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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020425 | Chr12 | 13603848 | 13606928 | - | Transcription factor MYC2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020425.m1 | 65 | 245 | PF14215.9 | bHLH-MYC_N | Family | 183.2 | 5.70E-54 |
LITCHI020425.m1 | 469 | 514 | PF00010.29 | HLH | Domain | 41.3 | 1.20E-10 |
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>LITCHI020425.m1 ATGACGGACTACCGGTTGCCATCCACGATAAATCAGTGGTCAGATGACAACGGTTTGGTC ATGGATGCGTTCATCTCCTCCGATTTATCAGGCCTATGGCCACCTACTCAGTCATCTGCA TCCACAGCCGACCCCACCAAAAACCACCACATCCCCTTTTCCTCTTCTTCTCAGCTATTC AATCAAGAAACTCTCCAGCAACGCCTCCAGCAGTTGATCGAAGGCGCACGTGAGAGCTGG ACCTACGCCATCTTCTGGCAATCCTCCTGCGATTACACTGGCGCTTCTCTTCTCGGCTGG GGTGATGGCTACTACAAGGGCGAGGCTGACAAAGCCAAATCCAAAATCAAAACCTCCTCC GTCGATGAGCAGGAGCACCGTAAAAAGGTCCTACGCGAGCTCAACTCATTGATTTCTGGA TCCACCTCTGCTCCTGACGACGCCGTCGATGAAGAAGTCACCGACACCGAATGGTTCTTC TTGGTTTCCATGACTCAGTCCTTTTTCGTTGACAGCGGTGCCCTGCCCGGTCAGGCCTTC TTCAATAACAGCCCTGTTTGGGTTTGCGGGCCGGATCGGTTAGCCAATTCGGGTTGTGAT AGGGCTAGACAGGGACACGTTTTCGGGTTGCAGACAATGGTTTGTGTGCCGTCGGCTAAT GGTGTTGTCGAGTTGGGCTCCACTGACGTTATTGTTCAAAACTCGGATCTGATGAATAAG GTCCGTTTCTTGTTTAATTTCAATGGTATGGAAATGGGTGGCTCTTGGCCTTGTATTCAA GGAGAGAATGATCCTTCTTCTTGGATCAATGATCCCTCTTCTAGTTATATGGAATTAAAA GACTCTGCTGCTCCTATGGCTTCTGCTTCTGCTACTATTACTTCCAAGGGAATTCAGCTT GAGAATCCCACTTCAACTGAAAACCCAAGTGGGGCGGTTCATTTGCAGCAGCAGACGCAG ACTTTCTTTTCCAGAGAATTGAATTTTTCTGAGTATGCGTATGATCAGAGTAGTGCAAAG AACGGGAATTCGCATTTGTTGAAGCCCGAGACAGGGGAGATATTGAACTTTGCCGAGAGT AAGAGGAGTTCTAGTACTGCTGCTAATGGCAACGGCTTGTTTTCGAATCATTCTCCGTTG GTAGCAGAGGAGTCTAATAAGAAGAAGAGGTCGGCTACTTCGAGGGAGAGTAACGAAGAA GGGATGCTTTCGTTTACTTCCGGTGTGATTTTGCCGTCTTCTGGTGTAGTGAAATCGAGT GGGGGTGGTGGTACTGGGGATTCTGATCATTCTGATCTGGAGGCGTCTGTGGTTAAAGAG GCTGAGAGTAGTAGAGTTGTGGATCCTGAAAAGAAGCCGCGGAAACGGGGGAGGAAGCCT GCTAATGGTAGAGAGGAACCCTTGAATCATGTCGAAGCTGAGCGTCAAAGAAGAGAGAAG CTCAACCAGAGGTTCTACGCTTTGCGAGCTGTCGTGCCTAATGTTTCCAAGATGGACAAA