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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI020301 | Chr12 | 12098651;12098946 | 12105681 | + | SWI/SNF complex subunit SWI3A |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI020301.m1 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 96.9 | 7.50E-28 |
LITCHI020301.m1 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.1 | 2.80E-09 |
LITCHI020301.m1 | 470 | 542 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 64.4 | 7.60E-18 |
LITCHI020301.m2 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.3 | 5.30E-28 |
LITCHI020301.m2 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.7 | 1.90E-09 |
LITCHI020301.m3 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.2 | 5.70E-28 |
LITCHI020301.m3 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.6 | 2.00E-09 |
LITCHI020301.m4 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.9 | 1.60E-09 |
LITCHI020301.m4 | 308 | 380 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.1 | 4.50E-18 |
LITCHI020301.m5 | 19 | 58 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.3 | 1.20E-09 |
LITCHI020301.m5 | 242 | 314 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.5 | 3.30E-18 |
LITCHI020301.m6 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.4 | 1.10E-09 |
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>LITCHI020301.m1 ATGGAGATCTCACAATATGACCCGAATTCAAAGCCGAGTCGACCCGGCGAACCAGACTTG GAACTCTACACCATCCCTAGCCACTCCAGTTGGTTTAGATGGGACGACATTCACGAAACG GAGCGTATCGCTCTCAAAGAGTTCTTCGATGGGAGCTCAATTTCAAGAACTCCCAAAATA TACAAAGAATACAGAGATTTTATAATCAACAAGTACAGAGAGGAGCCGTCGAGGAGGCTG ACTTTCACCCAAGTCAGGAAATCGCTGGTGGGTGACGTTAGTTTGCTCCACAAGGTGTTC AATTTCTTGGACAAGTGGGGTTTGATCAATTTTGGTGGTGCTGCTGCTCTGGACGCCTCC GTGGAGGACAACAAGAACCTTAAGAATCAAATTAGGGTTGAGGAAGGAGCTCCAAATGGG GTTCGTGTTGTTGCAACCCCCAGTTCTTCGAAACCAATAACTGTTCCACACGGTGGAGGA GGGGTGATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTT TTTGGTGGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGAT TCAGGAAGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAAT GGTAATTTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAAT GGTATCACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTA ATGAAGCATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTT GATTGTATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAAT GGAAGGGGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCA 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ATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTTTTTGGT GGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGATTCAGGA AGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAATGGTAAT TTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAATGGTATC ACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTAATGAAG CATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTTGATTGT ATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAATGGAAGG GGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCAGTTTCA TCCGAGCATCAAGAGATTACAAAAACGGAGGACCATGTTGATGAGCAGATGAAGGAGAGT GAGCAAAATGGAGATGCTGCAAACCAGGAACCTCCTGCGAAAAGAAAACGCATTGCTTCC CTTTCAGATGCTGGCTGTTCACTGGTAAAACAGGTAGCTCTCATCTCAACCATGGTTGGC CCACATATAACTGCTGCTGCAGCTGATGCTGCCGTCAACGCACTATGTGATGAAAGCTCA TGTCCAAGAGAGATATTCGATGGCAATGATGATTACTTAACTGATGGATCATGGTCTCCA TCTAAGCTTTATGAGTCAGAGAGGTGGTTTATTAGTTTATTTTCTGCTGATACTTTCAAG TTAATTGGTTGGCAGTTCCATTGTTGCTGTGATTTTGTGTCTTATACTTTGTCTTTTTCA GAGCACATCAGGTGGATGCTTCAGAAATGA
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