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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021505 | Chr12 | 23478498 | 23482236 | - | "Ribulose-1,5 bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit N-methyltransferase, chloroplastic " |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021505.m1 | 98 | 302 | PF00856.31 | SET | Family | 58 | 1.60E-15 |
LITCHI021505.m1 | 335 | 468 | PF09273.14 | Rubis-subs-bind | Domain | 74.5 | 1.30E-20 |
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>LITCHI021505.m1 ATGGTCGAAGCTTCTACAATCTTCCAAACGACACTGCTACCAGCATTCCCACATCACCAC AAGCCACGGTTGTCAACTTTCCGGCGCAAAACAAGACACGGACTCCAACTGCTTCACTGT TCTATCTCCACAGAAAACGATACGGCAGCCAAAACGGCGCCGACCCAGATGAGCATTCCG TGGGGTTGTGACGTAGATTCACTGGATAACGCTTCTGCCCTCCAGAAATGGCTGTCTGAG TCGGGCCTGCCAACGCAGAAGATGGGGATACAAAGAGTTGATGTGGGGGAGAGAGGCCTT GTTGCTTTGAAGAACATCAGGAAGGGTGAGAAGTTGCTCTTTGTTCCACCCTCTCTTGTC ATCACTGCTGACTCGCAATGGGGCTGTCCAGAGGCTGGTGAAGTGTTGAAGCAGTATTCA GTTCCGGATTGGCCATTGCTTGCAATCTATTTGATTAGTGAAGCAAGTCTTGAGAAATCT TCAAGATGGAGCAATTACATCTCTGCGTTACCCCGCCAGCCTTATTCGCTTCTTTATTGG ACAAGTGCTGAACTAGATAGGTATTTGGAAGCTTCGCAGATTAGAGAGCGGGCGATTGAA AGGATTACCAACGTCATTGGAACATACAATGATTTGAAGCTCAGGATATTTTCCAAGTAT CCTGACATATTCCCTGAAGAGGTATTCAATTTGGAAACATTCAAATGGTCATTTGGTATT CTTTTCTCACGATTGGTTCGGTTGCCATCAATGGATGGAAGGGTTGCATTGGTTCCTTGG GCAGATATGCTGAATCACAGTTGTGAGGTGGAGACGTTTTTGGATTATGATAAATCCTCA GAGGGAATTGTCTTCACTACTGATCGACCATATCAGCCAGGTGAGCAGGTTTTTATATCT TATGGAAGGAAATCAAATGGAGAGCTATTGCTTTCATATGGATTTGTTCCAAGGGAGGGC ACCAACCCAAGCGATTCAGTAGAGTTGTTGTTATCTCTTAAGAAATCTGACAAATGTTAT AAGGAGAAGTTAGAAGCCCTGAGGAAGCACGGGTTGTCAGCATCTCAGTGTTTTCCGATG CAAATCACTGGTTGGCCATTAGAGTTAATGGCATATGCTTATTTAACAGTCAGCCCTCCA AGTATGAGGGGAAAGTTTGAAGAGATAGCTGCTGCTGCCTCAAATAAAACAACCGTCAAG AAGGACATGAAATACCCCGAAATTGAGGAAGAAGCTTTACAATTTATATTGGACAGCTGT GAATCAAGCATATCCAAGTACTCCAAATTCTTGCAGGCAAGTGGATCGATGGATTTGGAC ATAACATCACCAAAGCAACTGAACCGGAGAGTGTTCCTGAAACAACTAGCTGTCGACTTG TGCACTAGTGAACGAAGAATACTGTTTCGTGCACAATACATACTGAGGAGGAGATTGAGG GACATGAGGAGTGGTGAACTGAGAGCTCTTAAAATATTTGACAGCTTCAGGAATCTCTTC AAATGA
