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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020502 | Chr12 | 14631566 | 14641376 | + | RING-H2 finger protein ATL46 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020502.m1 | 27 | 66 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 21.3 | 0.00026 |
| LITCHI020502.m1 | 356 | 611 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.1 | 2.10E-16 |
| LITCHI020502.m1 | 359 | 610 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 75.1 | 6.10E-21 |
| LITCHI020502.m1 | 771 | 820 | PF12861.10 | zf-ANAPC11 | Family | 22.5 | 9.30E-05 |
| LITCHI020502.m1 | 773 | 817 | PF12678.10 | zf-rbx1 | Domain | 35.7 | 8.50E-09 |
| LITCHI020502.m1 | 774 | 817 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 45.1 | 1.00E-11 |
| LITCHI020502.m1 | 774 | 803 | PF17123.8 | zf-RING_11 | Domain | 37.8 | 1.20E-09 |
| LITCHI020502.m1 | 775 | 816 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 24.3 | 2.20E-05 |
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>LITCHI010515.m1 + Up_Stream_Len 2000 TGTCTTAGATTTTCAAAATAATTGGTGGTTTGATTTTGATGCGTTGGCTGCACCAACTTT CCCTTCAACTCAGCACCATTCTCCGGGTCAAAAGGCCTTACATCCTTCTTCTGTCTTCTT CTGAGTTCTGACAACTATTCATATATCTCTGCTTATATATCCAATTTTTTTGGATATACA AAAGTACTGAATTATTTGTGTATTTATATTGATCAATGACTCTGCTCTAAATTGATTTAG ATATTTCTCGTTAATTATTTGGATTGGTGGAACATGTGTATTATTAGTATTTTATTTTCA GGATACCCATGAATATATTATTACTCGGTTGCCTGTTTGGGAAACAAGCACAAATATATA GGACAGACGGTCTGTCTTCAATTTTTTTTTTTTTTTTACTACCACTGCATGCGCTATTTT TTTTCCTTGTATGTTTTCTTAGACGTTTCTACTGCCATTCAACTCCATTTGCCAATTTTA TGACTCTGTCACTCTGTGGACTGGTTCGATATATAACAAGTCTAATATTGTTATATTAAC CTCCATGTGCAACTGTTGGTTTTAACAAATTCAGAATTACAAATTAAATGCCACTAATGC TGTCTATGATCAGCTGAGTCATATCCTCAAATAATTGAAACAAAAACAAAAACAAATCAA TTCGTATGTGCCCACATCATTATGGATTCAACATAAAATTCAAAATGTAATATTCTCTTT ATTTGACTTGATTTTACACTTATTAAATAAAATTTTAACATGTGATTAAAGTTTTATATG TTTCTTTATTAATAGTCAATTATACGATGATTAAACTAAAATATGTGGACTGTGATATTA GGTTGTGTAGTATTATTAGTCCACAAGGCAAAACTTACTTATCTACCGTATATCTTTTAT AATCATATTTATAAATTATATTTTTTAAAAATATTATATATAATGTAGTGATTTGAATCT AATGTTGTGAAATTAAATAAATACTCTTTATTATCAAATCATATTTAATGATAAATATAA AATGATTTAAACACCAAACTTAATTATAAAAGATAATATATAGATTCCCAATTTGCTATA AAATCCAAGCGTAACCAGTCGAAAGCCATGCAAACGATGACGAAAGATACTCCTATTGCG TGCATGGAGTGAGTTCCTTTGCCCAACAGAGACTTGCCACGTGTTATGTAATCTACTTTC