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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021244 | Chr12 | 21044900 | 21051003 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 40 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
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>LITCHI021244.m1 ATGTCCCCTATGGATCTGACAAGAAGGCAGTATTACTGTTCTTTCTTATGTTGCTCATTT TTTTTTGTGTTTGATGGTGGGCGGGACTATAGAGGTGGTGACTTGAGGGTTAAGCTTGAT AGAAGGCATTATCTGCATCGAAGGTTTTCTCCTGGAAGAGATGCAAGAGGCCGAGACAGG TTTCGTGGTCATAGCCCATCAAGGTCTCTGGATCCAAGTGACAGAAAACGGAGGAAGAAA CAGCAGGTTGATGGGCAAAGTGATTTTTCTGGAAGTTTGAAAATTTTAGATGGGATTGAA GACCAAGTTAAAGAAGGAAAATTTACATCTTCTGATTCAAAAATTGCTCTTCTGGACAAG TTAAAAGAAGTGCAGTCAGATATTGACATGCTTGATCACCAGAGACATCAACTAGAGATT TGTGTGGAAGAGAAGGTTCAAGAAGCAGATATTCTCACTTCTAGGATTGAGGAACTTGAG ACTCAATTACACAAGGAGAAAGAGGAAGCTAAAAGGATAGCTTTAAAAATCCAGAAGTTT GTCAAAGCACATAATCGTTACTCACAGATACAAGACGACCTTAAGAGATCACAAGCTCAA CTTCAGAATTTAGGATATCAGCTTGGCTCAGATGTTTCTGGAGCTGCTGGCAACGAAGAG GATTCGAGCATCAATATTGTTAGTGATGGAGAGACTACCGATCACCATCTACTTGGGCCA CAGAATGAGATGCAGACTATAATTTCTCCAAAAAAGAAAAAGCTGCATGTTGGTCAGGAC AATGGTGATGTAATCATACCGGCAGCAAACTTAACAAGAGGTGGGGGACATCAGGCTGAA ACTAGACAAGTTGAGAAGTTTTCTCGGTGGAATATGCACCCTGCTCAATCAAATGTTGAC ACAGAAGTTGAGGCTGCAAACAGTAAAGACAGTAATCATGGACCTTTAGCAGATGACGGC 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>LITCHI021244.m1 MSPMDLTRRQYYCSFLCCSFFFVFDGGRDYRGGDLRVKLDRRHYLHRRFSPGRDARGRDR FRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQVKEGKFTSSDSKIALLDK LKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQLHKEKEEAKRIALKIQKF VKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSSINIVSDGETTDHHLLGP QNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQVEKFSRWNMHPAQSNVD TEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKSKGLGSGLLLPSTGMAAHAIGED IEIEIEKLENVEMDSSVAEKGAKYEAMSLPFRLPQPLPAP. >LITCHI021244.m2 MAFAYLTECRLKMTSLLHWKFLLYWKFLAFSIAGGRDYRGGDLRVKLDRRHYLHRRFSPG RDARGRDRFRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQVKEGKFTSSD SKIALLDKLKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQLHKEKEEAKR IALKIQKFVKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSSINIVSDGET TDHHLLGPQNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQVEKFSRWNM HPAQSNVDTEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKSKGLGSGLLLPSTGM AAHAIGEDIEIEIEKLENVEMDSSVAEKGAKYEAMSLPFRLPQPLPAP. >LITCHI021244.m3 MVERKLFKTKLCQLYRKGRCSRQTCSFAHGDSELRRTFGPFNGGRDYRGGDLRVKLDRRH YLHRRFSPGRDARGRDRFRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQV KEGKFTSSDSKIALLDKLKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQL HKEKEEAKRIALKIQKFVKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSS INIVSDGETTDHHLLGPQNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQ VEKFSRWNMHPAQSNVDTEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKSKGLGS GLLLPSTGMAAHAIGEDIEIEIEKLENVEMDSSVAEKGAKYEAMSLPFRLPQPLPAP. >LITCHI021244.m4 MSPMDLTRRQYYCSFLCCSFFFVFDGGRDYRGGDLRVKLDRRHYLHRRFSPGRDARGRDR FRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQVKEGKFTSSDSKIALLDK LKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQLHKEKEEAKRIALKIQKF VKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSSINIVSDGETTDHHLLGP QNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQVEKFSRWNMHPAQSNVD TEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKSKGLGSGLLLPSTGMAAHAIGED IEIEIEKLENVEMDSSVAEKGAKYEAMSLPFRLPQPLPAP. >LITCHI021244.m5 MVERKLFKTKLCQLYRKGRCSRQTCSFAHGDSELRRTFGPFNGGRDYRGGDLRVKLDRRH YLHRRFSPGRDARGRDRFRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQV KEGKFTSSDSKIALLDKLKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQL HKEKEEAKRIALKIQKFVKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSS INIVSDGETTDHHLLGPQNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQ VEKFSRWNMHPAQSNVDTEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKVNLYVP LFLSICFVGRQTIHQLVGKARHLSKVSLGIFRILIL. >LITCHI021244.m6 MSPMDLTRRQYYCSFLCCSFFFVFDGGRDYRGGDLRVKLDRRHYLHRRFSPGRDARGRDR FRGHSPSRSLDPSDRKRRKKQQVDGQSDFSGSLKILDGIEDQVKEGKFTSSDSKIALLDK LKEVQSDIDMLDHQRHQLEICVEEKVQEADILTSRIEELETQLHKEKEEAKRIALKIQKF VKAHNRYSQIQDDLKRSQAQLQNLGYQLGSDVSGAAGNEEDSSINIVSDGETTDHHLLGP QNEMQTIISPKKKKLHVGQDNGDVIIPAANLTRGGGHQAETRQVEKFSRWNMHPAQSNVD TEVEAANSKDSNHGPLADDGKQKGGKNVSAGFSFADKI.
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>LITCHI004492.m1 ATGGTGTGCATACGGAAGGCAACAGTGGACGATCTGCTGGCGATGCAGGCCTGCAACCTG TTCTGTCTGCCAGAGAATTACCAGATGAAGTACTACTTCTACCACATACTCTCGTGGCCC CAGCTGCTCTACGTGGCGGAGGACTACAACGGTCGCATCGTCGGCTACGTCCTCGCCAAG ATGGAGGAGGAGAGCAACGAGTGCCACGGCCACATCACCTCCCTCGCCGTTCTCCGCACC CACCGCAAGCTCGGTCTCGCCACCAAGCTCATGAGCGCCGCCCAGAACGCCATGGAACAG GTGTTTGGGGCAGAGTATGTCTCATTGCATGTCAGGAAGAGTAACCGGGCAGCATTTAAC TTGTACGCAGAAACTCTGGGCTACAAAATCCACGACGTGGAGGCGAAGTATTATGCTGAT GGGGAGGATGCGTATGATATGCGCAAGCAGCTAAAGGGAAAGCAGAATCATCACCATGGG CACCACCACCACCACGGGCATCACCACCACCACCACCATGGGCATCACCACCACCATCAC