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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021345 | Chr12 | 21872285 | 21876522;21876532;21877905 | - | Homeobox protein knotted-1-like LET6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021345.m1 | 37 | 83 | PF03791.16 | KNOX2 | Family | 80.2 | 6.20E-23 |
| LITCHI021345.m1 | 115 | 136 | PF03789.16 | ELK | Family | 43.6 | 2.30E-11 |
| LITCHI021345.m1 | 155 | 194 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 57.6 | 9.10E-16 |
| LITCHI021345.m1 | 161 | 195 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 30 | 3.80E-07 |
| LITCHI021345.m2 | 47 | 93 | PF03791.16 | KNOX2 | Family | 80.1 | 6.60E-23 |
| LITCHI021345.m2 | 125 | 146 | PF03789.16 | ELK | Family | 43.5 | 2.40E-11 |
| LITCHI021345.m2 | 165 | 204 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 57.5 | 9.70E-16 |
| LITCHI021345.m2 | 172 | 205 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 30 | 3.70E-07 |
| LITCHI021345.m3 | 75 | 113 | PF03790.16 | KNOX1 | Family | 72.1 | 2.40E-20 |
| LITCHI021345.m3 | 133 | 179 | PF03791.16 | KNOX2 | Family | 79.4 | 1.10E-22 |
| LITCHI021345.m3 | 211 | 232 | PF03789.16 | ELK | Family | 43 | 3.60E-11 |
| LITCHI021345.m3 | 251 | 290 | PF05920.14 | Homeobox_KN | Family | 56.9 | 1.50E-15 |
| LITCHI021345.m3 | 257 | 291 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 29.2 | 6.40E-07 |
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>LITCHI021345.m1 ATGGTTGGAGCACCTCCTGAAGTGGTGGCTAGGTTGGAGGAAGTATGTGCTTGTGCTTCT GGGGAGGCCATGAATGCTAGGTCAACTGGAAGTACTAGTACAGGTTGCTTGGGTGATGAC CCATCGCTTGACCAGTTCATGGAAGCATACTGTGAAATGTTAACCAAATATGAAGAAGAG CTTACCAAACCCTTCAAAGAAGCCATGTTCTTCCTCTCCAAGATTGAGTCCCAACTCAAA GCCCTAACTCTTGTTCCTCCCATTTCTGGTCAAAATGGATCATCTGAAGAAGAGTTTGAT GTAAATGACAACAACTACATAGATCCTCATGCTGAGGATGGTGAACTGAAGGGTCAGCTT TTGCGCAAGTACAGTGGACATCTCGGCAATCTCAAGCAGGAGTTCATGAAGAAGAAAAAG AAAGGGAAATTGCCAAGGGAAGCCCGCCAGCAGTTGCTAGATTGGTGGAGCAGACATGAC AAGTGGCCTTATCCGTCCGAGTCACAAAAGCTAGCACTAGCAGAATCCACAGGGTTGGAT CATAAACAAATTAACAACTGGTTTATCAATCAAAGGAAACGCCACTGGAAGCCGTCGGAA GACATGCAATTTGTCGTCATGGACGGTGTGTACCCTTACAACTATATGGACAATCTCATG GCTAATCCCTATCCCATGGATTGCACTCCAACTCGCTTCTAA >LITCHI021345.m2 ATGCTCAACTTGAAGTCACTTTTGAGGGATATTGTTGGAGCACCTCCTGAAGTGGTGGCT AGGTTGGAGGAAGTATGTGCTTGTGCTTCTGGGGAGGCCATGAATGCTAGGTCAACTGGA AGTACTAGTACAGGTTGCTTGGGTGATGACCCATCGCTTGACCAGTTCATGGAAGCATAC