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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020608 | Chr12 | 15871437 | 15876832 | + | Serine/threonine-protein kinase HT1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020608.m1 | 29 | 286 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 192.4 | 9.40E-57 |
LITCHI020608.m1 | 30 | 284 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 178.4 | 1.80E-52 |
LITCHI020608.m1 | 44 | 257 | PF14531.9 | Kinase-like | Family | 28.9 | 7.50E-07 |
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>LITCHI020608.m1 ATGGGATCTTCAAATGAATTTTTTGCATCTACACAGTTCAGTTTAGACCCCAAGTGGCTA GTTGATCCTAAGCAGCTTTATGTTGGGCCAAAAATTGGAGAGGGAGCTCATGCTAAAGTA TACGAGGGAAAATATAAGAATCAAAATGTTGCTATTAAAATTGTTCATAGAGGAGACAAC CCTGAAGAGATTGCCAAGAGAGAAGCGCGATTTGCAAGAGAAGTTGCTATGCTGTCTAGA GTACAACACAAGAATCTTGTGAAGTTTATTGGTGCTTGTAAGGAACCTGTCATGGTAATA GTAACTGAGCTTCTATTGGGTGGGACATTGCGTAGATACTTGTTGAACACGCGGCCAAGG TCCTTGGACAGTTGTGTGGCTATTGGTTTTGCCCTTGATATTGCTCGTGCAATGGAATGT TTACACTCACATGGGATCATTCATCGTGACCTAAAACCTGAGAACTTGATCTTGACTGCA GACCACAAAACAGTCAAACTTGCAGATTTTGGTTTAGCCAGAGAAGAATCAATAACAGAG ATGATGACTGCTGAAACAGGGACATATCGTTGGATGGCTCCAGAGCTTTACAGCACAGTC ACATTAAGGCGTGGAGAGAAAAAGCATTACAATCACAAGGTGGATGCTTACAGTTTTGGG ATTGTGTTGTGGGAGCTTATCCACAACAAGTTGCCTTTTGAAGGCATGTCAAATTTACAA GCAGCATATGCAGCAGCTTTTAAGAATGTGAGGCCCAGTGCTGAGGATCTACCAGCAGAT TTGGCTTTGATTGTTACTTCATGTTGGAAAGAGGATCCAAATGCAAGACCAAACTTCAGC CAAATCATCCAGATGCTTCTGCATTACCTCTCTATGATTTCACCACCAGAGCCTGTTGTC CCTGTTCGGACATTTTCTTCAGAGAATGTTGTATATCCACCGGAATCTCCGGGCACAAGC TCTTTAATGTCTGCAAGAGATGACTCAGGAGCGGCCCCAAACTCATCAACAGTAAATGAC AAGCCGAGAGGTTTCTTCTTCTGCTTTAACCAATGTTACTGA
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>LITCHI020608.m1 GATTTGCGCTCTCTCTCTCTGGGTCCAAATAATTTCTTATTAACGAAAAGACACTATTTT TCTGACAAAGACTCAACTCCTGCCGCGGCTTTATATGCTCTCGCAGGTCTAGGAACCTCG ACTTTGTCTCAAACGCGTCCAAAACCAGAACCCTCTCATTTCTTCTCTCAAACCCACCTC CACCTTCACATTTCCCAGTCTACCTCCTTGAGTTTCACTGCAAACTCCAATCCTCCATCA AACTTCTCTTCATATACTTTCCTTTCCTCATCGCTTCATTTTTTCCCATCTAAGTTTTTA TATTTTCAACTCTGTTTCTAGACAGAACTTGTTGAGCCTCTTTCCTCTGTTTCTAAATTC TACAATTGTCAGTAGCTAGGAGGTGTCTGTGGAGACTGAATAAAAAACATGTGTGCTTTT ATTGATCTTTGTCTTGAGAATTAAAGGTCTTGGTCTTTTTTTTGATGACTTTGGATCTGT CTCTGAATGGGGATGTCTTGTGTCTATTAATAGTTGAAACTTTGATTTTACTTGGGAAGA AGAAGTGGTACACACGAGGAGAGCTTGCTTGATTTGGTTTTGTTAGTTCTTCTTTAATAG AGTTAGAAGGGCCAAAAAATGGGATCTTCAAATGAATTTTTTGCATCTACACAGTTCAGT TTAGACCCCAAGTGGCTAGTTGATCCTAAGCAGCTTTATGTTGGGCCAAAAATTGGAGAG