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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021595 | Chr12 | 24295792 | 24300744 | - | "Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g59200, chloroplastic " |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021595.m1 | 91 | 137 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 31.8 | 1.40E-07 |
| LITCHI021595.m1 | 94 | 122 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 22.8 | 7.70E-05 |
| LITCHI021595.m1 | 197 | 220 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 15.7 | 0.014 |
| LITCHI021595.m1 | 222 | 269 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 49.1 | 5.30E-13 |
| LITCHI021595.m1 | 223 | 270 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 17.8 | 0.0028 |
| LITCHI021595.m1 | 225 | 255 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 33.8 | 2.50E-08 |
| LITCHI021595.m1 | 298 | 332 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 16.6 | 0.0068 |
| LITCHI021595.m1 | 299 | 324 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 27.1 | 3.30E-06 |
| LITCHI021595.m1 | 323 | 351 | PF12854.10 | PPR_1 | Repeat | 24 | 2.50E-05 |
| LITCHI021595.m1 | 324 | 371 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 42.6 | 5.50E-11 |
| LITCHI021595.m1 | 324 | 370 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 19.5 | 0.00086 |
| LITCHI021595.m1 | 326 | 356 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 29.5 | 5.70E-07 |
| LITCHI021595.m1 | 347 | 406 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 16.6 | 0.0066 |
| LITCHI021595.m1 | 398 | 418 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 9.3 | 1.5 |
| LITCHI021595.m1 | 441 | 503 | PF20431.1 | E_motif | Repeat | 74.4 | 7.00E-21 |
| LITCHI021595.m1 | 464 | 493 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 18 | 0.0027 |
| LITCHI021595.m1 | 540 | 616 | PF14432.9 | DYW_deaminase | Domain | 89.5 | 9.70E-26 |
| LITCHI021595.m1 | 689 | 777 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 99.7 | 1.20E-28 |
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>LITCHI021595.m1 ATGGGTTGTTACACAATGACAGTTGTAGGACACTCAATTTACCCGCAAATTCCGAATTCC AGACCTAATAGTATATCACACAGAAAGCAGACCATCTCTCTACTGCAGAAATGCAAACAC ATCAACCAAATCCAATCCGTACACGCCAAAATCATTAGAGATGGCCATGAACACGATCCC TTTATCGTCTTCGAGCTTATTAAACTTTACTCCTCAAAATTCAACTCCATTGACTACGCT TCCTCGGTTTTTTACCACACTCATAACCAAAATGTGTACCTCTACACTTCTCTTATTAAT GGGTACGTGTTTTCGGGCTGTTACGTTGATGCTATTCGACTCTACTGTCGAATGGTTAGT GAATCTGTCGCGCCTGATAACTATGTTATCACTTCAGTGTTGAGGGCTTGTGGGGCTGTG CTGGCTCTGAGAGAGGGTAGGCAGGTTCATGGCCAGGTTTTGAAACTTGGGTTGAGGTCG