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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021505 | Chr12 | 23478498 | 23482236 | - | "Ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit N-methyltransferase, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021505.m1 | 98 | 302 | PF00856.31 | SET | Family | 58 | 1.60E-15 |
LITCHI021505.m1 | 335 | 468 | PF09273.14 | Rubis-subs-bind | Domain | 74.5 | 1.30E-20 |
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>LITCHI021505.m1 - Up_Stream_Len 2000 GCAGTACGAAGGTATACATATCAAATCCCCAGGTAAGTTTGCGTCAAGTTCAGTTGAATT GTCAAATACAACTAACTATCAACAATATTGGAACTTAACAAAATAACTAAAACAATTAAA TGCAATCAATGATACGCTGTTATCCACAATTTCAAGCTAAAGTTCAAATATCACTTTAGC ATCAATATTGGCTAGCCAGGCTTGTCTGAAAGTCACATACATCTGCATATATTCAACCCT AGACATGAACACAACAAACTTAGGCAACACTCACAAATTTGCTTTCCCTGAAGTACTGGT AAAGTTCATGCCAGACATCACCCCCCGCTATAGCTGCATATACGATTAGCCCCAGTCCTG CAGTGAGTGATATCTGATATGCAACGGGGTTAGCTCAAATTAGCCACAGAAAAAATGATA TTTTGACGTATACTTGTAATGTACTTAGTTGAAAAGTTAAAAATACTCTTACCAAGTTTC ATGTTGATTACACAAAAAAAAAAAAATGCTTACCCCAGCAGTTAATTTGGATTCCAAAAC ATTTAGAGGCCATCTACTCAGCTCAGTTTCATCAACAGGAGGAGGTGGTGGTTTCCAAAG AACAAAATAGGGTAGAAGAGCATATGCACCACCAAAGCATGAGAGTACAAGAAATGGCCA AACAGGAATGTTGCTCTTGGCGCTGCAGAAACAAAGATCAATCAGTCATGGTTATGGTTT TGTAACACTTAATCCTAACATTAATCCAGTTCATTCATTCATCCAAGAATACAATCTTAT TAAACGAAACAATCCTCAGCGTTTGGAGCAAATGCAGTGCACCGAAATAGTGATGGAGAT CAGTAGTTCATGACATAATACAAAGAACTAAAGATAGGGAATACCTTCTACCTGTTGGAA GCAGAATCATGCTATACACTAAAGGCCACAAACCCATGATATACCATAGAGACACAAGAA CTTCATTCATCCTAAAGCCGTCATCCCCCTTCAAATTCAGAAGCTTTTTTAGAAAATACA TGTCCCTTGACTGCAAGTTAAAAGTCCACACATTAATGAACAGATTCCCCATAGATTGAA ACTACTTCAAAGATATTATGCCATACTAAATGCAATAGTTAAGATAGTCACAACATATTC AACCAATCAGACTAATTTCTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATATATTTTCATTTTCT ACATGTGTTACCCAAATGCAACAATACAGGAACTAGATTTACCTTCAAGAAACAACATTT CATCAATGAAGCAAAGGAAACAGATAAAAAAGACAAAAACTTGAAACTAATACAAATTAA CTACTAGAAAAAGGTACTTATCAACAAAATCCAAAACATTGTTTGGGGGGGGGGAAGAGG GGTGTGAGGAGATGGGGATGGATTGCGGGCTGTTCTATCAATACCGGGGTCTGGTTAGGA GCGAGATTGAAAACATAGTAAATGAGCACACCCCACAACACAAAAAGCAAAATTGAGGTT GTCCAGTCCCTCCCCTCTTGAACACCATTTCTACTCTCCACTTTGCCAGCCAAAACCTGT