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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020502 | Chr12 | 14631566 | 14641376 | + | RING-H2 finger protein ATL46 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020502.m1 | 27 | 66 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 21.3 | 0.00026 |
| LITCHI020502.m1 | 356 | 611 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 60.1 | 2.10E-16 |
| LITCHI020502.m1 | 359 | 610 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 75.1 | 6.10E-21 |
| LITCHI020502.m1 | 771 | 820 | PF12861.10 | zf-ANAPC11 | Family | 22.5 | 9.30E-05 |
| LITCHI020502.m1 | 773 | 817 | PF12678.10 | zf-rbx1 | Domain | 35.7 | 8.50E-09 |
| LITCHI020502.m1 | 774 | 817 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 45.1 | 1.00E-11 |
| LITCHI020502.m1 | 774 | 803 | PF17123.8 | zf-RING_11 | Domain | 37.8 | 1.20E-09 |
| LITCHI020502.m1 | 775 | 816 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 24.3 | 2.20E-05 |
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>LITCHI020502.m1 ATGAATCCAACCCTCATTCTGATAATCTTCTTTTCATTCCTTTTCATTCTCTACACTGCA AATTCTTTGGAAGCAAAAGCTAAGGATTCCCTGGTCACCTTTCTCAGAGAACTTACTAAC AACAACAGCCAATTTGATGTGATTTGGAACTCAAGTTCTGATCCATGCCTGGACCAATGG AAGGGTATTATCTGTGACGATCAGACTGTGAAAAATATAAATGTCACCAGGTTCAATCTT TCTGGAACATTTGATGCCGCTCCTCTTTGCAATGACCACTCTCTTTCTTCATCTCTGTCT TTTCTTATCCTTGATGGAAACAATATTGGTGGAGGGATCTCAGCTGATATTGCAAATTGC AGACACCTAACTCACTTGCAAGTGAGTAGGAACCAGTTTTCTAAAAACATTTCGGACTCA CTTTCCAGGTTAAATAACCTGAAAAGACTAGATATTTCTTACAATAAGTTCTCTGGTAAC CTGCCAAACTTGTCCAGGATTTCTGGTCTTAATGTGTTCCTTGCACAATTTAACCAGCTT ACAGGAAACATACCTCCTTTTGATTTCTCTAATCTAGTTCAGTTCAATGTCTCCTACAAC AGTTTCAGTGGTCCTGCTCCAGACACAAAAGGCCGATTTCCAGGCTGCTACGTTGGTAAT TCCAAACTGTGCGGAGATCAATTGCCAAATAAATGTCCACCCCGTAGCTTAGACTTAGAC TCAGGGAATAAGGAATCAAATAGCAAGGTTAGACAACAGATTCTTATGTACTCCGGATAT TTTGTGTTGGGCGTCGTTGTGATAATCTTCATCATATACAAGCTACTAAAAAGAAAGAAG ATAGAACAGAAGACTGGAGCTGTAAACAAGGTAGCATCAATTGATGATACTATAAGCAAG CGTGGAGCGACATCAAGTGATCAGTACAATACAGGCGAGAGCAGATCAGAAGTTTCCATG GTTTCTGGTGATCAAAGCGCAGTGGTTTCCACTTCATTGGTGGTTCTCACAAGTCCTGAA