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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021480 | Chr12 | 23270779 | 23279202 | - | Putative protein FAR1-RELATED SEQUENCE 10 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021480.m1 | 70 | 161 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 86.9 | 1.20E-24 |
LITCHI021480.m1 | 293 | 386 | PF10551.12 | MULE | Domain | 75.2 | 4.50E-21 |
LITCHI021480.m1 | 566 | 597 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 31.3 | 1.20E-07 |
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>LITCHI021480.m1 ATGTCAACGAAACCATCCACTAATATCTGGATTCGACGCCAGCAGTGCCCATGTGGAGAT TGGAAGTGTTACATTAAGTATGATGGAGATGATCAGTCATCACTGAACTCGCAACAAATA AAGACTGAGACAACAGCCTCTTCATCCCTAGAAGCTGTCTTTACACCATATGTGGGCCAA ATATTTAAAAGTGATGATGAGGCATTTGAATACTACAGCAATTTTGCACGGAAGAATGGG TTTTCAATCAGAAAAGCACGCTCAACTGAAAGCCAAAATTTAGGGGTTTACAGGAGAGAT TTTGTTTGCTATCGGTCTGGATTTAATCAACCAAGAAAAAAGGCCAATGTGGAACATCCC AGGGACCGAAAGTCTGTACGCTGTGGATGTGATGCAAAACTTTATCTGACAAAGGAAATC GTTGATGGTGTCACCCAATGGTACGTTTCACAATTTAGTAATGTTCATAACCATGAATTA TTGGAAGATGACCAAGTACGTTTACTTCCTGCATATCGGAAGATACAGGAGGCTGATCAA GAACGCATTCTTTTACTCTCCAAGGCTGGTTTTCCCGTGAACCGGATAGTGAAGGTGTTA GAACTGGAAAAAGGAGTTCAACCTGGACAGTTGCCGTTTATAGAGAAGGATGTAAGGAAC TTTGTTCGGACTTGCAAGAAGACTGTTCAGGAAAATGATGCTTTGCTCACAGAGAAAAGA GAGAATGATACACTAGAACTTCTTGAAGCCTGCAAGGCCATGGCAGAGAGGGATGCAGAT TTTGTGTTCAACTATACAACAGATGAAAACGACAAGGTTGAAAATGTTGCTTGGTCATAT GGAGATTCTATTCGTGCATATTCACTGTTTGGAGATGTAGTTATTTTTGACACCACTTAT CGTTCTATCACCTATGGCATGCTCCTAGGAGTGTGGTTTGGTATGGATAATCATGGCAAC ACAATTTTCTTTGGGTGTGTATTGCTGCAAGATGAAAGTTCGCAGTCATTCACATGGGCT TTACAGACTTTTGTCGGCTTCATGAGAGGAAGACACCCACAGACAATTCTAACAGATATA GATTCGGGGCTTAGAGATGGTATAGCAAGTGAATTGCCAGATACTAAACATGTTATATGT ATATGGCATGTTCTGTCCAAATTATCCAGTTGGTTCTCCCTGCCTCTTGGATCGCAATAT GAAGAATTCAAAGCTGAGTTTGATATGTTGTGTCACCTTGAGAATGTAGAAGATTTTGAA CATCAATGGAACCTTTTGGTTGCTCGTTTTGAACTTGTTTCAGATAAGCACATGGCTTTA CTCTTCTCATATCGAGCATCATGGCCGTTTTCTTACATTAGAGGTTACTTTCTGGCTCGG ACAATGACAGTGGAGTTCTCTCAATCTTTGGACACATTCTTGAAAAGAATCCTGAGTGGA CAAACATGTTTGCAAGTGTTCTTTGAGCAGGTAGGTGCTGCTGCCAACTTTGGAAATTTA ATAAGCAATGGGATGCAGTATATGCATATTAAGACATGCACGCCTATTGAAGAACATGCA