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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020406 | Chr12 | 13331773 | 13335528 | + | Protein LOL1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020406.m1 | 28 | 52 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.5 | 9.00E-11 |
LITCHI020406.m1 | 67 | 91 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.2 | 1.50E-12 |
LITCHI020406.m1 | 105 | 129 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48.9 | 4.40E-13 |
LITCHI020406.m10 | 29 | 53 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 42.3 | 5.20E-11 |
LITCHI020406.m10 | 68 | 92 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.9 | 8.90E-13 |
LITCHI020406.m11 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 42.4 | 4.90E-11 |
LITCHI020406.m11 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48 | 8.40E-13 |
LITCHI020406.m12 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 42.4 | 4.90E-11 |
LITCHI020406.m12 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48 | 8.40E-13 |
LITCHI020406.m13 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 42.4 | 4.90E-11 |
LITCHI020406.m13 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48 | 8.40E-13 |
LITCHI020406.m2 | 29 | 53 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.5 | 9.50E-11 |
LITCHI020406.m2 | 68 | 92 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.1 | 1.60E-12 |
LITCHI020406.m2 | 106 | 130 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48.9 | 4.60E-13 |
LITCHI020406.m3 | 28 | 52 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.6 | 8.40E-11 |
LITCHI020406.m3 | 67 | 91 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.3 | 1.40E-12 |
LITCHI020406.m3 | 105 | 129 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 49 | 4.10E-13 |
LITCHI020406.m4 | 28 | 52 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.5 | 9.40E-11 |
LITCHI020406.m4 | 67 | 91 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.1 | 1.60E-12 |
LITCHI020406.m4 | 105 | 129 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48.9 | 4.60E-13 |
LITCHI020406.m5 | 28 | 52 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.6 | 8.40E-11 |
LITCHI020406.m5 | 67 | 91 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.3 | 1.40E-12 |
LITCHI020406.m5 | 105 | 129 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 49 | 4.10E-13 |
LITCHI020406.m6 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.7 | 8.20E-11 |
LITCHI020406.m6 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.3 | 1.40E-12 |
LITCHI020406.m6 | 103 | 127 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 49.1 | 4.00E-13 |
LITCHI020406.m7 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.5 | 9.20E-11 |
LITCHI020406.m7 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.1 | 1.60E-12 |
LITCHI020406.m7 | 103 | 127 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 48.9 | 4.50E-13 |
LITCHI020406.m8 | 29 | 53 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 42.3 | 5.20E-11 |
LITCHI020406.m8 | 68 | 92 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.9 | 8.90E-13 |
LITCHI020406.m9 | 26 | 50 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 41.6 | 8.80E-11 |
LITCHI020406.m9 | 65 | 89 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 47.2 | 1.50E-12 |
LITCHI020406.m9 | 103 | 127 | PF06943.15 | zf-LSD1 | Domain | 49 | 4.30E-13 |
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>LITCHI020406.m1 ATGCCAGTTCCTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAAT GGTGCGCAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGA GCAACCTCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACG GAAATGGCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCA ACAAGTGTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGCAAACCAGGTT GCGCACGTCAACTGTGGAAACTGCAGGATGCTATTGATGTACCAATATGGAGCACGATCT GTTAAATGTGCCATTTGCAATTTTGTGACATCAGTTGGGGTCAGTACATCTCGTCTTTCT TCTTAA >LITCHI020406.m10 ATGCCAGTTCCTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAAT GCAGGTGCGCAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTC GGAGCAACCTCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGC ACGGAAATGGCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGA GCAACAAGTGTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGGTATACAT TATTAA >LITCHI020406.m11 