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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021078 | Chr12 | 19637234 | 19641024 | - | Ethylene-responsive transcription factor ERF054 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021078.m1 | 214 | 262 | PF00847.23 | AP2 | Domain | 49.4 | 4.40E-13 |
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>LITCHI021078.m1 ATGGCTGCAGCGAAGAACAACAGTAGTGGTAAATTCAAAAAGGGTGTTGATGAAGCAAGA GAAGGAGGAGATTGGGAGATTGACAAAGGCAACGACGTTGATTTCAGTAGCTTCGAGAGG AGACAGCAATGGAGGCCAGTTTTAGATGAAGCTTCCCTGTCACATAGACCTCTCAAGAAG ATCCGCAGCCCTGAAAGAGTAAACCCTGTTCAATCTTCTTCTTCTTTAACTTATCAATCA CCTTCTTTATCTGTTTCTCCTAGTTCAGCTGGTGCTCCTCCAACCTCTTCAAGACTCCTT TTTCCGTTTGCTGTCGACACATCTCAACAGCAACAAGCTGTTCAGTTTCCGCAACAGTTT GGAGCATCACCATCTCCTCTGCCCATTTATCGACCTCCGATACAGGCGGCAACACAGCAA ATGATCTCTTTTAGTCCTCAGCAGCAAAACTTCAACTATCCTCCGTTTTTCGCGGGGGAG ACTGCTATGTCACACCAGCAATATCAACAACAGCTTCTTCAATACTGGAGTGGTGCATTG AATCTAAGTCCAAGAGGTAGAATGATGATGAACCGATTGGGACCTGATGGGAGACCGTTG TTTAGGCCTCAGGTTCAGCCTTTGAACGCTACAAAGCTATACCGGGGAGTGAGACAGAGA CATTGGGGCAAATGGGTTGCTGAGATTCGTCTCCCTCGAAATAGGACTCGCCTTTGGCTG GGGACATTTGACACGGCTGAAGATGCCGCTCTAGCCTATGATCGCGAGGCCTTCAAGTTG AGAGGAGAGAATGCTAGGCTTAATTTCCCTGAATTGTTTATCAATAAGGACAAAGCAGCC TCCTCCACAGCTCCTGATTCAGATGCTTCTTCTCCACCAACACCTCATGAAAGTTCAAGT TCGAAGCCAGGTCGGTCTCAAAAAGAACTTGATTTGCAGGTTGTGACCACAGAATCCATG CCGCCGCCACCACCACCAGCGCAGCTGCCTCAAGGAGACAATCCTGACGGTGATTCAGGT TTGGGATCGAGTGAGGCGACAGCAAGTGATGAGGTGCCGATGGTTGCTGAGGGTTCGGGT TCAGGGGAAGGCGTTTCGGGTTCACAGGAATTGGTGTGGGGAGATATGGCAGAGGCTTGG TTCAATGCTATTCCCGCAGGTTGGGGTCCTGGGAGTCCTGTGTGGGATGATTTGGACGCC AGTAACAATCTTCTGATGCCTTCAAACCTCCCTTTTGCCAATCCAAATCAGCAAGGTTTC AATGAATCGGATCGTCACAAGCAGCAGGACAATTCGGCTTCCGCTTCTTCTTCATCTTCC TGTCCTATGAAGCCATTTTTCTGA
