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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021449 | Chr12 | 22940791 | 22948463 | - | Histidine kinase 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021449.m1 | 395 | 589 | PF03924.16 | CHASE | Domain | 126.1 | 1.60E-36 |
LITCHI021449.m1 | 677 | 742 | PF00512.28 | HisKA | Domain | 67.5 | 8.40E-19 |
LITCHI021449.m1 | 795 | 964 | PF02518.29 | HATPase_c | Domain | 96.1 | 2.00E-27 |
LITCHI021449.m1 | 1143 | 1268 | PF00072.27 | Response_reg | Domain | 64.3 | 1.10E-17 |
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>LITCHI021449.m1 ATGAGTTGCTCTGCAGGAACTGGGGTTCTTGTCAAGTTCTCTAAACTTTTTGTCAAGAGG ATTCACAGGTGGGGCTTTGTTAACATGTCTACAGTCCGCAAGCACTCAGGCTCTAATGGA AGATTGCCTGAGAATTCCAAGTTGAAGAAGGCAAAGGAGTCTCTACATGGCCGTTTTCCT GTCGCAAGATGGATGAGGAAGCTCCTCTCCCTTGCAATTTTGGGGCTGCTTGTCACAGGA TGCATTTGGTTTCTTTCAACTTTTAGTTTGTGGAGGACTGATGATGGAACTTCAGGTTCT TGTGATAAGAAAGCTCAAATCTTTCTTCAACATGCCAATGTCAGCAGCCACCAGCTCCAT GCTTTGGCTACTTTGTTTTCTGATTCAGATCAGATAGCATCTCTTGAATGTACCAGAGAA CCAAGACCTGAAACTCCATCAAATAGTGGCATTGCATGCACCCTGAGGGTACGGTGTTCA GAGAAGCAGGAGTTTATGCAGCAGAATAAATGGGTTGCAGAAAATTTAGAGCATGAGAAC CAATGCCCTGTTCAAGATGTGAATGTCTACAGGAAGCTTGACCCGTCAGTGTTAGAGGAC AAGTCATTTGTTGCATCTGCCATCTCACAAATTTCATCCGAGTGTCAAAATTACGAGAAG AATGTCTCACTAACAAGGAAATGGAGGGATTGCGCAAGAGGTCAATTTAAGATTTTCTCG TTTTGTCTGGTTAAAGAATGTTGGTGGGTCCTTCTTATAGTGATAGTGAGCTGTAAGATT TTTGGTGTTCGGTTTAAATTGAGGAGGAGGAGGAGGAACCAAAAGCATAAGCAGGCTCAG TTGCAGCCTGTCCCTCAACAGCGGCTACCACTGCTGCAACTAAAGCAGCAACAGCTGCCA CTGCTACAGCAGAAGCAGCAACAGCAAACTCAGGATCCTCCTAGAGGTGCTGGAAAGTGG AGGAAGAAGTTTCTAATAGTATTTGTCTTGTCTGGTATTGCAATGTCGATCTGGTTATTT TGGTACTTAAACCAAAAGAGTGCATTGAGTAGGGATCAGACACTTGCCAACATGTGCGAT GAGCGAGCCCGGATGCTGCAGGACCAGTTCAATGTTAGCATGAACCATGTTCATGCCTTG GCTATTCTAGTATCCACATTTCACCATGGAAAACATCCTTCAGCCATAGATCAGAAAACC TTTGGTGAATACACTGAGAGAACAGCTTTTGAAAGACCACTTACCAGTGGAGTAGCTTAC GCTTTGAAAGTCCTTCACTCTGAGAGGGAGCAGTTTGAGAAGCGGATTGGATGGACAATA AAGAAAATGGACTCTGAAGACCAGACTCTTGTACAAGAATGTACACTAGAAAAATTAGAA CCTGCACCTGTTCAAGATGAATATGCACCTGTGATATTTTCTCAGGAAACCGTGTCTCAC ATTGTCTCCATTGACATGATGTCTGGAAAGGAAGACCGTGAAAACATTTTGCGAGCTAGG GCTTCTGGAAAAGGAGTATTGACCTCACCCTTTAAGCTATTAAAGTCCAACCACCTGGGT GTTGTTCTCACATTTGCTGTCTACGACACTGACCTACCCCCTGACGCTACACCAGAACAA