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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020792 | Chr12 | 17278781;17280475 | 17282814 | + | Serine/threonine-protein kinase PBS1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020792.m1 | 62 | 332 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 164.8 | 2.70E-48 |
LITCHI020792.m1 | 64 | 334 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 150.4 | 5.80E-44 |
LITCHI020792.m2 | 3 | 172 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 78.1 | 7.10E-22 |
LITCHI020792.m2 | 7 | 170 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 94.5 | 7.30E-27 |
LITCHI020792.m3 | 62 | 272 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 157.6 | 4.20E-46 |
LITCHI020792.m3 | 64 | 268 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 145.9 | 1.40E-42 |
LITCHI020792.m4 | 3 | 172 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 78.1 | 7.10E-22 |
LITCHI020792.m4 | 7 | 170 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 94.5 | 7.30E-27 |
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>LITCHI020792.m1 ATGGGTTATTGTGGCTGTTTCGGTTTTAGGAAGAAGGGACAGAAGCTGAAGACCGAAGAC AAGCAACATGTCGAGAAACCTGATGTGAAACAGGAATCAACACCTCAAAAAGTTAGATCG AATACTGATATCCAAGCTCAAATATTTACCTTTTGCGATCTTTCAAATGCAACAAATAAT TTTAGCGAAGACCGCTTCATCGGACGGGGTGGATTTGGAGTTGTTTACAAAGGGCAATTG GAAGGCACTGGTCAGGTTGTAGCGATAAAAAAACTAGATCACTCTGGTTTCCAAGGGGAG AAGGAGTTTCTGGTGGAGGTTCTAATGCTTTCTCTTATGCATCACCCGAATCTTGTCAAA TTAATCGGTTACTGTGCTGAAGGGGTCCAGCGTCTCCTTGTCTATGAGTACATGCCCCAA GGATCCTTGGAAGATCACCTCCTTGATGTTGCTCCTGATCAGGAGCCTTTAGATTGGAAT ACAAGGATGATGATAGCTTTTGGTGCAGCAAAGGGATTGGAATATCTGCACACTGAAGCA GATCCTCCTGTTATATACAGGGACTTGAAATCAGCTAACATATTGCTGGGTGAGGGCTTC CACCCGAAACTCTCTGATTTTGGACTTGCGAAATTCGGCCCAACTGGTGATAAATCACAT GTTTCCACCAGGGTCATGGGCACCCATGGCTACTGTGCCCCCGAGTACGCCAAAACAGGA AAATTGACAATCAAGTCTGACATTTACAGTTTTGGTATAGTCTTATTGGAGCTCATTACA GGACGTCCAGCAATGGATGATTGTCGTGGTCACGAAAGAATGCTTGTTGATTGGGCACGT CCCCGGTTCAAAGACAAAAGTAGTATATGGACGTTAGCAGATCCTCTGTTGAAAGGTGAG TTCTCAGAATCCATTTTCAAGAAGGTCCTGGAGGTTGCATTCATGTGTGTCAATGAAAAT CCTGCCTTGCGGCCTTCCATCAGAGATGTGGTTCGTGCTCTTGATTACTTAGCTTCTCAC CGATATGACCCAAATGAGCCCAAAATGGTTCATACCAAGGGGACTGAAGGGCACAGCTCT CCAAGTGAGAAACCAAATATGTTAGACAAGGACCCAGACAGGGAGCGAGCTGTTGCAGAG GCCAAGTTGTGGGGAGAAACTTTGCGAGAGCAAAGACTGCGAAACATGCAGAATTGCATA TGA >LITCHI020792.m2 ATGATGATAGCTTTTGGTGCAGCAAAGGGATTGGAATATCTGCACACTGAAGCAGATCCT CCTGTTATATACAGGGACTTGAAATCAGCTAACATATTGCTGGGTGAGGGCTTCCACCCG AAACTCTCTGATTTTGGACTTGCGAAATTCGGCCCAACTGGTGATAAATCACATGTTTCC ACCAGGGTCATGGGCACCCATGGCTACTGTGCCCCCGAGTACGCCAAAACAGGAAAATTG ACAATCAAGTCTGACATTTACAGTTTTGGTATAGTCTTATTGGAGCTCATTACAGGACGT CCAGCAATGGATGATTGTCGTGGTCACGAAAGAATGCTTGTTGATTGGGCACGTCCCCGG TTCAAAGACAAAAGTAGTATATGGACGTTAGCAGATCCTCTGTTGAAAGGTGAGTTCTCA GAATCCATTTTCAAGAAGGTCCTGGAGGTTGCATTCATGTGTGTCAATGAAAATCCTGCC TTGCGGCCTTCCATCAGAGATGTGGTTCGTGCTCTTGATTACTTAGCTTCTCACCGATAT GACCCAAATGAGCCCAAAATGGTTCATACCAAGGGGACTGAAGGGCACAGCTCTCCAAGT