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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021217 | Chr12 | 20821723 | 20824565 | - | Zinc finger protein CONSTANS-LIKE 12 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021217.m1 | 369 | 411 | PF06203.17 | CCT | Motif | 60.3 | 1.50E-16 |
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>LITCHI021217.m1 ATGGAGCCTTTGTGTGAGTTTTGCGGGGTGGTGAGAGCAGTGGTTTATTGTAAATCAGAC TTGGCTAGGCTTTGTTTGCATTGTGATGGGTGTGTACACTCTGCTAATTCATTGTCACGT AGGCACCCGCGTTCACTTTTGTGTGACAAATGCAATTCTCAGGCTGCAACTGTGCGGTGT ATGGATGAGAAGATGTCTTTGTGTCAGGGTTGTGATTGGAATGGAGGTGGTTGCTCGAGT TTGGGACATAGGTGTCAGGTTTTCGATTGTTACACAGGGTGTCCTTCTTCGGCTGAGTTT ACAAGGATTTGGTCATCGGTTCTTGATGTTCCTTGTTCAAGCAATTCTGTCAATGGTTGG GGGGGTGTCACTTCTTTGGTTGAGAATGACGATTGTTTGGAGCAAAGAGACAATGAGGGT TCATGTGGGATGGTGACGGGCAAGTTGGATGATTTGGACCCTTGTTCCAAGTTTGAACCT TGGATGGCGACGAGTTCTTCAATTGTACCACCACAACCGAATCCAAATTATATGCCCCAT TGTGGTGATCAATCTGCCTTCTTCTCGGACGAGTCCAGCAAATCAAAGGGTTGTTCAAAC TTTAAGCTTCCGGATGGTGATGATCTCTGTGATGGTCTCAACATAGATGATGTTCAATTA AACTTTGAAACTGATGATGAGATTTTTAGTTGTTCACAAGGGCAATCCAGCTACCAGTTT CAAGATGTAGGCAATGATCGTCCTTCAATGGAGAAAAACTTAACGGTTGCTGAGTCTGAT GGTCCTATTCCCAATGCTTTCGAGGCATCATCATTAGGACAACTGGATTGCGTGCCTTTT CAATCGTTGTGTGTTGGTGGGACAACCGGTGTGATGCAGGGCATGAATGGTAGTGCTAAT TGCATGCTTATGAATCCTAATTGCAACCGAAACATTAATCTTGGATTCCCTACTGGCCAA GTCCATTCAAGCATGTCACTTTCACTATCCAACATCACAGGCGAAAGTAGTGCTGCTGAT TATCAAGATTGTGGATTGTCACCAGTTTTCCTGACCGGTGAATCACCATGGGAGCCAAAC CTGGAAGCTAGTTGTCCACAAGCAAGGGATAAAGCAAAGATGAGATACAACGAAAAGAAG AAAACCAGAACATTTGGTAAACAAATAAGATATGCCTCTCGGAAAGCCAGAGCTGATACT AGAAAACGCGTGAAAGGCAGATTTGTGAAAGCGGGAGAAGAGTATGATTATGACCCTCTT GTGACAAGGAACTATTGA
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>LITCHI026549.