Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021486Chr122331184923314732+Nuclear transcription factor Y subunit B-3

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021486.m12791PF00808.26CBFD_NFYB_HMFDomain94.14.90E-27
Download   Copy
>LITCHI021486.m1
ATGGCTGATTCTGATCACGATTCCGGGGGGCACAACAACAACGCGAACAGCGAGCTGTCG
GCGAGGGAGCAGGACAGGTTCCTGCCGATCGCGAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAGGCG
TTGCCGGCGAACGCGAAGATATCGAAGGACGCGAAGGAGACGGTGCAGGAGTGTGTCTCA
GAGTTTATAAGTTTCATCACAGGGGAGGCGTCGGACAAGTGCCAGCGTGAGAAGCGGAAG
ACGATCAACGGCGACGATCTGCTCTGGGCCATGATGACTCTCGGGTTCGAGGAGTACGTG
GAGCCTTTGAAGGTTTACTTGCAGAAGTATAGGGAGACTGAGGGGGAGAAGAGTTCCATG
GGGAGGGAGAAGGATGGGGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGATCCGGCGGCAGTGGTGTGGGA
GGAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGAGTGAGTCCAAGTGGTGGGGGGTATAATGGA
GGAATGTATGGTGGCATGATGATGATGGGTCATCAAGGACACGTGTACGGTTCTGGCGGG
TATCATCACCAGCATCAGCAGCACCAGATGGGTGTTGGAAAAACTGTGACTGCCACTGGT
GGAGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGTTGGCGGTGGTGGAGGTAGTGGTGGAGCTGTTAGG
TCAAGTTGGGTTTTGGTGCTGATTCTAAAAGCAGCCTCCACCATCACTTGCTACAACAGG
GAATGGATATTGCTTTGTGCATGGAACACATCAGCATTGTTTACCATGTATGGTAAACTG
GAACTGGAATATGCAAAACGGAATTTAGTTGAAAATATTTTCAATAAATGTGACAAAGGC
ACATGGTTCAAAAGTGTGTCTTCTGCTTCCAATGATTGGAAGCAGCAGCTAGTCCGTCTA
AGCAATTTTGATGATAGAAAGCAGTTCCGATCCTTAGCTGTAAAACGCCAACGCTTTCGT
GCAGAAGCTTGA
Download   Copy
>LITCHI021486.m1
MADSDHDSGGHNNNANSELSAREQDRFLPIANVSRIMKKALPANAKISKDAKETVQECVS
EFISFITGEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMMTLGFEEYVEPLKVYLQKYRETEGEKSSM
GREKDGGGGGGGGSGGSGVGGGGGGGGGGGVSPSGGGYNGGMYGGMMMMGHQGHVYGSGG
YHHQHQQHQMGVGKTVTATGGGAGAGAGVGGGGGSGGAVRSSWVLVLILKAASTITCYNR
EWILLCAWNTSALFTMYGKLELEYAKRNLVENIFNKCDKGTWFKSVSSASNDWKQQLVRL
SNFDDRKQFRSLAVKRQRFRAEA.
Download   Copy
>LITCHI021486.m1
GGAAGATAGTGCGAGTTTCTTAAATATTGTTAAATTTATGAAATTTCATCAAATCGCAGG
GGTTTTTGTGCAATTTGCCCTTCAGTACTAAATAAATAAGTCAAAATTAGACCCCAAGTC
AATCCAACCACGTCTTAATGCAACTTCATAAGGCCACGTGTCACACAACGGATCGTTAGA
AAGACTCCAGCTCAGCTCCACAGGCGCCAAGCCGCAGCAGCCGCCTTACTATGCTCAAAA
ATCTCCCAAAAACAAAACACACCAACCCACCTTCCCAACTCCACCACGTGTCACCACCTG
ACCCGTCCATTCCTCAACCCCACTTGCCCAATCCAACACTCCACAGATCCCCCACGTGTC
CCATTCTTATCGACAAACAAACGGCCAAAGACCGCCCACGTGTCACGCCCGATGCATTAT
