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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021369 | Chr12 | 22105439 | 22111147;22111277 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021369.m1 | 56 | 80 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.4 | 3.20E-08 |
| LITCHI021369.m1 | 59 | 80 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.8 | 0.64 |
| LITCHI021369.m1 | 99 | 123 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.5 | 7.90E-10 |
| LITCHI021369.m1 | 102 | 122 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.6 | 0.74 |
| LITCHI021369.m1 | 144 | 168 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.50E-10 |
| LITCHI021369.m1 | 147 | 167 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.6 | 0.35 |
| LITCHI021369.m1 | 291 | 315 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.7 | 1.50E-09 |
| LITCHI021369.m1 | 294 | 314 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.2 | 0.00072 |
| LITCHI021369.m1 | 336 | 361 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.90E-08 |
| LITCHI021369.m1 | 340 | 360 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.8 | 0.3 |
| LITCHI021369.m2 | 56 | 80 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.4 | 3.20E-08 |
| LITCHI021369.m2 | 59 | 80 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.8 | 0.64 |
| LITCHI021369.m2 | 99 | 123 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.5 | 7.90E-10 |
| LITCHI021369.m2 | 102 | 122 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.6 | 0.74 |
| LITCHI021369.m2 | 144 | 168 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.50E-10 |
| LITCHI021369.m2 | 147 | 167 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.6 | 0.35 |
| LITCHI021369.m2 | 291 | 315 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.7 | 1.50E-09 |
| LITCHI021369.m2 | 294 | 314 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.2 | 0.00072 |
| LITCHI021369.m2 | 336 | 361 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.90E-08 |
| LITCHI021369.m2 | 340 | 360 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.8 | 0.3 |
