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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI020301 | Chr12 | 12098651;12098946 | 12105681 | + | SWI/SNF complex subunit SWI3A |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI020301.m1 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 96.9 | 7.50E-28 |
| LITCHI020301.m1 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.1 | 2.80E-09 |
| LITCHI020301.m1 | 470 | 542 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 64.4 | 7.60E-18 |
| LITCHI020301.m2 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.3 | 5.30E-28 |
| LITCHI020301.m2 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.7 | 1.90E-09 |
| LITCHI020301.m3 | 26 | 111 | PF04433.20 | SWIRM | Domain | 97.2 | 5.70E-28 |
| LITCHI020301.m3 | 247 | 286 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.6 | 2.00E-09 |
| LITCHI020301.m4 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 37.9 | 1.60E-09 |
| LITCHI020301.m4 | 308 | 380 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.1 | 4.50E-18 |
| LITCHI020301.m5 | 19 | 58 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.3 | 1.20E-09 |
| LITCHI020301.m5 | 242 | 314 | PF16495.8 | SWIRM-assoc_1 | Family | 65.5 | 3.30E-18 |
| LITCHI020301.m6 | 85 | 124 | PF00249.34 | Myb_DNA-binding | Domain | 38.4 | 1.10E-09 |
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>LITCHI020301.m1 ATGGAGATCTCACAATATGACCCGAATTCAAAGCCGAGTCGACCCGGCGAACCAGACTTG GAACTCTACACCATCCCTAGCCACTCCAGTTGGTTTAGATGGGACGACATTCACGAAACG GAGCGTATCGCTCTCAAAGAGTTCTTCGATGGGAGCTCAATTTCAAGAACTCCCAAAATA TACAAAGAATACAGAGATTTTATAATCAACAAGTACAGAGAGGAGCCGTCGAGGAGGCTG ACTTTCACCCAAGTCAGGAAATCGCTGGTGGGTGACGTTAGTTTGCTCCACAAGGTGTTC AATTTCTTGGACAAGTGGGGTTTGATCAATTTTGGTGGTGCTGCTGCTCTGGACGCCTCC GTGGAGGACAACAAGAACCTTAAGAATCAAATTAGGGTTGAGGAAGGAGCTCCAAATGGG GTTCGTGTTGTTGCAACCCCCAGTTCTTCGAAACCAATAACTGTTCCACACGGTGGAGGA GGGGTGATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTT TTTGGTGGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGAT TCAGGAAGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAAT GGTAATTTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAAT GGTATCACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTA ATGAAGCATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTT GATTGTATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAAT GGAAGGGGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCA 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ATGGGTGAGAATGGGGGGGTTAAGTTGCCTCCATTGGCTTCGTATTCGGATGTTTTTGGT GGTTTGGTGAAGTTGAAGGGGTCCAAGTGTTCGAATTGTGGGGAACGATGTGATTCAGGA AGCTATGAGGATAGCAAGGATAATTATATAATTTGCATAAAATGCTTCAAAAATGGTAAT TTCGGGGAGAACAAATCTATGGATAATTTTAAGTATAATGACTGTTCCGGAAATGGTATC ACTGATGGAACTGCTTGGACTGAAGCAGAAACTCTACTTCTATTAGAATCCGTAATGAAG CATGGGGATGACTGGGATCTGGTTGCTCAAAATGTTAAAACCAAGAATAAACTTGATTGT ATCTCAAAGCTCATTGAGCTGCCTTTTGGGGAATTGATAATGGGTTCTGCAAATGGAAGG GGTAGTGCTACTGGCCCTACTGGGAGCATGAACAATGTAATACAAGGATTGTCAGTTTCA TCCGAGCATCAAGAGATTACAAAAACGGAGGACCATGTTGATGAGCAGATGAAGGAGAGT GAGCAAAATGGAGATGCTGCAAACCAGGAACCTCCTGCGAAAAGAAAACGCATTGCTTCC CTTTCAGATGCTGGCTGTTCACTGGTAAAACAGGTAGCTCTCATCTCAACCATGGTTGGC CCACATATAACTGCTGCTGCAGCTGATGCTGCCGTCAACGCACTATGTGATGAAAGCTCA TGTCCAAGAGAGATATTCGATGGCAATGATGATTACTTAACTGATGGATCATGGTCTCCA TCTAAGCTTTATGAGTCAGAGAGGTGGTTTATTAGTTTATTTTCTGCTGATACTTTCAAG TTAATTGGTTGGCAGTTCCATTGTTGCTGTGATTTTGTGTCTTATACTTTGTCTTTTTCA GAGCACATCAGGTGGATGCTTCAGAAATGA
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>LITCHI030031.m1 ATCAAAAGAGAATTACTTTCCAATTAATTAATTAATTAATTAAACTTTATATAACTCAAG CCTAGCCGACCCAAACCAAAAAAACAAAACCAAAAACCATATACTCCACTTGTGTGTGTG TGTCTCTCCCTCTCTCACTATTTCAAGTCTTTGAAAGTCACTCTCACGCGTAAACACAAA CACAGATTTCGACACACATACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATCCATTTCCTCT GCAACAACAAACGACTTTCTCTCCTTCTCCTCCTCCCTTTTCTTTTTCCATGAAACCTGA AATTTTCCTGCAAAGTTGAGCTCTTTAGTAGGATTTTCTGTCACTTCCCTTTTTGGGTTC TTTTGCTTATTTATATATAAAAAACTTCAATCTTTCACTTCTCCATGAACACTAAATCTT CTCTACCAAATCTTGTCTCTTTTATTGTCAAAAAATACATCAACCCAATTGACTAAATCT TCAAAACATGAAAAAAATTCCAAACTTTACCCAAATTTGAGTCTTTTTATTGGCAATTCA GCTCCATGAAAACTCTCACTTTCATACAAAAAATAAAAATCCAAACTTTACCATAAATCT ACCAAAATTTGAGTCTTTTGTTGTCAATCTCACCAACCCAATTCACTAAGCTTTCAGGAT TTCATGTTTTTGGGAATTCACTAAATTTTCAGGATTTCGCTTCATCTTCAGGAAAACTCA CACTTTTGTTTAAAAAAAAAAAATCTTAACTTCGCCATAAAATTTACCAAATTTGAGTCT TTTGTTGTCAATTCCACCAACCCAGTTCACTAAATTTTCAGGATTTCAGGTTTTTTTGTT TTTGGGAATTCACTAAAGTTTCAGGATTTCAGGTTTTTTGGGTGGTTGTGTACAAATGCA AGACCCAGCAGCGACGTTTCAAGCAGTAAAGCCTCATTTTCCGGAGTTGGAGCAGCTCAA GTGTCCACGTTGTGACTCAACAAACACCAAGTTCTGCTACTACAACAACTACAACCTCTC GCAGCCACGGTATTTCTACAAGAACTACCGCCGCTACTGGACCAAAGGTGGCGCCCTCCG CAACATCCCCGTCGGCGGTGGCACCCGCAAGAACGCAACAAAGAAGAGACAGAAGCCGGA