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>LITCHI009733.m1 - Up_Stream_Len 2000 AATTTGGACTGTAAACCTACCTAGATGATACGATTTTATAATAATAAAATGCATGATTTT TCTTTTTCTTTTTTTTTTTTACTAAAAAGAAAAAACATATGAATTTTATTTTATTTTATT ATTTTTTTATTATTTTATTTTTTAAATTACAAAACTGGATCATACTAAATGGTTGTGGAC TATTTTGACTAGTCCTAGGTAATATTGTATTTGAAGTCAAATTCCAGCGTCCAACATCAC ATTAAATTTGTTGAAAGCAAATTCCAATGTCGACGTTTGAGGCCTTCAATTGGCATGTTG GACAGGTGACTCTGGCAAGAACTAAAACTTTTCATAGATGCAGACATCTTGCTTCCGGTT AGGCAATAGACACGGAAAAAAATTTACACTAGGATTTTACTACATTTCTATAAAAAGATT AAATCTCTATAAAAGAATTATATTTTGAACGTAAACAATATACATATTATTGACGCCACA TTTGGACTCTTAATCAGAGCATTAGGTTTTTTATTTTGCCCTTGGAGGAGTGTGACGAAG ACTGGATACTACCGTATTCTCCTTGAACCACAAAGTGACGTCTCCAACATTTGAATCAGT AATCTTATAAGTATTTTAGTTACAAACTTACCTTCATCAAGATAAGTTTGCAACCAAAAC ACCTATAACGTTATTAGTTTAAATATCGATGATGCCATTTTATGGTTCAAAGAGGACACG ATAGCACACAATCTTTTTCATACCCCTTCGGGGGCAAGGTAAAAAATCTGACACTCTGAT TAAGGGTCCAAATGTGACATCAACACACATGAATATATATATATATATTTATTGGGTGCT CTTGGGTATATTTGAGATATCGATACATTTGATTAAAAAAAATAGTGATTGCATTTTAAA ACTGTTGATTGTAATTTTTTATGTTTTTATTACATTTGATTATAACTAAATAAATCATAT TATATTAACAATAATGGATAAATAGGACCACTTTTACTAATTGTAATAAGATATATTTAA TTGTAATTGGATATAATAAATATATAATAAATTATAATAAATAATTATAGAATGTAATTA CTTATTTTTTTTATCAAGTGTATCGATATCTCAAATATATTGTAAAATATGTTTGTATAT TTATATTTTAAATTCAATGATAAATCAATGTAACAACTAATGTCGTATTCATTAGAATCA TACATTAAACATGTGGTATACTATTAAAATTTGTTGAAACAAAATGCATAATCCGAACTT TAAATTTTTTAAAAGATAGATTATCGGTACACCTAACAATTATTATTGTTATTATTATTT ATTATTTTTTATTTTGAAAAAGGGAAGGGCGTTCTAGCAAGTCCCAATTCTTTTTGAAAA CTTTATACAAAAGCTATAAAAAAACAACAAAACAGAAAACTCATCTCTGTCTCATCATGA TAACTTGCAAGCTCCTATCACGTGAGTTCATAGTGACGTCACGTGACCCCACAAAACTCG GCTTCCTGCTTGGCATTTTTCTCTCGTGATAACCACGTGATATTATCTTCCAAATCCCCA AAACACCCTCATTATGACCCCAAAATACCCTAACTACCCCCACCAACATTCGCAGTCTTT GTCCTCATACGTCACAGTGGTTTACGTGAGCAAATTGCTCTGACTCAACGTCCAGCCAAA TCCATGCACGTGGCTGCCATGAACACCCCCATTGTGAGTCAGAACTACCACTGTCTGACA CGTGTCATCGCATAGATACCCCTCAAGTCTCCTCTGCGTCTTGAAACACTTCCAAGACTA CGAAGTGAACACACAAAAAAAGGCGCACACACACAACACAACACAAAACACACTCAAAAC TCAAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTAGGGCTCTAGCGGGTGGAAAAG AAGCTTCTTCAGAACAGACAGCTACTGCAATTGTTGGGTATCTTTTTTTTAATTTTTTTT TATTGTTTTTAATTTTTTTA
