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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021301 | Chr12 | 21554780 | 21558267 | - | Transcription factor MYB101 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021301.m1 | 25 | 72 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 51.6 | 8.80E-14 |
LITCHI021301.m1 | 28 | 86 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 51.3 | 1.10E-13 |
LITCHI021301.m1 | 78 | 121 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 52.7 | 3.80E-14 |
LITCHI021301.m1 | 81 | 124 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 24.6 | 2.30E-05 |
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>LITCHI021301.m1 ATGGTGAGCAGCGTAGGAGCGGTTGCGGAGGGTGCAAAAGGGTTAGGCGGGCCGACGAAT CAGAACTTGAAGAAGGGGCCGTGGACGGCGGCGGAGGACGCAATCCTGATGGAGTACGTG AAGAAGCATGGAGAAGGGAACTGGAACGCGGTCCAGAAGAATTCAGGGTTGATGAGGTGT GGGAAGAGTTGCAGGCTCAGGTGGGCCAATCATTTGAGGCCTAATCTCAAGAAAGGTTCG TTTTCGCCTGAAGAGGAGAGGATCATCATCGAACTTCACGCGAAGCTCGGCAACAAATGG GCTCGCATGGCCGCTCAGTTACCTGGCAGGACTGATAATGAAATTAAGAACTATTGGAAT ACCAGGATGAAGAGACGCCAAAGAGCAGGCCTGCCCATTTACCCACAAGAAGTCCAAGAA AAAGCAGCTGCTTTTCACCTCCAACAAGTCCACCACCACCACAAGAGACCCCACAACAAC TCTTCTCCATTATCTTCCCTCCTCACCTCACAAAATCCTCCTACCTACAATCCCTCTCTC TCCTTGTTCAACACTTACAATTTCGCATCCCCTCCAAACCACCCTCTTCAAAATCAGGCC AATTCCTATTACACCAACCCGAACCACCAATTCAAGCTCTTTTGTAACAACAACAACACT GGGTTCTCTGTGCCTCTATCTTCCTCTCCTACTCCATATCAACCATCATCATCTGGCCTG TTCAATCAAAGCATCCAAACACAAGCTGTCCCATTCCCGACCTTCAAGTTTGATCATGGA AATCTTGAGCGTGACTTGAGATTTAGTTCAATGGTAGCGGGAGCTTCCATTGACCCGATT GATTTTGGCGCGGGACAGGAGGCGGAGCTCCCTTCATCCCAAACGCCGACGCAGCCAACG ACTCCATCTTCCGGGTCTAGCGGTGGTATTTGTGTGATGGTAGGCTCAGGAAATGCTACT AACAACAATAACATTGACTACAAAACTGCACCGCCCAAAATGGCGAGTACTATTAGCAAT AGTGGTTTGTTAGATGCTCTAGTGCAGGAATCCCACAATATGGCTCGCAATGATCTGAAT CACAATAGTGAGAACAATATTTCCGCGGCGGCAGCGGAGGAGGCAGCTGCTGACAAAGGG AAAGGCGTGGCTGCAGATTATGTGTCTTCAGACGAAGGTGGTGTTGAATCAATGATGAAA AAAGGTGGCGACGCTAATGCTGATAATCAGTGGGAGGATTTGAGCTCTTCTCAGTCTTCA ATTGGGATAAAACGGAGCGGAGAACCATTAGAGGAGATGAACTCCATGGACGAGGATCTG ATGAGCTTGCTCAACAATTTTCCCATGGCAATGCCACTTCCTGAGTGGTACCCAGCTGGA AGCAGCAACATCTCCAATGCCTCATCATCAAGCATCACTGCAGGCAGCAATGTGGAAAGT GCTGATCAACCAAACGTGCCACCCACCCCGCCACCACCCCCACCGCAACCCGCCGTGTCA TCCCCAGAAATTCAGTGGACCCAGTTGAGTTCGTATAGCAGTTGGAACAATATGCCAGGA ATTTGCTGA
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>LITCHI021301.m1 - Up_Stream_Len 2000 TAGGTTCAACTTAAGGTGTGCTCAAATGGTTTTATCATTATATAAGTGAGAACAAAAAAA AAAGCAAATTTATAGGATAATATCTAAAGGTCATCAACGATTTCTTACACGTCACTTTCA AATTCTTGATAGAAAAATAGTAAAAGATGAAAAAAAGACAAAATGGAAGAATGATCGGAA ATCCGTTTAAAAAAATAATTATTTTTTTTAAATAAATAAATAAATCTATATATATATATA TATAAAATTGGTGGCGGAATAAACGTTTACACAAAATGTGTATAAGAGTACAACTTTATG ACATATTTATTGTATGTTACAATAATTATTACTTCTCTGAGAGATATGTGAAAGCATCAA