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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020322 | Chr12 | 12382721 | 12394120 | - | MADS-box transcription factor 6 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020322.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93 | 6.10E-27 |
| LITCHI020322.m1 | 85 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 83.4 | 1.00E-23 |
| LITCHI020322.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.1 | 5.70E-27 |
| LITCHI020322.m2 | 85 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 83.5 | 9.60E-24 |
| LITCHI020322.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 93.2 | 5.40E-27 |
| LITCHI020322.m3 | 85 | 169 | PF01486.20 | K-box | Family | 59.4 | 3.20E-16 |
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>LITCHI020322.m1 ATGGGTAGAGGGAAAGTGGAACTGAAGAGAATAGAGAACCAAACAAGTAGGCAAGTCACC TTCTCAAAGAGGAAAAATGGGATCTTAAAGAAGGCTTATGAGCTGTCTGTGCTCTGTGAT GCTGAAGTAGCCATGATCATCTTCTCTTCCTCTGGAAAAGTTTATCAGTTCTCCACTGAT GAGATGGATAGGATCATTGCTAGGTATCGGAATGAAGTAGGGCTGCCTCGCTCTAATCTC CAGGGATTGAGAACGGCGGAGTCATGGAAAAGTGAGATTGAAGAGCTGGAAAAATCGATA GATATCATGGAAGCAAGACTTAGGCACTTTTGTGGAGAAGATATATCCACATTAAGTGTA AAAGAGTTGAAACAATTAGAGCGACACTTAAAGATAGGAGTCGATCGCATTCGTTCCAAG AAGAGGCGCATCATGTCGGAGCAGATCAGCTTGCTTAAAAGAAGGCAAAAAGAACTACAA GAGGAGAACCTTCGTCTTCGGCAAAAGGTTAAGTTGCAGGAAATACATGAGGCCAACTTA AGCTTGAGAAATTTAGAAGCAAATAGGCAGGATGAATTTCTGCAAAGGGTTCCTTTAGGT CTCACACGATCCATTAACCAAGGGGTGTAA >LITCHI020322.m2 ATGGGTAGAGGGAAAGTGGAACTGAAGAGAATAGAGAACCAAACAAGTAGGCAAGTCACC TTCTCAAAGAGGAAAAATGGGATCTTAAAGAAGGCTTATGAGCTGTCTGTGCTCTGTGAT GCTGAAGTAGCCATGATCATCTTCTCTTCCTCTGGAAAAGTTTATCAGTTCTCCACTGAT GAGATGGATAGGATCATTGCTAGGTATCGGAATGAAGTAGGGCTGCCTCGCTCTAATCTC CAGGGATTGAGAACGGCGGAGTCATGGAAAAGTGAGATTGAAGAGCTGGAAAAATCGATA GATATCATGGAAGCAAGACTTAGGCACTTTTGTGGAGAAGATATATCCACATTAAGTGTA AAAGAGTTGAAACAATTAGAGCGACACTTAAAGATAGGAGTCGATCGCATTCGTTCCAAG AAGAGGCGCATCATGTCGGAGCAGATCAGCTTGCTTAAAAGAAGGCAAAAAGAACTACAA GAGGAGAACCTTCGTCTTCGGCAAAAGGTTAAGTTGCAGGAAATACATGAGGCCAACTTA AGCTTGAGAAATTTAGAAGCAAATAGGCAGGATGAATTTCTGCAAAGGTCTCACACGATC