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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021217 | Chr12 | 20821723 | 20824565 | - | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021217.m1 | 369 | 411 | PF06203.17 | CCT | Motif | 60.3 | 1.50E-16 |
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>LITCHI021217.m1 ATGGAGCCTTTGTGTGAGTTTTGCGGGGTGGTGAGAGCAGTGGTTTATTGTAAATCAGAC TTGGCTAGGCTTTGTTTGCATTGTGATGGGTGTGTACACTCTGCTAATTCATTGTCACGT AGGCACCCGCGTTCACTTTTGTGTGACAAATGCAATTCTCAGGCTGCAACTGTGCGGTGT ATGGATGAGAAGATGTCTTTGTGTCAGGGTTGTGATTGGAATGGAGGTGGTTGCTCGAGT TTGGGACATAGGTGTCAGGTTTTCGATTGTTACACAGGGTGTCCTTCTTCGGCTGAGTTT ACAAGGATTTGGTCATCGGTTCTTGATGTTCCTTGTTCAAGCAATTCTGTCAATGGTTGG GGGGGTGTCACTTCTTTGGTTGAGAATGACGATTGTTTGGAGCAAAGAGACAATGAGGGT TCATGTGGGATGGTGACGGGCAAGTTGGATGATTTGGACCCTTGTTCCAAGTTTGAACCT TGGATGGCGACGAGTTCTTCAATTGTACCACCACAACCGAATCCAAATTATATGCCCCAT TGTGGTGATCAATCTGCCTTCTTCTCGGACGAGTCCAGCAAATCAAAGGGTTGTTCAAAC TTTAAGCTTCCGGATGGTGATGATCTCTGTGATGGTCTCAACATAGATGATGTTCAATTA AACTTTGAAACTGATGATGAGATTTTTAGTTGTTCACAAGGGCAATCCAGCTACCAGTTT CAAGATGTAGGCAATGATCGTCCTTCAATGGAGAAAAACTTAACGGTTGCTGAGTCTGAT GGTCCTATTCCCAATGCTTTCGAGGCATCATCATTAGGACAACTGGATTGCGTGCCTTTT CAATCGTTGTGTGTTGGTGGGACAACCGGTGTGATGCAGGGCATGAATGGTAGTGCTAAT TGCATGCTTATGAATCCTAATTGCAACCGAAACATTAATCTTGGATTCCCTACTGGCCAA GTCCATTCAAGCATGTCACTTTCACTATCCAACATCACAGGCGAAAGTAGTGCTGCTGAT TATCAAGATTGTGGATTGTCACCAGTTTTCCTGACCGGTGAATCACCATGGGAGCCAAAC CTGGAAGCTAGTTGTCCACAAGCAAGGGATAAAGCAAAGATGAGATACAACGAAAAGAAG AAAACCAGAACATTTGGTAAACAAATAAGATATGCCTCTCGGAAAGCCAGAGCTGATACT AGAAAACGCGTGAAAGGCAGATTTGTGAAAGCGGGAGAAGAGTATGATTATGACCCTCTT GTGACAAGGAACTATTGA
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>LITCHI021217.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGTTTTTTTCTTATACCATGTTTGAAATTGCCATGTTTTAAATCTTCTATACTTAAAAAA GCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTATATAATGAATGATAAACATCTTTTTAGATCCTATT TGTTATGTGGGATAAGATTGGATTATTTACATGAGATTAGATTAGATTGTATTAGATTAA TTTAATTGTTATATAATGTTTGATGACACTAGAATAAGATATAATTTTAAAAAAATTGCC AAAAATTTAAATTAAAAATTTCAGATATTTGAAAATATTTTTTTCCATTTCTTCAATTGT TTCCAGCTGCACACCACCACCCTTCTCTCTTATCACTCCCTCCTTCCCCACCCCAAACCC ATCTAAAACCCACATCGTTTCCGGTGGCGGGACGGACGGTAAAGATGACAGAAGCATCAA TGCCCTGGAACCATGGCGAAGACGACGCGGAACTCAATTACGAATAAATCCAATTGATGT