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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI021015 | Chr12 | 19146707 | 19157028 | + | Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI021015.m1 | 12 | 124 | PF08311.15 | Mad3_BUB1_I | Repeat | 85.1 | 3.90E-24 |
LITCHI021015.m1 | 229 | 445 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 47.2 | 1.90E-12 |
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>LITCHI021015.m1 ATGGCCGTCATTCCGTCCAACTCTGACATCACCACCTCTGTTTACGATCCTCTCTTGCCA TGGCTCTTGTCGATCAAGAGGGCACTGGACGAATGGTACTCGGCCAATCACTCCGGTGCG GCGGATCTCGACAAGCTTCTATCAGACTGCATTGGTACTTTCAAGCACCATTCACAGTAC AAAAACGACATCAGATTTCTCAAGATCTGGTTTCTCTATTTGGAGGGCAATAAAGATTTT GAAAAGGTTTTTAGAGATATGGAAGAGACTGAGATATGCATTGGCCATTCTTTGCTATAT CAATGGTATGCACTTTTTCTTGAAGCAAAAGGGAAGTGGCAGGATGCACATATGGTTTAT AATATTGGCATTTCAAGGAAAGCTGAACCACTTGAAACGTTGAAGCAAGCACATTCTTTG TTTCTTTATAGAATGTCTGAAAGACTTGAAGCTTCTTCACTTAAAAAGATGGATGAAGAT GAATTGATTGAGTCTGAGAAAAGTTGTGTCAACCCATGGTCCAATTCCACAATGGAAGAC CTATTGAAGAAGATAAATGCTCAACTTATAAAATACAATGGCTACCATGCAAGCAATAAA GTCTACTCGGGTAAAGTGGGGTTACCTACTGGAAAAAATATATCAAGGAATAAGATTATC GAGCTTGGTGGAAAGAAGTACCAGATCAAAGGATGCGCTGGTCAGGGTGGTTTTGCTCAA GTTTTTAAAGCATTTGTCAACAGTGATCCTGATGATGTGGTTGCATTAAAGATACAAAAG CCATCTTTCCCTTGGGAGTTCTACGTGTATCGGCAACTTGATCTGCGCATCTCAGATGAG GAAAGATCAAGATATGGTTTTGCGCACAGAATTCATCTCTATTCTGACTGTAGCATACTC GTTTGTGACTATCTACCTCAAGGAACGCTTCAGGATGCAATAAATGCATATGTGGTTATT GGCAAATCCATGGAAGAGGTGTTATGCATTTATTACACAATAGAGATGCTCTGCATTGTG GAATCTTTGCACAGTGTTGGAATCATTCATGGTGATTTCAAGCCTGATAATTTGCTCATT CGCTATGCTAGAGTTGATCTCACAATGGATGGATTTCACAACCGCAGTGGCCCTTGGCGC GACCAGGGTCTGTGCCTTGTTGATTGGGGAAGGGGAATAGACCTGCATCTTTTCCCTGAT AATATAAAATTTGAGGGAGATTGCCGGACATCTGGTTTTCGCTGTATTGAAATGCAGGAG AAGAAGCCATGGAAATTTCAGGTAGACACTTACGGACTGTGCGTTATTGTTCACATGATG CTGCACGGCACTTATATGGAGGTTGAAAAGAGAGCATCACCTGATGGTGGCTTCATTTAC CAGCCAAAGTCCTCTTATAAACGATATTGGAATGTCGAACTGTGGAAGAACCTGTTCTCA AAGCTGCTTAACATAGGCCCTGGCAGTGACAAGGAAGTGTTAAGGAACTTGAGACAGTCC TTCCAAGATTACATGTGCTCTAATCCGCAGCTTTTAAAGAAACTAAAAGAATTATTGGCA AAGCAGAAGGCTTCCTTGTGTTCTGCTTGA
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>LITCHI021015.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAACTCCGAGAGCTCATGGAATCTGCCACAAAACATTCACAATCAGAATAATTAGACAAA AACAACGTTCCAAACTTGGTACTTTATGATTCAAGATGCAATACAGAACATATTATAACA ATATCTCCTGCAACAACCATATCCAACATGTGTTTTAAAATAGTCCAGATGTGATTATCA GAAGATTGAATATAGCAATTAAACAACAATAAAATCACCCATAAAAGTCGGCCGATTCCA TCTTTTATACTAAAAATTTCAATTTGCAGAGATGATGACGCATGCACTAAAGTCCAAATC ATAACATGACTGGATTAGAAAAGATCACACTACCATCCAGCTACAAGAACTAAAAGACAA TAAGAATAACAGCATGTGACCAGATATTTACAATCATGCAATTAAAACATTAAAAAGGTC