TCTTCCTCCAAGTTCTGGTTATTGTCCAAGGTGCTTTGACATCTTTGGACAAAAAGAGAC CTTCTGCTATGGTTGTGGGGTCTGAGTAGTAAAGATGGCAACTTTGAGGTTGGTATTGCG TTGGGAAGTGAAAAGTTGGTTTTTTTAAGGTTATGGAGTTGAAGTGAAGTGATTCTGGGT GGTTTTGGGGTTTTGGTTGCAAGTGAAGTGAAGTAGTTGCAAGAGATGAGGTTGGTATTG GTCAACATGTTTTGTCTCAGACACCTCTTTACGCATGTAACTGCTTCTTATACCATGTTT TTCCACTTATACGACACCGTTTTAAATTATCTTCAAAATCCGTTTACAAGTGTCGTGCAC GCTGGCTTCTCTCTTCATCTTCTAAGCAGATAAGGTGGTCTCTCACTCTGTGTGTATGCG AGTGTGAAGACTCGAGAGTC
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>LITCHI021505.m1 GenomeSequence - ATGGTCGAAGCTTCTACAATCTTCCAAACGACACTGCTACCAGCATTCCCACATCACCAC AAGCCACGGTTGTCAACTTTCCGGCGCAAAACAAGACACGGACTCCAACTGCTTCACTGT TCTATCTCCACAGAAAACGATACGGCAGCCAAAACGGCGCCGACCCAGATGAGCATTCCG TGGGGTTGTGACGTAGATTCACTGGATAACGCTTCTGCCCTCCAGAAATGGCTGTCTGAG TCGGGCCTGCCAACGCAGAAGATGGGGATACAAAGAGTTGATGTGGGGGAGAGAGGCCTT GTTGCTTTGAAGAACATCAGGAAGGGTGAGAAGTTGCTCTTTGTTCCACCCTCTCTTGTC ATCACTGCTGACTCGGTAAAATTTCTCTTTCTTTTCATCTATCAATCAAAAAAGTTGTTC GCTTGTTACTAGTTTTTGTTTTTTGGTAGTTCTCTTCAATCAATGCAAGCTGTTATCTTT TTGTTTGTGTTTCAATGAGGGCTTTTGTTGTGTTGTTTGTTTGATTTCACAGGGTTGATA GTTATATTGTGTGTGTGTGGTTGTGGATGTTCTGGTTTTTCGTTTGACTTGTTTTAGTTT TTCTCTAATTTCTTCAAGCAGTGCAAGTTATCTTCTTTTTTCTTTATGTGTGTTTCTATG AGGATATTTATTTTATTTATTTTATTTTTTAATGATGTTGTTTGTTTGATTTATGTGAGT GATTGAGTGTTGGTGTTTGTGGATGTTTATAATTTTTTGTTTGATCTAGGATAGTTCAAC CAGTACATGTAATGCTGTTGATTTGTTGTAGTAGTCCTCTAGTTTTCTTCAATGGAAATT ATCATCTATGAGGAATATGGTTATGTTGTTTGTTTGAGCTTATGGGGGAGATGAGTGATT TTTGTATGTGGATGTTGGTTGTAAATTGTGGATGATAGCAATGGGGCTGTCCAGAGGCTG GTGAAGTGTTGAAGCAGTATTCAGTTCCGGATTGGCCATTGCTTGCAATCTATTTGATTA GTGAAGCAAGTCTTGAGAAATCTTCAAGATGGAGCAATTACATCTCTGCGTTACCCCGCC AGCCTTATTCGCTTCTTTATTGGTGAGTTTCTGTGCTTCACTGCTTGTTTTGTGGTGGGG TTCTTTGAGAGTTTAATTCTTTGCTACGGAAAGGGTCTACTCTCAGTGTTTCTCCCTACA GACTCTCTATGTCATTTCAGGACAAGTGCTGAACTAGATAGGTATTTGGAAGCTTCGCAG ATTAGAGAGCGGGCGATTGAAAGGATTACCAACGTCATTGGAACGTAGGAATTTGTTATT TTCAACCATAAAACACTTGGGTTTTGTTTTGTGCCCTGCAGCACCTGTAATTCAATGCTG AATGCATTCCCTTGTGCAGATACAATGATTTGAAGCTCAGGATATTTTCCAAGTATCCTG ACATATTCCCTGAAGAGGTACTTATTGTATGTTGCTGATATTAATAGGCCTACTACAATT TATCGTTAGACAGTAAAAACAATGATCAATCAATATAATACTAGTCTATATCTCCAGGCT ATTTTACTAGTCTGTATCTCTAGAAGACAGTAAAAACGATGATCAATCCATATAATACTT