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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020585 | Chr12 | 15603920 | 15618508 | + | Pescadillo homolog |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020585.m1 | 88 | 288 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 166.6 | 7.50E-49 |
LITCHI020585.m1 | 90 | 287 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 103.5 | 1.20E-29 |
LITCHI020585.m1 | 479 | 740 | PF06732.14 | Pescadillo_N | Family | 347.7 | 5.40E-104 |
LITCHI020585.m1 | 795 | 882 | PF16589.8 | BRCT_2 | Family | 35.2 | 1.30E-08 |
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>LITCHI020585.m1 ATGGCAGGGTTGGAGGAATTGAAAAAGAAGCTTGCACCGTTATTTGATGCTGAAAAGGGG TTTTTGGCTGGATCAACTTTTGACCCTTCTGATTCTTGTATGCTATCAGATGGTGGAACT GTAAATTTATTAAGTAGATCTTATGGAATGTACAACATCAATGAGCTTGGATTGGAAAAA TGGGCGACGGGGTCTGGGCTGGTGGATGAAGCAGACCATGGTGAAAAGACATATCGATGT GCCTCTCATGAGATGAGGATTTTTGGATCTATAGGTAGCGGTGCAAGCAGCGTTGTCCAG AGAGCTATCCACATTCCCACTCACAAAATTATTGCCTTGAAGAAAATTAATATTTTTGAA AAGGAGAAAAGACAACAGCTCCTAACTGAAATAAGGACATTGTGTGAAGCACCTTGTTAT GAGGGTCTCGTGGAGTTCCACGGGGCATTTTATACACCAGAGTCTGGGCAAATAAGCATA GCTTTGGAATATATGGATGGAGGATCGTTGGCAGATATCTTACGATTGCAGAAAAATATT CCAGAGCCAATTCTTTCATCTATGTTTCAAAAGCTACTGCAGGGATTAAGCTATTTACAT GGAGTTAGACATTTAGTTCACAGAGACATCAAGCCAGCAAATCTTCTTGTAAATCTCAAG GGGGAGCCAAAAATTACAGATTTTGGCGTAAGTGCTGGTCTAGAGAATTCAATGGCAATG TGTGCTACTTTTGTGGGAACTGTTACATACATGTCACCCGAAAGAATTCGAAATGAGAGC TATTCTTATCCTGCTGATATATGGAGCCTTGGTCTTGCTCTCTTTGAATGTGGCACAGGA GAATTTCCATATACAGCTAATGAAGGACCTGTCAATCTGATGTTGCAGAAGGATGCGGAT GCTAGGCCCACAGCAGAGCAGCTTCTTTCACACCCATTTATAACCAAGTATGAGGATGCT AGAGTGGACCTAGCAACATTTGTCCGCAGTGTATTTGATCCAACAAAAAGGTTGAAGGAT TTGGCTGATATGCTGACGATACACTATTACTTACTTTTTGATGGACCGGATGAACTTTGG CAGCATTCAAAGACCCTATATAAGGAAGGGTCAAGTTTCAGATACTCTGGGAAGCAATCT GTTGGTCCAAATGATATCTTTGTGACTTTGTCGAATATTCGGAGTACGTTAGCAGGTGAC TGGCCTCCTGAAAGATTAGTACATGTTGTGGAAAAGCTTCAGTGCCGTGCTTATGGTCAA GATGGAGTTACCATTCGAGTATCTGGTTCCTTTATTATTGGGAATCAGTTCCTTATATGT GGAGACGGCTTACAAGTAGAGGGCTTGCCGAATTTTAGAGATCTTTCAATCGATATTTCT AGTAAACGAATGGGTACGTTTCAGGAACAGTTTGTCATGGAACCGGGCAATGGAAAGAAA AAAGAAGGAAACGCTGCTAGATACATCACCCGCTCACAAGCTCTCAAACTCCTTCAAGTC AACACAAAGCTTTTCAGGAAACTATGTGTTTATAAAGGTATATTTCCTCGGGAGCCGAAG AAGAAGTTTAAGGGAAATCACCACACTTATTATCACTTGAAGGATGTTTCCTTCATTCGG CACGATCCAATTCTTGAGGAGCTTAGAGCTAAGAGCACTTACTTGAAGAAGGTTACTAAA GCCAAGGCCAAAAAGAATAGGGAACTTGCAGACGCTCTGTTGAAGCGTCAACCTGAAATC AAACTTGATAGACTTGTCTTGGAGAGATATCCGCACTTTGTTGATGCTCTTCGAGATTTG GATGACCCGCTCACATTGGTGCACCTGTTTGCTGCGTTACCTGCCAATGACAGGATTAAA