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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021725 | Chr10 | 483010 | 487961 | + | E3 ubiquitin-protein ligase ORTHRUS 2 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021725.m1 | 138 | 182 | PF13920.9 | zf-C3HC4_3 | Domain | 31.3 | 1.50E-07 |
| LITCHI021725.m1 | 139 | 177 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 30.7 | 2.30E-07 |
| LITCHI021725.m1 | 139 | 177 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 20.8 | 0.00032 |
| LITCHI021725.m1 | 269 | 417 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 175.8 | 4.90E-52 |
| LITCHI021725.m1 | 509 | 566 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 21.9 | 0.00013 |
| LITCHI021725.m1 | 509 | 563 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 29.7 | 5.20E-07 |
| LITCHI021725.m2 | 138 | 182 | PF13920.9 | zf-C3HC4_3 | Domain | 31.4 | 1.40E-07 |
| LITCHI021725.m2 | 139 | 177 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 20.9 | 0.00029 |
| LITCHI021725.m2 | 139 | 177 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 30.8 | 2.10E-07 |
| LITCHI021725.m2 | 269 | 331 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 65.8 | 3.70E-18 |
| LITCHI021725.m2 | 331 | 375 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 47.5 | 1.60E-12 |
| LITCHI021725.m2 | 467 | 521 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 29.8 | 4.80E-07 |
| LITCHI021725.m2 | 467 | 524 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 21.7 | 0.00014 |
| LITCHI021725.m3 | 14 | 64 | PF00628.32 | PHD | Domain | 29.2 | 6.70E-07 |
| LITCHI021725.m3 | 138 | 182 | PF13920.9 | zf-C3HC4_3 | Domain | 31.9 | 9.30E-08 |
| LITCHI021725.m3 | 138 | 178 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 27.6 | 3.00E-06 |
| LITCHI021725.m3 | 139 | 177 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 31.3 | 1.40E-07 |
| LITCHI021725.m3 | 269 | 417 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 176.7 | 2.60E-52 |
| LITCHI021725.m4 | 85 | 233 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 176.5 | 3.00E-52 |
| LITCHI021725.m4 | 325 | 379 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 30.2 | 3.60E-07 |
| LITCHI021725.m4 | 325 | 382 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 22.1 | 0.00011 |
| LITCHI021725.m5 | 85 | 147 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 66.4 | 2.50E-18 |
| LITCHI021725.m5 | 147 | 191 | PF02182.20 | SAD_SRA | Domain | 48 | 1.10E-12 |
| LITCHI021725.m5 | 283 | 337 | PF13445.9 | zf-RING_UBOX | Domain | 30.4 | 3.30E-07 |
| LITCHI021725.m5 | 283 | 340 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 22.3 | 9.50E-05 |
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>LITCHI021725.m1 ATGGCGCACGTTAACGACCTTCCCTGCGACGGCGACGGCATTTGCATGAGCTGCAAGAGG AAGCCATCGGCCGAAGAAGGAGAGACAGTCACGTGCAGGACGTGCGCCACTCCTTGGCAC GTGACCTGCCTTTCCGTCAGTCGTCTCGAGACGCTAGCTGCTGAGAGCGAGTGGGACTGC CCCGACTGCTCGGCGACGGAGGTCTCCAAACACTCGGAGAGAGCGAATCCAGGCGGCGAC CTGGTGGCGGCGGTTCGAGCGATCGAGTCGGACGAGTCACTCACCGAGCTGGAGAAGGCC AAGAGGAGGCAGGAGCTCGTCAGCGGCGGCCGAGCGAGATCGGAGGCGGATCCAGAGAAG AAGATAATGGAAGGCGATGACGATGTGATTGGTATTTTCGACGGCGCATTGAGCTGTTCG TTTTGCATGCAGCTACCGGAGAGACCTGTCACGACACCGTGTGGTCATAATTTTTGCTTG AAGTGCTTTGAGAAATGGATTGGACAGGGAAAGCACACATGTGCAAATTGTCGCAATATA ATCCCATCGAAGATGGCAAGTCAACCTCGGATCAACTCTGCACTTGTTTTTGCAATTCGT ATGGCCAAGATGTCAAAATCCAGTGGAGGAGGGGCAACGAAGGTCTGTCATTTTGTCCAC AATCAAAATCGGCCAGAAAAAGCGTATACCACAGAACGAGCAAAGAAACCTGGAAAGGCT AATGCTTGCAGCGGAAAGATCTTTGTCACTGTCCCTCCTGATCATTTTGGGCCTATTCTT GCAGAGAATGATCCTGTGAGAAAGCAGGGTGTGTTGGTTGGAGAGTCTTGGGAGGATAGG CTGGAATGTAGACAGTGGGGTGTCCATCTTCCTCATGTTGCAGGAATTGCAGGTCAGTCC AATTATGGAGCCCAGTCAGTGGCCCTCTCTGGAGGGTACATAGATGATGAAGATCATGGT 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AAGTGCTTTGAGAAATGGATTGGACAGGGAAAGCACACATGTGCAAATTGTCGCAATATA ATCCCATCGAAGATGGCAAGTCAACCTCGGATCAACTCTGCACTTGTTTTTGCAATTCGT ATGGCCAAGATGTCAAAATCCAGTGGAGGAGGGGCAACGAAGGTCTGTCATTTTGTCCAC AATCAAAATCGGCCAGAAAAAGCGTATACCACAGAACGAGCAAAGAAACCTGGAAAGGCT AATGCTTGCAGCGGAAAGATCTTTGTCACTGTCCCTCCTGATCATTTTGGGCCTATTCTT GCAGAGAATGATCCTGTGAGAAAGCAGGGTGTGTTGGTTGGAGAGTCTTGGGAGGATAGG CTGGAATGTAGACAGTGGGGTGTCCATCTTCCTCATGTTGCAGGAATTGCAGGTCAGTCC AATTATGGAGCCCAGTCAGTGGCCCTCTCTGGAGGGTACATAGATGATGAAGATCATGGT GAATGGTTTCTTTACACTGGAAGTGGAGGAAGAGACCTAAGTGGCAATAAGCGCACAACT AAGACACAGTCTTTTGATCAGAAGTTTGAAAAGTATAATAAGGCCTTACGAGTAAGTTGC CAGAAAGGTTATCCTGTTAGAGTAGTTAGGTCTCACAAGGAGAAACGTTCTTCTTATGCC CCTGAAACCGGAGTGCGGTATGATGGGATTTATAGAATTGAGAAATGTTGGCGTAAAAAA GGGATACAGGGTTATAAGGTATGCAGATATCTCTTTGTTAGATGTGACAATGATCCAGCA CCATGGTCAAGTGATGATAATGGAGATTGTCCAAGGCCTCTGCCAGTCATCAAGGAATTA AAGAATGCAATTGATATGAGTGAAAGAAAGGGATCTCCTTCCTGGGACTATGATGAGGAA AAAGCTTGCTGGATGTGGAAGAAACCTCCACCTTATAGTAGAAAACATGTGGAGAGTGGA 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