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACATAAAATCAATGTTAAATGACATGCATGCATTCAATCTTCTTTTTTATTTTCGCTTTT TGATCTCTTAGACTGGATTTTAATTGATTTGATGGTAAAGGCGTTTGATCTCTATGATAT GATATAATAAAATCACTTTTCTTTTGTATAATTCTTTGAAGATCATTTGTGATTTTCTTA TGTTTTCTTCTTTATCTTTTGGTTGAAATTTGATTTAATGATTTTTCAAAGAATAATATT TAACTTCTCAATTTTTTTTTGTCTAAATTTATATCGAAATAACATAGCATTTGAGTTATC AACAATCTATTAATTATCACATAATTTTATGATTTATAAGATGTTGATAACTTACATACT GTACATTTGAGTAAAAAATTTGGAAAGTCTGACATTATTCTTTTTAATTTAAAATAACAT TTTCAACATTCAAAATTTTCATTCCTTAACGATCTTTTAAAATAATAAATTTAATACCTA AATTTCCCATGTCTTTAATGATTTTTTTAAAATGATACTTTCAATGCTAGGATATGCGTG TTAAAAATGAAATAAGAAATTTTTTATAATTTGATTTTGAGATCACATTTAGATTTGATA ATAAAGATTTCATTTGTCTTTAAAAGTGAAAATAAATAGCTACATATATAAACACACTAC TTAAAAAATAGTTTTTGGCATAATAAAATGTTAAAAATACATTGATGTTAGATTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCATTCATTGATGTTAGTTTAAATTTTTATA TTATATGAAGTTATATTTGGGTATCATTGCATAAACATCCTTACCCATTTATTGTTGTTA TTAGACAATTTTTGAATACGGCTAAGTATGTTTTATTTATCTACTTAATTTTATTATTAT TTGTAATTCTAATTGATTTCATATGCATATTTGCGTATTTGAAAATTATTTCAAAGAAGA ACAATGGATATTATCACTCTTTTCAGTAGATTAGAAACTAGCGCTTGATTATTTATGCCT ACTTGACACGTGTTTTTATTTTATTTTATTTTTTCAAATCAACTTAATAAGTTTTTGTGT AATTTTTTTTTTTCCAGTTGAGGACACTTCAAATTTCCTTCATTAGAAGACTCGGCACCA AAGGTCAGAACAAAAGGAAAATAAATTCCAAAACATGTTAATCATAAAACAAAAGTAAAA AAGAAAAGATAGAATAAATCTAGAAATTATGATTTATTATTATTATTATTTTTAGCGAAA ATAGCTTTCCACTCTCACTTGGTTATTTACTTGGTAGAACAATAACATGTAATAATCAGA CAAGGCCTAGTTCTAGCCACCGGATGACATGAGATCATATATGAATGTTAATTTAAAACA ACTTTTACAATTTAACAAAGAATTCTCTATGTCTCAAGATTTATAGGGATTTGACTTCCT ATATGGAAAACAAATTACCAAAAAAACTTTACAATTTAATACTCAAAAATCTTGTTAAAG ATTTACTAACAAAAATTTATATAGTATATTTGTAAAGAAATATTTTTAATTTATTACATC TTTACCATGAGATTTGCAAGAAGATATATTAACCTTTTGGTTCATGAGAATTCATAAAAT GCAACCTGGAACAATGATAGCAGCTCGGCCTGCGATTGTCTTCATTGTGCTGGTGAGTAT ACTTGTTCATGAAACTCGAATATTGTTTATTATACATATATTTTCTGACACTACTGTAAT ATGCCGTAGCATACAAGAATTCTCTTGATGATATAATATACTTGCATGCACTTGAGTTTT TTTTTTATTTTTATTTTTAAATATTTTACTTAAACAATTATGTAATGACATTCTTCATCA TAGAATATAATTTTTCTGCACTCACAACTATACTTGTGTTTGTACTCTTATTTTCTTCAA AATATCTTCAATGACAGAGCCTCTTTATGTTGCTAATCCCATGCTTGTTAACACCATGGT GGTATAAGACGGCAAAACGA
