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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020828 | Chr12 | 17642404 | 17647042 | + | Transcription factor ICE1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020828.m1 | 300 | 342 | PF00010.29 | HLH | Domain | 36 | 5.60E-09 |
LITCHI020828.m2 | 300 | 342 | PF00010.29 | HLH | Domain | 36 | 5.50E-09 |
LITCHI020828.m3 | 300 | 342 | PF00010.29 | HLH | Domain | 36.3 | 4.40E-09 |
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>LITCHI020828.m1 ATGGTTTTGGGTGCAAACGGCATCGCTTGGATGGACGACGGTGAACAGCGAGACGACTCT GTTTCTTCTTGGACCAGAACCACCACCACCAATAACAACAACAACAGCAATGAAGTAGTG GAGGCCAAAGAAGAGGACATATCCATGGCTGCTGGTGGTTCGCTCTCTGCTTTCAAGTCC CTGCTTGAAACTGACTGGTTCATGACCTCCAGTTTGAACCCACCTCACCATCATGATTTC AACACCAGCTTGGAGACCCACCACCAAACTTTGAATGGTTTCTCTGATAACAACCTTCTT CTCCACCCAGTAGACTCCTCTTCTTCCTTCACTCTCAACCCCTCACACTCACACCAGTTG TCTCTTCTAAACACCAACAACGACAATACCATTACCAACACCAACAACCACCCTTTTGTC AGTGGCTTCGATTTGGGTTGTGAGGCTGCTTTTGTCGGCCAGTTAAGCCAGACCCCGAAT TTCATGGGTCTAACAAGCCAGATTTGTGCTGCTCCTGACTCCGGTTTCCAGGGTCTGAAT TCTTACAGCTGTTTTGACGGTCTCGATGGTCTATTTTTCAACAACAACAATAGGTCTAAT TCTAAAGCATGTCCACAGCCGATTCTATTCGAAAAACGAGCTGCTTCGAGACAGAATTGC GGTAAATTAGACAATTTAGAGATATTTGGAGGGAATTTCTCAGACAGGAAGATTGAAAAG ATGGCGGAGGCGAGTTTGGATATTTCAGGTTTGAATTATGATTCGGATGAGTATAACAAC AATAGCAATAATGTGGATGGCAAGATGGAGGAGAGTGTAAAGATTTCCAATGCGAATAGT AGTGTCACTGGTGGGGATTTTAAAGGCAAGAAGAAGGGTTTGCCTGCCAAGAATTTGATG GCTGAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTTTACATGCTCAGGTCTGTTGTG CCCAAGATTAGCAAGATGGATAGGGCATCAATACTTGGTGATACAATCGATTACTTAAAG GAGCTTCTTCAAAGGATCAATGAACTCCATAATGAATTGGAGTCAAGCCCAACAGCAGCT GGTTCTCTGATGCCTTCTACAAGTTTTCAACCTTTGACTCCGACTCCACCTACCCTTCCT TGCCGTGTGAAGGAGGAACTATGCCCGAGTCCTAAAAACGAACCTGCAAGGGTGGAGGTT AGGGTGAGGGAAGGAAGGGCTGTCAACATCCACATGTTTTGTGTCCGCAGACCAGGTCTC TTGCTCTCCACCATGAGAGCTCTGGACAACCTTGGTTTAGACATTCAGCAAGCTGTCATC AGCTGTTTCAATGGTTTTGCACTGGATGTGTTCAGAGCTGAGCAATGCAGGGAAGGCCAG GATGTCTTGCCCAAGCAGATCCAAGCAGTACTTCTAGATACGGCTGGCTACCATGGTGTG ATGTGA >LITCHI020828.m2 ATGGTTTTGGGTGCAAACGGCATCGCTTGGATGGACGACGGTGAACAGCGAGACGACTCT GTTTCTTCTTGGACCAGAACCACCACCACCAATAACAACAACAACAGCAATGAAGTAGTG GAGGCCAAAGAAGAGGACATATCCATGGCTGCTGGTGGTTCGCTCTCTGCTTTCAAGTCC CTGCTTGAAACTGACTGGTTCATGACCTCCAGTTTGAACCCACCTCACCATCATGATTTC AACACCAGCTTGGAGACCCACCACCAAACTTTGAATGGTTTCTCTGATAACAACCTTCTT CTCCACCCAGTAGACTCCTCTTCTTCCTTCACTCTCAACCCCTCACACTCACACCAGTTG