Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020739 | Chr12 | 16904912 | 16907884 | + | SWI/SNF complex component SNF12 homolog |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020739.m1 | 327 | 398 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 80.1 | 8.70E-23 |
LITCHI020739.m2 | 327 | 398 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 80.2 | 8.20E-23 |
LITCHI020739.m3 | 327 | 398 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 80.1 | 8.70E-23 |
Download Copy
>LITCHI020739.m1 ATGTCTGTCAACAACAATAATAATCCAGGGAAGAGCCTGGGGTCTTCTTCGTCGCATTTT GGTAATGCCGGGATGGCTAGTCCGTCCATGCCTGCGAATCCCAGTTTTCAACAGTCACAA GCTCAGGGACAGATGGGTGCTGGGTTCCAAAACCAGTTTCAGCTGTCCCAAGCGGCTCTA GCACAGGCTGCACAGCAGTCGAAAATGCAGGCTCATGTCCAAGCTGCACATGCCCAATTC CAGGCTCATTTACAAGCTCAAGGGATTTCCATTAACCAAATGCAGAATGCCGGTATTGGA AGCTTAGGGTCATCTTCGCCCTCTAATATGACTCCTGGAAATGCGAGTCTGAAAAGGATG CCTCAGAAGCCCCCCGTGCGTCCTCCTGGGGTTCCCATGATGAACACAATTTCCCCTCTG AAAGCTATGGAACTTATGCCTGCTGCTCGTAGGAAGAAGCAGAAGCTTCCTGAGAAACAG TTACAAGATAGAGTGGCAGCGATTCTGCCTGAGTCTGCCCTGTATACTCAGCTCCTTGAG TTCGAGGCTCATGTTGATGCTGCTATGGCTAGAAAGAAGGTTGACATCCAAGAGGCACTT AAGAACCCTCCTTGCGTGCAGAAAACCCTTCGGATTTATATTTTTAATACATTTGCTAAT CAGATTAAAACGATCCCAAAGAAGCCGAACGCTGAGCCCCCCACTTGGACACTTAAGATA ATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGGGTAGATCCAGACCAACCTGGAGTGGTTCAGCAATCA AATCCCTTTTACCCGAAGTTCTCTTCTTTCTTCAGAAGAGTAACCATTTCCTTGGACCAG AGACTGTACCCTGAAAACCATATTATTACATGGGAATATGCTAGATCACCTGCACCTCAC GAGGGTTTTGAGGTAAAGAGAAAAGGGGATAAAGAGTTTACTGCAAATATTAGGTTGGAA ATGAATTATGTGCCTGAGAAATTTAAGCTTTCTCAGGCTTTGATGGAGGTTCTTGGTATT GAAGTCGATACTCGCCCTAGAATTATAGCTGCCATCTGGCATTATGTGAAGGCTAGAAAA TTGCAGAACCCGAATGACCCTTCATACTTTAATTGTGATCCACCTCTTCAGAAAGTATTT GGGGAGGAAAAGATGAAGTTCACTATGGTTTCACATAGGATATCACATCATTTGTCTCCT CCGCAACCCATACTTTTGGAGCATGCAATTAAGCTTTCGGGGAATAATCCAGTTGGATCT GTATGCTATGATGTGTTGGTTGATGTGCCATTTCCCATACAGAGGGAGTTATCTGCCTTA TTGGCCAATGCTGAAAAGAACAAAGAGATTGATCAATGCGATGAAGCAATATGTGCAGCA GTCAGAAAAATCCATGAGCACCGAAAGAGGAGGGCATTCTTTCTAGGGTTCAGTCAATCT CCTGTTGAATTTATTAATGCATTGATTGAATCTCAAAGCAGGGATTTGAAGCTTGGATCT GGAGAAGCTAGTCGAAATGCTGAGAAAGAGCGTCGATCAGATTTCTTCAACCAACCATGG GTTGAAGATGCTGTTATTCGCTATTTGAACCGCAAGCCAGCTGCAGGAAGTGATGCCCCT GGAAGCACATAA >LITCHI020739.m2 ATGTCTGTCAACAACAATAATAATCCAGGGAAGAGCCTGGGGTCTTCTTCGTCGCATTTT