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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020851 | Chr12 | 17826759 | 17832009 | - | Receptor-like protein kinase HERK 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020851.m1 | 80 | 250 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 84.3 | 9.30E-24 |
LITCHI020851.m1 | 83 | 251 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 96.4 | 1.80E-27 |
LITCHI020851.m2 | 80 | 344 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 126.6 | 1.20E-36 |
LITCHI020851.m2 | 83 | 348 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 143.5 | 7.70E-42 |
LITCHI020851.m3 | 80 | 162 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 44 | 1.90E-11 |
LITCHI020851.m3 | 83 | 187 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 55.7 | 4.80E-15 |
LITCHI020851.m4 | 80 | 162 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 44 | 1.90E-11 |
LITCHI020851.m4 | 83 | 187 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 55.7 | 4.80E-15 |
LITCHI020851.m5 | 80 | 162 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 44.2 | 1.60E-11 |
LITCHI020851.m5 | 83 | 187 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 55.9 | 4.20E-15 |
LITCHI020851.m6 | 80 | 160 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 43.6 | 2.40E-11 |
LITCHI020851.m6 | 83 | 161 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 49.1 | 4.80E-13 |
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>LITCHI020851.m1 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGAGCTGCTCAAGATTCCCGACAGAAGCTAGAGTTCAAGCATAGACTTTCGATA GCTCTAGGGGCAGCTAAAGGTCTGGCTCATCTTCACTCTCTGAGTCCCCGTTTGGTACAT AAGGATTTTAAAACAGCAAATGTTCTTGTAGATGAAAATTTTATATCCAAGGTTGCAGAT GCAGGACTGCGCAATTTTCTTGGGAGAATTGATGTTGCAGGCCCATCTTCACAAGTGACA GCCGATGAGATATTCCTTGCCCCAGAGTATTACTACTTCGACTCCCCATGTTTGTGTGCC AATCTCTCTGATATACTGTTTTACCACTTATTTCATTGTTCACTTATGCAGGGTAAAAGA ATTCAGTAG >LITCHI020851.m2 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGAGCTGCTCAAGATTCCCGACAGAAGCTAGAGTTCAAGCATAGACTTTCGATA GCTCTAGGGGCAGCTAAAGGTCTGGCTCATCTTCACTCTCTGAGTCCCCGTTTGGTACAT AAGGATTTTAAAACAGCAAATGTTCTTGTAGATGAAAATTTTATATCCAAGGTTGCAGAT GCAGGACTGCGCAATTTTCTTGGGAGAATTGATGTTGCAGGCCCATCTTCACAAGTGACA GCCGATGAGATATTCCTTGCCCCAGAGGTAAAAGAATTCAGTAGATTTTCCGAAAAAAGT GATGTGTATAGTTTTGGGGTTTTCCTCTTGGAGTTAGTAACTGGGAGGGAAGCATCAGAT TCAGCATCGTTAGATACCAGTAAGAATTTGGTTGAATTGGTGCAAAATAGCCAAGAACTT AGCACTCTTTCAGACATCATTGACCAGAAACTGGGGAATAGCTTCACACCTGAAGGTATG GATGATTTCATACAGTTGATAGCCCGGTGTCTGGAGCCTTCAAGTGAGAGACGACCTTCA ATGAGCTATGTGGTAATGGAACTTGATCGTACACTTGATAGAGAAATGAGCTTGACAATC GTTATGGGTGAAGGAACCCCAACAGTGACTCTTGGAAGCCAGCTATTTCGAGCTACAAAA TAA >LITCHI020851.m3 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGAGCTGCTCAAGATTCCCGACAGAAGCTAGAGTTCAAGCATAGACTTTCGATA GCTCTAGGGGCAGCTAAAGGTGATCCTCTGCAAAATCAGTCTGGCTCATCTTCACTCTCT GAGTCCCCGTTTGGTACATAA >LITCHI020851.m4 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGAGCTGCTCAAGATTCCCGACAGAAGCTAGAGTTCAAGCATAGACTTTCGATA