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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021631 | Chr12 | 24501773 | 24512093 | + | Serine/threonine-protein phosphatase 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021631.m1 | 318 | 350 | PF00515.31 | TPR_1 | Repeat | 33.8 | 2.10E-08 |
LITCHI021631.m1 | 318 | 350 | PF07719.20 | TPR_2 | Repeat | 27.9 | 1.60E-06 |
LITCHI021631.m1 | 512 | 578 | PF08321.15 | PPP5 | Repeat | 64.6 | 8.60E-18 |
LITCHI021631.m1 | 587 | 780 | PF00149.31 | Metallophos | Domain | 110.9 | 1.20E-31 |
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>LITCHI021631.m1 ATGAAGATACAGTGCAATGGGTGCGACTTGGCAGAGGCCAAGGTACTGTGCTGTGCAGAC GAGGCGGTGCTTTGCTGGGATTGCGACCAGAGAGTTCATGCGGCCAACAAGCTCTCTAGC AAGCACCAGGGGGTGCCTCTCACTCATTTTTCGTCTCAGATGCCCAAATGTGACATCCGC CACGAGACCCTTGGCTATTTCTTCTGCTTGGAGGATCGTGCATTAGTTTGTAGGAAGTGC GATGTTGCCATTCACACAGCAAACGCCTATGTGTCTGGTCATCAGAGGTTTCAACTAACA GGTCTGAAAGCGGGACTTGAATCAGCAGAGCCAAGTGTGTCCTCTACCATCGATAAGTTG GACTCTATCGGAAAAGCTTCTGAAACAACATCAGCCCAGTCGATTTCCAAAAGGGGTGCT AGGATACCGATTGCATCCGAAGACGCAGGAATGCTGCATGGACTAATTATGGCAATCAAG GTACCATTTCCTGCAGGCACCACAGTTGGGAATATCGCGACATGGCACTTGGATGAATAT TTTGGAATGACAGATTTTAGTCAGAACTATGCAGTTACGGATAATGTGTCATCATCTAAG GTATGTGGCAGATACCGTCTACACTTTTACATCTCAGGCTCAGCAACTGCATATGATTTG GGGGGTCTACTAGTGAGCTGGAAAGTGCTGCAAAAATTAGGACAAGGGAAAGCAGACAGA TATTACTATTCATCTAACTGGTTCATATTTGGTTTACTTGAGCTGGGTTCTGTTGTGTTT CCCTCTCACAAATACGGCCAAGCTATTGATCTGTACACACAAGCAATTGAATTGAATGAT CAGAATGCTGTGTACTGGGCAAACCGTTCATTTGCCCACGCTAAATTGGAGGAATATGGT AGCGCCATACAAGATGCATCAAAAGCTATAGAAGTTGATCTGAAATACTCCAAGGGTTAT TATCGACGAGGTGCTGCTTATCTTGCCATGGGGAAATTAAAAGATGCACTTAAGGATTTC CAGCAGGTTAAAAAACTCTGTCCAAATGATCCTGATGCTGCCAAGAAATTAAAGGAATGT GAAAAGGCATTTAAGAAACAGAAATTTGAAGCAGCAATTGCTGGACCTGAGTCCGAAAGG CATTCAGTTGCTGATTCCATTGATTACCATACCATAGGGATGAGCCCCAGTTCATCATCT GTGCCCACCCAAGCAGCCATAGTGGCAGGGACGGCAGCAGTTGTGGCAGTGATGGTGATG GTGGGGCCGACTATAGCCACAATGTTGGCAGGAATAGTGGTAGCAGTGCTGATGGTCCTA GGGGCATGTTGGTCGGGTGGCTGCAATGGTAGTGGTGTCTTTACAAAGAGTCAAAAACTT GAACTAGGTGTGAGTTCTGGCCTCACCCTCTTAGGCTTGAGGCTCAATCCTGTGGGGTTA TTTGATTGTTGTTGTCTCCATTCTTGCCCGACTGTGTATAATTTCTTCTATCATGGACTC TGCAGAAAATTTGTAAGATGTTTTGATTCAATATTGACGACATTGCATTTCTGGTTTCTA GAGGTGGAGCCACAATACTCTGGGGCAAGGATAGAGGGAGATGTTATTACTTTGGATTTT