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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI021335Chr122180636921813715-Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI021335.m190260PF03152.17UFD1Family156.84.00E-46
LITCHI021335.m290260PF03152.17UFD1Family156.84.00E-46
LITCHI021335.m390260PF03152.17UFD1Family157.13.20E-46
LITCHI021335.m425195PF03152.17UFD1Family157.13.20E-46
LITCHI021335.m590260PF03152.17UFD1Family157.13.20E-46
LITCHI021335.m690260PF03152.17UFD1Family156.84.00E-46
LITCHI021335.m725195PF03152.17UFD1Family157.13.20E-46
LITCHI021335.m890260PF03152.17UFD1Family157.13.20E-46
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>LITCHI021335.m1
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ACATCATCCTCGTCATCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTAT
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GACATCCACCAAATTGCTGTTCATCAGAAGAGCGAACTTCCATGTTAA
>LITCHI021335.m3
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TTCAGTGAATTGTCTGGTCAAGGTGCTTTTGATAAGGGTCCTTTGCATTTTAAATTATCA
GTTGTTCATCAAGAGGGTATGTCGGATATGAAGGATGGTGAGGGAGAAAATCAGAGGACC
ACTCATTCAGGTGTTTTGGAATTCACTGCAGATGAAGGTTCTGTTGGGCTGCCTCCTCAT
GTTTGGAGTAACTTATTCCCTACTAATACACTAACGGCTCCATTAGTTGAAGTTCGTTAT
GTTCGATTGCCAAAAGGAACTTATGCAAAACTTCAGCCTGATAATAGTGGTTTTGCAGAG
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CATGATGTATTCACAGTCAATTATGGGGAACTAGCCTACAAGTTACGAGTTCTCGAGTTA
AAACCTTCTTTGAGCATATCTGTTTTAGAAACAGATATTGAGGTTGATATAGTCAGTCCT
GATGTAACATCAGAAGTGAAAGACCAGCATACATTGAAGCCACTTGTATTTGGAAAGTCA
GAATCTGGTGTGGTTGAAGAAGGAAACTATGTGTATTACAAGTTTTCCATTAATGATAGC
ATTTTGGAAAGTGTTGTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATA
GATGGAGGAGGCGACACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCAT
CACCAACATGAATGGTCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAAT
GATAACAGATTGGGGGTTGGTACGTACAGCATGGGTGTGTATGGCTTCAAAGGCACAACA
AAGTACCACGTTTTAGTTACTATTGAGGATAACAGTGGCCGCAAGGTGGGTCAACAAGCT
ACATCATCCTCGTCATCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTAT
ATACCCAGCCAGAGTATAGTCTTGCATGAAGCCTATTGTAGCAGACACAGCGTGGTATGT
CAGCATGCTGGTTGTGGAATCGTTCTTAGGATTGACGAGGCCAAGAATCATGTTCACTGT
GACAAATGTGGGCAACCTTTTCAGCGCGATGAAATGGAGAAGCACATGAAGGTGTTCCAT
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TTCTTTTTATGTAATGACTTCAATTCAACTCCTTGA
>LITCHI021335.m4
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CCTTATCAGGGTAGTGGAGATAAAATCAAATTGCCACCATCTTGTTTCAGTGAATTGTCT
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TTCCCTACTAATACACTAACGGCTCCATTAGTTGAAGTTCGTTATGTTCGATTGCCAAAA