ATTGAAGTGAAGCGCGTCCATAATTGTCGAAAGCTGAGTCATGAATGGCAAGCCTACATT GCTCGTACTCATAAATTGCGAAAGGTTTTTGTATCTGTGAAAGGAATATATTACCAGGCT GAGGTTGATGGTCAGAAGATCACATGGCTGACACCTCATGGGCTGCAGCAAGTTTTGCCT GATGAGGATGTTGTTTATGATGTCTTAATAACATTTTTGGAATTCTATGAGACTCTCCTT GCCTTTGTCAACTTTAAACTTTATCATTCCATAAATGTAAAATACCCTCCCATTCTTGAT CCTAAATTGGAAGCTTCAGCAGCAGAACTCTATGCATTGTCAAGGTACTTTGATGCAAAC ACTAGAACTTCTGGGCAGCTTGAGGAGACACGGCTAGAAGAATCTGAACTCAGACTTGCC CAACTTCAACATCAGCTTCCTTCCAATGAACCAGGTGCATTGATGCAACTTGTTAAAGGT GCTGCTGATGAAAATGAAGAGGATGAAGAAACAAAGGAGTGTAAGAAACTCTTCAAGAAT ATGAAATTCTTCTTAAGTCGTGAGGTTCCTAGGGAATCTTTGCTTTTTGTCATCCCTGCT TTTGGTGGTATGGTTTCTTGGGACGGAGAAGGGGCTCCTTTCCAGGAAGCTGACCAGAGT ATTACTCATCAGATTGTTGACAGACCAACTCAAGGTCATATGTTTCTTTCAAGAGAATAT GTTCAACCACAGTGGGTTTTTGATTGCATAAATGCGCGGATTATATTGCCAACTGATGCT TATTTGGTGGGAAGGGTTCCTCCCCCTCACTTGTCACCTTTTGTTGATAATGAGGAAGAA GGTTATGTTCCTGACTATGCAGAAACCATTAAAAGGTTGCGAGCTGCTGCCAAAAATGAA ATCCTGCCAATGCCAGGTGCTGGAGTCGAAGATTTGGATGATCCTCAGAATTTGTTGGCA GAAGGTTATATAACTAGAACAGAGGCTATTGAAGCTGCCGAGAGAAAGCAGAAGATGATG ACTTTTGAGAAGCAGTATCATGATGAATTAAAGATGGAGCTTCAGGGCTCCCAATATTCT TCATCTGTCTCTGATATTAATAAGCAGGCTTCTGGTGAGGATATGGAGGCTGGTGATGAA CCTCTCCCTGATGTGCAACAAATTGCCAATGACGCTGCAAATATGTCGAAAGTTCTCATG TCACGTAAAAAGAGGGGGCTTTATGAAGCCATGAAGAAAGGGCAAGAACGGAAGAAAGCT CACGTTGATCTTCTCAAGGACCGAAAGAAAAAAATTAAGGAAGCTAAGAAATCCAAGAAG AATTAA
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>LITCHI020585.m1 MAGLEELKKKLAPLFDAEKGFLAGSTFDPSDSCMLSDGGTVNLLSRSYGMYNINELGLEK WATGSGLVDEADHGEKTYRCASHEMRIFGSIGSGASSVVQRAIHIPTHKIIALKKINIFE KEKRQQLLTEIRTLCEAPCYEGLVEFHGAFYTPESGQISIALEYMDGGSLADILRLQKNI PEPILSSMFQKLLQGLSYLHGVRHLVHRDIKPANLLVNLKGEPKITDFGVSAGLENSMAM CATFVGTVTYMSPERIRNESYSYPADIWSLGLALFECGTGEFPYTANEGPVNLMLQKDAD ARPTAEQLLSHPFITKYEDARVDLATFVRSVFDPTKRLKDLADMLTIHYYLLFDGPDELW QHSKTLYKEGSSFRYSGKQSVGPNDIFVTLSNIRSTLAGDWPPERLVHVVEKLQCRAYGQ DGVTIRVSGSFIIGNQFLICGDGLQVEGLPNFRDLSIDISSKRMGTFQEQFVMEPGNGKK KEGNAARYITRSQALKLLQVNTKLFRKLCVYKGIFPREPKKKFKGNHHTYYHLKDVSFIR HDPILEELRAKSTYLKKVTKAKAKKNRELADALLKRQPEIKLDRLVLERYPHFVDALRDL DDPLTLVHLFAALPANDRIKIEVKRVHNCRKLSHEWQAYIARTHKLRKVFVSVKGIYYQA EVDGQKITWLTPHGLQQVLPDEDVVYDVLITFLEFYETLLAFVNFKLYHSINVKYPPILD PKLEASAAELYALSRYFDANTRTSGQLEETRLEESELRLAQLQHQLPSNEPGALMQLVKG AADENEEDEETKECKKLFKNMKFFLSREVPRESLLFVIPAFGGMVSWDGEGAPFQEADQS ITHQIVDRPTQGHMFLSREYVQPQWVFDCINARIILPTDAYLVGRVPPPHLSPFVDNEEE GYVPDYAETIKRLRAAAKNEILPMPGAGVEDLDDPQNLLAEGYITRTEAIEAAERKQKMM TFEKQYHDELKMELQGSQYSSSVSDINKQASGEDMEAGDEPLPDVQQIANDAANMSKVLM SRKKRGLYEAMKKGQERKKAHVDLLKDRKKKIKEAKKSKKN.