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>LITCHI009733.m1 GenomeSequence - ATGTTTGATATGTTCTTGTATTTGTACCATCTTTTGGTTTGTGTGTTAGAGACAAAAGGG TTTTAAAAAAAAAACAATCTTTTTGTGGTTTTGATTTGAAATTCTTATTTTTTATGTTGA TTTGATCTAGTTTTGACGGAACTTTGGTGAATAGTGTGAATATACCTATGCATGTGTCTT TTGTTTGTGGCTTTGCATTGTGTTTTTTAATCTTCATTTTGTGTTGAATTTTGTGGTTAT TGTTTTTGATGTGGTTGATGTTGATGTGTGAGAGTTTGAAGATAGTGTAATTTGACATTT TACAAGCAAAAATCTGTTTGTTCTCGGGCTGCTATGTGTTGTCTATGTTAGCGTGAGTTG TGATTTGTGTAGTCATGTACATGCATATGCTTGTTGGTGAACTCTTGCATGTGACTTGTG TGACCCATTTTGCACAATCCAGAGTTGGGACTACGCAGTTCTAGTGGAGGCTGTTTTGGT ATTCGCTTGGTTGGTTGTTTTGTTTAGATTAGGATGTGTGTGGTTTGTAATAAGTTATTG TCGTTTTTGTTTTTGGTATTGGAGGATGTGTAATATTTCACTGTTTCACTAATTGGTTGT TCTGTTTCAGTTAGGATGTTTATGGTTCATAATAGGTTATTGTCGTGTTTGTTTGTGGTA TTTGAAAACCTGTAATATTTCGCTGTTTGATTGGTTGGCTGTTTTATTTGAATTTGAATG TGTATGGCTCATAACTAATTATTGTCACGTTCGTGGTATTAGAGAACATGTGATTCTAGA TTATGTGTTGAGGCATGTCCATTTGTGGTATATTAGAGAACGTGTGGTGCTAAATTACGC GTTGAGGCTTGTCGGTTTGTGCTATTAGAGAACTTGTGGTGTTAAAATACACATTGAGGC ATGTCTGTTTGTGGTATTAGAGAAGGTATGTTTCTAGTTTACACATTGAGGCATGTCTGG TTGTGGTTTTAGAGACTGTGTGTTTCTACGTTATGCGTGGAGGCATGTCTGTTATGGTAT TAGAGAACGTGTGTTTATAGATTATGCGTTTCGCATGTGTTTCTACGTTATGCGTTTATA CATGTCCGTTTGTGATATCAGAGGATGTGTGATTCTAGACTACGCTTTGAGCTGTGTCCA TTTGTGGTATTAGAAAATGTGTGATTCTAGATTACACATTGAGGCTACCCTTTGGGTGGT ATTAGAACACTTGTGATTGTAGATTACACTTTGAGGCTATTTATTGGGCTAGGAAAGCAA ATTACGAGTGTCTACATTTTGGTTGTCCACACGGTGGTGGAAAAGAGAAGGAGATAGAAA TCAATTCTTTTCTTGGTTTAGTTACATAATTGGTTTAACAAGGAATCAAAAGAAGAAAAC TAATCTTAGAACTAGGTCACAATAACCAAAGTTCAGCTGTCTCTCTAGGTTTATTTAATA GTATTCTACGTATTTATATGTTTTCCTTTTTGAGCTGCCAAATGGAAGCTGACAAAAAGA TTGCTTAGTACTTGTCCTTAATAGTATAGCTCCACAAATGGGAACATTGTATTGCTATTG TTATATTTCTGGTGGGAGGTGATTATAAATTCATTGTCCAAATAAAGCAGCAATGTAATG ATTTTATGTTTGGAGTCTTCTTTTCCTTTTTTACTCATTAAATTAACATGTAAAACTGGT CTTCATAGATCTTATCTTTTGTGGACTTATACTTGATTTCATTTTCATTTGTGTTGTGTC TATAATGTACAGCTGTTTGGTTCTTATAGATGGGCATTTCTGTTTCTTTCTTTTTCATTT CTAATTTTTTGGTTCTTATAGATGTATGCTATGTATTGTGGAAAAAGAAATTTTCAAACT TCTTAGAATGAGAAGAGAAACACGGTAATTGTGTTGGTTGGTAGAGTCGCTCAGCACTTG