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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020909 | Chr12 | 18246037 | 18250688 | - | Probable serine/threonine-protein kinase PBL26 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020909.m1 | 88 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.7 | 4.30E-43 |
LITCHI020909.m1 | 90 | 294 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 142.9 | 1.10E-41 |
LITCHI020909.m2 | 88 | 297 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.8 | 4.00E-43 |
LITCHI020909.m2 | 90 | 363 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 146.8 | 7.60E-43 |
LITCHI020909.m3 | 88 | 264 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 115.9 | 2.20E-33 |
LITCHI020909.m3 | 90 | 264 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 105.5 | 3.00E-30 |
LITCHI020909.m4 | 88 | 293 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 148.8 | 2.10E-43 |
LITCHI020909.m4 | 90 | 292 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 144.1 | 5.00E-42 |
LITCHI020909.m5 | 88 | 295 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 147.7 | 4.30E-43 |
LITCHI020909.m5 | 90 | 294 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 142.9 | 1.10E-41 |
LITCHI020909.m6 | 88 | 264 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 115.9 | 2.20E-33 |
LITCHI020909.m6 | 90 | 264 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 105.5 | 3.00E-30 |
LITCHI020909.m7 | 88 | 172 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.5 | 6.30E-12 |
LITCHI020909.m7 | 90 | 172 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 48.5 | 7.20E-13 |
LITCHI020909.m8 | 88 | 172 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 45.5 | 6.30E-12 |
LITCHI020909.m8 | 90 | 172 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 48.5 | 7.20E-13 |
LITCHI020909.m9 | 46 | 130 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 46.5 | 3.30E-12 |
LITCHI020909.m9 | 48 | 130 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 49.5 | 3.60E-13 |
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>LITCHI020909.m1 ATGGACGACGATATGGAGTACAGAAGAAAAGAACGCACCGCATTAGTGGTCATAGTGGTT CTGGCTTCACTAGCCATCGCTTCTTTGCTCGTCGCTTTTAGCTATTATTGCTATATACGT AACAAAGTCTCTAAGCGCTTAAACAACCGCAAAAGAGTTGATCGTGAGGACAAAGGTGAC TCCGGAAATTTGCAAGTTAGTACTGATAAAGGACTTCAGGTGTTCACTTTCAAGCAGCTG CATTCGGCAACTGGTGGTTTCAGCCAGTCGAATGTGGTTGGGCATGGTGGGTTCGGGCTG GTGTACCGTGGAGTGCTTAGTGATGGGAGGAAAGTTGCTATAAAGTTGATGGATCAAGCC GGAAAGCAGGGAGAGGATGAATTTAAAGTGGAGGTGGAATTGCTTAGTCGGCTGAGATCA CCATATTTGCTGGCTTTGCTTGGATATTGTTCTGATAACAGTCGTAAATTGCTTGTTTAT GAGTTCATGGCAAATGGTGGTTTACAGGAACATTTGTATCCTGGTAGTGGTGCTAACTCG GTTGCCCTAAAATTGGACTGGGAAAGCCGTCTTAAAATAGCTCTTGAAGCTGCTAAGGGT TTGGAATATCTCCATGAACATGTTAGTCCACCAGTCATTCACAGAGATTTTAAGAGCAGC AACATTCTCTTGGACAAAAATTTCCATGCCAAAGTTTCTGATTTTGGACTGGCGAAGCTG GGATCTGAAAAGGCCGGTGGGCATGTTTCAACTCGAGTGTTGGGCACCCAGGGATATGTT GCCCCGGAGTATGCATTAACTGGGCATCTCACGACAAAATCAGATGTGTACAGTTATGGG GTTGTACTTCTGGAGTTGCTTACAGGCAGAGTTCCTGTTGATTCTAAGAGACCACCTGGA GAAGGAGTTCTTGTATCTTGGGTAAGTTTCTTTTCTTTTTTCTTCAGTAAACTTGAGTGC AATCGAATGATTAGTTCATAG >LITCHI020909.m10 ATGGACGACGATATGGAGTACAGAAGAAAAGAACGCACCGCATTAGTGGTCATAGTGGTT CTGGCTTCACTAGCCATCGCTTCTTTGCTCGTCGCTTTTAGCTATTATTGCTATATACGT AACAAAGTCTCTAAGCGCTTAAACAACCGCAAAAGAGTTGATCGTGAGGACAAAGGTGAC TCCGGAAATTTGCAAGTTAGTACTGATAAAGGACTTCAGGTGTTCACTTTCAAGCAGCTG CATTCGGCAACTGGTGGTTTCAGCCAGTCGAATGTGGTTGGGCATGGTGGGTTCGGGCTG GTGTACCGTGGAGTGCTTAGTGATGGGAGGAAAGTTGCTATAAAGTTGATGGATCAAGCC GGAAAGCAGGGAGAGGATGAATTTAAAGTGGAGGTTTGA >LITCHI020909.m2 ATGGACGACGATATGGAGTACAGAAGAAAAGAACGCACCGCATTAGTGGTCATAGTGGTT CTGGCTTCACTAGCCATCGCTTCTTTGCTCGTCGCTTTTAGCTATTATTGCTATATACGT AACAAAGTCTCTAAGCGCTTAAACAACCGCAAAAGAGTTGATCGTGAGGACAAAGGTGAC TCCGGAAATTTGCAAGTTAGTACTGATAAAGGACTTCAGGTGTTCACTTTCAAGCAGCTG CATTCGGCAACTGGTGGTTTCAGCCAGTCGAATGTGGTTGGGCATGGTGGGTTCGGGCTG GTGTACCGTGGAGTGCTTAGTGATGGGAGGAAAGTTGCTATAAAGTTGATGGATCAAGCC GGAAAGCAGGGAGAGGATGAATTTAAAGTGGAGGTGGAATTGCTTAGTCGGCTGAGATCA CCATATTTGCTGGCTTTGCTTGGATATTGTTCTGATAACAGTCGTAAATTGCTTGTTTAT 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>LITCHI031097.m1 MPEIEHVPNDNALFGKYELGKLLGCGAFAKVYHARDVRSGQSVAIKVINKKKINGTSLMS NVKREITIMRRLNHRHIVRLHEVLATKTKIYFVMEFVKGGELFAKVAKGRFSEDLGRRYF QQLISAVGYCHARGVFHRDLKPENLLVDENGNLKVSDFGLSAVSEQVRPDGLLHTLCGTP AYVAPEILTKKGYDGAKVDVWSCGVILFVLTAGYLPFNDPNLMAMYKKIYKGEFRCPRWM SSDLKRFLSRLLDTNPETRITLDEILKDPWFTKGGFREINFYDEGDVKVDKSGEGSETKH LNAFDIISFSAGLDLSSLFDQSHNPVNDGERFVSSESPEKLIKKVEDFANVEKFRVKRRK EWGVELEGQKGNLVIEVYRLTEELVVVEAKSTGGDARCFDSVWRNKLRSLLACQQEQPEQ VVSDNDN.
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