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>LITCHI020585.m1 CTTCATTGACGGAGGCAACTGCCTAACTATATAGTCAGCCGAAAATATCCACCATTTCTA CAATTAATTAATTTTAATTCCCAACAATTCTAAAACCCTCCATGCAAACTCAAATCCAAA ACTTATTTCAAATGTAGAACGTCCAGAAACTCAACCCACAAACCCATCTAAATACAAGCT GACATAGTCGTATAATTTGTTGGCTCACCAAAACAAATTGTCATGTTTCTAAATAAATGG AGAATTCAAGTCCGAGATTCAAAAATTGTCATCCTCCACCCATCCCGCTACCACCACCGC ATTGCTCTCGGCAACTTTCATCAATTGCTTAAACAACCGAGTCGACATACAAGACTCAGC ACTCGCGCTCTGGAGGACGAGTTTGCTTTCTTCTTGCCAGTTTTTTCCCTTTATTTTTAA TTGTTATAAATTAAGTCCACGTGTTTTAACCTGAAACGTCAAGGGCATGAGTGTAATTTT ACCTATTCCTAAATTAAATAACCTTGTGAAACCTCACCATAACGACACTAACCCGACCGT TTTAGGAAAGTGACTATTGAAACTCGCCACGATGATTACAAATTGAAGAAACTGCGACTC GTGTTCGTTGGTTGGTTGGTTCACAATTTCGTTCGTTGAAATTTCACGTAAATTGTTATG GCAGGGTTGGAGGAATTGAAAAAGAAGCTTGCACCGTTATTTGATGCTGAAAAGGGGTTT TTGGCTGGATCAACTTTTGACCCTTCTGATTCTTGTATGCTATCAGATGGTGGAACTGTA AATTTATTAAGTAGATCTTATGGAATGTACAACATCAATGAGCTTGGATTGGAAAAATGG GCGACGGGGTCTGGGCTGGTGGATGAAGCAGACCATGGTGAAAAGACATATCGATGTGCC TCTCATGAGATGAGGATTTTTGGATCTATAGGTAGCGGTGCAAGCAGCGTTGTCCAGAGA 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>LITCHI020585.m1 + Up_Stream_Len 2000 GGTTAGGATTTGATTAGTACCAAAGATTTTTTATTTATTTTTTATTTTTTAAGAATATTT TGATAATAATATAATAATAAAAGGTTAATTTAGAAAAATAATGTATTTTATTGATTATAA AAGTCTTTATCATTAAGATATAAGTAAAAATTTTGCACTCTTCTGTAGATATTTATAACT AATATTGAGATTTACCTTGAAAAAAATGATTATATATATATATATATATATATATATATA CACTGCAATGTATTGTATATGAACTATTAACTTTGCTGGATAGATGATAATGAAAAAGTT GATGTTGGTTCATAATGATATTTGGGTTGATCTTGGGTTGATCTTGATTGGTGATCAACA AATTTTATATTTTAATTTTTTTAATTTATATTTTTAATTGATTCTACAAAGAGAAAAATA AATTTATTTTTTAATGTGATTCTATTTGAACAGTGGAAATTATTTTTCAATAAAAGAAAA TATTAATCTATAAAGATGAGAATACTCTTATATAAGTTACATTAAATTTGACTGACGAAT GAAGTTTCTTATTAATAAAGTGTAAATTTAATTCGGGATGTAAATTCCTCATGTATACAT TTGCTTAATCTACTCTGACATCTCTGCATTTATTATTGTTTCTAGATCAATTATTATTGT CTCTAGATCAGTATGTTCAGGAGATTGAGTTTGACAACTAGAATGTCTAAAATGCCCTCA TAAATAAATCGAAATACAAACACAAAGCAAAACTAAAATTAAATAAAAACAATGGAGGCC ACTTCATTGACGGAGGCAACTGCCTAACTATATAGTCAGCCGAAAATATCCACCATTTCT ACAATTAATTAATTTTAATTCCCAACAATTCTAAAACCCTCCATGCAAACTCAAATCCAA AACTTATTTCAAATGTAGAACGTCCAGAAACTCAACCCACAAACCCATCTAAATACAAGC