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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020546 | Chr12 | 15174490 | 15178324 | - | Myb-related protein 305 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020546.m1 | 15 | 62 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 55.6 | 4.80E-15 |
LITCHI020546.m1 | 18 | 75 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 50.3 | 2.20E-13 |
LITCHI020546.m1 | 68 | 111 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 57.2 | 1.60E-15 |
LITCHI020546.m1 | 72 | 120 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 32.5 | 8.20E-08 |
LITCHI020546.m2 | 15 | 62 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 57.5 | 1.20E-15 |
LITCHI020546.m2 | 18 | 76 | PF13921.9 | Myb_DNA-bind_6 | Domain | 54 | 1.60E-14 |
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>LITCHI020546.m1 ATGGATAAATCTCCATGCAATTCTCAAGATGCTGAAGTGAGAAAAGGGCCGTGGACGATG GAAGAAGACTTGATTCTCATAAACTACATCAACAACCACGGTGAAGGAGTGTGGAATTCA CTAGCTAAAGCAGCTGGCCTGAAACGTACCGGAAAAAGCTGTCGGCTCCGGTGGCTGAAC TATCTGCGACCTGATGTGAAGAGAGGAAATATTACACCAGAAGAACAGTACTTGATTATG GAACTTCATGCTAAGTGGGGAAATAGGTGGTCCAAAATCGCTAAGCATCTACCAGGAAGG ACAGACAATGAAATAAAGAATTACTGGAGAACTAGGATCCAGAAGCATATTAAGCAAGCA GAAACGTATTCTGGGCAAAGTTCTTCTGAGGTAAATGAGCAGGCTAGCTCAAGCCAAATG TCTGCCACAACTTATGCTATGGAAAACTATTGTCCACCATCATACCCAGCAAACCCGGAC TGTTATCCGGTTACACCTTTTCCGGCCGATCAATTGAACGAAAATTATTGGAGCATGGAG GATCTCTGGTTACTTAATGGCGATTAA >LITCHI020546.m2 ATGGATAAATCTCCATGCAATTCTCAAGATGCTGAAGTGAGAAAAGGGCCGTGGACGATG GAAGAAGACTTGATTCTCATAAACTACATCAACAACCACGGTGAAGGAGTGTGGAATTCA CTAGCTAAAGCAGCTGGCCTGAAACGTACCGGAAAAAGCTGTCGGCTCCGGTGGCTGAAC TATCTGCGACCTGATGTGAAGAGAGGAAATATTACACCAGAAGAACAGTACTTGATTATG GAACTTCATGCTAAGTGGGGAAATAGGTCAGTTCATGTTATGCTATATAATTGA
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>LITCHI020546.m1 MDKSPCNSQDAEVRKGPWTMEEDLILINYINNHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLN YLRPDVKRGNITPEEQYLIMELHAKWGNRWSKIAKHLPGRTDNEIKNYWRTRIQKHIKQA ETYSGQSSSEVNEQASSSQMSATTYAMENYCPPSYPANPDCYPVTPFPADQLNENYWSME DLWLLNGD. >LITCHI020546.m2 MDKSPCNSQDAEVRKGPWTMEEDLILINYINNHGEGVWNSLAKAAGLKRTGKSCRLRWLN YLRPDVKRGNITPEEQYLIMELHAKWGNRSVHVMLYN.