CATCAGCATGGTGGTGGGTGTTGTTCAGGTGAGGTAAAAAGCGCAGATGCAAGGAGTGTT GAGGCAAGAGGAGAAGCGAAATCAGATTCGAAAGCCAGCACGAAATCAGATACAACGAAA GGGTGATGATGACTGGAGTAGAGAAAAATGATTATTACTTGGAGAAGTTAAGGGCTGTGG TCTGTTGTTGTGTTTGTTGGAACCTTTGAGTATTTATCATGTGGTTTATGGTTATGCTAT TTGATTTTGAGGTACTGTGATGGATATAGCAATTATAATGGTACCTTCCATTCCCTTTAT CAATTATATCTTGATTTTACAGTTCTTGTCTTCTTCACTTTTATGTTTATTTTGTATATT TGTTCACAACATTTTGATTAAGAGAGTTTGGGTAAATTTTTGAAAACGAATGGCATAACA ACATATTGATTTTTAGAAGGATTTTAAAAAAAAAAAATTATATCCCTTGTTTAATAAAAC TTCACAACAGTTCTACATCAGTACAGTTATTTGATACTGTCAACTTGATTGTACATATAT TGTTTGATACTTTTGGTATAGTCATTAAAATAACATGCATCAAGCAAGATTTCTATTTCA TTCCATATTATTTCTATGAGATATTGTGGGGCCCTTGCACGACTTCTAAGTTAAAGGCCA TAATGGAGGGGGTTGGAAGAGATTGCTAAGCAAACAGTGGAGCTTGGTTTAAGAGAAG
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>LITCHI004492.m1 + Up_Stream_Len 2000 GGCTGTGATTGGATGTGAGGATGGGACTGCCCGTGTGTTTGACATGTACAGTAGAAAATG TTCTCGAATTATCAGGTGTGTACTGTGAATTTGTTAAATTCTGTAAGTTTCATTCTTTGC GTGTCAGTTTTATATTAAAATATAATTGGTAAGTTTTAGACTCTCTATCAATAGTTACAC ATGTTGTGTAGTTGAATTGGTAATTTTTTTGTAATTTGTTATTACTATGCTTCATTTCTT ATGGTATTACATTAATCTCCTAATTGCAGGATGCATGCTGCATCTATAACATGCTTGTCT TTGAGTGAAGATCAATTAATTATAAGTGGATCCTCTCTTGGCAGTATCACGATATCCGGT CTCTTTTCTGACCAGAGGGTAACTACACTAAGATCAACTGATTCTACAGGTTTTTATCAT ATGCCTGCTGTCAAGAATAGATTTGACCTCATGAAATCATTTTCTGTTTCTCCTGAATTT TGGATTGCTTTGGTCACATTTATGCAAATAACATCATAATCTGACAGGCATAAAGACCTT GTGTTTCAACCCTTGTTCTCATCTAGTGTTTGCTGGAAGCACTGCCGGATATGTACGATG TTGGGACCTTAGGTATGCCAACGAATTATACTTGACAGGCTAATTTGTGGATGTCATAAT ACGGCTTGCTTTGTTATGAATCTTACAGGACAATGAAACGTTTATGGGAGAATCGAGTGA GTCCTAATGTTGTATATTCCTTACAACACCTACAAAACGACAGATCAACATTAGTAGTTG GCGGCATAGATGGTGTGTTACGGATTCTGGATCAGAACACCGGAGAAGTTCTCACAAGTT GTGTAACTACTATTAGCACATCATCAAATCCATCCCGAAATACTACCGCATCAATCGAAA GGTTGAAAGGAGTAAGGCTCTCAGAAGGCACCCTCATTGATAGAGTCCCCAAATCCGCTC GACCTCCTATCACATGTTTGGCGGTAGGGATGACAAAGGTTGTCACTGCACACAATAGCA AGCACATCAGATTGTGGAAATTCAACAAATGAGAGAAGAAAACTCCTTCAGTTTTGCCTG TATTGGATTTTGTATGTAACCTTCTAACGTAACATTAGCAATTTAATTTACTTTTAACTC TATGTATGCTAAAGTGGCCTTTAGAAGTAGTTTTAAAATATCTTGACAAAATTGCAGTTC GAAAAAGCACTCGGAGTACTTATCTATAATGGTTTACTTTCTATGAAGCATTTATTAAGT GATTCTTTAAAACCACGTCCTAAATATTTATCCAATCTTAATATGCACACACTTTACACA GAAGTTTATAAGACAAATGTAAAAATTAATCCAAAGTTCTCCCAAATTCGAAGTTGAGTT TGAAATTAGAATTTTATTGGTTTGGGTAAAGTTACCTACAAAGATTCTTCAATAAACCCT TGGATTTGTTATAAGATTTTTTAATAACAATCTTTTATATCAATTCAAGGGTTATTATTA AAGAATCTTTTTGAGTAATTATATGCATATCAATAAAAACCCATCTATTAAAGTCTAAAT TTTTAAAAATCAGAAAACTATAACTTCAAACTTTGTTTGAACAAAATATGGATGTAACCA