GTGAAGAAAATGATGGATGACTTCAAGAACCAGAAGTGCTTACACAAACGGTATGCATAC CAGATTGTCTTACAAATGAGGGAAATGTTTCGTGCTTTACCTTCACTTGTTGATATAAAT ATTCCTAACAGCAATCATTTTACAGTCTGTGGTGATGTACATGGTCAGTTTTATGATCTA TTGAATATTTTTGAGCTTAATGGGCTTCCTTCAGAAGAGAATCCATATCTGTTTAATGGT GACTTTGTGGATAGGGGGTCATTTTCTGTGGAGGTTATTCTCACATTATTTGCTTTTAAG TGCATGGCTCCTTCAGCTATATATCTTTCCAGAGGAAATCATGAGAGCAAGAGCATGAAC AAAATATATGGTTTTGAGGGCGAGGTCCGCTCCAAGTTGAGCGAAACATTTGTGGAACTC TTTGCAGAAGTGTTCTGTTGTTTACCATTGGCTCATGTCCTGAATGGAAAGGTTTTTGTA GTTCATGGAGGTCTCTTTAGTGTCGATGGGATAAAACTCTCAGATATTAAGGCAATTGAT CGATTCTGCGAGCCTCCTGAAGAAGGATTGATGTGTGAAATTCTGTGGAGTGATCCACAG CCTTCACCTGGAAGAGGTACTAGCAAGCGAGGAGTGGGTCTTTCTTTTGGTGCAGATGTC ACAAAAAGATTTCTGCAGGATAACAATCTAGATCTAGTTGTGCGATCACATGAAGTAAAG GATGAAGGTTATGAGATTGAGCATGGTGGTAAACTTATTACTGTATTTTCAGCACCAAAT TACTGTGATCAGATGGGTAACAAGGGTGCTTTTATTCGTTTTGAAGCCCCAGATATGAAA CCAAATATTGTTACATTCTCAGCTGTGCCTCACCCAGATGTGAAGCCGATGGCTTATGCA AACAATTTCCTCAGAATGTTCTCCTAA
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>LITCHI021631.m1 TCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGGTTTGAAGTTGATTTT TCAAGATGAAGATACAGTGCAATGGGTGCGACTTGGCAGAGGCCAAGGTACTGTGCTGTG CAGACGAGGCGGTGCTTTGCTGGGATTGCGACCAGAGAGTTCATGCGGCCAACAAGCTCT CTAGCAAGCACCAGGGGGTGCCTCTCACTCATTTTTCGTCTCAGATGCCCAAATGTGACA TCCGCCACGAGACCCTTGGCTATTTCTTCTGCTTGGAGGATCGTGCATTAGTTTGTAGGA AGTGCGATGTTGCCATTCACACAGCAAACGCCTATGTGTCTGGTCATCAGAGGTTTCAAC TAACAGGTCTGAAAGCGGGACTTGAATCAGCAGAGCCAAGTGTGTCCTCTACCATCGATA AGTTGGACTCTATCGGAAAAGCTTCTGAAACAACATCAGCCCAGTCGATTTCCAAAAGGG GTGCTAGGATACCGATTGCATCCGAAGACGCAGGAATGCTGCATGGACTAATTATGGCAA TCAAGGTACCATTTCCTGCAGGCACCACAGTTGGGAATATCGCGACATGGCACTTGGATG AATATTTTGGAATGACAGATTTTAGTCAGAACTATGCAGTTACGGATAATGTGTCATCAT CTAAGGTATGTGGCAGATACCGTCTACACTTTTACATCTCAGGCTCAGCAACTGCATATG ATTTGGGGGGTCTACTAGTGAGCTGGAAAGTGCTGCAAAAATTAGGACAAGGGAAAGCAG ACAGATATTACTATTCATCTAACTGGTTCATATTTGGTTTACTTGAGCTGGGTTCTGTTG TGTTTCCCTCTCACAAATACGGCCAAGCTATTGATCTGTACACACAAGCAATTGAATTGA ATGATCAGAATGCTGTGTACTGGGCAAACCGTTCATTTGCCCACGCTAAATTGGAGGAAT ATGGTAGCGCCATACAAGATGCATCAAAAGCTATAGAAGTTGATCTGAAATACTCCAAGG GTTATTATCGACGAGGTGCTGCTTATCTTGCCATGGGGAAATTAAAAGATGCACTTAAGG ATTTCCAGCAGGTTAAAAAACTCTGTCCAAATGATCCTGATGCTGCCAAGAAATTAAAGG AATGTGAAAAGGCATTTAAGAAACAGAAATTTGAAGCAGCAATTGCTGGACCTGAGTCCG AAAGGCATTCAGTTGCTGATTCCATTGATTACCATACCATAGGGATGAGCCCCAGTTCAT