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>LITCHI020546.m2 - Up_Stream_Len 2000 TGGGAGAAAAATTTATCTTTGAATTCCTCCAGAGTTGTTCAGTTATCCATTATTTACGGC TGACACTCCTAGTTTAAAGACATTTCCAAATTAAGGATGAAATTATCAACAAGATATAAA ATGTGAAAAGATAAAAATGATTTGCCAATAAAACCACGCTTCCTTTTTATGTTTCTGACT TTCTGTTTTGAAATATATTTGGGTTCGCTGCATCTCAAATTATTATTTTTAATATTTTAC AGGAAAAAAAATCAATGACACAAATAATCCTTGAATTTTATCAGTGAAGAAATTATCGTT ATATTTATATACATGTGTCACGTTATTAGAGGGAAAAATCGGTTAGTGATGATTGTTACA CTTGTGGCTCAGTCTAAATAAAAATTTTTGTTTAAGTTGCGACCTTAAACTGTTTTCTAG ATATAAATTGACATTCATCAGAATCATCGAAACTAATTTCTCCTTGATCAATTTCTTCTC TTCAAAATCACCCTTTTTTTCACATTTAGTAAAACTTAACTTTGTTTCAATTAATTATAT CAATTACTATTATTCTGTAGGTTCTGATATGCATGCAAAACAGACAATATTTTATGATCA AATTGTTCTTACCTTAATTTCTCTAATATATAGATTATCAATCTGCCTATATAGTACCAG GACAATATTCTAAATATGTAATATACTAATATATAATTTGCAATATGAAACACTTGCAAG GGCAGCGAAGTCAAATATATCTCTACATTTGAAAATGCAGGGCAGTTTCGAAATTCTCCT GTTGATCAACTTCTTACACCTTAGTCGAAGGATAAAGATGGAAGGAAAAATATATGAGAT TTATTTTTCTTTTCTTTTATTATTTATTATGTATAACATGAATATTTTATATTGTTGTAT GCATTTTTTGGACTCACCAAATGGGCTGTTAAAAGCCTGGTAAAAGCTTATTAAGTCGAC TTAATGCAAAGGCGACTTAATGCAAAGGCCCAGCAGATAAGACTCAGTTATCAACCCCAA GCTCAGCGAACTCTACAGCTCGCACCAGCGATCTCGTATCACATTGATTCACAGATCATT ATGTAGTTCATTCAATTCATAGCTCGCTGTTTAGCGAGGTCCAGTTTGATGTCGCTCAAA GCAGTGAACAGCTCGTTTAGTGATCAGTTAATACAAAATCTTCCAGAATAGGCAGTTACT CGACTTGATCGTAATTCTCTCACCAAAAACGGAAGTTAATTCAAATTTGAACTCAGTCAA CGTGATCTCGAGATTTACGAAGCAGTTACCCGATTTAGCTCCAACCGATCAAGAAACATA ATTAATTTGTAATTCTTTTCTTATTTTATTTCTTCCTAATTTGTAACGTCTCTCTCTCTC TCTCTCTATAAATAGAGGCTGAATTCATTTTAACAGAGATCTAAGCAATAATATACTGTC ACTCTGCTAAATTGTTGAGAGACAGTCATGAACGTAGGCACACTCGCTGAACCACGTAAA ATTTGTGTGTTGTTTCTGTTCTTGACCAGCTGTCTTTTGTTTTCTCCTTGGTTTTCGTAT TGTTCTTGGTTTTTGTGCGATTTTACATTAATTGCAGGTACTGGGTATTGAATTCTCATC GACCAGAAAATCACGTCGACATATATACATGTGTTTGTACTACGTGGGACGTAAAGGAAA TGGAATATATTTATATAGGTGGATTAACCCCAGCTAAGAAACAATATTATGTGTGGCAAA TAATGCAAGCAAACACATGTACTAATGTTTTGACATGCATGCATGTATTGTCATTAAAAT GATAATTAGGTTAAATATCTTCCAATAATGTGGATTATAAGGCTAATTAACATAAAAAAT TATATTACACAAGTTCTATAAATTCCTTAGCTGCCTCCATTATCTCATTATCCTTCTTCA CGTCTGCTCTCATCTTTTTCTTTCTTCTCAATTTTCTCTCTTTCTCTCTATCTCTCTGGC TCTCTCTTTGAATAACAAAA >LITCHI020546.