ATGCTTCCAACAGTGCTGATATCATGGTCCATAAAAATTGTGTGTTGGTTAGCAGGTGCG CAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGAGCAACC TCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACGGAAATG GCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCAACAAGT GTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGGTATACATTATTAA >LITCHI020406.m12 ATGCTTCCAACAGTGCTGATATCATGGTCCATAAAAATTGTGTGTTGGTTAGCAGGTGCG CAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGAGCAACC TCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACGGAAATG GCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCAACAAGT GTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGGTATACATTATTAA >LITCHI020406.m13 ATGCTTCCAACAGTGCTGATATCATGGTCCATAAAAATTGTGTGTTGGTTAGCAGGTGCG CAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGAGCAACC TCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACGGAAATG GCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCAACAAGT GTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGGTATACATTATTAA >LITCHI020406.m2 ATGCCAGTTCCTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAAT GCAGGTGCGCAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTC GGAGCAACCTCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGC ACGGAAATGGCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGA GCAACAAGTGTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGCAAACCAG GTTGCGCACGTCAACTGTGGAAACTGCAGGATGCTATTGATGTACCAATATGGAGCACGA TCTGTTAAATGTGCCATTTGCAATTTTGTGACATCAGTTGGGGCCTCAACAAGTAGTACA GAACAGAAGTTCAATGGTTAA >LITCHI020406.m3 ATGCCAGTTCCTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAAT GGTGCGCAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGA GCAACCTCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACG GAAATGGCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCA ACAAGTGTACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGCAAACCAGGTT GCGCACGTCAACTGTGGAAACTGCAGGATGCTATTGATGTACCAATATGGAGCACGATCT GTTAAATGTGCCATTTGCAATTTTGTGACATCAGTTGGGATAAACTAG >LITCHI020406.m4 ATGCCAGTTCCTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAAT GGTGCGCAGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGA GCAACCTCTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACG GAAATGGCACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCA 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>LITCHI020406.m10 TCAATTAGTGCAGGTCTTGACACACCTATGTTCAATGATAATTTTCTATAAAAAAAACAT AACACATCTGCTATATTACTTATTTGATCTTAAATGGTGTACAACTCTTATTTCATGTTT ATAACGAAGATTTGAGTTTCCTCATATATATATATATATATATATATTATCCATTCGTGG TTAAAGTATTTTCCTATATTATAAAAAGTAAGTATGGAGGCCACACACCTGATGTGGACA ACTTTCAAACAGACAACTTATCCATTGATGTCAAATTAAATTGAGGAAAAAAAAGAAAAA CGAACTCTCTCACTTCAACATTTTTTTTGTTATTATGCAAATCCCAAGCCAAACTCCTAA CTAATATGTTATATCCTCTCTCTTTTCTCTCTCTCTCTCTGCTTCATCTGCAAGTTGCAA AGGTATGTGTTTGGCCCACATCAAAGCTCTGTTGGATTTCATTGCTTGTTTATAGTGTCT TTAACCTTCTCTCCATTTTAATATAACAAGAAAGTTTCTGAATTGGGTATTGTTTGATTA TTTTAGTCATATGATTCTCTCACACTCTATTTTGTTATCTACAATTCCCTTCCTTTTGAT AGTGAATCATGAATGCAAAAAAAAATGGCTTTTAACTTGTTCTGCTGTCAATGGTTGTTG ACATGACAGGGATGGTAAAAATGGGAGAAAGTATTGCTTTATCCTGATTTTGAGAGAATA AGATTTAAGGAGCTTTGGAAGAAAAAGAAAAAGCTGTTAGAGATTTTGCAATGCCAGTTC CTCTTGCTCCTTATCCAACACCTCCTGCACCATACACTCCTCCTGCCAATGCAGGTGCGC AGAGTCACCTTGTGTGTTCTGGATGTCGAAATCTTTTACTCTATCCAGTCGGAGCAACCT CTGTATGCTGCGCAGTTTGCAATGCAGTCACAGCTGTGCCACCCCCAGGCACGGAAATGG CACAGTTGGTCTGTGGAGGTTGCCACACCTTACTTATGTACATCCGTGGAGCAACAAGTG TACAATGTTCTTGTTGCCACACTGTAAATCTAGCCTTGGAAGGTATACATTATTAAGTAA ACAAACAGCTCAATAAGTTATATATTAGTTTCCTTTTCATTTTCCTTAATATTACCTAGA AAATGAAAACTTAAAGTGATAGTGTTGAGTATTGTAAAGTTTTTGGAAACCTCATCAGGT GAGTTTGTATAGTTTATATTAGTTTAGGGCAAGCATAAAAGTTTCATTGTATGACAGCAA ACCAGGTTGCGCACGTCAACTGTGGAAACTGCAGGATGCTATTGATGTACCAATATGGAG CACGATCTGTTAAATGTGCCATTTGCAATTTTGTGACATCAGTTGGGGTCAGTACATCTC GTCTTTCTTCTTAACTTTATAAAAATAAAATTTTTGAGTTTGCCTCTTGTTAAAAGAAAA GATTCTTAAAGCATGAAGAATAGTTTATAAAAGAAACAACAATACCAATGATCAGATTAA AATTTTGATGGCAATGCAAGAACAAGTTTGTGCTTACTGCCAGTAAACGATGGACGATTT TTAGAATATCTTTACTGCCATGCATATAGTTGGGAATCAAATTGCAATAGAAGATTCTTT TGTTGGTGATCTCATTGCAGTGTCCTTGAAGCAATAAGAAATAAAAAAACTATATAATAC AGAGTTCATTGGCCACTAGAAGCTCATGGGGCCCAAATAATGTTTTCTTAGGCACATAAA ATATATGGAGTATCAATTTTAAATTGTTCTGGAAACAGTCCATTCAATATGTATTCTTTG TATATTTTATTGCCAGTACCCCTTAATTCTGAGAACTTACTTCTCAAACCCTACTGACCA TTACTTGCCATGCAACAGATAAACTAGATACCGAATACTACTTTTCAAATTGTGATGGTA 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