CGTGTAGAAGCCACTGTAGGCTATCTCGGCGCATCTTATGATGTTCCATCGCTGGTGGAG AAGCTTCTGCACCAACTTGCCAGCAAGCAAACTATTGTTGTTAATGTCTATGACACAACT AATGCTTCTGCTCCGATAAACATGTATGGTGATGAGGTCACTGAGACTGGTCTACTGCGC ATTAGCAGCCTTGATTTCGGTGATCCATTAAGGAAGCACGAGATGCATTGCAGGTTCAAG CAGAAACCTCCTTTACCTTGGACAGCAATAAATGCATCGGTTGGAGTCCTTGTTATTACT TTGCTTGTTGGTTATATCTTTTATGCGGCGATAAGTCGAATTGCAGAAGTGGAAAATGAC TATCATGAAATGATGGAGCTCAAAGCTCGTGCTGAAGCTGCAGATGTGGCGAAATCCCAG TTCCTTGCAACTGTTTCCCACGAGATCAGGACTCCAATGAATGGTGTCTTAGGTATGCTG CAAATGTTGATGGACACAAATCTTGATGCGGAGCAAATGGACTATGCCCAAACTGCTCAT GAGAGCGGGAAAGATCTTATATCGTTGATAAATGATGTTCTTGATCAGGCTAAAATAGAA TCTGGCAGGCTTGAACCTGAATCTGTACCTTTTGACCTGCATTCTATTCTTGATAATGTT CTATCACTTTTCTCGGGCAAATGTAATGAGAAAGAAATAGAGGTATTATCACCGAAGAAG TTCGCTGTATATGTTTCGGATCAGGTTCCTGATGTTGTAGTTGGTGATCCTGGGCGGTTC CGACAAATAATTACGAATCTCGTTGGAAATTCAATCAAGTTTACACGTAATAAGGGGCAT TTATTTGTCTCGGTGCATCTAGTGGATGAAGTAAGGAGCATGCTTGATGTTGAGGATGAA GTGCTACGACAAAGTTTACATTTAGTTCAAGACACGTCAAACAATGTGTATAACACGTTA AGTGGGCTCCCAGTTGTTAACAGATGGAAAAGCTGGGAAAATTTTAGAATGTTGAATAAC ACAGGTATAGCTGAGGAATCTGAAATGATTAAATTACTGGTGACAGTTGAGGATACAGGT CAGGGAATTCGTCAAGAAGCGCAAGATCGCATTTTCACTCCTTTTGTGCAGGCTGACAGT TCCACTTCTCGAACACACGGTGGTACTGGCATCGGTTTGAGTATCAGTCGTTGTCTGGTG GAACTCATGGGTGGGGAGATCGGGTTTGTGAGTGAATATGGCACTGGCAGTACTTTTTCA TTTTCTGTAACTTTCAGAAAAGGAAATACAAGAAAATGGCAGCAACACGATCCTGCTGTT TCAGAGTTCAAAGGATTAAGAGCTCTAGTTATTGACAAGAGCAGGATCCGAGCGGAGATC ACAAAATATCATGTTCAAAGGCTGGGAATATCTGTAGATATAACTTCCAGTATGCAAATG GGATGCTCATATATATCTACTACTCGCAGCACCAGTGCATTGACACAATTGGCTATGATC CTTATTGACAAAGATATCTGGAATAAGGAAAGTGGTCTTGCACTTTGGCGTATGCTCAGA CAGCAAAGGCAAACATTGGGCCTGGAAGTCTCAACAAACCTTCCAAAGATTCTTCTGTTG AGTACCTCCATTGATGCTACGGAGCGAAATGAGCTCCGATCTGATGGTATAGTGAATAAT TTTCTAATGAGACCTCTTCGGTTGAGTGTCTTGATTAGCTGCTTCCAAGAAACTCTTGGA TTCAGTAAGTTGCGCGTGAATAAGGAGAAACTAGCTTCTCCTGGGGATTTACTAAAAGAA AAACGAATTTTAGTGGTGGATGACAATATTACTAATAGAAGAGTGGCAGAAGGTAATCTA AAGAGATACAAAGCAATTGTCACTTGTGTGAATAGCGGGAAGGAAGCTGTGAAGAGCCTT ACGCCACCCCATAACTTTGATGCCTGTTTCATGGATCTGCAAATGCCTGAAATGGACGGG TTTGAAGCAACTCGGCAGGTACGTTGTATGGAGGACGAGTTTAATGCGAAAATGGTGTCC GGTGAGAATGTGGCTCGATGGCACACACCTATATTAGCAATGACAGCTGATGTCATTCAG GTAACTAATGAAAAGTGCAAAAACAGTGGGATGGATGGATATGTGTCGAAGCCTTTCAAT GAGGCACAACTTTATTCTGCAGTGGCAAAATTCTTCGAGTCTAGTTGA