TCCGAACGCGACCCGGAAAGGGAATGAGGGTGGTGCTCATTCTTCGTCAGTGTTGGCGGC GGTTGGGACGACGGTGAATCAGGAGGCGGCTTCGGGTTCTGTATGTATCGCGTCGGGTGA TGACCCGGGTAGGATGTATGGGCTGGGTGTGGATCCGGATCATAAGATGTTGGATATGAC TGGGAGCTTTAGCTCGCTGCTGGCCAATAATGGTGGGTTTGGGAGTGTTTTAGAGGGTTT GAATCCGACTGGGTCGGGTTTGAAAATGGGGCAAGTGGGCGGTTTCGGGGAGGCGTTTGG TTCGAATCAGAGTTTGGGTGCATTTTCGGGTCGGGGCTCCGTGTTAGAGACTCAAGGTGA TCACAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGATTCAAGTTGTTGGAGTGGCAATAGTAATGG GTGGCCTGATCTTGCTATTTACACTCCAAGTTCTAATTTCCAATAAATAGAGAGTTTGGT TTTTTTTGGTCATGGTGTTGTTTTAAGTATTGTGATTTTGGTAATTAGAAAATTAAGTTA GTAAATAGAGGAGAATGATTTTACATAATATATTTTTACATAGGTAATTTTATTTTTATT TTTATTTTTATCTTTTTTTGTTTGGGTGGTTATTGTGTGGAGTTTGATTGTTATGTTTTT CATATATAAAGTTATCCCAATTTTTTTTTTTTTTAGCTTTTGCTTTTGGTTAATTGTGGG TGTGGAGAATATTAGTTTGTGTTTGTAAGACGAAAACTATGATCATTGAGTTTGGCGGCA ACTCCACTTGCTCTTACTTACGAAGGAAGGGTAAGGTTCAAAGCACATTATTAAGACAAC AAAATATTTTACAAAAATGTAAGTTGACCTCTTTTAATTGTAGGAGTAGTATTTCGGATT ATGTATCTTAAGAAGATTACATCTACTGCTCTCGATAGTCATATTATATAATATCAAAGG GTAAAAAAAAAAGCTATCATTATCGATATATTATGTTAATGAAATAGGTGCCCTCTGTAG CTCTCTTTATATTTTTAGGTTAAATATTTTTCTAAGTTGATACTGAATTGGGTAAAGCTT TGACATAACCCGCAAAAATCAAACATTATGGTTCATATTTTTATTTTCATGCATGAGAGA TAATTATTTTTATAATAAGGTGAAAAAGTTATCTATACAAGTTTTAATATGCATTTAATG AGAATTGAATTCTTAATTTTTTGAAAGATGAGAGTTAGACAATTGATTTGTATGAGACTT AATAACGATGTATTTTAATGAAGTAAACATATTTTTGTTGGAAAAGGTTCTAGTTTGAAG TTGGGTTATTATGAATAAATGTGTTGAATACGTTGTGTTGATTTATAAGTATGGCTGTAT GGGATGCTTGGGGGTGGAGACTTTGAAAATTGAGATCTGGTTTGGTTGATTATCGAAAAA AAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGACAAGGTGATGGAATGGGGGAAGGAACGGGAAATCCAAA GTGCACAGTAGAAGTTAATTTGTTCCAAATATGTCTTGCAAGGAGCAGACAATTTTCAAC TTCCTTCAACCACTTGGAACTTGGATATTATTTCTTATTCCAATATGTTTCTTTCTTTTG GTCCTGTGTATTTGGCAACTTGTCATGAATCAAATGTGTTTTCTATCTTCTTTTTGACCA TATGTTGTATAAAACAATTATTTCATATTTGTTAGATAATTAATTTAAGGGAAG
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>LITCHI030031.m1 - Up_Stream_Len 2000 CACTGGTCCGGACACTTGGACGGTCATGATGGCACACGTTAACAAATGGGCGGATCTGAT TTGCTCACGGAAATTCGCATGATGTTCTCGCTAGGGCTCTTTTGCTTTATTTGCACGCAG GCTCTTGTCGGCTACGCGGCTTCCGGTTCAACTGTTTGGGCTTTTGTGGCTTAATTGTCG TCATTAGCTTAAATATCGGCTCAAGCTTTTTGCCAAGCTGTTGAGGTTTTGCCCTAATAT ATATTTTTTTCTCTATTTTTTTTTTTTTTAAATTAGTTTATGAAAGACAGAAACGTTTTT TATTATATGGGATAACTGATGTAAATGGAGAATAAAACGTGTTGCTAGTGGTGGTTGGTG AGTAACTAATTTATTCTATAACTTAATTGTCATAAAAATCTATAGATAAAGTGTTTTTTT