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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI021201 | Chr12 | 20699778 | 20701922 | - | Agamous-like MADS-box protein AGL66 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI021201.m1 | 11 | 56 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 57.7 | 6.30E-16 |
| LITCHI021201.m2 | 11 | 56 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 57.6 | 6.80E-16 |
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>LITCHI021201.m1 ATGATGGGTGGTAAGAGGTACCAGCTAAAGAAAATTGAAAAGCCAACTTCTCTGCAAGTC GCATATTCAAAGCGCAAAGAGGGGCTTGTGAGAAAAGTTAATGAAATATCTATTTTATGT GACACTGACGCTGGTCTGCTGATGTTCTCTCCTGCTGGTAGACTGACTTGTGTTACTAGC CCTGGAAGTAAGATTGAGGATATATTTCTCCGTTTTATCAACAAGCCCGATGAATTACAG GGAACAATTGAACATGAGGAGCATATATACCTCAAGCTCAAGCACTCGAAATATGAAGCA GAAATGCTGGAATTGATAAACACGTTTGTCTCGATCACCCCTCTTTCTCTCCTTCTTCCT GCATACACTCAGTATTATCATCCGGATGTGATGCGAATTACATCAGTTTATGAAGCTGAA GAACATGAAAAATACCTGACAGATGCAATTGAACGTATCGGAAGGATGAAAGCAAGGCTG CAACAAAAGGAAAATTTTTTTAGAGTTGCCAGGCCAATTCAGTCTTATGGTATTCTGGAT CGAGATACAAGTGAAGAGTCCGTGAATTCTACAAGGATGAGGGTCCCATCAATGAATGGA AATCCCCAATATGGAAGTGGAGCAGGCTTACTCACTCGACCACCCCAACTCGGTGCTGGC TACCTGACCAACCAAATTCCCCGGAATTTTCCTAGTGCCAGGTTCGCTTCAAGTTCAAAA CCAATGGGGAATTTCAATGGAGGTCAAATTTTTTCAGGGGTTTGCAAGCAACTTGTATGG TTGACAACTGCAGCTGCTTCTGTTCAGTTTATTGGGTTTACTAGTAATTTTAGTGGTTGT GTACTGTGTAGAGTCTTACTTTGA >LITCHI021201.m2 ATGATGGGTGGTAAGAGGTACCAGCTAAAGAAAATTGAAAAGCCAACTTCTCTGCAAGTC GCATATTCAAAGCGCAAAGAGGGGCTTGTGAGAAAAGTTAATGAAATATCTATTTTATGT GACACTGACGCTGGTCTGCTGATGTTCTCTCCTGCTGGTAGACTGACTTGTGTTACTAGC CCTGGAAGTAAGATTGAGGATATATTTCTCCGTTTTATCAACAAGCCCGATGAATTACAG GGAACAATTGAACATGAGGAGCATATATACCTCAAGCTCAAGCACTCGAAATATGAAGCA GAAATGCTGGAATTGATAAACACAAAGGAGACTCTTCAGAGAAAACTAGATCTGCTTAAT CGGCATCTACAGATTGCAGGGGAAAAGATGAGGTATTATCATCCGGATGTGATGCGAATT ACATCAGTTTATGAAGCTGAAGAACATGAAAAATACCTGACAGATGCAATTGAACGTATC GGAAGGATGAAAGCAAGGCTGCAACAAAAGGAAAATTTTTTTAGAGTTGCCAGGCCAATT CAGTTACAGTCTTATGGTATTCTGGATCGAGATACAAGTGAAGAGTCCGTGAATTCTACA AGGATGAGGCCAATTTATTTGTGTAGGGTCCCATCAATGAATGGAAATCCCCAATATGGA AGTGGAGCAGGCTTACTCACTCGACCACCCCAACTCGGTGCTGGCTACCTGACCAACCAA ATTCCCCGGAATTTTCCTAGTGCCAGGTTCGCTTCAAGTTCAAAACCAATGGGGAATTTC AATGGAGGTCAAATTTTTTCAGGGGTTTGCAAGCAACTTGTATGGTTGACAACTGCAGCT GCTTCTGTTCAGTTTATTGGGTTTACTAGTAATTTTAGTGGTTGTGTACTGTGTAGAGTC TTACTTTGA
