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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021546Chr122393784023946392-Homeobox-DDT domain protein RLT3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021546.m1655PF00046.32HomeodomainDomain43.12.90E-11
LITCHI021546.m12353PF05920.14Homeobox_KNFamily26.64.40E-06
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LITCHI021546.m2384439PF02791.20DDTFamily36.54.70E-09
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LITCHI021546.m3655PF00046.32HomeodomainDomain43.22.80E-11
LITCHI021546.m32353PF05920.14Homeobox_KNFamily26.74.20E-06
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LITCHI021546.m3663703PF15612.9WHIM1Motif32.93.40E-08
LITCHI021546.m3795868PF15613.9WSDFamily42.29.60E-11
LITCHI021546.m4655PF00046.32HomeodomainDomain43.62.10E-11
LITCHI021546.m42353PF05920.14Homeobox_KNFamily27.13.10E-06
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LITCHI021546.m4795840PF15613.9WSDFamily261.10E-05
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>LITCHI021546.m1
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GATTTATCATCCCCTCCAAACAGGAAACTTCCATATGCTTGTGGAAGAAATGCTTTGGGT
GTTAATGCTGCAACAAAGATAGTTAAAAGACGAGAGTCCTCTGTTTGTAATAGAGCAATA
AAGGCTGCTTCAACATCTTTAAAGTATAAACGCATGTCATCAACAGTCGAGAATGGGACT
GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG
AAGAAGGTGTTTCGCAAGGACGGTCCTCCACTTGGGTTGGAATTTGACTCTCCTCGAGCA
TTTTCCGTTTGTCACGATTCTGGAAATTCTGATTCTACCCTTCAAGAGAACCAAAGATCA
TTAAAAAGGAGAAAGGACTACAGTATGAAGAATAGTCCTGTGAAGAAGCATGGCATGGGA
AAAGGTTTGATGACAGTTTGGCGGGTGGTAAATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGC
ATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGATGTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGA
AAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAACTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTA
GCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCCTTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAG
GATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAGAAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTA
TCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATGCTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGA
GAGTTAGAAGCAGGACCAAATCCATCAACATGTTGTGATCATATTTCAACGAATGGACTG
CATGGTTGTTCCCTTTGCAGAGATTTGCTGGCCAAGTTTCCTCCAAATTCTGTTAAGATG
AAGCAGCCCTTTGCTACACAACCTTGGGATTCTTCTCCAGAGACTGTTAAGAAATTGTTT
AAGGTCTTCCATTTCCTTTATACATACTCAGCTACAGTTGATGTATGCTCATTTACACTT
GATGAGTTTGCTCAAGCATTTCATGATAAGGATTCCTTTTTACTTGGAAAAATTCACGTG
GCTTTGCTCAAGGTTCTCTTATCTGATGTTAAAACGGAGCTTAACAGGGGGTGCTTGTCA
CATTTGAGTGTATCATGCAAGTTTCTTGCTTTGCTCCACTCGGTTGAAGATCAAGAATTC
TTTGTGGAGTTCTGGAATGAATCTCTAAACCCTCTAACATGGACAGAAATATTGCGTCAA
GTATTGGTTGCAGCTGGTTTTGGATCAAAGCAAGGATCAGTGCGAAGGGAATCTCTTAGC
AAGGAAATGAACCTCATGGTAAAGTATGGCCTACGTCTTGGTACCTTGAAAGGTGAATTG
TTCAGAATTTTATTGGAGCAAGGAATTAATGGATTGAAAGTTTCTCAATTGGTAAAATCT