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>LITCHI021449.m1 MSCSAGTGVLVKFSKLFVKRIHRWGFVNMSTVRKHSGSNGRLPENSKLKKAKESLHGRFP VARWMRKLLSLAILGLLVTGCIWFLSTFSLWRTDDGTSGSCDKKAQIFLQHANVSSHQLH ALATLFSDSDQIASLECTREPRPETPSNSGIACTLRVRCSEKQEFMQQNKWVAENLEHEN QCPVQDVNVYRKLDPSVLEDKSFVASAISQISSECQNYEKNVSLTRKWRDCARGQFKIFS FCLVKECWWVLLIVIVSCKIFGVRFKLRRRRRNQKHKQAQLQPVPQQRLPLLQLKQQQLP LLQQKQQQQTQDPPRGAGKWRKKFLIVFVLSGIAMSIWLFWYLNQKSALSRDQTLANMCD ERARMLQDQFNVSMNHVHALAILVSTFHHGKHPSAIDQKTFGEYTERTAFERPLTSGVAY ALKVLHSEREQFEKRIGWTIKKMDSEDQTLVQECTLEKLEPAPVQDEYAPVIFSQETVSH IVSIDMMSGKEDRENILRARASGKGVLTSPFKLLKSNHLGVVLTFAVYDTDLPPDATPEQ RVEATVGYLGASYDVPSLVEKLLHQLASKQTIVVNVYDTTNASAPINMYGDEVTETGLLR ISSLDFGDPLRKHEMHCRFKQKPPLPWTAINASVGVLVITLLVGYIFYAAISRIAEVEND YHEMMELKARAEAADVAKSQFLATVSHEIRTPMNGVLGMLQMLMDTNLDAEQMDYAQTAH ESGKDLISLINDVLDQAKIESGRLEPESVPFDLHSILDNVLSLFSGKCNEKEIEVLSPKK FAVYVSDQVPDVVVGDPGRFRQIITNLVGNSIKFTRNKGHLFVSVHLVDEVRSMLDVEDE VLRQSLHLVQDTSNNVYNTLSGLPVVNRWKSWENFRMLNNTGIAEESEMIKLLVTVEDTG QGIRQEAQDRIFTPFVQADSSTSRTHGGTGIGLSISRCLVELMGGEIGFVSEYGTGSTFS FSVTFRKGNTRKWQQHDPAVSEFKGLRALVIDKSRIRAEITKYHVQRLGISVDITSSMQM GCSYISTTRSTSALTQLAMILIDKDIWNKESGLALWRMLRQQRQTLGLEVSTNLPKILLL STSIDATERNELRSDGIVNNFLMRPLRLSVLISCFQETLGFSKLRVNKEKLASPGDLLKE KRILVVDDNITNRRVAEGNLKRYKAIVTCVNSGKEAVKSLTPPHNFDACFMDLQMPEMDG FEATRQVRCMEDEFNAKMVSGENVARWHTPILAMTADVIQVTNEKCKNSGMDGYVSKPFN EAQLYSAVAKFFESS.
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>LITCHI017408.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTTTATAATTCGAGTTTTTAGTTGAATAAATGTGAGTCTCTATTCAACAATTAACAAC AAAAAGTATAAACCTTGATTTTATATATATATATATATATATACGTATATATGTATATAT GTAGTTGAAAGTCGTAACGCAGTATTTTTTTATTGTGACATATGATATTACAAAATGCTT TGAAATTTAAATCAGGAGAAGCGTGAAATACTGCAATGTTGGTAAGAAATGAATTTAAAA GTCCATACTGATAGTATCATATTATAAATTCTAAAAATGTGGAAGTATTTATAAAGCGCA ATGGATTACGATGGGATCTGGTGTGATTGTGATGGAGGATATATGGTGCATTTACAATTC CTGTGATTTTATTGGAAGATATATGGTGCAATTAGGGCATGTTTATTTGATGGGATTATG GATTAATCTCAGTTCAATCACATGTTTGGCATTAAATGTCCAACCCCATTTAATTTAATA TAGATTAAAAAATTATTTTACTAAACTTAATTGTAAATAATTTAATTTTAAAAAATAAAT TAAATATATTATTTAATGAAAATTTAATATAATTTAAATCCATTGAATATTTTATTTTTA GGAAATTGATTTTGTTAATTTTTTCTGAAATTTATTTTAAATGGTTAATTTTATTAAAAT AAATTTATATAATTAAACTCATATGATATCATACTTGAAATATAATTTTTTTTTTCAATC