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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020716 | Chr12 | 16746661 | 16751685 | + | Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020716.m1 | 284 | 342 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.4 | 6.20E-08 |
LITCHI020716.m1 | 284 | 302 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.85 |
LITCHI020716.m1 | 485 | 756 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 70 | 2.10E-19 |
LITCHI020716.m1 | 487 | 757 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 84.5 | 7.40E-24 |
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>LITCHI020716.m1 ATGGGATACTTTTACTTGTTGCTTCTAGTGTTGGTTTCATGGGTGGTTTTGTTTATCCCA AGTGGCCATCATGCATTGCAAACGTCTCAAGTTCAAGTCTTGCTTCAGCTTAGAATACAT TTGGAGTACCCTTTATCATTAGATGTATTGGAGAATTATGAGGGAGACCCCTGTAATCTG ACTTCAACTCCACACATGAGCATTACTTGCCAGGACAATTTAGTCACTGAACTTAAAATT ATGGGGGATAGGATTGTAAAGGTTGAGGAGTTCAATGGAAAAGCCATTCCAAACCAGACT TTGTCAGAGGGTTTCTCTATTGATTCTCTTGTTACTACATTGACAAGGTTAACAAGTTTG AGGGTTCTTAGCATAGTGTCTTTGGGGATTTGGGGACCACTTCCTGATAAAATTCATAGG TTATCTTCGCTTGAACTGTTGGATATGAGTTCCAATTTTATGTTTGGTTCCATCCCATTT GGGATATCAAGAATGGTTAAGCTTCAGTCTTTGACAATGGACACAAATTTTTTTAATGAT AGTGTTCCTGATTGGTGGGATTCCTTGTCGAACCTTACTATTTTGAGCTTGAAAGGTAAT CAATTGAAGGGTCGGTTTCCTACTTCTATTTGCAGAATTACTTCATTAACCGACATTGCC ATGTCTCACAATGAGCTTTCTGGTGAATTGCCTGACATGAGTAGCTTAACTAGTCTCCGT GTGTTGGATTTGAGAGAGAATGAGTTGGATTCTGGACTACCTATACTGCCAAAAGGGTTG ATCACAGTTCTCCTTAGCAAAAACTCATTCTCTGGTGAGATTCCTGAGCAAATTGGTGAA TTGGCTCTGCTTCAGCACCTTGATTTATCATTCAATCATCTGAGAGGGACACCCCCTTCT GCCTTGTTTTCTTTGCCAAACATCAGTTATTTGCATTTAGCTTCTAATATGCTCAGTGGT TCACTTCCAAACCTGCTTAGTTGCGGCCCCAAACTTGGTTTTGTTGATATGTCTGATAAC AAGTTAATAGGGGTACTTCCTCCTTGCTTGGACAGTACTTCAGATAACAGGGTTGTTAAA TTTGGTGGAAACTGCTTGTCCATTGATGGCCAACATCAACATCAGGAGTCTTATTGTAGA GAAGCAAATACGAGTAAACAATCAAGAATTAGAGAGATAGGAGTTTTAGTAGCTATCATT GGAGGAGCAGTTCTTTTTGTTGTCCTATTTGGATCCGCCCTTCTCATTCTGTTTAGACGC TACTGGTCAAGAGTGCAAGTTGAACGGCATACAACGCCAAAGGGTGTGCAGGAGAATCCA CCAACTGGGGTTTCCTCTGAGGTCCATACAAACGCCAGGTTAATATCTCAAGTGGCCAAG GCACAAAGTTCCCCGGTCTATAGATTATTTTCTTTGGAAGAATTGAAGGAAGCCACAAAC AACTTTGATTCGTCCACATTTTTGGGAGAGGGCTCCAAAGGGAAGCTTTACAAAGGGAGA TTGGAGAATGGGACCTATGTTGCTATTCGATGTCTTGCTTTGTTGAAGAAATATTCCATT AAAAACCTTAAAGTTCGGTTGGATTTTCTTTCAAAGCTTCACCATCCGCATTTGGTTGCC CTGTTGGGTCACTGCATTGAGGGTGGTGGACAAGATGATTCTAGTGCCAACAAAATCTTC