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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020905 | Chr12 | 18196769 | 18206433 | - | Shaggy-related protein kinase zeta |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020905.m1 | 78 | 362 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 215.6 | 8.60E-64 |
| LITCHI020905.m1 | 81 | 330 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 89 | 3.30E-25 |
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>LITCHI020905.m1 ATGGCCTCAATGCCCTCGGGGCCTCCTCAGCCGCAGACTCAGACTCACCACCAACCGCCG CCAGCTCAGCCGCCACACTTCGACAATGATCCCTTGAAACTTCGCCGTTCCGATTTGGAC TCCGACAAGGAAATGTCGGCTGCTGTAATTGAGGGCAATGATGCCGTCACTGGTCACATC ATTTCAACCACCATCGGAGGGAAAAATGGCGAGCCCAAACGGACTATTAGTTACATGGCT GAGCGTGTTGTAGGAACTGGATCATTTGGTATCGTTTTTCAGGCAAAATGCTTGGAGACC GGAGAAACTGTGGCTATAAAGAAGGTCTTGCAGGACAGGCGGTATAAAAACCGTGAGCTG CAGTTAATGCGCTTGATGGATCACCCAAATGTGGTTTCACTGAAGCATTGCTTCTTCTCT ACAACAAGTAAAGATGAACTCTTTCTGAATTTGGTTATGGAATATGTCCCCGAGACTATG TATAGGGTTCTTAAGCATTACAGCAGTATGAGTCAGAGGATGCCCCTCATCTATGTCAAA CTTTATACATATCAAATTTTTAGGGGCCTGGCATATATCCATACCGTTCCTGGAGTTTGC CACAGGGATGTGAAGCCTCAAAATCTTTTGGTTGATCCTCTAACCCACCAAGTTAAGCTT TGCGATTTTGGAAGCGCAAAAGTTCTGGTGAAGGGTGAAGCTAACATATCATATATATGC TCTCGGTATTATCGGGCTCCAGAACTTATATTTGGTGCAACAGAGTATACAACATCAATA GATATTTGGTCAGCTGGTTGTGTCCTTGCTGAGCTTCTTCTAGGACAGCCACTATTTCCA GGGGAAAATGCAGTGGACCAACTTGTTGAGATTATCAAGGTTCTTGGTACTCCAACTCGA GAAGAAATTCGTTGCATGAATCCAAATTATACAGATTTTAGATTTCCTCAGATTAAAGCT CATCCTTGGCACAAGGTTTTCCACAAACGAATGCCTCCTGAAGCAATTGATCTTGCTTCA CGACTGCTTCAGTATTCTCCAAGTCTTCGTTGTACTGCACTTGAGGCATGTGCTCATCCT TTCTTTGATGAGCTTCGAGAACCCAATGCTCGCCTTCCAACTGGTCGCCCTTTGCCCCCA CTTTTCAACTTTAAACAGGAATTATCTGGAGCATCACCAGAACTGATCAACAGACTTATA CCGGAGCATGTAAGGCGGCAGACAGGTCTCAGCTTCCCTAATCCAGCTGCCACGTAA
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>LITCHI020905.m1 MASMPSGPPQPQTQTHHQPPPAQPPHFDNDPLKLRRSDLDSDKEMSAAVIEGNDAVTGHI ISTTIGGKNGEPKRTISYMAERVVGTGSFGIVFQAKCLETGETVAIKKVLQDRRYKNREL QLMRLMDHPNVVSLKHCFFSTTSKDELFLNLVMEYVPETMYRVLKHYSSMSQRMPLIYVK LYTYQIFRGLAYIHTVPGVCHRDVKPQNLLVDPLTHQVKLCDFGSAKVLVKGEANISYIC SRYYRAPELIFGATEYTTSIDIWSAGCVLAELLLGQPLFPGENAVDQLVEIIKVLGTPTR EEIRCMNPNYTDFRFPQIKAHPWHKVFHKRMPPEAIDLASRLLQYSPSLRCTALEACAHP FFDELREPNARLPTGRPLPPLFNFKQELSGASPELINRLIPEHVRRQTGLSFPNPAAT.