CAGTACATTCTATACTGGAACCTTGTCAGGTGTTCTATAGACACTTATATATACTGCCAT TATTGATTTGTTACCATGCCTCTTGTTGATTTTTGCACTGTATATGGATTACAGGTATTC AATTTGGAAACATTCAAATGGTCATTTGGTATTCTTTTCTCACGATTGGTAAGCAAATGT TCAAACTCATTTGGCACACTCAAATTTTACAGCATTGGGAAATGATGCTCATTGCAAGTC TAGACATCCTCTAATTATAATGCTTGTATCCTTTTCTTTTCGACCTATGGCTCACATCCT TATTTTGTATCTATTTTTGTTTAATTTGAGTAACAAGCCATTTGTAAGAATTGAAGTTCA TATTTCTTTTACTCAGGTTCGGTTGCCATCAATGGATGGAAGGGTTGCATTGGTTCCTTG GGCAGATATGCTGAATCACAGTTGTGAGGTATGAAGAGTTGAAGATTAGTCTCTTTGTAA GTCATTATGTCGTTTAAAATATTCGCTGACAAATTCTGATTATGTTACGTTTGTATTTGA CTGGTCTAGGTGGAGACGTTTTTGGATTATGATAAATCCTCAGAGGGAATTGTCTTCACT ACTGATCGACCATATCAGCCAGGTGAGCAGGTAAACAATATTTAGTGATATCTCCATTAA CGATTCTATATACAGATCTCTAGTAGGAATTCCTGATGTAGAAGGAGAAACAACATGAAC CTGGTTATTAATACTATATCTTAAATTGCTCGAAAAGCTTGAAATTTTTTTATAAAAGAA AATGTTCCGCCTCTAACAATAATCATTCAAGTTCAATAAGCTTTACCTTGGTCACTAGCT TCAGCTTTAGTTTGTGTAAAAATATTTAACCTCACTGCTTGACCAGTCTCTTATTTCACT GCATGCAGGTTTTTATATCTTATGGAAGGAAATCAAATGGAGAGCTATTGCTTTCATATG GATTTGTTCCAAGGGAGGGCACCAACCCAAGCGATTCAGTAGAGTTGTTGTTATCTCTTA AGAAATCTGACAAATGTTATAAGGAGAAGTTAGAAGCCCTGAGGAAGCACGGGTTGTCAG CGTGAGTATCTGATCATCTATGTGTTTAATTTACCTTTCTTAAGTTTTTCCAAAAGTTTT CTTACGTCTCATAATATAATAAATGATCAAGTGTTTGAATTTTAAGTTAATTTGTTAGAG ACGTAAACATATTCGGTTTCTGTCTTCGTATGTTACTCCAATTGATAAACTTCAATTGAT GCATGGAACTACATGAAATCTTTTGGCAGATCTCAGTGTTTTCCGATGCAAATCACTGGT TGGCCATTAGAGTTAATGGCATATGCTTATTTAACAGTCAGCCCTCCAAGTATGAGGGGA AAGTTTGAAGAGGTATGTTAATTTCATCTACAAATCAAAAGCAAACATGTTTTAGTATTG CATAAGATAGCTCAAACATCTTTTGACCAGATAGCTGCTGCTGCCTCAAATAAAACAACC GTCAAGAAGGACATGAAATACCCCGAAATTGAGGAAGAAGCTTTACAATTTATATTGGAC AGCTGTGAATCAAGCATATCCAAGTACTCCAAATTCTTGCAGGTTTCACAGCTTCTTTGT TAGAGACTTATATACAAGTCAATGATTTTATTTCCAAAAAACTGTTGTCAACATACTATA ACATGTTATATTGGGGGACTTGTAGGCAAGTGGATCGATGGATTTGGACATAACATCACC AAAGCAACTGAACCGGAGAGTGTTCCTGAAACAACTAGCTGTCGACTTGTGCACTAGTGA ACGAAGAATACTGTTTCGTGCACAATACGTAAGGAATAATCACCCCTCTTGCTCGTGTAA ATCAATCAGTATTCATCTCATAATACCACGACATGCTGTTTATTGCACAATAATGCATCA TCATGAATGATTCAATTGGATTTTAACGATATCATATTATTCTTTGATGTACATTTGTGT TTGTATATTCGAATACAATGCTTGATGTTCAATGCCTTATTATGTGTTGTAGATACTGAG GAGGAGATTGAGGGACATGAGGAGTGGTGAACTGAGAGCTCTTAAAATATTTGACAGCTT CAGGAATCTCTTCAAATGA