CTCGTATATGAATATGTGCATAATGGGAACTATCGTGCCCATCTGTCAGAAAATTTTCCC GAGAAGGTTCTTAAGTGGTCAGATAGATTGGCGATTCTGATTGGTGTTGCCAAGGCTGTG CATTTTCTACATGCTGGCGTAATTCCTGGTGTTTTTAACAATCGATTAAGAACAAATAAT ATATTGCTTGATGAGCATCGGATTGCAAAGCTGAGTGACTATGGGATGTTTATCATCACA GAAGAAAATGATAAGCATGAGGCAAAAGGAGGAGGCCCAAAATCTTGGTATGTATCCTTA ACATTACATGTTAGAAGGATAATCCAAAAAACCAAACAAGAGGATGATGTTTACAACTTT GGATTCATATTACTTGAATCTCTCGTTGGGCCCATAGTAACTGGAAAAGGGGAAGCATTT CTGCTCAATGAAATGGCATCCTTTGGCAGCCAAGATGGTCGAAAACGGATCGTGGATCCA ATCGTGTTAACCACTTGCTCGCAAGAGTCATTATCCATTGTGGTATCCATCACAAATAAA TGCATATGTCCTGAACCATCCTCCCGTCCCTCGTTTGAGGACGTCCTTTGGAACTTGCAA TATGCAGCTCAAGTCCAGGCCACAGCCGATTCTGATCAGAAATCAGATTCCACATCATAG
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>LITCHI020716.m1 CCTGTATTTAGTTACACAAAAGGTTCACTCTCGCTCCATCTCTCACAAACAGAGAGAGAA ACAGAAGAAACCAACTTCTTCCTCCTTGAGACTTGGCTTGTCCTTGTCGTGTCCCTAATA ATAATAAACCAGGACCCCACGACCACCAACACCACCGTAGTAGCATTAAATGCATTCTCA GTTTTGCTCTGGTACGGCCCTCTGTTTTTATCCATAACATGGTCCACCACCTCTCTCCAT AAATTCTTTGAAACGACGCTTAACAAATCTCCTAGTCGAATTTTGCTTCCTGGGTCGTTT TCTGTTTTGCTTCATTGGATCCCCAGCTGAGCTTGTTTCGTGTTTCGGGTTTCAAGTTCT TAGCTTTGCATTTGTTATGTGGCATTTACTTGGGTTTCAGCTTTTATTGACTAGGTTGAA TATGGTTGACTAAGGAATGTTTAGAGTTAACATTTTGGTTATTGTCACTAAAAGGGACTG ATTTTGAGGTTTGGCTGTCTTAAAAACTTGTCCAAATTTGTCTGTGTCAACTATTTTTTT TCAGGTAAATTCACTTCTGGAGCTCTCTTTAAGCTTTTCTACATAGAAATCTTATCTGGG TCGGTTTTTGTTTCTCTTGAGATTACTAGTGCTATTCTATTTCTAGGATTTGTGTTGTGA AATTTAGAGCTTGGTATTTGATATATAGTTGTTCAATGGGATACTTTTACTTGTTGCTTC TAGTGTTGGTTTCATGGGTGGTTTTGTTTATCCCAAGTGGCCATCATGCATTGCAAACGT CTCAAGTTCAAGTCTTGCTTCAGCTTAGAATACATTTGGAGTACCCTTTATCATTAGATG TATTGGAGAATTATGAGGGAGACCCCTGTAATCTGACTTCAACTCCACACATGAGCATTA CTTGCCAGGACAATTTAGTCACTGAACTTAAAATTATGGGGGATAGGATTGTAAAGGTTG AGGAGTTCAATGGAAAAGCCATTCCAAACCAGACTTTGTCAGAGGGTTTCTCTATTGATT CTCTTGTTACTACATTGACAAGGTTAACAAGTTTGAGGGTTCTTAGCATAGTGTCTTTGG GGATTTGGGGACCACTTCCTGATAAAATTCATAGGTTATCTTCGCTTGAACTGTTGGATA TGAGTTCCAATTTTATGTTTGGTTCCATCCCATTTGGGATATCAAGAATGGTTAAGCTTC AGTCTTTGACAATGGACACAAATTTTTTTAATGATAGTGTTCCTGATTGGTGGGATTCCT TGTCGAACCTTACTATTTTGAGCTTGAAAGGTAATCAATTGAAGGGTCGGTTTCCTACTT CTATTTGCAGAATTACTTCATTAACCGACATTGCCATGTCTCACAATGAGCTTTCTGGTG AATTGCCTGACATGAGTAGCTTAACTAGTCTCCGTGTGTTGGATTTGAGAGAGAATGAGT TGGATTCTGGACTACCTATACTGCCAAAAGGGTTGATCACAGTTCTCCTTAGCAAAAACT CATTCTCTGGTGAGATTCCTGAGCAAATTGGTGAATTGGCTCTGCTTCAGCACCTTGATT