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>LITCHI021201.m2 - Up_Stream_Len 2000 TCTCCCAATTCACCTGAGTGGTAGGGGCTGAATCCTACCCAACTCGTCAGCTTTTAAATA AAATGTAATAAATTTATTAAAGTTTAATTTATTAGTCTATATTTGTACATTACAAATAAA TTATGATGTTAATGGTATCTTAAGAATTGTTATCATATATGATATAATTATAACAAAATT TGAAAATTATTGTTTATTATGGTTTGATGGTTTTATCACCTAATGTCTTTGAATATCTTA TATGACACTATTTTGTCATTTTTTAAATTTAATAAGTCATATATTTAGTTTATCAAATAG AAATTATAAATATGCTTTAAGGTTTTAACATCATTAAACAGTTATGTTATTTTATCGTTT TTGAAACTAATAGTCATGTATATGTCTTTTCGAATAAAATAAATTATTTTATCGGTTTCG AAATTAATGAAGTCATGTATTCACTTTCTCAAGTAAAAATCACAAGTTTACTTCAAAGTT TATCATTACTTGTCTTTAATATCTTAAACAACTATATTATTTTATCGTTTTTGAAACTAA TAGTCATGTATTTATCTTTTCAAATAAAAATATAAGTAAACTTTAAGTTTAATATCATTT ATTTTGAAGATCCTAGATTTTCAAAATTAATAAAGTTATATTTAACTTTTCAAATAAAAA ATCGTAAATATATTATTTTATCATTTTTTTAAAAATAAATAAAAAATCATATGACTGGTT TTTTAAATAAAACTTATTTTGACAATGATAAATTTTTGACATAAAGCTATAAAAAAATAC TAAAGGAACAAAATCCATAATAATCAAAATGAGAAGTAAAATCCATAATAGAATATTAAA TGAGAATTGCTTCTTTAATTTTACTCAAGTTTTCTTTTTTAAAATTAATTAATAATAAAA AGATATGTATTTAAAAAAAAAAAATCGAAAAGGAAAATGGAGATGCGGGGTATCGATCCC CGTACCTCTCGCATGCTAAGCGAGCGCTCTACCATCTGAGCTACATCCCCTTTAATGGCC ATTAAATGAATACATTACATTAAAACTATAAAATTTGACTCTGTTTTATGTCATACACGT ACAATGCCTGAATGTAGTCATGTGACAATTAGCCCTATTATTTGCATACCTGTACAATAT TTGACTAAGTTTCTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTTAAATATATTGACTATGTTTCATGTG ATGCGATTACAATAACACACACTTTTATCATATCTAATGCTCGTGTGTACTTACATCATA TCTACAGCTCTTAGTTGGGCAGCTCTATGATATTTGACCGTGTTTTATGTGACATAAGTA CAATGCCTGAATATAGTCATGTGACAGTTAGCTCTGTCAGTTGCATAACTATATAACATT TGACTATGTTTCATGTGATACAATTACAATATGTGAATATAGTGATTTGACAAACTGACA ATTAGTTCTATCTAATAGATTCTTAATTTTATTTTTCAATCTCAAAATTAAAAGTTGGGT TAGAGACAGGACACAGTCGCTTCTCTAGGCCCACTTTTGCTGATTTCATAATCCATTTCC TTATTTTTCATTTGTTGTAATCAATATAATATCTATTACCAGATTTAATTACCTTATCTT ATTACTAACTTTATTCATCAATATTTGGAGTCATTAGGTTGTTTATAAAGATTGTTATTA AAATCAATCCAAAAACTTCAATTGTGATTAGATAATAATGGTTAAATAAGATAGTTAAAT ATTTTATTAATAAAATAAAATAATAAAAAATAAGGGCTACAACTTTATTAAAAAGTGGAT CGCCATAGAATCCTCCTATTGATTATGTCTATGCAACTTTCAACAATTGGCTTGTAACAA TTATTACTATTGCAAATATAATTAACGCATTCTCATCTTTTTCTACATAAATTTACTCCA TTTCTCAGAGTACATAGTCATGCTCTACACTCAAATCACCCAGTTTTCCGCATTTGTTCT CCAAGCTTCACTTGATAATC >LITCHI021201.