CTATACTATACCAAATAAGACACAGTGCTACTTTTAATCAAATCCTAACTACGTCAAACA TATTATAGTATTAATCCAATTTCATTTCTTAAAAATACTACAATCCAATTTCATTTATCA AATGCTATGGCTTAATTACATTCAAGCTCGTCCCATCAAATACACATGATCTCAGCGTGT CCAAATGGTAGCAGTATATAAAGGTAACATATAGAAATTATAAAAATATAAGGTAATCAC AGCTAGTTATAATAAAATAGCTAGTTATCTATTTTCAATTTTTCTTTTAATTTTCATTTA CAAAATTCTTCATTTATTCAAACAGTTGGATTCATATCCAATGAATTTGAATGAATTAAT TTTGTATAATTGCATACACTATATATCAACATGACATCATTTGTGTTATATTTATCCATT TATTAACATGATGTTGCAGTTCAGCCTGAAGAAGACAGTGTTTTCAAGACATGGTCAAGT TGTTCTAGAAACTTGATTTTGCAAATGTATAGCATCAATTTAATACGGGACAATCTTAGA AAATCTGTACATTCCGGTTGGTGAAATCTGATCTATACCTCTTATTAATACAATTTAAAA GACTTTGTCATGTAAATTTCTCACCCAATGCAAAGAAATATTGCCAAGAATTGATGTTTT ACTTCAATAATTAATTAGGAAAGACAACTCTATATATATATATGTATGTATGTATGTATA TCACTGGTAATTTTATCACCACAATTATATGTTGTTTGAAAATTATAATAAGACAACAAA TAATCATTGTGTTTCACGCACATAGCATTGGGAAATAACCTATCTTGTTAGTTTAGATTT CATTTTTAGTACTACAAAGTCAAGAGGTACCTTGTCATTTTCTCTTTCTCCTAGCCAATG CAATGAGACATCTCAACATCGAAAAAATCAATATAATAAAGAGTATCAAATATATAACTG GACCATATGCAATTAAATAATCATAAGAAAAATCAAAACCCAGGGCTGCAAAAGTCATTA AATCTTAGTGTGTATGCACGGGACATCGAAGTAGTAGGTGAGTGAATGAACTATAAAAGT CTCGGCCTGCATCCACATGTGCCACATCAAAGTGACATTTTTTGTTACCATCTGATCATT TCCTCTCTAGCTGTACTACAACAAAAGTATCAAATCTATAAAGAAGAATAGTGATCATAT TCATTTTGCCATTGTTTTTGTGTACAAAAGACAAGTACTAGAAGCTTTTGGTGTACCTTT TTTTTATATGTAAAAGTAAG
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>LITCHI017408.m1 GenomeSequence + ACGCACATAGCATTGGGAAATAACCTATCTTGTTAGTTTAGATTTCATTTTTAGTACTAC AAAGTCAAGAGGTACCTTGTCATTTTCTCTTTCTCCTAGCCAATGCAATGAGACATCTCA ACATCGAAAAAATCAATATAATAAAGAGTATCAAATATATAACTGGACCATATGCAATTA AATAATCATAAGAAAAATCAAAACCCAGGGCTGCAAAAGTCATTAAATCTTAGTGTGTAT GCACGGGACATCGAAGTAGTAGGTGAGTGAATGAACTATAAAAGTCTCGGCCTGCATCCA CATGTGCCACATCAAAGTGACATTTTTTGTTACCATCTGATCATTTCCTCTCTAGCTGTA CTACAACAAAAGTATCAAATCTATAAAGAAGAATAGTGATCATATTCATTTTGCCATTGT TTTTGTGTACAAAAGACAAGTACTAGAAGCTTTTGGTGTACCTTTTTTTTATATGTAAAA GTAAGATGAAGCAGAAGAGGAACACATGGAAATCTGTCATCTTAAGTTGTTACCTGACAG AGAGCTGCTCTAGGCCAGAACCTAACAAGCAAGTAGTGAAACAAGCTTCTTCTCAACGGA TATCTTTGTCGGATATCAGCAATCTTAGCTCACCTATGTCTTTCGATGATCTCTCCAACT CTGTCGTTTGCTCAAAGCTTCATGCATTCACTCTTACTGAGCTGAGTGTGATTACACATA ATTTTGCTAGGAGTAATTTGCTTGGAGAAGGTGGGTTTGGACCAGTGTACAAAGGGTTTA