TCTCTTCTAAACACCAACAACGACAATACCATTACCAACACCAACAACCACCCTTTTGTC AGTGGCTTCGATTTGGGTTGTGAGGCTGCTTTTGTCGGCCAGTTAAGCCAGACCCCGAAT TTCATGGGTCTAACAAGCCAGATTTGTGCTGCTCCTGACTCCGGTTTCCAGGGTCTGAAT TCTTACAGCTGTTTTGACGGTCTCGATGGTCTATTTTTCAACAACAACAATAGGTCTAAT TCTAAAGCATGTCCACAGCCGATTCTATTCGAAAAACGAGCTGCTTCGAGACAGAATTGC GGTAAATTAGACAATTTAGAGATATTTGGAGGGAATTTCTCAGACAGGAAGATTGAAAAG ATGGCGGAGGCGAGTTTGGATATTTCAGGTTTGAATTATGATTCGGATGAGTATAACAAC AATAGCAATAATGTGGATGGCAAGATGGAGGAGAGTGTAAAGATTTCCAATGCGAATAGT AGTGTCACTGGTGGGGATTTTAAAGGCAAGAAGAAGGGTTTGCCTGCCAAGAATTTGATG GCTGAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTTTACATGCTCAGGTCTGTTGTG CCCAAGATTAGCAAGATGGATAGGGCATCAATACTTGGTGATACAATCGATTACTTAAAG GAGCTTCTTCAAAGGATCAATGAACTCCATAATGAATTGGAGTCAAGCCCAACAGCAGCT GGTTCTCTGATGCCTTCTACAAGTTTTCAACCTTTGACTCCGACTCCACCTACCCTTCCT TGCCGTGTGAAGGAGGAACTATGCCCGAGTCCTAAAAACGAACCTGCAAGGGTGGAGGTT AGGGTGAGGGAAGGAAGGGCTGTCAACATCCACATGTTTTGTGTCCGCAGACCAGGTCTC TTGCTCTCCACCATGAGAGCTCTGGACAACCTTGGTTTAGACATTCAGCAAGCTGTCATC AGCTGTTTCAATGGTTTTGCACTGGATGTGTTCAGAGCTGAGGTATGCATCTCTCTCTGT TTTTGTCAGCCGCTTCTGTCACACTATTTTTTGATGAAGAAGCGTAAATGA >LITCHI020828.m3 ATGGTTTTGGGTGCAAACGGCATCGCTTGGATGGACGACGGTGAACAGCGAGACGACTCT GTTTCTTCTTGGACCAGAACCACCACCACCAATAACAACAACAACAGCAATGAAGTAGTG GAGGCCAAAGAAGAGGACATATCCATGGCTGCTGGTGGTTCGCTCTCTGCTTTCAAGTCC CTGCTTGAAACTGACTGGTTCATGACCTCCAGTTTGAACCCACCTCACCATCATGATTTC AACACCAGCTTGGAGACCCACCACCAAACTTTGAATGGTTTCTCTGATAACAACCTTCTT CTCCACCCAGTAGACTCCTCTTCTTCCTTCACTCTCAACCCCTCACACTCACACCAGTTG TCTCTTCTAAACACCAACAACGACAATACCATTACCAACACCAACAACCACCCTTTTGTC AGTGGCTTCGATTTGGGTTGTGAGGCTGCTTTTGTCGGCCAGTTAAGCCAGACCCCGAAT TTCATGGGTCTAACAAGCCAGATTTGTGCTGCTCCTGACTCCGGTTTCCAGGGTCTGAAT TCTTACAGCTGTTTTGACGGTCTCGATGGTCTATTTTTCAACAACAACAATAGGTCTAAT TCTAAAGCATGTCCACAGCCGATTCTATTCGAAAAACGAGCTGCTTCGAGACAGAATTGC GGTAAATTAGACAATTTAGAGATATTTGGAGGGAATTTCTCAGACAGGAAGATTGAAAAG ATGGCGGAGGCGAGTTTGGATATTTCAGGTTTGAATTATGATTCGGATGAGTATAACAAC AATAGCAATAATGTGGATGGCAAGATGGAGGAGAGTGTAAAGATTTCCAATGCGAATAGT AGTGTCACTGGTGGGGATTTTAAAGGCAAGAAGAAGGGTTTGCCTGCCAAGAATTTGATG GCTGAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTTTACATGCTCAGGTCTGTTGTG CCCAAGATTAGCAAGATGGATAGGGCATCAATACTTGGTGATACAATCGATTACTTAAAG GAGCTTCTTCAAAGGATCAATGAACTCCATAATGAATTGGAGTCAAGCCCAACAGCAGCT GGTTCTCTGATGCCTTCTACAAGTTTTCAACCTTTGACTCCGACTCCACCTACCCTTCCT TGCCGTGTGAAGGAGGAACTATGCCCGAGTCCTAAAAACGAACCTGCAAGGGTAATTTCT ATTAATAACATAGTTTATTAA
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