TGTGAAATGTTAACCAAATATGAAGAAGAGCTTACCAAACCCTTCAAAGAAGCCATGTTC TTCCTCTCCAAGATTGAGTCCCAACTCAAAGCCCTAACTCTTGTTCCTCCCATTTCTGGT CAAAATGGATCATCTGAAGAAGAGTTTGATGTAAATGACAACAACTACATAGATCCTCAT GCTGAGGATGGTGAACTGAAGGGTCAGCTTTTGCGCAAGTACAGTGGACATCTCGGCAAT CTCAAGCAGGAGTTCATGAAGAAGAAAAAGAAAGGGAAATTGCCAAGGGAAGCCCGCCAG CAGTTGCTAGATTGGTGGAGCAGACATGACAAGTGGCCTTATCCGTCCGAGTCACAAAAG CTAGCACTAGCAGAATCCACAGGGTTGGATCATAAACAAATTAACAACTGGTTTATCAAT CAAAGGAAACGCCACTGGAAGCCGTCGGAAGACATGCAATTTGTCGTCATGGACGGTGTG TACCCTTACAACTATATGGACAATCTCATGGCTAATCCCTATCCCATGGATTGCACTCCA ACTCGCTTCTAA >LITCHI021345.m3 ATGGAAGGAGGATCTAGTGGTAGTACTAATAGGGTTTGTCCTGATAATTCTATGATGGGT TTTGGAGATATGAATTCTAAGATGTTATTTCCTTTGTTGAACTACAATTGTGATGGACAA ATGAAGGTACCTGTATTTGTGCAACAAGATAGTGGAAATCACAACAACAACATCAACATC AACATCAACAGCAGCAGCAGCAGCAATAGCATTTGTAATTCTATGAGGACCAAGATCACG GCTCACCCTCAGTTTCCTCGCTTGTTGGCTGCTTATGTTAATTGTCAAAAGGTTGGAGCA CCTCCTGAAGTGGTGGCTAGGTTGGAGGAAGTATGTGCTTGTGCTTCTGGGGAGGCCATG AATGCTAGGTCAACTGGAAGTACTAGTACAGGTTGCTTGGGTGATGACCCATCGCTTGAC CAGTTCATGGAAGCATACTGTGAAATGTTAACCAAATATGAAGAAGAGCTTACCAAACCC TTCAAAGAAGCCATGTTCTTCCTCTCCAAGATTGAGTCCCAACTCAAAGCCCTAACTCTT GTTCCTCCCATTTCTGGTCAAAATGGATCATCTGAAGAAGAGTTTGATGTAAATGACAAC AACTACATAGATCCTCATGCTGAGGATGGTGAACTGAAGGGTCAGCTTTTGCGCAAGTAC AGTGGACATCTCGGCAATCTCAAGCAGGAGTTCATGAAGAAGAAAAAGAAAGGGAAATTG CCAAGGGAAGCCCGCCAGCAGTTGCTAGATTGGTGGAGCAGACATGACAAGTGGCCTTAT CCGTCCGAGTCACAAAAGCTAGCACTAGCAGAATCCACAGGGTTGGATCATAAACAAATT AACAACTGGTTTATCAATCAAAGGAAACGCCACTGGAAGCCGTCGGAAGACATGCAATTT GTCGTCATGGACGGTGTGTACCCTTACAACTATATGGACAATCTCATGGCTAATCCCTAT CCCATGGATTGCACTCCAACTCGCTTCTAA
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>LITCHI021886.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATTGATTGTAACAGTAATCAAATTCGCATGATCAACCTAGAAGTGTTCACTATATAGTCA AAAAATTAATCAAATTCAAATTACTCAAATTCATATTATAAAGCCAGAAGTGTACGTATA CATAACTATATAGTCAAAATATTAATCAAAATTCATATTTTAAGGTGAACGTATGAATAG GAATCAAATTCAATTGATTGTTCAATGAAAACCTAATTCAGTTCCTGATTACTCTTTTTA GCGTAGAACCACTTAAATTAATTTGAGAAACCAGAGATCGTAAGTATGTTGAACTCAAAA TGAACCGATCAACATCTGCCGAAAATTTTGATGTTAACAGTTGAATAATTGAATAAACTA TTTGTAGTTATAATCAGATTCACACGATAAGCCACAAATGTACAGATACGTAACTTGAAA ATTCGATCGAAACTCAGATTTTTTACAGTGAATCTTACTTTGCTGGTCGAGATGTGAAGA TCTAAGAAGCCTTCCTGGTAGACTTTCCGCTTCTGCTTGATGTGCTTCGTGTAGGTCACG CGCCACCGCCTCTTCGCATCCTCCTCCATGTCGCTGCGATTTCAAAATTTTTTCGTAGCT TCGAAATATGTACGAACAATTTCCACGGGCGGGAAACCAGATAAAAGTTTCTACGACGTC