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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021217 | Chr12 | 20821723 | 20824565 | - | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021217.m1 | 369 | 411 | PF06203.17 | CCT | Motif | 60.3 | 1.50E-16 |
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>LITCHI021217.m1 ATGGAGCCTTTGTGTGAGTTTTGCGGGGTGGTGAGAGCAGTGGTTTATTGTAAATCAGAC TTGGCTAGGCTTTGTTTGCATTGTGATGGGTGTGTACACTCTGCTAATTCATTGTCACGT AGGCACCCGCGTTCACTTTTGTGTGACAAATGCAATTCTCAGGCTGCAACTGTGCGGTGT ATGGATGAGAAGATGTCTTTGTGTCAGGGTTGTGATTGGAATGGAGGTGGTTGCTCGAGT TTGGGACATAGGTGTCAGGTTTTCGATTGTTACACAGGGTGTCCTTCTTCGGCTGAGTTT ACAAGGATTTGGTCATCGGTTCTTGATGTTCCTTGTTCAAGCAATTCTGTCAATGGTTGG GGGGGTGTCACTTCTTTGGTTGAGAATGACGATTGTTTGGAGCAAAGAGACAATGAGGGT TCATGTGGGATGGTGACGGGCAAGTTGGATGATTTGGACCCTTGTTCCAAGTTTGAACCT TGGATGGCGACGAGTTCTTCAATTGTACCACCACAACCGAATCCAAATTATATGCCCCAT TGTGGTGATCAATCTGCCTTCTTCTCGGACGAGTCCAGCAAATCAAAGGGTTGTTCAAAC TTTAAGCTTCCGGATGGTGATGATCTCTGTGATGGTCTCAACATAGATGATGTTCAATTA AACTTTGAAACTGATGATGAGATTTTTAGTTGTTCACAAGGGCAATCCAGCTACCAGTTT CAAGATGTAGGCAATGATCGTCCTTCAATGGAGAAAAACTTAACGGTTGCTGAGTCTGAT GGTCCTATTCCCAATGCTTTCGAGGCATCATCATTAGGACAACTGGATTGCGTGCCTTTT CAATCGTTGTGTGTTGGTGGGACAACCGGTGTGATGCAGGGCATGAATGGTAGTGCTAAT TGCATGCTTATGAATCCTAATTGCAACCGAAACATTAATCTTGGATTCCCTACTGGCCAA GTCCATTCAAGCATGTCACTTTCACTATCCAACATCACAGGCGAAAGTAGTGCTGCTGAT TATCAAGATTGTGGATTGTCACCAGTTTTCCTGACCGGTGAATCACCATGGGAGCCAAAC CTGGAAGCTAGTTGTCCACAAGCAAGGGATAAAGCAAAGATGAGATACAACGAAAAGAAG AAAACCAGAACATTTGGTAAACAAATAAGATATGCCTCTCGGAAAGCCAGAGCTGATACT AGAAAACGCGTGAAAGGCAGATTTGTGAAAGCGGGAGAAGAGTATGATTATGACCCTCTT GTGACAAGGAACTATTGA
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>LITCHI021217.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGTTTTTTTCTTATACCATGTTTGAAATTGCCATGTTTTAAATCTTCTATACTTAAAAAA GCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTATATAATGAATGATAAACATCTTTTTAGATCCTATT TGTTATGTGGGATAAGATTGGATTATTTACATGAGATTAGATTAGATTGTATTAGATTAA TTTAATTGTTATATAATGTTTGATGACACTAGAATAAGATATAATTTTAAAAAAATTGCC AAAAATTTAAATTAAAAATTTCAGATATTTGAAAATATTTTTTTCCATTTCTTCAATTGT TTCCAGCTGCACACCACCACCCTTCTCTCTTATCACTCCCTCCTTCCCCACCCCAAACCC ATCTAAAACCCACATCGTTTCCGGTGGCGGGACGGACGGTAAAGATGACAGAAGCATCAA TGCCCTGGAACCATGGCGAAGACGACGCGGAACTCAATTACGAATAAATCCAATTGATGT CTCCTTAGTAAGTTCTCGCTTGGAGAATCGTTGGTAATGAAAGAGTAAGAAAAGAAATAG AAGAATGGAGAAGAAAGAGATGACTGGAAAAGAAAGCGACGACTAGAGAAAAATGGGAAG AACAACGATTCGATCAAAGAAGAAAGAGATAGACGGAGAAGAGATCGAAGAAGGATGACC