TACCCCCAATCCAACGGACCCGAACCACCCCATCCTCCCTCTCTCTCCCCTCCAACCGAA
AAAAAAAAAACACGCTTCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAACCCATCAAGTCTACTC
CTTTCCTCGATTCTCACACTCCACAACTCTTTCTCTGATCTGGGGATCGATCAAAATTCC
AACTTCAATCGACTTTTGCAAAAACTTTAACTTTCTTTTTTTTTGGTCTTCGCGCGTGCG
CGCGTGTGGGCGACTGTGATGGCTGATTCTGATCACGATTCCGGGGGGCACAACAACAAC
GCGAACAGCGAGCTGTCGGCGAGGGAGCAGGACAGGTTCCTGCCGATCGCGAACGTGAGC
CGGATCATGAAGAAGGCGTTGCCGGCGAACGCGAAGATATCGAAGGACGCGAAGGAGACG
GTGCAGGAGTGTGTCTCAGAGTTTATAAGTTTCATCACAGGGGAGGCGTCGGACAAGTGC
CAGCGTGAGAAGCGGAAGACGATCAACGGCGACGATCTGCTCTGGGCCATGATGACTCTC
GGGTTCGAGGAGTACGTGGAGCCTTTGAAGGTTTACTTGCAGAAGTATAGGGAGACTGAG
GGGGAGAAGAGTTCCATGGGGAGGGAGAAGGATGGGGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGATCC
GGCGGCAGTGGTGTGGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGAGTGAGTCCAAGT
GGTGGGGGGTATAATGGAGGAATGTATGGTGGCATGATGATGATGGGTCATCAAGGACAC
GTGTACGGTTCTGGCGGGTATCATCACCAGCATCAGCAGCACCAGATGGGTGTTGGAAAA
ACTGTGACTGCCACTGGTGGAGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGTTGGCGGTGGTGGAGGT
AGTGGTGGAGCTGTTAGGTCAAGTTGGGTTTTGGTGCTGATTCTAAAAGCAGCCTCCACC
ATCACTTGCTACAACAGGGAATGGATATTGCTTTGTGCATGGAACACATCAGCATTGTTT
ACCATGTATGGTAAACTGGAACTGGAATATGCAAAACGGAATTTAGTTGAAAATATTTTC
AATAAATGTGACAAAGGCACATGGTTCAAAAGTGTGTCTTCTGCTTCCAATGATTGGAAG
CAGCAGCTAGTCCGTCTAAGCAATTTTGATGATAGAAAGCAGTTCCGATCCTTAGCTGTA
AAACGCCAACGCTTTCGTGCAGAAGCTTGA
Download   Copy
>LITCHI021486.m1 +  Up_Stream_Len 2000
TTGTAGATAATTAATTACGTTTGTTGGGAAAATGAAAGTGGAAATAAATGATTACACTAT
CTTAATGTACTTTTAGTAATGGATAAATTGTCCAAACCTTACCCTGAAGTTTGATGAAAT
TGCATAAATATGACGATATTCGAAAAACTTACACTACTTTCCCTTAAGGTTTCTGAAATT
CAACACAAACCTCCTCTATTAACAACTTGTCGTTAATGAGTTGATGTTAAATGGTATGGG
TTAAGGGTAAAATAGTTAAATAACATTGATGATGTACAAAATATCCATGTGCAATGATTA
CGTAAATAAAAAATATATATAATTTTAAAAAATAAAAATAAAATTCAGAACTCCTTCTCT
CACTCAGCCCTCTCTCTCTCTCTCTTCATCACCTCAACCCTTTCTCTTAGCTTCTTTTTC
TCCCCTCAACTTCTTCTTCTCGACTTCTCCAAACCTCCGGCAAAAACAACATGAAAATGG
AGATCGATTAGGTCTTCGTCGAGACCGAGATAATTTTTGATAGAGACAGGAGACCCAGGT
GGTCGGTCTCCACTTGGTCATGGTGACCACCTGAGTCTCCAACAATAGAGATCCGGTTTC
GAGTCTTTGGTTTTGAATATCCATTGTGGAGACCTGAAATTGGGTCTCCATCTGGTCTGC
CACGGGGTGGAGACCCAATGTTTTTTTTTTTTCAATTTCCTTTTTTTTTTGTTATTGAAT
TTGTGGTTGAATTTTCTTGTGGGTATGGTTGAATTTCCTTTGAGTTTTTTTAATATATAT
