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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020466 | Chr12 | 14088631 | 14094329 | + | Heat shock factor protein HSF8 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020466.m1 | 35 | 124 | PF00447.20 | HSF_DNA-bind | Domain | 112.5 | 1.20E-32 |
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>LITCHI020466.m1 ATGGATGGAGCAGCCAGTAGCACCGCCGGTGGTGGTGGTGATCCGTCGACAAGTGCACAG CAGCCAGGGCCGATGCAGAACGCGGCAAATGCGCCGCCGCCGTTCCTGAGCAAGACGTAC GACATGGTTGACGATCCAGCGACGGACTCGATCGTTTCTTGGAGCGGCACCAACAACAGC TTCGTGGTTTGGAACCCTCCCGAGTTCGCGCGTGACCTCCTTCCCAAGTACTTCAAGCAC AACAATTTCTCCAGCTTTGTTCGTCAGTTAAACACATACGGTTTCAGGAAGGTTGATCCA GACCGCTGGGAATTTGCCAATGAAGGCTTTTTAAGAGGTCAAAAGCACCTGCTTCGGAGT ATTACTAGGCGAAAACCCGCTCATGGCCATGGTCATCAGCAGGCACAACAACCACATGGG CAGAGTTCATCTGTAGGTGCCTGTGTTGAAGTTGGTAAATTTGGGCTTGAGGAAGAAGTT GAGATTCTTAAGAGGGACAAGAATGTGCTCATGCAAGAACTTGTTAGGTTAAGGCAACAG CAACAATCGACTGATAGCCAGCTGCAAGCGATGGTGCAACGACTTCAGGGGATGGAGCAG CGCCAGCAACAGATGATGTCATTCCTAGCTAAAGCTGTTCAGAGCCCTGGATTCTTAGCT CAGTTTGTACAGCAGCAGAATGACAGCAATAGGCGCATTACTGAAGCAAACAAAAAGCGT AGGATCAGGCAAGAAGGTATGGCTGAAGATGACCATTCTGCTGCTTCTGACGGACAGATT GTTAAATATCAACCTTCGATGAATGAGGCGGCAGCAAAAGCAATGCTCAGAAAGATAATG AAACTGGATGTATCTTCTCGGCTGGATTCTATTAACAATAATAATCATGATAATTTCCTG ATTGGTGATGGTTCATCATCATCAAATAGTGGAAGCTCTTCAAATCATGTATCAGGAGTA ACTCTGCAAGTGGTTCCCCCAACTTCAGGGATCTCTGCGCATGGTCCTTCAGCTGCTGTA TCCGAAATACAATCTCCTGCACAGGTGCCAACTTCTGAAAAGATTGCAACAGATCAATAT TCTGATATTAATGCGCTGGTTGGAGCTCAGGAGGCACATTCAATCCCAATTTCTCAGGCA GATGTAATCATGCCTGAGATAGTGCCAGAAAATATTGTTGATATTCCTGGAGACAATTAC ATGTCCAGGGTGGGGAATGGAGATTTTATGGATCCCACTTCATTGGTAATGAATGGTTCA ATGCCTATAGAAATTGATGACATATCCCCTAATCCTGATATAGATGCTCTGCTAGAGAAC TCGAGCTTTTGGGATGATTTTCTGTTGCAAAGCCCAGTCCCTGAGGACATTGAATCAACC TCTGTAGATGCTAAAACCAAAGGAAATGAAATGCAGCCAATGGAGAATGGATGGAGCAAA GCTCAACATGTGGATCAGCTGACAGAACAAATGGGTCTTCTTAACTCAGACAGAGAAGAG GTTTGA
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>LITCHI020466.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATTAGCATTCTACAATTTTTCACCAAAACTACATTTGGTCATCCTGATACCATCAACATC AATTTTAGACATATAAGTCCAATCGAATGATGTTTCTCGCTTCTGTTTGGATACTCTTGA AACACTAGGCTCAACATTCTTAATTAGATTATCACCACCAACATTTATATCATTTCCTCG TTTTGAAAATGACTTTTAGAAAATTCTACCAAATACATTGAATTTTTAAAAACATTTTTA TTTTTATTTTTAAAAATAGTTTTAAAAATGATTACAAACACAACCTTAGTATTTCAATTT TACATCCTCTTTCAAAATTATTTGTGTGAGTTGATAAGCATTTTATAATAAGTCTTTGAT CTTTTTTTTTGTCTGAACAAGTTGGGATGGGGAAAAAAAGAGGTATGATCTAATCCGAAA ATGTTGGTTTCAAGTTTGTTTCGGGTCGGGTCGGTTTTAGTGTTGAAAAATCGACTATTT TCTGTTTTGGATCGGAAAACGTGACCCGACTCAAAATTGACTTTTAAGAAAAAGGTCTAA