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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020440 | Chr12 | 13860709 | 13866528 | - | Zinc finger CCCH domain-containing protein 12 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020440.m1 | 120 | 144 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 22.8 | 7.00E-05 |
LITCHI020440.m1 | 203 | 225 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 31 | 1.70E-07 |
LITCHI020440.m1 | 282 | 307 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 42 | 6.40E-11 |
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>LITCHI020440.m1 ATGAGATTGAGATTGTTGTTTTGTTTGTTGTTGATCAAATTGTCTATTATCTGGGGGAGG GAGTTAGGGTTTGAGAGAAGCATGAGTAGTTATGGTCGGGATTCAAGTGAGAACGTGGTG CAGGTAATAGTTGGAAATGGGGGAGGTGAGAATTGGATGCCGAATCCAAGCGATTCGTCA GTGTGGGCAACTGAAGACGACTACCGCGTTTGGAATGACACCTGCACTGGTGACACCCCT TCTAACTCCAACTCCAACTACCAAACGCAACAACCGCCTAACAAGAAATCGAGAGGCGGT GGTGGTGGTGGTGGTCAAGAGGTGAATTCCAAATCCAAAGCTATTGGGAAAATGTTCTTC AAGACCAAGCTGTGTTGCAAGTTCCGCAACGGGACTTGCCCTTATATCACCAACTGTAAC TTTGCTCACAGCATTGAGGAGCTGCGGCGGCCGCCTCCCAACTGGCAAGAGATTGTGGCT GCTCATGAGGAGGAGAAAGCTGGTGGTGGTGGTCCCAATGAGGTGGTGGTTCCTAGGGAG GAGTTTCAAATCCCCTCTTTGGGTTCGTCTAGTTTCGTGGTGGAAACGCAGAGGTCCTAT AAAGGGAGGCATTGCAAAAAGTTTTACACGGAAGAGGGTTGCCCGTATGGAGATAGTTGT ACGTTCTTGCACGACGAGCAGAGTAAGAATAGGGAGAGTGTGGCAATAAGTTTGGGACCT GGAGGGTATGGTGGCGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTGGTGCAGCAAGTGGAAGT GGAGCTGCTGCTGCTGCCGGGGGCGCGAATAATAGTGGGGGATCAAATGTGAAGCCGTCC AATTGGAAAACGAGGATTTGCAATAAATGGGAGCTTACTGGGTATTGCCCCTTTGGAAAT AAATGTCACTTTGCTCATGGTGTCCAAGAATTACACCGATATGGTGGTGGCCTTGTGGAG TCAGAAGCTAAAGATTCATCTGCTGCCCCTACTGACTCGAAGCTGGGAGGAGTGCCTTCC AAGACTCCAACAGATACTGTGGTTGCATCAGTCACTTCTGTTCCTCATGCAGATTATCAT ATCGGAGTTCCGTCACAGAGGTCAACCATTGTAATCCAGAGACCAGGGCAAAGAGCTCAC AAAAAATGGAAGGGTCCAGACAAAATCAGTAGGATATATGGCGACTGGATTGATGATATC GAATAA
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>LITCHI020440.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTAATTTAATTTAAAATTTAATTTTTAAAATTTGAATTTAAACTAAAACGGTGTCTTTTA GTGAAAACGTGTATGTTAATTCATAGGTATCTATTTTGTAAAATTATGTAGAGTCGTGTC TGTTCAGAGATACCTATTCAACATTTATAAATAGCAAATCATTTTTGTCATTTGAGAGAA TTTTTAATTTTTATGCATTCATTACAAAACAGAAAAACACATCAAAATTCTGCAAAATAT AAAATATACCGTACTTGGTTTTTCAATTTAACAAAGGATCTTGAAAGGTAGGCGCTCAAA GTTCTATAAGCACTAGAGTAAAAGACAATTACTGTTCTAAGGCCAAGACTCTGTATTTTA TATTTCAATTTCATAATCCTGGTATATATTTTTTCCTGTATTTTAACTATTATTATTTTT CTTTTGTTTTATTATAGTATAAATAATTTTCATAATAAAATTATTCTGCTTTAATGTTTA CTTTTCTTCTCTATTTATCATTGTTTTGATTGTAACAAAAATCGTGAGTTTCTCACACAT TTTTTATATACAAGCCTCAAACTCACAAAATGAAGGTTTAAACACTTCGTACGCATGACT