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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020987 | Chr12 | 18904013 | 18904582 | - | Homeobox-leucine zipper protein ATHB-52 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020987.m1 | 15 | 70 | PF00046.32 | Homeodomain | Domain | 57.8 | 8.00E-16 |
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>LITCHI020987.m1 ATGAATCTCCCAATTAATTCAACTCAGAACAGATACATGAAGAAAACAAACAGAAAAAGG CTCACCCAAGACCAGGTCATGCTCTTGGAGAGGAGCTTCAACGCCAACCAGAGGCTACAA ATAGACTGCAAACTTGAGTTAGCTCGCAGACTAGGCTTGCCACCAAGACAGGTTGCGGTT TGGTACCAAAATAGACGAGCCCGTCAGAAAATACAGACCACAGAAGTCGACTACAAGACC ATCCAGCTAGAGCTAGAAAGTGTGTTGGCAGAGAATAGAAGGCTTGAACAAGAAGTTGCT AAGCTCAAGTATGAGCTGAACAAGGCTCAACAGATGCTGATGGTGTCAACCCCATCTCCC AATCTTGTAACTTCAGTGTCAGCATTGGATGACTATGATCATGCCAGCTCAAGCTCGCCT GACAACATGATTTGCCGCTGGGAAGATGCAGGTTGTCTGTTGCCAATTGAGGAGCTATAT TCTTGCCTGATTGGTCCTGCAGGCCAGTCATATAAACAGAAGAATAATGACCTTTCAATT CAATCTGTAATATCTAGATCCATGGAATGA
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>LITCHI012635.m1 MASPYVVLILFLFLLQAIKGTIQQSQSKMIHLGSWLSPSAENRSWTSPSGLFAFGFYQQG SGFLVGCWLVTRPNVTVVWTAYRDEPLVLSNATLTLTMEGKLVLSTDKDKVIANTSESAY FASMFDSGNFVLYNRSSGIIWSSFDFPTDTILGGQNLYAGSELLSDISESNSLSGRFHLV MQEDGNLVSYPSKAIDDVETPEPYWESDSAYRKGKVHLHLNYTGDLVLLNDSMSIIKQLT KDNDYFSAYNSSVIYRATLDNDGIFRLYSYLFSEVGYSTSIKFSAPENMCQVSTFCGLNS YCALFDDRPGCRCLPGTEPIDSNEMFSGCQRNFTDEKCGESAEGYYMAGMEKMRWRNYPY LIIETMSEADCRNSCLKDCNCDAVLYSSRGCEKHKLPLKSARRDQTGQSSGVATYFKVGS KSIIRPAIRVTSKKAIILILVITLVFATCSCVFLATSGYFLFKHRVLKYKRLLETGNYFG SSEELSLRSFSYSELKKATNGFKQLLGKGSFGAVYKGSFQKGKKLVAVKRLEKVVSEGER EFQAEMHVIGRTHHKNLVRLLGYCAEGSKRLLKLVRGQEVDKKTLENMVMVGLWCVQDEP ALRPSMKSVVLMLEGITDISIPPCPTSPSAL.
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>LITCHI008892.m1 TGGCCGTATGGGGGCTGCTCCTTGAGTGGTTTCCAAGTATGTATTCTTGGGGGTATCATA CATGCGACAGTACTAACTCTGCTTTGCACTCACAGTAGACAGCGGAGAGAGAAAGTGTGA ATGTGTGTTTTCATGACTGCTCATTTCTCGTGAAAAGGCTTTACAAAGCCAGAATTCCCT CTCTTTTCAGACCCACAAATCTAGCTGCTCTTTGAAAAGCACCTGTTGCAGAACATTAAG CACACCTCTATTTTTATTTTTTTTTTTCATTTTTCTTTTTCTTTGCTTCACTTTCTTTCA CTATCATTCACAAACAGCTTTGCTTCTGGGGTCATTTTCTTGTTTGGTCCCTTCCTGATG TGGTTGTGTCGCAATGAGAAAAATGAGCGAATATGCTTCTCATGTTGTATGATGCACTGT TTTTTGGGACCTTCTTTTGTATTTTTGTTCTTGTTTTTGGCTCACCATTCGCGTCCATCT