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>LITCHI021078.m1 - Up_Stream_Len 2000 GATGTTGTTTTTGATACATTAATCAAAGTCTCATTGTTTGGGTTGTTTAATTTGGAAGAC TTTTTATTGATTAGTTCATCTATTTTGAAATTTTTTTTACAAATACTTGTTAACTAAATA CAAGACCAAGACCAAATCAACAATCTAGATATATACTATTACGTAATTAGCTTTCTCTCT TACCAATTTATATAATCAATTTCAGATAATAATTTATAATAACCTTCTCTCATTCCGTAT TACAGTGTGCCTTTATATTATTATCTTAATTCCTATACGTTAATAGTGATATGGTATTGT TGGAATGCAAATTAATTAATTAGAGAGGTTAATTAGATACAATTTGTTGTAATTTTAAAA ATCTATGTTGATATATAATTAGATACCATGAATATTCATCAATGATCAATTATTTAAAAT TATTCATATTAGAGTTGACAGGAATTAAAATTACATTGATGGTAATTATTATTTTTTTTT AAATATCAATACATATAAATCAACAATTGGTATAATTTTTTAACATTTTTAATACTCAAA TTTTCTAATATGATGGATGATAAAGAACCTTTATTCAATCTAATAAATGATTTGAATGAT TTCTAACAAACGATATAAAAAAAATTAAGATGATTACATTTTTTTAGAGAAAGAAATAAA ACTTAATAATATAAACATATTTTAATATAATAATATCTTGTTGATGTGCACACATCAATC TATAGAATAAACTAGACGTGCAAATCAATCTTTTTGTACTTATTCAACCTGGAACCCTCT CAATCATATTAGAACTATGCAAACACAAATGTGTAAAATAAAATAAAATCTAACCTAAAA ATTTCGACTTACTCACCTTATCACAATCACGTAATATCTAAGCAAATAAAGTTGTCATGT ACAATGATCTAATGAATATCTCAACATTCTCAAATTATCATTTTCCCTTTTTTAGTGTTC TAATTGTTATAATTTTAGCTTTTAAACAAGTGTATATTTTATCTAAAATGGGCTGCACTG CAACTGCAAGACTATGGAGTTGATATCAATCAAAAAGAATCTCTTCCCATCACCACGAGC CCACTCTACACGCCACATTATGCTGTACGGACACAGAGTCTGAGGCTTAGGGACAGAACA GTTTTAATTGAAAAAAAAAAGGCCACAACTTCCCGTACTTTCCTGTAAGCGCTCACTGAT TCGCCAACCTGAAAGTCAATCAAGTTTATAAACCGTGAACAGAACAGAAGACATAGCTGA TATTGAATTTGTATGTGCAACTGTACAATATAACAATGTCAATACATATAATAATATACA AGGGTAGTGGAGAGAGAGATTGGAGTATAAGCAACGCCGTGTGGGACCGAAGCAAAAGCC AACCAACCAGGACGTTTCTACAAATTCTCACCCTTGGAGATCTTTTTCCGCTCTCTCTTT CACTCATATAAACCCCCTTAAGGCCCCTGCTCTTCTTCCACCTCTCTATCTCTCACAAAA CACAACGCTCCAACCCTGCGTTTTTCAACTCCTCCAATTTTCTCTCTCTCTCTCTCTATA TATATTTTTTTTACAATTCGAAACGCGCCCTTTTGGAATCCCTTCGCGAATCTCTGCCGC TCGCTCTCTCTCTTTCTGATGTGTCGGTGCTTCAAGTTTGAGATGGGTTGCTAAGGATTT CATTTCACTATTTTCGTATCCGATTCTGTTTTTGGTTCTATCGGATTAACTATTTAATTG ACAAACCAGATTCTATAATTCTGTCTTTTGACCGATTTTGGATCTGGGTGTTGGGATATT TTTCTTTTTTGTCAATTCACTTTTGTTTCTGCAAATTGGGTTTTTGATATACATTTGATT CGAATCTTTTCTACTGTGAATTGATTTGCTTTGGTGTCCCATCTCAAATTCGTATCAATC TTGGTTGTAAATAGAATCTCACGAGGTGTGTGTTATTCAAAAAGAGAGCGAGCGAGCAGG TATAGCATACAGAGAGACAA