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCTCCCAATTCACCTGAGTGGTAGGGGCTGAATCCTACCCAACTCGTCAGCTTTTAAATA AAATGTAATAAATTTATTAAAGTTTAATTTATTAGTCTATATTTGTACATTACAAATAAA TTATGATGTTAATGGTATCTTAAGAATTGTTATCATATATGATATAATTATAACAAAATT TGAAAATTATTGTTTATTATGGTTTGATGGTTTTATCACCTAATGTCTTTGAATATCTTA TATGACACTATTTTGTCATTTTTTAAATTTAATAAGTCATATATTTAGTTTATCAAATAG AAATTATAAATATGCTTTAAGGTTTTAACATCATTAAACAGTTATGTTATTTTATCGTTT TTGAAACTAATAGTCATGTATATGTCTTTTCGAATAAAATAAATTATTTTATCGGTTTCG AAATTAATGAAGTCATGTATTCACTTTCTCAAGTAAAAATCACAAGTTTACTTCAAAGTT TATCATTACTTGTCTTTAATATCTTAAACAACTATATTATTTTATCGTTTTTGAAACTAA TAGTCATGTATTTATCTTTTCAAATAAAAATATAAGTAAACTTTAAGTTTAATATCATTT ATTTTGAAGATCCTAGATTTTCAAAATTAATAAAGTTATATTTAACTTTTCAAATAAAAA ATCGTAAATATATTATTTTATCATTTTTTTAAAAATAAATAAAAAATCATATGACTGGTT TTTTAAATAAAACTTATTTTGACAATGATAAATTTTTGACATAAAGCTATAAAAAAATAC TAAAGGAACAAAATCCATAATAATCAAAATGAGAAGTAAAATCCATAATAGAATATTAAA TGAGAATTGCTTCTTTAATTTTACTCAAGTTTTCTTTTTTAAAATTAATTAATAATAAAA AGATATGTATTTAAAAAAAAAAAATCGAAAAGGAAAATGGAGATGCGGGGTATCGATCCC CGTACCTCTCGCATGCTAAGCGAGCGCTCTACCATCTGAGCTACATCCCCTTTAATGGCC ATTAAATGAATACATTACATTAAAACTATAAAATTTGACTCTGTTTTATGTCATACACGT ACAATGCCTGAATGTAGTCATGTGACAATTAGCCCTATTATTTGCATACCTGTACAATAT TTGACTAAGTTTCTTCTTTTCTTTTTTTTTGGTTTAAATATATTGACTATGTTTCATGTG ATGCGATTACAATAACACACACTTTTATCATATCTAATGCTCGTGTGTACTTACATCATA TCTACAGCTCTTAGTTGGGCAGCTCTATGATATTTGACCGTGTTTTATGTGACATAAGTA CAATGCCTGAATATAGTCATGTGACAGTTAGCTCTGTCAGTTGCATAACTATATAACATT TGACTATGTTTCATGTGATACAATTACAATATGTGAATATAGTGATTTGACAAACTGACA ATTAGTTCTATCTAATAGATTCTTAATTTTATTTTTCAATCTCAAAATTAAAAGTTGGGT TAGAGACAGGACACAGTCGCTTCTCTAGGCCCACTTTTGCTGATTTCATAATCCATTTCC TTATTTTTCATTTGTTGTAATCAATATAATATCTATTACCAGATTTAATTACCTTATCTT ATTACTAACTTTATTCATCAATATTTGGAGTCATTAGGTTGTTTATAAAGATTGTTATTA AAATCAATCCAAAAACTTCAATTGTGATTAGATAATAATGGTTAAATAAGATAGTTAAAT ATTTTATTAATAAAATAAAATAATAAAAAATAAGGGCTACAACTTTATTAAAAAGTGGAT CGCCATAGAATCCTCCTATTGATTATGTCTATGCAACTTTCAACAATTGGCTTGTAACAA TTATTACTATTGCAAATATAATTAACGCATTCTCATCTTTTTCTACATAAATTTACTCCA TTTCTCAGAGTACATAGTCATGCTCTACACTCAAATCACCCAGTTTTCCGCATTTGTTCT CCAAGCTTCACTTGATAATC