CATTTTCAAACCTTTGTACGGGAATGTATATTAAGTCATATTAATATTAAGCCCACGTTA ATGTTGACACCCCACATGTCTTTTCTTGAATTTCCTTCTGTCCCCCGAAATTTTTCTGGT TATTATTATTATTTTTTTGACATATTACACTACTATTATTAGACTCTTTTATTAAGACAT ATTGAAGAACAGTTCGGAACTAAGTCTCTCCGACGCTGGAAGAAAGTGTCTAGAAATGGA AACAAAAGTTAACCCACAATATAGTGGGAAAATTATAACTACGGTTTGGTGGCTGTTAAG TATCGATCTTGACATGCATTAAGGAAAACATGTCAAAGTGGGGTTGACACTATCGAACTC ATCACGCTCTTCTAGTTAAGTTTTTTTTTTAAAAAAAAAGAAGAAATTGTTGTTGCCAAA GCTTTATTTTCTAATGGCAGAAAAATTAGAAGAAGAAATAGTAATTATTGCCAAAGCTTT ATTTTCTTATGGCAGCTTAATTTTCATGTTCTTTTATTAAAGAAAGATTTAGTTGTTGAG GACTTGGGTTAGCAGTTAATGAAGTGTTTTATAAGAAACCAGATATCCACGGAGAAGTAA AGAGTGATAATTTGTTGGGCATTTAATACAAAGGAGATCATGGCATCTTTGGTACTATTT TAATAACCTATATGAGAGGAAGTGTCCCAATCTTAATCAGCCAAACAAAAAGTGGAAAAT AATATTTTATTAGTGTGATCTGAGACAAGAAGCAAAGCAGAGGTTGTATATAAATATAGG AAGCCTCAGTTTTGGTGGCA
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>LITCHI031373.m1 GenomeSequence - CTAATTTTCCCTCTTAAAATTTGTGTCATATTTTGCTCCCTCAAGTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTGCATACAAAATCTTCATCGTTTCGACTTTCGACACATACAACGAAACT ATAATGACGAAGCATGGAGGAGGAGGAGGCCGAACATGTGAGCTCTGCGGACGCGACGCC TCCCTCTACTGTGACTCCGACTCCGCCTTTCTCTGCCGGAGTTGCGACGCTGACGTCCAC CGGGCCAACTTCCTCGTCGCTCGTCATCTCCGCCAGGTCCTTTGTTCGAAATGTAAATCC TTAGCTGGAAGCTTCGTCTCCGGCGCCGCCGTTGGATCCGACTCTCTTCGGCTGCCTCTT TGTAGGTCCTGCACGGCGGAGGAGGAGGACGAGGAGGAGGATTGTGTTTCCAGCGCTGAG AGCTCTGCCGTCACCGGCAAGGCGAAGGCGACGACGGCCGGATTCAAACGCATGGCCAGC TCGTCCAGCTCCGTCTCTGACGTCCTCTCCGGCGAGAATCCCGGATCGTCGGGGAAAAGG AGGAAAACGGCGTCGGATTCAAGGGCCGAGGGTATTTTTGTAAGTTGGAGTAGAAGGCTG GGGCTAAATGGTAATTTGGTGGTCTCGTCGGCCTGTCGAGCGTTGGAGTTGGGTTTGGAT AGACTCAATACGACGACGGTCGTGCTGCCGTTGCGAGTTTGCTTAGCGGCGTCGTTTTGG CTGGGATTGAAAATGTGCGGTCGCGATGTTGCCACGAGTCAGAATCTGAGGAAACTCGAG ACGGTGTCTGGAGTGCCGGCTAAGTTGATCGTGGCCGTCGAAAGGCGTCTGGCGCGTGTG ATCAGACTCCGGAAGCGAAGGTGGATTTGGAGGAGGGTTGGCCGAGTCTGATGTTTGAAT GGGCGCACGTGCGAGTCACGAGTTTAATTTTTTTTTTTTTTTTAATCCGATTAAAAATAG AGATCTTATATTAAAAAAAAAAAATTGTAAAATGATGGGTAGATTTGTAGTGTTTGGGTT TGGAGCGATTAATGGGTGATGATTTTTAGAGACTGACTGATGTACTAAATTTTGAATAAT AATAGTGATAGGTTTTGGGACATATAATATCAACAATTATCAAACTTTTTGATTTTTAAT TTATGATGGTGTTTTGTAGGATATTTGTGATTTGACTTGCCTCTCAATGCATGCCTAATG ATTTCTCTTGATTAAAGTTATTTAAGGATATTTATACACCACTACTTGGTTCTTCAATAC ATAAAATGTGTAGAATTTGATTTTTTTTTTTTT