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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020942 | Chr12 | 18545072 | 18549297 | + | Putative transcription factor bHLH107 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020942.m1 | 75 | 121 | PF00010.29 | HLH | Domain | 40.8 | 1.80E-10 |
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>LITCHI020942.m1 ATGGGTCCTTCTATTTGGACCTCATGCACGAAAGACACTGGCACTGAGAGACTCAGTGAC GAGCTTGCCGTGAAAACATCAGGATATCGGGGCAGAACAAGAAATGGGTCGTCTTCATTT TCGTCATTGGTCTTGGATAGCGAGAGAGGAGAGCTTGTGGAGGCTAATGTGAAGTTGCAG AAAAAAGGGGTGTCAGTGGAGAGAAGTGTTGCTGCTTTGAAGAATCATATTGAGGCTGAG AGGAACCGAAGGAGGAGGATTAATATGCATCTTGATACTCTCAGGACCCTGCTACCTGCT GCAAAGAAGATGGACAAAGCAACATTGCTGAGTGAGGTTATCAGCCGCTTAAAAGAACTG CAGAAGAATGCCGCAGAAGCTAATGAAGGTTTTCTCATACCGACAGACACAGATGAAGTA AGAGTTGAACAGCAAAAGGATGGATTGGAAGGAGCTCCTCCGCATTCCATCAGGGCATGT TTATGTTGTGATTATAAACCTGGACTTCTGTCTAATTTACGACAGGCACTTGATGCCCTC CATCTCATACTAGTAAAAGCAGAGATTGTGACCTTTGGAGACAAAATGAAACATGTTCTT GTGATGGCTAGCCGTAAAGAACAAAACAGTGAAAATACTGAAGTATGTGAATCTCTTCTA AGCTCTGTTCACCAGGCACTTCGGTCTGTACTTGATAAATTTTCAGCTTCAGAGGAGTTT CTTTTAGGAGCCAGATTGTCAAATAAGAGGCCAAGGATCTCTCTGTTTGATTCGTCCTTG TCATCTTAA
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>LITCHI025746.m1 MNRNRENENEMLHSHRQRSSLFHRPTLFKWRAPGIFTVRFKRLLSTPPKTSQTPASVRKL DRSLLPSSLTNSVSTSESTRSNVSHADQNLCSHVLKLSARLGFIRTGKQVHAHLIKSGTQ DILYLQNQMLHVYTKCKEFDDAEKMFDEMLVRNVVTWNTVVCGVVDCGCGSKSSLYLGFL YFRRMLLDGVGSDHITFNGLLRACVMLDDVEAGRQMHCLIVKLGFVLNCFVSSALVDLYG KCRLVRDARRVFDGVSCRDLVLWNVMVSCYSLNCLADEAFEVFNLMRFKGVKGDEFTFSS LLNLCGTFGSFLKLGRQIHGLIVKQYFDVDVLVASALVDTYAKNGHIEDARRAFDQMAAK NVVSWNTMVVGYGRHGYGREAMRLLRDMFKEKLYPDELSVASILSSCGNLSIICETMQIH AYVVKNGLQAFPSIGNSLINAYSKCGSIDSAFKCFSFVTNPDLITWTSIIGASAFHGLSE KSIEIFETMLSQGVRPDPVVFLVLLSACSHSGLVDEGLHYFKLMSNDYQIMPNSEHYTCL IDLLGRAGLLDKAFNILASMPIEPSSDTFAAFIGACKVHRNVRLAEWAAEKLFELEPGNP VNYSLVSNMYASERRWFNVARTRKMMRDNCNYKVPDAVSHEYKSACFLSPNPFYGRRTVR STPDRFSNYSTTTSSSYSDSSSLRKSPKNPVALAARSIAGVFVGCFTPPEPDRSKNFDDS EEFKPPSVFSDTSRAGSERRRSSSSNRGVYVNSYSSSHSRETGNARFTIEEISKATRNFS PSFKIGQGGFGAVYRGKLEDGTTVAIKRAKKSVYDKHLGVEFQSEIKTLAQVEHLNLVKF YGCLECQDERIIIVEYVPNGNLREHLECLHGNILDLAARLDIAIDVAHAVTYLHMYTDHP IIHRDIKSSNILLTENLRAKVADFGFARLAADVESGATHVSTQVKGTAGYLDPEYLRTYQ LTEKSDVYSFGVLLVELITGRRPIEARRELKERAMKKFTDGDAILTLDPRLEHSSANNLA LEKVLELALQCLAPHRQNRPSMRRCAEILWSIRKDYRELVDVGLLASHSQRSNSIREK.