GCTCTAGGGGCAGCTAAAGGTGATCCTCTGCAAAATCAGTCTGGCTCATCTTCACTCTCT GAGTCCCCGTTTGGTACATAA >LITCHI020851.m5 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGAGCTGCTCAAGATTCCCGACAGAAGCTAGAGTTCAAGCATAGACTTTCGATA GCTCTAGGGGCAGCTAAAGGTGATCCTCTGCAAAATCAGTGA >LITCHI020851.m6 ATGTCAGCGTCTCTTGCAGCAATAATTGGAGGTGCTGCAGGAGCTGTGGCATTGGGGATA GTTATCTTCCTTATATGGTTCTGCCTATTTCACAATCGGAGTGTTTCAAGAACTTCTGAA ACCGGGTCTTCTGATCCATCTATTCAAGTGGAGGGAAGAGATGTTGGGGTTGAGTTATCA ATACCAGAAGTTAGGCGTTTTGAGATGGAAGAGTTGTCTCTGGCCACAAAAAATTTTGAT GATAAAAACTTGATTGGGGTAGGGAAATTCGGAGAGGTATATAAGGGCTTGCTTCAGGAT GGAATGTTGGTTGCCATCAAAAAACGACCTGGAGCACCGAGTCAGGATTTTATAAATGAG GTACACTTCCTCTCATCTATTCAACATCGGAATCTTGTGACTCTTCTGGGCTACTGTCAG GAAAATAATCTACAGTTTCTTATATACGAGTATATACCAAATGGAAGTGTTTCCATTCAC TTGTATGGTAACTCTCTATCCGGTCTCTAA
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>LITCHI020851.m1 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGAAQDSRQKLEFKHRLSI ALGAAKGLAHLHSLSPRLVHKDFKTANVLVDENFISKVADAGLRNFLGRIDVAGPSSQVT ADEIFLAPEYYYFDSPCLCANLSDILFYHLFHCSLMQGKRIQ. >LITCHI020851.m2 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGAAQDSRQKLEFKHRLSI ALGAAKGLAHLHSLSPRLVHKDFKTANVLVDENFISKVADAGLRNFLGRIDVAGPSSQVT ADEIFLAPEVKEFSRFSEKSDVYSFGVFLLELVTGREASDSASLDTSKNLVELVQNSQEL STLSDIIDQKLGNSFTPEGMDDFIQLIARCLEPSSERRPSMSYVVMELDRTLDREMSLTI VMGEGTPTVTLGSQLFRATK. >LITCHI020851.m3 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGAAQDSRQKLEFKHRLSI ALGAAKGDPLQNQSGSSSLSESPFGT. >LITCHI020851.m4 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGAAQDSRQKLEFKHRLSI ALGAAKGDPLQNQSGSSSLSESPFGT. >LITCHI020851.m5 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGAAQDSRQKLEFKHRLSI ALGAAKGDPLQNQ. >LITCHI020851.m6 MSASLAAIIGGAAGAVALGIVIFLIWFCLFHNRSVSRTSETGSSDPSIQVEGRDVGVELS IPEVRRFEMEELSLATKNFDDKNLIGVGKFGEVYKGLLQDGMLVAIKKRPGAPSQDFINE VHFLSSIQHRNLVTLLGYCQENNLQFLIYEYIPNGSVSIHLYGNSLSGL.
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>LITCHI020851.m6 GTTTAGCATCTGGTCTGTGCTGGCTGATACCCATCGGCCGCAAGCAATGCAAACCAACTC TTTTTTCTTTTTTTTTTTTCGAATACATAATTTTGTTTTCTCACTTCCTCAGTTCTGAAA AAAATCATCATTGATATGGGCTAAGAATGACGAGAATCCAAAGTGTTTTCATGTTAAAAA AAAAAAAAAAATTAGATTAAAAAAATCCAAAAGTTTGCAGAGCTGTGGAGGAGGTAGCCG TTGTATCTCTTTTGCTTTTATAGTTTTTATGCAAAATATTTTATAAACTATTGTAATAAT AATAATAATTATTATTATCATATATGTTCACATACAATACACAACAAATATAATTTAATA TTATTATTATAGGAATCAGTAGGAGCAATGTCAACATAGCTGGCTGGTGGGGATGACTGC CCCACACGCTACAGCTTTGAATCTCTCTCTATCTCTATTATTCCTGCATTAAATTTATCA TATCAGAGTTCATGAGAATGAATTTATGTGAATTTTAATGTGTACTCTAACTGCTAAGCT GTGCTTGATATATATATATATATATATAATATATATATTTGTTGGTTGTACTACTGTGTG TGAATTTGTATCTGTTACAGCCAAGATGGTCTGTACAAGACAGAAAATAAAAACTTGCTT TCAACTTGCAGTACCAGACAAGTATATATGATACTGCTTTACAGCCCACAAAAATACTAT ATTAAAATTACTAGAAGAGAAAAAAAAAAAAAAACCACCCCTTTTCTTGCTTTTATTCGT TCTCATCTTTCTTGTTGATAATCATCTTTGAATTCGTTCTCGGCTTGTAAATGGGTCATG GAAAAATTGGATTTTTTAAGGGATTTTATTCGTTTTAATTTTTGCCCTTTTTGTGGGGTT TGATTGTGTATGTGCGTGGATATATGATTTTTGTGGGTTTTGAAATGGGTGGTTTGGTGG 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