GTGAATGGATTGAAATTTGAGGACTTGCTGAGAGCTCCTGCAGAGATGCTACGAAGAGGA AAACATGGTAGCCTCTACAAGATCATGCTTGAAAATGGTATGGTCCTGGTTGTCAAAAGG ATTAAAGATTGGTCAATTTCAACCAGTGAATTTAAGCACAGGATGCAGCGGTTAGACCAA GCCAAGCATCCAAATTTGTTGCCAGCCCTTGCCTTTTATTCTTCTCAACAAGAGAAATTA TTGGTGTACGAATACCAACAAAACGGAAGTCTCCTTAGGCTTTTGCAAGGCGCTCGAAAG GGCCAAGCATTTGAGTGGAGCAGCAGACTAGGAATTGCAGCTGGTATTGCTGAGGTATTA GCATTCATGCATCATGAACTTAGTGATGCTTGGATCGCTCATGGTAACTTGAAATCCTCC AACATCTTGTTCAACAAAAACATGGAGCCATGCTTAAGTGAGTATGGTCTTAAGGTGATA GAGAACAATCAAGCCTCCTCCTGCTCCTCTTCTATTACCATTGATGGATACAAAATCACT GGGGATGGTTCATCAAGTGCCTACAAAGCAGACATTTATGGACTTGGTGTGATTCTTTTG GAGCTACTGACCGGAAGGCTAATGCAGAAAGATGGGGAGGACCTGGCCAAATGGGTTCAC TCAGTGGTTCGAGAAGAATGGACAGCAGAAGTGTTTGACAAGTCATTAATGTCAGAAGGT GCAAGTGAAGAGAGGATGATGAACTTGCTCCAGGTTGCCATTAAATGTGTTCATTCTTCC CTAGAAGCTAGGCCAACTATAAAACAATGCTCTCTTATGATCTGTGGAACGAGAGAGAGC AGAGACAATAGGTGGTTCTTGGAGCACACTCACTTGAAGATGTCTTGGATTCATAGACAA ATGAACCAAAAAGATGGTTTTTTGACATATCCTCCTCCACTTGCTCCTCCAACTACGTCT ACATCTCCATATATTAGTACTTTTCACAAAGAATCAAGTCCTACTTCATCATCTGGTGTA AGAATAAGTCCTGCTGTTCTGTTTATAATAGTGATTTTGGCAGTACTGTTTTTCATATCT GGTCTTCTCCACTTGCTTGTTAGATTCCTCATAAAGCACCCGTCTTCATCAGCTTCTAAT CAATCTGATAGTAGATACCCTGAAATGTCCACCTCTGATGCTCTTCAGAGACAGCTGCAG CAGCTTTTCCATCTCCATGACTCTGGCTTGGATCAAGCTTTCATAGATGCACTACCTGTT TTCCAGTACAAGGAGATAGTGGGTCTAAAAGAGCCATTTGATTGCGCTGTTTGTTTGTGT GAGTTTACTGAGAAGGACAAGCTTAGATTGCTGCCTATGTGCAGCCATGCTTTCCATATC AATTGTATAGACACTTGGCTACTGTCTAACTCAACATGTCCTCTTTGTAGAGGAACCCTT TTCACTCCTGGGTTTTCTATTGAGAACCCCATGTTTGATTTTGATGATTTGAGAGAAGAA GATGGGGGTCTTGGTTATGGAGACAGTGGATTCACTGCTGCTCAGAAATCTGTGGAAATT GAAGAAATTGTTGTTGACAAGGGTGTTTTGCCTGTGAGACTTGGTAAATTTAGGAGACTA AATGATGGGGCAGGGGAGGCTGGTGGTGAGACTAGTAGTAGTAATTTAGATGCAAGAAGA TGTTATTCAATGGGTTCATATCAGTATGTGCTTCATAATTCAGACCTGAGAGTTTCATTG TGCAATGACCGGCTTGGCCATGGTTCGAATCTTGCAAAAGGGATGGAAAACAATGGCAAC TCTTCGGTTAATGGGGATGTGGAGGGTAAGAAGATCAATAGTGTGGCTAAAGGTGAGAGC TTTTCGGTATCGAAGATATGGCTTTGGTCTAAGAAGGGCAAATTTTCAAGTTCATCAGAT GACCAAATGGGCATGCCTGAATCTCTTAAAATGGACTTGCCATGGATGGGGAGAACACAA GAAAACTAG
