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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020609 | Chr12 | 15877900 | 15889545 | + | SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020609.m1 | 77 | 218 | PF02365.18 | NAM | Family | 99.7 | 1.90E-28 |
LITCHI020609.m1 | 584 | 665 | PF01985.24 | CRS1_YhbY | Domain | 48.7 | 6.70E-13 |
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>LITCHI020609.m1 ATGCCCTGCGCTTTTACCAAAATGCCCCTGAACTCGGTTTTCGAAGTTGCAACTCGTCCG ACAGGACTTAGGACTTGGCTTGTCAATAGTAGAGCAATAGCAAAGAAAGTGAGAAATGCT AGTCGGTTTTCTGCTCAACAAATCAAAGACTGTGAGGCTAATCGGGAATGCCCAAATTGC CATTATAGGATTGACAACAGTGATGTTTCTCCCGATTGGCCAGGTTTGCCTGCTGGTGTA AAGTTTGACCCATCTGATATAGAGCTCTTAGAACATTTAGAAGCAAAATGTGGAGTTGGG AACTTGAAGCCACATATGTTTATAGATGAGTTTATTCCAACACTTGAGGGGGACCAAGGA ATTTGTTATACCCATCCAGAAAATCTTCCTGGTGCTAAGAGAGATGGAAACAATGTCCAT TTCTTTCACAAAACAATTAATGCCTATGCTACTGGTCAAAGGAAGCGCCGCAAGGTTCAG TGTCAACACAGTTTGAATGGGGAACATGTCCGCTGGCATAAAACTGGTAAGACTAAACCT GTAATAGAAAATGGAGTTCAGAAGGGCTGTAAAAAAATTATGGTTCTTTACAAAAGCTCA AAGAAGGGTTCCAAGCCGGATAAATCCAACTGGGTGATGCATCAGTACCATCTGGGCACT GATGAAGATGAAAAGGATGGCGAATATGTGGTTTCTAAAATTTTCTATCAACAAGAAAAG CAAAATGATAAAGGTGATGATTGTCCCATCCTTGAGGATCCCGATAACTCCACTCTTCGA ACTAGTCCAAGGACGCCCAAAACAAATCCTCCTAATCCCCCTCGGCCAGGGAAGTCTGTA AAGGAAGATGATGTTGCTGACGATAATACACATGAGTCATATGCCCAGGAAGCAGTGGAA CTTGGAGAAGCATCACATGTACCTGCACCTGGAGTTCCAATTGATGACCATCTGGGCTAC CAATCATGGTTGGCTGGAGAATCTCAGGCCATTGAAAAGTCTGATTTGGACTGCATTGAA GATTCTTTGTTATGCAAGGAGGAAAACTATTCTTCTGCCGAATTAAACAAATCTGGAATC AATAATGGCTCAAGCACTTGCTTGGCCACTAATGGAAATAACATGAGAGGGAATAACAGT GCACCCTGTGGAATCTCTGACCTGGAGAACCTAGAACTAGATACCCCGCCAGATTTTCAT CTCCCTGACTTGTCTTTTGGTTCTCAGGAAAGCATTCTTGATTGTCTGACTGAAGTTTGC CTCTCCAAACATTTTCTTCGTCTGCAAAGAGTCAACTTGATTGCTTCAAGGGAAGTAGGG ACTTTTCTCTTTCTGGTTCATGAACATTTTGCTCCAAAGGCATATGAGGCTGTGAATAAT GTGAAGGATGGTTGGCGGAAACCGTTATCGTCTTATGTGATTGAAAAAGGTAGTCGTTTT TGTGAGGATTCTCGTCCCTCTTTTGTGCCAGTGAATCATTTCTGGAGTGGGTGGTGGTGT CGTTCAATGTCCACTTCAAGAGGGAGGGGCATGCGAAGCAAGGTGGAGAGACGGATGCAA AAGGAGTCCGGTAAGACCCTCAGAGAGATCCGCAGAGCCAAAAAGATTAAGAAGAAGCTC ATGACTGATGAGGAACGGCTTATTTACAATCTCAAAAGAGCCAAGAAAAAAGTGGCTTTG CTGCTACAAAAGCTGAAGAAATATGAACTACCAGAATTACCACCCCCTGTGCATGATCCT