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>LITCHI021369.m1 ATGTTTTTGAGTGTGCCACCGATGCCAGATAACCGGCAAGTGAAGAGCAATGCTGTGTCA AATCAATCTGCTGATAACATTGAAGAAGCTATACGGAGGTTGAAAATTCATGATAATCAA GAAGGGGGTGGTGTCGCTCAGTCAAGCCCCTACCCGGATCGCCCAGGTGAACCAGATTGT TTATTTTACCTAAGGACTGGGTTGTGTGGTTATGGAAATAACTGTCGGTTCAATCATCCT GCTAGTGCTGCACAGGGTGCTCAATATAGAGAAGAGCTCCCTGAGAGACTTGGACAACCT GACTGTGGGTATTATTTAAAGACAGGGACCTGCAAATATGGATCAACATGTAAATATCAT CACCCAAAGGATAGGAATGGTGCTGGACCAGTCTTGTTCAACATTCTAGGTCTTCCTATG CGTCAGGATGAAAAATCTTGTCCGTATTATATGCGGACTGGATCATGTAAGTTTGGAGTT GCATGCAAGTTTCACCATCCCGAGCCTGGAACTAGCTTACCAGTAACTGGAAATGCTGCA TTGGGATCAATGGGGTCATCCATTCTGCCTTCATCCGGTCTATCTTATGCAGGTGGCCTT CCAACATGGTCATTGCCTAGGTCACCTTATGTCCCTGGACCACGTCTACAAGGGACACAA GGCATTTTACCTGTCATTGTTTCTCCTTCTCAAGGCATTGTAACTGCACCAGGCTGGAGC ACGTACATGGGAAATATGAGCCCTCTATCTTCTACCGGTGTTCTTGGATCCAATCTCATT TACAATTCCAGGAATCAAGGTGAATTAGGTGCTGGTGGGCAGGTGAGCTTGTTACCAGCG ACTGGTCTAAATTTACCTGAGAGACCTGATCAACAAGAATGCCGGTATTATATGAACACT GGAACCTGCAAATATGGCTCTGATTGCAAGTACCATCACCCAAGAGAAAGGATTGCTCCA TCAACAGGAAATACTATAGGCCCACTTGGCCTTCCCTCAAGACCTGGACAAGCTGTGTGT TCAAATTACAGTATGTATGGTATCTGCAAGTTCGGTCCTACTTGTAGATTCGATCACCCT TTTGCAGGGTATCCTTGTAACTACACTTTCAGCCTTCCACCACTATCTATATTGGATTCA TCGCTCATGAATCATCAGGTCATACAAACAGCTCACACATCCGAGACTTCTCCTGCTATG TCATCGAAATACCCCGATTGGGTACAAAATTCCGATACTGCAAGCGTTAAACATCAGGTC CCTGATACAAAGAACTCTGCTACAACCAATTCAGATGAGTCGCCTACACCACCGGATCAC TCTCCACCTCATTCCATGCAGAATTCTTCAGAACCATCACATGATCAGTCTAATTGA >LITCHI021369.m2 ATGTTTTTGAGTGTGCCACCGATGCCAGATAACCGGCAAGTGAAGAGCAATGCTGTGTCA AATCAATCTGCTGATAACATTGAAGAAGCTATACGGAGGTTGAAAATTCATGATAATCAA GAAGGGGGTGGTGTCGCTCAGTCAAGCCCCTACCCGGATCGCCCAGGTGAACCAGATTGT TTATTTTACCTAAGGACTGGGTTGTGTGGTTATGGAAATAACTGTCGGTTCAATCATCCT GCTAGTGCTGCACAGGGTGCTCAATATAGAGAAGAGCTCCCTGAGAGACTTGGACAACCT GACTGTGGGTATTATTTAAAGACAGGGACCTGCAAATATGGATCAACATGTAAATATCAT CACCCAAAGGATAGGAATGGTGCTGGACCAGTCTTGTTCAACATTCTAGGTCTTCCTATG CGTCAGGATGAAAAATCTTGTCCGTATTATATGCGGACTGGATCATGTAAGTTTGGAGTT GCATGCAAGTTTCACCATCCCGAGCCTGGAACTAGCTTACCAGTAACTGGAAATGCTGCA TTGGGATCAATGGGGTCATCCATTCTGCCTTCATCCGGTCTATCTTATGCAGGTGGCCTT CCAACATGGTCATTGCCTAGGTCACCTTATGTCCCTGGACCACGTCTACAAGGGACACAA GGCATTTTACCTGTCATTGTTTCTCCTTCTCAAGGCATTGTAACTGCACCAGGCTGGAGC ACGTACATGGGAAATATGAGCCCTCTATCTTCTACCGGTGTTCTTGGATCCAATCTCATT TACAATTCCAGGAATCAAGGTGAATTAGGTGCTGGTGGGCAGGTGAGCTTGTTACCAGCG ACTGGTCTAAATTTACCTGAGAGACCTGATCAACAAGAATGCCGGTATTATATGAACACT GGAACCTGCAAATATGGCTCTGATTGCAAGTACCATCACCCAAGAGAAAGGATTGCTCCA TCAACAGGAAATACTATAGGCCCACTTGGCCTTCCCTCAAGACCTGGACAAGCTGTGTGT TCAAATTACAGTATGTATGGTATCTGCAAGTTCGGTCCTACTTGTAGATTCGATCACCCT TTTGCAGGGTATCCTTGTAACTACACTTTCAGCCTTCCACCACTATCTATATTGGATTCA TCGCTCATGAATCATCAGGTCATACAAACAGCTCACACATCCGAGACTTCTCCTGCTATG TCATCGAAATACCCCGATTGGGTACAAAATTCCGATACTGCAAGCGTTAAACATCAGGTC CCTGATACAAAGAACTCTGCTACAACCAATTCAGATGAGTCGCCTACACCACCGGATCAC TCTCCACCTCATTCCATGCAGAATTCTTCAGAACCATCACATGATCAGTCTAATTGA