GGTAATGCCGGGATGGCTAGTCCGTCCATGCCTGCGAATCCCAGTTTTCAACAGTCACAA GCTCAGGGACAGATGGGTGCTGGGTTCCAAAACCAGTTTCAGCTGTCCCAAGCGGCTCTA GCACAGGCTGCACAGCAGTCGAAAATGCAGGCTCATGTCCAAGCTGCACATGCCCAATTC CAGGCTCATTTACAAGCTCAAGGGATTTCCATTAACCAAATGCAGAATGCCGGTATTGGA AGCTTAGGGTCATCTTCGCCCTCTAATATGACTCCTGGAAATGCGAGTCTGAAAAGGATG CCTCAGAAGCCCCCCGTGCGTCCTCCTGGGGTTCCCATGATGAACACAATTTCCCCTCTG AAAGCTATGGAACTTATGCCTGCTGCTCGTAGGAAGAAGCAGAAGCTTCCTGAGAAACAG TTACAAGATAGAGTGGCAGCGATTCTGCCTGAGTCTGCCCTGTATACTCAGCTCCTTGAG TTCGAGGCTCATGTTGATGCTGCTATGGCTAGAAAGAAGGTTGACATCCAAGAGGCACTT AAGAACCCTCCTTGCGTGCAGAAAACCCTTCGGATTTATATTTTTAATACATTTGCTAAT CAGATTAAAACGATCCCAAAGAAGCCGAACGCTGAGCCCCCCACTTGGACACTTAAGATA ATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGGGTAGATCCAGACCAACCTGGAGTGGTTCAGCAATCA AATCCCTTTTACCCGAAGTTCTCTTCTTTCTTCAGAAGAGTAACCATTTCCTTGGACCAG AGACTGTACCCTGAAAACCATATTATTACATGGGAATATGCTAGATCACCTGCACCTCAC GAGGGTTTTGAGGTAAAGAGAAAAGGGGATAAAGAGTTTACTGCAAATATTAGGTTGGAA ATGAATTATGTGCCTGAGAAATTTAAGCTTTCTCAGGCTTTGATGGAGGTTCTTGGTATT GAAGTCGATACTCGCCCTAGAATTATAGCTGCCATCTGGCATTATGTGAAGGCTAGAAAA TTGCAGAACCCGAATGACCCTTCATACTTTAATTGTGATCCACCTCTTCAGAAAGTATTT GGGGAGGAAAAGATGAAGTTCACTATGGTTTCACATAGGATATCACATCATTTGTCTCCT CCGCAACCCATACTTTTGGAGCATGCAATTAAGCTTTCGGGGAATAATCCAGTTGGATCT GTATGCTATGATGTGTTGGTTGATGTGCCATTTCCCATACAGAGGGAGTTATCTGCCTTA TTGGCCAATGCTGAAAAGAACAAAGAGATTGATCAATGCGATGAAGCAATATGTGCAGCA GTCAGAAAAATCCATGAGCACCGAAAGAGGAGGGCATTCTTTCTAGGGTTCAGTCAATCT CCTGTTGAATTTATTAATGCATTGATTGAATCTCAAAGCAGGGATTTGAAGCTTGGATCT GGAGAAGCTAGTCGAAATGCTGAGAAAGAGCGTCGATCAGATTTCTTCAACCAACCATGG TAA >LITCHI020739.m3 ATGTCTGTCAACAACAATAATAATCCAGGGAAGAGCCTGGGGTCTTCTTCGTCGCATTTT GGTAATGCCGGGATGGCTAGTCCGTCCATGCCTGCGAATCCCAGTTTTCAACAGTCACAA GCTCAGGGACAGATGGGTGCTGGGTTCCAAAACCAGTTTCAGCTGTCCCAAGCGGCTCTA GCACAGGCTGCACAGCAGTCGAAAATGCAGGCTCATGTCCAAGCTGCACATGCCCAATTC CAGGCTCATTTACAAGCTCAAGGGATTTCCATTAACCAAATGCAGAATGCCGGTATTGGA AGCTTAGGGTCATCTTCGCCCTCTAATATGACTCCTGGAAATGCGAGTCTGAAAAGGATG CCTCAGAAGCCCCCCGTGCGTCCTCCTGGGGTTCCCATGATGAACACAATTTCCCCTCTG AAAGCTATGGAACTTATGCCTGCTGCTCGTAGGAAGAAGCAGAAGCTTCCTGAGAAACAG TTACAAGATAGAGTGGCAGCGATTCTGCCTGAGTCTGCCCTGTATACTCAGCTCCTTGAG TTCGAGGCTCATGTTGATGCTGCTATGGCTAGAAAGAAGGTTGACATCCAAGAGGCACTT AAGAACCCTCCTTGCGTGCAGAAAACCCTTCGGATTTATATTTTTAATACATTTGCTAAT CAGATTAAAACGATCCCAAAGAAGCCGAACGCTGAGCCCCCCACTTGGACACTTAAGATA ATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGGGTAGATCCAGACCAACCTGGAGTGGTTCAGCAATCA AATCCCTTTTACCCGAAGTTCTCTTCTTTCTTCAGAAGAGTAACCATTTCCTTGGACCAG AGACTGTACCCTGAAAACCATATTATTACATGGGAATATGCTAGATCACCTGCACCTCAC GAGGGTTTTGAGGTAAAGAGAAAAGGGGATAAAGAGTTTACTGCAAATATTAGGTTGGAA ATGAATTATGTGCCTGAGAAATTTAAGCTTTCTCAGGCTTTGATGGAGGTTCTTGGTATT GAAGTCGATACTCGCCCTAGAATTATAGCTGCCATCTGGCATTATGTGAAGGCTAGAAAA TTGCAGAACCCGAATGACCCTTCATACTTTAATTGTGATCCACCTCTTCAGAAAGTATTT GGGGAGGAAAAGATGAAGTTCACTATGGTTTCACATAGGATATCACATCATTTGTCTCCT CCGCAACCCATACTTTTGGAGCATGCAATTAAGCTTTCGGGGAATAATCCAGTTGGATCT GTATGCTATGATGTGTTGGTTGATGTGCCATTTCCCATACAGAGGGAGTTATCTGCCTTA TTGGCCAATGCTGAAAAGAACAAAGAGATTGATCAATGCGATGAAGCAATATGTGCAGCA GTCAGAAAAATCCATGAGCACCGAAAGAGGAGGGCATTCTTTCTAGGGTTCAGTCAATCT CCTGTTGAATTTATTAATGCATTGATTGAATCTCAAAGCAGGGATTTGAAGCTTGGATCT GGAGAAGCTAGTCGAAATGCTGAGAAAGAGCGTCGATCAGATTTCTTCAACCAACCATGG GTTGAAGATGCTGTTATTCGCTATTTGAACCGCAAGCCAGCTGCAGGAAGTGATGCCCCT GGAAGCACATAA
Download Copy
>LITCHI003207.m1 MENYFEEILEPGPDCCIYRVPQFLRNINEEAYAPQLISIGPLHYGKKELMGMENQKRRYW SKFGQRVNAEKLNEFETYVKEQEQRIRDHYSVTSMLQSSEYVRMVLYDAIFIIELLLRNH EKTDDFLLKSPRVVDIRRDLLLLENQLPFFVLNHLYTKAFPNREKNQSLFVLFLEYLCGS NSGIYFGEHFSRVKHFIDFHRVILVECKPTTVGSDENGTYVPCATKLNKSGLKFRGINRK SMLDISLETRKQYGKWFPWFEVNELQIPTIIIDDDTECSLRNLMAFEMFHYPTETHICNY AFLMDRLIETEKDVDLLVEKGVIINHVGDNEAIAKIFNKLCSHIVLSKDSCYNDINKKIR AHYRYSWNHAKAAQRIFNLNPQNKREIICDEKLKAIFDGKDVVGFLEIGKLLSRHYV.
Download Copy
>LITCHI003227.m1 CTGGAACTGGACCCATATGTTGAAATTGGTTTGAAATTTGAAAGAAGTTGCACATAAAAT ACGAGTTACCATATGTGGTACCCAAAAAGTCAAAAACCTCGAGACATTTGAACTACACAT CTCTACTCCAACAGCAGACACCAGTACCAGCAAACCGAGACCACCATGTCGTCAGCTGCG GCCAGGGTTTTCAACGGCTGCCGAGCCCTCTTGGCGCCTGCCAGGGCCGCCTCCACCTCC GCAGCCACCAAAAAGAAAGCAATCACAACCACAACCACAGCAGCAGCAGCAGCCAAAAAG CCGAGAGCCAAATCTCCACCCAAGGGCAGAGCACACACCCCCAACCGAAGCGCTGGAATC TTCAAGGTCCTGCCCGTCTCTCCTGCTCTCGCCAACTTCGTAGGAGCCTCTGAAGCCTCC CGTGCCGAGTCCGTTCGCCAGATCTGGTCCTATATTAAGACCCACAACCTCCAGAACCCT CAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTTAAGGCAATCTTTGATGGAAAAGCT GTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGTCATTTTGTGTAGATCACTGAC TTCTGTTTCTAATATGACTTTTAGGTGCATGGATTTGAATTACTGTCTCAACATGTAACA AGTGAGCTCTCATGACTTTTCTCACAAATATTTTAGGGTGTTGTTATTCTGATACATGCT TTTGTATGAGAGCCGAACCCTTGGGTTGAGTTTGTGATTTCAATTTCTTAGCCTCACTTA TTGCTTATCTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTCCTTAGGTACGGCCTAACTCATTCGTATG CCAAATAACATGATGAAATAGAATTGATG
