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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021369 | Chr12 | 22105439 | 22111147;22111277 | + | Zinc finger CCCH domain-containing protein 3 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021369.m1 | 56 | 80 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.4 | 3.20E-08 |
| LITCHI021369.m1 | 59 | 80 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.8 | 0.64 |
| LITCHI021369.m1 | 99 | 123 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.5 | 7.90E-10 |
| LITCHI021369.m1 | 102 | 122 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.6 | 0.74 |
| LITCHI021369.m1 | 144 | 168 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.50E-10 |
| LITCHI021369.m1 | 147 | 167 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.6 | 0.35 |
| LITCHI021369.m1 | 291 | 315 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 37.7 | 1.50E-09 |
| LITCHI021369.m1 | 294 | 314 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 20.2 | 0.00072 |
| LITCHI021369.m1 | 336 | 361 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 32.6 | 5.90E-08 |
| LITCHI021369.m1 | 340 | 360 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 11.8 | 0.3 |
| LITCHI021369.m2 | 56 | 80 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 33.4 | 3.20E-08 |
| LITCHI021369.m2 | 59 | 80 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.8 | 0.64 |
| LITCHI021369.m2 | 99 | 123 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 38.5 | 7.90E-10 |
| LITCHI021369.m2 | 102 | 122 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 10.6 | 0.74 |
| LITCHI021369.m2 | 144 | 168 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 39.3 | 4.50E-10 |
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>LITCHI021369.m1 ATGTTTTTGAGTGTGCCACCGATGCCAGATAACCGGCAAGTGAAGAGCAATGCTGTGTCA AATCAATCTGCTGATAACATTGAAGAAGCTATACGGAGGTTGAAAATTCATGATAATCAA GAAGGGGGTGGTGTCGCTCAGTCAAGCCCCTACCCGGATCGCCCAGGTGAACCAGATTGT TTATTTTACCTAAGGACTGGGTTGTGTGGTTATGGAAATAACTGTCGGTTCAATCATCCT GCTAGTGCTGCACAGGGTGCTCAATATAGAGAAGAGCTCCCTGAGAGACTTGGACAACCT GACTGTGGGTATTATTTAAAGACAGGGACCTGCAAATATGGATCAACATGTAAATATCAT CACCCAAAGGATAGGAATGGTGCTGGACCAGTCTTGTTCAACATTCTAGGTCTTCCTATG CGTCAGGATGAAAAATCTTGTCCGTATTATATGCGGACTGGATCATGTAAGTTTGGAGTT GCATGCAAGTTTCACCATCCCGAGCCTGGAACTAGCTTACCAGTAACTGGAAATGCTGCA TTGGGATCAATGGGGTCATCCATTCTGCCTTCATCCGGTCTATCTTATGCAGGTGGCCTT CCAACATGGTCATTGCCTAGGTCACCTTATGTCCCTGGACCACGTCTACAAGGGACACAA GGCATTTTACCTGTCATTGTTTCTCCTTCTCAAGGCATTGTAACTGCACCAGGCTGGAGC ACGTACATGGGAAATATGAGCCCTCTATCTTCTACCGGTGTTCTTGGATCCAATCTCATT TACAATTCCAGGAATCAAGGTGAATTAGGTGCTGGTGGGCAGGTGAGCTTGTTACCAGCG