GAGCTATTTACACCTGAGCAGCTTCAGGCATATAAGAAGATTGGCTTCAGAAATAAAAAT TATGTTCCTGTTGGTGTTCGTGGAGTATTTGGAGGAGTTGTCCAAAATATGCATCTCCAT TGGAAGTTTCATGAGACTGTCCAGGTTTGTTGTGATAACTTCCCCAAAGAAAAGATTAAG GAAATGGCAACCATGCTTGCAAGGCTGAGTGGTGGCATTGTGACTAACATACATAACGTG AAAACAATTATCATGTTACGTGGCAGAAACTATCGCCAACCAAAACATTTGATCCCTTTC AACACCCTTACAAAGAGGAAGGCATTGTTCAAGGCCAGATTTGAACAAGCTCTTGAATCT CAGAAATTAAACATAAAGAAGATAGAGCAGCAGCTCCGACGAATGGGTGTAAACCCTGAG GATCCGGTTGCCATGGCCAGCATCCAAAGAGTTGCTTCAACATTTTTCAATGCAATTGAC CAGAAGGAAGGAAGCCCTTATGTCTTCCGGGGAGATAAAGAGTCAGCATTTGAACCTCAT AGAAGTATAGAACATACTGAACCTCCTGCTGATAGTGACCAGGAGGAACTAGATAATTTC ATTGCTGAAATAGAGCATGCAGCTGACAAAGAATGGGAAGCAGAAGAAGCTGCAGAGAAA GAAGAATTCACTAGAATTAGGTATTGGAACAGAGAAGAGTTTGGGGGAAGGTTCAGAAGA ACTGAAAACTACAGTGATGATGACCGAGGTGACAACATTAAAGGAACAAGAGGTTGGAAG GATAAACGTGGACAGAAGAGAAGTGCTGATAGTGGTGATGAAGTTGCTGATGAATGGGAG TCTAGCCATGCTGGAGATGCTAGTGATTTCGAGAGTGATGCTGATGATTCTGATAAAGCT CACAATGATTTCAACAGATTTAAAGTAGAAAGAAGGAAGCAGAATAACGTTGGGGGGGCT AACAGTAATAACAAGGGTTTCCAGAGAAATGTGGAAGCTCATATGGCTGAAGAAGATTCT GAGTCAGAAAACATGTTTAGTGATCTTGAAAACGCAATGTGGCAATCTGACTCTGAGGAT CAGCATGATTCAAGAGCATCAAGAACAGTGGCAACTCACGATCACGTGAACCACAGTGAT GAAGAGGATTTTGAGTACGCTGCTGATGATAATTGTGAAGCTGACAATGAGATCCACATG GATAGAAGATATAATGACAAGCAGCATACTAGGCAGAACAATATTGATTCTAATTTCAAG AGAAATGCAAAAGCTAGCTTCAGGGGAAAAAATACTCAGAAAGAACAGAGGTCAGAAGAT TGCTTTAGTGATTCTGAAGTTACAATGTACGAATCAGACTCTGATAAAGATTCAGGATCG CTGGGGTATAATTATATTAGCAGTGATGAAGAATCTTATCGCCCACAGAAAGTCGAAAAG AATGAAGTGAATCAGAGTAGATCAAAGACACCGAAAGAGGTGGACGAGACATGGGACAGT GATTAG
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>LITCHI020609.m1 ATGCCCTGCGCTTTTACCAAAATGCCCCTGAACTCGGTTTTCGAAGTTGCAACTCGTCCG ACAGGACTTAGGACTTGGCTTGTCAATAGTAGAGCAATAGCAAAGAAAGTGAGAAATGCT AGTCGGTTTTCTGCTCAACAAATCAAAGACTGTGAGGCTAATCGGGAATGCCCAAATTGC CATTATAGGATTGACAACAGTGATGTTTCTCCCGATTGGCCAGGTTTGCCTGCTGGTGTA AAGTTTGACCCATCTGATATAGAGCTCTTAGAACATTTAGAAGCAAAATGTGGAGTTGGG AACTTGAAGCCACATATGTTTATAGATGAGTTTATTCCAACACTTGAGGGGGACCAAGGA ATTTGTTATACCCATCCAGAAAATCTTCCTGGTGCTAAGAGAGATGGAAACAATGTCCAT TTCTTTCACAAAACAATTAATGCCTATGCTACTGGTCAAAGGAAGCGCCGCAAGGTTCAG TGTCAACACAGTTTGAATGGGGAACATGTCCGCTGGCATAAAACTGGTAAGACTAAACCT