CGGAGCATTCTTACACCTTATGCCTTCCGTGTCATACAACATGAAATTGTGCTGTCCATG CAGTACGAAACAACTGAAATGGCAAATGGATCATTTGTTGTGCGACACTACAAGAAAATG GATGGGGAGTATTTTGTGATATGGATACCAGAAGATGAGCAAATTCACTGTTCATGTAAG GAATTTGAACATTCAGGAATACTCTGTAGGCATTCTCTTCGAGTATTTTCTATAAAAAAC TACTTTCAACTCCCCGAAAAATATCTTCTCCTCCGTTGGCGACTGGAGAATTCCCTAGTT CCTACAGAAGATCATAATACTCAAAGCAGCAGTGATGAGTGTGCTCAGGCCTTTCACTCC CTTGCTGCAACTCTATTGACAGAGTCATTGATCTCCAAGGAACGCTTTAATTATGTTCAT AGAGAACTTACTGGCCTTCTTGATAACGTCCGAAATATGCCAGTGATTGATGAATTTGCT GTGAATATGGCAGTTAACAATGTCAGTGAATCCTAG
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>LITCHI021631.m1 TCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGGTTTGAAGTTGATTTT TCAAGATGAAGATACAGTGCAATGGGTGCGACTTGGCAGAGGCCAAGGTACTGTGCTGTG CAGACGAGGCGGTGCTTTGCTGGGATTGCGACCAGAGAGTTCATGCGGCCAACAAGCTCT CTAGCAAGCACCAGGGGGTGCCTCTCACTCATTTTTCGTCTCAGATGCCCAAATGTGACA TCCGCCACGAGACCCTTGGCTATTTCTTCTGCTTGGAGGATCGTGCATTAGTTTGTAGGA AGTGCGATGTTGCCATTCACACAGCAAACGCCTATGTGTCTGGTCATCAGAGGTTTCAAC TAACAGGTCTGAAAGCGGGACTTGAATCAGCAGAGCCAAGTGTGTCCTCTACCATCGATA AGTTGGACTCTATCGGAAAAGCTTCTGAAACAACATCAGCCCAGTCGATTTCCAAAAGGG GTGCTAGGATACCGATTGCATCCGAAGACGCAGGAATGCTGCATGGACTAATTATGGCAA TCAAGGTACCATTTCCTGCAGGCACCACAGTTGGGAATATCGCGACATGGCACTTGGATG AATATTTTGGAATGACAGATTTTAGTCAGAACTATGCAGTTACGGATAATGTGTCATCAT CTAAGGTATGTGGCAGATACCGTCTACACTTTTACATCTCAGGCTCAGCAACTGCATATG ATTTGGGGGGTCTACTAGTGAGCTGGAAAGTGCTGCAAAAATTAGGACAAGGGAAAGCAG ACAGATATTACTATTCATCTAACTGGTTCATATTTGGTTTACTTGAGCTGGGTTCTGTTG TGTTTCCCTCTCACAAATACGGCCAAGCTATTGATCTGTACACACAAGCAATTGAATTGA ATGATCAGAATGCTGTGTACTGGGCAAACCGTTCATTTGCCCACGCTAAATTGGAGGAAT ATGGTAGCGCCATACAAGATGCATCAAAAGCTATAGAAGTTGATCTGAAATACTCCAAGG GTTATTATCGACGAGGTGCTGCTTATCTTGCCATGGGGAAATTAAAAGATGCACTTAAGG ATTTCCAGCAGGTTAAAAAACTCTGTCCAAATGATCCTGATGCTGCCAAGAAATTAAAGG AATGTGAAAAGGCATTTAAGAAACAGAAATTTGAAGCAGCAATTGCTGGACCTGAGTCCG AAAGGCATTCAGTTGCTGATTCCATTGATTACCATACCATAGGGATGAGCCCCAGTTCAT CATCTGTGCCCACCCAAGCAGCCATAGTGGCAGGGACGGCAGCAGTTGTGGCAGTGATGG TGATGGTGGGGCCGACTATAGCCACAATGTTGGCAGGAATAGTGGTAGCAGTGCTGATGG TCCTAGGGGCATGTTGGTCGGGTGGCTGCAATGGTAGTGGTGTCTTTACAAAGAGTCAAA AACTTGAACTAGGTGTGAGTTCTGGCCTCACCCTCTTAGGCTTGAGGCTCAATCCTGTGG