AATATAAGCGATTAAAAAATCGAAGCGGCGTGAGAACGATCGGTATAAGAGAGTGACAAT GACTACGAAGCTAGAGGAGAGAGAGCAAATAGGAAAGGTGAGAGAAAATTAACTTAACTA CTGAATGAGCTTTAATTAACCCATTAGAATAAGTTAAAATAATTGTTGTGATAAATTGGG ATAACTTAGTGAAAGGTGCTTGGACTAACTTTTTCTACAAACACAGTCCCATCATGGGTG ACAAACAATGTCTTAATGTACAAAAATATTTCCTTGAAAAAATACCAAATTACATTATAT ATAATATACATTTTATTTGTTGCACGCAAATTTATTTCAACTCATTTAACTAAATTTTCA CATATAAATATCACAAATTCATAATCATGAATTATGTGGTTCCATTAAATACTTTTTAAC TAATACAAGTTAATAATAATTAATGATTCATAAAATTCAAAATATAATCAAATTATTATC ACATCACATGCAGTAAGACAGCTACTCCAAAATCTTAGCAGCACATGGGATTATTAGGAG AAAACTACGGAGAGATAATCCTCTATTTATTTGTAATTAATATTTAATTTGCGTCACGAT TAAGATAAGATTAAAATCCCATAAAAATAGGCGAAGTCATAAACAAATTGACTTACAATA ATCGGACCAAAGCAAAAGCCAAGTCAGCAGACGGACATGCCACGTCATCAGACTCTAAGT CTGAAACCCCGAAATCAAAAAATTCTTCACGAGCAAAGCCACGCCAGCGACCCGACCCCG AGATCTCCAGGATCCGACCACTTACAGCCTCAACTCTCAAGTAAGTTACTGATATCTCGG AGCTGATTCGTCAATCGGTTTGTGACCCGTTTGGCTACGAAGCCCACCCCGTTCTTTGCA CTTATTTACCAGGTCCTGCCACCGTCCCTATCATGAGTCCGAGTAATACGGCTGACCATA ACAATTTTTTTCAAGTTGAGACCGTCCACGCCAGCATCCACGTGGCAACCTCCAAGAGGA GTCAGGGAAAACGTGAATAAATAAACGACACTAACCGAACTGAACTGACTCGACACTGTC AGAAACCAACAACATAGCTTACTTGAATGTTTTGTCACACATTTTTTTTCTTTCTTTTAG AAACTAAAAATGAAAAAAGTAAAAAAATTCCCATTAATTCTTGATATTGGTTGATCAATT ATTCTTCTTTCCAAGATTCTTTTGGTGGGAATTCGGAGTTTTCGATTGGGTGGTGTTTTT TTTTTTATTCCTTTTTGTGATCTTTGAATGTTATAGAAAAGTTGATTTTGGTTGTTTTTT TTGTGAATTTTGAGAAAGGA
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>LITCHI010646.m1 GenomeSequence - ATTATATCATCATATAAATTATATATATTTTGGTGGATAGAATGCACACGCCAAAATTCT TACTTTTTTTTAAACATAATCTTAGGTAGAGAGTCAATTTTATTTAAACTTTTGTAAGAT AACCATACGGTCAATTTTAAACTTGTTTGAAAGTATTATTTTTCTACTGTTCAACTGCAG TCAAATTAGGTTTTAATAAAGTGTTTTGACCATTATTCTGTTTTTTATACACACTTGCAA TAAAATTCCTACCGTAACTTAACTTTCACTTTCCTAGTCCACTCCCTCGTATAACGATAT TAAACTTTTTTAACTGTTGGCAGCGGCATAAAAGGTGCTCATCTTCTCTATCACTCCCTT GTGGTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTAACTACAGTCTACTTCAACTTGCACGCCCACTCACA ATTCTCTTTTCTCTTCTCTTCCTTTTACATACACTATCTTTACTTCTGTTTTCGTACTAC CACTTCGTGCTCCCTTAACCGATAAACATAACACATCGTACCACTGTTTTCTTGTTTCAT TTTCTCGTCACCAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGATGTTTCCTTTTCGAACTCACCATGGAC TCGGCACCTTGCCGAATCAAAACGGGTTTGTCCCAGAGCCCAACTGGATGTCGTTGATGA CCGGTGAAGATTCAATAACCAGTTCAGCATCAAAGGTGGAGAAGAAATCAACGGAGCCAT GCAAGAGCCATAAGGAGGCTGAGAGGAGACGCAGGCAGCGTATCAACGCCCACCTCTCCA CTCTCCGCTCCCTCCTCCCCAATACAACCAAAGTAACGTATTCCATTTTTTTTGACGTTA AATATCTCAACTAAATGATGCCATGGTTTAATGTGAACATATTTTTTTAATGTTTGTATG 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