GTATAAAAGCCTCACAAAGCCTCATTTTCACTCTCATCTCGTCTCTCATCTTTCATCATT CTCACATCTCATCTCTTTCAAACCCTGGCCACCATTCGTCACCACCATCTCACATATCAT TCCCACTCATCTCTCATCTCTCATCTTAAATCTTTCATCAAACTTAATTGCCATTCACAC CCAACTATCAGTGATGCCATTGTTTGCACCTTTGACCGTTGTTCTCACCCTTAGCAATCG TTCGCACACAACCACCGCTTATGTTGTTGTTTGCACCCTTAGCTGTCGTTCGCACTCAAC CATCGTTGATGTCTCTCTCGTATCTTATCTATTTAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAGTTTTC ATCTAACTTTTATTTTAAGTTTTTGGTGAATGATTTTATGTTTGATTGCTAAGATTCTGT GTTTGGATATATGTTTTTAAATTTTTGTAAAGTTCTAGATAATGGATGTGTATTTAGATC TGTGTTTGTAAATTTTTGTTGGGATTTTATGTTTGTAAATTTTTGGTTTTGTTTAGATTT TGTAAATTTGTGCAAAGATTCTAATTTTCATTCCCCTCACCATTATCATTTTTAAATTTT TTTTTCTTTAATGAGAAACCAACATGGATCGACCTAAATTGAACCAACCCGACCAAGTCG GTTCATATCGGTTGCCATCCTTCTTTCGGATCGGGTCGATTTTCAAAATTGAAAACCGAT CCATATCGATTTTGGATTGGTTTTTGCCAACCCGTGCCCCCCCTATTAACAAGTGATAAT AAAGAACAATTTTTAGGTTAGATTAACACTAAAATTAGACCAGAATAGTTAAAAAAAGTG GGTATGTGAAAAAAAAAATATTTTTATATTCTTATAATGGGTAGAAAAAATAGGAAGTAA ATAAAAAATAAAAAAGGCTAGTAGCATTAGGTAGAGATGTAAAAAATATATGATTCGATC TGCTTAGAACAAGTTTGGAGCATTGAAATTAGGTTTTGAATTGGATTTGAGTCAAAATTG TTTGATCCAATTTCATAGTGAATCGGATTTAAGTCCAACACTTTTGATCCAATTCGATAT CGACCGAACCTATTGGTATCTCTAAGAGCATCCCAATCACAATTAAAAAGAAGGGCAAAC GGCGGTATTAGAAGAAAAAGGAGGCGGGTGTTTCCGTAATTTCACAGAGCAGAAAAGGAT GGTGATGTTGGTTTTCCACAACCGGCTGGTGCCAGTCTGCATCCGGTGGCCTTGTTGACG CTATAAACCTCCTAATCTCCCCGTGACCGTACAAACCACCTGTCTCTTTTTCGATAAACC TGTGTAGGATATTGAATCTTTCTTCTCAGACTCTCGCATTTAGGGTTTAATAATTGGTTT TATTTTATCCACCAATGGCGCTCATTGTAATTAGTTCCTAAAAACCCTAAATCTTTCTTC AAAACCCAAAGCATTTCAGC
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>LITCHI020466.m1 GenomeSequence + CATTGAAATTAGGTTTTGAATTGGATTTGAGTCAAAATTGTTTGATCCAATTTCATAGTG AATCGGATTTAAGTCCAACACTTTTGATCCAATTCGATATCGACCGAACCTATTGGTATC TCTAAGAGCATCCCAATCACAATTAAAAAGAAGGGCAAACGGCGGTATTAGAAGAAAAAG GAGGCGGGTGTTTCCGTAATTTCACAGAGCAGAAAAGGATGGTGATGTTGGTTTTCCACA ACCGGCTGGTGCCAGTCTGCATCCGGTGGCCTTGTTGACGCTATAAACCTCCTAATCTCC CCGTGACCGTACAAACCACCTGTCTCTTTTTCGATAAACCTGTGTAGGATATTGAATCTT TCTTCTCAGACTCTCGCATTTAGGGTTTAATAATTGGTTTTATTTTATCCACCAATGGCG CTCATTGTAATTAGTTCCTAAAAACCCTAAATCTTTCTTCAAAACCCAAAGCATTTCAGC ATGGATGGAGCAGCCAGTAGCACCGCCGGTGGTGGTGGTGATCCGTCGACAAGTGCACAG CAGCCAGGGCCGATGCAGAACGCGGCAAATGCGCCGCCGCCGTTCCTGAGCAAGACGTAC GACATGGTTGACGATCCAGCGACGGACTCGATCGTTTCTTGGAGCGGCACCAACAACAGC TTCGTGGTTTGGAACCCTCCCGAGTTCGCGCGTGACCTCCTTCCCAAGTACTTCAAGCAC AACAATTTCTCCAGCTTTGTTCGTCAGTTAAACACATACGTACGCACGCCTCCCTTTTCT CTACTCAGTTGATTTTTATTGTTAATGTTTTAGTTCCTTTAATTGGAGATATTGATTTTT GTACTTTTTTAGTCTTATTTGAAATCTTTGATGTAGATGGTTTACTTGGCACTGTAAATT 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