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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021546 | Chr12 | 23937840 | 23946392 | - | Homeobox-DDT domain protein RLT3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021546.m1 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.1 | 2.90E-11 |
| LITCHI021546.m1 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.6 | 4.40E-06 |
| LITCHI021546.m1 | 374 | 429 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.5 | 4.70E-09 |
| LITCHI021546.m1 | 653 | 693 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.8 | 3.60E-08 |
| LITCHI021546.m1 | 785 | 858 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 1.00E-10 |
| LITCHI021546.m2 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.1 | 3.00E-11 |
| LITCHI021546.m2 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.6 | 4.40E-06 |
| LITCHI021546.m2 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.5 | 4.70E-09 |
| LITCHI021546.m2 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.8 | 3.60E-08 |
| LITCHI021546.m2 | 795 | 868 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 1.00E-10 |
| LITCHI021546.m3 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.2 | 2.80E-11 |
| LITCHI021546.m3 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 26.7 | 4.20E-06 |
| LITCHI021546.m3 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 36.6 | 4.50E-09 |
| LITCHI021546.m3 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 32.9 | 3.40E-08 |
| LITCHI021546.m3 | 795 | 868 | PF15613.9 | WSD | Family | 42.2 | 9.60E-11 |
| LITCHI021546.m4 | 6 | 55 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 43.6 | 2.10E-11 |
| LITCHI021546.m4 | 23 | 53 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 27.1 | 3.10E-06 |
| LITCHI021546.m4 | 384 | 439 | PF02791.20 | DDT | Family | 37 | 3.30E-09 |
| LITCHI021546.m4 | 663 | 703 | PF15612.9 | WHIM1 | Motif | 33.3 | 2.50E-08 |
| LITCHI021546.m4 | 795 | 840 | PF15613.9 | WSD | Family | 26 | 1.10E-05 |
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>LITCHI021546.m1 ATGGAAACGAAAAGGAAGACGCCACTCCAGGTTGAAGCACTTCAGAGATTCTATGAAGGA GAGAATTATCCCTCGAAAATGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGTCTTTGGATTTGACATTC AAGCAGGTTCGGACATGGTTTATTGAGAAGAGGAGGAGGGATAAAAGTGATGGTGGAATT GATTTATCATCCCCTCCAAACAGGAAACTTCCATATGCTTGTGGAAGAAATGCTTTGGGT GTTAATGCTGCAACAAAGATAGTTAAAAGACGAGAGTCCTCTGTTTGTAATAGAGCAATA AAGGCTGCTTCAACATCTTTAAAGTATAAACGCATGTCATCAACAGTCGAGAATGGGACT GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG AAGAAGGTGTTTCGCAAGGACGGTCCTCCACTTGGGTTGGAATTTGACTCTCCTCGAGCA TTTTCCGTTTGTCACGATTCTGGAAATTCTGATTCTACCCTTCAAGAGAACCAAAGATCA TTAAAAAGGAGAAAGGACTACAGTATGAAGAATAGTCCTGTGAAGAAGCATGGCATGGGA AAAGGTTTGATGACAGTTTGGCGGGTGGTAAATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGC ATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGATGTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGA AAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAACTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTA GCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCCTTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAG GATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAGAAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTA TCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATGCTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGA 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