GCATCACTTCTTGGTGATGCGATTTCGTATATTAATGAGCTCAAGGCTAAGCTTCAAACC TCCGAGTCTGATAAAGAGGATTTGCAAAAGCAGTTGGATTCCATGAAGAAGGAACTTGCA GGCGCCAAGGATACACGTTCAGGGCCACAAGCGTCTGATCAAGAGCTCAAAATGTCGAAC CATGGAAGTAAACTGTTTGACATGGATATCGAAGTTAAAATTATCGGATGGGACGCCATG ATCAGGATCCAGTCAAGTAAACGGAACCATCCTGCAGCCAAGCTAATGTTAGCCTTGAGA GAATTGGACTTGGAAGTGCACCACGCGAGCATGTCTGTTGTGAATGATTTGATGATCCAA CAAGCAACCGTCAAGATGGGAAGTCGTTTTTACACGCAAGATCAGCTCAAGCTTGTTCTA ACGTCCAAATTTAGTGATGCTAGGTAA
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>LITCHI020425.m1 - Up_Stream_Len 2000 CTAGTATATTTGTTTGTGTTTGTAGTGGTTGTTGGATTTTTTGGTGGTGTTTGGTTGTTT TCCGAAATGATGGCTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTTGGGTGGGGTTTAGGT GTTTTCTAGTTGGTTTTGCCTAGTTGGACCAATTATTTGACCAACTCAGCCGATTACATA TCTCTGGCGAGCAAAACCTCTGATTTAGGGGTTATTGGATCGGCATGGTGTCGGTCAGTG ATTCATCAACAAAAAGTCACCATTAATTGGTGATTTTTGGAACAATGAATATCATTAATA TAACATAAAGTACATTAGAGATTATACTTAGTGTTAAGGAAAAAAAAAAAGCAGTGTAAG CACCATCATTTCCATTCTAATGAAATTATTATAGAACCCACCATATATTGGATAATTTAA TAAATTATCTATAAATTAATTAGATGAATAAGATTAAATGAATTAATTAATATTTATTCT TAAATTTTCTATAACTAAATTATAGTTACCCTAAAATTTTAAATCAATAGAAACTACTCA ATTTATAAACTATTTAAATGCATAACAAGATAAATCAATAATTACCATATCTCTAAATTT TCCTTTATTTAAAATTATAATAACTCTAAATTTTTAAACAAAATAACAATTCCAAGTCAT AAATTTCACAATAACATACCTAATTTGAAGATCAATTGTTGGTATTGATTAAAAAATTGA GCTAAATCTAAAATGTAAGTTAATAAATCAAAATTATATTTATAAAATTAAATTTAAATA AAACAGTTGAATATGTAAAACTCTTAAAATACAACCTAATATGAAGAATATGGAGAACGG AGTTAACTAAGGTTGTCTTTTGTTTGTTTATATTTTATGCTCAAGTAAAAAATACAAATT GAAATTAGAATATCGCAAAGAACTGGTCAGAGACTGGCTGCACAAAAGCAAGGAACCAAA AACAAAAGAAGGAAAGTCTGAGCGTATGCGGTTGTGCAAAAGTAAAGCAACAGAGAACAA AATATAATTTATTTGATTGGTTAAAAAGCGATGGCTATTATAATAAATTAATTAAAAGAC GATATGATTGTAATATCGTAAAATTTTTTTAAATGAACCCACAAAGGGCTCCATCCCTGG GAGAGAAAAAGAGTAGAAGAAATTATAGAGCAGAGATTTGAGAGAGGGAGAGAAGGGGAA AGTAGACGGTCAAATTTTGTATTGTGTATTTTTATTTTTTTAATTAACATTTTACTTTAT TTTTCCTTTAAATTTTAGTTTTTGAGCAAGGATAAAAATGTAATTTTATAGTCAACCATT GAAAATAATGGTGATCAACAATTAATCAACAGTTTTACGGGTTATTTATGTAATTAAAAT