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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020538 | Chr12 | 15012117 | 15026476 | + | Serine/threonine-protein kinase fray2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020538.m1 | 24 | 285 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 199.4 | 7.30E-59 |
LITCHI020538.m1 | 25 | 281 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 150.9 | 4.30E-44 |
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>LITCHI020538.m1 ATGGTGTGCTATAAAATGTATACGATGGAGCATATTTCAGAGAAACGATTTCCTTGCAAT GCAAAAGATTATAAGTTATATGAAGAGGTTGGTGAAGGTGTCAGCGCCACTGTCTACAGG GCTCTTTGCATTCCACTAAATGAAATGGTCGCCATCAAGGTTCTTGATCTCGAGAAGTGC AATAATGACTTAGATGGTATTAGGCGAGAGGTACAAACAATGAGTTTGATCGATCACCCT AATTTATTAAGGGCCCATTGTTCTTTTACTGCTGGTCATAGCCTTTGGGTTGTGATGCCA TATATGGCGGGGGGATCCTGCCTTCATATAATGAAATCAGCCTTTTCAGAAGGTTTTGAA GAGCCTGTTATTGCTACTTTGTTGCGTGAGACTCTCAAAGCCCTTGTTTATCTTCATTCC CAAGGGCACATCCACAGAGACGTGAAGGCTGGGAATATTTTAATTGATTCTAACGGTGCC ATCAAGTTAGCAGACTTTGGTGTATCGGCATGTATGTTTGATGCTGGAGATAGGCAGCGT TCGAGAAATACTTTCGTTGGAACTCCATGCTGGATGGCTCCTGAAGTTATGCAGCAACTG CATGGATATGACTTTAAAGCAGATATTTGGTCATTTGGAATAACAGCACTGGAACTTGCT CATGGGCATGCCCCATTTTCAAAATATCCACCAATGAAAGTTTTGCTGATGACCTTACAG AATGCACCTCCAGGTCTAGATTATGAAAGGGACAGGAGGTTCTCAAAGTCTTTCAAAGAG TTGGTAGCTGCTTGCTTAGTAAAGGATCCCAAAAAACGTCCATCATCAGAAAAGCTACTG AAGCACCATTTCTTTAAACATGCACGTTCGACTGATTTTCTGGCTCATGCTATTCTCGAC AATCTTCCTCCATTAGGTGAACGTTTTAGGACGCTGAAGACAAAAGAGGCTGATCTTCTT GTGCAGAATAAGGCTCTCTATGGTGATAAAGAGCAGCTATCACAGCAAGAATACATAAGA GGAATAAGTGCCTGGAATTTCAACCTTGATGATTTAAAAAGTCAGGCTGCTCTTATTGAG AACTATGATCTGCAAACTGCAGAAGATCTAAATGGGAGTAGGAAGCAGAGTGATGAGTAT GATGATGTTGGGGTAATGGCAGAAAGATTATCTCCAGAGAGGTCTAATCATTCAAATGCT GCTCCTAGTCAGGAGGACGGCTTCAATGATCTTCATGATTTAGAGAACTCTTTTGCTTCA TTTCCGAGAAAACCTCTTCAAGCACTCAAAGGATGCTTTGATATTTGTGAGGATGATGAA GGTGCAACAAGTCCAGGTTGGAAAGGTTCTTCAAGATTAGAAATTGAACAGCAATTTGAT GCAAGGACATCACAAGACCGAGAAACTAGCAAAAATGAGGGTGAGGATTCAGGGCGAAGT AGCTCTTTACCACGTCATGTTTCTGAGCATAGGAAGTTCTTGAGCGGTTCACTAATACCT GATAATGCCTTGTCTCCAAAGAAGATTATTGGTGAAGGGGATAGAGAAGCTCTGCTAAGG TTTAGTGTAGCACTGGCCCTATCCTTTTGGGATTCTCTACAGCCAAAAAATTCTGAGCGG AACTATAGTGGTCCACTGTTGTATCGCCATAGGAGAGACACAAATAACCTTCCATCAGTA GAAGATACATCAGAAGGAGCAGTTGTCCAACGTAAGGGACGGTTTAAAGTTACCTCAGCA GACCTAAGCCCCAAGGGACCTATGAACAACTTATTTAGCTCAGTTAGTGGAGGTCCAGTG AGTCCAACAACCCCAAATTTTACTGCTGCCTCACTTCTCCCATCTCTGCTATGTATTTTG CAGCAGAATTCCATGCAAAGGGAAGAAATCATCAGACTGATCAAGTATGTGGAGGATACC TCTGGCAAGCTAGCAGAGTCAGCTGAGGCAAGCAACGACCTTTTACAGAGTGCTCCTGCT TCTACAAGGGAGAGGGACCTTCAGTCTCAGATGATTCTTTTGCAACAGAGGGTGGTGCTT GCAGAACTATTCATCAGTTCTAGAATTTTTAGTGGTGATGTTGTGGCTACAAGGGTTGAT GGTCTATAG