TTTGAATTTTCTTATGAATTTTTGATGAGATTTTGTGGTTGTTGGATGGTGTTTGGTTGG
TGAGAAAATGTGGGTTGTGGGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGGTTGAAGATCAGGGT
TGTGAGGTTGATTAAAGAAGACTGTTAGAAAAATTTATGTTAATGATGATGAGCTGGTGA
GGATGAATAAGTGATTAAATTTTTTATTTTAAAATATGTAAATTTATTAAGGTTTAAATT
GGTGATGATGTTGGTGATTAATTGATTGGATAAAAATCAATGATGAATTGATGGTATGAA
AATTGATTAAGAAAGTTTGATGAAAACAAATGAACAAATTTGATGGAGTTGATGAAGATG
ATAAGATATCTTTTAAATGTTATTTTAATTATTTTATTTTTATTTTTTTAAATTAAATTA
ATAATATATTATTTTATTTAGGGTATTTTGGTACTTTTGTTCAAATTGACTTTGATTGTT
TGTCTTAAATAACAACTCACTCACGGTAAGAGAAGTTTGTGTTGAGTTTCAGAAACCTTA
GGGGAAGATAGTGCGAGTTTCTTAAATATTGTTAAATTTATGAAATTTCATCAAATCGCA
GGGGTTTTTGTGCAATTTGCCCTTCAGTACTAAATAAATAAGTCAAAATTAGACCCCAAG
TCAATCCAACCACGTCTTAATGCAACTTCATAAGGCCACGTGTCACACAACGGATCGTTA
GAAAGACTCCAGCTCAGCTCCACAGGCGCCAAGCCGCAGCAGCCGCCTTACTATGCTCAA
AAATCTCCCAAAAACAAAACACACCAACCCACCTTCCCAACTCCACCACGTGTCACCACC
TGACCCGTCCATTCCTCAACCCCACTTGCCCAATCCAACACTCCACAGATCCCCCACGTG
TCCCATTCTTATCGACAAACAAACGGCCAAAGACCGCCCACGTGTCACGCCCGATGCATT
ATTACCCCCAATCCAACGGACCCGAACCACCCCATCCTCCCTCTCTCTCCCCTCCAACCG
AAAAAAAAAAAACACGCTTCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAACCCATCAAGTCTAC
TCCTTTCCTCGATTCTCACACTCCACAACTCTTTCTCTGATCTGGGGATCGATCAAAATT
CCAACTTCAATCGACTTTTGCAAAAACTTTAACTTTCTTTTTTTTTGGTCTTCGCGCGTG
CGCGCGTGTGGGCGACTGTG
Download   Copy
>LITCHI021486.m1 GenomeSequence + 
GGAAGATAGTGCGAGTTTCTTAAATATTGTTAAATTTATGAAATTTCATCAAATCGCAGG
GGTTTTTGTGCAATTTGCCCTTCAGTACTAAATAAATAAGTCAAAATTAGACCCCAAGTC
AATCCAACCACGTCTTAATGCAACTTCATAAGGCCACGTGTCACACAACGGATCGTTAGA
AAGACTCCAGCTCAGCTCCACAGGCGCCAAGCCGCAGCAGCCGCCTTACTATGCTCAAAA
ATCTCCCAAAAACAAAACACACCAACCCACCTTCCCAACTCCACCACGTGTCACCACCTG
ACCCGTCCATTCCTCAACCCCACTTGCCCAATCCAACACTCCACAGATCCCCCACGTGTC
CCATTCTTATCGACAAACAAACGGCCAAAGACCGCCCACGTGTCACGCCCGATGCATTAT
TACCCCCAATCCAACGGACCCGAACCACCCCATCCTCCCTCTCTCTCCCCTCCAACCGAA
AAAAAAAAAACACGCTTCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCAAAACCCATCAAGTCTACTC
CTTTCCTCGATTCTCACACTCCACAACTCTTTCTCTGATCTGGGGATCGATCAAAATTCC
AACTTCAATCGACTTTTGCAAAAACTTTAACTTTCTTTTTTTTTGGTCTTCGCGCGTGCG
CGCGTGTGGGCGACTGTGATGGCTGATTCTGATCACGATTCCGGGGGGCACAACAACAAC
GCGAACAGCGAGCTGTCGGCGAGGGAGCAGGACAGGTTCCTGCCGATCGCGAACGTGAGC
