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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020942 | Chr12 | 18545072 | 18549297 | + | Putative transcription factor bHLH107 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020942.m1 | 75 | 121 | PF00010.29 | HLH | Domain | 40.8 | 1.80E-10 |
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>LITCHI020942.m1 ATGGGTCCTTCTATTTGGACCTCATGCACGAAAGACACTGGCACTGAGAGACTCAGTGAC GAGCTTGCCGTGAAAACATCAGGATATCGGGGCAGAACAAGAAATGGGTCGTCTTCATTT TCGTCATTGGTCTTGGATAGCGAGAGAGGAGAGCTTGTGGAGGCTAATGTGAAGTTGCAG AAAAAAGGGGTGTCAGTGGAGAGAAGTGTTGCTGCTTTGAAGAATCATATTGAGGCTGAG AGGAACCGAAGGAGGAGGATTAATATGCATCTTGATACTCTCAGGACCCTGCTACCTGCT GCAAAGAAGATGGACAAAGCAACATTGCTGAGTGAGGTTATCAGCCGCTTAAAAGAACTG CAGAAGAATGCCGCAGAAGCTAATGAAGGTTTTCTCATACCGACAGACACAGATGAAGTA AGAGTTGAACAGCAAAAGGATGGATTGGAAGGAGCTCCTCCGCATTCCATCAGGGCATGT TTATGTTGTGATTATAAACCTGGACTTCTGTCTAATTTACGACAGGCACTTGATGCCCTC CATCTCATACTAGTAAAAGCAGAGATTGTGACCTTTGGAGACAAAATGAAACATGTTCTT GTGATGGCTAGCCGTAAAGAACAAAACAGTGAAAATACTGAAGTATGTGAATCTCTTCTA AGCTCTGTTCACCAGGCACTTCGGTCTGTACTTGATAAATTTTCAGCTTCAGAGGAGTTT CTTTTAGGAGCCAGATTGTCAAATAAGAGGCCAAGGATCTCTCTGTTTGATTCGTCCTTG TCATCTTAA
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>LITCHI020942.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATGTCAACACATTTTACCCAAATTCATACTCAAATAATACGATATATATCTTGTAACACA ATATTACTTATTCAATTATTTCATGACTTATGTAGTACCGATAATTTACATATGACGTCA TTTGAATATAAACTTTGAAAAACAAAAAAAGAATGGGCAACTACAATAAGATCATGGTCT ATGAACATTTTGTTATAGATAATGTTGCGTTGTTTTTGTCCAAATTCATGCATGAATAAT ATATTATGTGAGTTATCATTATATATATGTATATGTGTGTGTATTTGCTATCAAATCATA TTGGATGATGGTCATACTACACATCATTTACACATAAATTTAGACAAAATTTGTTGACAA ATTAACACTACTTTGTCCTTATATAATGTCCATGTATTAAATTTGCAAACCTAACTAATA ATCTTGCATTGTTTTTATTAGTAATTTAAATATGTTATTAAAAATAAAACACCTAAGAGA TTTGAAAAATACATTCGATGAGAACATATTTTTAAATAAATCCTTCATATTTGTTTTATT TAAATATTATAAATATTAGAATATTATCATATTTTTAAATAAATTATTTTTCAAACCACA TGTCAAACAATTTATCCACATGTTAAAAAGAGATTATTAATTGAACAACCTGTAGAAAAG TGTTGATTATTTTGAATGCAAAATCTCAAATCCTACCTGAACCACCTAAACCACATTTTT TGTGGATAATATAAATATAAATATATATATATTTTTTAAAAAAAACCACCTCTTTGCACA TCATTTATGTTTGTGTATTTTTTCATTTTTGAAAAGTTGGAAACCATTGAACTCATATTA GGGTAGCTTACTTTTACTTATTATGAGAGTAATTATTTTTCGTTTATAGGAATAAATATG