GGAGCTCATGCTAAAGTATACGAGGGAAAATATAAGAATCAAAATGTTGCTATTAAAATT GTTCATAGAGGAGACAACCCTGAAGAGATTGCCAAGAGAGAAGCGCGATTTGCAAGAGAA GTTGCTATGCTGTCTAGAGTACAACACAAGAATCTTGTGAAGTTTATTGGTGCTTGTAAG GAACCTGTCATGGTAATAGTAACTGAGCTTCTATTGGGTGGGACATTGCGTAGATACTTG TTGAACACGCGGCCAAGGTCCTTGGACAGTTGTGTGGCTATTGGTTTTGCCCTTGATATT GCTCGTGCAATGGAATGTTTACACTCACATGGGATCATTCATCGTGACCTAAAACCTGAG AACTTGATCTTGACTGCAGACCACAAAACAGTCAAACTTGCAGATTTTGGTTTAGCCAGA GAAGAATCAATAACAGAGATGATGACTGCTGAAACAGGGACATATCGTTGGATGGCTCCA GAGCTTTACAGCACAGTCACATTAAGGCGTGGAGAGAAAAAGCATTACAATCACAAGGTG GATGCTTACAGTTTTGGGATTGTGTTGTGGGAGCTTATCCACAACAAGTTGCCTTTTGAA GGCATGTCAAATTTACAAGCAGCATATGCAGCAGCTTTTAAGAATGTGAGGCCCAGTGCT GAGGATCTACCAGCAGATTTGGCTTTGATTGTTACTTCATGTTGGAAAGAGGATCCAAAT GCAAGACCAAACTTCAGCCAAATCATCCAGATGCTTCTGCATTACCTCTCTATGATTTCA CCACCAGAGCCTGTTGTCCCTGTTCGGACATTTTCTTCAGAGAATGTTGTATATCCACCG GAATCTCCGGGCACAAGCTCTTTAATGTCTGCAAGAGATGACTCAGGAGCGGCCCCAAAC TCATCAACAGTAAATGACAAGCCGAGAGGTTTCTTCTTCTGCTTTAACCAATGTTACTGA TGCTTCCAATGACACAGTCTGCCCTTTGGGGATCCCCCCATATTACTGTAGGAATATCAA TAAACAATAATCACAAATATTACATAATACATCTCTTATAAGAAAATGTCAATCTATTCC ATAGGACTCTGAGTAGTCTCCGATACCTTTATTAACTTTGGATTCTCATTCTTTCATGAA TACAAGTATCATACCAGATGGATATTTAGGATTTAGGAGTGGAGGTTGCTGTGATGTATT ATCATTGTAATATAGGGTCATCCAAAGGCCTTGACTCCTTACATCCGACCACTGACCCGG GAAAGAGAGAAGCCATTCTGATTATTTAACTCAAATTAATTTGTTTGTACCAAATGGTTT GAAAGTCTACGCTTTGTTACAACATTGTCAATCTGTATTGATGTTTTAATACAATACGTT GCATATTCCCAACTTGAGCTTTGCTTTTCCTGATTTTAGGCTTGTTTGCTCCTAAAAGAT GCAGCATCCCTGTTACTGGGGAACATAATCCGGGCCTGTTTGACATGCCATGTAAAGACT TGATAGTTGATAATTAATGAGAACTTCTGTGCACATGAGACTTTAAGCTAAAAATATCTT TTAAATGTCATGCACAACATATACAGGACCTAATTTGGCTGCAAATTAACACCTTTAGCT TCAGTTTCAAAGAAAGTGTTATATTTCAAAGATTGCTCTACAAGGTTGTCTAAAGTGTTG ACAAATAC
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>LITCHI020608.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTGTTGATGAAAAAAAAAAATCAATATAAACATCGAAACAAATTTTACAAACTGTACTT GAATGTGCTTTTATTTTTTAAAAAAATCAAATCACTAAAAATAAATTATATAAAGAAGTT TTAGATGAGATGATAATAATGTCCCAAGTACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTT AAAAGAGCATTTTGAAAACACAATCAATAAAGTGATTCTTTTCTTCATTTTTCTTTTTGT ACTACGGACTTAAAAAAAAATTGAAGAGAATATGACATTAATTTGTGACCTTATTAATGA AGATATAAATTTATACGGTTCCCCACCATATAACCTCAAAATTTTTGGTTATTTCTGTCT TCATCATTTAACTATGTTTGTACGATATTAAATAATAATAATAATAATATAAAACAGTTA ATATGGTACTTAAATTGGAAAAAAAAAAAGGTCAGACTCTAAAACCCATAATAAGTTATA AACTTATGGTGTATTTACTTGATGAATGGAAAAATGAGAATAAGGAATGTAAATTATTGA TAATGTTTATTTGCTATAAAATCATTTCGTAATAAAAATGAAATTATGAGTCTTATTTAA