TATCAAATTCATTTATTAATTATTACAGGTTACAACTTGCAAGAGTTCTTTTGCATAAAC CAATTCTGCGAGCTGATGATTCCTTAAATAATACAACAAACATAGTCTCCTAAAATAATA TTGTTGTGTCATGTACCTTTTAAAACACAACAACAAACACACATGAGTAATTATTCGTAT GAATAATGAAATCAAGCAAACCTGCTACATTGCTGGCAAAACCTCTGGCGAATCCCAGCC ACGACGACAACCTGAGCCTTTGCATGGACCTCGCAAACCTTGTGCCTCCGGTGGTACTGC TTCGCATCACTCAGATCAACCGTACACTTCTCCACTTGACAATTCCTCAACCCACTTCCA GCAGCCTTTGCAACGCCGCCATCCAGCACTAGTTTCTTCTTGCAGCTGCCGCCACCGGTG TCATCTTCTTCTTCCTCCATGTACTGCTCCTCATCAGAATCAACACCTGTCACTTCCCTT TTCACGAGTTTTACCATCTTGTTCTTGCCTTTGCCATCCATTCGTTGCCAAAAGAAAAAT AAAATAAAACAAGTAAATACTGGAACCAAAAAGTGGAAAAGCAACAGAAAGAAAAGATAC TGGAGTTGAGGCGGGTTTGATAAGAGACAAAAAAGTTGAGAAAGTAATAGACAGGTTCAG CAAATAAGTGAGGACCACAGTCACAGCCACAGGCTCCATCCTCTTTCTTATTTTTGCGCT GTGCGTGTGTGTGTGTCTTGGCCTTTTTGTTGTCTATAGGGGAGGTGAGAAAATCTTTAT GCATCACCTACTTTTACCCTTTTTTTCTCGAAAAAATTTATTATAGAACATAAATATTAT TAAAAAATTAACAAACTATGCCGCGGTGTCCAATCTCGTGAGTGGGGGCCCCTCTTACGC CATTGCTATGCAGTTCTTGCTTGAAGGAGACGGTTCTCTCCTGTGAAAGCTCATACGATA CATTTATTTTACCCATGTGCGCGTGTCTAATATCTGCGTTGAACGAATCGGATGCTGACA CATTGGCTGCTGGTGTCTGTCGTGACTTTGATTAGTTTGATTGTAGTGTGGTGACATGCG CCACGTTATGCAACTTACTTGCATCGAATAAAATGATCTACGAGTTGGGGAGGTATTCGG TGGGTTGAGGAGAGTGGTTGTTGGGATAGCGTCAAAGTCAGATTTGACTCTTGTTGGTGT AAACTAATGGGAAAGAGACACGTGGCGATGCAGAGGCACTGGTGGTGTTGACCTGTTGCT TAGGAAAAAATCGAGTCTCGGTCTTGTTAACGCGTATGGTACGTTTCCTATTTACCGCTG TGGGGTCCGGTCGGCTTCTTTGAGATTGACCCCGGTTGACGACCCGATATAACAGGATCC GGGTCAATTGACGTGTGTGGCGCGGGCACTTATGGGAATTTTTATGGGGACCATTTGAGA ATTCAACTGGACTTGGACTTGAAAAAAGGCCCATTAACCATTGAAAAGTTCAAACATCTG AAATTTGAAAAGCAAGAATTTCCCGCTTCTTTCGTGGTCTCTCTCTCTTTCAATCCGATT TTTCTCATCAGAGAACAAGC
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>LITCHI021015.m1 GenomeSequence + GTTTTATTATTTACTAAAAAAGAAAAAGGAGAATTGTTTCAATTGTAAAAGTAAAAAAAT ATATATTTTACTGATATAAGTTTCTCCTTACTTATAATTTTATTTATGACTAATTTTATC ATATAAATATTTTTAAGAAAAACGGGTGTTTAAATCATTTTCATAGATGGTAATAATCCC ACCCAATATAAAATTCTTTCATGTCATCCATATATAAAAATGATTATGGCTTAAATAACA TTATATTAAAAATAATAATTTATGTTTTAACTTACTATTAGAAAAAAAAAAAAACTTAAC TGCTGCAATTTATGATATGCTAATCAATAAATAGATCCATACTAATAATGATTTACCTTG CATAACACATGACATAGGAATAAAATGACCACATAAAGATATGTAATACAAATTTATGTA TGAATTGGGAGATCAAACATAATTCTAAAAATTAATCGTGACACTTTTGTTGGTAAAGAA AAATTGAACTATGTTCTTTCAACTCATTACACTATAGAAAAAAAAATGTACTCTCAAACA TTTTGGACTGAAGAATCAGTAATATGAAGTTAGATGACTTAGAAACCGTTGCAGTTGCCT GTATGATAAATTTGAATTATCTCAATAAAAATGTCCGTGGAATTGGGTAAGCAAATAGTC AAATAAAAATAATAAAAACTGATTTTTCAAAATTGTAGGAAAAAGCTAATATATAATATA TTAGACCGAAATTATCAAATATTATATTTGAGGATGATATCAAATACTTATTATGCAACA GAGATATTTGGAGATAACTATTCCGATGATATAAGGATAAATCTACTCTCGTTAAAATAA TAATAATAATAATCGTTTCTGCTAAAAATCAAATCGCAGTGACTGAGAAGATACCTACCA 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