AACATCTTAGAATGGATTATAATTTTATACAAAGTCAGGAAAAGTTTGTGAATAATGATA GTTGTAAAAGTATTTTTATCTATAAAAATATAATTTACGATACATCCTAACAAACACACT AATATCTATTTTTGTTTTTTTAAAATAAATCAAACGATGTATTAGAAAAAAAAATAAAAT ACAACTTCGCAAGAGTGAAATTCATCTGACACGGTGAGGGTGGCAGTGTAAAAAGAAAAA CAAATCAAATTATTTTTTGACTGAAATCGAATACAGTTTCAGTTAATAATCAGTCAAAAA AACAGTATCCACATCAAGAAGCGAGCAACAAGCACGTGTCTGAGCCAAGCAAAGTAGTTA ACCCTAGTCTAGTACCAACTACGAAAAGCCGGCTTTTTACCGATTAAATCGGGGATAAAG GAGGAGGGGCCTTCGTAGAAACCGCCCGGCTCCCAAGCAATTTATCAAAATTCAGCTGAA ATTCACTTCAAATAAATCCCAAACCCAAATGCGCCCCTAACTGACCCCTCGCTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTTATCTTCGAACTCCCATCCTTTCCCATCCTCTCCTTTCTCTCTCTGC TGCTGGTGTAACTGACTGTT
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>LITCHI020425.m1 GenomeSequence - CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTTCGAACTCCCATCCTTTCCCATCCTCTCCTTTC TCTCTCTGCTGCTGGTGTAACTGACTGTTATGACGGACTACCGGTTGCCATCCACGATAA ATCAGTGGTCAGATGACAACGGTTTGGTCATGGATGCGTTCATCTCCTCCGATTTATCAG GCCTATGGCCACCTACTCAGTCATCTGCATCCACAGCCGACCCCACCAAAAACCACCACA TCCCCTTTTCCTCTTCTTCTCAGCTATTCAATCAAGAAACTCTCCAGCAACGCCTCCAGC AGTTGATCGAAGGCGCACGTGAGAGCTGGACCTACGCCATCTTCTGGCAATCCTCCTGCG ATTACACTGGCGCTTCTCTTCTCGGCTGGGGTGATGGCTACTACAAGGGCGAGGCTGACA AAGCCAAATCCAAAATCAAAACCTCCTCCGTCGATGAGCAGGAGCACCGTAAAAAGGTCC TACGCGAGCTCAACTCATTGATTTCTGGATCCACCTCTGCTCCTGACGACGCCGTCGATG AAGAAGTCACCGACACCGAATGGTTCTTCTTGGTTTCCATGACTCAGTCCTTTTTCGTTG ACAGCGGTGCCCTGCCCGGTCAGGCCTTCTTCAATAACAGCCCTGTTTGGGTTTGCGGGC CGGATCGGTTAGCCAATTCGGGTTGTGATAGGGCTAGACAGGGACACGTTTTCGGGTTGC AGACAATGGTTTGTGTGCCGTCGGCTAATGGTGTTGTCGAGTTGGGCTCCACTGACGTTA TTGTTCAAAACTCGGATCTGATGAATAAGGTCCGTTTCTTGTTTAATTTCAATGGTATGG AAATGGGTGGCTCTTGGCCTTGTATTCAAGGAGAGAATGATCCTTCTTCTTGGATCAATG ATCCCTCTTCTAGTTATATGGAATTAAAAGACTCTGCTGCTCCTATGGCTTCTGCTTCTG CTACTATTACTTCCAAGGGAATTCAGCTTGAGAATCCCACTTCAACTGAAAACCCAAGTG GGGCGGTTCATTTGCAGCAGCAGACGCAGACTTTCTTTTCCAGAGAATTGAATTTTTCTG AGTATGCGTATGATCAGAGTAGTGCAAAGAACGGGAATTCGCATTTGTTGAAGCCCGAGA