CGGATCATGAAGAAGGCGTTGCCGGCGAACGCGAAGATATCGAAGGACGCGAAGGAGACG
GTGCAGGAGTGTGTCTCAGAGTTTATAAGTTTCATCACAGGGGAGGCGTCGGACAAGTGC
CAGCGTGAGAAGCGGAAGACGATCAACGGCGACGATCTGCTCTGGGCCATGATGACTCTC
GGGTTCGAGGAGTACGTGGAGCCTTTGAAGGTTTACTTGCAGAAGTATAGGGAGACTGAG
GGGGAGAAGAGTTCCATGGGGAGGGAGAAGGATGGGGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGATCC
GGCGGCAGTGGTGTGGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGAGGAGGAGGTGGAGTGAGTCCAAGT
GGTGGGGGGTATAATGGAGGAATGTATGGTGGCATGATGATGATGGGTCATCAAGGACAC
GTGTACGGTTCTGGCGGGTATCATCACCAGCATCAGCAGCACCAGATGGGTGTTGGAAAA
ACTGTGACTGCCACTGGTGGAGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGTTGGCGGTGGTGGAGGT
AGTGGTGGAGCTGTTAGGTCAAGGTAGGTCTATTTTCAAGCATTAACTTGTTGGAAGAAC
TTAGAATTTTTAGATACAGTTATTTGTTAGGTAATTTGTTTTTTTTTCTCTCTTTTTTTT
TTTTGGTTAATTTTAATGGTTTTGTGGAAGAATTATTAATTATATATAAATATATGTGTA
ATTGTGAAGGAAGAGAGAGAGTGTGAGATAAAGAGAGAGTTGATTAGTGCTAACTAAGGG
ATTAATGTACTTGTTATTGTTGTATTATGAAAGTAACATATAAATATATATAATTACATG
AATATTATTAGCTGTTTTTGGGATTGTTTTTGGTTTTCCTGTTGTTAAAAAGCATGTATG
GAATTGGAAGAGAAATTTTTAATTGGAGTTGACAAACATGCAACTTTGAGATTGAGAGTG
TCTGACAAATATTTTGATGCTTAACAAAAGTAGGCTTTGTTCAGACATGTTTCCTTTTTG
AGGAAAGTTAGTTGAGTTTGAGTTTTGAGTTAAAGAGTTATTGTCTTAAAACAATAGAGC
TCCTCCAGTTCAGCCATTTGTCCAAATTCTCTCCATCTACCAGATTTGGAGATAGTGTTG
GATTTTTTTTTTTGGTTTTTTTTGTCTGTGTACTAGATTGTTTTGATGCTACTCTTTGAA
GACCAAATAGTGGGCAAATAGATGCTCCAATGTGAATTTATGTTACAGTCTCTCAGTTCC
CAATAGATTCTTCTCTCATTAATTTCTCGTGTGATCCTTTCTTTTTGATTGGTTCCATTT
AGTTGGGTTTTGGTGCTGATTCTAAAAGCAGCCTCCACCATCACTTGCTACAACAGGGAA
TGGATATTGCTTTGTGCATGGAACACATCAGCATTGTTTACCATGTATGGTAAACTGGAA
CTGGAATATGGTAAGAGTTACTATAGCAAATCTATGGAGAGATTTTTTCTTTTTATACCG
CAGGAGTAAAATTTTGAGTTGTACATATGGTATGTCATCTCAATTAATTGCAGTAGATTT
TTGACCGTTAGTGTGACTAAAATCTTTTTATTAGCTTGTGCCTATATACATATATTGTCA
ATTAATGTGATAAAATCACATTATTCAAAGTGTCTTACTCGTCACTTGCTACAACGAGGA
TACCGTTGTGTGCATGGAACACATTTATATTATTAATTATTATTCACTGACATTCAAATA
CAGTAAAAGTTTGCATGTTTTGTTTTTATTAAAGAATATTTTCAACGGGGGTGGCAAAGA
CACATTGTTCAATATGTGTATCCTTACTCTTACCATCATTTCTTATAGGGAGGATATTGC
ATATAATACATTAATATTATGATGTATGACTGACTAATGTTAGAATACTGTAAACGTTTG
TGTAGCAAAACGGAATTTAGTTGAAAATATTTTCAATAAATGTGACAAAGGCACATGGTT
CAAAAGTGTGTCTTCTGCTTCCAATGATTGGAAGCAGCAGCTAGTCCGTCTAAGCAATTT
TGATGATAGAAAGCAGTTCCGATCCTTAGCTGTAAAACGCCAACGCTTTCGTGCAGAAGC
TTGA