GTAATAGAAAATGGAGTTCAGAAGGGCTGTAAAAAAATTATGGTTCTTTACAAAAGCTCA AAGAAGGGTTCCAAGCCGGATAAATCCAACTGGGTGATGCATCAGTACCATCTGGGCACT GATGAAGATGAAAAGGATGGCGAATATGTGGTTTCTAAAATTTTCTATCAACAAGAAAAG CAAAATGATAAAGGTGATGATTGTCCCATCCTTGAGGATCCCGATAACTCCACTCTTCGA ACTAGTCCAAGGACGCCCAAAACAAATCCTCCTAATCCCCCTCGGCCAGGGAAGTCTGTA AAGGAAGATGATGTTGCTGACGATAATACACATGAGTCATATGCCCAGGAAGCAGTGGAA CTTGGAGAAGCATCACATGTACCTGCACCTGGAGTTCCAATTGATGACCATCTGGGCTAC CAATCATGGTTGGCTGGAGAATCTCAGGCCATTGAAAAGTCTGATTTGGACTGCATTGAA GATTCTTTGTTATGCAAGGAGGAAAACTATTCTTCTGCCGAATTAAACAAATCTGGAATC AATAATGGCTCAAGCACTTGCTTGGCCACTAATGGAAATAACATGAGAGGGAATAACAGT GCACCCTGTGGAATCTCTGACCTGGAGAACCTAGAACTAGATACCCCGCCAGATTTTCAT CTCCCTGACTTGTCTTTTGGTTCTCAGGAAAGCATTCTTGATTGTCTGACTGAAGTTTGC CTCTCCAAACATTTTCTTCGTCTGCAAAGAGTCAACTTGATTGCTTCAAGGGAAGTAGGG ACTTTTCTCTTTCTGGTTCATGAACATTTTGCTCCAAAGGCATATGAGGCTGTGAATAAT GTGAAGGATGGTTGGCGGAAACCGTTATCGTCTTATGTGATTGAAAAAGGTAGTCGTTTT TGTGAGGATTCTCGTCCCTCTTTTGTGCCAGTGAATCATTTCTGGAGTGGGTGGTGGTGT CGTTCAATGTCCACTTCAAGAGGGAGGGGCATGCGAAGCAAGGTGGAGAGACGGATGCAA AAGGAGTCCGGTAAGACCCTCAGAGAGATCCGCAGAGCCAAAAAGATTAAGAAGAAGCTC ATGACTGATGAGGAACGGCTTATTTACAATCTCAAAAGAGCCAAGAAAAAAGTGGCTTTG CTGCTACAAAAGCTGAAGAAATATGAACTACCAGAATTACCACCCCCTGTGCATGATCCT GAGCTATTTACACCTGAGCAGCTTCAGGCATATAAGAAGATTGGCTTCAGAAATAAAAAT TATGTTCCTGTTGGTGTTCGTGGAGTATTTGGAGGAGTTGTCCAAAATATGCATCTCCAT TGGAAGTTTCATGAGACTGTCCAGGTTTGTTGTGATAACTTCCCCAAAGAAAAGATTAAG GAAATGGCAACCATGCTTGCAAGGCTGAGTGGTGGCATTGTGACTAACATACATAACGTG AAAACAATTATCATGTTACGTGGCAGAAACTATCGCCAACCAAAACATTTGATCCCTTTC AACACCCTTACAAAGAGGAAGGCATTGTTCAAGGCCAGATTTGAACAAGCTCTTGAATCT CAGAAATTAAACATAAAGAAGATAGAGCAGCAGCTCCGACGAATGGGTGTAAACCCTGAG GATCCGGTTGCCATGGCCAGCATCCAAAGAGTTGCTTCAACATTTTTCAATGCAATTGAC CAGAAGGAAGGAAGCCCTTATGTCTTCCGGGGAGATAAAGAGTCAGCATTTGAACCTCAT AGAAGTATAGAACATACTGAACCTCCTGCTGATAGTGACCAGGAGGAACTAGATAATTTC ATTGCTGAAATAGAGCATGCAGCTGACAAAGAATGGGAAGCAGAAGAAGCTGCAGAGAAA GAAGAATTCACTAGAATTAGGTATTGGAACAGAGAAGAGTTTGGGGGAAGGTTCAGAAGA ACTGAAAACTACAGTGATGATGACCGAGGTGACAACATTAAAGGAACAAGAGGTTGGAAG GATAAACGTGGACAGAAGAGAAGTGCTGATAGTGGTGATGAAGTTGCTGATGAATGGGAG TCTAGCCATGCTGGAGATGCTAGTGATTTCGAGAGTGATGCTGATGATTCTGATAAAGCT