GGTTATTTGATTGTTGTTGTCTCCATTCTTGCCCGACTGTGTATAATTTCTTCTATCATG GACTCTGCAGAAAATTTGTAAGATGTTTTGATTCAATATTGACGACATTGCATTTCTGGT TTCTAGAGGTGGAGCCACAATACTCTGGGGCAAGGATAGAGGGAGATGTTATTACTTTGG ATTTTGTGAAGAAAATGATGGATGACTTCAAGAACCAGAAGTGCTTACACAAACGGTATG CATACCAGATTGTCTTACAAATGAGGGAAATGTTTCGTGCTTTACCTTCACTTGTTGATA TAAATATTCCTAACAGCAATCATTTTACAGTCTGTGGTGATGTACATGGTCAGTTTTATG ATCTATTGAATATTTTTGAGCTTAATGGGCTTCCTTCAGAAGAGAATCCATATCTGTTTA ATGGTGACTTTGTGGATAGGGGGTCATTTTCTGTGGAGGTTATTCTCACATTATTTGCTT TTAAGTGCATGGCTCCTTCAGCTATATATCTTTCCAGAGGAAATCATGAGAGCAAGAGCA TGAACAAAATATATGGTTTTGAGGGCGAGGTCCGCTCCAAGTTGAGCGAAACATTTGTGG AACTCTTTGCAGAAGTGTTCTGTTGTTTACCATTGGCTCATGTCCTGAATGGAAAGGTTT TTGTAGTTCATGGAGGTCTCTTTAGTGTCGATGGGATAAAACTCTCAGATATTAAGGCAA TTGATCGATTCTGCGAGCCTCCTGAAGAAGGATTGATGTGTGAAATTCTGTGGAGTGATC CACAGCCTTCACCTGGAAGAGGTACTAGCAAGCGAGGAGTGGGTCTTTCTTTTGGTGCAG ATGTCACAAAAAGATTTCTGCAGGATAACAATCTAGATCTAGTTGTGCGATCACATGAAG TAAAGGATGAAGGTTATGAGATTGAGCATGGTGGTAAACTTATTACTGTATTTTCAGCAC CAAATTACTGTGATCAGATGGGTAACAAGGGTGCTTTTATTCGTTTTGAAGCCCCAGATA TGAAACCAAATATTGTTACATTCTCAGCTGTGCCTCACCCAGATGTGAAGCCGATGGCTT ATGCAAACAATTTCCTCAGAATGTTCTCCTAA
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>LITCHI021631.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTTGCATATGTACAGGTGTTGCTTCCGACAATAATAGGAGGACATGAGGAACCAATAGA AAGATGGCACAAGTCAATGGATTATCGACCTCTGATTGAAGGAACCATTCACAGATCTAC TAACTTAACGAAAGTGAAGAAGAGAAGTAGAGGAAGACATCGAAGGAGAAGAGTAGGAGC CCGTGAAACATTGCTTCCCAATGGCAAAGTGATAAATTCAAGACATTTAACTAATATCTG TTATCTAAAGAATAATGTGAACACCTAGAAAGTTAGGTCTTGTCTTATTATAAAATATAC TTTAGTGGTTCATTAGAGAGATAAAGAGAATAACTAGACACGTTTAGTAAGATAAACAAA TTTTAAAAAGATAAATACCAATATAAGCATTAGAGGGTGCTCTTGAAAATAAACATGTTT AGATCATTTTGACGAACGTTTTTATTTATTTTGCAAGTTAAATTAAAAGTTTCCAATCAA AAGAAAGAAGCATGATCGTAGGTTGCAACTCAACAAAGATAGTTACAACCTTCAAGCATA CATTAGTGTATGAACAATATATTTACTTATAATTCGAGTGATTTATTATATTCTCATATC ATGTATGTAATTTAGTTTATAATTATATATTTATATTATATCACGTTCTATCTTCTTATT ATAAGTATAGATATCTTTTTTATATGAGAGTAAAGTTTTCAAGCGATACATGGTATTAAA TCTCTAACCATTTGTATCAACAACCTTTCTTTTCTTATTTTTTTTATTTTTTAATCACTT TAAAAGAGAAAGAGTTGATAACATAATAACAATTTTTTTTAAAATATATATTTTGCTCTC CTATAGAGTTTAGTTATAGTGTGTAATAACCATACGAAAAACATATGGTAACAAAACATT