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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI020826Chr121761744617622073+Transcription factor ICE1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI020826.m1300342PF00010.29HLHDomain365.60E-09
LITCHI020826.m2326368PF00010.29HLHDomain36.24.80E-09
LITCHI020826.m3300342PF00010.29HLHDomain365.50E-09
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>LITCHI020826.m1
ATGGTTTTGGGTGCAAACGGCATCGCTTGGATGGACGACGGTGAACAGCGAGACGACTCT
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GAGGCCAAAGAAGAGGACATATCCATGGCTGCTGGTGGTTCGCTCTCTGCTTTCAAGTCC
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ATGTGA
>LITCHI020826.m2
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CGCATAACGTTCAAACTTGGAATCTATTTCTCTTCTCATCTGTCCATTTCCTCTCACAAC
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>LITCHI020826.m3
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GCTGAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGCTCAATGATAGGCTTTACATGCTCAGGTCTGTTGTG
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GAGCTTCTTCAAAGGATCAATGAACTCCATAATGAATTGGAGTCAAGCCCAACAGCAGCT
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TTGCTCTCCACCATGAGAGCTCTGGACAACCTTGGTTTAGACATTCAGCAAGCTGTCATC
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TTTTGTCAGCCGCTTCTGTCACACTATTTTTTGATGAAGAAGCGTAAATGA
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>LITCHI020826.m1
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>LITCHI020826.m2
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>LITCHI020826.m3
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>LITCHI020398.m1
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CTTTTATTTTTGGATTTTTCAGATCTTTAATAGATATAGTTTTGGTACTTAGCTACTACG
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CTTCTGTCCCAGGGACCGAAAGTATCCAAATGGATCAAGAACAAACAGAGCCACCAAAGC
TGGCTACTGGAAAGCCACTGGAAAAGACCGTAAGGTTGTTTGTCAATCTGCTTCTGTAAC
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TTCATCTGGAGAACAAAAGGCCAAGAGAGTTGGGAGTAGTTCAAGCATTGTGGATTTGAC
CTCAACTAAAGTTTCCAATGAGCCCTTGAGCAGCTCTGGTGACATTTGTTCTCAAGCAAG
TTGCCTGTACAATGAGAGTCAGTATTCAAGTCCCGTTGCTTCTCCTTATGATTATGTAGT
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CCCACCGGACCTAATTCTTGACTCTTCAAAGGACTATCCACAGGTCCATGAAACTGCATC
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AGAGCACAGAGAATTCTCGCCTAGTTCATCATTCTCAAATTTTACCGGAGAAGTTGAATT
TGTAGAGGATCTCAGTCGAATCAGCTGCATGTCACCGTACTCGGGATATGCAAACTACAC
AAGTTTTAACGGGAATGAGGATATTTCCTATGAAGGTTATGACCAAACCAATTCACTAAA
TTATCCCAACCTATTCTGA
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>LITCHI020398.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TTTAAAATAATTTTTGAATATAATATGAATGGAAAATGTAGCATTTTTTATTTTCAATAA
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AAAACATCTTAATGTCTAGAAACATACTCATAAACTTTTATATCGAACAAAAATGCTAAA
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AGGATAAAATTTAGGTGACTTAGTTAGAATTCCCTACACAGACACATTGAACATGGGTTC
AAATATTGTGTCGTCGTTCAAATCACAATTTGTTTCGTGAGACAAAAACCAATAGAAAGC
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TAATAATTCCCATAATAAATATAAAATATTTTTAATTCAATCAGTCATCTATTATTAATA
TATGAAAAATATGAGTAATAAAGATATGAATGTTATTTTTTGAAATAGAAAACCGCCAAA
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CGGTGTTTGTTTTTTTGGACCTGTTTGCCTTCTCAGTTCTCCCCATTCCTGTTACTATAT
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TTTTTTTTTTTTGAGTTTCTCTTTCTTTTTCTGTTTAATTTTGTTTTGTTTATCCTTTAT
ATTTGAAATAGAAAAAAAAA
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>LITCHI011739.m1 GenomeSequence - 
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ATATAAAAATTATCAGGCAGAAACCATCTTTATATTTTCTATCTGCTCCTAATTAATTGT
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CTCCCATTTTTCATACATCGCTATAAACCGTATATGGTAAGTACTCTATCTCTATAATAT
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ATGAGTCTAGTTGGGGCGGTCTACTACATGATCATATATTTGATTTCAATCATTCTCTCC
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ATCACCATCAAACACCACCAGAGCTTGTCTTCAATCTCCACCCCTCTTCTGTGCTCCCAA
ATTCATCAACCATCTCCTTGGCAGGCCTCCCAGCGGATCCCTTGTTCCACTTGAACCTCT
CCCCACATCACCACCATGATGACATTGATGCTTGTACTGGTAGAGGGAGGCATGTTAATG
GCAAGAGAAAAAAACCCTTAACTGCAGAGCGCCAAAGAAGAGAACAGTTGAATAGCAAGT
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TCAGGTCCACGATTCAGGATTTCGTTTCCCAAGTAAGCGAAATAGATAAATTGTTTTTTT
TATTTTTTTATTTTTTCAATTTATAATAAAAGATTTAAACAATATCTAGAACGCACACTA
GGAATTACTATATATTTTAACAAAATTCAGTACCAAAATGTGCTCTATAGATTAATATTT
TTCTGCATGTTTTAATTATACATGATATGTAGCCTGATAAAGCATCAGTGGTGGGAGATG
CTATTGAGTACATAAGAGAGCTTCTAGGAACAGTTAATGAGCTGAAGAAAATGGTGGAGA
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GCTCCTGGCTGCAGAGGAAATCCAATGATGTAGAGGTTGATGTTCGTGTCGTGGACGATG
AAGTGACCATCAAACTTGTTCAACCAAAGAAGATTGATTGCTTGCTGCTTGTTTCCAAGG
CTCTTGATGATCTTCACTTGGATCTTCACTATGTTGCTGGTGGCCAAATTGGTGGCTACT
ACAGTTTTTTGTTCAACACCAAGGTTTGAACTTGATCCTCTATAATATTATAGAAAAGGT
TAGACCGTTCTGATTTTTTTTAAATCTAGATTGACTTATTTTGAGTATGTTGAAGACTAT
CAATTAGCTTTTGATTAATTGAGATTGATTGAGGAATATTTGAAAATGATTATGTTACAT
TTCCTACTCTACATTCCGTAGTTTATATACTTGCACTATTGATTGAATAAAATATAACAA
TATCTTTCTTTCTCTCATTTATTATATATAATATTATATTATATAAAGAAAATATTATAC
GTGTAGACTATCCTGATTTTTTTGAAATCCAAATTAACTTATTTTGAGTATATTGAAATC
AACTATCAATTAGCTCTTGATTGATTGAGATTAATTGAAGAAAATTTGAAAATGATTCTG
TTATAATTTCGACTCCACGTTTAGTAGTTTACATACTTGCACCCTTGCATTACTGAATAA
AATATAACAATATCCTTTTTTCCCTCATTTTCTACCAACTTTTATACTTTTTGTTATCAA
AGTAGGACAAGTGGATGAATACAAAATACTTTTGAATATATTAGCATATCGTTAAGGCTT
GAACTTTTTGAAAAAAGTGAGTGTGTCCACAGGAGAGGATTACTATTATATAATGTTTTG
GATTTTGCAGATGCATGAAGGTTCTTGTGTTTATGCTGGTGCCATAGCCAACAAACTCAT
TGAGGTCATGGACTGCAAGTTTGAGGGAAGTGGTGTTTCCGTGGCGGACGGGTGA