CATCTGTGCCCACCCAAGCAGCCATAGTGGCAGGGACGGCAGCAGTTGTGGCAGTGATGG TGATGGTGGGGCCGACTATAGCCACAATGTTGGCAGGAATAGTGGTAGCAGTGCTGATGG TCCTAGGGGCATGTTGGTCGGGTGGCTGCAATGGTAGTGGTGTCTTTACAAAGAGTCAAA AACTTGAACTAGGTGTGAGTTCTGGCCTCACCCTCTTAGGCTTGAGGCTCAATCCTGTGG GGTTATTTGATTGTTGTTGTCTCCATTCTTGCCCGACTGTGTATAATTTCTTCTATCATG GACTCTGCAGAAAATTTGTAAGATGTTTTGATTCAATATTGACGACATTGCATTTCTGGT TTCTAGAGGTGGAGCCACAATACTCTGGGGCAAGGATAGAGGGAGATGTTATTACTTTGG ATTTTGTGAAGAAAATGATGGATGACTTCAAGAACCAGAAGTGCTTACACAAACGGTATG CATACCAGATTGTCTTACAAATGAGGGAAATGTTTCGTGCTTTACCTTCACTTGTTGATA TAAATATTCCTAACAGCAATCATTTTACAGTCTGTGGTGATGTACATGGTCAGTTTTATG ATCTATTGAATATTTTTGAGCTTAATGGGCTTCCTTCAGAAGAGAATCCATATCTGTTTA ATGGTGACTTTGTGGATAGGGGGTCATTTTCTGTGGAGGTTATTCTCACATTATTTGCTT TTAAGTGCATGGCTCCTTCAGCTATATATCTTTCCAGAGGAAATCATGAGAGCAAGAGCA TGAACAAAATATATGGTTTTGAGGGCGAGGTCCGCTCCAAGTTGAGCGAAACATTTGTGG AACTCTTTGCAGAAGTGTTCTGTTGTTTACCATTGGCTCATGTCCTGAATGGAAAGGTTT TTGTAGTTCATGGAGGTCTCTTTAGTGTCGATGGGATAAAACTCTCAGATATTAAGGCAA TTGATCGATTCTGCGAGCCTCCTGAAGAAGGATTGATGTGTGAAATTCTGTGGAGTGATC CACAGCCTTCACCTGGAAGAGGTACTAGCAAGCGAGGAGTGGGTCTTTCTTTTGGTGCAG ATGTCACAAAAAGATTTCTGCAGGATAACAATCTAGATCTAGTTGTGCGATCACATGAAG TAAAGGATGAAGGTTATGAGATTGAGCATGGTGGTAAACTTATTACTGTATTTTCAGCAC CAAATTACTGTGATCAGATGGGTAACAAGGGTGCTTTTATTCGTTTTGAAGCCCCAGATA TGAAACCAAATATTGTTACATTCTCAGCTGTGCCTCACCCAGATGTGAAGCCGATGGCTT ATGCAAACAATTTCCTCAGAATGTTCTCCTAA
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>LITCHI021631.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTTGCATATGTACAGGTGTTGCTTCCGACAATAATAGGAGGACATGAGGAACCAATAGA AAGATGGCACAAGTCAATGGATTATCGACCTCTGATTGAAGGAACCATTCACAGATCTAC TAACTTAACGAAAGTGAAGAAGAGAAGTAGAGGAAGACATCGAAGGAGAAGAGTAGGAGC CCGTGAAACATTGCTTCCCAATGGCAAAGTGATAAATTCAAGACATTTAACTAATATCTG TTATCTAAAGAATAATGTGAACACCTAGAAAGTTAGGTCTTGTCTTATTATAAAATATAC TTTAGTGGTTCATTAGAGAGATAAAGAGAATAACTAGACACGTTTAGTAAGATAAACAAA TTTTAAAAAGATAAATACCAATATAAGCATTAGAGGGTGCTCTTGAAAATAAACATGTTT AGATCATTTTGACGAACGTTTTTATTTATTTTGCAAGTTAAATTAAAAGTTTCCAATCAA AAGAAAGAAGCATGATCGTAGGTTGCAACTCAACAAAGATAGTTACAACCTTCAAGCATA CATTAGTGTATGAACAATATATTTACTTATAATTCGAGTGATTTATTATATTCTCATATC ATGTATGTAATTTAGTTTATAATTATATATTTATATTATATCACGTTCTATCTTCTTATT ATAAGTATAGATATCTTTTTTATATGAGAGTAAAGTTTTCAAGCGATACATGGTATTAAA TCTCTAACCATTTGTATCAACAACCTTTCTTTTCTTATTTTTTTTATTTTTTAATCACTT