TATCATTCAATCATCTGAGAGGGACACCCCCTTCTGCCTTGTTTTCTTTGCCAAACATCA GTTATTTGCATTTAGCTTCTAATATGCTCAGTGGTTCACTTCCAAACCTGCTTAGTTGCG GCCCCAAACTTGGTTTTGTTGATATGTCTGATAACAAGTTAATAGGGGTACTTCCTCCTT GCTTGGACAGTACTTCAGATAACAGGGTTGTTAAATTTGGTGGAAACTGCTTGTCCATTG ATGGCCAACATCAACATCAGGAGTCTTATTGTAGAGAAGCAAATACGAGTAAACAATCAA GAATTAGAGAGATAGGAGTTTTAGTAGCTATCATTGGAGGAGCAGTTCTTTTTGTTGTCC TATTTGGATCCGCCCTTCTCATTCTGTTTAGACGCTACTGGTCAAGAGTGCAAGTTGAAC GGCATACAACGCCAAAGGGTGTGCAGGAGAATCCACCAACTGGGGTTTCCTCTGAGGTCC ATACAAACGCCAGGTTAATATCTCAAGTGGCCAAGGCACAAAGTTCCCCGGTCTATAGAT TATTTTCTTTGGAAGAATTGAAGGAAGCCACAAACAACTTTGATTCGTCCACATTTTTGG GAGAGGGCTCCAAAGGGAAGCTTTACAAAGGGAGATTGGAGAATGGGACCTATGTTGCTA TTCGATGTCTTGCTTTGTTGAAGAAATATTCCATTAAAAACCTTAAAGTTCGGTTGGATT TTCTTTCAAAGCTTCACCATCCGCATTTGGTTGCCCTGTTGGGTCACTGCATTGAGGGTG GTGGACAAGATGATTCTAGTGCCAACAAAATCTTCCTCGTATATGAATATGTGCATAATG GGAACTATCGTGCCCATCTGTCAGAAAATTTTCCCGAGAAGGTTCTTAAGTGGTCAGATA GATTGGCGATTCTGATTGGTGTTGCCAAGGCTGTGCATTTTCTACATGCTGGCGTAATTC CTGGTGTTTTTAACAATCGATTAAGAACAAATAATATATTGCTTGATGAGCATCGGATTG CAAAGCTGAGTGACTATGGGATGTTTATCATCACAGAAGAAAATGATAAGCATGAGGCAA AAGGAGGAGGCCCAAAATCTTGGTATGTATCCTTAACATTACATGTTAGAAGGATAATCC AAAAAACCAAACAAGAGGATGATGTTTACAACTTTGGATTCATATTACTTGAATCTCTCG TTGGGCCCATAGTAACTGGAAAAGGGGAAGCATTTCTGCTCAATGAAATGGCATCCTTTG GCAGCCAAGATGGTCGAAAACGGATCGTGGATCCAATCGTGTTAACCACTTGCTCGCAAG AGTCATTATCCATTGTGGTATCCATCACAAATAAATGCATATGTCCTGAACCATCCTCCC GTCCCTCGTTTGAGGACGTCCTTTGGAACTTGCAATATGCAGCTCAAGTCCAGGCCACAG CCGATTCTGATCAGAAATCAGATTCCACATCATAG
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>LITCHI020716.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAATATATAACTCATATATTATATCATTTGATGTAAATCTATATAATTTAATAATATTTA TAAATAAAAATAATAGTTTAAACATCAAAGTTAGTTTTATAATATACCTTCGATCCATAT ATATCCTCCAATCTCAAAAATAATAGCAATTTTTTGTAAAAATACAATCATACTTTTTTG AGAGTATCAATACTAATACAGTTTAATAATAATAAATATGTAATTAAATTAATAAAATTT TATGTTAGAGTAATTGTTATATATTTATATGTAATATCAAAAAAATACATAAATTTGAAC TTTTCTATTAAATAATTTTCTCATTCTACTAAATTGAAGAGAATTTTGATAAATTTGTGT TATTAAGTCAGTAAATATAGAAAAATGAAAGTAGATAAATTCGAAATTACTTAAAATTAA ATAGTTGATGTGGTAGAGGGATAGAAAGCGTTCAAGCGCAAGGTGGTGTGGGTGCGCGTG GTGGTGGTGATAGTTTAGTTTAAGGGAATTCCAAAAAATAAAGCCACTGTACTATCAGAG TGGTATTGCATTCAAACACAGGCTGTCCAAACGGCTGGGTGGGGGTCCACTCAATGTTTG GGCACTCATCTTCCATTTCCAATGCTAACCAACTCCTTTTTCCTATGAGTGCCCTACTTT CCATGTAACCGTTATTCGACTACTTCACAAAATTACTTAATTACCATTGATATATATTTT