ATTTGAGATTGTGGAATGAGAATTCAATTTCCTCCATCCTCTTTGAGAATTTTATTTTCA TTCACCTTTCTAAATTAAAAATACTTTTATACCCCTTATTAAAAAAAAGTTTTATGAAAA ACTTGTATATATATTTTTATACATTTTATGTTTATTAAAAAAAAAGTGTTTATACATTTT GTATTCCCTTTTCCACTTGGATATAGATTTTTCGTTATTTTAGTTGGTTGTTTTTATATT TATAAAAATAAATATTTACATATGCTAAAATATTCATTATATATAAATATGAATGTATAT TTATAAAAAAGAAACACAATGCTTCTTTTGCTATGTTATTTATTTTTTTATTTCATTTTA CAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTATGGAGTACATAATTTCAATTAAGGGTATTTTCTGTA ATTTGTAATTAATTCATTTAAATTTCAAAAAAAGTAAACAACTCAATGAAAATATTATTA ATTCTCATTTCCATTCTTACAATTGATGTAAACAATTTATTTTGATTTCGATACATTATT TCGATTCTAGATTATTTCATTTTCATTCAAATTCCTATAATTAAAGTAAATGCATCATTA AAATAATGTTAGATTTCTCAATTTTTTGGAAAGTGAGTTATTGACATTATATTAATTATC ATATTATCTTATGATTTATAAGAGATTGACAATATATAATTTGGATAAAAGATTTGAAAA ATGTAACGTTACTTATAAATTTACCGTAATAAAATTAATACAGTAACAAAAACATCACTC TAGATTTGCGCTCTCTCTCTCTGGGTCCAAATAATTTCTTATTAACGAAAAGACACTATT TTTCTGACAAAGACTCAACTCCTGCCGCGGCTTTATATGCTCTCGCAGGTCTAGGAACCT CGACTTTGTCTCAAACGCGTCCAAAACCAGAACCCTCTCATTTCTTCTCTCAAACCCACC TCCACCTTCACATTTCCCAGTCTACCTCCTTGAGTTTCACTGCAAACTCCAATCCTCCAT CAAACTTCTCTTCATATACTTTCCTTTCCTCATCGCTTCATTTTTTCCCATCTAAGTTTT TATATTTTCAACTCTGTTTCTAGACAGAACTTGTTGAGCCTCTTTCCTCTGTTTCTAAAT TCTACAATTGTCAGTAGCTAGGAGGTGTCTGTGGAGACTGAATAAAAAACATGTGTGCTT TTATTGATCTTTGTCTTGAGAATTAAAGGTCTTGGTCTTTTTTTTGATGACTTTGGATCT GTCTCTGAATGGGGATGTCTTGTGTCTATTAATAGTTGAAACTTTGATTTTACTTGGGAA GAAGAAGTGGTACACACGAGGAGAGCTTGCTTGATTTGGTTTTGTTAGTTCTTCTTTAAT AGAGTTAGAAGGGCCAAAAA
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>LITCHI020608.m1 GenomeSequence + GATTTGCGCTCTCTCTCTCTGGGTCCAAATAATTTCTTATTAACGAAAAGACACTATTTT TCTGACAAAGACTCAACTCCTGCCGCGGCTTTATATGCTCTCGCAGGTCTAGGAACCTCG ACTTTGTCTCAAACGCGTCCAAAACCAGAACCCTCTCATTTCTTCTCTCAAACCCACCTC CACCTTCACATTTCCCAGTCTACCTCCTTGAGTTTCACTGCAAACTCCAATCCTCCATCA AACTTCTCTTCATATACTTTCCTTTCCTCATCGCTTCATTTTTTCCCATCTAAGTTTTTA TATTTTCAACTCTGTTTCTAGACAGAACTTGTTGAGCCTCTTTCCTCTGTTTCTAAATTC TACAATTGTCAGTAGCTAGGAGGTGTCTGTGGAGACTGAATAAAAAACATGTGTGCTTTT ATTGATCTTTGTCTTGAGAATTAAAGGTCTTGGTCTTTTTTTTGATGACTTTGGATCTGT CTCTGAATGGGGATGTCTTGTGTCTATTAATAGTTGAAACTTTGATTTTACTTGGGAAGA AGAAGTGGTACACACGAGGAGAGCTTGCTTGATTTGGTTTTGTTAGTTCTTCTTTAATAG AGTTAGAAGGGCCAAAAAATGGGATCTTCAAATGAATTTTTTGCATCTACACAGTTCAGT TTAGACCCCAAGTGGCTAGTTGATCCTAAGCAGCTTTATGTTGGGCCAAAAATTGGAGAG GGAGCTCATGCTAAAGTATACGAGGGAAAGTATGTCAATTTGTTGTGTCTTCTGTTTCTT TTCTCTTGATTCTAGTTCTTGATCTTCATATAATCAATTAGGTTCTTTGATATTTAGAGT AAATTTAATTATCTGTGTTTGTTGACTTTTTTTCTGTTTTCTTTATTTTTTATAAACTAT 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