CATTAA >LITCHI020322.m3 ATGGGTAGAGGGAAAGTGGAACTGAAGAGAATAGAGAACCAAACAAGTAGGCAAGTCACC TTCTCAAAGAGGAAAAATGGGATCTTAAAGAAGGCTTATGAGCTGTCTGTGCTCTGTGAT GCTGAAGTAGCCATGATCATCTTCTCTTCCTCTGGAAAAGTTTATCAGTTCTCCACTGAT GAGATGGATAGGATCATTGCTAGGTATCGGAATGAAGTAGGGCTGCCTCGCTCTAATCTC CAGGGATTGAGAACGGCGGAGTCATGGAAAAGTGAGATTGAAGAGCTGGAAAAATCGATA GATATCATGGAAGCAAGACTTAGGCACTTTTGTGGAGAAGATATATCCACATTAAGTGTA AAAGAGTTGAAACAATTAGAGCGACACTTAAAGATAGGAGTCGATCGCATTCGTTCCAAG AAGCAAAAAGAACTACAAGAGGAGAACCTTCGTCTTCGGCAAAAGGTTAAGTTGCAGGAA ATACATGAGGCCAACTTAAGCTTGAGAAATTTAGAAGCAAATAGGCAGGATGAATTTCTG CAAAGGGTTCCTTTAGGTCTCACACGATCCATTAACCAAGGGGTGTAA
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>LITCHI014981.m1 + Up_Stream_Len 2000 ATGTGTGAAGTATTTTCTTGATAGAAGTTGTTATCTTCTAGTTGTAAAAATAGTCATCCC AACTCCGCTATTAGTGATCAATCTCAATAGGTTCGAGATAGTTGTGAAAGTAGTTATTCG AGTCGTGTTATTAGTGATCTATCTCAATAAGTTTTAGTACTCTTTTAACCAGTTGTCTTT CAAGTTGTGCTATTAGTAATCTCTCTCAATAGGTTTTGTTGACCAATAAAATCATCCAAT ACCTTATTTAATGCAAATTGAACAAAATTAATGAATTAATCAAAACAAGTATGGAGTGAT AATGGCGCAAATATAATGTAAGAGTAATAAATAAAAGAGATAAGCGAATTTTTAATGTGG TTCGAGAAAAGAGAAATTTAAGGTTTCAAACCTACAATTAGGTCACCAAAATGTAAAAAA AAATGTTAAAATTTCTTTCCTAATTTGCATCAAATTGCATTAAATACATAGATTTTGAAT TAAACTATAATTTTGGAAATTTCCCATCCGGTGTGATTTCTTGCTTATTGCATAACTCTT TCCACTTTCAAAATCCTACTGAAATAAAGAACATTGCGAACTGCTACGTGAAGGAAACTC AAGCTACTTCACATGCGAGCTTCAGGGTTCGAGTTGCCCTTACTGCTTGTTAGAGCGGTA GGCCTTGTTCACTTTCTGCTATCGTTGATGTAACATTATGTTGTGGGCTTCGTGGTGAAT TCCTCCCCCTTTGGGCCTCTAGGCCTTTGGGTTCTTGAATCACTTATTGGGTCTCATTTG GGTTGAAGGTCCAAGTACTATTTTTAGGCACAAAGAACCTACTCCTCTAACCACTAAAGT GTAAGTATTCCACAAATATATATATACATAAAATTGTTAAATTAATATGTATTAGAGCTA ACAAAGAATGGAAGGTAAAACCATACCTTCCAAGCGTGGTAGCTTTGGTGTGTTTTTGTA ATATACACAAATCTAATCCTCCACGTAGGAAGTCAAAACAAATGATTCGTATCAAAACCA CAAAAACTAACAAATTATCACTGGTGAGGCATATTGTATCTTAACGTAATTGAATTTAAA ATAAGGAAACTTAAACTATTAACACTAATATAAATTAAATAATTAGAACTAAACTGTTGT TTATTTGTTTGTTTGTTTGGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTAATAAAAAAAAAATTTAAAAT CGTCCTAAATTTTATAAAGAAAGTTTGACCCACATTTGCGTCCTTATATTACAACTGGTA TTTTAAAAAAAAAATGAAGTCACAAATTTTAAACCTTAATTTTAATTTTAAGTTTTTTTT