ACTGGTCTAAATTTACCTGAGAGACCTGATCAACAAGAATGCCGGTATTATATGAACACT GGAACCTGCAAATATGGCTCTGATTGCAAGTACCATCACCCAAGAGAAAGGATTGCTCCA TCAACAGGAAATACTATAGGCCCACTTGGCCTTCCCTCAAGACCTGGACAAGCTGTGTGT TCAAATTACAGTATGTATGGTATCTGCAAGTTCGGTCCTACTTGTAGATTCGATCACCCT TTTGCAGGGTATCCTTGTAACTACACTTTCAGCCTTCCACCACTATCTATATTGGATTCA TCGCTCATGAATCATCAGGTCATACAAACAGCTCACACATCCGAGACTTCTCCTGCTATG TCATCGAAATACCCCGATTGGGTACAAAATTCCGATACTGCAAGCGTTAAACATCAGGTC CCTGATACAAAGAACTCTGCTACAACCAATTCAGATGAGTCGCCTACACCACCGGATCAC TCTCCACCTCATTCCATGCAGAATTCTTCAGAACCATCACATGATCAGTCTAATTGA >LITCHI021369.m2 ATGTTTTTGAGTGTGCCACCGATGCCAGATAACCGGCAAGTGAAGAGCAATGCTGTGTCA AATCAATCTGCTGATAACATTGAAGAAGCTATACGGAGGTTGAAAATTCATGATAATCAA GAAGGGGGTGGTGTCGCTCAGTCAAGCCCCTACCCGGATCGCCCAGGTGAACCAGATTGT TTATTTTACCTAAGGACTGGGTTGTGTGGTTATGGAAATAACTGTCGGTTCAATCATCCT GCTAGTGCTGCACAGGGTGCTCAATATAGAGAAGAGCTCCCTGAGAGACTTGGACAACCT GACTGTGGGTATTATTTAAAGACAGGGACCTGCAAATATGGATCAACATGTAAATATCAT CACCCAAAGGATAGGAATGGTGCTGGACCAGTCTTGTTCAACATTCTAGGTCTTCCTATG CGTCAGGATGAAAAATCTTGTCCGTATTATATGCGGACTGGATCATGTAAGTTTGGAGTT GCATGCAAGTTTCACCATCCCGAGCCTGGAACTAGCTTACCAGTAACTGGAAATGCTGCA TTGGGATCAATGGGGTCATCCATTCTGCCTTCATCCGGTCTATCTTATGCAGGTGGCCTT CCAACATGGTCATTGCCTAGGTCACCTTATGTCCCTGGACCACGTCTACAAGGGACACAA GGCATTTTACCTGTCATTGTTTCTCCTTCTCAAGGCATTGTAACTGCACCAGGCTGGAGC ACGTACATGGGAAATATGAGCCCTCTATCTTCTACCGGTGTTCTTGGATCCAATCTCATT TACAATTCCAGGAATCAAGGTGAATTAGGTGCTGGTGGGCAGGTGAGCTTGTTACCAGCG ACTGGTCTAAATTTACCTGAGAGACCTGATCAACAAGAATGCCGGTATTATATGAACACT GGAACCTGCAAATATGGCTCTGATTGCAAGTACCATCACCCAAGAGAAAGGATTGCTCCA TCAACAGGAAATACTATAGGCCCACTTGGCCTTCCCTCAAGACCTGGACAAGCTGTGTGT TCAAATTACAGTATGTATGGTATCTGCAAGTTCGGTCCTACTTGTAGATTCGATCACCCT TTTGCAGGGTATCCTTGTAACTACACTTTCAGCCTTCCACCACTATCTATATTGGATTCA TCGCTCATGAATCATCAGGTCATACAAACAGCTCACACATCCGAGACTTCTCCTGCTATG TCATCGAAATACCCCGATTGGGTACAAAATTCCGATACTGCAAGCGTTAAACATCAGGTC CCTGATACAAAGAACTCTGCTACAACCAATTCAGATGAGTCGCCTACACCACCGGATCAC TCTCCACCTCATTCCATGCAGAATTCTTCAGAACCATCACATGATCAGTCTAATTGA
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>LITCHI002019.m1 CCAACTACAACTAACTATCTAAACTAACATAATTATCTCATCATTTTCCCATAAAGCCCC ATATCAACCCTCCCCTCTCTTTTCTTACTTAACTTCTGTGCCAGGCACTTCTCTCTCTCT CTCTGTCTACACACGCACGAACGCACAAAACCCAACAACAATAAAATTCAGTGTAATTAA AAGACCATCCAGGAGGTTGTACTTCCTCTTCCAATATTTATCCATATCCAGTCAGGCCAA TCATAAAACACACAAATATATACGAAGGGTTTTAAATTTTAACAATGAATTCATTTTTAA AAATTTAGTAAGGGGGAGGTGGACCATTAATCACATACCCACCTCCATATGTGTTAGTTC CAACCACATAATATATAATATTGGTTGTACACATACTGCACAAACACATACATGTATTAA TATAAAATCTGGTATCTGTTGCTATAATTTAAGTGAGTGAGGGGAGATTTAGAGAGGTAA CTAAACCAATAGTCCAAAAACATATGAGAGTTTGGACACATTAAAACTTTATTTCTCTCT