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>LITCHI020905.m1 TATCGAAAAGAAATGGACGGGTATGCAACTCAGAAACCAAAATAAAAAACAATACGTAAA AACACAAGTATGTGAATGTACAAGCGGACAGACAAAAACAAAACCAAAAAAGCATGCAAT CGGCGCGTGACGAGTAACGTACGTAACCGTCGCGTGGGTCTACTTCAAAAGTATGCTGTC TTGTATTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTAATTTTTTTTAAATATGGAAACGGAACCAA AAATAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGAGAGAGAGTGTTGGTGAGGAGCTGTAA ACTCACATGGCCTCAATGCCCTCGGGGCCTCCTCAGCCGCAGACTCAGACTCACCACCAA CCGCCGCCAGCTCAGCCGCCACACTTCGACAATGATCCCTTGAAACTTCGCCGTTCCGAT TTGGACTCCGACAAGGAAATGTCGGCTGCTGTAATTGAGGGCAATGATGCCGTCACTGGT CACATCATTTCAACCACCATCGGAGGGAAAAATGGCGAGCCCAAACGGACTATTAGTTAC ATGGCTGAGCGTGTTGTAGGAACTGGATCATTTGGTATCGTTTTTCAGGCAAAATGCTTG GAGACCGGAGAAACTGTGGCTATAAAGAAGGTCTTGCAGGACAGGCGGTATAAAAACCGT GAGCTGCAGTTAATGCGCTTGATGGATCACCCAAATGTGGTTTCACTGAAGCATTGCTTC TTCTCTACAACAAGTAAAGATGAACTCTTTCTGAATTTGGTTATGGAATATGTCCCCGAG ACTATGTATAGGGTTCTTAAGCATTACAGCAGTATGAGTCAGAGGATGCCCCTCATCTAT GTCAAACTTTATACATATCAAATTTTTAGGGGCCTGGCATATATCCATACCGTTCCTGGA GTTTGCCACAGGGATGTGAAGCCTCAAAATCTTTTGGTTGATCCTCTAACCCACCAAGTT 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>LITCHI020905.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAATTGTTGATTAATTCAGAGTAACATAGCTTGAATCATATTCATTGAATTTGGTTGATT CGGGTTGCATCTACTTCAAATTAAATGCGATAGAATTTGATTAAAAAGTTATAAACACTA ATTAATATTAGACAATAAATTTAATTAAACAAAAAATCATTGGTTTAGAAAGATAAACAC CTCTGATGAGATATCCTTCTAATTGTAAACATTTAATGACTGCAAAACTAGTTGAGGATT ATTGAACTGGTGCATTTACCTTTAGAGTATACTCTTAAAAATATCCCAATAATTCTATTA GATGCATTTACATTTTTAGACTGGTGATAATAACATTCTCATGAGCAAAGATTTAGCAGT CCCTGCCATAAAATCGAAGCCTTAGAAGTTCAAATGAAGGGATAAAGATTCTCTGTTAAT GTTGACACGGTACCAATCTTTTTATGAGAACAATTTAAGTTTGAATGATATATAAGAGAG AAAAAATCTATCAATCTTAACCATTTATTTTTTTAAATACTAATATGTCACTGGATTATC AAAAGATTAACAAAAAAAATGATGATAGAGAATCTTTACTCTGAATGAAGAATGTAACAC TTAGACCAACTCCTTGTGCTCATCCACATTGCCACAATGAAGAGTCATTAAAGACAGTTG ATTACTTCAATTACTGTGATTGTTGCTGCATTTTCTTGTTCATGTGGACAGTAATATTGT AATAAATCAACATATTTTGCTTTTATAACAATTATTGTTCTCATCTTGATATGAATCATG AATGTATATTTGATCATGAAAATAGCTTCTATCTATTTTTTTTTTTTTTTTTTCCGATAA GCTTCTATCTACTAACATTAATACCATATGGTTATTTCATTTCAATAAATAACGATTGCT TTTATCATTCAATTAATACAGTTTCACTAACATTAAAAATTATCATCGAAACAAATGACT