CACAATGATTTCAACAGATTTAAAGTAGAAAGAAGGAAGCAGAATAACGTTGGGGGGGCT AACAGTAATAACAAGGGTTTCCAGAGAAATGTGGAAGCTCATATGGCTGAAGAAGATTCT GAGTCAGAAAACATGTTTAGTGATCTTGAAAACGCAATGTGGCAATCTGACTCTGAGGAT CAGCATGATTCAAGAGCATCAAGAACAGTGGCAACTCACGATCACGTGAACCACAGTGAT GAAGAGGATTTTGAGTACGCTGCTGATGATAATTGTGAAGCTGACAATGAGATCCACATG GATAGAAGATATAATGACAAGCAGCATACTAGGCAGAACAATATTGATTCTAATTTCAAG AGAAATGCAAAAGCTAGCTTCAGGGGAAAAAATACTCAGAAAGAACAGAGGTCAGAAGAT TGCTTTAGTGATTCTGAAGTTACAATGTACGAATCAGACTCTGATAAAGATTCAGGATCG CTGGGGTATAATTATATTAGCAGTGATGAAGAATCTTATCGCCCACAGAAAGTCGAAAAG AATGAAGTGAATCAGAGTAGATCAAAGACACCGAAAGAGGTGGACGAGACATGGGACAGT GATTAGCTTCAAATTTGCTCATCTGTTTTCTCCTCAGATTGTATCAGGCAAGCTGACCAA TGGAGATCAATTTTTCATGCTTTATTCATTTGGTGGAATTATACCCTTTGCTTATTCTTA AACATGAAAATACAAGGTTCAGCACAATGTAAACTGAGACTGCTTTGAATGTTAAATGAA GGCAGAAGACATTCTTTAATTGATGAAATGAGGTCGAAGATGTTCATTGTTTTTCTCTGC ATGGCATTCGAATTGAGTACATTTCTTCTTTGTACATCAAGCGTTTTTATTTGTTAAATG GCGAGGTTTGATTAGGGGATATATTTTTTATTACCACATACTCGTTTGAATTGGAAATCT GGGAGAAGAGAGACTATTACCTCGAGAAAGAAACGTAATGTGCATAAACTTAATTACAGT ACAGAAGTTCATAATCATTTTCAACTCTAGTGCCAAGTTTGTAACCTTTCCTAGTATGTT GGTTCTAAAATTTGTTACTGTACATAAAA
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>LITCHI020609.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCTGCATTACCTCTCTATGATTTCACCACCAGAGCCTGTTGTCCCTGTTCGGACATTTTC TTCAGAGAATGTTGTATATCCACCGGAATCTCCGGGCACAAGCTCTTTAATGTCTGCAAG AGATGACTCAGGAGCGGCCCCAAACTCATCAACAGTAAATGACAAGCCGAGAGGTTTCTT CTTCTGCTTTAACCAATGTTACTGATGCTTCCAATGACACAGTCTGCCCTTTGGGGATCC CCCCATATTACTGTAGGAATATCAATAAACAATAATCACAAATATTACATAATACATCTC TTATAAGAAAATGTCAATCTATTCCATAGGACTCTGAGTAGTCTCCGATACCTTTATTAA CTTTGGATTCTCATTCTTTCATGAATACAAGTATCATACCAGATGGATATTTAGGATTTA GGAGTGGAGGTTGCTGTGATGTATTATCATTGTAATATAGGGTCATCCAAAGGCCTTGAC TCCTTACATCCGACCACTGACCCGGGAAAGAGAGAAGCCATTCTGATTATTTAACTCAAA TTAATTTGTTTGTACCAAATGGTTTGAAAGTCTACGCTTTGTTACAACATTGTCAATCTG TATTGATGTTTTAATACAATACGTTGCATATTCCCAACTTGAGCTTTGCTTTTCCTGATT TTAGGCTTGTTTGCTCCTAAAAGATGCAGCATCCCTGTTACTGGGGAACATAATCCGGGC CTGTTTGACATGCCATGTAAAGACTTGATAGTTGATAATTAATGAGAACTTCTGTGCACA TGAGACTTTAAGCTAAAAATATCTTTTAAATGTCATGCACAACATATACAGGACCTAATT TGGCTGCAAATTAACACCTTTAGCTTCAGTTTCAAAGAAAGTGTTATATTTCAAAGATTG CTCTACAAGGTTGTCTAAAGTGTTGACAAATACCACATCATGCCCTTTTTAAGTTGACTA