TTAAAAAAAAATAATTAATTATGCATCTAGGAAAGAGTAATGTTAGACTTTTTAAATTTT TGATCTAAATTCATATTCAAATGATGTGATATATAGATTGTCAACATCTTATAAATCATA AGATGATATAATAATTAATAGAGTAATGTTACACTATCTAAAAATTTATCTAAATTCATT ATATAAATAATGTGATAAGTTTATATGTAACTATCATATTAATTTTAGGATAATGTATTG ATGATGTGGTAAAATTTTTAAAAAATATAACATTATTTTAAATAAAAAAATTAAAAAACC TAACATTACTCTTTATTAAAAAAAATGTATGATTTGAATATACGATCTCATGTTTTGGAT ATGAGATGCATACAAGTGGCCAACCCCAATCTAACCAAACATTTAAATATAATTTTTGTT ATACCATTTAAATTTTGTAAAAACTGTAAGAAGTTAAATAGATTCTAAGCAATAATTAAT TGCATATAGAGAGTGAGTGAAAGTAGAATGACCATTACTAGTTAACAAGAGTTGTTTTTC GGTTTTCTCGGTAAACAAGAAATGACGTGGCATTACCAACTACAAATTTTACAAGTAGAA ACCAGTGGGAATGCTATGCTATTGCTTTTCGCTGAATTTTCAACTCTCCAAACCGGAACC CAATTTCCCTCTCACCAAAC
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>LITCHI014981.m1 GenomeSequence + CGTGGCATTACCAACTACAAATTTTACAAGTAGAAACCAGTGGGAATGCTATGCTATTGC TTTTCGCTGAATTTTCAACTCTCCAAACCGGAACCCAATTTCCCTCTCACCAAACATGGA GGCGGCGGCCAGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGTCCTGCTCCTTTCCTCATGAAGAC CTATGACATGGTCAGCGACTCTTCCACCGATGAGATCGTGTCTTGGAGCTCCAACAACAA CAGTTTCGTCGTCTGGAATCCACCTGAATTCGCTCGCCTTCTTCTTCCTACCTATTTCAA GCACAACAATTTCTCCAGTTTCATTCGACAGCTCAACACCTACGTGAGACACCAACCTCC TTCATTTTTATTTTTTATTTTTAAATTTAATTTAGCAATGTCTGTGTGTTTGTTTTATGT ACTAATTAGGAAATCCATGAGGTGGGTTCATGTTATATTTTGCTGATCTTGCTTAAAATA GATAAAGTTGTTAACTTTTTTAAATTAATTAATAAAGAGAGGACTTGGGGTTTCTCTTGT TGCTTTAATAAGGAGATTTTGAACCAGAGAATTGTAATCTCCATTGGGGATTATTTAGAT TTTTAATTATGCATCTATGTGCTGCATCAATCAGATCATGTTTTTCAGTCCATTGATTGG TGGATTGACATAGAAAAGAAGAGGATTGGTTCTTCGAACGGCAATATTTACATTAATCTC TAAGAATTTATTCTAATTATAAAGTTAGCGCTTTTCAGTGTTAGCATAGTATAGCTAATG TGTGCTTGAGCTAGTGCTGCATTCTAAAAAGTCAGTTATGATAGTGAGAATAGTGTTGAT ATGTATCAATCATGCAAAATCACTCCTATCTTATACATTTCCAGAATTCTGAGGTCACAG TTATGATAATTGATAAAATCAGACCGGCACTGTAACACATATGATTTAATTTACGTATTG TCTACTACCAGGGGACTATAGGTAGCTTTAAAGATTACATGTAATCAATTCATCCATGCA TGGTCCATGAACAAACACTCGAATGGGGCGTAAGTAAATTTTCATAATTTCAGAAGCTGC TTGATGACTTTTTTATGTTGTTTAGTTTTTGTTTTTGTATAGATATACCTATGTTGTGCA CCCATGGATTAGTTTTACTGGGTTTCTTTTGAAAGCTATCTATTACAGAAGCTATCTATT AGTTTTTGTTTTTTGTATGGATATACCTATGTTGTGTACTAGGTTTCTTTTGTATTGGTG