AATAGATCGATAAGGTTGAAACTTGTGGAGTTTTATGGCAAGTGTAGCGAATTTAATGAC GCGGCACAGATGTTCGATGAAATGCATGAGTGCGATGTGGTTGCATCAACGGTTATGATG AATTGTTATTTTGATCATGGATTGGTTGAAAGAGCCATTGATGTTTTTAATCGGGTTGAG ATGAAGGACACGGTTTGTTGGACCGCGATGATTGATGGGTTGGTTAAGAATGGGGAGATG AGTAGAGCTTTGGGTGTGTTTAGAGAGATGCAAAGGGACAATGTGAGGCCTAATGAAGTT ACCGTTGTGTGTGTTTTATCTGCGTGTTCGCAAATGGGAGCGCTGGAGCTTGGGAGATGG GTTCATTCGTATGTGGGGAAGCATCGAATTGAGCTTAATCATTTTGTGGGAGGTGCTTTG ATCAATATGTACTCTAGGTGTGGTGACATTGATGAGGCGCAACAGGTTTTTGAAGAGATG AAGGAGAGGAATGCCATCACTTATAACTCAATAATTGTAGGGCTTGCCCTGCATGGGAGG GGCTTTGAAGCTATTGAGATGTTCCGTGAAATGCTCAAGCGAGGGCTAGAACCAAGTAGC GTTACCTTTGTTGGTGTGTTGAACGCTTGTAGTCATGGGGATTTGTTAGATTTGGGATTC GAGATCTTTCATTCTATGTTGAAAGATTATGGTATTAAGCCACAGATTGAGCATTATGGA TGCATGGTTGATCTTCTTGGACGTGTAGGGCGTCCTGAAGAGGCTTATGACTTCATCACG AGCAGGAAAATAAAACCAGACCATATCATGTTGGGGGCACTACTAAGTGCCTGTAAAATC CATGGAAACCTTGAGTTGGGAGAAAAGATTGCCAAAACATTGCTGGATTGCGAAAAAGCA GATTCCGGAACTTACACTCTTCTATCAAATGTGTATGCTTTGTCAGGGAAATGGGAAGAA GCTGCACAAATGAGAGTAAAAATGAAGGAAGCCGGAATCCAAAAGGAACCAGGCTGTAGC TCCATAGAAGTGAACAATGAGATTCATGAGTTCATTTTGGGAGACATTAGACACCCACAA AGGCAACAAATCTACAAAAAGTTACAAGAATTGAACCAAACACTAAAAGCCTCATATGGG TACTCCCCAGCAACAGAAACAGTCTTGCATGACATTGAAGAGAAGGACAAGGAATGGGCT CTAGCAATTCACAGTGAGAGGCTTGCAATTTGTTATGGCTTGATCTCAACCAAACCATTC ACTGCAATACGGGTTGTGAAAAATTTGAGGGTGTGCAATGATTGCCACTCCATGATCAAG CTCATAGCTAAGATCACCAAGAGAAAAATTGTTGTGAGGGATCATGGGGATTATGGGGTG ATTTCAGATTCTGCTGAAATGGAGCCTGTTGTTGATATAGATAGCAAGATGATAGAAAAT GTGGTTGGAAGTAACACTTGTATGTCTGAAGGTGGAGAAATGATTGACTTCTATGATGGG AGAGAGTTGATTGTGAATGAAATAAATGGGAGTGTGGAACTGTATGTGGGAATGGAGTTT GAATCAGAAGAGGCTGCCATGGTATACTATGATACTTATGCTAAGAATGTGGGGTTTATT ATTCGGGTTGGTAATTGTCATCGTTCGAGTCGGGATGGATCAATTGTCAGCCGTAGGTTT CTTTGTAATAAAGAAGGGTTTCGTGTAAATAACAAGAAGGCCAAAAGCCTTGAGGTAAGA AAGCCAAGGGAAGTCACTAGGGAGGGTTGCAAGGCAATGATTATGGTGAGAAGGGAGAAG TCAGGGAAATGGGTTGTTACTAAGCTTGAAACAGAACATAGTCATCCGCTAGGAATTCAT TCTGGCAAGGGTCGTCGAGATACAGTTCAGGCCCGACCACAGGATGAGAAGGATAAGAAA ATCCGGGAGCTATCATTAGAGCTCAATCGCGCAAATCAACAATTGGCAAAGTGCCGGGGG CAATTGGATATGGTTTTGAAAGACATTGAACAGCACACAAATCACCTTTCGCAAAGTATT CAGAACATTATTGAGAATGTAAGGGAAGTTGAAGCTGAAGAGTTGGATCAATAG
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>LITCHI030144.m1 CCCTTCGATTGGATCAAAGCCCACAAGTCCAAAAACAAATAACAAACGCCACCACCCACC ATCACAACCATCTCCCAACACCAACACCAACACCAACACCAAACAAACAAACATACAAAC AATGCTTCTTCTCCTTCCTCCTCTCTCTCAGTCTCTCTCTCTCCTCACAGAGTGAGAAAG TTCCCTCCCTTATCACCACTAGCCTCCGATCTCCACAAAAGTCCGCCGCCTAATTCATCA CCTACCCACCAATCAAAACACACCAACCTTCTCCTCTAGCCTCCAATTTCACTCGGCAGT CTCTGTTTTTTTATTATTTTTTCAGTTTCTCATCTGGGTCGGCGGGTTTTTTTTTTTATT