GTATTAACCATAAAAGCCGGTTTAAGCCTGAAATTAGGTATGTGGACTTAAACTAGAGAG AGATGTGTTAGTTCATCATTGCAATAATAGACTGAGAGGGGGCAGTAGTTTGTATTAACA AGGGCCTATTAATGTGGTGAATTACCTAGAAATTATATTCATGACTTTTGCAATCAAAGA GTAATTGGAAAGAATAAAAAAAGTTTCCTAGTTTAGAGTATTCTATTATGTGTCCATTAG ATTCCTTAAATGTCTAGTGAAGATGTAATTGGAAACAATTATTAAGTTTCCAAGTGTAGA GCATTCTGGTGTCCACTAAATTCTAAATGTCTAATGAAATTGTTACATCTATGTGGTAAA TCTTGAACATGAGTTTGCTATTTAATTATCTTTAGCCTTTGTTTTCTCTGTCAATAGTTG TAGCTTCTACAATTGTGTTTTATTTTGGTACCCGCATTTACTATTATTCCACACGAATTG TCTACTAGTTTCGGCAACTTGCCTAGGTACAGCTTTTGTTTTCAGTACATTTGTCTCCTA AGTTGCAGGCTTCGATAAAATTAATTTTCTTTTCTCGGTCACAGTGGTATGCCGGATTTT GTTCCTTTTCTAGATGTCTGAACATATTCAATGTGAGTTGCTTCTTAATTGGCTGATATT TTGTAAACAAATGTCAAGCATATGTGCTGCTCAGTGAAGGGAACAACTCAAATTATAGTG AATTGAGACGATTTTATCTATGCAAAACTGATATTAACTTGCACCATTTTTGATAAGTTT GCATAGCTTGGTCTTCATTTCAGATAAACTTGAAACTTTGGTTTAAACAATTGAGCTGGT GAAATCATACAAATATGTAAGAACTGAAGCTATGAACTTAAAAGGCAGCATATGCTAGCC AGACAACTAGGGTGTCATTTTGATATTCTGTGGGAAATATGATTTTAACTCAACCGAAGG AAATGTTATAGTTGGTCCTAAGTTTTTTGAACCTAGTCAAGCATTTTCATTTTCTGTAAG AATTTGCTTTTTGTGCATGAAGTTCTTGCATGAAGCTGGATTGGTTCTTAGCAGTCAACC TGTGTTGGTATTAGTTAGCGTGAACATTTGCTTGTTTGACGTATTATAGTTTATTTTCAA AGAAAAATTGACTCAGAGCAAGCCTCTTCTTTGTGTTTTTTCCTTTGCAGCAATTGTTAT GTGAGAATAGTTATAATAGAGAAAAAGGTTTCCCTGTAATTGACTATGGATCATTCAGAT CAAAACCAACAGCAGCAGCAGCAGCATGTGATGGGTGTTGTAGCTGGCGCCGGTCAGATG GCATATGGTACTTCTCCTTACCAAACTGCTCCCATGGTGGCTTCTGGCACTCCTGTAACG GTTCCTTCTCCTACTCAACCCCATTCAGCTTTCTCGAATTCCACTTACCAACTCGCTTTC CAACAAGCATAGTAGTTCCACTAGCAGCAGCAGCAGCTTCAATTTTTCTGGGCAAACCAA ATGCAGGAAGTCGAGCAAACGGCTGACTTCAAGAATCACAGCCTCCCTCTTGCTCGGATC AAGAAAATAATGAAAGCTGATGAAGATGTCCGAATGATTTCAGCTGAGGCTCCTGTCATA TTTGCTAAGGCTTGTGAGATGTTCATTCTGGAGCTGACTCTGCGCTCTTGGATCCACACT GAAGAGAACAAAAGGAGGACACTGCAAAAGAATGACATTGCAGCTGCCATTTCAAGGACT GACGTGTTTGATTTCCTGGTGGACATTATTCCAAGAGATGAACTGAAAGAAGAGGGACTC GGAATCACTAAGGCCAATCTTCCCGTCGTTGGTTCCCCTGCTGACATTCCTTTATTCTGG CCACCGCAGCAGCATCCTGTCACACCACCTGCAGGTATGATCATGGGAAAGCCAGTCGAT CAAGCTACACTCTATTCCCCTTCACAGCCTCGACAACCGGTGCAGTTCATGCCCTGGGCT CAAACTCAACCACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGGAACATCAGCAGCAGCAGCATACT GACTCTTAA