CTTTTCATGTAAAGCAAGTTTCGAATTCCAAGAAGTTTTTGCTTAGAAAATATCTCAGGC TTCCCTTCCAATGGCTATTAAAATTTGAAAGCTCTTTTACTTTATCATCCAATTACCTCT AAAAGTAGTTTTTGGATTTCAAAAATTGCAAGTTAGATTTTAAAAATATATCAAATAGGA CCTCAATTTAAAAGCGAAAAGATCAGTTAGCATATTAGTATTCAAAATTTTATGCAATTA ACCTAGATTTAATGCCAAGTGATGTTGTTCAAAATTATAAATTTTTATGTTATAATTTAT TACAATTATAACTTCAAAACTTCGTGTTGTGCTAAAAAATAATACCGGGGCTAGAAACCT AATAAGAGTTTGATAGATTAACAAGCCTAAAGGCTCATATGAAAAATGAAACAGTTTAAA GTTAATCGTACCATGATATATTAAATGTTATGCGAGTAAGGACACTAAACAAGTTCAATT GCTCTAAAATAGTAAATCAACTCAGAACAAGAAGCTTGCAAAAGACATTGCTCGAGGTAA CAATCATAAAAGCAGCCTATGGCATATATGTGAGTTCGCAATTTTTTTATTAGTAAAAAA AACACGGAGACTTGAAATTTTTTACCAATTCGCAGAAACTAAGTGTTAATGGATTTTGGA CAACGACACTTGGACAACTAGAATTATTGTTTTTGTAAATCGTTATGATTTAAAAAAAAA AATCCCTGTAAATTAAAATAAAACGTAAATTTAGAATTGTCCAGCACTCTTTTTTTTTTA TTTATTTTTTTAATGGCTATTGTCCAGCACTTTTGTTGGCAATGATGGCAAATTTGAGGC TTTCAAGTCTCATTAACCGCGTAAAGGCAGCTTCACCTTCAACTAACACATAACGACAAA CAACAGTGTCGTATGGACTGTACACAATCGTCAATATTTAAATTGTGAGTGGATAAAATG GGGCGATTAAAAGAGTGATTTGTCACAGTTTCCACAATAAGCTTGGGGAGCACGAAAGCG GATGTCCCTACCCCTTCCAA
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>LITCHI020609.m1 GenomeSequence + ATGCCCTGCGCTTTTACCAAAATGCCCCTGAACTCGGTTTTCGAAGTTGCAACTCGTCCG ACAGGACTTAGGTTCGTGTAAGAGCAGACAGCCTCGGACTTAGCTTCAGTCAACGTCCGG GGCCCACAAAACAATTCAGTTTGCCTGATACGTTGACCCGAAGCTGAGGTTCGGGGTCCG AACCTCTCATTAACGGCTCCAAACCAAAGAAGAATTTTCCCGCTCAGCGTGAGAAAAAGA GAGAGAGCTCAGTTAACTTAGCCGAGTGGAGAACAGAGAAGACTCAAAGAAATTGATGAG AACATTTACACTATATCAATACAAAGTGACTGCTTTCTCTCTATCTCTACAACTCTCTTG ATAGATAGAAATGTCCAGGTGAGATTCAAGTTGATGAACATCTTCGCATATTTTATTTCC TCCATTAAAGATTTTAACTTTCTTTTAAAACAAAAAGAAAAAATTTCTTTTATTTTTTTA TTTTTTTGTTTTGTTTTTGGGTTGTTGCTCTGAAAGAAGGTTGTGGGAGATGGGTTTGGT TTATTTGAAAGGAACTTTATGGTTGGCATTATAGTGCAAATGGGAACCACTACCAGTGTT TGATGCAACGTGAATAATAATGTTGCTAGGAAAAATAAATGGAGTTTTGGAACTTGTATT GATTAGAGCCGCGGACCTTTTTCTGTTTATCAGGGTGTGAGTTGTGTTGGTCTTAAAGAA TTCAAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATTTCGGAGTAATTAGTGCAAGTTAATATAA GTCAATATTAGGTTAACTTATATCATGATTTCTATCTGTAAAAGAAGAGAAATTTAGTCA TGAAGAGGGGTAAATTTTTTTATTTGGTTGGGCAAGCTTCAATGGGAACTTGGAATTTTA 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