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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020301 | Chr12 | 12098651;12098946 | 12105681 | + | SWI/SNF complex subunit SWI3A |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020301.m1 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 96.9 | 7.50E-28 |
| LITCHI020301.m1 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.1 | 2.80E-09 |
| LITCHI020301.m1 | 470 | 542 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 64.4 | 7.60E-18 |
| LITCHI020301.m2 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.3 | 5.30E-28 |
| LITCHI020301.m2 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.7 | 1.90E-09 |
| LITCHI020301.m3 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.2 | 5.70E-28 |
| LITCHI020301.m3 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.6 | 2.00E-09 |
| LITCHI020301.m4 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.9 | 1.60E-09 |
| LITCHI020301.m4 | 308 | 380 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.1 | 4.50E-18 |
| LITCHI020301.m5 | 19 | 58 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.3 | 1.20E-09 |
| LITCHI020301.m5 | 242 | 314 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.5 | 3.30E-18 |
| LITCHI020301.m6 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.4 | 1.10E-09 |
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>LITCHI020301.m1 ATGGAGATCTCACAATATGACCCGAATTCAAAGCCGAGTCGACCCGGCGAACCAGACTTG GAACTCTACACCATCCCTAGCCACTCCAGTTGGTTTAGATGGGACGACATTCACGAAACG GAGCGTATCGCTCTCAAAGAGTTCTTCGATGGGAGCTCAATTTCAAGAACTCCCAAAATA TACAAAGAATACAGAGATTTTATAATCAACAAGTACAGAGAGGAGCCGTCGAGGAGGCTG ACTTTCACCCAAGTCAGGAAATCGCTGGTGGGTGACGTTAGTTTGCTCCACAAGGTGTTC AATTTCTTGGACAAGTGGGGTTTGATCAATTTTGGTGGTGCTGCTGCTCTGGACGCCTCC GTGGAGGACAACAAGAACCTTAAGAATCAAATTAGGGTTGAGGAAGGAGCTCCAAATGGG GTTCGTGTTGTTGCAACCCCCAGTTCTTCGAAACCAATAACTGTTCCACACGGTGGAGGA GGGGTGATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTT TTTGGTGGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGAT TCAGGAAGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAAT GGTAATTTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAAT GGTATCACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTA ATGAAGCATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTT GATTGTATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAAT GGAAGGGGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCA 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ATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTTTTTGGT GGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGATTCAGGA AGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAATGGTAAT TTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAATGGTATC ACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTAATGAAG CATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTTGATTGT ATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAATGGAAGG GGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCAGTTTCA TCCGAGCATCAAGAGATTACAAAAACGGAGGACCATGTTGATGAGCAGATGAAGGAGAGT GAGCAAAATGGAGATGCTGCAAACCAGGAACCTCCTGCGAAAAGAAAACGCATTGCTTCC CTTTCAGATGCTGGCTGTTCACTGGTAAAACAGGTAGCTCTCATCTCAACCATGGTTGGC CCACATATAACTGCTGCTGCAGCTGATGCTGCCGTCAACGCACTATGTGATGAAAGCTCA TGTCCAAGAGAGATATTCGATGGCAATGATGATTACTTAACTGATGGATCATGGTCTCCA TCTAAGCTTTATGAGTCAGAGAGGTGGTTTATTAGTTTATTTTCTGCTGATACTTTCAAG TTAATTGGTTGGCAGTTCCATTGTTGCTGTGATTTTGTGTCTTATACTTTGTCTTTTTCA GAGCACATCAGGTGGATGCTTCAGAAATGA
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>LITCHI026868.m1 GTACGTTATGCTAAGTGAATAGTTGCTTTAAAAGACGACAAGGAACATTTCGATGGGGCA ATTCGGTAAATGTACGCAATAGTTACGACGTCAAGTACGAATATAAATGCCACAACAGTC CAGCCTATACGGTTCTAATGTAAATGGAGCAACCACAATACGCTGAGGATGACCTGACCA TCACAGCAACCGCCGATGACGCCGCAATCCTCCGTAAATCCACTCCACAACGCGGCGGCA CGCGCCACCCCGTCTACCGCGGAGTCCGGAAGCGGCGGTGGGGCAAATGGGTCTCCGAAA TCAGAGAGCCGCGCAAGAAGTCGCGCATTTGGCTAGGGTCGTTCCCGGCTCCGGAGATGG CGGCCAGAGCCTACGACGTGGCTGCGTACTGTCTAAAGGGACGCAAAGCGCAGCTGAATT TCCCCGACGAGGTTGACGACCTGCCGCGGCCGTCCACGTGTACAGCCAGGGACATCCAGG CCGCGGCTGCCAAGGCTGCGCATGCGGTGATTTCGTCGAAAAAGAGTAATGTATCGGACG GCGACGGCGACGATTTTTGGGGTGAGATTGAATTGCCTGAGTTGATGAACAGTGAGCGGT ATAGTAATTCTTGTGGGTGGACTTTTAACGGTGATGCCACGTGGATTGACGGAGAAGCAC AGCAGCCGTTCATGGCTTGTCTCTAACGTGTACGGATACGGTGACATGTACGTATTAATT ATGCGTCCTTAGTGCTATATTATACAGGCTGCTTGTATTTAGTTTTTCATTAATTTCTTG CTCTTATTATGTTTAATTATTCGGTTCGTGTTTGGTTATTCACTGGTTTTGCAATAATTT CGAAAAAGTTGTAAATCAAGCCCCGAAAATAATAATGGTCGTGAATAAATAATTTGTTTT TTGGGGTGTGTTTAGTTGGG
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>LITCHI027881.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAGTTATAAATTGCATTTTTATATGCATTTTCAGTACAGGGGGAATGTATAGATATATTC ATGAATTTATAATGAGATAATAATTTTGACATGTTATAAATGCAGTCAATCAAAATCTTA AATGTTGTAGGTGATTTCTAACCTATCAATCTAAATTTTGGTTTCTCAAAAGAAAGAAAA AACTTAAATTTCCAGATTTAACTCTTACTGCTTAAATTTATGGCTTTAATTCTTCCGGGC TATCCTCTTGCCATATGCACATTATATACAAAAGAGCAAATTAATGTACTATTGATCTGC ACATCACCTTCTTGATATTAGTGATTTGTCGCTTTCTCATTTCCTAAGGTATTGGGGGTT TAATTTCTATTAGATGCATTTTACATCTTGTGGAGTGGTTGTGTAAGTACTTAAAACTTA AATTTCTAGGCTTAACCCTTACTGCTTATATTTATAGATTTAACTTTTCCGGTCTATCCT