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>LITCHI021078.m1 GenomeSequence - CTGGAACCCTCTCAATCATATTAGAACTATGCAAACACAAATGTGTAAAATAAAATAAAA TCTAACCTAAAAATTTCGACTTACTCACCTTATCACAATCACGTAATATCTAAGCAAATA AAGTTGTCATGTACAATGATCTAATGAATATCTCAACATTCTCAAATTATCATTTTCCCT TTTTTAGTGTTCTAATTGTTATAATTTTAGCTTTTAAACAAGTGTATATTTTATCTAAAA TGGGCTGCACTGCAACTGCAAGACTATGGAGTTGATATCAATCAAAAAGAATCTCTTCCC ATCACCACGAGCCCACTCTACACGCCACATTATGCTGTACGGACACAGAGTCTGAGGCTT AGGGACAGAACAGTTTTAATTGAAAAAAAAAAGGCCACAACTTCCCGTACTTTCCTGTAA GCGCTCACTGATTCGCCAACCTGAAAGTCAATCAAGTTTATAAACCGTGAACAGAACAGA AGACATAGCTGATATTGAATTTGTATGTGCAACTGTACAATATAACAATGTCAATACATA TAATAATATACAAGGGTAGTGGAGAGAGAGATTGGAGTATAAGCAACGCCGTGTGGGACC GAAGCAAAAGCCAACCAACCAGGACGTTTCTACAAATTCTCACCCTTGGAGATCTTTTTC CGCTCTCTCTTTCACTCATATAAACCCCCTTAAGGCCCCTGCTCTTCTTCCACCTCTCTA TCTCTCACAAAACACAACGCTCCAACCCTGCGTTTTTCAACTCCTCCAATTTTCTCTCTC TCTCTCTCTATATATATTTTTTTTACAATTCGAAACGCGCCCTTTTGGAATCCCTTCGCG AATCTCTGCCGCTCGCTCTCTCTCTTTCTGATGTGTCGGTGCTTCAAGTTTGAGATGGGT TGCTAAGGATTTCATTTCACTATTTTCGTATCCGATTCTGTTTTTGGTTCTATCGGATTA ACTATTTAATTGACAAACCAGATTCTATAATTCTGTCTTTTGACCGATTTTGGATCTGGG TGTTGGGATATTTTTCTTTTTTGTCAATTCACTTTTGTTTCTGCAAATTGGGTTTTTGAT ATACATTTGATTCGAATCTTTTCTACTGTGAATTGATTTGCTTTGGTGTCCCATCTCAAA TTCGTATCAATCTTGGTTGTAAATAGAATCTCACGAGGTGTGTGTTATTCAAAAAGAGAG CGAGCGAGCAGGTATAGCATACAGAGAGACAAATGGCTGCAGCGAAGAACAACAGTAGTG GTAAATTCAAAAAGGGTGTTGATGAAGCAAGAGAAGGAGGAGATTGGGAGATTGACAAAG GCAACGACGTTGATTTCAGTAGCTTCGAGAGGAGACAGCAATGGAGGCCAGTTTTAGATG AAGCTTCCCTGTCACATAGACCTCTCAAGAAGATCCGCAGCCCTGAAAGAGTAAACCCTG TTCAATCTTCTTCTTCTTTAACTTATCAATCACCTTCTTTATCTGTTTCTCCTAGTTCAG CTGGTGCTCCTCCAACCTCTTCAAGACTCCTTTTTCCGTTTGCTGTCGACACATCTCAAC AGCAACAAGCTGTTCAGTTTCCGCAACAGTTTGGAGCATCACCATCTCCTCTGCCCATTT ATCGACCTCCGATACAGGCGGCAACACAGCAAATGATCTCTTTTAGTCCTCAGCAGCAAA ACTTCAACTATCCTCCGTTTTTCGCGGGGGAGACTGCTATGTCACACCAGCAATATCAAC AACAGCTTCTTCAATACTGGAGTGGTGCATTGAATCTAAGTCCAAGAGGTAGAATGATGA TGAACCGATTGGGACCTGATGGGAGACCGTTGTTTAGGCCTCAGGTTCAGCCTTTGAACG