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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020723 | Chr12 | 16779968 | 16782790 | - | Protein LYK2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020723.m1 | 192 | 224 | PF01476.23 | LysM | Domain | 25.1 | 1.50E-05 |
LITCHI020723.m1 | 389 | 661 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 115.1 | 3.70E-33 |
LITCHI020723.m1 | 422 | 663 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 113.1 | 1.50E-32 |
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>LITCHI020723.m1 ATGGCAATTACTCTGGTCAGTGTGCTCTACTACTTCAGAGCTGTCGTCTTATTCATCTTG GTCGTACTATTTGTCCCTATATTTGGACAGAAGTTGTTGAGCTGCGATACTAGCTCCTCC CTAGAGGCCTCAGGATATCATTGTAGTAGTAGCGGAGCTGGTTCACAGGATCAGTGTGAC ACATTTGCAATTCTTCGTACAAACTCCTACTATTTTTCTCTTTTCAATCTCAGCTTTTAC TTGGGCCTGAACCGGTTTGTCATTGCTGAGGCCAATGGTTTCTCTGCTGAAACTGAGTTT CTTCCAAAGGATCAGCCTCTGTTGATCCCTATTGATTGCAAGTGCAATGGTGGGTTCTTC CAGGCTGATTTAACTAAGACAACTGTCAAAGGAGAGAGCTTTTTGAGCATTGTTGAGTCA CTCGAAGGCTTGACAAGTTGCAAAGCTATTCAAGACAAGAACCCAAGTGTTTCACCTTGG AATCTTGTTGATAAGCTTCACTTACAAGTTCCACTAAGATGTGCCTGTCCACCTTCAACT GAGAATCTCCCACAGACCAGGCTCTTGCTGTCTTATCCGGTAAGTGAAGGCGATACTGTC TTTAACTTAGCCACTAAATTCAACACCACACCAGAAGCTATAATTTCTGCAAATAACAAG TCTTCATCTGAAACCAGATTCAAACCTGAAAGCCTGCTACCTTTCACTTCTCTTTTGATT CCCCTTAATGGTGAGCCTACTCTTGGCTCCCTCTCCAAACCCAGTGAACCAAATTTGCAT TTTCCAACACGTGGTAGCATCCCAGCAATTAGTACTCCAACAAAGAAGAAGTCAAAGATG ATGAAAGTGGGAGCCTATATTGCTCTCAGTGGAGTTGTCGTTGGTGGGTGCATTGCTATT GCAGCTGCCGTGGCCATAATCCTATTGAAGAAGAAGAAGAAACAGGTGCCAATCAAGCAT CAGAGTGGAGATTTGGAGCTCCAACAGCTTAGTCAAAGTGTAAGAACAACAAGTGATAAA AAAGTCTCTTTTGAGGGATCACAGTGCACTCTTGACAGCCAAATCATTTACACTTCTGCC CCTCAGAAAATGCTGTTGGAGAGTTATGCTATCGAGGAGCTGAGAAGAGCAACTGAAGAT TTCAATTCTAGTAACCAAATAGAAGGAGCAGTGTATCATGGTCGTTTAAGTGGCAAGAAC TTGGCCATCAAACGAATACTACCAGCAACCATCTCAAAGCTTGACGTGCGGCTTTTCCAG ACTGCAACTCACCATCATCCAAACATAATCAAGCTTCTGGGGACATGTATGACTGATGGC CCTCGCTCATTTCTGGTGTTTGAGTATGCTAAAAACGGGTCCTTGAAGGACTGGCTTCAT GGTGGATTGGCAATGAAGAACCAGTTCATTGCCTCCTGCTACTGTTTCTTGACGTGGGGT CAGAGGTTAAGAATCTGTCTAGATGTGGCCATGGCTTTACAGTACATGCACCATGTCATG AATCCAAGCTATGTTCATAGGAACATAAAGAGCCGGAACATCTTCCTGGATGAAGAATTC