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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020517 | Chr12 | 14820540 | 14825471 | - | Serine/threonine-protein kinase HT1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020517.m1 | 86 | 215 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 53.6 | 2.00E-14 |
LITCHI020517.m1 | 87 | 205 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 35.2 | 8.80E-09 |
LITCHI020517.m2 | 86 | 357 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 214.5 | 1.70E-63 |
LITCHI020517.m2 | 88 | 354 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 173.1 | 7.60E-51 |
LITCHI020517.m2 | 195 | 303 | PF14531.9 | Kinase-like | Family | 25.4 | 8.70E-06 |
LITCHI020517.m2 | 211 | 289 | PF17667.4 | Pkinase_fungal | Domain | 27.3 | 1.60E-06 |
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>LITCHI020517.m1 ATGAGGGAGAAGAACGAAAGTGGAGGAGGTGGTGGGTATGTGAGAGCAGATCAGATAGAT CTGAAGAGATTGGATGAGCAGTTACAGAGGCATCTAAGTAGAGCATGGACTATGGAGAAG AACAAGAACAGGAAGGAACATGAAGACAGTAATGAAGAGGGTCATCAACAGAGTCATCAT AGACCACCCACCATCAACACAGGTCGAAGTGTGGCCAGACAGGACTGGGAGATTGACCCT TCTAAGCTTATCATCAAAGGAGCCATCGCTCGTGGCACTTTTGGCACTGTTCACAGAGGC GTCTATGATGGCCAAGATGTTGCTGTTAAACTTCTTGACTGTGGGGAAGAGGGCCACAGG TCTGAGGCTGAAATAGCTTCACTTAAAGCAGCTTTTGCCCAAGAAGTTGCCGTTTGGCAC AAGCTTGATCATCCTAATGTAACTAAGTTTATAGGGGCGACAATGGGCTCACCAGAGCTA CACATACTAACAGAAAATGGTCCAATTGACTTGCCAAGCAGTGCTTGTTGTGTTGTTGTT GAGTATTGCCCTGGGGGTGCACTTAAATCTTATCTCATAAAGAACCGGAGAAGGAAGCTT GCTTTCAAAGTAGTTATTCAACTGGCACTAGATCTTGCACGAGGGTAA >LITCHI020517.m2 ATGAGGGAGAAGAACGAAAGTGGAGGAGGTGGTGGGTATGTGAGAGCAGATCAGATAGAT CTGAAGAGATTGGATGAGCAGTTACAGAGGCATCTAAGTAGAGCATGGACTATGGAGAAG AACAAGAACAGGAAGGAACATGAAGACAGTAATGAAGAGGGTCATCAACAGAGTCATCAT AGACCACCCACCATCAACACAGGTCGAAGTGTGGCCAGACAGGACTGGGAGATTGACCCT TCTAAGCTTATCATCAAAGGAGCCATCGCTCGTGGCACTTTTGGCACTGTTCACAGAGGC GTCTATGATGGCCAAGATGTTGCTGTTAAACTTCTTGACTGTGGGGAAGAGGGCCACAGG TCTGAGGCTGAAATAGCTTCACTTAAAGCAGCTTTTGCCCAAGAAGTTGCCGTTTGGCAC AAGCTTGATCATCCTAATGTAACTAAGTTTATAGGGGCGACAATGGGCTCACCAGAGCTA CACATACTAACAGAAAATGGTCCAATTGACTTGCCAAGCAGTGCTTGTTGTGTTGTTGTT GAGTATTGCCCTGGGGGTGCACTTAAATCTTATCTCATAAAGAACCGGAGAAGGAAGCTT GCTTTCAAAGTAGTTATTCAACTGGCACTAGATCTTGCACGAGGGTTGAGCTATCTTCAC TCTCAGAAAATCGTACACAGAGATGTTAAAACAGAAAACATGCTTCTGGACAAGACACGT ACTGTGAAGATTGCTGACTTTGGAGTTGCTCGCCTTGAAGCCTCAAATCCTCATGACATG ACAGGAGAGACCGGAACCCTTGGTTATATGGCCCCAGAGGTTCTCAATGGTAACCCATAC AATAGAAAGTGTGATGTCTACAGTTTCGGTATCTGTTTGTGGGAGATATACTGCTGTGAC ATGCCATATCCTGACCTCAGCTTCTCGGAAGTGACATCAGCTGTTGTCCGCCAGAACTTG AGGCCGGAGATACCTCGCTGCTGCCCAAGCTCTCTTGCACTTGTAATGAAGCGATGCTGG GACGCCAACCCTGACAAACGACCTGAGATGGATGAAGTTGTAACCATGTTGGAGGCCATC GACACATCCAAGGGTGGAGGCATGATCCCTGTTGATCAGCCTCAGAGTTGTCTCTGTTTT TGCAGATATCGAGGACCCTAA