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>LITCHI026549.m1 GenomeSequence + ATGGAGCAGAAGGTAGACTTGAACTCCCATAGTTTGCGCTCTATGATGATATCTGAAATT GATATCACAGCTAGGTTACTGCATCCACTGAGCTCGTCTGCAACGGTTTTAGCCAGACTT ATGAATTCATCTTTAGACAGAAACAAACTTTCCTTCTTCGACATTGAAACTTGGGTTAGT ACTTAAAAAGATTTAAGTTTGAGTTTATCTTACGTAGAAAGAAAGGTCTAAATTAATAGG TGTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCACCTAAGGTTTAAATTTGAGACCTTAA TTTTGTATGAAAATGTGGTTATCACCCAACTATACTCGTGACCATTCCATCTAATGTATT TAATAAAAATTAATTAATTAATTAATTTTCTTTCTTGTAGGTTGCAGCTTCACTGTTTCA AACACTCTCTACAATTCCTCTCATATCACAAATCTCATTTATTGGGTTGGATGGTTTGTT TTTCTCTTACTATATTAACAATAATCAAATCCTAGCAATGTACTGTAACTCTTCATTATC AAGTGTTGGTGGTAATAGAAGAAAGCAGACATGGTACACACAATCTGTGGATCGCGATAC AGGAATTCTTTATGGAGAACCCATGATATCTACTCCTTTGAATATAAACTTAACTTTGCT TGAAGAAGTTTTACATAGCACAGATGCAATTGCTTCTAAAGGGTCTGGCTGGATCCAGAC TCGTGAGTCTCTATTTCTCAACACAGCTAATATTAATGGAAGAGCAGCTGTCTCTATAGG GTGTCCAGTTGAATCAATAACTAACTTCTTCACTAGTATGAATTTGAGTCTCCATGGTGC GACTTTGTCCATGGCTACAATTGATGGGGAAGTGTTGCTTGAAGGACTTCCAAATGCTCA TATGAAGTTCGCCAATAACTTAATTTCCTTCCAATCGAAGAAGATAGTTGGTCGTAACAT GCATACAAGTGACACTACATATATTACATGCGTGTCAGCTGGTGCTGACTCATATTCTAT TCTCAACATAGAGGACATAGAATATATTGTTTATTGTTCACCACTTGAACTTGTGGGCAT GAAATCGGTAAGCTTAAAATCTATTGTTCTTATATTTACTTAAAAATTTAAGTTTTTAGT TCTAACATTGACAACATAATCTTTACTAATTTTTCTAATTGGGTTTTAGGTTTATGCATT GGCGTTGCCGCGCAAAGGAGTGACAAGCTTTGTGCATAGGACTAGCAAATTGGCACTCGG GCTCCTAATTCTATTAATGGTCATTGAAGGAATCACTGTGTTCATCTTTGTACATTTGAT GGTTAGATCGGCCAAAAGGGAGGCGCATTTGTGTGCTGCACTCATCAAACAAATGGAAAC AACGCAACAAGCGGAGAGAAAAAGCATGAACAAGAGTACCGCCTACGCTAGTGCTAGTCA CGATGTTCGTGCCTTTGTAGCAGCCATTACTGGTCTCATTGAGATTTCCTATCCTGACGC TCCTCCTGGTTCAGAATTGGAGACAAATTTGAGGCAAATGGAAGGCATTGTAAAGGACCT TATCTGTAAGTTTTAAACTATAAATTTATATGCTATAGTAAGTTCACTTACCCCTTTTTT TTTTTACCCGTACACAATACTCATTAAATAATTGTGTAGTCCAGCTTTATTGAATACTGT TCTTGATCAAAGCAAAATCGATGCGGGCAAGATGCAGCTAGAGGAAGAACCATTTGATCT AGGCCAACTATTGGAGGACGTGGTTGATTCATTTCATGCTCGTGCTGTGACTAAAGGAGT AGAAGTGATGTTGGATCTTTTTGATGGCTCAGTTAACAAGTTTTCACATGTTAAAGGAGA TGAAGGAAAACTCAAACAAGTTTTGATCAACTTACTGAGCAATGCCATTAAATTTACATC TAAAGGCCATGTAACTGTCAGAGCATGGGTTCAGAAGTCTAGTTTACAAACTTCCATTAT CGCTTCGAATCGAGATGGATTTTTACAGCATCTGTCCTGCTTGTTTTACAAAAACAAGAA AGCAGAAACTGACCTTGCAGCCGTGAATTCCCTTAAAAACAATCCTAACTGCATGGAATA