CTTAACGTTCTTACCATTCTTTCTTGAATTTTGCATTAAAACTCTTAGCTTGAAGTAAAA CTTTCAAATCGCTTGAGCTAAGTTTGACTGTTTGAGCATCATTGTTTTATATCAACTTTT TTTTAAAGAGTTTTTAATGTAATTATTTTAAATCATTCAAGTTGTATGTGAGAAGTTAGG TTCTTTACTTATATATATATATACATATATATAATAGATAAAAGTTCTTTACTTATTTTA GTAAGAGAGTAAGAGGACGATAATCTCCTAATATGGTTGGTGAAGTAAATGATCACCATT GTACAAATCGTAAAGAATCTTGATGGTGAAGAGACTAAAATTTGGTTAAGTTAGTAAAGT TGATGCAAGCAAATGTTGGTCGAACCTCCATAAATCGAGTATTCTATTCTCTAAACTCCT ACTCTCTTTACTTGCAAATACATTATCTTGTCACATATTCTTATTTTCATCCATACTAAA TTTGCATTTTGTGACTAAGAAGTTGCTAGAAAGGTTTTAAAATTCTCAATAACCCAATTG ATCCCGATTTAAAGGTTGACTTTCGATCTCCTATATATATGACTTTGAAATTCGAATTAT TAATATTGTGATAGAGTTACAAGATTTTAAGAACCATATCATACCACTTTTACAAAATAG TCCATTTTAGCCTTATAAACTTATAACAGCTCGTCACAATAATAAGGGATGTTTTTATAA TTTTATGCAAAAAAGTCATGTCCATGTAATTAATTCTAAACCCAGAATTTTTGTGCAATT TTTCCATGATAAAAATACTAGGATGCCACGTTAACATCATGAGTAATGTTAAATTTTTTA AAAATTTTATTTAATTAACATAGTATATGAATTATCAAAAATTATAATAATTATTATATT ATCTTATAAATTATAATATGTTCGCAATATGAATATGATATTATTTGGTCACAAATGTTA AAAAAAGAAAAATTTAAAAGACTACCATTACTCGTTTGTCGTATACATGGATACTCATTA GTTGGAATCATTTTGGGCTGGGAGATGTTTTGGGAGTGCAACACAAGTGATGTGTGATGG TGTCTCCAATTACCAGTTGAAGCAATCCAGTAGCGTGTTACCACGTCATAACGTCTGCAG AGAGATGATTGAAAACCCATTTGGAAAGAAACAAGACAAAGGACTGTAAATACATGTATT CATTCATTTACAACGTCCTCATTGAAAGGGATAATAAAACTAGTGCCATAACACAACACA GGTGTTCGATTGTGAATTTACCATATCTCTCTCTAAATTTCAAATATTTTCTTTCTAACT CTTCTCAACTCTACAAGCTCATGTATGTAATCTTGTTAGGGCAGATCTAACCCTCTTGTA TTGTTTCTGTTGGTTGTTGT
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>LITCHI020440.m1 GenomeSequence - CAAATGTTAAAAAAAGAAAAATTTAAAAGACTACCATTACTCGTTTGTCGTATACATGGA TACTCATTAGTTGGAATCATTTTGGGCTGGGAGATGTTTTGGGAGTGCAACACAAGTGAT GTGTGATGGTGTCTCCAATTACCAGTTGAAGCAATCCAGTAGCGTGTTACCACGTCATAA CGTCTGCAGAGAGATGATTGAAAACCCATTTGGAAAGAAACAAGACAAAGGACTGTAAAT ACATGTATTCATTCATTTACAACGTCCTCATTGAAAGGGATAATAAAACTAGTGCCATAA CACAACACAGGTGTTCGATTGTGAATTTACCATATCTCTCTCTAAATTTCAAATATTTTC TTTCTAACTCTTCTCAACTCTACAAGCTCATGTATGTAATCTTGTTAGGGCAGATCTAAC CCTCTTGTATTGTTTCTGTTGGTTGTTGTATGAGATTGAGATTGTTGTTTTGTTTGTTGT TGATCAAATTGTCTATTATCTGGGGGAGGGAGTTAGGGTTTGAGAGAAGCATGAGTAGTT ATGGTCGGGATTCAAGTGAGAACGTGGTGCAGGTAATAGTTGGAAATGGGGGAGGTGAGA ATTGGATGCCGAATCCAAGCGATTCGTCAGTGTGGGCAACTGAAGACGACTACCGCGTTT GGAATGACACCTGCACTGGTGACACCCCTTCTAACTCCAACTCCAACTACCAAACGCAAC AACCGCCTAACAAGAAATCGAGAGGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTCAAGAGGTGAATTCCA AATCCAAAGCTATTGGGAAAATGTTCTTCAAGACCAAGCTGTGTTGCAAGTTCCGCAACG GGACTTGCCCTTATATCACCAACTGTAACTTTGCTCACAGCATTGAGGAGCTGCGGCGGC 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GAATGAGGGACGCCAAAGACACTTGATAATAATTTTCGGCATCTGATGTATGGAATGAAA GGCATGCATAACGAACTTTTCAACAGTTGGGCCTCAAAGTTTGCTCACTTAAGATCCAAG