GAGAAACCAAATATGTTAGACAAGGACCCAGACAGGGAGCGAGCTGTTGCAGAGGCCAAG TTGTGGGGAGAAACTTTGCGAGAGCAAAGACTGCGAAACATGCAGAATTGCATATGA >LITCHI020792.m3 ATGGGTTATTGTGGCTGTTTCGGTTTTAGGAAGAAGGGACAGAAGCTGAAGACCGAAGAC AAGCAACATGTCGAGAAACCTGATGTGAAACAGGAATCAACACCTCAAAAAGTTAGATCG AATACTGATATCCAAGCTCAAATATTTACCTTTTGCGATCTTTCAAATGCAACAAATAAT TTTAGCGAAGACCGCTTCATCGGACGGGGTGGATTTGGAGTTGTTTACAAAGGGCAATTG GAAGGCACTGGTCAGGTTGTAGCGATAAAAAAACTAGATCACTCTGGTTTCCAAGGGGAG AAGGAGTTTCTGGTGGAGGTTCTAATGCTTTCTCTTATGCATCACCCGAATCTTGTCAAA TTAATCGGTTACTGTGCTGAAGGGGTCCAGCGTCTCCTTGTCTATGAGTACATGCCCCAA GGATCCTTGGAAGATCACCTCCTTGATGTTGCTCCTGATCAGGAGCCTTTAGATTGGAAT ACAAGGATGATGATAGCTTTTGGTGCAGCAAAGGGATTGGAATATCTGCACACTGAAGCA GATCCTCCTGTTATATACAGGGACTTGAAATCAGCTAACATATTGCTGGGTGAGGGCTTC CACCCGAAACTCTCTGATTTTGGACTTGCGAAATTCGGCCCAACTGGTGATAAATCACAT GTTTCCACCAGGGTCATGGGCACCCATGGCTACTGTGCCCCCGAGTACGCCAAAACAGGA AAATTGACAATCAAGTCTGACATTTACAGTTTTGGTATAGTCTTATTGGAGCTCATTACA GGACGTCCAGCAATGGATGATTGTCGTGGTCACGAAAGAATGCTTGTTGATTGGGTAGCA CACTTCTTGAACTTCTTAGTTATCAATTTTCCATTACTTCTTAAAACTCTGATTTCTAAA TTAAATTTGTTTCTCCTTACCATTTACCTGCAAAGTCAGCATAGCCACATGTAG >LITCHI020792.m4 ATGATGATAGCTTTTGGTGCAGCAAAGGGATTGGAATATCTGCACACTGAAGCAGATCCT CCTGTTATATACAGGGACTTGAAATCAGCTAACATATTGCTGGGTGAGGGCTTCCACCCG AAACTCTCTGATTTTGGACTTGCGAAATTCGGCCCAACTGGTGATAAATCACATGTTTCC ACCAGGGTCATGGGCACCCATGGCTACTGTGCCCCCGAGTACGCCAAAACAGGAAAATTG ACAATCAAGTCTGACATTTACAGTTTTGGTATAGTCTTATTGGAGCTCATTACAGGACGT CCAGCAATGGATGATTGTCGTGGTCACGAAAGAATGCTTGTTGATTGGGCACGTCCCCGG TTCAAAGACAAAAGTAGTATATGGACGTTAGCAGATCCTCTGTTGAAAGGTGAGTTCTCA GAATCCATTTTCAAGAAGGTCCTGGAGGTTGCATTCATGTGTGTCAATGAAAATCCTGCC TTGCGGCCTTCCATCAGAGATGTGGTTCGTGCTCTTGATTACTTAGCTTCTCACCGATAT GACCCAAATGAGCCCAAAATGGTTCATACCAAGGGGACTGAAGGGCACAGCTCTCCAAGT GAGAAACCAAATATGTTAGACAAGGACCCAGACAGGGAGCGAGCTGTTGCAGAGGCCAAG TTGTGGGGAGAAACTTTGCGAGAGCAAAGACTGCGAAACATGCAGAATTGCATATGA
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>LITCHI020792.m1 CGATTGTAGTTAGTATAAGGTAGGTGACGTAATGCAAAAAAGTGGAAATCCTGTGTCACC CAAAAAAAAAATAAACGTGTAATAGAAGTCGAGCGTTTTTACTCGTAAGCGTGTGCTTTT GCATTGCCAACAACACATGAACTAACACACCCCAACGAAACCACCTCTTGTGTTTTTCAT TTTTTTTATTTCATTTCTTGCGTTTAGATTTTCGATTTCAATTTTCATTCTCGCTGATCT TTTCGTGTCATTATCAGTCATTGTCAGGTGCAGTGTGGGATTCAGTGCATTGCAACAACC CAAAAAAAGAAAAAAAAACGAGAACAATACATTTTTATTTTTTGTTTTGGAAAACCGCTT TTGATTCTATAGAAGGAAAGCGAATGGGTTATTGTGGCTGTTTCGGTTTTAGGAAGAAGG GACAGAAGCTGAAGACCGAAGACAAGCAACATGTCGAGAAACCTGATGTGAAACAGGAAT CAACACCTCAAAAAGTTAGATCGAATACTGATATCCAAGCTCAAATATTTACCTTTTGCG ATCTTTCAAATGCAACAAATAATTTTAGCGAAGACCGCTTCATCGGACGGGGTGGATTTG GAGTTGTTTACAAAGGGCAATTGGAAGGCACTGGTCAGGTTGTAGCGATAAAAAAACTAG ATCACTCTGGTTTCCAAGGGGAGAAGGAGTTTCTGGTGGAGGTTCTAATGCTTTCTCTTA TGCATCACCCGAATCTTGTCAAATTAATCGGTTACTGTGCTGAAGGGGTCCAGCGTCTCC TTGTCTATGAGTACATGCCCCAAGGATCCTTGGAAGATCACCTCCTTGATGTTGCTCCTG ATCAGGAGCCTTTAGATTGGAATACAAGGATGATGATAGCTTTTGGTGCAGCAAAGGGAT TGGAATATCTGCACACTGAAGCAGATCCTCCTGTTATATACAGGGACTTGAAATCAGCTA 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