Download Copy
>LITCHI003227.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCCATTCCATTTAAAATAGATATGAATATTATTATTATTATATCATTGTTGGAGTAGGAA TGGATATATTCCTGATTTACATTTTATTTTCACATATGGGTAGGTGATAATCTATGGACA TTTATACCCGTCCCAATATGTTAGTAATTTTAATATTATATAAATATAATAAAATTTATT TTTATTATATATTTATTAAAAATGATTACACAAATTTCTTTCGAGTTTACTGTCGCCTGA AACCTAAAATCTATATTTTAATCTAACCTAAAACCTTAAAGCTGTCTTACAAAGTAAAAA CTAATAAGCTGCGATGCCGATAGGCCACTGGACTTCCAATTGCCGAATTTTATGGTTCTT TATCTGGTACTTGATTTCTTTTATTTATTCCATATTTAATAATTATTTCATTTTTCTTCT TTAATTATTGACGATGAATTAATCATTAATTTCCAAAACGTCTAATCTGTGAGATTACTT CAACAAGAATATACTTCGCAACCACGTGAAAATATGCAATTGTGAAATTGTTATAAAAAA AAAACTAGATGTTATAATTTGTATGGACAGCTTATGTATAGTTGCTTAGACATGGATCTT TAAAATTCAATTAATATGATTTTATGCTGCTTATGTACAGGTACGTAACACATTTTTCTT GAAGAATTTAACTAGTTGCGAATTATTATTATAGTTTATCTTGGTTTTTTAGAGTTTATG TAATTTGAACTTTTAATGGTTGCATTCAAGTGTTTAATCTTTTATGCTAACTTTCATGAG ATAATATTTTGTAGATGTATTTTGCTTTTGAATAATTGATATTGACAATAATTTTCATGA CACACTCAATCTAAAATATGACTTTATTTGTATTTTTAATATTCAATTTTGAGGATGTTA ATCACATATCCATCACCAGTTGTTAGTTATTTATTTATTTTTTCATGTAAAATATAATAA TTTAACATTTTTTATTAGATATAAAGGTGGACGGACCAGAGATGGACACATCTATTTAAA TTCAAATATTTACTCAAATTTGTCTTACTTATTATAACAAGAATCAAAATAAGAATGGAG ATATATATTTTAAACAGAGATAAATACCTTATTATCCATATCCAAGGACGGCTCCAAGGT ATTTGGGGCCTTAAGCGAACTTTTAAAACAAGGTTTTTTTTCAATTATTAAATCTCGTCT TGTTATCCGTTCTATCTCATCTCCCCGAATCAGAATACTATCAAGTATAATTGTTTTATA TAACTATCGTTTGTTTTGTTGATTGCTATATAATTTTCACATTCTTCATCAAAAGTGTAA TGTTGTTATTATTATATGCAATTTTATTTTTACCTTTTCATCATCTATTGTCTTAGTTAG AAATTATTGTTCATCTACTAAATTTTTCATTCAAGTTTATATTTTCGTTGTTGTTAACGA CAAATTTATCAAGAACTCCGTTTATGATTGAACTAATTTTTCTGTTCTTCTTTTTTTGGA GTTTTTTATATCCTTATTAATATTTTCTATTAAATATGTCTACTAATAATTATCAAAACT AACAAAAAAATTAATAATATGTAAAAAATTAATAAAAATTAAAAATACAAAAAAAAAATG TTAAAGTAATAGAGTTTAGAATAACAGAATCTAAAATTCGATGAACAATTAATATTATGA TCGATGATAATTATAATTATTATTAGTATACCATTTGTGCAAAATTTTCTAATTTTTTTA AATCATCATTTTACAAATTTTTCAAAAATAATACTATGAACAATTAAAAAATAAATAAAT AAAAGCATTTCCCATAAATATTGTTGGGCAGACTACTGGAACTGGACCCATATGTTGAAA TTGGTTTGAAATTTGAAAGAAGTTGCACATAAAATACGAGTTACCATATGTGGTACCCAA AAAGTCAAAAACCTCGAGACATTTGAACTACACATCTCTACTCCAACAGCAGACACCAGT ACCAGCAAACCGAGACCACC
Download Copy