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>LITCHI023936.m2 TTGACTCAAAATTTACCGTGGCTCCCCCAAAAAGGCAGCAAGACGCGCCTCGTAAATATC TACCGTCCCATCCGGTGACCAACCCCACTTTCACTCACCTACTCCACTCTCGAAACTCAC CTCCTCACTCGGTCACCCCCGTCAATACATTTCAAATAACTTCAAATCCTCTCTTCGCTT CCCAATCCCTTCTCCATTTTGATTTTTAATTGAGCTGATTGATGCTCCATACCCTAACTT GCTCATCATCTTCAAGCTCACAATCTAAAAGTCAGTTGATTTGAACTGTTTTCAGATTTT TTGCTACTATTAAAACATGTGTGGTGTTTCGGAGAAGTTAAATTCTAAGGCTTTGGGACC TAGTTCCACGCAAAGTGACTCGTCGCTAAGTGGAAGTATGAGTAATATGTGTGAGAAGGT CGACAGTGGACATTGTTTTTCTCGTTTGCTGGAACTTGCAGCTGATAATGATGTTGAGGG GTTTAAGGAAGCGGTGGGGGATGGATCTGTTGTTGGTGATGTTGGACTTTGGTATAGTTT CCATGGGGGGTTGAAAAAGATGGTTCTTGAGTGTAGGACCCCGTTAATGGTTGCTGCCAA ATATGGCAGTGTTGATGTTGTGAAGTTGATTCTTTCTTTTTTGAAGGCTGATGTGAATCT GTCTTGTGGGGTGGATAAGAGCACTGCATTGCATTGTGCTGCTTCTGGTGGATCTGTTGA TGCTGTTAGTATTGTCAAACTGCTTCTTGTTGCTGGTGCTGATCCTAATGCTACTGATGC GAATGGACGTCGTCCATTTGATGTTATTTGTGCTCATCGGAATCTTCCTGATTCTAGAGC TACCCTTGAAGAGCTTTTGAAGAATGATGGGTCTGTCAGTGTAGACAGTCTGTGGGTTTC AACTGTTAGTTTGAGGTCCAGTTCACGGTCTCTATCATCGTTGTCAGATAATGGTTCTTG 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GTCTCCATCGCATAAATCTGTTGTTCTTAATCAACTCCAGCACCAGCAGAGTATGTTATC TCCAATCAAGACAAACATGCTCTCTCCAAAAATGGTTGATCACCCTCTCTCGCAGGCTTC ATTTGGCGTTTCCTCTCCAGGGAGAATGTCACCTAGGATGGTGGAACCTATATCCCCAAT GAACTCCCGCCTATCTGTTCGTGCTCATCGTGAGAAGCTGCAACAACACTTATCCAACTT CTCCTCACAAGAACTCGGCCCTACTTTCTCACGCGATCCTAAATCTAACAATGTTGTTGG TTCCCCAGTGAACTCCCTTTCAAAATGGGAGTCCTTCAATGGACAAGTAGATTGGTCTGT TCAGAATGATGAATTGAATCGCTTATCCAAATCACAGTCATTTGGGCACAAAGGTGAGGA GCCTGATGTGTCATGGGTTCAGTCACTTGTCAAGGAAACTCCATCATCAAAGATCAAGGA AACACCTCCAGTTCCAGCCACAACAAGCATGGCACAATCTGTTGAGGGTTCTAATAACTT AAACCCTCAAACTGAATCCGGTGATCATTTAGGATCATGGCTTGATCAGCTACAGCTTGA TCAGATTGTCGCTTAGCAAAAGTGAAACGATTTTCACTGTGCTTTAAGATAGTCAAAATT GAATTACTAATCAATTATTTTCCTGGTGATAATTATTCATTAATTATTTACTTGGTGATA CACCAGTTCAGATTATTACACATAACAATACAAAGCAGAGGAAGGAGCAAGTTCAGAGGA AACTTTGTCTTCATTTATTTATTATTTATTGTTATTACAGAAGAAGAAGAAGTCAGGCAG GAATGATGGTGTCTGTCTGGATTAGCAAAGACCCGAGTCAGGTTAGGTAGTTCTCTTGCC ATACTTCGCATGAACTAAGTCTACGTTTTTTTTTTTAATTATTATATGTTACTCTTTGAA 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