TCACAGGTTGCTGAATTGAACCTTGCTGGCACGACTGAGGAGCTTGAATCTTTGATAAGT
TCTACTCTTTCAAGTGATATTACTTTATTTGAAAAGATCTCAGCATCTGCATATCGTCTA
CGTGTTAGCACTTCAAAGGAAGTCGATGATTTTGATTCAGATACTGAGGACTCTGGCAGT
GTTGAAGATAACTCCAATGTTGCTGGCACATGCAGCAGCAGTGATGATTCAGAATGTGAT
TCAGAAAATCACAGTCGACGAAAACTTAAACTTGTAAACTGTCGTAAAAATAAAGGTAAA
ATGTTGACAGTTCATAATGAAATTGATGAGAGCCACCCGGGAGAGGTGTGGTTGCTAGGA
CTTATTGAAGGGGAATATTCAGATCTAAGCATTGAAGAGAAGTTGAATGCCTTGGTGGCT
TTAATTGATCTTGTTGGTGCTGGATCCAGTATCAGAATGGAGGATCCGGCAAAAGCCATT
GTTGAAAGCGTTCCTGGTATCCATTATGGTTCTGGAGCAAAAATTAAGAGATCGTTGTCA
AACCAACAGAATTTGCCTCGGCCATCTTGGATTCATGTTGGACAACAACATGGTGTAAAA
GGATCATGCACATCGTCTGACTCGCGCCCGGTTGATTCCTCATTGATAATATCAAAGCTT
TCAATAGAAAAATCATCAAGCAATGGGAAAGGTGCAAAAGAAACAGAAGTCTCAGTTGAT
TTACATCCTATGCAATCTGTATATTTGGGGTCTGATCGTAGGTACAATAGATACTGGCTT
TTTTTGGGCCCTTGTAACGTATATGATCCTGGCCATAAGAGGGTTTATTTTGAATCATCT
GAGGATGGTCACTGGGAAGTGATCGATACTGCAGAGGCATTGCGTGCCTTGTTGTCTGTT
CTGGATGACAGGGGTAGACGGGAGGCTCTTCTTATCGAATGCTTGGAGAAGCGGGAAGCT
TTCCTCTGCCAGGCTATGTCAAGTAATCTGGTAAATGACTCTGGAACAAGGGAATCTGAT
CGGTCTGAATCAGATATTGTTAGAGAAGACAGTTCTTCTCCAGTGTCAGATGTGGACAAC
AACCTAAACCTGACTGAGTCCAGAAACAATTCTTTACCTCCCCTTGGTGCTATAGTTCTT
GAAGTGGGGAGGAAAGGAGAAGAACAAAACCGAAAGTGGAGCCGTCTTCAAGCTTTTGAT
GTGTGGATATGGAATTCCTTCTACTTGAACCTTAATGCAGTAAAAAATGGTAAAAGGTCT
TATCTTGATTCCCTTACTAGGTGCGAAAGTTGTCATGACTTGTACTGGAGAGATGAGAAG
CACTGTAAGATATGCCATACAACATTTGAGCTTGATTTTGATCTAGAAGAAAGATATGCA
ATCCATGCTGCCACTTGTAGGGGGAAAGGAGACATTAACACATCTGTAAAGCATAAGATC
CTATCATCACAATTGCAGTCACTGAAAGCTGCAGTTCATGCCATTGAGTCAGTTATGCCT
GAAGATGCATTGGTGGGTGCTTGGACGAAATTTGCTCATAGATTATGGATCAACCGACTT
AGGCGCACCTCATCTTTGGCAGAACTTTTGCAGGTTGTTGCTGATTTTGTCAGTGCAATC
AATGAGGATTGGTTATGTCAATTGAAAGCTGAACAAGAGGTTAATCCTGTTATTGAAGAA
GTCATTGCATGCTTTCCATCTATGCCCCAGACTTCATCTGCACTTGCATTGTGGTTGGTG
CAATTGGATGCATTGATAGCTCCGTATTTGGAAAGAATCAAGTCTGAAAAGCAGCAGGAA
ATCAGGACTAGATGTAGAGGTAAGCATGCTATTGATCAATAG
>LITCHI021546.m2
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GAGAATTATCCCTCGAAAATGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGTCTTTGGATTTGACATTC
AAGCAGGTTCGGACATGGTTTATTGAGAAGAGGAGGAGGGATAAAAGTGATGGTGGAATT
GATTTATCATCCCCTCCAAACAGGAAACTTCCATATGCTTGTGGAAGAAATGCTTTGGGT
GTTAATGCTGCAACAAAGATAGTTAAAAGACGAGAGTCCTCTGTTTGTAATAGAGCAATA
AAGGCTGCTTCAACATCTTTAAAGTATAAACGCATGTCATCAACAGTCGAGAATGGGACT
GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG
AAGAAGGTGTTTCGCAAGGACGGTCCTCCACTTGGGTTGGAATTTGACTCTCCTCGAGCA
TTTTCCGTTTGTCACGATTCTGGAAATTCTGATTCTACCCTTCAAGAGAACCAAAGATCA
TTAAAAAGGAGAAAGGTTTCCAAGCATGACAAGCTAGTGTGTCAGGACTACAGTATGAAG
AATAGTCCTGTGAAGAAGCATGGCATGGGAAAAGGTTTGATGACAGTTTGGCGGGTGGTA
AATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGCATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGAT
GTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGAAAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAA
CTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTAGCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCC
TTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAGGATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAG
AAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTATCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATG
CTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGAGAGTTAGAAGCAGGACCAAATCCATCAACA
TGTTGTGATCATATTTCAACGAATGGACTGCATGGTTGTTCCCTTTGCAGAGATTTGCTG
GCCAAGTTTCCTCCAAATTCTGTTAAGATGAAGCAGCCCTTTGCTACACAACCTTGGGAT
TCTTCTCCAGAGACTGTTAAGAAATTGTTTAAGGTCTTCCATTTCCTTTATACATACTCA
GCTACAGTTGATGTATGCTCATTTACACTTGATGAGTTTGCTCAAGCATTTCATGATAAG
GATTCCTTTTTACTTGGAAAAATTCACGTGGCTTTGCTCAAGGTTCTCTTATCTGATGTT
AAAACGGAGCTTAACAGGGGGTGCTTGTCACATTTGAGTGTATCATGCAAGTTTCTTGCT
TTGCTCCACTCGGTTGAAGATCAAGAATTCTTTGTGGAGTTCTGGAATGAATCTCTAAAC
CCTCTAACATGGACAGAAATATTGCGTCAAGTATTGGTTGCAGCTGGTTTTGGATCAAAG
CAAGGATCAGTGCGAAGGGAATCTCTTAGCAAGGAAATGAACCTCATGGTAAAGTATGGC
CTACGTCTTGGTACCTTGAAAGGTGAATTGTTCAGAATTTTATTGGAGCAAGGAATTAAT
GGATTGAAAGTTTCTCAATTGGTAAAATCTTCACAGGTTGCTGAATTGAACCTTGCTGGC
ACGACTGAGGAGCTTGAATCTTTGATAAGTTCTACTCTTTCAAGTGATATTACTTTATTT
GAAAAGATCTCAGCATCTGCATATCGTCTACGTGTTAGCACTTCAAAGGAAGTCGATGAT
TTTGATTCAGATACTGAGGACTCTGGCAGTGTTGAAGATAACTCCAATGTTGCTGGCACA
TGCAGCAGCAGTGATGATTCAGAATGTGATTCAGAAAATCACAGTCGACGAAAACTTAAA
CTTGTAAACTGTCGTAAAAATAAAGGTAAAATGTTGACAGTTCATAATGAAATTGATGAG
AGCCACCCGGGAGAGGTGTGGTTGCTAGGACTTATTGAAGGGGAATATTCAGATCTAAGC
ATTGAAGAGAAGTTGAATGCCTTGGTGGCTTTAATTGATCTTGTTGGTGCTGGATCCAGT
ATCAGAATGGAGGATCCGGCAAAAGCCATTGTTGAAAGCGTTCCTGGTATCCATTATGGT
TCTGGAGCAAAAATTAAGAGATCGTTGTCAAACCAACAGAATTTGCCTCGGCCATCTTGG
ATTCATGTTGGACAACAACATGGTGTAAAAGGATCATGCACATCGTCTGACTCGCGCCCG
GTTGATTCCTCATTGATAATATCAAAGCTTTCAATAGAAAAATCATCAAGCAATGGGAAA
GGTGCAAAAGAAACAGAAGTCTCAGTTGATTTACATCCTATGCAATCTGTATATTTGGGG
TCTGATCGTAGGTACAATAGATACTGGCTTTTTTTGGGCCCTTGTAACGTATATGATCCT
GGCCATAAGAGGGTTTATTTTGAATCATCTGAGGATGGTCACTGGGAAGTGATCGATACT
GCAGAGGCATTGCGTGCCTTGTTGTCTGTTCTGGATGACAGGGGTAGACGGGAGGCTCTT
CTTATCGAATGCTTGGAGAAGCGGGAAGCTTTCCTCTGCCAGGCTATGTCAAGTAATCTG
GTAAATGACTCTGGAACAAGGGAATCTGATCGGTCTGAATCAGATATTGTTAGAGAAGAC
AGTTCTTCTCCAGTGTCAGATGTGGACAACAACCTAAACCTGACTGAGTCCAGAAACAAT
TCTTTACCTCCCCTTGGTGCTATAGTTCTTGAAGTGGGGAGGAAAGGAGAAGAACAAAAC
CGAAAGTGGAGCCGTCTTCAAGCTTTTGATGTGTGGATATGGAATTCCTTCTACTTGAAC
CTTAATGCAGTAAAAAATGGTAAAAGGTCTTATCTTGATTCCCTTACTAGGTGCGAAAGT
TGTCATGACTTGTACTGGAGAGATGAGAAGCACTGTAAGATATGCCATACAACATTTGAG
CTTGATTTTGATCTAGAAGAAAGATATGCAATCCATGCTGCCACTTGTAGGGGGAAAGGA
GACATTAACACATCTGTAAAGCATAAGATCCTATCATCACAATTGCAGTCACTGAAAGCT
GCAGTTCATGCCATTGAGTCAGTTATGCCTGAAGATGCATTGGTGGGTGCTTGGACGAAA
TTTGCTCATAGATTATGGATCAACCGACTTAGGCGCACCTCATCTTTGGCAGAACTTTTG
CAGGTTGTTGCTGATTTTGTCAGTGCAATCAATGAGGATTGGTTATGTCAATTGAAAGCT
GAACAAGAGGTTAATCCTGTTATTGAAGAAGTCATTGCATGCTTTCCATCTATGCCCCAG
ACTTCATCTGCACTTGCATTGTGGTTGGTGCAATTGGATGCATTGATAGCTCCGTATTTG