TTTGCCATATGAACCCACATTATATGCAAAAGAGCAAATTAATGTATTATGAATCCATAT GTCACATTTTTTATATTAGTGGTTTGTTGCCTTCTAATTTCCTAAGGTATTGGAGGTTTA ATTTCTACTAAGTACATTTTATATCTTGTTGAGTAGTTTTCCCCATTACCATGTAAGTAG TTATCTCTCATTTTTAGTAGTAATATCTTGACTGCCTAAATAGTGTATTTGGCTTCGACA AATTTGACACTCTAATGATACATTCGGTGCTTTAAAAAAAATATATCATAAACTCTAGCT ACATAATTTAAATATTGAATAGATAAATGATGATGATATTGTTTTAAGTTTGTCTTTTAA GATATATATATTTTTGAAATAAAGTCTTTTAAGGTTGATATACCCTAATCCTTAACCTAG ATTTCAAAAAACAATTTAATTCAAAATTTGAAAATAAATGGATTTGGAATTAAAAGATAA GATTTGGAGTCTAAACTATGTTACCCATCCCATTTTTGTGGAAACTTAATAGCTAATATT CCTTTGAAAAAAAATAAAATCGATATTTAAAATATTTGATTTTTTCAATTTCTGTTAACA AAAATTTTGGATTGATTCATTGAACCCTTTTTTATCGTTCTAAAATGTTCTTTTTCAAAA TCCATGGGAAATTGGCACTAATTAAGATCTTCAAATTCAAAACGGCCAATCCCATCTAGC ACACCCACGTACGCGTTGTCATTCACCAGATTCCCCAGGGTAAAACCGTCATCAAGGAAA AAATGCAGTGGTATGAGCCCGTGAATACACCTATAACCTAAGGGCATTCCCGGAATAATG GAAAAAATCCGGGGGCCCAAATAAACCTGAAAAAAGAAAAAAGTTGGACATGAAAATAAT AAAAAATGAAAATAAAAAAAGTAAATTTAATTGCGGACGCGAGAGAAGATTGAAATATGG TTTAACAGATCCCTCTCTCTCTCTCCCTCTCAATCTCAAGCTGTTTCTCTCTCTGCCCTG CCTCTCTCTTCTTTTTCCTTTTTCGTTTTCGTTGTCTCTGAAGGCGCTCTTTGTCCCTTA TCGGCTAACGTTTCTCGCTTTCTCTTCCTCCAAGCACACCACCGACAAAAACAAAGAAGT TCCGATTCTCTCTTCGGCACGACAAACTGCAACTGCTGCTGATTCCAATTATATCATTTT TCCGCCGCTGTTTCTGCTTATTCAGGTTGCGTTACTGTTGGCTTCTCAAAACCCTAGATT GGCCATTTACATTCGGTGCCAATCATCCTTCTCCGTGGATCTTTGGACGTCATTCCGGTG AGTTTAATTCGGTTTTTGACGTTCTGTTTTTAAAACCCTAGATCGTGTTGAGTCTTGACG TTGGTTGCCGTGTCGTCAGGTTGCGGGTCGATCTCGTTATTAGGAGGTGATAGAGTGGGC GTTATAGTGAATAGAACTTATCAAGGTTTGGTGATAATTGGTTTAAGGAGAATAGAAGAA GCCGATGCGATTGGAAATTG
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>LITCHI000884.m2 GenomeSequence - GATTAGGAGTAGAGAGTGATCCACGTTAGGTGGAAAAACTATCCATCAACTCTATGGTTT GTTCATGGATTTAGAATATATTTTTTAAGGGCAACTTGGCTATAAGAGCCACCTACTTTA TAGTTGTGGACCCATCTTAACATTGTCCATATGAGGCGGCTTAAGATAAGCAAGGGAAAA GTTTGAGGAAGGTTCAAGTAAAGTTTTTGGAACATTTGAGGAAAGTTATAACTTAATACA ATATTTGAGGAAAGTTATAACTTAATACAATATTGTGATCTTTTGCTTCTTGCAATTTAG CTGGTTTTGTTGTAAGCAAGAGGAGCTAGAGTTGACTGGAAAGTCTCTCAGATTTTTTCG CTGGAGAATGGCTAACACTTCTGTGTGGCACGTTTGCTGCAAGGTAAATTTGAAATTTAG TTCATAGCTGCTTTACATCTTATTTTTGATGAGGATTGAGCTACTTTACATCTTATTCAA ATGCTTTTGGACTACAGTCTTGCATATATTATTTTTGCTTTCACTGCACTTATATTTGTT TAGCCACTTTTGAAAGTATTCAAGCTCCTGTGACTATAAAGATATGATAAATTAGGCCAG AAACTCATATTTCATTTTTAGTTAAACTGTGTTCGTGATGCTGGGAGCAATAGCTGTTGA GAGAGGTGGAGGGGAATCAAACACCCCTTCATGAGTTTTTTTATTATTAGAGTAGTTAAA TTCTGTTATTGTTTCTTTTTTAATGTTTTTAAGTTTTTGAGTTGAGCACAATTATGTTGT GTTAGAACGCGATTTACCAGAAGTGCTTGCTTCTGAGTTGATTACAATAATGTTTTTAAG TTTTTGAGTTGAGAACAAATTTGTTATATATTTATGTTTGGACGTTAGTAATATAGAAAT