AATGATTTCAATAAAATTAAAATATTTAAATTACACTTAATTGCATATTTCATGATTTAA TCAAATACGATAGTGTAATGTGTAAGTTTAGTTTAGTTGAGCTAATCATATGTTCTCTTT GAAAGTGAAATTTTTTTATTTAATATAGGTAGTTTAGGAAGAGCGCAACATACCATCTTT TAATAAGAATGATTGAACACTTTCTTTGATTTTAAAATATCAAAGACTTAAGTCTCACAT TTATCATATAAAATACAAAGTATTGATAGTTTTATCTGAATCCTCATCATAAATAATAAA TAAAAGATTTAGAAAAAAGCTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAA AAGTTTAGGAAGGGAACTTTTCCTTGAAAAAAAGTATAGGAAGGAAGCTTAATTTGCCTT GAAATAGTTCAATGGTAAGAAAATACTCAACAAAATAAATAGGATAAGCTTTATTTAAAT GTCTAAAACAACTATTTCCAAAAAAAATGTCTAAAGCAACTTTTATGAGATATCCTATCC TAGTTAATGATTAAAACTTAAAAAGTGTGACAAAAATAGTTTTCAGGCTTACCATGTGAA TTTTTTCCTTGTTATTTAAGAAATTGTATTGGCAATCTACAGGAAATTTAAAGTTATATT ATTAACCGAAATATAGAAAAATATTTCATCAATTTTTTAGGCTTTTAAAAAGATAAACAC ATAATTTATAAATTTTTTCTTCTTTTGACATTACAACTCACGTGTAGTGGTGGCATGTAC GTAAAGAACTTATACTTGGTAGGAAGAACATGAATCTACCTATTATAATCTTGACACGCG TAAATCTTATCGTATAATGAAATTGTAACCGAAGATACATGTATATTTTTTTATTATGCT CTTAATACGGTAAATATTATGAAATGATAAAGATTGCAGTGAAAGACATATGTACAAACG ATCGGACCCAAATTCTTCATAGTGTGTAGGTATCAAGGGTGGACATAGAAAACGCGTAGA AGGAAGCCTCCATAGACGTACCACTTAGCATGCAAAACGGAGCGAAATGGAAGCTAACAC CTCTAGTTTATAAATTCACCACCCAAGCCACCCTCTCTTGGGCTGTCACAAACAACGACA CACACTACTCCTCTCTCTCACAATCCAAGCTTTGGTCCCACACTTTCTCTCTCTAACGCA ATCCAACCCCAACCCCATCTCTCTCTACATCTTCACCTCTTTCTCTCACTAAATCTCTAA AATTTTTTCATTTCTTTGTCCAAAACAGCCCAGAAAATCAAGCGCATACACAAGACAGAA GGAAAGAAGAACTTGTCTCTCTCTTTTCTCTCTCTCTCCCCCCTCCCTTTCGCTTCAATT CTCTTCACCTTGGGAGAGGAGAGAACTCTCAAAAGTAAAAAATAAATACAAAAACACCAA TCCACCCTAAGTCACAACCCAGTAACATACAAAAACACCCATCAAAGAAAAAGTGCATCA AAACCATCCAGATATTACGTAGTACAATCTCTGTGAGTCCTTTTTTTTTCTATATAAACC AAGCAAAACTTCACACCCCAAAACCAGCATCAATTGCATCAGAGTTGGTGGTGGAGGATA TAAACGTAAATATATCAAGA
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>LITCHI014928.m1 GenomeSequence + CACATTGATTGATCAAATCGTCCACCAGCTGTGACAATTATATACAGAAGATAAACAAAG GCTGGTGGCTTTATCGTTTATTCAATTGACGTGACTCAGAAAGCCAAGGGACCGCCAAGT GGTGTTAGGACCCTACTCCCATAAATGAAAACTGAAGAAAAATAGACCCATCTTGCCTTT GTTATTTGACCAAATGGTCCAAAAATCCAAAGACAGTATCCTAATTGAATTTCCAGTCTA TATAAACAACTCTGTCCTGAACAAATTCAGCAGCAGAAGAGAAATAAGAGAAAATCCAGA AAATAAGCCAAAATGAGAAGCAAATTCCATTACCTATCTTTCTCTACTATCTTGCTCTTC TTCATTTGCTATCGATCAGTAGAGGCTCAACCAAACACCACAGGCTACCCTTGCTCATCC AACCAGACCACCTATCCATGTCAAACCTATGCTTTCTACAGAGCCATGGCTCCTGACTTC CTTGACCTTGCTTCCATAGGTGATCTTTTTTCAGTGAGCCGCCGCATGATTGCAGAACCT AGTAATATAACCTCTAATTCTTCTCTCATCCAAGACCAGCCTCTCTTTGTCCCTATAACA TGTGGTTGCAATACTTTAAATGATTCTAGCACCATTTCCTTTGCCAACCTCTCTGTCAGA ATCAAGTTAGGGGACACTTTTATCCGCTTGTCCACCAGATATTTCCAGAACCTGACCACT TATCAATCTGTTCAGGTTGTCAATCCGACTTTTGTCCCCACCAAACTAGAGATTGGTGAT ATTATATACTTTCCAATCTTTTGTAAGTGTCCAAATCAAACCCAGTTGCAGAACCAAGTG AAATATCTTGTCTCTTATGTGCTTCAGCCGTCTGATAACTTATCATCAGTTGCTTCAACG 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