GAAAGAAAAGGAAAAAAGTTCACACCTTGTCTTTGCTTACATACTTTATATACACAAATA CCTTTCTTTACACCTACCTGAAGGTTACCCTTCAGTTAATATATATATGCTTATATGCCT CTTTTGCCTTATTTTTATATCTATACATTTTTAAAGTAAATAAATATAAGCTCAATAGAG AGAGAGAGAGAAGCCCACCAGCCACTCTCTCTTTTCCTCTCTAACCTGTCTCACCAACTC ACATCTAGAAGCAATTAGGGTCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTAATAGTCAACA GCCTATATATATAACGGACACTCCACAACTTCTCACAAGGGCCGGCCTTAATGTTTCAGC AACAACACCCCACAAAAGCAAAGCAAACACATCAACACCACAACACAACACAACACAAAC ACAACTAGCTCAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTACTACTTCCCCACAACACAAAATCAAAA ACTCAACACATAGAGTTACATACACAACAACTTGTCATCATCATCATCATCATCATCATT GGTTTCCACAAAATGGGGAGGTCTCCATGTTGTGAAAAAGCACACACAAACAAAGGAGCA TGGACCAAAGAAGAAGATGATAGGCTTATAGCATACATCAGAGCTCATGGAGAAGGCTGC TGGCGTTCACTGCCTAAAGCAGCTGGTCTTCTTCGATGTGGGAAAAGTTGTAGACTTCGT TGGATCAACTACTTGAGGCCTGACCTTAAACGTGGAAACTTCACTGAAGAAGAAGATGAG CTTATTATCAAGCTCCATAGTCTTCTAGGCAACAAGTGGTCTTTGATAGCTGGGAGGTTA CCAGGAAGAACAGATAATGAGATAAAAAATTATTGGAACACACATATAAGGAGAAAACTT TTGAATAGAGGAATTGATCCTGCAACACACAGGCCACTAAATGAGCCTCCTACAACAACA ACAGCAACAACACCACCTCTAGATGTGACCACCACCACAATCTCCTTCACCGCTGCAAAA GATACATCAACAGAACAGATGATCAAAAAAGGCCCTCAACAACAACAACAGCAAGTGCTA CTACAAGTCAAACAAGAGAGGTGTCCAGACTTGAATCTAGAGCTCAAAATAAGCCCTCCT TCACAATATCAAAATCAATCAGACCAGCAGCCAATGAAAACTGGGGGGAGATCATCGTCC TCGTCAACATCAACAACATCAAACAACCTCTGCTTTGCTTGCAGCTTGGGGCTACAAAAC AGCAAAGATTGCAGCTGCACCACCAGTTTCATTGTTGACCATAATGGTACTACTACAACT AGTATCAATGGTGCCACTCCGACAGCCACCAACACTTGTTATGATTTCCTAGGCTTGAAA GGTGGTGTTTTGGATTATCGAGGCTTGGAAATGAAATAGTATCAAAAAACAAAACAAAAC AAAACAAAAATTTTCAACCGGGGTTGCAACTTTGGAGATTGAAATGTCATGTAGATTCAA CAAAATTGAAGAGAGAATTGAGTAAGAGATTAATGTTATTAGTTTCAAAATCTCTCTAAT TTTCTTCTCTTTTTTTTTTGTTTTTATGTTATTTTTTTTACTCTAATGTGTATGATTATT AATAGTGCATACTACATGGTAAAAATTTTAGTACAGGTGGTCTTACTGTTGAGAATTGCC TTTACATTTTTATTGGAATGTTATTGTAATTTGATTTTATCCATATTCAATCATTTATTT ATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACTCAAATCATTTTAATTTTTAAAAATTTTTCTTTTTA AATGATTGTAAAAGAGGAGAATATATATATAT
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>LITCHI002019.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAGTTTGGACTTAGCTAAGCTCTAGGTGGGTACAGTGAATGAGAGATATAGGTGAAAAAG TAGGTAAATTGTTCACAGAAAACTACACACGAAGTGGCCTCTTTTATCTCTGTCTTTGAA AACTACTTCTCCCCATCATCATTTTCTTTACTTTTACTAGCCTACTTCAACGGATTATTA TTATTATTATTATTTTATTATTCGTATCAAATGTATCTTTATTGTTATGAATTTTTAAAA AAATATGTATAATTTTAAATTAATAACGAACAAATGAAAACAGAATCGTACTATGTAGTT TACTCGAATATGGTAATATGATATATCTGTTTTTTCAGCTTTATCTTGATGACGTACCAA AGAAAACTACATCTGCCCATGGTCTTAACTCTTACCAGCCGCTTGAACTTCATGATGAGA GAGAGAGAGAAGCTTGGTGGTGTGGTGGGTAACAAATGATATGCAAATTGGAAGAGGGAG ATAGGGGAGGGAGAGATAACAACAAAAAGGTGAATCAACCTCTCACTCCCTAACCCTACC