TATTACAAAAGATTTGACTACTGTACCAGTTGGGTAAAATTATTTATTAATAATAATTTT TGAATATTATTTAATAATCACTCTTAAAATCAATGTAAGAATTGTTATTGATCGATAATC TTACTTAACTAGTTAAGTAGTCAAACTTTATTACAAAACCATCTTGATAATGATGATGAA AGGATTTTTATTGTAAAGTGACTAATAGGTTATTAACAAACGACCCGACCCGCCCCAAGG CCCAAGCCTAGGAAGCCCAATCGAGCATGACAATATCAGCCCACACTGTCTTTTCTCCCT TCTCTCTCACACACACACGAGGACTCGAAGCAGCGAAACCCTAACAGAGGAGGAGGTTGT CGTCTTGCATTCGAAAAACG
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>LITCHI004492.m1 GenomeSequence + ATGGTGTGCATACGGAAGGCAACAGTGGACGATCTGCTGGCGATGCAGGCCTGCAACCTG TTCTGTCTGCCAGAGAATTACCAGATGAAGTACTACTTCTACCACATACTCTCGTGGCCC CAGCTGCTCTACGTGGCGGAGGACTACAACGGTCGCATCGTCGGCTACGTCCTCGCCAAG ATGGAGGAGGAGAGCAACGAGTGCCACGGCCACATCACCTCCCTCGCCGTTCTCCGCACC CACCGCAAGCTCGGTCTCGCCACCAAGCTCATGAGCGCCGCCCAGAACGCCATGGAACAG GTCCCTTTTCTGCATCAATTTCGTTGATGATTTTGTTGTTTTGATTGATTGATTTGAATG TGTATGATTAGGGCAAAGTTGAGGTTTTTATCGAATTTAGTGAACGATTAGGGTTTTGGG TAGATATTTTGAGTAGCTTGAATTGGTGTATCTAAAAATGAGTAGTGAGTGTCGTTGAAT ACTGTTGAAGTGTATTCATTGCCTGTGAATGCGAATTCTTGATAAATTTTGGTTTTTGAT TGCTGAAAGTCGGGTTTTAAATGCTGATTAAATGTAAAAAAAGATGAGAAATTTTAAATG ATTGACTAGTGTTGAGCTAAGATATTGAAGCTTATGTGTAGACTGTAAATGCAAATTGTT GATAAATTTTAGTTTTTGAGATATGAAAGATGCTATTTGGAACATGAGTACTGTTGAGTT GAGATATTGAAGCGGAATCCTAGCCTGGAAATGAAAATTTTGGATAAATTGTGATTTTTG GGAGCTTAGAGACTAGTTTTAAATGCTGATTAGATATAGAAGAGATATTGAAGGGTAATT TAATCTTGATGTGGTATTATGAGAAAAGTAGCTTATTGGATTGCATATAGTTGCATAAAT GGACAATGATGTCAATTTCATGAACTGATATATTGTTTTGAAGTCGATGTAAACAGGTGT TTGGGGCAGAGTATGTCTCATTGCATGTCAGGAAGAGTAACCGGGCAGCATTTAACTTGT ACGCAGAAACTCTGGGCTACAAAATCCACGACGTGGAGGCGAAGTATTATGCTGATGGGG AGGATGCGTATGATATGCGCAAGCAGCTAAAGGGAAAGCAGAATCATCACCATGGGCACC ACCACCACCACGGGCATCACCACCACCACCACCATGGGCATCACCACCACCATCACCATC AGCATGGTGGTGGGTGTTGTTCAGGTGAGGTAAAAAGCGCAGATGCAAGGAGTGTTGAGG CAAGAGGAGAAGCGAAATCAGATTCGAAAGCCAGCACGAAATCAGATACAACGAAAGGGT GATGATGACTGGAGTAGAGAAAAATGATTATTACTTGGAGAAGTTAAGGGCTGTGGTCTG TTGTTGTGTTTGTTGGAACCTTTGAGTATTTATCATGTGGTTTATGGTTATGCTATTTGA TTTTGAGGTACTGTGATGGATATAGCAATTATAATGGTACCTTCCATTCCCTTTATCAAT TATATCTTGATTTTACAGTTCTTGTCTTCTTCACTTTTATGTTTATTTTGTATATTTGTT CACAACATTTTGATTAAGAGAGTTTGGGTAAATTTTTGAAAACGAATGGCATAACAACAT ATTGATTTTTAGAAGGATTTTAAAAAAAAAAAATTATATCCCTTGTTTAATAAAACTTCA CAACAGTTCTACATCAGTACAGTTATTTGATACTGTCAACTTGATTGTACATATATTGTT TGATACTTTTGGTATAGTCATTAAAATAACATGCATCAAGCAAGATTTCTATTTCATTCC ATATTATTTCTATGAGATATTGTGGGGCCCTTGCACGACTTCTAAGTTAAAGGCCATAAT GGAGGGGGTTGGAAGAGATTGCTAAGCAAACAGTGGAGCTTGGTTTAAGAGAAG