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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021344 | Chr12 | 21865022;21866579 | 21870279 | - | Chromatin remodeling protein EBS |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021344.m1 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.5 | 5.60E-24 |
LITCHI021344.m1 | 140 | 188 | PF00628.32 | PHD | Domain | 38.7 | 7.50E-10 |
LITCHI021344.m10 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.6 | 4.90E-24 |
LITCHI021344.m10 | 140 | 188 | PF00628.32 | PHD | Domain | 38.8 | 6.90E-10 |
LITCHI021344.m11 | 3 | 105 | PF01426.21 | BAH | Domain | 71.8 | 4.80E-20 |
LITCHI021344.m11 | 110 | 158 | PF00628.32 | PHD | Domain | 39.2 | 5.30E-10 |
LITCHI021344.m2 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.6 | 4.90E-24 |
LITCHI021344.m2 | 140 | 188 | PF00628.32 | PHD | Domain | 38.8 | 6.90E-10 |
LITCHI021344.m3 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.6 | 4.90E-24 |
LITCHI021344.m3 | 140 | 188 | PF00628.32 | PHD | Domain | 38.8 | 6.90E-10 |
LITCHI021344.m4 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 84.6 | 4.90E-24 |
LITCHI021344.m4 | 140 | 188 | PF00628.32 | PHD | Domain | 38.8 | 6.90E-10 |
LITCHI021344.m5 | 3 | 105 | PF01426.21 | BAH | Domain | 71.8 | 4.80E-20 |
LITCHI021344.m5 | 110 | 158 | PF00628.32 | PHD | Domain | 39.2 | 5.30E-10 |
LITCHI021344.m6 | 3 | 105 | PF01426.21 | BAH | Domain | 71.8 | 4.80E-20 |
LITCHI021344.m6 | 110 | 158 | PF00628.32 | PHD | Domain | 39.2 | 5.30E-10 |
LITCHI021344.m7 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 86.5 | 1.30E-24 |
LITCHI021344.m8 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 86.5 | 1.30E-24 |
LITCHI021344.m9 | 3 | 105 | PF01426.21 | BAH | Domain | 73.2 | 1.70E-20 |
LITCHI021344.m12 | 23 | 135 | PF01426.21 | BAH | Domain | 86.5 | 1.30E-24 |
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>LITCHI021344.m1 ATGGCCAAGACCAAACCTGGCAAAAAGGACCTCGACTCTTACAGCATCAAAGGCACCAAC AAAGTTGTCAGACCTGGTGATTGTGTGTTGATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCA TACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCTGATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTG CGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTGGGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAG GAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTGCAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGT ATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAGCTTGAAAATGTTGGTGCGGAAGATTACTTT TGTAGGTTTGAATACAAGGCTGCCACTGGAGGTTTCACCCCAGACCGCGTGGCCGTGTAT TGCAAGTGTGAGATGCCATATAACCCGGATGACTTGATGGTGCAGTGCGAGGCGTGCAAG GATTGGTTTCATCCTTCTTGTATGGGTATGACCATTGAACAAGCCAAAAAATTGGATCAC TTTTTGTGCTCTGATTGTTCATCAGATGTTGATGCCAAAAGATCTTTGAATACATTTCAG GTTTCCCCATCTGTAGAGGTTAAGGTACGGGCACACAGATTGCCATTTTTATATTTGTCT TTATGTGTGGTATGTTATAGTTAA >LITCHI021344.m10 ATGGCCAAGACCAAACCTGGCAAAAAGGACCTCGACTCTTACAGCATCAAAGGCACCAAC AAAGTTGTCAGACCTGGTGATTGTGTGTTGATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCA TACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCTGATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTG CGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTGGGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAG 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TTTTTGTGCTCTGATTGTTCATCAGATGTTGATGCCAAAAGATCTTTGAATACATTTCAG GTTTCCCCATCTGTAGAGGTTAAGGTGGAGTCAAAGCGCAGAAAGAGATGA >LITCHI021344.m5 ATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCATACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCT GATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTGCGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTG GGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAGGAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTG CAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGTATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAG CTTGAAAATGTTGGTGCGGAAGATTACTTTTGTAGGTTTGAATACAAGGCTGCCACTGGA GGTTTCACCCCAGACCGCGTGGCCGTGTATTGCAAGTGTGAGATGCCATATAACCCGGAT GACTTGATGGTGCAGTGCGAGGCGTGCAAGGATTGGTTTCATCCTTCTTGTATGGGTATG ACCATTGAACAAGCCAAAAAATTGGATCACTTTTTGTGCTCTGATTGTTCATCAGATGTT GATGCCAAAAGATCTTTGAATACATTTCAGGTTTCCCCATCTGTAGAGGTTAAGGTGGAG TCAAAGCGCAGAAAGAGATGA >LITCHI021344.m6 ATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCATACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCT GATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTGCGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTG GGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAGGAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTG CAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGTATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAG 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CGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTGGGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAG GAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTGCAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGT ATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAGCTTGAAAATGTTGGTGCGGAAGATTACTTT TGTAGGTTTGAATACAAGGCTGCCACTGGAGGTTTCACCCCAGACCGCGTGGCCGTGTGA >LITCHI021344.m9 ATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCATACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCT GATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTGCGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTG GGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAGGAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTG CAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGTATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAG CTTGAAAATGTTGGTGCGGAAGATTACTTTTGTAGGTTTGAATACAAGGCTGCCACTGGA GGTTTCACCCCAGACCGCGTGGCCGTGTATTGCAAGTGTGAGATGCCATATAACCCGGAT GACTTGATGGTGCAGTGCGAGGCGTGCAAGGATTGGTAA >LITCHI021344.m12 ATGGCCAAGACCAAACCTGGCAAAAAGGACCTCGACTCTTACAGCATCAAAGGCACCAAC AAAGTTGTCAGACCTGGTGATTGTGTGTTGATGAGACCATCGGACTCTGATAAGCCACCA TACGTGGCGCGTGTGGAGAAGATCGAGGCTGATCATAGGAACAACGTGAAGGTTCGTGTG CGGTGGTATTATAGGCCTGAGGAATCCCTGGGAGGGCGGAGGCAGTTCCATGGAGCCAAG GAGCTGTTTTTGTCTGATCACTATGATGTGCAAAGTGCACACACCATTGAAGGGAAATGT ATAGTGCACAGTTTCAAGAACTATACTAAGCTTGAAAATGTTGGTGCGGAAGATTACTTT TGTAGGTTTGAATACAAGGCTGCCACTGGAGGTTTCACCCCAGACCGCGTGGCCGTGTGA
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