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGGGAGAAAAATTTATCTTTGAATTCCTCCAGAGTTGTTCAGTTATCCATTATTTACGGC TGACACTCCTAGTTTAAAGACATTTCCAAATTAAGGATGAAATTATCAACAAGATATAAA ATGTGAAAAGATAAAAATGATTTGCCAATAAAACCACGCTTCCTTTTTATGTTTCTGACT TTCTGTTTTGAAATATATTTGGGTTCGCTGCATCTCAAATTATTATTTTTAATATTTTAC AGGAAAAAAAATCAATGACACAAATAATCCTTGAATTTTATCAGTGAAGAAATTATCGTT ATATTTATATACATGTGTCACGTTATTAGAGGGAAAAATCGGTTAGTGATGATTGTTACA CTTGTGGCTCAGTCTAAATAAAAATTTTTGTTTAAGTTGCGACCTTAAACTGTTTTCTAG ATATAAATTGACATTCATCAGAATCATCGAAACTAATTTCTCCTTGATCAATTTCTTCTC TTCAAAATCACCCTTTTTTTCACATTTAGTAAAACTTAACTTTGTTTCAATTAATTATAT CAATTACTATTATTCTGTAGGTTCTGATATGCATGCAAAACAGACAATATTTTATGATCA AATTGTTCTTACCTTAATTTCTCTAATATATAGATTATCAATCTGCCTATATAGTACCAG GACAATATTCTAAATATGTAATATACTAATATATAATTTGCAATATGAAACACTTGCAAG GGCAGCGAAGTCAAATATATCTCTACATTTGAAAATGCAGGGCAGTTTCGAAATTCTCCT GTTGATCAACTTCTTACACCTTAGTCGAAGGATAAAGATGGAAGGAAAAATATATGAGAT TTATTTTTCTTTTCTTTTATTATTTATTATGTATAACATGAATATTTTATATTGTTGTAT GCATTTTTTGGACTCACCAAATGGGCTGTTAAAAGCCTGGTAAAAGCTTATTAAGTCGAC TTAATGCAAAGGCGACTTAATGCAAAGGCCCAGCAGATAAGACTCAGTTATCAACCCCAA GCTCAGCGAACTCTACAGCTCGCACCAGCGATCTCGTATCACATTGATTCACAGATCATT ATGTAGTTCATTCAATTCATAGCTCGCTGTTTAGCGAGGTCCAGTTTGATGTCGCTCAAA GCAGTGAACAGCTCGTTTAGTGATCAGTTAATACAAAATCTTCCAGAATAGGCAGTTACT CGACTTGATCGTAATTCTCTCACCAAAAACGGAAGTTAATTCAAATTTGAACTCAGTCAA CGTGATCTCGAGATTTACGAAGCAGTTACCCGATTTAGCTCCAACCGATCAAGAAACATA ATTAATTTGTAATTCTTTTCTTATTTTATTTCTTCCTAATTTGTAACGTCTCTCTCTCTC TCTCTCTATAAATAGAGGCTGAATTCATTTTAACAGAGATCTAAGCAATAATATACTGTC ACTCTGCTAAATTGTTGAGAGACAGTCATGAACGTAGGCACACTCGCTGAACCACGTAAA ATTTGTGTGTTGTTTCTGTTCTTGACCAGCTGTCTTTTGTTTTCTCCTTGGTTTTCGTAT TGTTCTTGGTTTTTGTGCGATTTTACATTAATTGCAGGTACTGGGTATTGAATTCTCATC GACCAGAAAATCACGTCGACATATATACATGTGTTTGTACTACGTGGGACGTAAAGGAAA TGGAATATATTTATATAGGTGGATTAACCCCAGCTAAGAAACAATATTATGTGTGGCAAA TAATGCAAGCAAACACATGTACTAATGTTTTGACATGCATGCATGTATTGTCATTAAAAT GATAATTAGGTTAAATATCTTCCAATAATGTGGATTATAAGGCTAATTAACATAAAAAAT TATATTACACAAGTTCTATAAATTCCTTAGCTGCCTCCATTATCTCATTATCCTTCTTCA CGTCTGCTCTCATCTTTTTCTTTCTTCTCAATTTTCTCTCTTTCTCTCTATCTCTCTGGC TCTCTCTTTGAATAACAAAA
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