GATTACATCATCACTGTCCAAGTATGGTTTAGCGTTACATAAAGTTGAAGTGTCTAATAA TATCTTAAATTTAAATTGTCGCAAAACATGTGTTATTTATAACGTTTTCACTCTATATAC AAATGGAGAAGGAGGGAATCTTAATTTTTGTTTTTTTAAAAAAACCAACAATCCTTGTTT AGTACACCTTAATCTTAGTTTTTATATACAAACCCAAATAAATCTTGATTTTCTTTATTT AGGTTGTTACGAAAATATAAATCATAATGAATTGAGTTATTATCAAAACAAACAAAATTG ATAATTGATTTTTTAAAATATATTTTCAATTTAACAATTTAAGCACAAGATTATTAAATT AAATGAATACTTTTCACTAATGAACTATATTGAGAGACAAGTAACTAAGTTATTCAACGT ATCTGATTATTTATAAATGAAAAACCCATACAACACATCATAAATAATTAAATATAAAGA ACAACGGAACTATTTGACATCCTAACATATGCTGGTATACTGTTGTGGTTCTTCTTTAAC ACGTGTAATTAAATAAATGATATTTACATTGAGATTGTAACAATCATAATTGTTTAAATT TAGCTTGTAATGCATTATTATATAAAAAATAAATAAAACTTAAATAACAAAATTTGTTAG ATTAATATGATTATTTCATTAATTTAAACATTATGAATATTATTTTTAAAAACATTTAAC AGTATACATAGAAATGATTTTCATTGCAAAAAATAATTTGGAGGAAATTCGAAAGTGTTA AGGTCAAACAGATGGGGTGTGGCAGTCAAACGGCGCCGCTCACCTTAGAGCGTCCACATC AGATGCGTGCGTGGCAAAACGAATGGAAGCAGAGCCAAGTGTCAAGTTCTCATAACATCC ACCAACGCACGCGATCAAAAATATCGTAAGCCAGTCGGTTGCAAAACTTTCAGGCCGAGT TGGCTGTTGTCGGTCTATATAAAGCAACTTTACTTTCAACCCTATTAAATATTTCCATTT TCAGTTTGCTGTTATTCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGG TTTGAAGTTGATTTTTCAAG
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>LITCHI021631.m1 GenomeSequence + TCTCAAAATATTAAAAAACAATAACGGCATGCGTTTTTTTTTTGGTTTGAAGTTGATTTT TCAAGATGAAGATACAGTGCAATGGGTGCGACTTGGCAGAGGCCAAGGTACTGTGCTGTG CAGACGAGGCGGTGCTTTGCTGGGATTGCGACCAGAGAGTTCATGCGGCCAACAAGCTCT CTAGCAAGCACCAGGGGGTGCCTCTCACTCATTTTTCGTCTCAGATGCCCAAATGTGACA TCCGCCACGTACCCTCTACTTCCACCGCTTGTTTCTTTCTTCCTTGCTTTGCTCACACTC TTTTCTCTGTTCAATGTTGTTCTCGATTATGTTGTCAATTGGAAATGAAAGCCGTCAAAT ACTATGAATTCTGACAATAATAAGCTACCGATTTGTTACCAGCAATAAGTTAACAGGTTG TTTGTAAGATGAATGTAAAAGTTGAACCTGTCTCTATAGCTTCAATGGAGAATGGGACCC TATATATATTTTCATTTCTTTGTGGGGTGAATCAATTCTCCAAGTCCTCTATTTGCACGT ATGATGAGTCTCAACTTGGAAATTGACTTACTGCTACTTTATTTTTTTTAAAGATGACAT AACATAACTTCATCCGTCTTGTTGAAAAGGTTTCATATTTGACTAGTAGTTATTAAGGGG CCTTAGTCTGAGAGGATTGTTGCAGGCTGTGCCCTTTGCTAAGTTGGCAGTCTCAGTTCT GGCATGTTTATATATTATACCACATTGTTAACCAGAAAGATGCAGAACAAGCCTAGTAGA GTTGCAGTACACAAGTTTAGAACCTAAATCATATTGAGACTGTGTCATGAATCAATTGTT TTCCACCATTTGTTCAGCAGTACTGCAATTAACTTGTAGTAAAAGGATCGCCTTTAAAAG 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