TTGTTGGTATCTATGTTAAATTTTTTCTTATTTTATTTGTTATTTAGATGCTTTATTTTT ATATATTTTTTAATTATAACATTCTACTATTTATGAAGTTCAAACATTGGGTTTTTTTTT TTTTAAAAGCAAAATTTGGGTTCTTACCTATAACATGAATTTAACATTTGAGATTTATAG TTATAAAATAACAAACAATAATATAGTTTAAATTATTAAAATTTAAAATTTAAGCTACTA TCAAATACAAATATATCTTAATCAAAGAATAATGACATTTTTAAATAACAAATATACTTT GAATAGAAATGATCAATATTAAGTTATATTTTTATTTGTGACTATTAAATCAAATGGAAT AACAAATTACGTCTATTGATGATATCATTTGTAATAGATACGACAAATCTAGTTATATCC ACCCACATTCCACTATACAAAAGTTCCATTTTCATATTAAAAAATTCCATAAAGCATTAG TGGGTTACTTTATACTCAATCATCCCACTAATAAATTAATAATTCTATTTAAGGTTAAGA AGGACATAGCATCATAGCAGTTGACATTTGTTCTTCTTCCAAACCCATAATAAACTATCC AAACAATTTCAAACCCCATTTGACGTCTGGCCATGCTTATAAAAGGAGCCAAGAATCAGA ATCATTAGTGTCTACTATTATTTTAATCAAAAGAGAATTACTTTCCAATTAATTAATTAA TTAATTAAACTTTATATAACTCAAGCCTAGCCGACCCAAACCAAAAAAACAAAACCAAAA ACCATATACTCCACTTGTGTGTGTGTGTCTCTCCCTCTCTCACTATTTCAAGTCTTTGAA AGTCACTCTCACGCGTAAACACAAACACAGATTTCGACACACATACACACTCTCTCTCTC TCTCTCTCTTTTATCCATTTCCTCTGCAACAACAAACGACTTTCTCTCCTTCTCCTCCTC CCTTTTCTTTTTCCATGAAACCTGAAATTTTCCTGCAAAGTTGAGCTCTTTAGTAGGATT TTCTGTCACTTCCCTTTTTGGGTTCTTTTGCTTATTTATATATAAAAAACTTCAATCTTT CACTTCTCCATGAACACTAAATCTTCTCTACCAAATCTTGTCTCTTTTATTGTCAAAAAA TACATCAACCCAATTGACTAAATCTTCAAAACATGAAAAAAATTCCAAACTTTACCCAAA TTTGAGTCTTTTTATTGGCAATTCAGCTCCATGAAAACTCTCACTTTCATACAAAAAATA AAAATCCAAACTTTACCATAAATCTACCAAAATTTGAGTCTTTTGTTGTCAATCTCACCA ACCCAATTCACTAAGCTTTCAGGATTTCATGTTTTTGGGAATTCACTAAATTTTCAGGAT TTCGCTTCATCTTCAGGAAAACTCACACTTTTGTTTAAAAAAAAAAAATCTTAACTTCGC CATAAAATTTACCAAATTTGAGTCTTTTGTTGTCAATTCCACCAACCCAGTTCACTAAAT TTTCAGGATTTCAGGTTTTTTTGTTTTTGGGAATTCACTAAAGTTTCAGGATTTCAGGTT TTTTGGGTGGTTGTGTACAA
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>LITCHI030031.m1 GenomeSequence - ATCAAAAGAGAATTACTTTCCAATTAATTAATTAATTAATTAAACTTTATATAACTCAAG CCTAGCCGACCCAAACCAAAAAAACAAAACCAAAAACCATATACTCCACTTGTGTGTGTG TGTCTCTCCCTCTCTCACTATTTCAAGTCTTTGAAAGTCACTCTCACGCGTAAACACAAA CACAGATTTCGACACACATACACACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATCCATTTCCTCT GCAACAACAAACGACTTTCTCTCCTTCTCCTCCTCCCTTTTCTTTTTCCATGAAACCTGA AATTTTCCTGCAAAGTTGAGCTCTTTAGTAGGATTTTCTGTCACTTCCCTTTTTGGGTTC TTTTGCTTATTTATATATAAAAAACTTCAATCTTTCACTTCTCCATGAACACTAAATCTT CTCTACCAAATCTTGTCTCTTTTATTGTCAAAAAATACATCAACCCAATTGACTAAATCT TCAAAACATGAAAAAAATTCCAAACTTTACCCAAATTTGAGTCTTTTTATTGGCAATTCA GCTCCATGAAAACTCTCACTTTCATACAAAAAATAAAAATCCAAACTTTACCATAAATCT