AGTGCTAAGGTTGGGAATTTCGGCATGGCGAAATGTGTTGAGGATGATACTGAGAATCCA CAGTTCTATTCAACCAATCCTGCTACTTGGAGCTTGGGGTATTTGGCTCCTGAATACATT CATGAACGAGTAATAGACCCAAGGATTGACATTTTCGCTTATGGGGTGGTTTTGTTGGAG GTTTTATCAGGGCAGACCCCAATAAACAGGCCTAAAAAGAAGGAAGTAGGGAGTGTTTGG CTTTCAGAGAAAATCAGGTGCATATTGCAATCAGAAAATGCAGATGATGAGCTAAGGGAC TGGATGGACAATGCATTGGGAGACAACTATTCATTTGATGCTGCTGTCACGTTGGCCAAC ATTGCAAAAGCTTGTGTAGAGGAAAATCCTGAAATGAGACCAACTGCTGGTGAGATTGTG GAGAAGTTATCAAGATTGGTGGAAGAATTACCACAAGGTGAGCATATATCAATCTGTGAG AGTTATTCAAAACCTCTAGTGAAGGCATCTGCAACCAAACAACATTAA
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>LITCHI020723.m1 MAITLVSVLYYFRAVVLFILVVLFVPIFGQKLLSCDTSSSLEASGYHCSSSGAGSQDQCD TFAILRTNSYYFSLFNLSFYLGLNRFVIAEANGFSAETEFLPKDQPLLIPIDCKCNGGFF QADLTKTTVKGESFLSIVESLEGLTSCKAIQDKNPSVSPWNLVDKLHLQVPLRCACPPST ENLPQTRLLLSYPVSEGDTVFNLATKFNTTPEAIISANNKSSSETRFKPESLLPFTSLLI PLNGEPTLGSLSKPSEPNLHFPTRGSIPAISTPTKKKSKMMKVGAYIALSGVVVGGCIAI AAAVAIILLKKKKKQVPIKHQSGDLELQQLSQSVRTTSDKKVSFEGSQCTLDSQIIYTSA PQKMLLESYAIEELRRATEDFNSSNQIEGAVYHGRLSGKNLAIKRILPATISKLDVRLFQ TATHHHPNIIKLLGTCMTDGPRSFLVFEYAKNGSLKDWLHGGLAMKNQFIASCYCFLTWG QRLRICLDVAMALQYMHHVMNPSYVHRNIKSRNIFLDEEFSAKVGNFGMAKCVEDDTENP QFYSTNPATWSLGYLAPEYIHERVIDPRIDIFAYGVVLLEVLSGQTPINRPKKKEVGSVW LSEKIRCILQSENADDELRDWMDNALGDNYSFDAAVTLANIAKACVEENPEMRPTAGEIV EKLSRLVEELPQGEHISICESYSKPLVKASATKQH.
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>LITCHI020723.m1 GTGCATCCATAAGTACATGAATCGAATCTCAACCTCTTATTTTCCATAAATCAAGATAAG GTACAAGATATAGAGTGCATGTCTTGTCTAATCACATGCATGATTGGATTTATATGCCTA TTAAAACAAAACGAACGCAGGTTTGAAGCCCAAGAAACTAGTCTCAAGTATAGTTAACAG TGTTGGTTATGATCACTGATCACCACCGGCCATTGATATTTTGAAAACAGATAGCCATCT CTTTAGCGAATGGAATCAAGCCCAAGGTTAGGTGGTTTAACCCAAACAGCTGGAGTCTGT ATAAATATATATATACACAATACCTTTGTAGCCCCCAAGAATCCTGTCCATGAACAGCTT TCAAATATTCTTATTTTACACCATTTTCTTATGGATCCAAAATATTCACCACCCCACTCT TAAAGTGATAAAAAGCTCCTTATATTTTTAATAGTCCTGCAAGTTTTTGAACCGAGTGAA TATAGAGCATGGCAATTACTCTGGTCAGTGTGCTCTACTACTTCAGAGCTGTCGTCTTAT TCATCTTGGTCGTACTATTTGTCCCTATATTTGGACAGAAGTTGTTGAGCTGCGATACTA GCTCCTCCCTAGAGGCCTCAGGATATCATTGTAGTAGTAGCGGAGCTGGTTCACAGGATC AGTGTGACACATTTGCAATTCTTCGTACAAACTCCTACTATTTTTCTCTTTTCAATCTCA