GGCTTCTGATCAAAAATCTTTGATGCTTGTCCTCTTCTTTTTTTTCCTCTGAAATTAAGA GATTAGATTCCTCTTAAATGCTTATAGTCCTAGAAATCTGAAATGGTTAAATGCACTTTG ATTCTTTGATCAATAAAACAAAAAGGTGTGTTTGATAAACAGTTTAGTCATGTTATTGAG GAAAAGTCCAGCAAGATTTGGTGCTGCTGTGACTTGGTGTTTATGGCCTTTTGATCAGTG ATAAAAAAGGATTCTGAGTTGCTGCATTGAAGAAGCAATAAAGACAATATCCAAACAATG GCATTTTTATGGTGGTTGTCTGTTTTGCTGGTTGGGGTTTTATCAATATCTCAGCTTGTG GGCGGTCAGTTAAATGACGAGGCTGCATTGCTGGCCATCAACAGAGAGCTGAGAGTGCCT GGTTGGGGTGTCAACAACACAAACTACTGCAACTGGTATGGCATTGAGTGTGGCTTGAAT CAGTCATTTGTTGAAAAGCTTGATCTTTCTGGGCTACAGCTTCGAGGTAATGTGACTACA ATCTCTGAGCTTAAAGCCTTAAAGAGACTTGATCTTTCTGGTAATAGCTTTTATGGGAAC ATTCCTTCAGCTTTTGGCAACTTATCTCAGCTTGAATTTCTTGATTTGTCATCGAATAAG TTTGGAGGTTTGATTCCTAGAGAATTGGGTGGTCTCGCAAACCTTAAGACATTGAATCTT TCCAATAATATGCTTCTAGGAGAGATACCTGATGAGCTTATGAGCCTAGAGAGGTTGCAG GATTTTCAAGTCTCTAGCAATATATTGAATGGTTCTATTCCATATTGGGTTGGCAATTTG ACCAATTTGAGAGTGTTTACTGCCTATGAGAATCAATTAAGTGGTGAAATTCCTGATAAT CTAGGCTCAGCTTCTCAACTTAAGTTGTTGAATCTTCATTCAAACCAGCTTAACGGGTCA ATACCGAAGAGCATTTTTGCTTCGGGGAAGCTTGAGGTCTTGATTCTGACTCAGAACAGA TTTACTGGCGAAATTCCTGAATCAGTTGGGAACTGCAAAGGCCTTTCTAGTATCCGAGTT GGGAACAATGATCTTGTAGGAGTTATTCCCAAGGCTATTGGAAATGTTAGCGGCCTAACA TACTTTGAAGCAGACAACAACAATCTCTCTGGTGAGATTGTTTCTGAGTTTGCTCAGTGC TCTAATCTTACCCTCCTAAATTTAGCGTCAAATGGGTTTACTGGAACCATACCTCCGGAG TTTGGACAGCTGACGAGTCTGCAGGAGTTGATTCTTTCTGGTAACAGAGTTTTCGGTGAA ATTCCAAACTCTATTCTTTCATGCAAGAATCTGAACAAGCTTGATTTAAGCAATAACATA TTCAATGGAACCATACCAAATGAGATCTGCAACATGTCGAGGTTGCAATACTTGCTATTG GGTCAGAATTCAATAAGAGGGGAGATACCTCATGAGATTGGCAACTGTGTTAAACTACTT GAGTTGCAAATGGGTAGTAATTATTTGACTGGAAGTATCCCTCCTGAGATTGGTCATATC AGGAATCTACAGATAGCCTTGAATTTGAGCTTCAATCACCTTCATGGACCACTGCCTCCT GAGCTGGGGAGGCTTGACAAGCTGGTATCTTTGGATGTCTCTAATAATCAGCTATCCGGT ACTATTCCGCCTGCATACAAGGGAATGCAGAGTTTGATAGAAGTTGACTTCTCAAATAAT CTGCTCACCGGTCCCATTCCCGCCTTTGTTCCATTCCAAAAGAGCCCAAACAATAGCTTT TTCGGTAATAAAGGGCTTTGTGGAGAGCCATTAAGCTTTTCGTGTGGAAATTACAATGAT CCTGGCAGCAAGAATTACCACCACAGAGTTTCTTACAGGATCATACTAGCTGTTATTGGT TCTGGCTTGGCAGTTTTTGTATCAGTAACTGTAGTGGTTCTGCTGTTTATGATGAGGGAG AGGCAGGAAAAAGCGTCAAAAAGTGATGATATTGTTGAAGATGCAACCAATAACAAACCA ACAATAATAGCTGGGAATGTCTTTGTTGAGAATCTCAGACAGGCGATAGATCTTGATGCT GTTGTTAAAGCGACAGTGAAGGATTCAAACAAGCTCTACTGTGGGACTTTCAGTGCGGTT