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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI020322Chr121238272112394120-MADS-box transcription factor 6

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI020322.m11057PF00319.21SRF-TFDomain936.10E-27
LITCHI020322.m185170PF01486.20K-boxFamily83.41.00E-23
LITCHI020322.m21057PF00319.21SRF-TFDomain93.15.70E-27
LITCHI020322.m285170PF01486.20K-boxFamily83.59.60E-24
LITCHI020322.m31057PF00319.21SRF-TFDomain93.25.40E-27
LITCHI020322.m385169PF01486.20K-boxFamily59.43.20E-16
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>LITCHI020322.m1
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TTCTCAAAGAGGAAAAATGGGATCTTAAAGAAGGCTTATGAGCTGTCTGTGCTCTGTGAT
GCTGAAGTAGCCATGATCATCTTCTCTTCCTCTGGAAAAGTTTATCAGTTCTCCACTGAT
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CTCACACGATCCATTAACCAAGGGGTGTAA
>LITCHI020322.m2
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TTCTCAAAGAGGAAAAATGGGATCTTAAAGAAGGCTTATGAGCTGTCTGTGCTCTGTGAT
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CAGGGATTGAGAACGGCGGAGTCATGGAAAAGTGAGATTGAAGAGCTGGAAAAATCGATA
GATATCATGGAAGCAAGACTTAGGCACTTTTGTGGAGAAGATATATCCACATTAAGTGTA
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AAGAGGCGCATCATGTCGGAGCAGATCAGCTTGCTTAAAAGAAGGCAAAAAGAACTACAA
GAGGAGAACCTTCGTCTTCGGCAAAAGGTTAAGTTGCAGGAAATACATGAGGCCAACTTA
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CATTAA
>LITCHI020322.m3
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>LITCHI020322.m3
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TGCAACAAATGTTTTGTAATTAATTAGCCAATAAGTGTTCTTTATTGAAACCATTGATGA
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>LITCHI020322.m2
TCACTAGTGACGTCGTGTCACCGGGCACATCTTATCTGCGTCAGATCCATACCTGCCCAT
CTACTCTTCAATTCTCTCTTTCACTGTTCCATTTACTTAAATAAAATAATAATAATAATA
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GTAGAGGGAAAGTGGAACTGAAGAGAATAGAGAACCAAACAAGTAGGCAAGTCACCTTCT
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TGCTTTAAATTAATTTGCTTTATTTACCGCAGCTTCGGCTTTGCGCGGGCCCTATCATTT
TGATTTGCTTTTGCGCTTGAAGTGTGACACATTACTGTTTCGAGCTTTCGGAGGTTGTAG
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>LITCHI020322.m1
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TGGATAGGATCATTGCTAGGTATCGGAATGAAGTAGGGCTGCCTCGCTCTAATCTCCAGG
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TCATGGAAGCAAGACTTAGGCACTTTTGTGGAGAAGATATATCCACATTAAGTGTAAAAG
AGTTGAAACAATTAGAGCGACACTTAAAGATAGGAGTCGATCGCATTCGTTCCAAGAAGA
GGCGCATCATGTCGGAGCAGATCAGCTTGCTTAAAAGAAGGCAAAAAGAACTACAAGAGG
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TGAGAAATTTAGAAGCAAATAGGCAGGATGAATTTCTGCAAAGGGTTCCTTTAGGTCTCA
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GGTGATGACGTTGCTTTAAATTAATTTGCTTTATTTACCGCAGCTTCGGCTTTGCGCGGG
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GGAGGTTGTAGCTTACTTGATAAACATATATATATATATATATGCAACAAATGTTTTGTA
ATTAATTAGCCAATAAGTGTTCTTTATTGAAACCATTGATGATCAAAACCATTATCCAC
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>LITCHI020322.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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TGTGCCAATTGCATGGCCATGTAATACAGCTTCTCAACAAGTATTATAATTACATGTTCC
AAGTAGTTATATATAAACCGATCTAGCTAGGTAGTTGGAGTTAGAGATATAGAGACAGAA
ATTAAGCTATAGAAGAGGAT
>LITCHI020322.m2 -  Up_Stream_Len 2000
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ATGCACCACATTTAATCTTTTTTGCTTGCATTTGAATTTGTGCACCTCTTGTACACTTCC
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GTGATAATATTTTCTTTCGATTATGAAAATAAATATTTATGTTACATTAATAGTTATCTC
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AAGTAGTTATATATAAACCGATCTAGCTAGGTAGTTGGAGTTAGAGATATAGAGACAGAA
ATTAAGCTATAGAAGAGGAT