ACCAAAATTTGAGTCTTTTGTTGTCAATCTCACCAACCCAATTCACTAAGCTTTCAGGAT TTCATGTTTTTGGGAATTCACTAAATTTTCAGGATTTCGCTTCATCTTCAGGAAAACTCA CACTTTTGTTTAAAAAAAAAAAATCTTAACTTCGCCATAAAATTTACCAAATTTGAGTCT TTTGTTGTCAATTCCACCAACCCAGTTCACTAAATTTTCAGGATTTCAGGTTTTTTTGTT TTTGGGAATTCACTAAAGTTTCAGGATTTCAGGTTTTTTGGGTGGTTGTGTACAAATGCA AGACCCAGCAGCGACGTTTCAAGCAGTAAAGCCTCATTTTCCGGAGTTGGAGCAGCTCAA GTGTCCACGTTGTGACTCAACAAACACCAAGTTCTGCTACTACAACAACTACAACCTCTC GCAGCCACGGTATTTCTACAAGAACTACCGCCGCTACTGGACCAAAGGTGGCGCCCTCCG CAACATCCCCGTCGGCGGTGGCACCCGCAAGAACGCAACAAAGAAGAGACAGAAGCCGGA TCCGAACGCGACCCGGAAAGGGAATGAGGGTGGTGCTCATTCTTCGTCAGTGTTGGCGGC GGTTGGGACGACGGTGAATCAGGAGGCGGCTTCGGGTTCTGTATGTATCGCGTCGGGTGA TGACCCGGGTAGGATGTATGGGCTGGGTGTGGATCCGGATCATAAGATGTTGGATATGAC TGGGAGCTTTAGCTCGCTGCTGGCCAATAATGGTGGGTTTGGGAGTGTTTTAGAGGGTTT GAATCCGACTGGGTCGGGTTTGAAAATGGGGCAAGTGGGCGGTTTCGGGGAGGCGTTTGG TTCGAATCAGAGTTTGGGTGCATTTTCGGGTCGGGGCTCCGTGTTAGAGACTCAAGGTGA TCACAATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGATTCAAGTTGTTGGAGTGGCAATAGTAATGG GTGGCCTGATCTTGCTATTTACACTCCAAGTTCTAATTTCCAATAAATAGAGAGTTTGGT TTTTTTTGGTCATGGTGTTGTTTTAAGTATTGTGATTTTGGTAATTAGAAAATTAAGTTA GTAAATAGAGGAGAATGATTTTACATAATATATTTTTACATAGGTAATTTTATTTTTATT TTTATTTTTATCTTTTTTTGTTTGGGTGGTTATTGTGTGGAGTTTGATTGTTATGTTTTT CATATATAAAGTTATCCCAATTTTTTTTTTTTTTAGCTTTTGCTTTTGGTTAATTGTGGG TGTGGAGAATATTAGTTTGTGTTTGTAAGACGAAAACTATGATCATTGAGTTTGGCGGCA ACTCCACTTGCTCTTACTTACGAAGGAAGGGTAAGGTTCAAAGCACATTATTAAGACAAC AAAATATTTTACAAAAATGTAAGTTGACCTCTTTTAATTGTAGGAGTAGTATTTCGGATT ATGTATCTTAAGAAGATTACATCTACTGCTCTCGATAGTCATATTATATAATATCAAAGG GTAAAAAAAAAAGCTATCATTATCGATATATTATGTTAATGAAATAGGTGCCCTCTGTAG CTCTCTTTATATTTTTAGGTTAAATATTTTTCTAAGTTGATACTGAATTGGGTAAAGCTT TGACATAACCCGCAAAAATCAAACATTATGGTTCATATTTTTATTTTCATGCATGAGAGA TAATTATTTTTATAATAAGGTGAAAAAGTTATCTATACAAGTTTTAATATGCATTTAATG AGAATTGAATTCTTAATTTTTTGAAAGATGAGAGTTAGACAATTGATTTGTATGAGACTT AATAACGATGTATTTTAATGAAGTAAACATATTTTTGTTGGAAAAGGTTCTAGTTTGAAG TTGGGTTATTATGAATAAATGTGTTGAATACGTTGTGTTGATTTATAAGTATGGCTGTAT GGGATGCTTGGGGGTGGAGACTTTGAAAATTGAGATCTGGTTTGGTTGATTATCGAAAAA AAAAAAAGAAAAAAAAAAAAGACAAGGTGATGGAATGGGGGAAGGAACGGGAAATCCAAA GTGCACAGTAGAAGTTAATTTGTTCCAAATATGTCTTGCAAGGAGCAGACAATTTTCAAC TTCCTTCAACCACTTGGAACTTGGATATTATTTCTTATTCCAATATGTTTCTTTCTTTTG GTCCTGTGTATTTGGCAACTTGTCATGAATCAAATGTGTTTTCTATCTTCTTTTTGACCA TATGTTGTATAAAACAATTATTTCATATTTGTTAGATAATTAATTTAAGGGAAG