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>LITCHI020502.m1 + Up_Stream_Len 2000 GCAAAGTCTCATCACCAGATCCTGATATATTTTTGCTATGATTTACACAAGCAGGCAACC CAAGTTGAGCCCCCTTCATTAGGTTTTCATGGCTATGCAACGTGGCTGTAAGGGCCCTTC ATCCATATGTATGCTTACCATGTATAGCAAGAGTGAGAGGACCTTGCATTCTCTGATTTT GGACATCCGAAAATCCCCCTATCATTCCTTGTTCAGGGCCCTTAAAGCTGGGGACTACTG GCGACTTTCATTCTTACCTCACACTTTGTTCATTATCACTTTGCTCACTCCAAAAGAATC TTGGATTATGAGCTTGTGACAGGCGAAGGAACTTAGTAATAGAATGATTTTTTCATTTGA TTTGAATTCGGTTGGCTTCACAATGTGTTTCAATAAATCACCAAAGAACGTGATAGAATG TATCACATATATGGAACTCAGTATTTACATGGTTCCGGTCCTCCACTTGTAGATATCTTA TTCTGACTTCTTTTGGCTGCAGATCTTTTGAATATATTTGAGGTTTTCCTGCCGCAGCTC TTACTCTATCCTAATCCTTCAGATCCATTAAATGGTGATGCAGCATCATTGATGATGAAG GACCAGAAGCAATACGAACAGAGAGTGAAAGGTGAAATCTTCTTATGTTTTCTTATTCTG ATATCTGGTTGTGACTGAGAGTAGAACAAACAGTGAGCCTTTTTGAATTTATGTACTGGG ATATGTTTTAGCTGGTCACTCCCGTTTTTATCAATTTTGGGTTGAATTTCTATGCAACTC AGTGAATGGCTGTATTCTTGCTAAAAATATGTTCCATGTATCATCAGTATTGTGTGTGTT TATAAGCCACATATCTTCATTGTAGAAACTAGTCCGGAATATCTCCTTTGAAATTTGAAT AATCTTACTAGATGTATGCTGTTTACACTCTTTTGTTGCTTGATTATGACAGAGTATTGT GAAAGATATGCTAAGAAGGAGAATATAATGAGCTCACCCCTAGAAGATAGTGATGAGGAT GTAAGCAACGACGATGTTAGTGATGGACAAAGCATATCTAGTGATGACAACATTGCTGGA GATGCAGATCCATGAGGAGCTGTCTTCCCTTCAGCCATAATTAAACCAATTATTTGTTAT GATTACATGTTCGATTACTTGTAAAATGATAAAGGGTAGTTAGACTAGAAGCATGATACC ATTCATTTGTACTGAATGTAAGTTGTTTGCGTAGGCATAGTGACTGTAATGACAGATGGA AATGAATAGGATTGGACCCTTACTCTAATTGTTTTCCTCTTTTCGCATAATTTGGTTAAA ACATCAAATCAATTGCTTCAGAAATTAAACGTAATGTTCTTCAAAAATATACCGGTAATG TTCTTTAGAAGATATTTACAAAATCTAAGGCTAGGAGGCTACACAAATAATTTCTGATTT GACTTACAAATACTTCTGAATGACTTGTAGAAGTCTGAATCAGGACTAACATGATAAAGG GTCACGAGACTCGTGACAACTACTTTTACAAATCGATAATGAACTAGCGAATAAATCTTA GAGATCTCTTTTAAGGGTCAAGATGTCAATTTGAGTTTGAAGAGAGGTTATGACATTCTT TGCATTGCACGAACTTAAACTGACTGTCTAAGTCACTTCAATGAGCTTTCTGTTCTGGAA GAGCAGAATAGCTTGAAGTATCTAACTGTTTATTGGTTGAATAATTCTACATTTTGATGA CATGACAAGACAAACTCAGCCTTTTGTAGCTGCCAGCTCATGCCTTGTTAATAAGAATCC AATTTCTCATTGTAGATTCAGCCAATTAGCCGACTGGAGGCGTTCTTTCTGATACCTGGA CTCACCTGAACATAGAGAACTCCTCAAAGTTCCATAATCTTGTAATCATAGGTCCTGCCG ACTCATATTCACTAGTCTAAGTTTGTTTTTGACGAATCTGGAATTGCAGGCCTTTTCGCC TCAAAATTTAGATTCCCAGG
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