>LITCHI020322.m1 -  Up_Stream_Len 2000
AACAAAATTTTTATAATCTATTTTATTCAATACAAGAATTATTTGTTTTCTCTCAATTTA
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AAGTAGTTATATATAAACCGATCTAGCTAGGTAGTTGGAGTTAGAGATATAGAGACAGAA
ATTAAGCTATAGAAGAGGAT
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>LITCHI020322.m3 GenomeSequence - 
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AAGTAGCCATGATCATCTTCTCTTCCTCTGGAAAAGTTTATCAGTTCTCCACTGATGAGT
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AGTTTGGTGTTTCATGTTAATGGGTGCAGGATGGATAGGATCATTGCTAGGTATCGGAAT
GAAGTAGGGCTGCCTCGCTCTAATCTCCAGGGATTGAGAACGGCGGAGGTATATCATGAT
TTTTCGACTTTGTTGTATATGTATAATTGCATATATGTGTATATTAAACAGTTTATTAAG
ATTATTACTCTAAATCTTTTAAGTTACAGTGCTAGTAGAGGTTTCTAACTGTGTCGATTT
TTTTAATATTTTCTAACAAAAGCAAAGAATAAAATATTCAAAAGAGGAAAAAGGACGAGG
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TTAAATATTTAATCAAAGAAAAGAATACATAAACAATGTTTCGAATTGCATGTATATGTC
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AGGGCTGAGGCCAAACTTGCTTGATGCGTTGTTGAAGTTTGATTAAAGTAAGGAGGGGGA
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CGATTCCTTCTTTCAAAATGAAGTCTGTTTATACAGTGACAAATACTCCAGTTTAAGATA
GGAGAGTTTATACAACTTAATTTCTGTACATTAAGGAAGTCAATTTTAGTTCACCATGAA
GACACTTTTAAACTTGTATATGACCTTGTACGATCTTGGGAGTTCAGAACACTACATTGA
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CCTTTCGACATAGAGAGATGGCTGGCTTGAACTGATAACATGTCGGTGTTTGGCTTGTAA
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GATTAGTTGGAATGATGGTTATTGAAGTTACTCCAATAATTGTAATTATTAAATAAGATT
ATCCAACCAGTAAAATAGTTAAATCTTTTATATAAATATTTATGCAATCGGTAAATTCAA
TGTTGCCTTAACCAATGAAATCTCAATTTAGTCTCTATTTTGCTTTAACATGCATCAACT
ACATGTACTTCAGTTTTAGGGTTAATTGCATAAACTTCGCTTGAATATATAGGATAAGGC
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CAAAAGGCAATCTTACTGCCGATGGAGCTCATATCTCCTATAAGAGGGAAAATCGATCAC
CTCTTGGAGAAGATCCAAAACAGAGATCGATTTCCACTATGGGAGATTGAATGATTTGCT
ATAAAGGAGATAATCAGGAGATCAATTATCTTCTTTGTTGAAAATCATTATATCTCCACT
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GATCTCCCTAGTAGGAGATTGAACAGAGATAGATCAGTCTCCTTTGGCGATGGTTCCACC
ATTGATTTATTTTTTCTTTTTCAATATTTTATGTAGGGTTTATAATTAAAGAAGAAATTA
GGAACTTTCTTGTAATATATTTTAAGTGAAATTCATATTGATAAAAATGTGGGGTTAATT
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ATCGATAGATATCATGGAAGCAAGACTTAGGTATGTACTTCCACAGATGTTGTCGTGCAT
TCGTAATTGTTCTCCACTTTTACGTCATCATTAATTAAATTTTACTTTGTTGCAGGCACT
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ATAATTAATTTATATTAATTATTATTGTTTGGGCAAGTATATGTAAATTGATTTTTTAGT
TTCTATTAGGAACATACTAAATAAAGTCAACTACTTATCTATGAACCTGTCTTATATAAT
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TGACAAGTGCAAACTATGAATAGACATTTTTACCCCTAGTTAAGATATACTTATTTAAAA
ATAAAAATAAAAAAAATAAATTAGATAGATGATGGAGATTAATGCACCAAATAAAAATAT
TAAAAAATTGTAGAAAATGGTGAAGATCTACTTTAGATCTCCACCAGTCATAGATGAAGG
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TATCTTCTCCTTCTTTCTTTCTCCCCCAATCTCCTCTCTCTCTTTGTCTTTGTCTCTGTC
TCTGTCTATCTGTCTCTCTCTCTATCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTTTCTTCCTT
CTTCCCCTCAGTTTGCAGTCGCTAGAAAACCATTTCCAGATTTTCTAGGTTTTTAGCACT
GAAAATCCATATTTCTGGGTTTCCAATTGACTAGAATGAGTTTCTATATTGGAAACCGAG
TCATTAATCATCATCAATCGGCAAATAACCTACCTACAATCAAGGGTCCATCATTAATCA
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GGGTATTGGTGATTGATAGTTTAGGGTTGCCAGTGAAGGGGAGACGAATGGTTCGGTTTT
TTTATTTTTTGGTGATTTCATATTTTTATGTATTTTAATATTTTTTAATTCATTTTATTA
ATCTATATATATTATATATTTATTTGATAAATCTTTATTTAAATTGATTAATGCAATTCT
TTTTTTACCTCTAGAGTCAAACGATCAACATTTTCAACTTAATGAAATCAATGAGGGTTA
GAAATATTTTTGTCCTTTCACACACCTTTAATTAGTATTTTAAATATTTATAATAACATT
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>LITCHI020322.m1 GenomeSequence - 
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