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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021546 | Chr12 | 23937840 | 23946392 | - | Homeobox-DDT domain protein RLT3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021546.m1 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.1 | 2.90E-11 |
| LITCHI021546.m1 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.6 | 4.40E-06 |
| LITCHI021546.m1 | 374 | 429 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.5 | 4.70E-09 |
| LITCHI021546.m1 | 653 | 693 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.8 | 3.60E-08 |
| LITCHI021546.m1 | 785 | 858 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 1.00E-10 |
| LITCHI021546.m2 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.1 | 3.00E-11 |
| LITCHI021546.m2 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.6 | 4.40E-06 |
| LITCHI021546.m2 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.5 | 4.70E-09 |
| LITCHI021546.m2 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.8 | 3.60E-08 |
| LITCHI021546.m2 | 795 | 868 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 1.00E-10 |
| LITCHI021546.m3 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.2 | 2.80E-11 |
| LITCHI021546.m3 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.7 | 4.20E-06 |
| LITCHI021546.m3 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.6 | 4.50E-09 |
| LITCHI021546.m3 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.9 | 3.40E-08 |
| LITCHI021546.m3 | 795 | 868 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 9.60E-11 |
| LITCHI021546.m4 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.6 | 2.10E-11 |
| LITCHI021546.m4 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 27.1 | 3.10E-06 |
| LITCHI021546.m4 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 37 | 3.30E-09 |
| LITCHI021546.m4 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 33.3 | 2.50E-08 |
| LITCHI021546.m4 | 795 | 840 | PF15613.9 | WSD | Family | 26 | 1.10E-05 |
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>LITCHI021546.m1 ATGGAAACGAAAAGGAAGACGCCACTCCAGGTTGAAGCACTTCAGAGATTCTATGAAGGA GAGAATTATCCCTCGAAAATGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGTCTTTGGATTTGACATTC AAGCAGGTTCGGACATGGTTTATTGAGAAGAGGAGGAGGGATAAAAGTGATGGTGGAATT GATTTATCATCCCCTCCAAACAGGAAACTTCCATATGCTTGTGGAAGAAATGCTTTGGGT GTTAATGCTGCAACAAAGATAGTTAAAAGACGAGAGTCCTCTGTTTGTAATAGAGCAATA AAGGCTGCTTCAACATCTTTAAAGTATAAACGCATGTCATCAACAGTCGAGAATGGGACT GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG AAGAAGGTGTTTCGCAAGGACGGTCCTCCACTTGGGTTGGAATTTGACTCTCCTCGAGCA TTTTCCGTTTGTCACGATTCTGGAAATTCTGATTCTACCCTTCAAGAGAACCAAAGATCA TTAAAAAGGAGAAAGGACTACAGTATGAAGAATAGTCCTGTGAAGAAGCATGGCATGGGA AAAGGTTTGATGACAGTTTGGCGGGTGGTAAATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGC ATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGATGTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGA AAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAACTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTA GCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCCTTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAG GATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAGAAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTA TCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATGCTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGA 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GTTGATTCCTCATTGATAATATCAAAGCTTTCAATAGAAAAATCATCAAGCAATGGGAAA GGTGCAAAAGAAACAGAAGTCTCAGTTGATTTACATCCTATGCAATCTGTATATTTGGGG TCTGATCGTAGGTACAATAGATACTGGCTTTTTTTGGGCCCTTGTAACGTATATGATCCT GGCCATAAGAGGGTTTATTTTGAATCATCTGAGGATGGTCACTGGGAAGTGATCGATACT GCAGAGGCATTGCGTGCCTTGTTGTCTGTTCTGGATGACAGGGGTAGACGGGAGGCTCTT CTTATCGAATGCTTGGAGAAGCGGGAAGCTTTCCTCTGCCAGGCTATGTCAAGTAATCTG GTAAATGACTCTGGAACAAGGGAATCTGATCGGTCTGAATCAGATATTGTTAGAGAAGAC AGTTCTTCTCCAGTGTCAGATGTGGACAACAACCTAAACCTGACTGAGTCCAGAAACAAT TCTTTACCTCCCCTTGGTGCTATAGTTCTTGAAGTGGGGAGGAAAGGAGAAGAACAAAAC CGAAAGTGGAGCCGTCTTCAAGCTTTTGATGTGTGGATATGGAATTCCTTCTACTTGAAC CTTAATGCAGTAAAAAATGGTAAAAGGTCTTATCTTGATTCCCTTACTAGGTGCGAAAGT TGTCATGACTTGTACTGGAGAGATGAGAAGCACTGTAAGATATGCCATACAACATTTGAG CTTGATTTTGATCTAGAAGAAAGATATGCAATCCATGCTGCCACTTGTAGGGGGAAAGGA GACATTAACACATCTGTAAAGCATAAGATCCTATCATCACAATTGCAGTCACTGAAAGCT GCAGTTCATGCCATTGAGTCAGTTATGCCTGAAGATGCATTGGTGGGTGCTTGGACGAAA TTTGCTCATAGATTATGGATCAACCGACTTAGGCGCACCTCATCTTTGGCAGAACTTTTG 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AATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGCATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGAT GTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGAAAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAA CTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTAGCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCC TTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAGGATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAG AAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTATCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATG CTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGAGAGTTAGAAGCAGGACCAAATCCATCAACA TGTTGTGATCATATTTCAACGAATGGACTGCATGGTTGTTCCCTTTGCAGAGATTTGCTG GCCAAGTTTCCTCCAAATTCTGTTAAGATGAAGCAGCCCTTTGCTACACAACCTTGGGAT TCTTCTCCAGAGACTGTTAAGAAATTGTTTAAGGTCTTCCATTTCCTTTATACATACTCA GCTACAGTTGATGTATGCTCATTTACACTTGATGAGTTTGCTCAAGCATTTCATGATAAG GATTCCTTTTTACTTGGAAAAATTCACGTGGCTTTGCTCAAGGTTCTCTTATCTGATGTT AAAACGGAGCTTAACAGGGGGTGCTTGTCACATTTGAGTGTATCATGCAAGTTTCTTGCT TTGCTCCACTCGGTTGAAGATCAAGAATTCTTTGTGGAGTTCTGGAATGAATCTCTAAAC CCTCTAACATGGACAGAAATATTGCGTCAAGTATTGGTTGCAGCTGGTTTTGGATCAAAG CAAGGATCAGTGCGAAGGGAATCTCTTAGCAAGGAAATGAACCTCATGGTAAAGTATGGC CTACGTCTTGGTACCTTGAAAGGTGAATTGTTCAGAATTTTATTGGAGCAAGGAATTAAT 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>LITCHI019504.m1 MERYDYQMELPPGFRFHPTDEELITHYLSPKVLDNCFSARAIGEVDLNKCEPWDLPRRAK MGEKEWYFFCVRDRKYPTGLRTNRATDAGYWKATGKDKEIHKAKSLVGMKKTLVFYKGRA PKGEKTNWVMHEYRLEGKYSHYNLPKTAKNEWVICRVFQKSCGGKKTHIQGMVRLGSFEN DMSPSVLPPLMDSSPYNNSETGTAAVNEASHVTCFSDPMEDQKTTTQEDMIVDSCFNNTC SSTFLPSSNHPHSDISPSSFLSKSSVSNSFYANQILPTLANLHYHDAFLMQDQSILKTLL ENYPSDMKLNPKTEFSQDSVVSNQEDPSTSGGPAALDCFWNY. >LITCHI019504.m2 MGEKEWYFFCVRDRKYPTGLRTNRATDAGYWKATGKDKEIHKAKSLVGMKKTLVFYKGRA PKGEKTNWVMHEYRLEGKYSHYNLPKTAKNEWVICRVFQKSCGGKKTHIQGMVRLGSFEN DMSPSVLPPLMDSSPYNNSETGTAAVNEASHVTCFSDPMEDQKTTTQEDMIVDSCFNNTC SSTFLPSSNHPHSDISPSSFLSKSSVSNSFYANQILPTLANLHYHDAFLMQDQSILKTLL ENYPSDMKLNPKTEFSQDSVVSNQEDPSTSGGPAALDCFWNY. >LITCHI019504.m3 MNTDWKANTLIIISPKQQKYSPLFYSVFLCFCMILVYFCDNVVDRWFSILLQNEWVICRV FQKSCGGKKTHIQGMVRLGSFENDMSPSVLPPLMDSSPYNNSETGTAAVNEASHVTCFSD PMEDQKTTTQEDMIVDSCFNNTCSSTFLPSSNHPHSDISPSSFLSKSSVSNSFYANQILP TLANLHYHDAFLMQDQSILKTLLENYPSDMKLNPKTEFSQDSVVSNQEDPSTSGGPAALD CFWNY.
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