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>LITCHI021201.m2 GenomeSequence - CCAAGCTTCACTTGATAATCATGATGGGTGGTAAGAGGTACCAGCTAAAGAAAATTGAAA AGCCAACTTCTCTGCAAGTCGCATATTCAAAGCGCAAAGAGGGGCTTGTGAGAAAAGTTA ATGAAATATCTATTTTATGTGACACTGACGCTGGTCTGCTGATGTTCTCTCCTGCTGGTA GACTGACTTGTGTTACTAGCCCTGGAAGGTTGTTAACTAGTTTTACAATCAATAGTAATA TAAAGTTCTCTTTCTCTTCATGCATGATATATATATATATATACATATATATGTATATAA ATGGTCTTGTTCTTGTGCTCTTTGACTTGTTGATTTCCTTGTGGGGTCCTTTTTTTTAAT TTTTAATTTTTTTTGTGTGGATACAGTAAGATTGAGGATATATTTCTCCGTTTTATCAAC AAGCCCGATGAATTACAGGGAACAATTGAACATGAGGAGGTAATAGTCCTCTCTCTCTCT CTGTCATACACACACACACACACAACAAAAAATAAACATTCATCGATGTTATGTTCTATG AATGTTGGTCTGATAATCTGTCTTCTAATCAGCATATATACCTCAAGCTCAAGCACTCGA AATATGAAGCAGAAATGCTGGAATTGATAAACACGTTTGTCTCGATCACCCCTCTTTCTC TCCTTCTTCCTGCATACACTCAGTGACTCACCATCTCTTTGTTATCTTTTTTGTCTCTGA TGTAATTGGTTCTTTTCTTTTGTCTTTGGATTGAATCATATCTGATGTTGTTGACTGGAC ATGCATGCTCAGAAAGGAGGTAAAAAAACCTTTGATGACATGAATATAGGATGGATTTCC ATATCGTCCATAACATTTTAGATGATTTTTTTAATCACTTTTTGGCTTCCTAGACTCTTC AGAGAAAACTAGATCTGCTTAATCGGCATCTACAGATTGCAGGGGAAAAGATGAGGTCAT ACTATATTTTCTTCTCTAATTTTCTGTTGTTATCTCTATATCATAATCTTGAACTTTGGG TTGCATATCATGTATGGGGTCCTATTTACTGATTAGGTGTAAATATAGGGATGATTCGGA GGCATTAGATTACAATTTAGGGGCGTATAAAAATCAACGTTTAAAAATTTAAAAATAAAA ATAAAAATTGAAAGATTATAGACATCTTTCATGACTATCCAATAATCATAGTAGTTAAAT GGATCGTATATGATAAGTTAACAATATTTTTTATTGTTCATACCAAAAAAAAAACAGGTA TTATCATCCGGATGTGATGCGAATTACATCAGTTTATGAAGCTGAAGAACATGAAAAATA CCTGACAGATGCAATTGAACGTATCGGAAGGATGAAAGTATGTATACTTTTCCCGTGATC ACATTTTTATTAGATTGTTGATGATGAAAATTAGTGAAAATTGTCTTCTTTCTTACAGGC AAGGCTGCAACAAAAGGAAAATTTTTTTAGAGTTGCCAGGCCAATTCAGGTAACAAGAGA AGAAAAATAGATGCTTGAATTTGGTTTATTTGTCTGTTTTGTATTATTAATTGAATGCTG TTTTGGGTATGAAGCTGTTAATCCATTACACTTTTTTTTCCTTTTATTATTATTATTATT ATTAGTTACAGTCTTATGGTATTCTGGATCGAGATACAAGTGAAGAGTCCGTGAATTCTA CAAGGATGAGGTATTTGCTAGATTTTGGTTGCTTGTCAGTTAGTTCAATTATGTTGAAAA CCAGGTTGGTATATATTTCTCACAGATAGGCCAATTTATTTGTGTAGGGTCCCATCAATG AATGGAAATCCCCAATATGGAAGTGGAGCAGGCTTACTCACTCGACCACCCCAACTCGGT GCTGGCTACCTGACCAACCAAATTCCCCGGAATTTTCCTAGTGCCAGGTTCGCTTCAAGT TCAAAACCAATGGGGAATTTCAATGGAGGTCAAATTTTTTCAGGGGTTTGCAAGCAACTT GTATGGTTGACAACTGCAGCTGCTTCTGTTCAGTTTATTGGGTTTACTAGTAATTTTAGT GGTTGTGTACTGTGTAGAGTCTTACTTTGAACTCTAAAAATGTAGTGTGTTAGAACTTGG AAGTACATAATTAAGTCTATCTATCTATGGTGGGGACTGGGGAGC >LITCHI021201.m1 GenomeSequence - CCAAGCTTCACTTGATAATCATGATGGGTGGTAAGAGGTACCAGCTAAAGAAAATTGAAA AGCCAACTTCTCTGCAAGTCGCATATTCAAAGCGCAAAGAGGGGCTTGTGAGAAAAGTTA ATGAAATATCTATTTTATGTGACACTGACGCTGGTCTGCTGATGTTCTCTCCTGCTGGTA GACTGACTTGTGTTACTAGCCCTGGAAGGTTGTTAACTAGTTTTACAATCAATAGTAATA TAAAGTTCTCTTTCTCTTCATGCATGATATATATATATATATACATATATATGTATATAA ATGGTCTTGTTCTTGTGCTCTTTGACTTGTTGATTTCCTTGTGGGGTCCTTTTTTTTAAT TTTTAATTTTTTTTGTGTGGATACAGTAAGATTGAGGATATATTTCTCCGTTTTATCAAC AAGCCCGATGAATTACAGGGAACAATTGAACATGAGGAGGTAATAGTCCTCTCTCTCTCT CTGTCATACACACACACACACACAACAAAAAATAAACATTCATCGATGTTATGTTCTATG AATGTTGGTCTGATAATCTGTCTTCTAATCAGCATATATACCTCAAGCTCAAGCACTCGA AATATGAAGCAGAAATGCTGGAATTGATAAACACGTTTGTCTCGATCACCCCTCTTTCTC TCCTTCTTCCTGCATACACTCAGTGACTCACCATCTCTTTGTTATCTTTTTTGTCTCTGA TGTAATTGGTTCTTTTCTTTTGTCTTTGGATTGAATCATATCTGATGTTGTTGACTGGAC ATGCATGCTCAGAAAGGAGGTAAAAAAACCTTTGATGACATGAATATAGGATGGATTTCC ATATCGTCCATAACATTTTAGATGATTTTTTTAATCACTTTTTGGCTTCCTAGACTCTTC AGAGAAAACTAGATCTGCTTAATCGGCATCTACAGATTGCAGGGGAAAAGATGAGGTCAT ACTATATTTTCTTCTCTAATTTTCTGTTGTTATCTCTATATCATAATCTTGAACTTTGGG TTGCATATCATGTATGGGGTCCTATTTACTGATTAGGTGTAAATATAGGGATGATTCGGA GGCATTAGATTACAATTTAGGGGCGTATAAAAATCAACGTTTAAAAATTTAAAAATAAAA ATAAAAATTGAAAGATTATAGACATCTTTCATGACTATCCAATAATCATAGTAGTTAAAT GGATCGTATATGATAAGTTAACAATATTTTTTATTGTTCATACCAAAAAAAAAACAGGTA TTATCATCCGGATGTGATGCGAATTACATCAGTTTATGAAGCTGAAGAACATGAAAAATA CCTGACAGATGCAATTGAACGTATCGGAAGGATGAAAGTATGTATACTTTTCCCGTGATC ACATTTTTATTAGATTGTTGATGATGAAAATTAGTGAAAATTGTCTTCTTTCTTACAGGC AAGGCTGCAACAAAAGGAAAATTTTTTTAGAGTTGCCAGGCCAATTCAGGTAACAAGAGA AGAAAAATAGATGCTTGAATTTGGTTTATTTGTCTGTTTTGTATTATTAATTGAATGCTG TTTTGGGTATGAAGCTGTTAATCCATTACACTTTTTTTTCCTTTTATTATTATTATTATT ATTAGTTACAGTCTTATGGTATTCTGGATCGAGATACAAGTGAAGAGTCCGTGAATTCTA CAAGGATGAGGTATTTGCTAGATTTTGGTTGCTTGTCAGTTAGTTCAATTATGTTGAAAA CCAGGTTGGTATATATTTCTCACAGATAGGCCAATTTATTTGTGTAGGGTCCCATCAATG AATGGAAATCCCCAATATGGAAGTGGAGCAGGCTTACTCACTCGACCACCCCAACTCGGT GCTGGCTACCTGACCAACCAAATTCCCCGGAATTTTCCTAGTGCCAGGTTCGCTTCAAGT TCAAAACCAATGGGGAATTTCAATGGAGGTCAAATTTTTTCAGGGGTTTGCAAGCAACTT GTATGGTTGACAACTGCAGCTGCTTCTGTTCAGTTTATTGGGTTTACTAGTAATTTTAGT GGTTGTGTACTGTGTAGAGTCTTACTTTGAACTCTAAAAATGTAGTGTGTTAGAACTTGG AAGTACATAATTAAGTCTATCTATCTATGGTGGGGACTGGGGAGC