CAATGTTGCCTAAACTTACACCACAAGGTTGGGGCCAAACAAAACCAAAATACCCAAAAA ATAAATCCAAAAATTATTAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGTAAGGTGAA CCAATGCCCACATACAACCACAACCACACTCATCATATATATATCTTTTCCCTATTCTTC TCTTTTTTTTTCATCATCTCTCCCTTCGTTCAACCCAACCTCCAACTCTTCTAGAAACCC CCCCTCACTCTCTCTCTTTCATATGCATGATAGTGTACCAATAGAATAAAGAACCACAAC TACCATCCTGCATACTTGTACAAACGAATTGCCAAACCACTTGTACAAATTTTTCTTTTA CAAAACCCCCAACTACAACTAACTATCTAAACTAACATAATTATCTCATCATTTTCCCAT AAAGCCCCATATCAACCCTCCCCTCTCTTTTCTTACTTAACTTCTGTGCCAGGCACTTCT CTCTCTCTCTCTGTCTACACACGCACGAACGCACAAAACCCAACAACAATAAAATTCAGT GTAATTAAAAGACCATCCAGGAGGTTGTACTTCCTCTTCCAATATTTATCCATATCCAGT CAGGCCAATCATAAAACACACAAATATATACGAAGGGTTTTAAATTTTAACAATGAATTC ATTTTTAAAAATTTAGTAAGGGGGAGGTGGACCATTAATCACATACCCACCTCCATATGT GTTAGTTCCAACCACATAATATATAATATTGGTTGTACACATACTGCACAAACACATACA TGTATTAATATAAAATCTGGTATCTGTTGCTATAATTTAAGTGAGTGAGGGGAGATTTAG AGAGGTAACTAAACCAATAGTCCAAAAACATATGAGAGTTTGGACACATTAAAACTTTAT TTCTCTCTGAAAGAAAAGGAAAAAAGTTCACACCTTGTCTTTGCTTACATACTTTATATA CACAAATACCTTTCTTTACACCTACCTGAAGGTTACCCTTCAGTTAATATATATATGCTT ATATGCCTCTTTTGCCTTATTTTTATATCTATACATTTTTAAAGTAAATAAATATAAGCT CAATAGAGAGAGAGAGAGAAGCCCACCAGCCACTCTCTCTTTTCCTCTCTAACCTGTCTC ACCAACTCACATCTAGAAGCAATTAGGGTCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTAAT AGTCAACAGCCTATATATATAACGGACACTCCACAACTTCTCACAAGGGCCGGCCTTAAT GTTTCAGCAACAACACCCCACAAAAGCAAAGCAAACACATCAACACCACAACACAACACA ACACAAACACAACTAGCTCAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGTACTACTTCCCCACAACACAA AATCAAAAACTCAACACATAGAGTTACATACACAACAACTTGTCATCATCATCATCATCA TCATCATTGGTTTCCACAAA
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>LITCHI014316.m1 GenomeSequence - CACTTTTAGTGCCTACGCGTCGACATTCATTAATGCTATGCAGTCTACAACTTTCAACTC CAAAGTTCCGACAGTGCCACCCACCGCTTTCAAACGATCGTACCTGTAACTGGTCGAGTC ATCAACTTCTCAACTTGACTCGACAAAACCACCATCCTCCATCAACCACCCCTGATTGTC AACCTAGCTTCCAACCAACCTCTCCAAGTCTTTGCATCACTAGTAGTAAGCCCGCTTCCT CTCTTAAACTACTTGTAAAAATTCTACCTTCAAAGTTGCCTTCTTTTCTCTTCAAGATTC CTTTTTTTTTAAATGCATTTTTATCATCTTTGCTTACTGACTTTTTTTTTTAATTGCTTT TGGCAGTTTGAATTGTTATAATTAAATGAGAAAGAGAAATAAAGAATCATAAAGTTTTTT ATAGTGGGGGTGTGATTATTTTGATGAAATCTAACTTGTTCAATGAGGATGAAAAACTGG TCTGGTGGGTTGTTGATAATGGCTCTTGCTGTGATTTTGGTTATAAGTTATAGTTTTATG GGGACTAGTACTACTCAAGAACCGAGAAAGGGAAAACAGTCAGCTTATAGTTTTTGGAGG AACCATCCAGCTGATGATGATAAGGGGAAGGGGGGTAATGATGCTGCTGTTAGGTCTCCT CCTCCAATTGGAGTGAAGAGATTGTTTAGGTTGTCAGACAAGCCTCATCTTGTAGATGTC GATGGACTTGGTGATCTTTATGGAGTGAAAAATATGTCCAAAGTGGAGTCTAGTGCTTTA CTTGCTTGGAGTCATATGCGTTTAGTTTTGTCACGGTCTGATGCTTTGCCTGGAACTGCT CAAGGTGTTAAGGAGGCTGCGATGGCATGGAAGGATTTGTTGTTGATGATTGAGGAGGAG 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