GAAAGAATCAAGTCTGAAAAGCAGCAGGAAATCAGGACTAGATGTAGAGGTAAGCATGCT
ATTGATCAATAG
>LITCHI021546.m3
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GATTTATCATCCCCTCCAAACAGGAAACTTCCATATGCTTGTGGAAGAAATGCTTTGGGT
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AAGGCTGCTTCAACATCTTTAAAGTATAAACGCATGTCATCAACAGTCGAGAATGGGACT
GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG
AAGAAGGTGTTTCGCAAGGACGGTCCTCCACTTGGGTTGGAATTTGACTCTCCTCGAGCA
TTTTCCGTTTGTCACGATTCTGGAAATTCTGATTCTACCCTTCAAGAGAACCAAAGATCA
TTAAAAAGGAGAAAGGTTTCCAAGCATGACAAGCTAGTGTGTCAGGACTACAGTATGAAG
AATAGTCCTGTGAAGAAGCATGGCATGGGAAAAGGTTTGATGACAGTTTGGCGGGTGGTA
AATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGCATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGAT
GTACCTCAGACAGCAATCTCTGTATCAAGAAAACCACCGCTTAGAAAGAAAAGAGCTCAA
CTTGTAACTCTGTTGAAACAGAGGAGGTTAGCTAAATTGCAGGATAAGAAGAAGCCTCCC
TTGAAAAAGAGACAGGTGAATTTGAGCAAGGATGTGAGTCTGACACAGCCACGCAAAGAG
AAATGTGAACTAGCTTTGGAAGGCTTGGTATCTCAAGAGTGTCTTGATCAAATTGCTATG
CTTGTGGATGATGAAGAGCTGGAGCTAAGAGAGTTAGAAGCAGGACCAAATCCATCAACA
TGTTGTGATCATATTTCAACGAATGGACTGCATGGTTGTTCCCTTTGCAGAGATTTGCTG
GCCAAGTTTCCTCCAAATTCTGTTAAGATGAAGCAGCCCTTTGCTACACAACCTTGGGAT
TCTTCTCCAGAGACTGTTAAGAAATTGTTTAAGGTCTTCCATTTCCTTTATACATACTCA
GCTACAGTTGATGTATGCTCATTTACACTTGATGAGTTTGCTCAAGCATTTCATGATAAG
GATTCCTTTTTACTTGGAAAAATTCACGTGGCTTTGCTCAAGGTTCTCTTATCTGATGTT
AAAACGGAGCTTAACAGGGGGTGCTTGTCACATTTGAGTGTATCATGCAAGTTTCTTGCT
TTGCTCCACTCGGTTGAAGATCAAGAATTCTTTGTGGAGTTCTGGAATGAATCTCTAAAC
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GGATTGAAAGTTTCTCAATTGGTAAAATCTTCACAGGTTGCTGAATTGAACCTTGCTGGC
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GAAAAGATCTCAGCATCTGCATATCGTCTACGTGTTAGCACTTCAAAGGAAGTCGATGAT
TTTGATTCAGATACTGAGGACTCTGGCAGTGTTGAAGATAACTCCAATGTTGCTGGCACA
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CTTATCGAATGCTTGGAGAAGCGGGAAGCTTTCCTCTGCCAGGCTATGTCAAGTAATCTG
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GCAGTTCATGCCATTGAGGTGAGGTCATTTGGCTATTGGCTTTGTGGCACCTTGCCATAT
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ACAGGAGTAGAATTGGTATTTGTTTCATAG
>LITCHI021546.m4
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GGCAGGAGAAGGCAAAAAATGATTATTCTTCAAGATATGTTGTCTCCAGATTACATTCTG
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AATCCCAATGGGGGGAGATTTCCTACTGGCATTGATTTTGCTGACAGAGACGACGCTGAT
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GCCAAGTTTCCTCCAAATTCTGTTAAGATGAAGCAGCCCTTTGCTACACAACCTTGGGAT
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GCTACAGTTGATGTATGCTCATTTACACTTGATGAGTTTGCTCAAGCATTTCATGATAAG
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GTTGATTCCTCATTGATAATATCAAAGCTTTCAATAGAAAAATCATCAAGCAATGGGAAA
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GGCCATAAGAGGGTTTATTTTGAATCATCTGAGGATGGTCACTGGGAAGTGATCGATACT
GCAGAGGTAACTCTCTCAGCCTTTATCAAGATGCTTGGATCTTGCTGA
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