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>LITCHI025746.m1 ATGAATAGAAATCGTGAGAATGAAAATGAAATGCTACATTCACATCGTCAACGGTCATCT CTATTTCACCGTCCGACGCTCTTCAAATGGCGCGCTCCTGGAATCTTCACCGTCCGTTTC AAACGACTGTTATCAACCCCACCAAAAACCTCTCAAACCCCCGCCAGTGTCCGAAAACTC GACCGATCTCTCCTCCCGAGTTCACTCACAAACTCAGTGTCTACTTCAGAGTCAACCCGC TCTAACGTATCACACGCAGATCAAAATCTTTGCTCTCACGTCCTAAAACTTTCTGCCAGA CTCGGTTTTATCCGAACGGGAAAACAAGTACATGCCCACTTGATAAAGTCAGGAACACAG GACATACTGTATTTGCAAAATCAAATGCTGCACGTGTATACCAAATGCAAGGAGTTTGAT GATGCAGAGAAAATGTTCGATGAAATGCTCGTTAGGAATGTCGTGACTTGGAATACAGTG GTTTGCGGGGTGGTTGACTGTGGTTGTGGTTCCAAGTCAAGTCTCTATCTGGGTTTTCTT TATTTCAGGAGAATGTTGTTGGATGGCGTGGGTTCAGATCACATAACGTTTAATGGTTTG CTTCGTGCTTGTGTCATGTTAGATGATGTTGAGGCGGGTAGGCAGATGCATTGTTTAATA GTGAAACTGGGTTTTGTTTTGAATTGTTTTGTAAGTAGTGCTCTTGTGGATCTGTATGGG AAATGTCGTTTAGTCAGAGATGCAAGACGGGTCTTTGATGGAGTTTCTTGTAGAGATTTG GTGTTGTGGAATGTGATGGTGTCTTGCTATTCATTGAATTGTTTGGCAGATGAGGCTTTT GAGGTTTTTAACTTGATGCGATTTAAAGGTGTGAAGGGGGATGAATTTACGTTTTCTAGT TTGCTGAATCTGTGTGGGACTTTTGGATCTTTTTTGAAATTGGGGAGGCAGATTCATGGT CTTATTGTTAAACAGTATTTTGATGTTGATGTTTTAGTGGCAAGTGCACTCGTCGATACG TATGCAAAGAATGGACATATAGAGGATGCTCGCAGGGCTTTTGACCAGATGGCTGCTAAA AATGTTGTTTCGTGGAATACTATGGTTGTGGGTTATGGGCGGCATGGATATGGAAGGGAG GCTATGAGACTTCTCAGAGACATGTTTAAAGAAAAACTCTATCCTGATGAGCTTAGCGTG GCTAGCATTCTAAGCTCATGTGGCAATTTATCGATAATTTGTGAAACTATGCAAATCCAT GCTTATGTGGTTAAAAATGGGCTTCAAGCTTTTCCATCAATTGGAAATTCTTTGATAAAT GCATACTCTAAATGTGGTAGCATTGACAGTGCATTCAAATGTTTTAGTTTTGTAACAAAT CCTGATCTAATCACATGGACTTCTATTATTGGTGCATCTGCGTTCCATGGCCTTTCAGAA AAAAGTATTGAGATTTTTGAGACGATGCTGTCTCAAGGTGTAAGGCCAGATCCAGTTGTT TTTCTTGTGCTTCTTTCTGCCTGTAGCCATAGTGGGCTAGTTGATGAAGGGCTTCATTAC TTCAAATTGATGAGCAACGATTATCAAATCATGCCTAATTCTGAGCACTATACTTGTCTC ATTGACCTTCTTGGTCGAGCTGGTCTTCTGGATAAGGCTTTTAATATATTGGCATCTATG CCAATCGAACCTAGTTCTGATACTTTTGCAGCGTTTATTGGAGCATGCAAAGTGCACAGA AATGTACGATTAGCAGAATGGGCGGCAGAGAAGCTGTTTGAGTTGGAGCCTGGCAACCCC GTGAATTACTCTCTCGTGTCTAACATGTATGCTTCTGAAAGGCGTTGGTTTAATGTAGCA AGAACTCGCAAAATGATGAGGGACAATTGTAATTATAAAGTTCCAGATGCTGTAAGTCAT GAATATAAGTCTGCTTGCTTTTTGAGTCCAAACCCCTTCTACGGCCGACGCACCGTACGC TCCACCCCCGACCGCTTCTCCAACTACTCCACAACCACATCCTCCTCCTACTCCGACTCC TCCTCCCTCCGCAAGTCCCCCAAGAACCCCGTCGCCCTCGCCGCCAGATCCATCGCCGGC