GGAACTTATGCAAAACTTCAGCCTGATAATAGTGGTTTTGCAGAGTTACCAAATCAAAAG
GCTATACTTGAGACAAGCCTTCGCCAACATGCCACTCTTTCGAAGCATGATGTATTCACA
GTCAATTATGGGGAACTAGCCTACAAGTTACGAGTTCTCGAGTTAAAACCTTCTTTGAGC
ATATCTGTTTTAGAAACAGATATTGAGGTTGATATAGTCAGTCCTGATGTAACATCAGAA
GTGAAAGACCAGCATACATTGAAGCCACTTGTATTTGGAAAGTCAGAATCTGGTGTGGTT
GAAGAAGGAAACTATGTGTATTACAAGTTTTCCATTAATGATAGCATTTTGGAAAGTGTT
GTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATAGATGGAGGAGGCGAC
ACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCATCACCAACATGAATGG
TCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAATGATAACAGATTGGGG
GTTGGTACGTACAGCATGGGTGTGTATGGCTTCAAAGGCACAACAAAGTACCACGTTTTA
GTTACTATTGAGGATAACAGTGGCCGCAAGGTGGGTCAACAAGCTACATCATCCTCGTCA
TCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTATATACCCAGCCAGAGT
ATAGTCTTGCATGAAGCCTATTGTAGCAGACACAGCGTGGTATGTCAGCATGCTGGTTGT
GGAATCGTTCTTAGGATTGACGAGGCCAAGAATCATGTTCACTGTGACAAATGTGGGCAA
CCTTTTCAGCGCGATGAAATGGAGAAGCACATGAAGGTGTTCCATGAGCCACATAGTTGC
CCCTGCGGAGTAGTCCTTGAGAAGGCTGCAATGGTGCAACACCAAGCTTCAAATTGCCCT
CTACGCCTCGTTACATGTCGGTTCTGTGGGGACATGGTCCAAGCTGGAAGCTCTGCAAAG
GATGCTCGGGACAGATTACGAGGACTCTCTGAGCATGAGAGCATCTGTGGATCAAGGACG
GCACCCTGTGATTCTTGTGGCCGTTCAGTCATGTTGAAGGACATGGACATCCACCAAATT
GCTGTTCATCAGAAGAGCGAACTTCCATGTTAA
>LITCHI021335.m5
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GAGAGGGCACGACTCAAACTTGAGAGAGATAGGAAGTCCAAAGAGGAAGCCAAGAAACAA
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AAGGCTGAACAGCAGATGCAGGAAGATATGCTGGTTGGAGGAGGGATTGTGTTTTCTCGT
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TTCAGTGAATTGTCTGGTCAAGGTGCTTTTGATAAGGGTCCTTTGCATTTTAAATTATCA
GTTGTTCATCAAGAGGGTATGTCGGATATGAAGGATGGTGAGGGAGAAAATCAGAGGACC
ACTCATTCAGGTGTTTTGGAATTCACTGCAGATGAAGGTTCTGTTGGGCTGCCTCCTCAT
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GATGTAACATCAGAAGTGAAAGACCAGCATACATTGAAGCCACTTGTATTTGGAAAGTCA
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ATTTTGGAAAGTGTTGTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATA
GATGGAGGAGGCGACACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCAT
CACCAACATGAATGGTCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAAT
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AAGTACCACGTTTTAGTTACTATTGAGGATAACAGTGGCCGCAAGGTGGGTCAACAAGCT
ACATCATCCTCGTCATCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTAT
ATACCCAGCCAGAGTATAGTCTTGCATGAAGCCTATTGTAGCAGACACAGCGTGGTATGT
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GACAAATGTGGGCAACCTTTTCAGCGCGATGAAATGGAGAAGCACATGAAGGTGTTCCAT