CTCCTTAGTAAGTTCTCGCTTGGAGAATCGTTGGTAATGAAAGAGTAAGAAAAGAAATAG AAGAATGGAGAAGAAAGAGATGACTGGAAAAGAAAGCGACGACTAGAGAAAAATGGGAAG AACAACGATTCGATCAAAGAAGAAAGAGATAGACGGAGAAGAGATCGAAGAAGGATGACC AATATAAGCGATTAAAAAATCGAAGCGGCGTGAGAACGATCGGTATAAGAGAGTGACAAT GACTACGAAGCTAGAGGAGAGAGAGCAAATAGGAAAGGTGAGAGAAAATTAACTTAACTA CTGAATGAGCTTTAATTAACCCATTAGAATAAGTTAAAATAATTGTTGTGATAAATTGGG ATAACTTAGTGAAAGGTGCTTGGACTAACTTTTTCTACAAACACAGTCCCATCATGGGTG ACAAACAATGTCTTAATGTACAAAAATATTTCCTTGAAAAAATACCAAATTACATTATAT ATAATATACATTTTATTTGTTGCACGCAAATTTATTTCAACTCATTTAACTAAATTTTCA CATATAAATATCACAAATTCATAATCATGAATTATGTGGTTCCATTAAATACTTTTTAAC TAATACAAGTTAATAATAATTAATGATTCATAAAATTCAAAATATAATCAAATTATTATC ACATCACATGCAGTAAGACAGCTACTCCAAAATCTTAGCAGCACATGGGATTATTAGGAG AAAACTACGGAGAGATAATCCTCTATTTATTTGTAATTAATATTTAATTTGCGTCACGAT TAAGATAAGATTAAAATCCCATAAAAATAGGCGAAGTCATAAACAAATTGACTTACAATA ATCGGACCAAAGCAAAAGCCAAGTCAGCAGACGGACATGCCACGTCATCAGACTCTAAGT CTGAAACCCCGAAATCAAAAAATTCTTCACGAGCAAAGCCACGCCAGCGACCCGACCCCG AGATCTCCAGGATCCGACCACTTACAGCCTCAACTCTCAAGTAAGTTACTGATATCTCGG AGCTGATTCGTCAATCGGTTTGTGACCCGTTTGGCTACGAAGCCCACCCCGTTCTTTGCA CTTATTTACCAGGTCCTGCCACCGTCCCTATCATGAGTCCGAGTAATACGGCTGACCATA ACAATTTTTTTCAAGTTGAGACCGTCCACGCCAGCATCCACGTGGCAACCTCCAAGAGGA GTCAGGGAAAACGTGAATAAATAAACGACACTAACCGAACTGAACTGACTCGACACTGTC AGAAACCAACAACATAGCTTACTTGAATGTTTTGTCACACATTTTTTTTCTTTCTTTTAG AAACTAAAAATGAAAAAAGTAAAAAAATTCCCATTAATTCTTGATATTGGTTGATCAATT ATTCTTCTTTCCAAGATTCTTTTGGTGGGAATTCGGAGTTTTCGATTGGGTGGTGTTTTT TTTTTTATTCCTTTTTGTGATCTTTGAATGTTATAGAAAAGTTGATTTTGGTTGTTTTTT TTGTGAATTTTGAGAAAGGA
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>LITCHI021217.m1 GenomeSequence - CCAAGAGGAGTCAGGGAAAACGTGAATAAATAAACGACACTAACCGAACTGAACTGACTC GACACTGTCAGAAACCAACAACATAGCTTACTTGAATGTTTTGTCACACATTTTTTTTCT TTCTTTTAGAAACTAAAAATGAAAAAAGTAAAAAAATTCCCATTAATTCTTGATATTGGT TGATCAATTATTCTTCTTTCCAAGATTCTTTTGGTGGGAATTCGGAGTTTTCGATTGGGT GGTGTTTTTTTTTTTATTCCTTTTTGTGATCTTTGAATGTTATAGAAAAGTTGATTTTGG TTGTTTTTTTTGTGAATTTTGAGAAAGGAATGGAGCCTTTGTGTGAGTTTTGCGGGGTGG TGAGAGCAGTGGTTTATTGTAAATCAGACTTGGCTAGGCTTTGTTTGCATTGTGATGGGT GTGTACACTCTGCTAATTCATTGTCACGTAGGCACCCGCGTTCACTTTTGTGTGACAAAT GCAATTCTCAGGCTGCAACTGTGCGGTGTATGGATGAGAAGATGTCTTTGTGTCAGGGTT GTGATTGGAATGGAGGTGGTTGCTCGAGTTTGGGACATAGGTGTCAGGTTTTCGATTGTT