TCATCAATGTTTTTCTTAGTAAAAATATAACTAGTTAATAATTAATGTTGTCGTTATTTA TACATCTTAAAGGTAAAATCCAACTTGTAAAAATAAAGCACATTATACCTGAGTAAAAGT GATTTAGTTATTTTGATCTTAAGAGGTTAGAATTCAAATCCTATCATTATTCTCTAAAAC ACAAGGTGTGAGTTATAAATCTTCTTTAAATAAGAGTTGTCATGTTTACGCTTGTGAAAG TAGTTATTCGGATCGTATTATTAGTAATTTATTTATTGGGTACCGACAGTTCGCCGACTT GTAAGGTGTCAATGGCTAAAAAATGAATTAGATATATTATCAAAATCTAAAGTTACTAAT AGCACTTTGAATAACAGTAATAACAATATTTCTATCTGTACTTGCTACATAGTTAACATA CTATAACAATTTCCACGAATTAGTTAACATAGACTACCTTTAATAATTAGTTCTACTGAT TTCTCTACATTAATTGATGTGACAAATTTGCCTAAAATTGCTATACGCTGAACATACACA TCGTTACGAACCATTAATCTCAATCCCTTTTTAAGAGTATATACTATTTATTTCAACAAC TTATACACATAATTACACTATACATGACAAATACACGTAATTATACTATATATAAGATGT ATATGAACATCCAAACCGAACATTGTAATTAATTTCATAAAACATTTTCTAAAAATAGTT TTTACAACAAGCATTATCGAAAAGAAATGGACGGGTATGCAACTCAGAAACCAAAATAAA AAACAATACGTAAAAACACAAGTATGTGAATGTACAAGCGGACAGACAAAAACAAAACCA AAAAAGCATGCAATCGGCGCGTGACGAGTAACGTACGTAACCGTCGCGTGGGTCTACTTC AAAAGTATGCTGTCTTGTATTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTAATTTTTTTTAAATAT GGAAACGGAACCAAAAATAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGAGAGAGAGTGTTG GTGAGGAGCTGTAAACTCAC
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>LITCHI020905.m1 GenomeSequence - TATCGAAAAGAAATGGACGGGTATGCAACTCAGAAACCAAAATAAAAAACAATACGTAAA AACACAAGTATGTGAATGTACAAGCGGACAGACAAAAACAAAACCAAAAAAGCATGCAAT CGGCGCGTGACGAGTAACGTACGTAACCGTCGCGTGGGTCTACTTCAAAAGTATGCTGTC TTGTATTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTTAATTTTTTTTAAATATGGAAACGGAACCAA AAATAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGAGAGAGAGAGAGTGTTGGTGAGGAGCTGTAA ACTCACATGGCCTCAATGCCCTCGGGGCCTCCTCAGCCGCAGACTCAGACTCACCACCAA CCGCCGCCAGCTCAGCCGCCACACTTCGACAATGATCCCTTGAAACTTCGCCGTTCCGAT TTGGACTCCGACAAGGTGCTTACTATCTAGTGTCGTGCATGACATGGTTGCTGTTTTAGA TCTAGCTTCCTGGCTTCTGTTTCTCCAACTCTTCACTTCACGCGATCTGTCTCTTTGCTC ACTTTCCATTTTATTTTTATTTATTTTGTGACTACTGTTACTAATTAGTGTTCATTTTAT TTGGATAGAGATCTTCATGTTGTGTTAATTTAGAAAAAGTGAAAGGAAAAATAAATGGAG AATTATCAAGTTCATTTTTTGAACTGTGCGGTGTGTTAAAGGTTGAATTTTGCTTAGTTT GAAGAATCAATAGCCTTAAAAATCTTTAATTTTTTGTGTTTTTCAGCTACCAAACAGTGC ATTTGGCTTTTTTTTTTCCCCCTTCCTGTTATGGTGGTGTTTGTTTGTCCAGTTTATTTT CATTTTTTTTTTGCTTTGTTTTGTTGTATAGTTTTAGTATGATTTCTTGCTAGATCTTTA 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