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>LITCHI020538.m1 GCAAATGCAATCACCCTTTCCTCTCGATCTAATCTAACGATTTTTCCCGATAATTTCCCG ATGCCTTCCATAATCGCGATTTATTCAGATACTGAAACACTCAAAATCTCTTGGCGGGCC CCAGTGGCCATTTGCCTCAACAGCTACCCCCTCGTTTGAAAATTATTTCTCTTACGTATT AATGTTATTATTATAACCAAAATTGTTAATATTATTGCTATTATTCTCTGCAACTCCGTG AAGAGAAAAATCAAATAAAAAAGTCGTGCATATAAAAAGGAAAACAAAAACAAAAATAAA AATAAAAAGGGCTGCAACTTTTATTTCACTGTAAACGGTGGAAGATTCGATCTGAAGAGG ATCTCCAAAGAGACCAGACACTTGGATGAGAAATCTGAAGCTCTCGTCATCGTCATCGTT TTTGTCGATTAATTGAAACTGCTATTTTATCGACGAACAAGTAACCGTATATTGACAGTT ATCGTTAGCTGAATCCGACGCCGTTTTTTTCTTCTTTCCTACTTTGTCTAATCAGGTTAC TTACTACTGAAATTATCAGCTTTCAGTTCTGTAGAAGTTACAACTATTTATTTTCAAACC TACCGCTTCTAGTTTTTGGCACAGATCTTACACGGGACTGAGGTCATGTTTTGGGGCATA TTTGTCCATTTGTAGTAGTATAGCAGGGATCTGTAGAATCACAAAAAATAAAGAGAGAAA TTTGAAACCTCCATAGTTCTATTCATTGTCTATGGTAAAACACCGAACTTATAGTGTGCC TAAGCTGGATTTATTTTCTTCTGGGCGGCCTGATGTGATCTTTCACCACCAGTTACAGTA GTTCTTGAAAACTTGACATTGGATACAGTAGTATCCTCGTTAAATGATAATTCTATAAAC CCTTTATCATTTGCTTGAGTAGTTCAACTGTTTTTGTCATTATCCTGGCCTTTGGGAGTC TTGTGTGGTCAAGCTTGTGAAAAAAAAGTATTGTTTAAAAGTTCATCTTGATGATGTCAC TGGATTCACATAGTGTTTTGTGCTGAAGAAGGGGAAAATGCTTCCCAATTGGAAGAAACC CAATATCGATTTGACCCTCTTGTGCTCGGTATACATTTTATATATCTTTGCTGGAACGTC TTGGAGTAAAGAGGGTGTTAATGGTGTGCTATAAAATGTATACGATGGAGCATATTTCAG AGAAACGATTTCCTTGCAATGCAAAAGATTATAAGTTATATGAAGAGGTTGGTGAAGGTG TCAGCGCCACTGTCTACAGGGCTCTTTGCATTCCACTAAATGAAATGGTCGCCATCAAGG TTCTTGATCTCGAGAAGTGCAATAATGACTTAGATGGTATTAGGCGAGAGGTACAAACAA TGAGTTTGATCGATCACCCTAATTTATTAAGGGCCCATTGTTCTTTTACTGCTGGTCATA GCCTTTGGGTTGTGATGCCATATATGGCGGGGGGATCCTGCCTTCATATAATGAAATCAG CCTTTTCAGAAGGTTTTGAAGAGCCTGTTATTGCTACTTTGTTGCGTGAGACTCTCAAAG CCCTTGTTTATCTTCATTCCCAAGGGCACATCCACAGAGACGTGAAGGCTGGGAATATTT TAATTGATTCTAACGGTGCCATCAAGTTAGCAGACTTTGGTGTATCGGCATGTATGTTTG ATGCTGGAGATAGGCAGCGTTCGAGAAATACTTTCGTTGGAACTCCATGCTGGATGGCTC CTGAAGTTATGCAGCAACTGCATGGATATGACTTTAAAGCAGATATTTGGTCATTTGGAA TAACAGCACTGGAACTTGCTCATGGGCATGCCCCATTTTCAAAATATCCACCAATGAAAG