TACAAGGCAATTATGCCTTCCGGGTTGGTTTTGTCAGTGAGGAGACTGAAATCCATGGAC AGAACTATAATTCATCACCAGAGTAAGATGATTAGAGAGCTGGAAAGGCTAAGCAAACTG TGTCATGATAATTTAGTTTGCCCTATTGGATTTGTAATTTATGAAGATGTTGCTCTTCTG CTGCATCATCACTTGCCAAATGGAACATTAAGTCAGCTTCTTCATGAGTCGACAAAGCAA TCTGAGTATCGACCTGACTGGCCTACTAGACTATCCATTGCAGTTGGAGTGGCAGAAGGG CTGGCATTCCTTCATCATGTTGCAATTATCCACCTTGACATCTCCTCTGGTAATGTACTT CTGGATGCTGACTTCAACCCTCTGGTTGGGGAGATTGAAATATCAAAGCTCTTAGATCCC TCCAAAGGCACTGCAAGTATTAGTGCTGTTGCTGGATCCTTCGGCTATATTCCCCCAGAA TATGCATATACAATGCAAGTTACAGCACCAGGAAACGTTTACAGCTATGGGGTGGTTTTA CTCGAGATCCTAACAACACGACTACCAGTTGATGAGGAATTTGGTGAAGGAGTAGACTTG GTGAAGTGGGTTCATGGTGCTCCTGCCAGAGGGGAAACGCCTGAGCAGATATTGGATGCC AGGCTTAGCACAGTTTCTTTCGCTTGGAGGAAAGAAATGCTTGCTGCTCTAAAGGTAGCT TTACTCTGCACTGACAGCACACCAGCCAAACGGCCAAAAATGAAAAAGGTAGTTGAAATG CTTCAAGAAATAAGGCAAAACTGA
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>LITCHI008892.m1 + Up_Stream_Len 2000 GAAGGAATCCTAGGTTTGTCATTATAATTTTTTTATATATCTCCTAAGCAATTGCAAGAA TAAATATTTTTTTCTTTGTTAAGTCTTTAACGGCCACTCTAAGGAAGTTATATTCAATCC ATAATTTATTGAAGTTTGATAATTTTTTTTTTTTAATGATAGATGTTGATGGGATTCATA AATTTGTTGAAATTCTTTAATAAATTGAATGAAATTATGAGGAGAATTTATTGAAGTTTG ATATATTTTTTTTAAATGATAGATGTTAATGGGATTCATAAATTTGTTAAAATTCTCTAA TAAATTGAATGAAATTATGAGGAGAATGATATGATTTGTTATAAACTCAATTCTTTATAA AAAATAAAACACCTTGCACAATCTACCAATTGAACTTAATTGAGATGGAGAGATACGAAA CCACTATTGCTAGAATAATATAACTTATGACAAACGAAAAAGAATGTTACTTGCACATGC ATGATTCAATATATTATCTTACTATTTATTTAAAAATTACAAATAGTCTGCATACGTTTT GAATGGCTACATCATATGATAATGTACTTAAAATTAAAAATAGTCTATATTATTGTAATG AATTTTGAATAAAAATTTTGTAATGGTTTTTCCTTTGGTTGGTGAAAGATTTTAGTAGTC TCCCAACAAAATCGCATTTTTGACTGAAAGCTACTAAACAGTGCAAGTCAAGAAATTGAA CGTTCCCAAGCCTAGTATTCAGATGACTAGGTTGCCATGAAAGTAATTTGATGTACTCTG AAACACTTAACATGACATTAAACCCAATGTCAGAAGTACCTCAAAATAAAATAAAATAAA GATCCCCATGTCAGAAGAATAAAAAAAAGAATCTTGACTCCTATGTCTCGAAAAGATTTT GAGAAGCACTGGATCAAACTAGAAAACTAAAGCTAAGCTATTTATTCATGATCTTATAAT CATACCCCCTAATTATGGTCATAATTATGATACCAAGACTCCAAGTAGAGTGATTAAGTG ATTTGTTACTTTCATCCATTACTTTAAATAATAGGTTTTAAATAATTTTATTTTTTGTAT TAATATCATAAAATATATGAATAATTCTCTTTTAACATTTAAAAATATTTATTTGAATTA TATTGTTAAAATTTTATCTAAATTGGTCATGGTAATCTTATGATTCTGTAAATTTATAAG GTATATATATATATGACGACATATGGCCGTATGGGGGCTGCTCCTTGAGTGGTTTCCAAG