>LITCHI003227.m1 GenomeSequence - CTGGAACTGGACCCATATGTTGAAATTGGTTTGAAATTTGAAAGAAGTTGCACATAAAAT ACGAGTTACCATATGTGGTACCCAAAAAGTCAAAAACCTCGAGACATTTGAACTACACAT CTCTACTCCAACAGCAGACACCAGTACCAGCAAACCGAGACCACCATGTCGTCAGCTGCG GCCAGGGTTTTCAACGGCTGCCGAGCCCTCTTGGCGCCTGCCAGGGCCGCCTCCACCTCC GCAGCCACCAAAAAGAAAGCAATCACAACCACAACCACAGCAGCAGCAGCAGCCAAAAAG CCGAGAGCCAAATCTCCACCCAAGGGCAGAGCACACACCCCCAACCGAAGCGCTGGAATC TTCAAGGTCCTGCCCGTCTCTCCTGCTCTCGCCAACTTCGTAGGAGCCTCTGAAGCCTCC CGTGCCGAGTCCGTTCGCCAGATCTGGTCCTATATTAAGACCCACAACCTCCAGGTCTCA TAACCCTACCCCTTTTTTTATTTTTCTCTCTCCTTTTTCTCTATTTTTGTTGAAATCGTG AATTTTGATTGCATTTCCCATCTGGGTTTGTCACATTTGTCGTTAAAACACTGTGCAATT GATAATGGAGTTGTTGCCTTTAGATTTCATTTTGTATTTTTAGGTGTTTTGGGCATATGA ATAATGAATTTGAGTGTCTGAAAGATTGTTTGTCTTCTTTAGTGGACCATGATTCAAACT AGAATGAATTTTCAGCCCTGCGATTTTGTGGGACTGTATATGGCAACCATGGGTAAACAA ACATGTCGTTATATCTACACACACCATCTTATATCTCTATTTGATGAAACAGGTTAACAA TTGACATTGTTATGTGCTTAAAGTTAACTCTTTGGGAGAGAGCTTACTCTTAGGGATGTC AACGAGGCCTGGGTTCCCAAATCCCTATATTCCTATATGAGGGGAGATTTTGAGGATTGG GTATAGGGATCCATCCCAGATATAAATGGGGATGGGATGTTGACCATCTCTCCATTTACC CATTTAAGTTTAATGAACAGCTTTTAGAAGAGACTACTTTTGTCTTTGCGATTGTATTAA TATTCAACTCAATAAGTATTAATTCAAAATTTATTTCCTTTGTCTAAAGTAATTCTTGGA TTTTTCTTTTGGACTACAAGTTAAGTAGAATTAATTAATTCTACTAAACTTGCACTCAAA ATAAAAAATTTTAGAATTATCTTGGCCAACAAAGAAAATAAATATTGAATTAATACTTAC TCGAAATCTAATACAATCGCAAAAGTACCCTATTCTAGATTCTGGAAATTGATAAATATT TTTTTAATATTTAAATTAAAATTAAATTGGGGAAATGGTGGAAATAGGGATGGGGTATAC GAAACGTCTTTATGTTTCTCTGACTGTACGGCCTCCTTAACAAGCCTATTTGATTAAAGG CCCCCATAAAATGCCCCTACCCCCATTTATATTTGGGGGTGGATTTTCATCCCCATCCAC AGTCCCAAAAAACTCCCAACATTTCCTTCCAAATGGGGAAAAGATTTAGGAACCTGTGGT CCCATACTCCCATTGACATCCATACCAAGTCTCTCTGTTATTGTTTCTTTGTGCCCTGCA ATTTAGAATGTTTTATTTTCAGCATCATTTGGAGTAATATACTTTGATCAGGCTTGACAA TCATTTGGTTCATATATATTACATATGGCTTTTAATTGAAGGGTTCATGGAATTGAAGTT CTGTAATCAAGGAAATTATTAGAATACCAAAATTTGCAGTACTTTAACATGTTGATGCCT TTGGTTGCAGAACCCTCAAAACAAACGGGAAATCATCTGTGATGAGAAGCTTAAGGCAAT CTTTGATGGAAAAGCTGTAGTTGGATTCCTTGAGATTGGGAAATTGTTGTCTCGTCATTT TGTGTAGATCACTGACTTCTGTTTCTAATATGACTTTTAGGTGCATGGATTTGAATTACT GTCTCAACATGTAACAAGTGAGCTCTCATGACTTTTCTCACAAATATTTTAGGGTGTTGT TATTCTGATACATGCTTTTGTATGAGAGCCGAACCCTTGGGTTGAGTTTGTGATTTCAAT TTCTTAGGTGATCGTTTTGTAAAAATTAGGCTGTCAAGGAAGTTTATTCGGTATTGTGCT TCCATTAATACCAGCCTCACTTATTGCTTATCTATTTTCTAGTTATTTTTCTTTCCTTAG GTACGGCCTAACTCATTCGTATGCCAAATAACATGATGAAATAGAATTGATG