TTTATCAATTTAATGTCATATATAAAAAAAAAAACACCACCTATGATTTATAAGATTGCT TAACAATTGCAATTCAAAGTTTAGTATATAAGGTGCAATTAGAATTCACTGTCTTAAAAC TGTAGTTATAAAGGTGAATCATTGAACAATCTTATCTTAATTGATAAATGATTTTTAATA ATATTTTGATTAGTTAGTGTCACTTAATCTACTCATTTAATTAGATGTTGAGATAATAGT TTCATCATCATATATTAAAATTGATGTAAATGTAATAAAGTGATGATAGAGATTTTAGAT GGGAGAATACTGGATTCATAAAAATCCAGATAACATCTTCTGTGTTTAAATGCAAGTGTT TCAAATGCAACCATAAAGAATTAATGAACAGGGGCAATTAAGTAATAAACGAAAAGAGCA TACCATAAAAAAGGTCGAAGCAAATCATAAAAATCAAACGTATCCGTTAAGCGGACAAAA AGCAAAACCATGTGATGGCACAACCGCAATATCAACGAGAATCCAAGGACAAATCCACAT CACCCAATACATACCAAAATCATAAAAAGACAAAAAACAAACAAACCTGTATTTAGTTAC ACAAAAGGTTCACTCTCGCTCCATCTCTCACAAACAGAGAGAGAAACAGAAGAAACCAAC TTCTTCCTCCTTGAGACTTGGCTTGTCCTTGTCGTGTCCCTAATAATAATAAACCAGGAC CCCACGACCACCAACACCACCGTAGTAGCATTAAATGCATTCTCAGTTTTGCTCTGGTAC GGCCCTCTGTTTTTATCCATAACATGGTCCACCACCTCTCTCCATAAATTCTTTGAAACG ACGCTTAACAAATCTCCTAGTCGAATTTTGCTTCCTGGGTCGTTTTCTGTTTTGCTTCAT TGGATCCCCAGCTGAGCTTGTTTCGTGTTTCGGGTTTCAAGTTCTTAGCTTTGCATTTGT TATGTGGCATTTACTTGGGTTTCAGCTTTTATTGACTAGGTTGAATATGGTTGACTAAGG AATGTTTAGAGTTAACATTTTGGTTATTGTCACTAAAAGGGACTGATTTTGAGGTTTGGC TGTCTTAAAAACTTGTCCAAATTTGTCTGTGTCAACTATTTTTTTTCAGGTAAATTCACT TCTGGAGCTCTCTTTAAGCTTTTCTACATAGAAATCTTATCTGGGTCGGTTTTTGTTTCT CTTGAGATTACTAGTGCTATTCTATTTCTAGGATTTGTGTTGTGAAATTTAGAGCTTGGT ATTTGATATATAGTTGTTCA
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>LITCHI020716.m1 GenomeSequence + CCTGTATTTAGTTACACAAAAGGTTCACTCTCGCTCCATCTCTCACAAACAGAGAGAGAA ACAGAAGAAACCAACTTCTTCCTCCTTGAGACTTGGCTTGTCCTTGTCGTGTCCCTAATA ATAATAAACCAGGACCCCACGACCACCAACACCACCGTAGTAGCATTAAATGCATTCTCA GTTTTGCTCTGGTACGGCCCTCTGTTTTTATCCATAACATGGTCCACCACCTCTCTCCAT AAATTCTTTGAAACGACGCTTAACAAATCTCCTAGTCGAATTTTGCTTCCTGGGTCGTTT TCTGTTTTGCTTCATTGGATCCCCAGCTGAGCTTGTTTCGTGTTTCGGGTTTCAAGTTCT TAGCTTTGCATTTGTTATGTGGCATTTACTTGGGTTTCAGCTTTTATTGACTAGGTTGAA TATGGTTGACTAAGGAATGTTTAGAGTTAACATTTTGGTTATTGTCACTAAAAGGGACTG ATTTTGAGGTTTGGCTGTCTTAAAAACTTGTCCAAATTTGTCTGTGTCAACTATTTTTTT TCAGGTAAATTCACTTCTGGAGCTCTCTTTAAGCTTTTCTACATAGAAATCTTATCTGGG TCGGTTTTTGTTTCTCTTGAGATTACTAGTGCTATTCTATTTCTAGGATTTGTGTTGTGA AATTTAGAGCTTGGTATTTGATATATAGTTGTTCAATGGGATACTTTTACTTGTTGCTTC TAGTGTTGGTTTCATGGGTGGTTTTGTTTATCCCAAGTGGCCATCATGCATTGCAAACGT CTCAAGTTCAAGTCTTGCTTCAGCTTAGAATACATTTGGAGTACCCTTTATCATTAGATG TATTGGAGAATTATGAGGGAGACCCCTGTAATCTGACTTCAACTCCACACATGAGCATTA 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