TTGATGAGAAGCTTAGGCCAGGATTGGAGGCTCAACCTGTGGCTGTTAAGGCCCTGGACT TGGATGGCCTGCAAGGTCACAGAGAGTGGATGGTATAATATAGCTTTCAAAATCTTGAAT TCTTGAGTTATGTATTGTATTGCAGTGATGCTTATAATTTTTCTTGCTTTTTTCAGGCAG AGATAATATTTCTAGGACAACTGAGACATCCCCATCTAGTTAAGTTGATCGGATACTGCT GTGAGGAGGAGCACAGGCTCCTGGTTTATGAATACTTGGCAAGAGGCAGCTTGGAAAATC AATTGTTTAGAAGTATGGTATTTATATGTCCATTTCGGTCATCATATTATATACATATAT TTTTAGACGATATATAAAGAAAGTTGAATTCTTTTTGTATATGTGCACTGAATTTGTATT GGACAAAATAATCCTGTAGCACCATCCAGACCTAAAAGGAAAAATTGTGACATTTTCACT ATTTTTGTTAATGTTTGCACGTATGCAGGGTATGTTGCTACCTTACCGTGGTCAACCAGG ATGAAAATTGCTTTGGGGGCTGCTAAGGGCCTAGCTTTTCTTCACGAAGAAGAAAAACCG GTGATATATCGTGATTTTAAGACTTCAAACGTTCTGTTGGACGCTGTAAGCAATCCTGCT GCTCTGTCATGTTCTCCTTTAGTTTCTTTCCCTTTTTTATTTTGTTTGAAATTCTAGCTT TGTCTCTGCAGGATTTCACTGCTAAACTTTCAGATTTTGGGCTGGCTAAGGATGGTCCAG AAGGAGAAGAAACATATGTAACGACACGAGTAATGGGGACACAAGGCTATGCTGCCCCTG AGTATGTCATGACTGGTATGTTATTCAATTGCTTTTGATCTCTTCTTTGTCTAATTAAAA CATCATTGAATGTGACCATTGACTGGAATTTAACAACTACATGCCAAACTCTTTATCTTT TAAATTATTTCTATGTATTTGGAATACCGTCCATTGGTTTTATAATTTGAAACAACTTCT TCCATCAAAAGAAAACTCAAATAAGCAACCTTGATCTGACTTTAGACAAGTCCTGAAATG CATTTATTCTTCAATTGGAAAAATAATGAAACTTTGTAACAATATTCCAGGTCACTTGAC GACCATGAGTGATGTGTTCAGCTTTGGGGTAGTTCTACTAGAGTTGCTGACAGGTAAACG GTCCATGGACAACATGCGCCCTGGTCGAGAGCAAAGCCTTGTAGAATGGGCAAGACCTCT AATGAGGGACCCAAAAAACCTTGATAGGCTAATGGACCCTAGACTTGAAGGGCAATACTC CATCAAGGGAGCTCAAAAAGCAGTTGCACTGGCTTATATATGCTTGAGCCACCGACCAAA GCAGAGACCAACAATGACTGAAGTAGTCAAGATCCTGGAATGTCTTCAGGGCTTTGAGGA CACATTTCAAAAACCATTTGTCTATGTTGTTCCTGATGAAAATGACAGCAAAGAGTCTTT TGGTACCGACAATGGATCACAAACTGATCGAGAAGGAAAAGATTCCAATGACAAAAATCA TCGTAGGACTCGGAGACGTAGGATCAAACTGCCTACAACTCTAATAGCTCATTCTGATTC TGCTCTGTATAAGAAATTTGCACATGGCTTAAACTCTCCCAAGCAAGCAATAGCAAACTA GACAGTAAGACAAACTGAATAGCTTTTCAAAAATTTGCAGCTGAACTGGTTTTTTGTATG TTCTCCACATCAAAATCAAAGTAAACAATTTGTGGTTAATGTTAAAACCGCATTGCCAGG TTACAAACCAAGCACTTAAAAAAAAGTGCTTGGTCAGTTCATTTCCTGGTTTTTAAGTAT CTGAGTTAAGAATTGTAGTATATATATATAAGGAGTTTTGAAGAGGTAAATCTTCCATAC AACTAGTTTTTGTTTAAACATACTTAACTTCAAAGTTCTTCATGTGAATTAAGAATTGGG CAAAAATGATCACTTTGGTTAGAAGGTAGAATGTTTTCTTGTCTCTAGAGAATTGGTTTG TTTGTCAATACATGTATGTACTACAAGTCTGCAATTAAGATGCTTGTAATTTTTTTTTTT TTTCCAGTTTATATATTAGTAAATATTATTGCGTAAGTGTATGAATGTTCCTATGTACAA CTTGCAATTTTCGGTAGTTTATATCACAGAAAATTCAACAATAGAAAGTAAC