TAAAAGAGAAAGAGTTGATAACATAATAACAATTTTTTTTAAAATATATATTTTGCTCTC CTATAGAGTTTAGTTATAGTGTGTAATAACCATACGAAAAACATATGGTAACAAAACATT GATTACATCATCACTGTCCAAGTATGGTTTAGCGTTACATAAAGTTGAAGTGTCTAATAA TATCTTAAATTTAAATTGTCGCAAAACATGTGTTATTTATAACGTTTTCACTCTATATAC AAATGGAGAAGGAGGGAATCTTAATTTTTGTTTTTTTAAAAAAACCAACAATCCTTGTTT AGTACACCTTAATCTTAGTTTTTATATACAAACCCAAATAAATCTTGATTTTCTTTATTT AGGTTGTTACGAAAATATAAATCATAATGAATTGAGTTATTATCAAAACAAACAAAATTG ATAATTGATTTTTTAAAATATATTTTCAATTTAACAATTTAAGCACAAGATTATTAAATT AAATGAATACTTTTCACTAATGAACTATATTGAGAGACAAGTAACTAAGTTATTCAACGT ATCTGATTATTTATAAATGAAAAACCCATACAACACATCATAAATAATTAAATATAAAGA ACAACGGAACTATTTGACATCCTAACATATGCTGGTATACTGTTGTGGTTCTTCTTTAAC ACGTGTAATTAAATAAATGATATTTACATTGAGATTGTAACAATCATAATTGTTTAAATT TAGCTTGTAATGCATTATTATATAAAAAATAAATAAAACTTAAATAACAAAATTTGTTAG ATTAATATGATTATTTCATTAATTTAAACATTATGAATATTATTTTTAAAAACATTTAAC AGTATACATAGAAATGATTTTCATTGCAAAAAATAATTTGGAGGAAATTCGAAAGTGTTA AGGTCAAACAGATGGGGTGTGGCAGTCAAACGGCGCCGCTCACCTTAGAGCGTCCACATC AGATGCGTGCGTGGCAAAACGAATGGAAGCAGAGCCAAGTGTCAAGTTCTCATAACATCC ACCAACGCACGCGATCAAAAATATCGTAAGCCAGTCGGTTGCAAAACTTTCAGGCCGAGT TGGCTGTTGTCGGTCTATATAAAGCAACTTTACTTTCAACCCTATTAAATATTTCCATTT TCAGTTTGCTGTTATTCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGG TTTGAAGTTGATTTTTCAAG
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>LITCHI021631.m1 GenomeSequence + TCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGGTTTGAAGTTGATTTT TCAAGATGAAGATACAGTGCAATGGGTGCGACTTGGCAGAGGCCAAGGTACTGTGCTGTG CAGACGAGGCGGTGCTTTGCTGGGATTGCGACCAGAGAGTTCATGCGGCCAACAAGCTCT CTAGCAAGCACCAGGGGGTGCCTCTCACTCATTTTTCGTCTCAGATGCCCAAATGTGACA TCCGCCACGTACCCTCTACTTCCACCGCTTGTTTCTTTCTTCCTTGCTTTGCTCACACTC TTTTCTCTGTTCAATGTTGTTCTCGATTATGTTGTCAATTGGAAATGAAAGCCGTCAAAT ACTATGAATTCTGACAATAATAAGCTACCGATTTGTTACCAGCAATAAGTTAACAGGTTG TTTGTAAGATGAATGTAAAAGTTGAACCTGTCTCTATAGCTTCAATGGAGAATGGGACCC TATATATATTTTCATTTCTTTGTGGGGTGAATCAATTCTCCAAGTCCTCTATTTGCACGT ATGATGAGTCTCAACTTGGAAATTGACTTACTGCTACTTTATTTTTTTTAAAGATGACAT AACATAACTTCATCCGTCTTGTTGAAAAGGTTTCATATTTGACTAGTAGTTATTAAGGGG CCTTAGTCTGAGAGGATTGTTGCAGGCTGTGCCCTTTGCTAAGTTGGCAGTCTCAGTTCT GGCATGTTTATATATTATACCACATTGTTAACCAGAAAGATGCAGAACAAGCCTAGTAGA GTTGCAGTACACAAGTTTAGAACCTAAATCATATTGAGACTGTGTCATGAATCAATTGTT TTCCACCATTTGTTCAGCAGTACTGCAATTAACTTGTAGTAAAAGGATCGCCTTTAAAAG 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