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>LITCHI020517.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGAAAAAATTTTCTTATAATGAATATGTGGATGAGTTTCTATTGACTTCGAAGTGTAATT AAGAAATAGGGTGGTTGGTAATTCAAACTTAGGATTTTTTTTTTAATTAAAAAAAAAATT CAAAGAAAGAAGGAAAAGTGAAAGGTACAAGTTGTAATTTGTGTAAGGGATAATCCCAAT TGCCCCTAGTGTTTGATATAATCATTACTTTTCCCCCTATAATTTATAAAAATCATATTT TATCCCTTCTATTAATTCTATTAGTGAAAGAAGATTTTAACAATGACAATACATGAAAAG ACTAAACTGCCCTTCAATAAAAAATAAAAATTAATTTTTTTATGAAATAAAATAAAAAAT AAAAAAATGAAGATCCAATCTTCAATGTATCATGTCTTGTTCTTCTTCAATGAAGAACAT TCAAATAGCAAAAATAAATAAAAAATAAAAAAAATAAAGCAATGTACACATAAATCCATC TTCAGAGTTTTGGTTTCTCTTTTCACATACACAATGCATATTTTTTAAAAAAAATCAACA AAAACCCTATCATCACCAAACCCTAACACTACAACATCAAGCATCAAAGAAAAAAACTCC AACACAACATCAAACATCTAAGAACAACAGACACCAATATCAACAAACACCACATCAATG AACAATCTTCTTCTTCATTTTTCATCAACAAACATCACATCAATAACAACAAAACATCTA TATTGCATTTGAAAAAAAAAAAAAAACCAATACCGAATTCATCATATTTATCCTAAAAAA ATTCAGAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTTGAAAAGAAATGAAAACATTTGATCTCC TTCATCGAAGACCCAAAGTCTCCATCGTCTAGAGACTAAAACGCGATGGAAACCAGAATT GATTTCCTCATGATGAAGACTACTATTTCCAAGTGACAAGTTTGGTCTTCAAGTGATGGA GATCATTGGGTTTCCTTCACCGGAGACCAAGTCTCTAGTGAAGGGGACCTAATGTTCTCC ATACCGACGTCTGATTTCTGACGAAGAAAAAGATGGAAGATGGAAGATGGAAAGATGGAA GAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAGAAGAAAAAAGCAAATGGATATGGTTGACTGAAGAAA ATAGAAGAAAAAGATAAAAAAGATTTTTATTTTTCATTTAAATAAATAAATTAATATATA AATTAATTTATTTTTCCAAAAATCTATTTTAATTTAATTAAAATAATAATTATTATTACT ATAATTTTAATTTTGTTTTGACAATTTTGTCCTTCCTTATAATGGTCAAACATGAGTTTT TAGCATTTAAGTTGATCACAAGAGATTTTTTGAACATTTCAATAAATACAGAAGAATTTT TAGTATATCTATAAATTACATGAGATATTAGTTATTTCCAAATGGAGAAGAGATTTTGAT TATTTTATTAAATTATAGGGAAGGAAATGAGATTATCCCTTTAGATAGAGTACTACGAAC AACATACGAGGCAAAGCGAAGTGTTGGAAAGAGAGAAGAAGACAACAAAAAAAAAAAGGA AGGTGCATTGACCGTGAATCCCATAAAATAACAAACAACTAGCACCAGACAAGAGGGCTG CTGCTGCTGTGCTGCTAGTACTCGTCATCAAATTAAAAGAAGAGGTTGAGAAGAGACGAA GTGGGTAAGAAACACACGTCGTCTTCAGGCAAATCCATGTGCCCACATGCCTCTTTTTTA CTTACTCTTAGATAGCTAGCTACATACATCCATACATACATAACATTACCCCCTACATAC AGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTACAGCTACTGCTACATGAAC AACAACTAGTAATAGACATTTGCACCATTTTTAGAACTAGTAGGATAGATATATATATTT GTATGTAATAATTATAGATTGATTGATTTGCTCAATCATCATCAACTCCAACACCAACCA ACGTGTTTTCAGAGAAGAAA >LITCHI020517.m2 - Up_Stream_Len 2000 TGAAAAAATTTTCTTATAATGAATATGTGGATGAGTTTCTATTGACTTCGAAGTGTAATT AAGAAATAGGGTGGTTGGTAATTCAAACTTAGGATTTTTTTTTTAATTAAAAAAAAAATT CAAAGAAAGAAGGAAAAGTGAAAGGTACAAGTTGTAATTTGTGTAAGGGATAATCCCAAT TGCCCCTAGTGTTTGATATAATCATTACTTTTCCCCCTATAATTTATAAAAATCATATTT TATCCCTTCTATTAATTCTATTAGTGAAAGAAGATTTTAACAATGACAATACATGAAAAG ACTAAACTGCCCTTCAATAAAAAATAAAAATTAATTTTTTTATGAAATAAAATAAAAAAT AAAAAAATGAAGATCCAATCTTCAATGTATCATGTCTTGTTCTTCTTCAATGAAGAACAT TCAAATAGCAAAAATAAATAAAAAATAAAAAAAATAAAGCAATGTACACATAAATCCATC TTCAGAGTTTTGGTTTCTCTTTTCACATACACAATGCATATTTTTTAAAAAAAATCAACA AAAACCCTATCATCACCAAACCCTAACACTACAACATCAAGCATCAAAGAAAAAAACTCC AACACAACATCAAACATCTAAGAACAACAGACACCAATATCAACAAACACCACATCAATG AACAATCTTCTTCTTCATTTTTCATCAACAAACATCACATCAATAACAACAAAACATCTA TATTGCATTTGAAAAAAAAAAAAAAACCAATACCGAATTCATCATATTTATCCTAAAAAA ATTCAGAAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAGTTGAAAAGAAATGAAAACATTTGATCTCC TTCATCGAAGACCCAAAGTCTCCATCGTCTAGAGACTAAAACGCGATGGAAACCAGAATT GATTTCCTCATGATGAAGACTACTATTTCCAAGTGACAAGTTTGGTCTTCAAGTGATGGA GATCATTGGGTTTCCTTCACCGGAGACCAAGTCTCTAGTGAAGGGGACCTAATGTTCTCC ATACCGACGTCTGATTTCTGACGAAGAAAAAGATGGAAGATGGAAGATGGAAAGATGGAA GAGAAGAAGAAGAAGAAAAATAAGAAGAAAAAAGCAAATGGATATGGTTGACTGAAGAAA ATAGAAGAAAAAGATAAAAAAGATTTTTATTTTTCATTTAAATAAATAAATTAATATATA AATTAATTTATTTTTCCAAAAATCTATTTTAATTTAATTAAAATAATAATTATTATTACT ATAATTTTAATTTTGTTTTGACAATTTTGTCCTTCCTTATAATGGTCAAACATGAGTTTT TAGCATTTAAGTTGATCACAAGAGATTTTTTGAACATTTCAATAAATACAGAAGAATTTT TAGTATATCTATAAATTACATGAGATATTAGTTATTTCCAAATGGAGAAGAGATTTTGAT TATTTTATTAAATTATAGGGAAGGAAATGAGATTATCCCTTTAGATAGAGTACTACGAAC AACATACGAGGCAAAGCGAAGTGTTGGAAAGAGAGAAGAAGACAACAAAAAAAAAAAGGA AGGTGCATTGACCGTGAATCCCATAAAATAACAAACAACTAGCACCAGACAAGAGGGCTG CTGCTGCTGTGCTGCTAGTACTCGTCATCAAATTAAAAGAAGAGGTTGAGAAGAGACGAA GTGGGTAAGAAACACACGTCGTCTTCAGGCAAATCCATGTGCCCACATGCCTCTTTTTTA CTTACTCTTAGATAGCTAGCTACATACATCCATACATACATAACATTACCCCCTACATAC AGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTACAGCTACTGCTACATGAAC AACAACTAGTAATAGACATTTGCACCATTTTTAGAACTAGTAGGATAGATATATATATTT GTATGTAATAATTATAGATTGATTGATTTGCTCAATCATCATCAACTCCAACACCAACCA ACGTGTTTTCAGAGAAGAAA
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