TTTTGCTGATGACCTTACAGAATGCACCTCCAGGTCTAGATTATGAAAGGGACAGGAGGT TCTCAAAGTCTTTCAAAGAGTTGGTAGCTGCTTGCTTAGTAAAGGATCCCAAAAAACGTC CATCATCAGAAAAGCTACTGAAGCACCATTTCTTTAAACATGCACGTTCGACTGATTTTC TGGCTCATGCTATTCTCGACAATCTTCCTCCATTAGGTGAACGTTTTAGGACGCTGAAGA CAAAAGAGGCTGATCTTCTTGTGCAGAATAAGGCTCTCTATGGTGATAAAGAGCAGCTAT CACAGCAAGAATACATAAGAGGAATAAGTGCCTGGAATTTCAACCTTGATGATTTAAAAA GTCAGGCTGCTCTTATTGAGAACTATGATCTGCAAACTGCAGAAGATCTAAATGGGAGTA GGAAGCAGAGTGATGAGTATGATGATGTTGGGGTAATGGCAGAAAGATTATCTCCAGAGA GGTCTAATCATTCAAATGCTGCTCCTAGTCAGGAGGACGGCTTCAATGATCTTCATGATT TAGAGAACTCTTTTGCTTCATTTCCGAGAAAACCTCTTCAAGCACTCAAAGGATGCTTTG ATATTTGTGAGGATGATGAAGGTGCAACAAGTCCAGGTTGGAAAGGTTCTTCAAGATTAG AAATTGAACAGCAATTTGATGCAAGGACATCACAAGACCGAGAAACTAGCAAAAATGAGG GTGAGGATTCAGGGCGAAGTAGCTCTTTACCACGTCATGTTTCTGAGCATAGGAAGTTCT TGAGCGGTTCACTAATACCTGATAATGCCTTGTCTCCAAAGAAGATTATTGGTGAAGGGG ATAGAGAAGCTCTGCTAAGGTTTAGTGTAGCACTGGCCCTATCCTTTTGGGATTCTCTAC AGCCAAAAAATTCTGAGCGGAACTATAGTGGTCCACTGTTGTATCGCCATAGGAGAGACA CAAATAACCTTCCATCAGTAGAAGATACATCAGAAGGAGCAGTTGTCCAACGTAAGGGAC GGTTTAAAGTTACCTCAGCAGACCTAAGCCCCAAGGGACCTATGAACAACTTATTTAGCT CAGTTAGTGGAGGTCCAGTGAGTCCAACAACCCCAAATTTTACTGCTGCCTCACTTCTCC CATCTCTGCTATGTATTTTGCAGCAGAATTCCATGCAAAGGGAAGAAATCATCAGACTGA TCAAGTATGTGGAGGATACCTCTGGCAAGCTAGCAGAGTCAGCTGAGGCAAGCAACGACC TTTTACAGAGTGCTCCTGCTTCTACAAGGGAGAGGGACCTTCAGTCTCAGATGATTCTTT TGCAACAGAGGGTGGTGCTTGCAGAACTATTCATCAGTTCTAGAATTTTTAGTGGTGATG TTGTGGCTACAAGGGTTGATGGTCTATAG
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>LITCHI020538.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTATTATTCTCTGCAACTCCGTGAAGAGAAAAATCAAATAAAAAAGTCGTGCATATAAAA AGGAAAACAAAAACAAAAATAAAAATAAAAAGGGCTGCAACTTTTATTTCACTGTAAACG GTGGAAGATTCGATCTGAAGAGGATCTCCAAAGAGACCAGACACTTGGATGAGAAATCTG AAGCTCTCGTCATCGTCATCGTTTTTGTCGATTAATTGAAACTGCTATTTTATCGACGAA CAAGTAACCGTATATTGACAGTTATCGTTAGCTGAATCCGACGCCGTTTTTTTCTTCTTT CCTACTTTGTCTAATCAGGTCAGATTCAGTCCAACTTTGTCTTCTACTTTTGTTTCGCTG AAACCCTAGGTTTATATGCTATGCATCGAAGTTGATTGTTGGTTTATATCTGAATTTTGT CATTCTTATGAGTTATTATAATTATTATTGTTGTTGTTTTGGTTATTTATGAATCTGATT GAAGTTGTCTTGAGAATTTAGTTGTTTTTGTTGATTTGGATTTGTAGGATCGTATTTGTA ATACTTGTGTTATGCATTGATTTGTTATAAGAGTGACGCAAGTTTGGTGTTTGAATTGTG AAATGGAAAAAAGGAGAAACTTTTGTTGGTGAAAGTGGAGGAAATGGAAAATGATGTGGA AAATGTTTGGTTCAGTGACTCTTTGGGATTAGTTTTCATATAATCTCTTTACAATGGGTG CTTTTCCGGAGACTTGAATAACAAGGTTGGGCCTTTTTGTTTTTTCAAATAGCTGACTCA