CAGGGGAGATATTGAACTTTGCCGAGAGTAAGAGGAGTTCTAGTACTGCTGCTAATGGCA ACGGCTTGTTTTCGAATCATTCTCCGTTGGTAGCAGAGGAGTCTAATAAGAAGAAGAGGT CGGCTACTTCGAGGGAGAGTAACGAAGAAGGGATGCTTTCGTTTACTTCCGGTGTGATTT TGCCGTCTTCTGGTGTAGTGAAATCGAGTGGGGGTGGTGGTACTGGGGATTCTGATCATT CTGATCTGGAGGCGTCTGTGGTTAAAGAGGCTGAGAGTAGTAGAGTTGTGGATCCTGAAA AGAAGCCGCGGAAACGGGGGAGGAAGCCTGCTAATGGTAGAGAGGAACCCTTGAATCATG TCGAAGCTGAGCGTCAAAGAAGAGAGAAGCTCAACCAGAGGTTCTACGCTTTGCGAGCTG TCGTGCCTAATGTTTCCAAGATGGACAAAGCATCACTTCTTGGTGATGCGATTTCGTATA TTAATGAGCTCAAGGCTAAGCTTCAAACCTCCGAGTCTGATAAAGAGGATTTGCAAAAGC AGTTGGATTCCATGAAGAAGGAACTTGCAGGCGCCAAGGATACACGTTCAGGGCCACAAG CGTCTGATCAAGAGCTCAAAATGTCGAACCATGGAAGTAAACTGTTTGACATGGATATCG AAGTTAAAATTATCGGATGGGACGCCATGATCAGGATCCAGTCAAGTAAACGGAACCATC CTGCAGCCAAGCTAATGTTAGCCTTGAGAGAATTGGACTTGGAAGTGCACCACGCGAGCA TGTCTGTTGTGAATGATTTGATGATCCAACAAGCAACCGTCAAGATGGGAAGTCGTTTTT ACACGCAAGATCAGCTCAAGCTTGTTCTAACGTCCAAATTTAGTGATGCTAGGTAATTGC CACGTGAAAGAGAGCGAACCTGGGATCTGTGCGAGCTTGACGATATCTTATCGTTGATTT GTGTAAGTGTCTGGGACATTTTAAGGCTTCCCGGTAGTGCGCAATCTCTGTAATATAGCA GATTTTGATGTTCTGCTTGTTCTTTAGTAGTAGTTTTTAGTATAAATTCTAGTTTTGAGG TGATTTGAATTATTGAGGAGCTTAACTAGTAATGATTGGAGCAATAGGTTTCAGTTTCAA GGATGAAACATTGTTAGGCTCCAACCCAATGGAAGTAGCCTTTTTTGGTTTTGAATTTTA GTATGTATATAGTAATTAATATAATACCTGATTAACTTCCATGGTATTATGAATCCCCCA TTTACGTTCTGTCATATTCAAATTCAGTTATGATATTATCTTGTTCATTGGATGTTGTAT TATTGTCATTATTATTTTCCTTGGACTCGAAACTATATATGCATACTGTCCTTCTTGTTG GGTTTGATAAGCATATATGTGCTTCAAGTTGAGTGGAAATAGTATAGTTTTAGATTCGGT CATTTTATATTTATCAACAAGTGTAGAACAAATTGCCGTTTGGAATCAATCAAGTTCAGG TGATGTTTTGGGATAAAGTTGTGCATCTTTTGGTTAAGAACAAAGAAGTTTTCATTTTGG GTATGTGCAACTTAGCAGTTGGAAGTGCATATTATAATTTATGCCTCAGCAAGACAAAAG CTGGTTGTGGATCGTTGTGAAGAGTCGATGCTATGGGTTTATTCACTTTGCTATGCATTG TTTTGACATTTGAAAAACAGATTAGTTTGGTTCCTTTTCTGGTAAAATAAAACATTTTGG ACACCCATTTACAGGTGCTGAATATGGACCGACATGCTGGATGCTGAAAGCTCATAGTCG ATCTCTCAACTTATATCATACCACAGCTCTCTTGATTATTGGATGAATCCATGCGAAATT TGTAATGTGAACACTTTACAATAAATTATCTGCGTGTTTTTCTTCATAGATTTTAATAAA TAAATAAGAAACCTATGGTGT