CTACAAAGCTATACCGGGGAGTGAGACAGAGACATTGGGGCAAATGGGTTGCTGAGATTC GTCTCCCTCGAAATAGGACTCGCCTTTGGCTGGGGACATTTGACACGGCTGAAGATGCCG CTCTAGCCTATGATCGCGAGGCCTTCAAGTTGAGAGGAGAGAATGCTAGGCTTAATTTCC CTGAATTGTTTATCAATAAGGACAAAGCAGCCTCCTCCACAGCTCCTGATTCAGATGCTT CTTCTCCACCAACACCTCATGAAAGTTCAAGTTCGAAGCCAGGTCGGTCTCAAAAAGAAC TTGATTTGCAGGTTGTGACCACAGAATCCATGCCGCCGCCACCACCACCAGCGCAGCTGC CTCAAGGAGACAATCCTGACGGTGATTCAGGTTTGGGATCGAGTGAGGCGACAGCAAGTG ATGAGGTGCCGATGGTTGCTGAGGGTTCGGGTTCAGGGGAAGGCGTTTCGGGTTCACAGG AATTGGTGTGGGGAGATATGGCAGAGGCTTGGTTCAATGCTATTCCCGCAGGTTGGGGTC CTGGGAGTCCTGTGTGGGATGATTTGGACGCCAGTAACAATCTTCTGATGCCTTCAAACC TCCCTTTTGCCAATCCAAATCAGCAAGGTTTCAATGAATCGGATCGTCACAAGCAGCAGG ACAATTCGGCTTCCGCTTCTTCTTCATCTTCCTGTCCTATGAAGCCATTTTTCTGAAGGA TCAAGATTGATTGCTCATCCACAAGATTCATCTTTGCAAATGGTCTTTAAAAGTGGTCTC TTTTTCCTTCTCTTTCTCTCTATTTCCCTCTAGCCCCACCCCCTTGATTTTTCTCACTGG TTGCAGATTTTCTCAAAAAATCATCCCTATGACTTTCAAGTTACTTCACTTTTTTCAAAG CCTCAAATCACTCTGGTTGCTGATTTTTCACAAAACAACCTGTGATTGTTTTCTTTCTAA TCAGATCATTCAGTTCCTTTCATGTCACATCTTTTTTCTCCCAAATCCTCTAGTTTTTAA AATTCGTCATTAGATTCTCCCTCCACCCCATGTGCTGCAAAAAGGCTGCATATTTGAGGC CTTTTAGTAGTGGCAATTCAGTAGATGCTTTATGATAGGTTACATGCATTTTGTTCCTAG TGGCAGTAGTATCACATCTGTCCCTAGCTAGGGTCCCCTGACATTCCCAATCATGTTTTC AGTTTTTGTGTCTTCACTGTTGATGTTATGTTATGGAGTTTGTATTAAGTTTAGGACAGG ACATCATAAGTTTCAAAACAAAAAAAGGAAAAGGAACAGGACCAGCATAGACAGAGACAG TTTTAAGATCTCCTCGGTTGGCCCATCCATCACGAGCTATATTATCATGCTCGACGATCA ATTTGATGTAGTTTTTTGTACATTGTTGAAGTTTATAATAATTATAGCATTGTAATGTTT AGTGTAATCTCGATATAGTTGTTGTAATCATGAATCAAACCATTTGCTAGCACTATAATG TTCATGATTTCGTTTTCTTGTCGAACTCTACTGCTTGTGAAGTATTTTAATATCTGTTGA ATTAATCTCCAAGCGAAACACGCCACGCCTTGTGATAATTGCCTCACATGTATTATATCA TTCTTGATTGTGATGATTTTTCCGCAAAATCAGCTAATTACTTGAATACCTTATGATTAA CAATTATTAAGCTAAAAACGGGCATATATATGATTGATACTTTTGGAAAATTTTCAACAT CTAATGAGAGGAATATGAACACCCAAAATTCCCACTGAGATCATTTGCTCATGCTCACCA GCGTTGGGAACAGACACCTATGATTTAGTGATGTTGCCATGGATCATTCAAATGTCAAAC CAGCTGTGCTCTCAATTATCTAACTAAACTTTATTTCAACTCAATCGGAAAATGCTTTTC TTCAATGCCTC