTGTT
GTCCCAAACGTGTCCAAAATGGATAAGGCCTCTCTATTGGCTGATGCGGTTACCTACATC
AAGGAACTCAAGGGCAAGATCGATGAATTAGAGAGCAAATTAGTCCATGAACAGCCAAGA
AGACAAAAGGCTGCGTCTGTGTTAGCTGCTAGGAATATCTACGACAACAACCAAAGCAAT
TGCTCAATAAACGAGCACACGAGGCCCGTTTCAAGTCATCATTCTGTGAAAGCGATGGAT
GTGGATGTGAAGATTGTGGGATCAGAAGCCATGATACGCGTTCAATGTCCGGACACGAAC
TACCCAGCTGCAAAGTTGATGGACGCTCTTAGAAACCTTGAGTTTCATGTTCATCATGCT
AGTGTGTCAAGCGTCAAAGAGCTAATGCTTCAAGATGTTGTGGTCAAAGTTCCCGAGGGA
ATGATCTCCGAGGATGTCATGAGAGCAGCTATTTATCAAATGATGCAAAACTAGGTCCAA
TGTGAAAATTGAGTCATCTTTGAGCAAGTCCTAAGAATGGCTATATAACTAGTTGCGATA
TGAAAATTCTCTGGTACGAACGTTTATATTTTGTTAAAGTTTCAATTATAAATATAAATT
ATTAATATTTCAGTAGATTTATTTATACTTACTTTTTTTTTTAAATTGAATGAGATCGGA
TTTGATGTTTGGATAAATTGAAGTATGGATGTTAACTTGGTTTGATACATCTTCAGTCAC
ACATGCACTGTAAGTTCTTATATTTAGATTTTCACCGCCACTGTGTTTTGGAATTATAGT
TTGCTGCTGATATGTATTCTCCTAAGGTGTTGTCATTCCCTTCAATTATAAGATTCTCTG
TTGTAGTCTATGCGGGAGGTAGAACGAGTGGACACAATTACATTGAAACGGGAGATATGA
GAGAAACAATATTCACCAGAAATTTAAGAATCATGAACATGAATTCTTGATCATGAATAC
TGCAGACGCTATATCACGTGGGGTTTCTATACAACGACACTATATGTCATTCCAGGAAAC
AAATTGATGAAATTATCTACTGGGTCGATATTTCCTGTTCATCTCAGTGTTTAAAGGCAT
GTCTCAACTTTTGAGGAAATTATATTTGTCCTTATTTGTTTCTCAGATCATTACTTAAGA
GTGTGATTTATTGTCACCAAGTGTTAGGACAAGGAATTTACGTCCACAGAGGTCTATTGT
CCGATTAGAGGTGAAGCATAAGTAGTCTAGATTCCACCCCATCGATTTGAGCTTTCATTT
AAGGATATATAGATTTTTTTTTTTTTTTGAAATTAAGGAGATATAGATTGATAGCTAATA
AATAGACGGAACTAGGTAGTTAAATAATATATATATATATATATATAAGATTGAGTTGAA
ATCATGCCCTTCACACTCTTAAACTTTTAATAATTTAAAAATAAAAACTAACTAATAATT
ATGATATAATGAAGTTGTAATGGAAGGTA
Download   Copy
>LITCHI021833.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AGGACAGCAGTTTTCCTTAGATGCGTATCTATTTAGAATTTGAAGTTCACCATTGTGCAT
CCAACAACATCCAAAATTATCCATTAAATTAAATTCTCTAGATTTGAAAAAATAAAAAAT
AAGGTCATAGATAATAAATTATAGTGAATCCTCTTAGCATGCTCATTAAACATTTAAACT
AATTAATTCTCTATGCATAACACTAGAATTCAAGATATATGATTTTGTGAAAATTTGTCT
CATTTGAATTCTATGGGTAAAAGGGAAAGAAAAATGGAACTATAGAGGCAAATAATTCAA
TTCTCAGCACATAGATATTAATCTTAAAACAATCCAAGTAGTGTATCAAATGATGAGAAT
AATATTTAGTCATATATTAGGTAGCTTCGTTTATATAATGTCACTTACAAAATTCTTAAT
GGGTAGCTACATCTGAACATATGGCTTTTAGCTTGGAATAACAATGGAAAACTAATTTTC