GATCCTTTGAACTAGCTGAACCCAATTACCTAATAAAGTTCTTAATAACATTTTAAAAAT TAATAATTATAACCTGGTTATATGTATATTAGTCCATGTAGGAATCAAATGCATTGCACA TGGTATTGCAAATTTTTACTTATCATGCATGTTAATTTTATGCATGCCTTTTCAGCAATG TGGTCCCCCTAGCAGCATGTGTTCTCATTCAAAAAAGAATTGAAGATATTACAAGAATCT GTTTCTTCTAGAGCATGTACTTGGTCTATAATATTAAAGGGAAAAAAATTGTTGTTTATG TTTTCTTTTCTTTGGTTTTATGTCCTGTCTTGCAGTTTAATTTTTAAATTTATATTGGTT GATTCTTTTGGTCAAAACTTGTTCATAACTCAACTCGAATAACTCAAATTTATTTGCTTA ATGGATGAACTCTTGATTTTGCTTCTTTTTTTGATGAAGAGAAATTTAGTATTCTCAAAC TATCATTTGGATGTTAGTTTTTCATTGAAAATGATTAGGTCTATCTTCTGTTTTCTAGTG CATATGTTTTCCCATAGATTAATTTGGAATTCTATAAAGTCTATAAATCTTTTCTTTTTT TCCTTTTAGTTTTCTGATACTCATATGATCATATCACATGCCTGCATCAGCTTGTAAAAT TCGTATGTTTTGGTTTCCTCTGTCCATCCCTTGTCTTTCTTCTGACACGGACAGGAGAAA GAAAAAAATTTACTTCTTTTCTATTTATTATAAACCAGTTGGTTTCTATATAACATGGAA GCTGACTTTATGAGTTTGATTTAATGTGCTTATCAGAATTTGGTTGTCACAGGGATTTCG AAAGATCGATCCTGAGAGGTGGGAGTTTTGTAATGAAGATTTTGTCAAGGATCAAAAGCA TCTTCTTAAGAATATCCACCGCAGAAAACCTATTCACAGCCACAGTCACCCTCAGAGTTC TTTAGTGGATTCAGAGAGAGCAGTACTTGAGGAAGAAATGGACAGGCTTATGCATGAGAA AGCTCAACTAGAGGCAAATATTTCAAGAATCAAACAGCAGCGTTCAGCAGCAAAGCTTCA GTTGGAAGATATGACACAACGGGTTGATGCTATGGAGCAGAGGCAGGAGAATTTGTTGAA CTTCTTGGAAAAGGTTATTCAGAACCCTACTTTTGTTGAACATCTGGCTCAGAAAATTGA GTCCATGGATTTCTCTGCATATAATAAGAAAAGACGACTGCCACAAGTTGATCACTCTAA GACAGTTGTGGAAAGTAGTCATTTTGATAACAACAGTAGTTCTAGACCTGATTTTGGACA TATTTTCCACCAAGATTTCTCAAATAAGCTGAGACTAGAATTGTCACCAGCTGTTTCAGA TATTAATGTTGTTTCCCATAGCACTCAGAGTTCCAATGATGATGGGGGAAGTCCACACAG GAAAATATCTGAGGGCAACAGAAAAGATGCACATACAAGAACAGAAGGCAATTTATTTGT GCCCGAAACATTTGATCTTGCTGATACTGGGGCATCTTTTACATTTAAAATGGATTCATC CATCCCTCGCAAAGTACCAGCAAATGACAGCCCAAGTGTGCGTTCCTTGCAGCAGAGATT GTCCTCTAATGAAGAAGTTGATGGTCATGTTTCCTGCCATCTCAATCTAACTCTGGCATC TTCTTCTCTGCAATTCAGTAAATCCAGTATGACCCAACCAAATCATGATATTGGCAAGGC TCTAGAGTCAAGGTATATTTCTGATGATAAAGAATCTGATACTAGATCTTTTCCTAAGAG CAAGAATCTTGGTAACCGGAATGCTACTCTGTCTTCTTCACAAGAAGCCCCAAATAACAA TTCAGAGCCTTCTGCCCCACCAGCTCGAGTAAATGATGTGTTCTGGGAACAATTTCTTAC TGAAAGACCAGGTTCTTCAGACAATGAAGAAGCCAGTTCAAGTTATAGGGCAAACCCATA TGAAGAGCAAGAAGATAGAAGATCAGGCCAGGGAATGTCAAGAAATGGTCAGAGTATGGA GCAGCTAACTCTTTGA