TGTTTTTGAAGTGGATGATACAGGTAAAGGAATCCCCAAGGAGAAACAAGAATCGGTGTT TGAGAATTACGTGCAGGTCAAAGATGGGGAAGGAGGCACAGGCTTAGGACTTGGCATTGT TCAATCTCTGGTATACTTATATATACATATATATATTCTTTTAATTTAATATATATATAT ATTCTTTTAATTTAGCGAATTTACATTAAATAAATCAGTCTTGTGTAAAAGTAAATAACA GTTTTTAAATTAAAATGTTCCAACAGGTTCGACTCATGGGTGGTGACATCAAAATTGCGG ATAAACCAATAGGGGAGAAGGGAACATGCTTTAGGTTCAACATTTTCCTGACCGTAGAAG AAGCCCGGTGTGTTGATAACACAAAAAAAGATAATGAAATGGGACCTGATTCTGCATTAT ACAACAGAGGATTAACTGTTGTGTCTCCCAGGCCTAACCTGACCATGATCAGGACCAATA GTCCCAGGCTCACCAGTCTTCTCAGTCCCAAGGTCGAAAGCTCCCTTGTAGTCCTGATAG GCAACCAAGAGCGCCGCCGTATTTCCCAGAAGTATCTGGAGCATCTGGGGATCGGGGCGA TGATCGTTGACGGTTCTCAAAGTCTTCAGGCCACACTCAGGAAGATAAAGAACAGGCTTG GCCATTCTCCTCGTGGCTCCTTGGCGAAATTGGAAATGAGTTTTAGGAGTGACAGTGCGA GGACGAAAGATGTCCCTTTAAGTGCCATGGAAGGTACCGACCAAAGGGTCCAATCATGTC GAAGGAGAGGAGGAGGAGGCCCAAACTTTGTGCTTCTTGTCATTGATGCAACTGCTGGAC CAATTTTAGAGCTTCTAAGGGTTGTCAATGAGTTTAGAAGAGACATTCACGGCCGCTGCA AGGTGGTTTGGTTGGACAGTCCGACTTCAAGAAGAATCAACGTCAAGGACCCTGAACAGG AAGAGATGATTGATCCTAGTGACGAGATTGTAACCAAGCCATTACATGGATCTCGTTTGA CTCAAATTATAAGATATTTGCCTGAATATGGAGGCACTTACTCACCAAATGTTTCCACTA GACCAAGAAGAGAAAAAGGTCCCAGCTGCTCCCCTTGTGCTAAGCAATCTCAACGAAGAC AACTGAGTCAACAACAATCAGAGTCACAAGAAGAAGACATTTCTGGGAGTGGGAACTACT CTGGGAAGGATGTTTATTCAACTGCTCCAGTCCAGACCCATGGCAGGTCACCTAGCTGTG GATACAAAACCAGACAGACAGAAATTGAAGAAGTGTTTGATGAACCAAAGGATGAAAAGC CTTTGACTGGCAAGAGATTCCTGGTGGCCGAGGACAATCATGTGCTGCGCAAAGTGGCCA GCATCACTCTAACCAACCTTGGTGCAACTGTCCAACTTTGTGAAAATGGAGAGGAAGCTC TGCTACTGGTCCTCAATCGTCTCAAAGAATATATAAAACATGGTGGTCCTCCCATTATGC CCTATGATTACATATTAATGGACTGCGAGGTACGTAACGATTGTAATTTGTTTCCCATGT TATGGTTATTGGTTTTGTTCATTATTTTTAACTTGAATTGTGAAATTCATGTGCTTGACA GATGCCGATAATGAATGGGTTCGATGCAACGAAGCAGATCAGGGAGGAAGAGAAGTATTA TGGAGTTCAGATTCCAATTATTGCATTGACTGCTTATGACTCAGGCGAACAAGTAGAGAA TGCCATTTTGGCTGGTATGGATATGCATCTCGCAAAACCCCTGAAGAAGGAGAATCTATT GGAGGCCATCAGATACATAGACCGTAAATACAGATATGTTTGAAATTTTTGTATCTCTTA GATGTATGTAGCCTTTCAAGGTTTTGCCTGTAATATAAATTATCCCTTTAGGATTTTGGT ATTAAATGAATGCAATTGTATGCAATATTTTAAAACTGCTTGGTGTTGAAG