CGAGCAATAAAAAGTGGGGTAATTATTATCTGTGCACAAAAAAAAATTCATTGACAATAA AGAGTATTTATCTCCAATTTAAAGAAATAACATGGAAACCATATAAATAATATTTATTCT TGATAGATATCTATAAATCTCGCTAAGGTTTTTATAAAAGAAAACTTTATTTCAATCTTC AAATTATAAAAAATTATCAATTTTAAAAGGTTTTTAAAAACAGCTTATTATATTACTAAA GTTTTAAAATTTCTTTAAAAAAAAATATAAACTGTCATCAATTCACAATCCAATGAGACG AAAAGTTTGGTTGAGAATGGTATTTTTTACATTCCGTAAGAGAGAGTTGAGAATGAAATA TATATATAAATTCCTTAAATAAAATTAAAAAAATAAGTAATTAATTAATTAAAAAAAACT TATTAATCAATTAAAATTTAAAAATAAAAATCTCAATTTTTCATCTTTAAAATGGACATC GATGATTATATATATTTCTTAGATAAAATTTAAAAAATAAGATATCTCTAGTATCTATCT TTTTATCTTTAAAATTGGCAGTGAAAATTAAACTTAATTGAAAAAATAAATTTTAAAATG ATAAAACAAAATCATTTGGATTCCATTCGCCATCTCCATCTTCATTGATGTCGATGCCCA TTGAAGGGGAACGATCAAAATCAAGCAGACAAACAAAAACACCAAAATCAAAAGCATACA AAATGACAGCCAACTGATTGTTTTATGGCAGTTTCCAAAAGACCTCAGGGCCTAAAACGA AAGAGAAGACACTGGCAGTAAAATGAAGTTTCCCTTTTTAAACTTAATTTGTTGCGTTAA GGAAAATGAAAGAGAGGACAAAATGAAGAAAAAAAAACCAGAAGGGCCCATTTGGTTGTG GAAGTGCTTTCCTTTTTCCACTTTATAATGGTGAGTTGGAGGACGCAACGACAAAACAGC ATCTGACATTGGACTCCACGAGCTATCAAACTGTCTCCTGCATTAGTGGGCAGCGAACAC TCCCCCAAGTCTAACTCAGATCTGAGTCATTGTTCACCAAACTACGTCGTTGCAAGGCCT TCAGTTTGGTGTTTCGATCC
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>LITCHI025674.m1 GenomeSequence + AAAAGTTTTCGTGCATTTAGAAAGACTCTTGATCTTGAATTTTGTTTTAATCACGATCAA ACGATCAGATTAAAGACACCAAGAAAGTGCACGATCGATATTTGTCCGTTATAAGTCTCT CCTTCCCCTCTCAAAAAAGATTTAAAAAGAGCTGCATCTTGGATCACACAACCGCCTTCA CGGATTCCTTTACCCGCCATTCTGTCGCCGTACACGCTCCATTTTCTTTTTGGGTTTTCT GTTTGGTTTCCAAGAAACCGGAGGAAAAAGCAAAGAAAATCCATAAGTTAAACACTTTTC GCTTTCTTTTGTGCAGTCAATTCAAAATTCCGGGAGAAAGAAACCCGTCACTATCATCAC TACAACAATCTTGATAGAATTCTGGAAAGAGTTCACCTTACACACTTCCAACTTTTGAAT TTCAGGATGGCAATTTTGTCAATTCAACTTTGTCACGGCGTGAAGTCTCCCGGGGCGTTG TGGTCACGACGTAAGCAAGCTATTTCAGCTTCTGTTAGAGTGTCGTCGTTTGGTTCAGTT GATTGGAATTCGTGTTGTTTTAAGGGTCGTCAATCTCGGACTTCGGCTCTGGTGAGAGAG AGAGGAAAGAAAATTGAAGAGTACGATTCTGTGGACGCAGATGAGGATAGACAGGTAATT ATACATTTTCAATTTTCAATTTGGCTGCATTTGATTGCTTGTCAAATTTACTTGGTTCTT TCGATAGGTTGTACGGTCGGCCCCAAAATTGCCGGAGCGTGATTTCACTGGCACAGCCTA TGTGCCTGTCTATGTGATGTTACCAGTGAGTTTTGTTAGATTTTCACTTACGTACTGCCT CTAGGTGGAGTTGATTTGGTTTGTTTCAATTTTTGCTAAAAAAGAGAATTGTTTAAGTTT 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