TATGTATTCTTGGGGGTATCATACATGCGACAGTACTAACTCTGCTTTGCACTCACAGTA GACAGCGGAGAGAGAAAGTGTGAATGTGTGTTTTCATGACTGCTCATTTCTCGTGAAAAG GCTTTACAAAGCCAGAATTCCCTCTCTTTTCAGACCCACAAATCTAGCTGCTCTTTGAAA AGCACCTGTTGCAGAACATTAAGCACACCTCTATTTTTATTTTTTTTTTTCATTTTTCTT TTTCTTTGCTTCACTTTCTTTCACTATCATTCACAAACAGCTTTGCTTCTGGGGTCATTT TCTTGTTTGGTCCCTTCCTGATGTGGTTGTGTCGCAATGAGAAAAATGAGCGAATATGCT TCTCATGTTGTATGATGCACTGTTTTTTGGGACCTTCTTTTGTATTTTTGTTCTTGTTTT TGGCTCACCATTCGCGTCCATCTGGCTTCTGATCAAAAATCTTTGATGCTTGTCCTCTTC TTTTTTTTCCTCTGAAATTAAGAGATTAGATTCCTCTTAAATGCTTATAGTCCTAGAAAT CTGAAATGGTTAAATGCACTTTGATTCTTTGATCAATAAAACAAAAAGGTGTGTTTGATA AACAGTTTAGTCATGTTATTGAGGAAAAGTCCAGCAAGATTTGGTGCTGCTGTGACTTGG TGTTTATGGCCTTTTGATCAGTGATAAAAAAGGATTCTGAGTTGCTGCATTGAAGAAGCA ATAAAGACAATATCCAAACA
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>LITCHI008892.m1 GenomeSequence + TGGCCGTATGGGGGCTGCTCCTTGAGTGGTTTCCAAGTATGTATTCTTGGGGGTATCATA CATGCGACAGTACTAACTCTGCTTTGCACTCACAGTAGACAGCGGAGAGAGAAAGTGTGA ATGTGTGTTTTCATGACTGCTCATTTCTCGTGAAAAGGCTTTACAAAGCCAGAATTCCCT CTCTTTTCAGACCCACAAATCTAGCTGCTCTTTGAAAAGCACCTGTTGCAGAACATTAAG CACACCTCTATTTTTATTTTTTTTTTTCATTTTTCTTTTTCTTTGCTTCACTTTCTTTCA CTATCATTCACAAACAGCTTTGCTTCTGGGGTCATTTTCTTGTTTGGTCCCTTCCTGATG TGGTTGTGTCGCAATGAGAAAAATGAGCGAATATGCTTCTCATGTTGTATGATGCACTGT TTTTTGGGACCTTCTTTTGTATTTTTGTTCTTGTTTTTGGCTCACCATTCGCGTCCATCT GGCTTCTGATCAAAAATCTTTGATGCTTGTCCTCTTCTTTTTTTTCCTCTGAAATTAAGA GATTAGATTCCTCTTAAATGCTTATAGTCCTAGAAATCTGAAATGGTTAAATGCACTTTG ATTCTTTGATCAATAAAACAAAAAGGTGTGTTTGATAAACAGTTTAGTCATGTTATTGAG GAAAAGTCCAGCAAGATTTGGTGCTGCTGTGACTTGGTGTTTATGGCCTTTTGATCAGTG ATAAAAAAGGATTCTGAGTTGCTGCATTGAAGAAGCAATAAAGACAATATCCAAACAATG GCATTTTTATGGTGGTTGTCTGTTTTGCTGGTTGGGGTTTTATCAATATCTCAGCTTGTG GGCGGTCAGTTAAATGACGAGGCTGCATTGCTGGCCATCAACAGAGAGCTGAGAGTGCCT GGTTGGGGTGTCAACAACACAAACTACTGCAACTGGTATGGCATTGAGTGTGGCTTGAAT CAGTCATTTGTTGAAAAGCTTGATCTTTCTGGGCTACAGCTTCGAGGTAATGTGACTACA ATCTCTGAGCTTAAAGCCTTAAAGAGACTTGATCTTTCTGGTAATAGCTTTTATGGGAAC ATTCCTTCAGCTTTTGGCAACTTATCTCAGCTTGAATTTCTTGATTTGTCATCGAATAAG TTTGGAGGTTTGATTCCTAGAGAATTGGGTGGTCTCGCAAACCTTAAGACATTGAATCTT TCCAATAATATGCTTCTAGGAGAGATACCTGATGAGCTTATGAGCCTAGAGAGGTTGCAG GATTTTCAAGTCTCTAGCAATATATTGAATGGTTCTATTCCATATTGGGTTGGCAATTTG ACCAATTTGAGAGTGTTTACTGCCTATGAGAATCAATTAAGTGGTGAAATTCCTGATAAT