CATATTGGTCTTACAAGTGATGTGTTATAGAATGGGAGCATGAGGATATATGCTAGTTTA TTGCATAACCAAGTAGTTTACTGGTGTAGTTAACTTCTGGATTGTCAATTATTCAATTTA TATTTTGAGTAAGCAATGAGATTTTCAGAGTCTGTTATTGTTTTGGCTAGTAGTCCTTCA TGAAACATCACTAATTTCAAGTGATTTGTGTTGTGCTACTGTATTCAGTTCAGATTCCAA GTTTTCTTGTAATCAAAAAGTATATGGCATAACCTAGCATTGTTGCATCAGTTTGTCATC ATTTTCGAAGATTGTTAAATCTTTAACTTGTATAGCTTGATTCTAAATCACAGGTTTTCA GGTACAAGAAACGTACACTTGCAGTTCTATTTTTCACATTAGAGGCGATATCATTTATAT TGGATCAGTATGGAGGAAGACATTTGGGTTTCCTTGTTGCTTCAGTTTTCTTATCACTAG TTGGTTTTCTTATAACTGCTTACAATTTCACAGAAAGCAGATCTGAAGTCGAAAACCAAC GCGAAGTGATAGAGCTTGTCTTCTCTATTGTCCAATTGATTGTTACATACATATACTTTG TTTGTGCAACTTTGGAAGTAAAACTCAAGTTGAATGCTGCATCCATTTTCCCACTGGTCC TTGCTATAACAGCTCTTGCCTTAGCTTTTAAGAATAATGAACAAGTTACAGATTTGTCGG CAGTCCAGACTCAACTTATTTCATTAAACACTTCGATGGTGGGTGTAGAGACTACGGATT CACTGGCACCTGGCATACAAGGTGCTTCATCAGATGCGTCAAGGGTGGATGATGAAGAAG AGATTACAGATTCAAGCGCTCTCCTATGCATTACTTCGTCAAATGCACCAGCAGAGATTG ATGATCACGAGAATGCAGATATGAGAGCACCCCTCGTTTCATCAAATACTCCAATGACGT CTGATGATGAAGAGGTTAGTACTCCAAGAGGGTGGTATGATGTTGATGAAGGAACAGGGT GGAGTACTGATGTTGATGAAGAAACAGTGTGGAGTACTGATGTTGATGAAGAAACAGAAT CGACTGCTGTTGAAGCATCGATTTTTGCAAGTAAAGAACGCTTCAATCTTTTTCTCTCAA CTGATCTGGAACCAGAGAAGTTTTTTACTCAGAGGTCGAGGTTACCCCCACACATGACAT CCGCTCAATCTAATCTATGGCAGAGTACTAAGGTATGCATGTTAATTTTAAGCAAATAAT TGGCATAGCAGTGATGATTTTGAGCAATATATGATCAGATTATAATGCTTGCAAGAATAT AAGTAATATATAAAAGTTACATGGATGGTTCCACGGTGGTCCATAGTAAAAACTGTAGAA ATTGTTTGTGTGGAAAGCAGAAAATGAAGTCACTAAGTTTTTCTTGTATGTTTAACGTTT AATTATGGATCATTGAGAATTAATTAGCTCTTACAATATGTGATCCATGTTTTGAGTATT TCCTATTTATTCTCTCTTACTATCGTTAAAATAAATGTGCTCCTTGATTTCAACTATAGT ATTTAATGTATAGATAATTGGATTTATAATACATCAACAAGAATTAACTGCTTCAAAGTG TTCTCATACATTAATCTTAACTACATGCAACAGCTGTTCTCAGTACGTATTACTAAAACA GATCTTGAGAAGGAATTGATAGTTCCAACCCGAGTTATGAAGCATTTCTTGATTCCTGAA GGAAAGGAGTTTGTGGATTTGCTGGTGAAGGACTTGAAAGAAAAATTTTGGAACTTTCGT TTTACTGTTTATCCGAAGCCTGCTCTCACTGATGGTTGGCTTGAATTCGTGAAAGATAAA GATCTTGCACGTAATGATATAGTCACCTTCTATAAGTTGCGAGACGAAATTTTTGGAGAG CAGTACAGAGTTGAGGTTGACAGTGAATACAGGTGGTAGAGGGTATTTAGTCTATTAATA TGGTTATTAACTTGTTAGGAGAGAGTCTCGACGATTCTGAAAAACATTAAGGTCCAATGC ATGCATGTGTTTGCGGTTTATCATATGAGTACAAGAAACGTTGTTGCAGGTAACGAAAGC CAGGGATGTGTTCTTTATATTCTGTGTTGTGAATCTGTTTGTAACAAGGTAAGGAAAGGT TAGGAGGTGTTTAAAGGATGTTATCATTACGGCAAGTTTTTCCATTTTTATTGTTCTGTT CAACAGTTTAAGCATAAAGTGTTTGAAGAGGTGTTTGTATAGCTCTTCATGTTGTACATA TTGGATATGAAGTGAAATACAGTTCAATCAGTTTCACTGTATCAAAACCCTAAGGTCTTG GATCTGAATTTCATCTTCCTCTTTTAA >LITCHI000884.m1 GenomeSequence - 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