GCTTTTACTTGGGCCTGAACCGGTTTGTCATTGCTGAGGCCAATGGTTTCTCTGCTGAAA CTGAGTTTCTTCCAAAGGATCAGCCTCTGTTGATCCCTATTGATTGCAAGTGCAATGGTG GGTTCTTCCAGGCTGATTTAACTAAGACAACTGTCAAAGGAGAGAGCTTTTTGAGCATTG TTGAGTCACTCGAAGGCTTGACAAGTTGCAAAGCTATTCAAGACAAGAACCCAAGTGTTT CACCTTGGAATCTTGTTGATAAGCTTCACTTACAAGTTCCACTAAGATGTGCCTGTCCAC CTTCAACTGAGAATCTCCCACAGACCAGGCTCTTGCTGTCTTATCCGGTAAGTGAAGGCG ATACTGTCTTTAACTTAGCCACTAAATTCAACACCACACCAGAAGCTATAATTTCTGCAA ATAACAAGTCTTCATCTGAAACCAGATTCAAACCTGAAAGCCTGCTACCTTTCACTTCTC TTTTGATTCCCCTTAATGGTGAGCCTACTCTTGGCTCCCTCTCCAAACCCAGTGAACCAA ATTTGCATTTTCCAACACGTGGTAGCATCCCAGCAATTAGTACTCCAACAAAGAAGAAGT CAAAGATGATGAAAGTGGGAGCCTATATTGCTCTCAGTGGAGTTGTCGTTGGTGGGTGCA TTGCTATTGCAGCTGCCGTGGCCATAATCCTATTGAAGAAGAAGAAGAAACAGGTGCCAA TCAAGCATCAGAGTGGAGATTTGGAGCTCCAACAGCTTAGTCAAAGTGTAAGAACAACAA GTGATAAAAAAGTCTCTTTTGAGGGATCACAGTGCACTCTTGACAGCCAAATCATTTACA CTTCTGCCCCTCAGAAAATGCTGTTGGAGAGTTATGCTATCGAGGAGCTGAGAAGAGCAA CTGAAGATTTCAATTCTAGTAACCAAATAGAAGGAGCAGTGTATCATGGTCGTTTAAGTG GCAAGAACTTGGCCATCAAACGAATACTACCAGCAACCATCTCAAAGCTTGACGTGCGGC TTTTCCAGACTGCAACTCACCATCATCCAAACATAATCAAGCTTCTGGGGACATGTATGA CTGATGGCCCTCGCTCATTTCTGGTGTTTGAGTATGCTAAAAACGGGTCCTTGAAGGACT GGCTTCATGGTGGATTGGCAATGAAGAACCAGTTCATTGCCTCCTGCTACTGTTTCTTGA CGTGGGGTCAGAGGTTAAGAATCTGTCTAGATGTGGCCATGGCTTTACAGTACATGCACC ATGTCATGAATCCAAGCTATGTTCATAGGAACATAAAGAGCCGGAACATCTTCCTGGATG AAGAATTCAGTGCTAAGGTTGGGAATTTCGGCATGGCGAAATGTGTTGAGGATGATACTG AGAATCCACAGTTCTATTCAACCAATCCTGCTACTTGGAGCTTGGGGTATTTGGCTCCTG AATACATTCATGAACGAGTAATAGACCCAAGGATTGACATTTTCGCTTATGGGGTGGTTT TGTTGGAGGTTTTATCAGGGCAGACCCCAATAAACAGGCCTAAAAAGAAGGAAGTAGGGA GTGTTTGGCTTTCAGAGAAAATCAGGTGCATATTGCAATCAGAAAATGCAGATGATGAGC TAAGGGACTGGATGGACAATGCATTGGGAGACAACTATTCATTTGATGCTGCTGTCACGT TGGCCAACATTGCAAAAGCTTGTGTAGAGGAAAATCCTGAAATGAGACCAACTGCTGGTG AGATTGTGGAGAAGTTATCAAGATTGGTGGAAGAATTACCACAAGGTGAGCATATATCAA TCTGTGAGAGTTATTCAAAACCTCTAGTGAAGGCATCTGCAACCAAACAACATTAAGTCT ATGAACATTTTATTATAAAATTAGAGCCAGTAAATTAAAAATCTAGTTTGTGTGCTACTT TTTATTGTGTTTTAGAGTTAATTATCTATAATTAGGCTATTAGTCTTGGCCTCTTGAACA GGGTAGTGGGATCCTGTATATATGTAATTAAGAAAATGTTTTTGGACATGGAAGAGCAGG TTTCTACTTTGTATTTTCTCTCTGTTTTCAGGAAAGAATAAATAATATAATGTTGATACC AAG