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TTCTTTTTATGTAATGACTTCAATTCAACTCCTTGA
>LITCHI021335.m6
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GTTGTTCATCAAGAGGGTATGTCGGATATGAAGGATGGTGAGGGAGAAAATCAGAGGACC
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GTTTGGAGTAACTTATTCCCTACTAATACACTAACGGCTCCATTAGTTGAAGTTCGTTAT
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GATGTAACATCAGAAGTGAAAGACCAGCATACATTGAAGCCACTTGTATTTGGAAAGTCA
GAATCTGGTGTGGTTGAAGAAGGAAACTATGTGTATTACAAGTTTTCCATTAATGATAGC
ATTTTGGAAAGTGTTGTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATA
GATGGAGGAGGCGACACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCAT
CACCAACATGAATGGTCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAAT
GATAACAGATTGGGGGTTGGTACGTACAGCATGGGTGTGTATGGCTTCAAAGGCACAACA
AAGTACCACGTTTTAGTTACTATTGAGGATAACAGTGGCCGCAAGGTGGGTCAACAAGCT
ACATCATCCTCGTCATCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTAT
ATACCCAGCCAGAGTATAGTCTTGCATGAAGCCTATTGTAGCAGACACAGCGTGGTATGT
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GACAAATGTGGGCAACCTTTTCAGCGCGATGAAATGGAGAAGCACATGAAGGTGTTCCAT
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GCTTCAAATTGCCCTCTACGCCTCGTTACATGTCGGTTCTGTGGGGACATGGTCCAAGCT
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GACATCCACCAAATTGCTGTTCATCAGAAGAGCGAACTTCCATGTTAA
>LITCHI021335.m7
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CCTTATCAGGGTAGTGGAGATAAAATCAAATTGCCACCATCTTGTTTCAGTGAATTGTCT
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GCTATACTTGAGACAAGCCTTCGCCAACATGCCACTCTTTCGAAGCATGATGTATTCACA
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GAAGAAGGAAACTATGTGTATTACAAGTTTTCCATTAATGATAGCATTTTGGAAAGTGTT
GTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATAGATGGAGGAGGCGAC
ACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCATCACCAACATGAATGG
TCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAATGATAACAGATTGGGG
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TCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTATATACCCAGCCAGAGT
ATAGTCTTGCATGAAGCCTATTGTAGCAGACACAGCGTGGTATGTCAGCATGCTGGTTGT
GGAATCGTTCTTAGGATTGACGAGGCCAAGAATCATGTTCACTGTGACAAATGTGGGCAA
CCTTTTCAGCGCGATGAAATGGAGAAGCACATGAAGGTGTTCCATGAGCCACATAGTTGC
CCCTGCGGAGTAGTCCTTGAGAAGGCTGCAATGGTGCAACACCAAGCTTCAAATTGCCCT
CTACGCCTCGTTACATGTCGGTTCTGTGGGGACATGGTCCAAGCTGGAAGCTCTGCAAAG
GATGCTCGGGACAGATTACGAGGACTCTCTGAGCATGAGAGCATCTGTGGATCAAGGACG
GCACCCTGTGATTCTTGTGGCCGTTCAGTCATGTTGAAGGACATGGACATCCACCAAATT
GCTGTTCATCAGAAGAGCGAACTTCCATGTTAA