TTTGTGAAGATGCTTACTTGACTTTGATTTATTCTCCATCAAATGAGATCGTGCGGGCTT
GAAAAAAATGTTTTCACATTGTAATAAATACCGTACTAACAACAGTACTTGTATATATTA
GATTAATAAAAAAGTTAATGATACCAAGTAATTAAATAAATATTTTTAAAAAATAGATGA
TAACCCATTATAGTTCTAGGTTACTGACTTTTTTAAATATACATATATATATATATATAT
AATTGCAAGATAATTGAAAGTCTATATATGGACACGAATGGCTATGAGTCTGTCTCAATT
TTCATAATATTGAATCTATATACACCAATAATAAGGGACAGAAACTCTCCACACATGTCG
TCAAATGTACATGGCCTCAAATATCATTATGATTGTGAGAGAGTGTACTACTTGAGTTAT
GAATAGATGTATTCTATATTACAAATCTTGGAACCTACAAAATAAAGGATCCTAATTTTA
TATATAGTTCAAAGATGAACTCTACTACCATATAGGACTAGATAGAAAAGGGCATGCACA
TTCACTTGTAGCTTTAATAGTTAATGTACTTTTTATTTACATTAATAGAAGTTTAAGCGT
ACCAATGAGTATTTAGTATTTACCTTAATTATAGTGGCAGACATCTTTCGATCGATATTA
GATTTTTGGATTGTATGTAGTATTTAATCTTGATGGTTTCCGACAAAGGCTAACTCTTTA
ATGCGAATAGACTTTTTATTACTATATGTATGTATATATGTAAATATATAAATATAATAC
TTTTAAAATGAGGGCTTTCTTATTTTTTATCAATCAATCAAATTTATTAATTATATTTGA
ATTAACTAATATATATATATAGTAATTTTTATATATATAAAAATTTTACTATCAGTGTCT
CCAAAATTTAAAAGTTTGGACGAATCAATCAAATTCATCCATAACATTTGAATTACTTAG
AAAAGAGAATATAATTGATGAATTTAATTGATTTGGTCTAACTTTTTAAAGTTATGGAGA
GAATACTTATGCTAACGCGTCAAAGATAAAATAATTGAAGAAAATTTTGGATTTAGTGGG
ATGTTATGCATTCCCATTATGATCTTGACACATGTTAAGATGCGCAGTGGGATTGCATGA
TGTTTTCCGTGGCATGCAAATTTTCGGAATTGACGTAGAAGGACCCACTGGCTTCCCCAA
ACAGAAATCAAATGGAGCCCATGACGCAGGACAATAACAATTCACATACCCGTTTGGGTT
CATGATTGTACAATAACTTGGACACGTTTATAATGGTTTTTGATAGTGAAACATAAGACA
GTAACCAGGAAGCAGTTCTACGTTTTGTGTCACTTTTATATGACCTCGACGTTGCTTAGT
TTCCAAACCCCTACAATCACTCCTTCCTTCTCTTTTTCTAATTTTTTTCTCTCTTGATTG
ATCACTACTCTTTCAAAGACACAAAGAGCATAAAAAGAAAACACACACACACACACACAC
ACAAAGAGAGACGGAGTAAC
Download   Copy
>LITCHI010601.m1 GenomeSequence + 
GGGATTGTTGGTTAACTATAAGGCCCCACAAGTCTTCTTATTATAGAAAGTCCAAACTTC
GTTGATCTTAGGCAGTGATTTGTGTGTGGTTTTTCTTTAATAATTATATAGGTTTGGACA
GCGATGGCTCAGCTCATTTCTCACCTTAATTTTATTTTAATTAATGTCATTAACAATTAG
TTTCTTCTTACGCTAGTAATACCCAGTGGCGGATTTCTTAATTTTGTATATATACAAATC
ACAATCATCTCATTTTCTTATCAAACTCGGTTCCAAAATGTTTGCATTAACTCCCACTCC
TCTCATCCAAAGCTTTGGATGGCCCTTAGACGATTCCACAAGCCATCAAAACAACTACTT
GTTCAATGATAGTTTTGAGTCATATACTTCTAAGTTTGGTCCACCTTATGAGCAGCCACA
AGTTCAGCTTGATCGCTCTGCACCATTTAACACAAATAGCAGCGGAGATCACAGCGTGGT