TGACATAGTCGTATAATTTGTTGGCTCACCAAAACAAATTGTCATGTTTCTAAATAAATG GAGAATTCAAGTCCGAGATTCAAAAATTGTCATCCTCCACCCATCCCGCTACCACCACCG CATTGCTCTCGGCAACTTTCATCAATTGCTTAAACAACCGAGTCGACATACAAGACTCAG CACTCGCGCTCTGGAGGACGAGTTTGCTTTCTTCTTGCCAGTTTTTTCCCTTTATTTTTA ATTGTTATAAATTAAGTCCACGTGTTTTAACCTGAAACGTCAAGGGCATGAGTGTAATTT TACCTATTCCTAAATTAAATAACCTTGTGAAACCTCACCATAACGACACTAACCCGACCG TTTTAGGAAAGTGACTATTGAAACTCGCCACGATGATTACAAATTGAAGAAACTGCGACT CGTGTTCGTTGGTTGGTTGGTTCACAATTTCGTTCGTTGAAATTTCACGGTCAGTTGTTT TCTTTTTTTCTTTTGATTTTTATTATATTTCTAAATTGAAAGTAAACTCATATATTTTTA TTATGGATATTGCTTCTTTGATTTGTATGTTTTTGTAGTCTGCGTTGTGAATATTTATTT AAATTGTTATTGTTTTAGTGATGTACTGTTGGTCAAATTGTGTACTGTGTGACATACATA TGCTTAATTTGGTATGCAAATCTCTGGACATTTATTGCAGTGGCCAAGATCAGATCACAA TTTGAGTTTTTCTTTTGTTATTAATTATGATATCTAGTTACTTTAATTAGAGAAAAAAAT TGATAGCTGTTGTGTTTTTATATAGCAGTAGCAATTATAGATGTGTTGAAGTGTTGAAAG AACTCAAGTTGTTTTTGTGTCGATGAAATGCATGTGATGTGGATTGTTTACCATAATTTA GACATGAAATAGAATTCTGGGTGGTTGGTTGTTTGTTTAAGATATTGTGATGTTCTCAGT TTCAAAGATATGGAAATGTTGAATGTGTTGATGGTAATCTCTGAAATGAAAAACAATTTT TCTTGTTGTAGTAAATTGTT
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>LITCHI020585.m1 GenomeSequence + CTTCATTGACGGAGGCAACTGCCTAACTATATAGTCAGCCGAAAATATCCACCATTTCTA CAATTAATTAATTTTAATTCCCAACAATTCTAAAACCCTCCATGCAAACTCAAATCCAAA ACTTATTTCAAATGTAGAACGTCCAGAAACTCAACCCACAAACCCATCTAAATACAAGCT GACATAGTCGTATAATTTGTTGGCTCACCAAAACAAATTGTCATGTTTCTAAATAAATGG AGAATTCAAGTCCGAGATTCAAAAATTGTCATCCTCCACCCATCCCGCTACCACCACCGC ATTGCTCTCGGCAACTTTCATCAATTGCTTAAACAACCGAGTCGACATACAAGACTCAGC ACTCGCGCTCTGGAGGACGAGTTTGCTTTCTTCTTGCCAGTTTTTTCCCTTTATTTTTAA TTGTTATAAATTAAGTCCACGTGTTTTAACCTGAAACGTCAAGGGCATGAGTGTAATTTT ACCTATTCCTAAATTAAATAACCTTGTGAAACCTCACCATAACGACACTAACCCGACCGT TTTAGGAAAGTGACTATTGAAACTCGCCACGATGATTACAAATTGAAGAAACTGCGACTC GTGTTCGTTGGTTGGTTGGTTCACAATTTCGTTCGTTGAAATTTCACGGTCAGTTGTTTT CTTTTTTTCTTTTGATTTTTATTATATTTCTAAATTGAAAGTAAACTCATATATTTTTAT TATGGATATTGCTTCTTTGATTTGTATGTTTTTGTAGTCTGCGTTGTGAATATTTATTTA AATTGTTATTGTTTTAGTGATGTACTGTTGGTCAAATTGTGTACTGTGTGACATACATAT GCTTAATTTGGTATGCAAATCTCTGGACATTTATTGCAGTGGCCAAGATCAGATCACAAT 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