GTTTCGTCAATTTGGGGGGAGGGGGGTGTGTGGGTTGTGGCCGCGCTGGTTGGGTGTGGG GGACAGAGGAGGGACATTTTTGTAATTTAAAACCACCTGATGGGGAGGCGCTTACGTGGC GGGATCCGGTTGGAGAATATAGGATTTTGTCCACAGAAAAAAAGGAGAGATGCAAAACCC AAACCCAGCTTTGCGGTCACCATTAATTGTTTGTTTATTTATTTGTTTCTGTATTTGGGT TTCGCTGTAAACATCCTCTAGCTTGAAAAAAAGTTGTCAATTTTATCGGCTTTTTTATCC AGCGACCTCGTCTTCAGGTACACACACCTCCACAGTCAATCTTCAAAATCTTCGCTTGTG TAAATTAGGGTTTTTTTTTTCAAATTTCGTTTGCTTGATCGCTGCTTCAATTTATATTTA ATTCGTTGTTGTTCTATACTAAAAACCGAAAATTGGTAGGATCTTGAGCTTCTAGTTTCT AAAATTTTAATTTTTTTATGTGGATTTGTTCGTCTGGTTGTGGGTGTCGAATCCTTTGAT TTTGTCATTTTTAGATATAAATTAGTTAATTTTTGTTATTGGTTATGATTCTTTGATGGG TTTGTTGGTGATTCACATGTGGAAAATTGGATGATTCTTTTTGTCTCTTTTTGTTTTACT GTGATGGTCATTTGTTTCTGTTTTAGGAATAGTTGTGATTACCGGGTTCAATGAGGTTCA AGCTAGAGCCTTTCGAGTTAGTTGTATTGTTGTGATTCTGTGGTTTAAGTAGAGACGCGA AGGAAACTGTGATTGAGAAGATTGAAGCGGATAGTTAGTTTTAAGCTGATGACTGATCTC TCTGACGCTTAGTTTTCACTTTAGATATGTTACATATTTCTTGTCATTTCTGAGATCGGG ATGTTGTTGATATGGATACATATTTGTTTTGTAGTTGATAAGCGAACATAATTTTTATGC CAGCAGTTTGGTAGGGGTATTTCTGGCTTATGTAGACACTTACAGTTGACGAATGATATT ATATTACCAGTCCATTTGTAAGAAATTTTGGATTTGAGCTCAAGGAAGTTTTAGTAGAAT GTGCCATACTGGCATTTAGCTCTATAGAGAAAATGTTACTCACTCAGTAGCCTGCATCTT TGCAGCCATTTCTATAATTGTTTCTTCTAGATGTCTTCATTAATGTATTGTAGATGTCTT CATAAATGTATATTATATCTTGACTTGTTTGAATTGAGGGCGCAACAACTTGTTACATTG GTTGAACAGGTGATCATTTTTCTTTTCAACCCCCGGTAACTACGTTATTGACCACGGACA GTCTATGGTGTAAAGAAAAT
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>LITCHI017234.m2 GenomeSequence - GTGATCCTGCAAACTTTTATTAGTAACTAGTAAGATGATATCTGAGTAGAATCGTAACAT GATGGTTGACAAGAGCGTCAAAATCAGAAGGTGCATCTTCATCATACAAAATGCAGGTCC CGTTGGAAATAGCTAAAAGACAAGCTGTAAAGCCCAACCCAAAAGTCCATCCACCATCAC AGCCCCACCTGGGCCGTTGGATCGAAACAAAAAGACAATCCATTCAAGGTCACCCACATG GGTCCGGGGGAGCAAAAACGGCATCAACGATGCAACATCACATTGTACTCAGACAGTTAG GGTCACAGCCACGTGACCATAGCTAGACATCACTCTCCAATTAAAAAATTGGAAGAACAG TAAAGACGCTCCTCCGGAAAGAGGTGATTTTGAAAAACGACTCGAGCGGGATTGGACCAC GTGGCGTCATATGGGAATTCGACCGTTGGTACTGCAAAACGCCTATTGAAAATGTGTCCA TAGATCCGTTTGCTCGTTTGTGTCTCTCTCTCATCGTCTCCTTCGAAAATCAATCAGACA CAAACACTCTCTCCCTCTCTGGTTCTCTCCTCCTCACTCGGGATGGCGATCGCTGCAGAA CAAGACAAGGTTTCTTTTAATTTGATGGATAAAAAATGTAGCTTGATTTTTAGTTTTTAA GGGTTTTTGAGTCTGCAATTTGAAATTTAGGTTTTTCTCTTTTAATAAAAATAATTGAAG AAAGATATTCTTTGTTTTGGGTCTTGGAAAGAATGGAGATTCTTTTAAAGGTTCAAGATT TGAAGCACTTTTTGGGTTTTCTCTGTACATTTGTGTTTAAATGTCTAGATTTTGGCATTG GATCGTCGTTGAAGATTTGAATTTTTTATTGGGGTTGATGCTGTGGGTATTGAAAAAAAT 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