TAAAAAGCTTTCTCACAATGCTAGTGAGCGTGATCGGAGGAGGAAGATCAACTCTTTGTA
TTCTTCTCTCCGTTCTCTACTTCCCATGGCTGACCAAACAGTAAGCCTTTTGTTTCCACT
TTCCTTTTTTTTGCTTTTTCATTCTTAAAGCTGTTTTAATTACTTAATAATTCATCTAAT
AGTGACTGAAATGTTTCCGTTTTGGATCAAGCTATCCCAGTTATAATTTTCTGTTTGTTT
AATATAATGGACACATAGTTTGAAAAAGAGGAATAAGGTAATACAGTCTCAAAATAGGAA
AAGTTGTTGTGTGTATATATTTTTATGAGATTGTGTCCATTCAAACTAAAACTGTAACAT
TATTTTCAAAATAACAAGTTGGGCCTAACAGATCTTTTGAAAGACCCCTTATCATCCAAG
TTCGTAATCTTTAAGGAAACTTTTGAAATCTCTCAGCTATAATTCTCGATAAATAAAAAT
CTTAGGTGAGAAAAGCGGAATAGTTTGATGCTAAACCATCTTCAACCTCCTCCATCATTT
AAGTGGTAAGTTCAAATCTCAGCAGTTCCATAATTTGTGTGAACAACTCTTTCCCAATAT
CTAGGAGTAGAGTTTTGTAATAGCTGATCCGTAATAGATGTTAGATAATAATAAACGGAA
TCTTTTAGAAATAAATTAACAAACCACACTTCGTAGGAGAATCATTGACATTATTTATAA
TTATAACAGAAGAAATTAAGCATTCCAGCTACAATTTCGCGTGTGCTAAGGTATATACCG
GAGCTGCAACAGCAAGTGGATGGTCTAATTCAAAAGAAGGAAGAGCTTTTGTCCAGAATA
TCAACATCTTCGCAGGGAGATCTTATTCATCAAGAAAAACGAGGAAAAAAGCCCATTCAA
TGTTCGTTAACTTCTATTTTAGCAAGTTGGCTAACTGATAGTGAAGTTATAATTCAGATT
TCTACATATAAACACCACCAAAATCCATTATCTGAAATCCTGCTTAATTTGGAGGAGGAT
GGACTTCTTCTTATGAATGCTTCTTCTTTTGAATCGTCCACAGGCAGTGCCTTCTACAAT
CTACACCTTGAGGTATGTAATTCCTTGATTTAGATCCCAATGTAGTATTTGTTCTAAGGG
CTCACATAACTTTCATTCTAAAAGGCTTTGAGATTGTTTACAATTGAATTCTCTAGTCTC
ACTTGTTACTGTAATTAAGGACTCCTGACATTAAAACAATCATTAGTTACCGTTTTCAAA
GTAATTGATATCTAATGATATTGTGCCTCCACGTAAGTATGTTTGTGGCTTTAAAATGTC
TGCTTTTTTAATTGCTTATATTGGATTATCCAGGGGCAAAGAACGGACAAAATGGAATGC
GAGATTTTATGTGAAAAGCTTTTGTCATTGTACGAAAAGAAGGAATGCTTATATCCATTG
AAACACAGAAATGACGGCCAATTAAGTCCTGGCATTGTGGAAAATGATGGACGGCATCTC
TCTAGGGACTAGGAAGAAATCTAATAGTGGTGCATTCTCTTCTTAGTGTTGACTGTTGAG
TGATCATGAAAATATTTGGAGTACAAGATGCATCCCATTCAGATGAATTGCTGTTGTCAA
AAATCTTAGGGTGCGTAACGTTCTTTTTTTTTTAACCTGAAGTTAATTTGACATATTTAC
TATTATTTGTTTTTCTAACTTAAGATCTATTTTAAAATATAAATGTGTGAAAAAAAGGTA
AAAAAAATCTAACTTCATCGTAAGTAGAAAGTGATGAAATAATTTCAAAAAAAAAAATAA
TAATAAGTGATGAAATAAATTAATTTTGTATTATTATATTATTACCAAAATATCCTTGAC
AAAAAATCTCAATCTTACATAAGTCTTAATTCTAACCAAACGCTAACCCTAATAATAGGT
GGCGACTACCGCCCCACCCCCACTCATTGGTTGATGATAGAGGCTGGTTGGCCATTTTGC
ATCATTGAGAGGAGGCTGCTCCTC