>LITCHI021335.m8
ATGGATTTCGAGTTGAGAAGAGCGAGAGAGAAGCTAGAGGGAGAACAGAAGGAGAGAAAA
GAGAGGGCACGACTCAAACTTGAGAGAGATAGGAAGTCCAAAGAGGAAGCCAAGAAACAA
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ATATTTGAGGCTCTGCCTTATCAGGGTAGTGGAGATAAAATCAAATTGCCACCATCTTGT
TTCAGTGAATTGTCTGGTCAAGGTGCTTTTGATAAGGGTCCTTTGCATTTTAAATTATCA
GTTGTTCATCAAGAGGGTATGTCGGATATGAAGGATGGTGAGGGAGAAAATCAGAGGACC
ACTCATTCAGGTGTTTTGGAATTCACTGCAGATGAAGGTTCTGTTGGGCTGCCTCCTCAT
GTTTGGAGTAACTTATTCCCTACTAATACACTAACGGCTCCATTAGTTGAAGTTCGTTAT
GTTCGATTGCCAAAAGGAACTTATGCAAAACTTCAGCCTGATAATAGTGGTTTTGCAGAG
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AAACCTTCTTTGAGCATATCTGTTTTAGAAACAGATATTGAGGTTGATATAGTCAGTCCT
GATGTAACATCAGAAGTGAAAGACCAGCATACATTGAAGCCACTTGTATTTGGAAAGTCA
GAATCTGGTGTGGTTGAAGAAGGAAACTATGTGTATTACAAGTTTTCCATTAATGATAGC
ATTTTGGAAAGTGTTGTTTCAGGAGATAAAAGAATCGAGGTGAAGATTGATAATGAGATA
GATGGAGGAGGCGACACTAATGTTTATATGTCCAGGCATCCCGTCATATTCCCAAACCAT
CACCAACATGAATGGTCTTCTCATGATTTGAGTTCAAAGGTTTTGATTCTTAGTTCTAAT
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AAGTACCACGTTTTAGTTACTATTGAGGATAACAGTGGCCGCAAGGTGGGTCAACAAGCT
ACATCATCCTCGTCATCTGTGGAGATGGATACTGTGAAGTGTAGGAACTGCAACCATTAT
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GAGCCACATAGTTGCCCCTGCGGAGTAGTCCTTGAGAAGGCTGCAATGGTAAGAGATACA
TTCTTTTTATGTAATGACTTCAATTCAACTCCTTGA
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>LITCHI005764.m1
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GGPPRKKLRLSKEQSRLLEESFRQNHTLNPKQKEALAAQLKLRPRQVEVWFQNRRARSKL
KQTEMECEYLKRWFGSLTEQNRRLQREVEELRAMKVGPPTVLSPHSCEPLPASTLTMCPR
CERVTSTASDKPGPTRLTTTSPAAAAASTAASLSPKVDSPALQSRQPSAAC.
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>LITCHI005764.m1
ATCTCACTTTTTTTATAACCTACCCTCCTCGTCTCTTCTCTTCCATTTTCTCATTTTCTT
TTCCTTTTTTCTTGTTGTCTCCCTTTGTCTCCTTTTGTTTTTTTCTCTATTTACTTTACC
TTTTTCGATCTTCTTCATTAAAGAAAATCTACCAGTCTTTTTATCTATCTCTATCTCTTG
ATCATCATCTTCTTTTTCTTCTTCACCTGCAACTTTCATGGCGATTTTACCCGGAAGCTC
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AGGTGAAGAGGAAGACTACGAGGAAGAGAGCAGCAATGGAGGCCCTCCTCGCAAGAAACT
CCGTCTGTCGAAAGAACAATCTCGTCTTCTCGAAGAAAGTTTCCGACAAAACCACACCCT
CAATCCTAAGCAAAAAGAAGCATTGGCTGCGCAATTGAAGCTGAGACCAAGGCAAGTTGA
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GGAGGAACTCCGGGCCATGAAGGTGGGTCCACCCACCGTCCTCTCTCCCCACTCCTGTGA
GCCACTTCCCGCCTCTACTCTCACCATGTGTCCGCGTTGTGAGCGCGTCACCTCCACTGC
CTCCGACAAGCCCGGTCCCACCAGGCTCACCACCACCTCCCCCGCCGCCGCAGCTGCCTC
CACTGCCGCGTCCTTGTCCCCCAAAGTCGACTCTCCTGCCCTCCAATCACGACAGCCTTC