TTTATTTTTTATTTTTTGTAAATTAAGGGGGGGAGAGGGGGGGGGGGGGGGGTGGTTGTG GAGGAGAAAATGGAGCCTAGAGTTGGGAACAAGTTCCGGCTTGGTCGAAAGATCGGTAGT GGGTCCTTTGGAGAGATCTATTTGGGTACTAATATTCAAACTAATGAGGAAGTTGCTATT AAGTTGGAAAATGTTAAGACAAAGCATCCTCAGCTACATTATGAATCTAAGTTGTATAAA ATACTACAAGGAGGAACTGGAGTCCCAAATGTGAAATGGTTTGGTGTTGAAGGGGACTAT AACGTCCTTGTGATAGATTTACTGGGGCCTAGCCTTGAAGATCTATTTAACTTTTGCAGT AGGAAACTGTCTCTCAAGACAGTCCTTATGCTTGCTGATCAGATGATAAATCGGGTTGAA TTTGTTCATTCAAAATCTTTTCTGCATCGAGATATCAAGCCGGACAACTTCCTCATGGGT TTAGGAAGGCATGCAAATAAGGTTTATGTCATTGACTTTGGTCTTGCTAAGAGGTATAGA GATACCGCCACACATCAACATATTCCTTATAGAGATAATAAGAATTTGACGGGAACTGCT AGATATGCAAGCATGAACACTCACCTTGGCATTGAACAAAGCCGCAGGGATGATTTAGAA TCACTTGGATATGTTCTTATGTATTTTTTAAGAGGAAGTCTTCCATGGCAAGGATTGAAA GCTGGAACGAAGAAGCAGAAGTATGAGAAGATCAGTGAGAAGAAAGTATCAACTTCTATT GAGGCCTTATGCCGGGGTTATCCTACAGAATTTGCATCATACTTTCATTACTGCCGGTCA ATGCGATTTGATGATAAGCCAGACTATGCTTATTTGAAAAGACTCTTCCGTGACCTTTTT ATTCGTGAAGGTTTCCAGTATGATTATGTGTTTGACTGGACAATTCTGAAGTATCAGCAA TCACAGATTCCTTCTCCTGCCCGTGCACTTGGCCCTGTAGCTGGACCAAGCTTTGCCGTG CCTCCAACTGGTGCCAATACAGGTGGTGGCGAAGAAGTTAGGCTTAATGGCTGGTCTTCT GCAGATCCCAGTCGCAGGAGGAACTCTGGACCGCTTACAAGCTCTGCAAACCTAACCTCA AAACAAAAAGGTCTACTTCCGAACGATCCAACACATTCAAAGGAGGCTATGGCATCGGGT TATAATTTCTTGCGAACAACTGGATCATCAAGGCGAGCTGCTATCTCTAGCAGTCGTGAT GCAGCTGTGGTTGGAAGTGAGGCCGACCCTTCTCATCCTCGCACTGCAGATGTCAGCACA GGACTGCTCCAAAAGATTTCTAGTGGTCAAAGAAGTTCACCAGTTGTATCATCAGAAAAC AGGCACACTTCTGGCAGAAGCACAACCAACATAAAGAATTTCGAGTCCACACTTCGAGGC ATCGAGAGCCTGCATTTCAGTACCGATGAGAGGGTACACTATTAGCAGACAGCCTGGAAC TTGCCCACTGTAAATTTTAAAAACGATTATACTTTTATCATGCATATGGGGTGGAATGTG TTGTTTGTGATGTGTTCTATAAAAGAAAAAGCTGATTAGCAAAAGATGGGAATGTCTGCC TGTAAGTAATCAATAAAGAAAGAGATGGATCATAGTGGAACCCTTGTGGAAAAGCACTGC TTAGGTAAAAGTGCTTTTGTCTTAACACAGGTGTCTAAGGCTTTCATCAAGTTAGTACAG TTTGAGTTGTATGAAATTGAAATGTTATCAGTACTTATTTTTGTGTTGGATTTCATTTCC TATATATATGACAGATCTCACACACTCTCGTTGGGGCCCAAAAACCATATGAGCACTGTA AATCTTCATGAGAGAAGCAATTGTATTGTATTCAAATATAGAACTTTCTGTTGCTATCAC TCTTTCTTTTTGTACTTTTTTGGCCACGTGACTGCCTACTTGATGATAACTTTAACTTCG AGATTACCAATTAGTTAGTGTTGATTGCATAATGCCTTTTTAGTAGTTATTATAACAAAG ATTGATTTTGAATACAATCCAGTCTAATTACCACTTACTGATAAGATGGTTTGGTGTGTT TTCTCTTTTCTTGTTAGGATACGATTGATGGATGTTACCTAAATGTTATTTTAGGTTTAT TTTAGTTTCAAATAGTATGATATGATATTATCCGATTTGAGCATTGAATATAAATTTTGC TTTGGATTTAAGATGTAATATTTTTGATGTCTCATTTTCTTTCATCTTTATCCACTTAAT TATTGCGCTTTTAAGAAAATGAAATTTTTGATATATGTTATTATGTGCAATAATATAATG ATAATATGATGACGTGATATGTTTGTCGAACAAATGGTGGTTGGTAATTACTCTTTGCAT AGGGGAAGGGGTG >LITCHI030144.m2 CCCTTCGATTGGATCAAAGCCCACAAGTCCAAAAACAAATAACAAACGCCACCACCCACC 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