ACACAGGGTGTCCTTCTTCGGCTGAGTTTACAAGGATTTGGTCATCGGTTCTTGATGTTC CTTGTTCAAGCAATTCTGTCAATGGTTGGGGGGGTGTCACTTCTTTGGTTGAGAATGACG ATTGTTTGGAGCAAAGAGACAATGAGGGTTCATGTGGGATGGTGACGGGCAAGTTGGATG ATTTGGACCCTTGTTCCAAGTTTGAACCTTGGATGGCGACGAGTTCTTCAATTGTACCAC CACAACCGAATCCAAATTATATGCCCCATTGTGGTGATCAATCTGCCTTCTTCTCGGACG AGTCCAGCAAATCAAAGGTTTATATCTAAGAAATTCTGTTGTTTGATTTATTGTGTGAAT TTATTAACTAGACATTATGTTCTACTTCATGTGGATGCAGGGTTGTTCAAACTTTAAGCT TCCGGATGGTGATGATCTCTGTGATGGTCTCAACATAGATGATGTTCAATTAAACTTTGA AACTGATGATGAGATTTTTAGTTGTTCACAAGGGCAATCCAGCTACCAGTTTCAAGATGT AGGCAATGATCGTCCTTCAATGGAGAAAAACTTAACGGTTGCTGAGTCTGATGGTCCTAT TCCCAATGCTTTCGAGGTCTGTCTACATTTGAGTTTCTTATAGTTTTTTCTTATGATTCA GTCAAAATCAATATATATCTATGTATTTGAAGGTACACCCATTGGCATCCAATTATGTTG TTCATTTCAAGATTTTGTCTAAATTCATTGGTCATTATCATATCATTAATTCTCAGTGGT GGTGAATGTCTGGAACATGAGACCTTTTGGTTCAGGATTTTTTGGCATTCTAGTATAGTT TCAGATATTTCATTTTCTCCTCAAAATAAATTAGGAACAACTCTTGTGCTTGTGTTGATC CATATGTCTTAGACATGCTGAAACATTTTTTTGACTGTTTTTATATACATTGTACTGTTT GATACCACGCATATTATCTACTACCGATCCTCACATATTAGAATACCACCAACTATAAAT GCATTTCATAGTACACATTGAAGAACCAGTGCTTGGTTTTGTGATATGATGGGGAATGCT TTGATGTGCTAGTCACTGTGTATGCATTTACAATGATAAATCATGGCTGCCTCTTACCTT TGTGTATTATTCAGGCATCATCATTAGGACAACTGGATTGCGTGCCTTTTCAATCGTTGT GTGTTGGTGGGACAACCGGTGTGATGCAGGGCATGAATGGTAGTGCTAATTGCATGCTTA TGAATCCTAATTGCAACCGAAACATTAATCTTGGATTCCCTACTGGCCAAGTCCATTCAA GCATGTCACTTTCACTATCCAACATCACAGGCGAAAGTAGTGCTGCTGATTATCAAGATT GTGGATTGTCACCAGTTTTCCTGACCGGTGAATCACCATGGGAGCCAAACCTGGAAGCTA GTTGTCCACAAGCAAGGGATAAAGCAAAGATGAGATACAACGAAAAGAAGAAAACCAGAA CGTATGATCTTTATTTCCGTTTATTTTATGCTGAATATGATGCTATATGTATTCGGAAAA ATTAGCTAGTAATTATAAAATTTTTTCTTACCTTTGTCTTACACCTCTTGATGTATTTTA CTCATTTGTCATGTGTAGATTTGGTAAACAAATAAGATATGCCTCTCGGAAAGCCAGAGC TGATACTAGAAAACGCGTGAAAGGCAGATTTGTGAAAGCGGGAGAAGAGTATGATTATGA CCCTCTTGTGACAAGGAACTATTGAGCTGCCAAATCTTTCTCTTAGCTTGTAAGGCGTTG CTGAATTGGCTAGGTACAAATCTTGCCACCTGCAGAATGTTATGCAGATTATGCTCCCTT TAATATTTGGAGAAGATAGAAGCAGTACTACAGCATGTATACTCAATGCAATGGTGCCTA AAGATCAAGTACTTAAGAGGAAATCAGCAAAATGTAGAGATTTGTCATCCAGATCTCGAC TGTTATTTATCATAGGAGTTGTAAGGTAATCTAAAAATTGGGCCCTATTCAGAGGGAAGA AGAAACAACAAACATATTATCATGTATTAAATAACACATGTAGAACTGTGTCAGAATTGT GATGCGATCAAGAATTTTCCAATCGGAAAATGGTAATAAAGATAGGAAAAAAATATAAGA TTGATTTTTGTCATTATCTCAATATTCTCCACATGAGATTGTTACATATTGAAGTTTGTC AGAAACTCAGAGTTGTGATGCGA