CTAGGCTCAGCTTCTCAACTTAAGTTGTTGAATCTTCATTCAAACCAGCTTAACGGGTCA ATACCGAAGAGCATTTTTGCTTCGGGGAAGCTTGAGGTCTTGATTCTGACTCAGAACAGA TTTACTGGCGAAATTCCTGAATCAGTTGGGAACTGCAAAGGCCTTTCTAGTATCCGAGTT GGGAACAATGATCTTGTAGGAGTTATTCCCAAGGCTATTGGAAATGTTAGCGGCCTAACA TACTTTGAAGCAGACAACAACAATCTCTCTGGTGAGATTGTTTCTGAGTTTGCTCAGTGC TCTAATCTTACCCTCCTAAATTTAGCGTCAAATGGGTTTACTGGAACCATACCTCCGGAG TTTGGACAGCTGACGAGTCTGCAGGAGTTGATTCTTTCTGGTAACAGAGTTTTCGGTGAA ATTCCAAACTCTATTCTTTCATGCAAGAATCTGAACAAGCTTGATTTAAGCAATAACATA TTCAATGGAACCATACCAAATGAGATCTGCAACATGTCGAGGTTGCAATACTTGCTATTG GGTCAGAATTCAATAAGAGGGGAGATACCTCATGAGATTGGCAACTGTGTTAAACTACTT GAGTTGCAAATGGGTAGTAATTATTTGACTGGAAGTATCCCTCCTGAGATTGGTCATATC AGGAATCTACAGATAGCCTTGAATTTGAGCTTCAATCACCTTCATGGACCACTGCCTCCT GAGCTGGGGAGGCTTGACAAGCTGGTATCTTTGGATGTCTCTAATAATCAGCTATCCGGT ACTATTCCGCCTGCATACAAGGGAATGCAGAGTTTGATAGAAGTTGACTTCTCAAATAAT CTGCTCACCGGTCCCATTCCCGCCTTTGTTCCATTCCAAAAGAGCCCAAACAATAGCTTT TTCGGTAATAAAGGGCTTTGTGGAGAGCCATTAAGCTTTTCGTGTGGAAATTACAATGAT CCTGGCAGCAAGAATTACCACCACAGAGTTTCTTACAGGATCATACTAGCTGTTATTGGT TCTGGCTTGGCAGTTTTTGTATCAGTAACTGTAGTGGTTCTGCTGTTTATGATGAGGGAG AGGCAGGAAAAAGCGTCAAAAAGTGATGATATTGTTGAAGATGCAACCAATAACAAACCA ACAATAATAGCTGGGAATGTCTTTGTTGAGAATCTCAGACAGGCGATAGATCTTGATGCT GTTGTTAAAGCGACAGTGAAGGATTCAAACAAGCTCTACTGTGGGACTTTCAGTGCGGTT TACAAGGCAATTATGCCTTCCGGGTTGGTTTTGTCAGTGAGGAGACTGAAATCCATGGAC AGAACTATAATTCATCACCAGAGTAAGATGATTAGAGAGCTGGAAAGGCTAAGCAAACTG TGTCATGATAATTTAGTTTGCCCTATTGGATTTGTAATTTATGAAGATGTTGCTCTTCTG CTGCATCATCACTTGCCAAATGGAACATTAAGTCAGCTTCTTCATGAGTCGACAAAGCAA TCTGAGTATCGACCTGACTGGCCTACTAGACTATCCATTGCAGTTGGAGTGGCAGAAGGG CTGGCATTCCTTCATCATGTTGCAATTATCCACCTTGACATCTCCTCTGGTAATGTACTT CTGGATGCTGACTTCAACCCTCTGGTTGGGGAGATTGAAATATCAAAGCTCTTAGATCCC TCCAAAGGCACTGCAAGTATTAGTGCTGTTGCTGGATCCTTCGGCTATATTCCCCCAGGT AATCATATGTATATTTGCTTTATTGTTCAAGCTTCCACTTTGACTTTCCTTTGTCTCATT TTTATTCTTGTTTATTTCTTTGTTTGCTTCCCAGAATATGCATATACAATGCAAGTTACA GCACCAGGAAACGTTTACAGCTATGGGGTGGTTTTACTCGAGATCCTAACAACACGACTA CCAGTTGATGAGGAATTTGGTGAAGGAGTAGACTTGGTGAAGTGGGTTCATGGTGCTCCT GCCAGAGGGGAAACGCCTGAGCAGATATTGGATGCCAGGCTTAGCACAGTTTCTTTCGCT TGGAGGAAAGAAATGCTTGCTGCTCTAAAGGTAGCTTTACTCTGCACTGACAGCACACCA GCCAAACGGCCAAAAATGAAAAAGGTAGTTGAAATGCTTCAAGAAATAAGGCAAAACTGA