GTCTTCGTCGGCTGCTTCACTCCTCCCGAGCCCGACAGGTCCAAGAATTTCGACGACTCA GAAGAATTCAAACCTCCCTCCGTGTTTTCGGATACTTCGAGAGCCGGTAGCGAGAGAAGG AGGAGTTCGAGTTCGAATCGGGGTGTGTATGTGAATTCATATAGTTCATCACATAGTAGA GAGACGGGCAATGCGCGATTCACAATAGAGGAGATCTCCAAGGCTACGAGAAACTTCTCC CCGTCTTTCAAGATTGGACAAGGTGGCTTCGGGGCTGTTTATAGGGGCAAACTAGAAGAT GGAACCACTGTTGCAATTAAGCGTGCTAAGAAGAGTGTATATGACAAGCATTTGGGTGTG GAGTTCCAGAGTGAGATCAAAACACTGGCACAGGTGGAGCATTTGAATTTGGTCAAGTTC TATGGATGTTTAGAGTGCCAAGATGAGAGAATTATTATTGTGGAGTATGTTCCAAACGGA AATCTCAGAGAGCACTTGGAGTGTCTGCATGGCAACATTCTTGACCTTGCTGCGCGGCTT GATATTGCCATTGATGTTGCCCACGCTGTTACCTATCTTCATATGTATACAGATCATCCA ATTATTCACAGAGACATTAAGTCTTCCAACATTCTCCTCACTGAAAACTTAAGAGCCAAG GTAGCAGACTTTGGCTTTGCTAGATTGGCAGCTGATGTTGAGTCAGGTGCCACCCATGTG TCAACCCAAGTTAAAGGAACTGCTGGCTACTTAGACCCAGAATACTTGAGAACATATCAA CTCACTGAGAAGAGTGATGTATATTCGTTTGGTGTGTTACTAGTTGAACTAATCACCGGG AGGCGCCCCATTGAAGCGAGACGGGAACTCAAGGAGCGGGCAATGAAGAAGTTCACTGAC GGTGATGCCATTTTAACCTTGGATCCGAGGCTAGAACACAGTAGTGCGAATAACTTAGCT CTTGAGAAAGTTCTTGAACTTGCTTTACAGTGCCTGGCTCCACACAGACAGAATCGGCCC AGCATGAGGAGATGTGCAGAGATTCTATGGAGCATCCGAAAGGATTACAGAGAGCTAGTA GATGTCGGCTTACTAGCTTCTCATTCCCAGAGGAGCAATTCAATTCGAGAAAAATAAAGA ACAAATGGCTCAAGTAGATTCAAGCTATATATTGTTGCCAGGGTGATGAATTTGAGTTTA CTTCAAGTGGTGCTAATACATGGAGATATTAAAGAGAAGAAAAAGCAACGTATAAAAAAG GAAGAAGATTATTGTGGGTTTCTTTTGAACCAAAACGAAATCGAAATTGCTCTGGAATCG AGGTAGAGGGAGCCAATGATTTCTAGGAGTTGGATATCGCTGGAACAAGTCTACAGTTGT TGCAAAGCATAGAGAAGAAAATCTACTTATGAGGTTTGGCTTTTGTATAGGAGAGTCATT TAGAGATTGGGAAGTTCTCTGCTTTCATTTTCATTTGTGTGCCTTTTTGTTTTTCGCTTG ATTATTGATTCTTATTCATTTGCCTTGGGGGTATGCGACAACTTTTAAGTGAATTTGAAT TCTGTCTCCTACAAATTATTGGAATATGTATATGAAATAGTAGAGGCAAAATGTTTCAGT CTATCAGTATACTTCTTGGTGCTACGCTATCCTCATTCATTATCATGAGTTTTTCTATGG ACTACACTCGGACTTGGTTTTTTATTTCAGTCATGTAGTCATGACAGCTAAGATACAATT TTACGATCCTTTGCACTTGAAGATTTTATATATATATATATATATATATATAGAGAGAGA GAGAGAGAGAGCATGACTCTTCACATTGCGGTGCTAGAGTATGACAATTTGCTCTCTTTA AAAAATAAAATTTTAAAAATTAACGATAAACAGACAAAACCAATGGATGGTCGAACCTGT ACACTTTCCATCATCAAGCTGATTAGTCATATGAATAATGTTGTGAATAAAAGGGAAAAA AAAACACACGCACACACACACACTTCACTTCATATTAATATAAATCCTGCTCTGCCCTTA ACCGCAACTAGTGTTCTACCTTGCCTCGGTTCTTTATCCTACCTAACTGTATACAGATAT TTCCTTATATTATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAA
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>LITCHI025746.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAAAAAAGAAGCAAATTTGTGATGAGAAGTATATGGATTTCAGCGTTTTGACCAATAGA ATTGTGAAAGTTAGTACCTTTTCTTTTGTTATTACTTTATTTCTCAAGTGGTTTGAAGCG ATCTTGTTATGATCATTCTAGATTTTGTAGTATTGTTATGCCAGTATTATATTTTTCATT TGAATTTGAGTATGGCGTCATATTCATTGTTTTTTAGGTGTTTATTGTAATGCTAAAATA TTTTAAAGTTTGCTACCTGTCATTTCAATGTTGAAAATAGTTTTATGAGTGCTATATATA TATATATATATTTACTCAAAAATATATATGTGTATAAAGATGTATATTATAATTACAATG CAAATAAATATATATTTATCTTTCAAATTAGCATACTTACGATGAAAAGAAGAGTTATCT TTATGTTTATTATTAAATATATAACATGAATTAATTTTTCAACACAAACGTAGAAAATGA TATTAATATATATATGTTACTAATAACTTTACATTCAAATATTTTCCTAGTAAAATTTGG TTTAAAGATAAGTACAATAACCAAGTCAATTTCAAGTATGAAACCAAAATCTACACGATG GAGATTTACGTTTCTTTATTTTCTTTTACGCAAACTCGTGATAACGTAGTAAAGATGGAA GAGATTGACATTGACATTGAGAATCTTATCATCCAAGTTCAAAAGAGGAACAAGAATTTC CAAAAGAAATGTGTCATGATCCATGACAAATAATTATAATATCCAAATTAAGAACAATAG ACGGTCAAGAAAAAAAGAAAAAAAGCAAAAAGCATGTATTCTTTCTCTTACAAAAGTATA TATAATATACAAAATAGATGCTCACCTATTGATCTTATATTTTCGTGAAAAAAGAGGATA AGTTTATGAAATTATTTAGTATATGTAATGCAATATTAGATAAGCCAATGAGACATTGAA TACTTAAATCTCCAAAACTCCATCCTCAGTTGGGGCTAGATTTTGAGGAATTTGGGATGA AAATCAAAATTCATTCATGTTTATAAACAGAGATGAAGAAGCCACCACCTATTCTCATCC TGTTTTTCTCATTTTCCTTATCTTCCCTTTTTCAATTTTAATTTAAATATGAAATTATAT ATTTTTTCAATATTAATTTATGCAATAGTTTATGTAAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTCAAT GTTTGCTGAGAATTAAATATGTTAAATTGTTGATGAAATTATTTTATAAAATATGTTTGA TTTATTTATATTTGCTTTGTAAATTTTTATTATTGTGTATATTTTTTAAATTTGGATCAA ACGAAATCAAAAAATGATGGAAGACTAAGGAGGAACAAAGAAAATCGGAGAACAGGGATG GGATGGGAGAACCACCCCTAAATATCCCATCCCCATTTCCATAATGAAGATTTCAATGCG GATTGAGGAAGGTTGAAGGAATGAGAATAACAACGAGGATAATATCCATATCTTCGAAAT GACCTATTAACATTCATATGCAAAAAAAATTATCAAATTTTCAATATTATAAAGAAAGCA AACCATAGTTTTTCAAAATAAATAAACAAAGGCAAAAACTAACACCCACCCAAAGATCAA GTGATTATTGTACTTTCATTTTATGTTTATGATCAAGGTTCGAATTTTCGTTATATATAG TTATTAATATTTACAATTTGTTATTGACATAAATTTCTTCCATCGGTGTAATGGAAAGTA GATTTTTAAGTTGTATATAATATTTATTAAAAAAACAATATTTTTGATTAACGATTTTAT TGAACTTATCAACCATCTCGTTTTTTTTTTATAAAAAAAAAAACCCTAAATATCAAAAGG AAATTTTAAGTCTTATTAAATTAATATTATAGATTTTTTAATATTAATACTATGGATTTT AAGCTACCAAGTCTGCCCTAGAAACGAAATTAAAAATTAAAAACTATATTCTTTTTTTTT TTTTTTTTTTGCCCTTTATA
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