GGGAGACCAAGAAATAATCTGAATGAAAAGTGTTTTAGGTTTTTGTCGTCGTTTCCATTT CTGGAATGTGAAGATGTTCTTGATTTTCGATGGGAGATGTGTCTGGGATGTATTGGTTCG GTGGAAGCTTTTGTTATCAATGGCTTTTTAGAGGGGATGTTCGGCAAAATATACTGACTT GCACCTGCATGCAACATGTACTCGCACATTTTAGGGGGATTAAGTAAAAATAGATTATTA TACTCTCACTGTATGGAGGCATTAGGAATTATGCTCTCCATGTATGGAGTCATAAAGCTG ATTGAGTGAAATGTCAGATGTGCCAGCCCTAGTTAGTCAGTATGTAGGAGGTGTAAAATT CCTGTTTTAAGTGCTTGTCTTCACGTAGGACGAAATTGTGGTGGCTGCTTCGCATATCAA ACATAAATTTGAAGATGGCATGCAACTGAGTTATGACTTTTGAAAATGTGCACTTGTTTT CTTCTTGTTTTTTCATATAATTGTTGCCTTTAGTCATGTTGATTTATTTATTTTTAATCA TGTTTTGATAACTGCAATTAAAAATAAGAGTTTTAATGCTTAATTTTCTCTGCAGGTTAC TTACTACTGAAATTATCAGCTTTCAGTTCTGTAGAAGTTACAACTATTTATTTTCAAACC TACCGCTTCTAGTTTTTGGCACAGATCTTACACGGGACTGAGGTCATGTTTTGGGGCATA TTTGTCCATTTGTAGTAGTATAGCAGGGATCTGTAGAATCACAAAAAATAAAGAGAGAAA TTTGAAACCTCCATAGTTCTATTCATTGTCTATGGTAAAACACCGAACTTATAGTGTGCC TAAGCTGGATTTATTTTCTTCTGGGCGGCCTGATGTGATCTTTCACCACCAGTTACAGTA GTTCTTGAAAACTTGACATTGGATACAGTAGTATCCTCGTTAAATGATAATTCTATAAAC CCTTTATCATTTGCTTGAGTAGTTCAACTGTTTTTGTCATTATCCTGGCCTTTGGGAGTC TTGTGTGGTCAAGCTTGTGAAAAAAAAGTATTGTTTAAAAGTTCATCTTGATGATGTCAC TGGATTCACATAGTGTTTTGTGCTGAAGAAGGGGAAAATGCTTCCCAATTGGAAGAAACC CAATATCGATTTGACCCTCTTGTGCTCGGTATACATTTTATATATCTTTGCTGGAACGTC TTGGAGTAAAGAGGGTGTTA
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>LITCHI020538.m1 GenomeSequence + GCAAATGCAATCACCCTTTCCTCTCGATCTAATCTAACGATTTTTCCCGATAATTTCCCG ATGCCTTCCATAATCGCGATTTATTCAGATACTGAAACACTCAAAATCTCTTGGCGGGCC CCAGTGGCCATTTGCCTCAACAGCTACCCCCTCGTTTGAAAATTATTTCTCTTACGTATT AATGTTATTATTATAACCAAAATTGTTAATATTATTGCTATTATTCTCTGCAACTCCGTG AAGAGAAAAATCAAATAAAAAAGTCGTGCATATAAAAAGGAAAACAAAAACAAAAATAAA AATAAAAAGGGCTGCAACTTTTATTTCACTGTAAACGGTGGAAGATTCGATCTGAAGAGG ATCTCCAAAGAGACCAGACACTTGGATGAGAAATCTGAAGCTCTCGTCATCGTCATCGTT TTTGTCGATTAATTGAAACTGCTATTTTATCGACGAACAAGTAACCGTATATTGACAGTT ATCGTTAGCTGAATCCGACGCCGTTTTTTTCTTCTTTCCTACTTTGTCTAATCAGGTCAG ATTCAGTCCAACTTTGTCTTCTACTTTTGTTTCGCTGAAACCCTAGGTTTATATGCTATG CATCGAAGTTGATTGTTGGTTTATATCTGAATTTTGTCATTCTTATGAGTTATTATAATT ATTATTGTTGTTGTTTTGGTTATTTATGAATCTGATTGAAGTTGTCTTGAGAATTTAGTT GTTTTTGTTGATTTGGATTTGTAGGATCGTATTTGTAATACTTGTGTTATGCATTGATTT GTTATAAGAGTGACGCAAGTTTGGTGTTTGAATTGTGAAATGGAAAAAAGGAGAAACTTT TGTTGGTGAAAGTGGAGGAAATGGAAAATGATGTGGAAAATGTTTGGTTCAGTGACTCTT 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