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>LITCHI001881.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATCAAACAATTTAGGACGCGTTTGGCAGTGTCTTCCAAATCTCAAATATTTTCATCCAAA ATTATTATTGCTTTATTTTTATTATACATTACAAATAAAAATTAAAAATAGTGGTTGATA TATGCTTATTGATTGATAATAAAAATTAATGAAAATTAAAATTCCAATGAAAAAAAGGGA AACAGCAATCACATAATTTCAATCAAATATTAAGCTTTTAAGAATAAATAAATAAATATA GAGAGAGAGAGTTTAATGATTAGAATCTTTCAAGATTTTAACATTACATGTGCCACCGAA AAATTTACACTTATAACATCATGAGACATTACTTCCATAAGAAATAATAAAAGTGATATG AACAATCAAAAATCTACTTTTATAATATTACGAAATATTCACTTTCATAAGAATTGATAA AGGAAAAATACTTTAGTAAGGGAGGAAAAGTACTTTCTCACATATACTATCATATCAATA AATATAGATGTGAAACTCAAATTTTTATCATAAATATTAAAAAAGTATACTAATTACTTA AATAATGAGTGTATATATAATAAATCTTAATTAATTATAAAAACAGTCATTTATATGATA CACTAAATTATTAGTTGAATGTATTTTAATAAAATTACAATTCACATTATATTAGGGAAG GAAAATTGAATTCCAAATAACTTCATATCTATTTACACCTTAAAAAAAAATTTGAATCTA ATCATCAATAGTTTTGATAAATTTTAAACCCATTCAAACTTCAAACTATTAAATTAACTT TCCCATTAATTTAAAACATGCTCCCGAATGTTTAAGTTTAAAAATGGAAAAAAACAAAAA AAAATCTAAACCCGATCCATTACTAATCCACTTTTAAATCTAGTCTAAATCCAATATGTT 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>LITCHI001881.m1 GenomeSequence + TCCACCATTCCTCTAAAAAAAATATATTTTATGTATACATTTTTAAAAATCCTACTTTCC TTAACCGACATCCAAACACAGCCTTACATTATTTAATATTTTAAAAATTCATGTCTGTTT AATCTCCTTTACTATTTGCTTCTGGTTCTTCTTCTTCTTCTTCAGCTTTTCAATGGCCAA AGCGAAAGCTCCAAAGCGAACTCTAGACTCCTACACAGTCAAACACATCAACAAAACCAT CAAACGTGAGTCAACACCACAACTCTCTCGTTCTCTCTCTCACTCTTGCATATTCTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATTAAAATTTTCGATAAATTAAGAATTTGTTGTCTCTAA CACGTGTGACGTGTCGATTCGATCAGCCGGCGATTGCGTGCTAATGCGGCCGTCGGATCC CTCGAAACCGTCCTACGTGGCGAAGATCGAGCGGATCGAGTCAGACGCGCGTGGCGCCAA CGTCAAGGTGCACGTGCGCTGGTACTACCGTCCAGAGGAGTCGATCGGCGGCCGCCGCCA GTTCCATGGTTCGAAGGAGGTCTTCCTCTCCGATCACTTCGACATCCAGAGTGCTGACAC CATCGAATCCAAGTGTACCGTCCACAGCTTCAAGAGCTACACCAAACTCGACGCCGTCGG CAACGACGACTTCTTCTGCCGCTTCGAGTACAACTCCTCCACCGGTGCTTTCAATCCCGA TCGCGTCGCCGTGTAACATCTCTTTCTCTTTTTCAATTTTTCAATTTTCGTTGATTTTAG AAGAAATTGACAGGTTTATGTGTATGAAGTTCAGTGTTTTATATTAAAATTTGAGGTTAA TTGATTTTGATGTGTGTTTGATGTTTTGGAGTGGTTTTAAGATGAAAGTTTGCGAGTTTT 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