TGCCGCTTGTTAGATAGAGTCAACAACCAACAAAAACTTAGGGAGAATTTTTCATTTTTT
ATTTTTAAGGGGAGAAAAAAAATATAGAAAGAAGTGGAGAAGGGGAAAAAAGTGTTCAGA
GAGTGTTGATAGTTGTTACATAATGTGAATGGATGTACGGAAAATTGAAGATAGATAGAT
ACTATAATATATGGTATCTAATCTCCAAATATATCTTTGTTATTTTGTTATTTGTTTTTT
TTTTTTTTAAATTTATTTAATCATGTTTCTTTTCTTGATGGTTGACCATTTTCTTCTTTT
TTTTTTTAATTATTATTATTTTTTTTTATATTCAAGTG
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>LITCHI005764.m1 -  Up_Stream_Len 2000
GTGCAGTCCTGATCATCTCCCTTTGATTTTTATGTCTTAATCAAAGTCAAACCCCTCTTT
TATTTTTCTTTCCCTTTTTAAATTACATTCTACTTATTCTTTCATATGTAAAATGTTATT
GCAATAATATTGCTGAAAACAATTAAGAATATCATTTTTTTAAAAGAAAATATTCATATA
ATTGCATTTATATCGTTAATTTTATAGTATAGTTGATATTGATTGAAATATTTAATTAAA
TTTTTAAATTTAGAACATTTATTTGTTTGCACAATCGTTCAATGATAATTATATAAATAC
ATATAAAAACAACTGTTTAATCAAATGATTTATTTTGACTTACATATTTCTCAATGCGAC
GAGCAACGCTTGTCAACTGTTTCTTTTCCTTGCAATGACTTGTGTACGTTTTATGATATT
ATTATAATAAAATAAAGAGAATTATTACCACTATTATTTTTTTTGTCTTGAAATGAAGGA
GGTATTGAAAATCAAAATTGGCTGGATTTTGCGAACAAGTATCATGATCATATTTAGTTC
CCCAAAAAAAAAAAAAAAGTATCATAAAAAAAAAAAAGTATTTCAGTTCCAAAAAAAAAA
GAAAAAAAAGTATCATAATCGCATTTATAAGTATCTCAACCAACATTTGAAAAACAAGTT
TTTTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAGACCCATGAATTTATATCAATTTATATCAACTTTCAA
CAATATTTATTACAATTAATTTTAGCTAGGTGTTGAATTATAACTAATAATCGATTGTGT
CATTGACTAAATTTGAGATTGATACCGAATTAATATCTGCGCGGGTGTCTGTCTATGTCA
AAATATGGTCCAATACCAAGGTTCTTGTGGGTACAGTTTCAAACAGAGAAGCAAAAATGG
GTAACAGACTAACAATCACAAACACAAAACAAAACACTTTCTCCATTAATGAGACTTTGT
CCAAACTCCATTTCCTCAAATTATGACTTCTACTTCTTTTGCAATTATGTCAACATACGT
TACACCTCGTCTATTCCTATCGTACCCTCTTGCATTTAATTCTTCATTATTATATTACTG
TAACTGGTGCTATCATAATTATAATTAATTAAACCCCACGATATATACTATAGCTAATCA
TCCATCTCATTATCACAACCCAATAAAGTCAATGACCCAGATTATAAGTTTGCAAATATA
GGTCCATGATGAATACTGAATTACACAGATAATCAAGACTTGACACTCAATAATTTTTTT
AAAAAATTTGTTTATAACAGTCATTTAAAAAGTCAAACAAATCCAAATTTTTTTAAATTA
AAATTATTATGTGTATATTGGCTTGCACAATAAATGTAAATAACTGACTATACAATTTGA
ATATACCTAGAAAAATAAATAGGAATACTTGCACATAGAAGACATGAAATATAATTTTTT
TTAAAAAAAGATTACATATGAAATAGTTGTAGAAATGATAAAATGTTGGGAGGGAAGGGA
GGGGCTCAAAGCCCCAGTCTAGACTCCCAATCATTTCACGAGCTGACCTTTGAACCGACA
ACCAGACTAAAACCATCTCACAAACAGAAAAAGACTGCCGGTGATCCTCCTACACCAATC
AGATTGACACGTGTCGCGTATCAGATGGTCAGACCCTCTGACTTGACGACAACAGTCAAA
AACCCTAGGCAGCTACCAATACAAATGATTTTCAATTCTTTTATTATAATTAAAATATAA
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TTAAAGAAAATCTACCAGTCTTTTTATCTATCTCTATCTCTTGATCATCATCTTCTTTTT
CTTCTTCACCTGCAACTTTC
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>LITCHI005764.m1 GenomeSequence - 
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